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Biq 1 Era
Biq 1 Era
1-era-bioquimica-dalla
37 pag.
Bioquímica – 1ª ERA
GENERALIDADES CATALIZADORES
ENZIMAS
- Propiedades
1. Termolábiles
• Frente a altas temperaturas, dejan de funcionar
• Desaparece el sitio activo
• La temperatura debe ser estable
2. Regulables
• Puede aumentar o disminuir su funcionalidad
• Modificando la velocidad de una reacción química
• Enzimas pueden estar activadas en cuanto otras desactivadas
3. Específicas
• 2 teorías:
a) Hipótesis llave-cerradura: no cualquier reactivo puede relacionar con el sitio
activo
b) Hipótesis del ajuste inducido
ESPECIFICIDAD
- No cualquier sustrato va tener su estructura molecular, los átomos o moléculas necesarias para
lograr interacciones reversibles con el sitio activo
- Hay sustratos que no tendrán un elemento para generar una unión reversible; este sustrato no puede
inducir un ajuste
- El ajuste solo se induce si las uniones se pueden establecer la especificidad por el sustrato
NOMENCLATURA
Nº Nº Nº
1 – 6 (familia) subfamilia sub-subfamilia serie
- Familias:
1. Oxidorreductasas: catalizan reacciones de oxidación o reducción
• Encontramos también en la subfamilia (oxidasa, reductasa, deshidrogenasa,
oxigenasa) y en la sub-subfamilia (deshidrogenasa que usan como cofactor FAD y
NAD)
2. Transferasas: catalizan la transferencia de grupos funcionales de una molécula a otra
• Aminotransferasa: transfiere grupos aminos
• Carboxitransferasa: grupos carboxilos
3. Hidrolasas: catalizan la ruptura de enlaces covalentes incorporando H2O en uno de los
sustratos
4. Liasas: semejante a las hidrolasas, pero no incorporan H2O
• Catalizan la ruptura de enlaces C-C, C-N, C-O
5. Isomerasas: catalizan la transformación de isómeros
• Isómero dextrógiro → levógiro
• Sis → trans
6. Ligasas o sintetasas: catalizan la unión covalente de un C con otro, va a favorecer la unión
covalente de un C con O2
• Permite la síntesis de una macromolécula
• Requieren gasto de energía
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COENZIMAS
- Cofactores débilmente unidos a la enzima
- Cuando tenemos una enzima que tiene un cofactor que le acompaña, la función del cofactor es la de
modificar su estructura durante la reacción
- Hay una enzima oxidorreductasa
- Tengo un sustrato que tiene que oxidar y necesito una enzima que acelere la oxidación, el problema
que surge es que el sustrato al oxidarse, va liberar electrones, se no tengo a quien dar estos
electrones, ellos van a pasar a la estructura de la enzima y modificarla, porque se reduciría
- Si la enzima toma los electrones, no se recupera inalterada, por eso, el cofactor debe tomar los
electrones
- Las coenzimas están débilmente unidas a la enzima, se modifican a lo largo de la reacción y se
regeneran con otra enzima
- La vuelta del estado normal realiza en otra reacción química con otra enzima diferente, porque la
enzima a la cual la ayuda está unida débilmente y se puede desprender
GRUPOS PROSTÉTICOS
- Cofactores unidos por enlaces covalentes (fuerte, estable) a la enzima
- El cofactor no se va separar de la enzima, va a modificarse, pero va permanecer unido en esta
condición a la enzima
- Se regenera con la misma enzima
Ejemplos
CINÉTICA ENZIMÁTICA
- Cuanto más sustrato desaparece, más producto aparece en un determinado tiempo, mayor es la
velocidad
V1 V2 V3
Sustrato
Enzima
V3 > V2 > V1
Producto
- Constante de V: se satura la enzima, pero no deja de funcionar, va continuar, pero a una velocidad
constante
MICHAELIS - MENTEN
- Establecieron 2 enunciados que explican las características de la cinética enzimática
• Mayor cantidad de sustrato, mayor la velocidad de la cinética
• A altas concentraciones de sustrato, la velocidad se vuelve constante porque todos los sitios
activos de la enzima se saturan
- Criaron la curva de saturación: es una hipérbola
LINEWEAVER – BURK
- Recta de las inversas, con solo 2 puntos
- Transformaron la ecuación de la curva en una recta
- Hicieron la inversa de la ecuación para calcular los parámetros
- Donde corta la
1
• Ordenada: 𝑉𝑚á𝑥
−1
• Abscisa: 𝐾𝑀
- Se conoce la inversa de la Vmáx y del KM
INHIBICIÓN ENZIMÁTICA
- Afecta la cinética
- Inhibidores: fármacos, venenos, toxinas
- 2 mecanismos
1. Irreversible:
• Pérdida definitiva de la actividad catalítica
• La acción del inhibidor es unirse a la estructura de las enzimas y modificar
estructuralmente, haciendo con que ella pierda el sitio activo
