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Todos estos aminoácidos tienen en común un grupo carboxilo y un grupo amino unido
al mismo átomo de carbono llamado Cα y las dos valencia restantes están unidas a un
átomo de H y a un radical R. R es una cadena lateral, y que es lo que diferencia un
aminoácidos de otro.
Todos los aminoácidos excepto uno, la glicina, tiene el Cα asimétrico, que está unido a
4 sustituyentes diferentes, lo cual le confiere la propiedad de presentar isómeros
ópticos o estereoisómeros.
Todos los aminoácidos que forman parte de las proteínas pertenecen a la serie L, no se
conoce ningún aminoácido que pertenezca a la serie D que forme parte de las
proteínas.
- Aminoácidos con R polar neutro: La polaridad puede venir por grupos OH,
amidas, un aminoácido con un resto fenol y uno con azufre, fuera de la
cadena dando polaridad ya que es un poco ácido, dando puentes disulfuro
por oxidación.
El grupo COOH- se desprotonan antes porque el pKa1 es más bajo que el pKa2
(pKa del grupo –NH3+). Una vez desprotonado el COO-, se siguen añadiendo
bases y se desprotonan el amino, pero esto ocurre muy por encima de 7.
Los aminoácidos son anfolitos pues tienen un pKa y un pKb tiene dos grupos
ionizables y estudiamos el del COOH hasta llegar al punto isoeléctrico y a partir
de él estudiamos el del - NH3+. Tenemos:
La carga neta de un aminoácido por tanto depende del valor del pH al que se
encuentra, como no hay dos aminoácidos con los mismos pK, tampoco hay dos
aminoácidos que tengan la misma carga neta al mismo pH. A pH fisiológico, la
mayor parte de los aminoácidos están en forma neutra (monoamino –
monocarboxilo). Las curvas de valoración de los aminoácidos con grupos
ionizables se comportan de forma distinta,
3. FORMACIÓN DE UN PÉPTIDO
- Son polares.
- Son planos.
Las cadenas polipeptídicas están formadas por planos peptídicos que giran por
sus Cα. Los ángulos de torsión se definen de 180° cuando la cadena
polipeptídica es plana y en su conformación totalmente extendida. Se
encuentra estabilizada por resonancia y el enlace peptídico es plano (no puede
rotar).
Las proteínas deben ser muy extensas. La organización proteica tiene distintos
niveles:
o Diagramas de Ramachandrán:
Estos dos tipos de estructuras secundarias son regulares ya que los ángulos
de torsión van girando lo mismo uno en relación con el otro.
Puentes de hidrógeno.
Interacciones iónicas.
Interacciones hidrofóbicas.
Fuerzas de Van der Walls.
- Según su función:
o Enzimas.
o Proteínas de transporte:
Hemoglobina (O2).
Ovoalbúmina.
Caseína.
o Proteínas contráctiles:
o Proteínas estructurales:
o Proteínas de defensa:
Fibrinógeno y trombina.
Toxinas y Venenos.
o Proteínas reguladoras:
Hormonas.
Proteínas G.
- Según su composición:
- Según su estructura: