Biosíntesis de aminoácidos

Cursos Básicos Ciencias

Bioquímica – Dra. María del Pilar Navarro
mnavarron@cientifica.edu.pe
APLIQUEMOS LO APRENDIDO

Aspectos generales
Los aminoácidos:

• Son moléculas orgánica que posee por lo

menos un grupo carboxilo (un ácido orgánico)
y un grupo amino (una base orgánica).
PRECURSORES INMEDIATOS: ALFA CETO ACIDO

2
DEPENDE EL GRUPO FUNCIONAL AMINOACIDO AMINOACIDO
S S

ANILLOS AROMATICOS
3
 Aminoácidos
CLASIFICACIÓN DE AMINOÁCIDOS SEGÚN SUS REQUERIMIENTOS

Esenciales No esenciales

No pueden ser sintetizados
Sintetizados por el  organismo
son aportados por los alimentos (dieta), 
en el hígado
condicionando su esencialidad. 

4
Clasificación de acuerdo a sus requerimientos
TIPOS DE AMINOACIDOS

ARGININA

5
Aminoácidos pueden ser:
• Glucogénicos (forman piruvato o
intermediarios del ciclo de Krebs)
• Cetogénicos (generan solo acetil-
CoA o Acetoacetil CoA) o ambos.

6
Síntesis de aminoácidos
Es el conjunto de procesos bioquímicos mediante los cuales se
producen los distintos tipos de aminoácidos a partir de otros
compuestos. LOS ALFA CETO ACIDOS

LOS ALIMENTOS DAN EL GRUPO AMINO

Características
• Los sustratos para estas reacciones se obtienen a partir de la dieta del organismo.
• No todos los organismos son capaces de sintetizar todos los aminoácidos.
• Los seres humanos, sólo son capaces de sintetizar 11 de los 20 aminoácidos que pueden
encontrarse en su organismo, formando parte de sus proteínas o como intermediarios
metabólicos.
• Los otros nueve se denominan aminoácidos esenciales y deben incorporarse a la dieta

7
Aspectos generales GLUCOLISIS
PENTOSAS
ANILLO
AROMATICO
• La biosíntesis de AA requiere CADENAS
CARBONADAS, generalmente α-cetoácidos
(piruvato, oxoloacetato, alfa cetoglutarato), y PENTOSAS

NITRÓGENO REDUCIDO, NH4.

• Los ESQUELETOS CARBONADOS de los
aminoácidos provienen de intermediarios de la
glicolisis, ciclo de Krebs y de rutas de las pentosas
fosfatos.
• El N2 está disponible en la atmósfera, pero son los
microorganismos del suelo los encargados de
fijarlo al suelo y convertirlo en N aprovechable por
los organismos superiores, NO3- para plantas y
NH4 para animales.

FIJACIÓN DEL AMONIO A LAS CADENAS

CARBONADAS (biosíntesis de nitrógeno
orgánico)

8
FIJACIÓN DEL AMONIO A LAS CADENAS CARBONADAS (biosíntesis de nitrógeno
orgánico)

• Nitrógeno en forma de amoníaco es la fuente de nitrógeno para

todos los aminoácidos.
• El nitrógeno de aminoácidos, purinas, pirimidinas y otras
biomoléculas proviene del nitrógeno atmosférico.
• El proceso de biosíntesis se inicia con la reducción de N2 a NH3 por
FIJACIÓN DE NITRÓGENO
EL AMONIO SE TIENE QUE REDUCIR EN AMONIACO LA MAQUINARIA ENZIMATICA LO TIENE LAS BACTERIAS
ALFA CETO GLUTARATO ---------------- 5C --------- TRASNFIERE EL GRUPO AMINO ----------- AMINOACIDO
PIRUVATO --------------- 3C --------- TRASNFIERE EL GRUPO AMINO ----------- AMINOACIDO
OXALACETATO ------------ 4C --------- TRASNFIERE EL GRUPO AMINO ----------- AMINOACIDO

9
 Biosíntesis de nitrógeno orgánico

• La fijación de nitrógeno es
realizado por microorganismos
(bacterias y arqueobacterias)
diazotróficos (que fija nitrógeno)
para el metabolismo de los
eucariotas superiores.
NITRICAR
• Estos microorganismos fijan 60%
del nitrógeno.
90%
• Los rayos y la radiación UV fijan
un 15%.