2. Reversible:
• Siempre podemos tener actividad catalítica
• No modifican la estructura de la enzima
• Solo produce cambios en los parámetros: KM y Vmáx
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2. NO COMPETITIVA
• El inhibidor se une a un sitio distinto del sitio activo, provocando una prematura
saturación de la enzima
• El sitio activo queda libre para el sustrato
• El KM NO SE MODIFICA
• Hay prematura saturación de la enzima (con mucho menos sustrato), generando ↓
Vmáx
3. ACOMPETITIVA
• Inhibidor se une al complejo enzima – sustrato
• Inhibidor espera que el sustrato se ubique en el sitio activo, en este momento se lo
hace un sitio diferente del sitio activo provocando una prematura saturación de la
enzima
REGULACIÓN ENZIMÁTICA
ALOSTÉRICA MICHELIANAS
Curva Sigmoidea Hipérbola
Regulación alostérica Si No
Reguladas por PH, T°, [S], [enzimas], alostérica, PH, T°, [S], [enzimas], zimógeno,
covalente y genética covalente, genética y
compartimentalización
4. Covalente
• Unión covalente de grupos fosfatos a aminoácidos serina, treonina, tirosina
• Enzima es proteína → aminoácidos → biomoléculas
• Enzima: dejan los oxidrilos libres → desfosforilados
• Enzima: con los oxidrilos unidos → fosforilada
• El proceso de fosforilación o desfosforilación modifica la estructura de la enzima,
aumenta o disminuye su actividad
• Fosforilación: KINASA → enzima que acelera ese proceso
• Desfosforilación: FOSFATASA → aumenta la actividad
5. Genética
• Gen: en el núcleo celular
• Transcripción: copiar 1 de las hebras de ADN, formar ARNm
• Todo gen tiene una región reguladora
• Inductores: estimulan la transcripción de genes
➢ ↑ producción de ARNm, ↑ síntesis de proteínas
• Represores: inhibe la transcripción de genes
➢ No sintetiza ARNm, no hay síntesis de proteínas ni actividad enzimática
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- Los canales pueden estar abiertos o cerrados según si el receptor ha sido activado por la unión de un
ligando específico o por un cambio en el potencial eléctrico transmembrana
- OPERADOS POR LIGANDO:
RECEPTORES IONOTRÓPICOS
- Son canales donde su apertura y cierra depende de la interacción de un mensajero químico con su
receptor específico que está presente en el canal
- Características:
• Receptores forman parte del canal
• Interacción con el ligando produce un cambio conformacional en la estructura del receptor,
permitiendo el flujo transitorio de un ion a favor del gradiente
• La respuesta puede ser excitatoria conduciendo a despolarización de la membrana o
inhibitoria originando una hiperpolarización de la membrana celular
- Ligandos:
• Acetilcolina: abre canales de Na+, permite su ingresso al interior celular
➢ El ingreso provoca la despolarización de la membrana, generando una respuesta
excitatoria
➢ Esto ocurre cuando la acetilcolina estimula la contracción muscular
• GABA: neurotransmisor
➢ Provoca la apertura de canales de cloruro, que ingresan a la célula
➢ Genera hiperpolarización de la membrana, generando una respuesta inhibitoria
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∆G: cabio de energía libre: energía capaz de realizar trabajo durante una reacción a
temperatura y presión constantes
∆H: entalpía: contenido de calor de un sistema de reacción
∆S: entropía: expresión para el desorden del sistema
- Variación de ∆G:
∆G = 0 → equilibrio
∆G > 0 → endergónica (consume energía)
∆G < 0 → exergónica (libera energía)
- H: entalpía
∆H > 0 → endotérmica (absorbe calor)
∆H < 0 → exotérmica (libera calor)
- S: entropía
∆S > 0 → aumenta entropía
∆S < 0 → disminuye entropía
- Más favorable: ∆G < 0 → espontánea, exergónica, sin necesidad de intervención externa
∆H < 0 → libera energía
∆S > 0 → aumento de entropía
REACCIONES ENDERGÓNICAS
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- Estas reacciones utilizan moléculas de alta energía y necesitan una molécula de ATP
- Compuestos de alta energía:
• Caracterizan por tener uno o más enlaces químicos de alta energía que la liberan a través del
catabolismo
• La energía liberada cuando se rompe los enlaces puede ser almacenada o transferida a otras
moléculas
• ATP: es el principal almacenamiento de energía, es energía potencial
➢ Energía está en las uniones fosfoanil
➢ Con la energía potencial puedo: hacer anabolismo, contracción muscular, transporte
activo, transmisión de impulsos nerviosos
METABOLISMO
CATABOLISMO
- Fase degradativa
- Las moléculas orgánicas de los nutrientes se convierten en productos finales simples
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ANABOLISMO
- Fase de biosíntesis
- Biosíntesis de moléculas complejas a partir de precursores simples
- Requiere energía, generalmente en forma de ATP y de poder reductor de NADH, NADPH y FADH2
VÍA ANFIBÓLICA
- Es principalmente catabólica, pero sus intermediarios pueden utilizarse con fines anabólicos
- Ejemplo: ciclo de Krebs
OXIDACIONES BIOLÓGICAS
OXIDAR
REDUCIR
- Ganancia de é
- Ganancia de H
- Pérdida de O
- Disminución de la valencia
REACCIÓN REDOX
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POTENCIAL REDOX
RADICALES LIBRES
- Presentan 1é no apareado
- Altamente reactivas: están buscando el modo se sustraer 1é a otra molécula y recuperar el
compañero del é no apareado
- Formación y neutralización por transferencia de é
- Son inespecíficos: reaccionan contra cualquier sustancia
- Se forman por:
1. Ruptura homolítica de un enlace covalente de una molécula normal
• El enlace covalente se rompe
• 1é queda con uno de los átomos y el otro é con el otro átomo
• Quedan con 1é no apareado: radical libre
2. Por la pérdida de 1é de una molécula normal
• Queda el é no apareado y la sustancia con carga positiva porque perdió 1é y alteró
su neutralidad
3. Por la adición de 1é a la molécula normal
• Agrega 1é
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MITOCONDRIA
- Estructura:
1. Membrana externa
• Permeable
• Limita la organela
2. Membrana interna
• Posee crestas
• Permeabilidad selectiva
3. Espacio intermembrana
• Entre ambas membranas
• Ocurre la cadena respiratoria
4. Matriz mitocondrial
• Delimitada por la membrana interna
• Ocurre: ciclo de Krebs y descarboxilación oxidativa del piruvato
PIRUVATO
- Es la descarboxilación oxidativa
- Pierde grupo carboxilo en forma de CO2 y ocurre el proceso oxidativo
- Elementos fundamentales:
Piruvato Acetil – COA
NAD CO2
COASH NADH+H+
- Exergônico: espontâneo
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REGULACIÓN DE LA PDH
- Regulación covalente
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- Carácter anfibólico: principalmente catabólico, tiene intermediarios que por los puntos de fuga
pueden abandonar este proceso catabólico y ser usado en un anabólico
- Balance energético:
1 acetil – COA produce
1 GTP. 3 NADH+H, 1 FADH2
1 GTP = 1 ATP
3 NADH+H+: 3 x 2,5 ATP = 7,5 ATP
1 FADH2: 1,5 ATP
TOTAL: 10 ATP
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CADENA RESPIRATORIA
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COMPLEJOS
I II III IV
NADH deshidrogenasa Succinato Citocromo b, c1 Citocromo a, a3
Cofactor FMN deshidrogenasa
Cofactor FAD
COMPLEJO I
COMPLEJO II
COENZIMA Q O UBIQUINONA
COMPLEJO III
- Q-citocromo C oxidorreductasa
- Contiene citocromos b, c1 y centros Fe-S
- El primero que recibe son electrones de la coenzima Q, es el citocromo b, que va tener hierro en
estado férrico que pasa a ferroso
- Luego, envía los é a la ferrosulfoproteína, entonces, su hierro vuelve a férrico y el hierro de la proteína
se transforma en ferroso
- Vuelve a ser férrico, el hierro de la proteína, y envía los é al citocromo c1, que transforma su hierro
férrico a ferroso
- Vuelve a ser férrico, cuando envía los é al citocromo C
- Los protones son bombeados al espacio intermembrana
CITOCROMO C
COMPLEJO IV
INHIBIDORES DE LA CADENA
LANZADERAS
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FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
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BIOMARCADORES
MIOGLOBINA
- Hemoproteína
- Función: almacenar oxígeno
- Daño en el miocardio o MEE: ↑ sus niveles en el plasma
TROPONINAS CARDÍACAS
LACTATO DESHIDROGENASA
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FOSFATASAS
- Fosfatasa alcalina
• Enzima no específica, PH óptimo 9 – 10
• Aumenta drásticamente en enfermedades óseas
• Las isoenzimas de células epiteliales de canalículos biliares representan 10%
• En ictericias obstructivas por litiasis o cáncer de cabeza de páncreas aumentan 10 – 20 veces
• La isoforma de origen hepática representa 25%, un aumento de 2 – 3 veces se observa en
enfermedades hepáticas como: hepatitis viral, alcohólica o carcinoma hepatocelular
- Fosfatasa ácida
• PH óptimo 4 – 6
• Se encuentra en células prostáticas, GR, GB, plaquetas
• Aumenta en cáncer de próstata
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