• El 25% restante se fija mediante

procesos industriales (fabricas
de fertilizantes).
SE CONSUME 2 MOLECULAS DE ATP POR FIJACION
NITRICAR
• Para fijar nitrógeno
SE CONSUME 2 MOLECULAS se necesita
DE ATP POR FIJACION
H2 (gaseoso), hierro
(catalizador) y presión de 300
atmósfera) 10
 Biosíntesis de nitrógeno orgánico a amoníaco
El proceso biológico de fijación de nitrógeno requiere un complejo enzimático con múltiples centros redox,
conocido COMPLEJO NITROGENASA. La transferencia electrones
esta acoplado a hidrólisis de
FERREDOXINA ATP POR CADA MOLECULA
DONA LOS ELECTRONES A LA REDUCTASA

Se genera por fotosíntesis o por

procesos oxidativos SE FIJA Y REDUCE EL
Por cada electrón transferido se NITROGEN A AMONIACO
hidrolizan dos moléculas de ATP. PERO PRIMERO SE TIENE
QUE FIJAR

TRANSFIERE LOS ELECTRONES AL MOFE

Aporta electrones con Utiliza los electrones

elevado poder reductor reducir el N2 a NH3
NITROGENASA
MOFE PROTEINA

COMPLEJO NITROGENASA Es inactivado por O2

Los componentes reductasa y nitrogenasa
son proteínas ferro-sulfuradas

Funcionando como transportadores de electrones 11

 El Fe se encuentra unido con Biosíntesis de nitrógeno orgánico a amoníaco
el S de un residuo de Cys

Los componentes reductasa y nitrogenasa son proteínas

ferro-sulfuradas

Funcionando como transportadores de electrones

Desencadena un cambio conformacional que

Reductasa (Ferroproteína-Fe-proteína)
DIMERO
Dímero de subunidades idénticas (30 kDa)
unidas entre sí por agrupaciones 4Fe-4S
acerca al componente nitrogenasa para
transferir los electrones al centro donde ocurre
la reducción del nitrógeno

TRANSFIERE LOS
Su función es transferir electrones desde ELECTRONES AL MOFE
Y SE HIDROLIZA 2 ATP
un donador (ferrodoxina reducida) hasta
la nitrogenasa

Hidroliza 2 ATP cuando cede un

electrón 12
 Biosíntesis de nitrógeno orgánico a amoníaco
• El COMPONENTE NITROGENASA es un tetrámero
de 240 kDa.
• En su centro presenta un molibdeno (Mo), y por
ello, recibe el nombre de Molibdeno-
ferroproteína (MoFe-proteína) CUANDO
ELECTRONES
TIENE
EL
CLUSTER P LO PASA AL

N2
LO FIJA Y REDUCE CENTRO MOFE PARA
QUE FIJE Y REDUCE
LOS ELECTRONES

SITIO DE
ALMACENAMIENTO
Reducción a NH3
DE ELECTRONES
Electrones proveniente de la
reductasa se incorporan al
cluster P.
(Almacena e- hasta ser
utilizados por el cofactor
FeMo)
e-

AGRUPACIONES DE
CISTEINA

13
 INTEGREMOS LO APRENDIDO

Los electrones (probablemente originados desde NADH o

2 MOLECULAS DE
AMONIACO NADPH) se transfieren, de uno en uno, desde la ferredoxina
TRANSFIEREN
ELECTRONES  a la reductasa y de ésta a la nitrogenasa. Cuando el cofactor
FeMo ha captado 2 e−oxida 2 H+ generando H2; ello permite
la unión del N2. Tras recibir el cofactor FeMo otros 6 e− se
produce la reducción del N2 hasta 2 moléculas de NH3
REDUCTASA NITROGENASA 1E ---- 2 ATP
2E ----- 4ATP
1 ELETRONES ------ 2 MOLECULAS DE ATPS 8 ELECTRONES ---- 16 ATP GASTADO ----- 2 MOLECULAS DE AMONIACO
EL ATP ES PARA FIJAR 14
EL NITROGENO
Incorporación del amonio a aminoácidos

Glutamato y Glutamina
TRANSAMINACION

Donadores de nitrógeno a la mayoría de

los aminoácidos

Proviene por TRANSAMINACION

transaminación de
grupo α-amino del
glutamato

Glutamina cede su átomo de nitrógeno en la

biosíntesis de Trp y de Hys
TRIPTOFANO HISTIDINA --- PLANTAS
15
 Síntesisdel
Síntesis deGlutamato
Glutamato AMINOACIDO TIPO ACIDO EN SU CADENA LATERAL
ENCONTRAMOS UN GRUPO CARBOXILO

A PARTIR DEL GLUTAMATO SE FORMA LA GLUTAMINA

ALFA CETO GLUTARATO DONA LA CADENA ELLA TIENE UN GRUPO AMINA
CARBONADA
ALFA CETO GLUTARATO ----- 2 GRUPOS CARBOXILOS

• Reacción de síntesis ocurre en la

MATRIZ MITOCONDIAL.
• Es inhibida por GTP y activada por
ADP
Glutamato deshidrogenasa

SE DESHIDROGENA EL NAPH

EL ALFA CETO GLUTARATO SE REDUCE POR LA

OXIDACION DE UN NAPH

16
 Síntesis
Síntesis delde Glutamato
Glutamina a partir de Glutamato
AMIDA DEL GLUTAMATO
ES LA GLUTAMINA

Proceso de amidación dirigida por ATP

(Intermediario: Acilfosfato + Amoníaco)

GRUPO
AMONIACO

FOSFORILACION DEL ATP GLUTAMINA SINTETASA

GLUTAMINA SINTETASA MARCA

EN LA CADENA LATERAL

LE PEGA UN ORTOFOSFATO
SUSTRATO

17
Síntesis del Glutamato y Glutamina

glutamato sintasa
α-cetoglutarato + glutamina+ NADPH+ H+ 2 glutamato +NADP+

• Cataliza la aminación reductora de alfa-cetoglutarato a glutamato.

• Donador de nitrógeno en la reacción es la glutamina
• En el interior de la enzima se hidroliza el grupo amida de la cadena
lateral Gln para producir amoníaco

18
Recordar:
• Se necesita ATP y ferredoxina reducida para reducir el N2 a NH3 por
parte del complejo Nitrogenasa (microorganismos).

• La fijación de nitrógeno es necesaria para la síntesis de

aminoácidos, nucleótidos y otras biomoléculas que necesitan
nitrógeno.

• La incorporación del grupo amino en la síntesis de los aminoácidos

proviene del glutamato y de la glutamina.

19
 La cadena carbonada del resto de los aminoácidos se sintetiza a partir de
intermediarios del ciclo de los ácidos tricarboxílicos y de otros importantes
intermediarios metabólicos, y el grupo amino se les agrega finalmente, a partir del
glutamato, en una reacción de transaminación.

α-cetoácido
OXALACETATO

ASPARTATO

α-cetoácido
PIRUVATO RIBOSA 5 FOSFATO

FOSFOENOLPIRUVATO … GLUCOLISIS

ERITROSA 4 FOSFATO
α-cetoácido
ALFA - CETOGLUTARATO 3 – FOSFOGLICERATO
FENILANINA GLUCOLISIS
GLUCONEOGENESIS

20
Síntesis de aspartato y alanina
Aspectos generales:
• Se sintetizan a partir de una reacción de transaminación.
• Transferencia de un grupo alfa-amino (donador) a un alfa cetoácido (aceptor),
convirtiéndose el primero en alfa-cetoácido y el segundo en un alfa-
aminoácido.
• Las enzimas que catalizan estas reacciones son: Aminotransferasas o
Transaminasas, son dependientes del piridoxal fosfato (PLP, piridoxal-5'-
fosfato, P5P), que es su coenzima, y además, es la forma activa de la
vitamina 6.
• Enzimas que están presentes tanto en el citosol, como en la mitocondria de las
células de los seres vivos.

Los aminoácidos lisina y treonina no participan en

reacciones de transaminación
21
Síntesis de aspartato a partir de oxaloacetato

• Se sintetizan mediante la adición de un grupo

amino al oxalacetato y/o al piruvato.
ASPARTATO AMINOTRANSFERASA (AST)/PLP
Oxaloacetato + glutamato aspartato + alfa-cetoglutarato

La AST cataliza la transferencia de un grupo amino de aminoácidos específicos (L-glutamato o L-

aspartato) a cetoácidos específicos (α-cetoglutarato u oxaloacetato).

• Existen dos formas de la AST la mitocondrial y la citoplasmática.

• Cada enzima está formada por dos unidades de la misma cadena polipeptídica.
• Los pesos moleculares de estos dímeros son 93.000 daltons para la forma soluble y 90.400
daltons para la mitocondrial.
• La forma mitocondrial constituye el 12% de la actividad sérica total.

22
Síntesis de alanina a partir de piruvato
Distribución de la ALT en tejidos adultos
normales:

• Se sintetizan mediante la adición de un grupo amino

al oxalacetato y el piruvato.
ALANINA AMINOTRANSFERASA (ALT)/PLP
Piruvato + glutamato Alanina + alfa-cetoglutarato

• La ALAT cataliza la transferencia de un grupo amino entre

la L-alanina y L-glutamato; los cetoácidos
correspondientes en este proceso son α- cetoglutarato y
piruvato.

• La ALT es un dímero cuyas subunidades pesan 50.500

daltons, en consecuencia la molécula completa tendrá
101.000 daltons.

23
TRANSAMINASA (ASAT– ALAT)
UTILIDAD CLÍNICA:

- Lesión hepatocelular: Hasta 10 veces o más el valor normal (≥400 U/ml)

- Ictericia extrahepática: ALAT 10 veces el valor normal y ASAT en un grado equivalente o menor

- Carcinoma Hepático: Incremento de ALAT de aprox. 5 veces y ASAT 7-10 veces

- Cirrosis biliar primaria: Incremento ALAT de 5 veces y ASAT aprox. igual.

- Hepatitis alcohólica: Incremento ALAT de 3 veces su valor y ASAT de 5-6 veces

- Cirrosis alcohólica: Incremento leve de ambas: ALAT de 1-2 veces y ASAT 3-4 veces.

24
 TRANSAMINASA (AST– ALT)
• Utilidad Clínica:
Tabla 1. Concentraciones esperadas de AST y ALT en
diversas enfermedades hepáticas
COCIENTE DE RITIS:

AST/ ALT
> 2 proceso crónico
< 2 proceso agudo

AST/ALT > 2
Cirrosis alcohólica y alteraciones musculares severas

25
Reacciones de transaminación que originan al glutamato,
Oxaloacetato y Piruvato.

• GOT (glutamato-
oxalacetato transaminasa),
también llamado AST
(amino aspartato
tranferasa).
OXALACETATO GLUTAMATO
ASPARTATO ALFA - CETOGLUTARATO

• GPT (glutamato piruvato
transaminasa), también
llamado ALT (alanina amino
transferasa),

ALANINA ALFA CETOGLUTARATO GLUTAMATO

PIRUVATO

26
Síntesis de Asparagina a partir de
oxalocetato AMIDA DEL ASPARTATO

SUSTRATO : ASPARTATO

• Químicamente análoga a la formación de

Gln.
• Reacción de amidación dirigida por hidrólisis
de ATP.
27
Síntesis de Asparagina a partir de
oxalocetato El NH3 se produce por la hidrólisis de la cadena
lateral de la Gln, transfiriendo de manera directa al
aspartato activado en el centro activo
Donador de nitrógeno

Aspartato + Gln + ATP Asn + AMP+ PPi + H+ GLUTAMATO

GLUTAMINA

ADENILAR LA GLUTAMINA

Aspartato: se activa por adenilación en vez de fosforilación 28

Adenilación: regulación de la Asparagina sintetasa y
de la glutamina sintetasa

Mecanismo de regulación de la actividad enzimática por la modificación

covalente de la proteína, que consiste en la introducción de un resto
adenílico aportado por el ATP.

GRUPO OH ACTIVA LA ENZIMA

29
Síntesis de Asparagina a partir de
oxalocetato
SE ADENILA EL SUSTRATO

HIDROLISIS DEL ATP

ACIL – ADENILATO SEDE EL GRUPO AMINO PERO SE

QUITA LA ADENOSINA MONOFOSFATO

30
Síntesis de Prolina y Arginina a partir de α-cetoglutarato
GUANIDIL

Glutamato deshidrogenasa

o
at
a m a
t as Precursor
l u
g sint

31
SE TIENE QUE ACTIVAR EL SUSTRATO

El grupo carboxilo
reacciona con el ATP Intermediario (acilfosfato)

Reducción

GLUTAMATO

INTERMEDIARIO
Pirrolina GLUTAMATO SEMIALDEHIDO

carboxilato
Proceso no
enzimático
Reducción

´PROLINA DELTA 1, PIRROLIDINA – 5 CABOXILATO …. TIENE DOBLE ENLACE

32
Biosíntesis de Arginina

TRANSAMINACION

REDUCCION Y
HIDROLISIS DE ATP

INTERMEDIARIO

33
Síntesis de Serina, Cisteína y Glicina

34
Síntesis de Serina, Cisteína y Glicina

35
Síntesis de Serina a partir de 3-fosfoglicerato

1 2 3

α-cetoácido

1. Reacción de oxidación
2. Reacción de transaminación
3. Hidrólisis
36
Síntesis de Cys a partir de Ser

Cys, el SH viene de Hcys

y el esqueleto carbonado
La conversión de Ser a Cys viene de la Ser
requiere la sustitución de
un átomo de azufre
procedente de la Met por
el átomo de O2 de la
cadena lateral

Ecuación final:
Hcys + Ser Cistationina+alfa-cetobutirato + Cys 37
Síntesis de Gly a partir de Ser

38
Síntesis de Fenilalanina, Triptófano y Tirosina

39
 Biosíntesis de aminoácidos aromáticos

La tetrahidrobiopterina se sintetiza a partir de

la guanosina trifosfato(GTP) a través de tres
reacciones químicas mediadas por las enzimas
GTP ciclohidrolasa  I (GTPCH), 6-
piruvoiltetrahidropterina sintasa (PTPS);
y sepiapterina reductasa (SR).

40
Biosíntesis de aminoácidos aromáticos

Tetrahidrobiopterina (BH4)
También llamada sapropterina o BH4, es un cofactor esencial de las tres hidroxilasas de
aminoácidos aromáticos:
• La fenilalanina-4-hidroxilasa (para la conversión de fenilalanina a tirosina),
• La tirosina-3-hidroxilasa (para la conversión de tirosina a L-dopa), y la triptófano-5-
hidroxilasa (para la conversión de triptófano a 5-hidroxitriptófano).
• También es esencial para la síntesis de óxido nítrico mediante la óxido nítrico sintasa.

• La sapropterina, bajo la marca comercial Kuvan, es un preparado sintético de la sal dihidrocloruro de

tetrahidrobiopterina.
• Ha sido desarrollado por BioMarin y aprobado por la FDA americana el 13 de diciembre de 2007. Se vende en
comprimidos que contienen 100 mg.
• La sapropterina es el único fármaco aprobado para el tratamiento de la fenilcetonuria.
• El Kuvan está indicado para reducir la fenilalanina en la sangre en los pacientes con hiperfenilalaninemia. Suele
utilizarse en conjunción con una dieta restringida en fenilalanina.

41
 Biosíntesis de aminoácidos aromáticos

Deshidratación

Oxidar
Biosíntesis de Phe, Tyr

Pierde el grupo
Condensación Carbohidrato fosforilo y forma un Reducido
de C7 anillo
Precursor inmediato del
Intermediario

Condensación
con 2da anillo aromático
Fosforilació n/
molécula PEP
n c ió ión
a c
r at ila
d x
shi rbo
De sca
de De Transaminación
sc
s
o
mat a ox arb
o r i l id ox
y e l c os e n s at ila
iv c
ki m ato mediari noácido a i ón
h i er mi .
El s los int de a r y Trp)
son íntesis (Phe, Ty
bios áticos
arom
Mutasa 42
 Biosíntesis de Trp
Corismato capta un NH2
de la hidrólisis de la Antranilato se condensa
glutamina con el PRPP
El C1 se une con el grupo nitrógeno de
antranilato por una reacción dirigida por
hidrólisis del pirofosfato

Se extrae en
forma Por reordenamiento

Triptofano Deshidratación/
sintasa/PLP descarboxilación

Reaccionan
Triptofano
sintasa/PLP
Esqueleto carbonado de la Ser

43
Síntesis de Histidina

Condensación
1

5-aminoimidazol-4-
carboxamida ribótido 6
7

44
The Plant Cell, Vol. 17, 2089–2106, July 2005, www.plantcell.org
Regulación de la síntesis de aminoácidos

Diferentes mecanismos de regulación:

• Retroinhibición (alostérica)
• Multiplicidad enzimática Retroinhibición de
• Retroinhibición acumulativa rutas ramificadas
• Modificación covalente

45
Regulación de la síntesis de aminoácidos
Retroinhibición

• El producto final de la ruta regula al enzima que cataliza el paso comprometido en esa ruta
• Reacción irreversible, catalizada por enzima alostérico
• Ahorro energético: sólo se produce la reacción si se necesita y si no hay disponibilidad de
producto.

46
Regulación de la síntesis de aminoácidos

Retroinhibición de rutas ramificadas

Fosforilación de la aspartato es
la etapa limitante en la
biosíntesis de Tre, Met, Lys

Gln sintetasa es inhibida de

forma acumulativa por sus
productos finales del
metabolismo de la Gln, así como
por Ala y Gly

47
Regulación de la síntesis de aminoácidos

Modificación covalente
Adeniltransferasa-
Proteína reguladora, Pa
(catalizan la
incorporación de AMP)

(Más activa) Menos actividad

Des-Adeniltransferasa-
Proteína reguladora, Pd
(Libera AMP del enzima
adenililado)

Uridiltransferasa

Pa se convierte en Pd
por unión UMP

La unidad UMP se desprende

por hidrólisis de Pd

48
Aminoácidos son precursores de biomoléculas
2 molécula delta-aminolevulinato
• Purinas y pririmidinas derivan de aminoácidos. (se condensan)
• Extremo reactiva de la esfingosina (intermediario de la síntesis de
esfingolipidos): Procede de Ser.
• Histamina (potente vasodilatador): Procede de la His. Porfobilinógeno
• Tetrayodotironina, adrenalina, melanina: Proceden de tirosina.
• 5-hidroxitriptamina (neurotransmisor) y el anillo de nicotinamida
(NAD+), se sintetizan a partir del Trp. 4 moléculas de Porfobilinógeno
• Glutatión (tripéptido) formado por Glu-Cys-Gly.
• Oxido nítrico (reacción catalizada por oxído nítrico sintasa): procede de
la Arg. Un tetrapirrol de cadena abierta,
que se cierra para formar
• La primera etapa de biosíntesis de las porfirinas esta dictada por la uroporfirinógeno III
condensación de glicina y succinil-CoA para formar delta-
aminolevulinato por acción de la enzima delta-aminolevulinato
sintasa (contiene PLP y esta en mitocondria).
Oxidación y modificación de cadenas
laterales, da lugar síntesis
Protoporfirina IX
Capta un Fe para formar grupo
49 hemo
Conclusiones
1. La fijación de nitrógeno utiliza ATP y ferredoxina reducida para reducir el N2 a amoníaco, por
acción del complejo nitrogenasa.
2. La incorporación de NH4+ en el metabolismo de los aminoácidos es por la GLUTAMINA Y el
GLUTAMATO.
3. Los aminoácidos se sintetizan a partir de intermediarios del ciclo de Krebs, glicolisis y rutas de las
pentosas fosfatos.
4. La biosíntesis de aminoácidos está regulada por retroinhibición, en donde la etapa limitante se
inhibe alostéricamente por el producto.
5. Los aminoácidos son precursores de purinas, pirimidinas, histaminas, tiroxina, glutatión, oxido
nítrico y porfirinas.

50