1.

Transiciones y transversiones

2. Hotsopts

Sitios calientes, donde se producen multiples mutaciones. Los microsatélites son secuencias cortas de
ADN que son más propensas a sufrir mutaciones. Por el ejemplo las secuencias CA, donde la maquinaria
tiene dificultades para replicar y sufre “resbalones”. También la desaminación de la 5 metil-Citosina
produce timina

3.
 4. Mecanísmo Mismatch Repair

MutS detecta los apareamientos incorrectos, se une al DNA y

recluta a MutL, que a su vez activa a la MutH que se une (a la
hebra metilada) y corta la hebra no metilada (neo-
sintetizada).   Luego del corte, actúa la UvrD con función
helicasa y la EXO1 degrada el fragmento (100-1000 nt) en
dirección 3´ a 5´. En cambio, la exonucleasa VII o RecJ en
dirección 5´ a 3´. Luego la ligasa y Polimerasa III se encargan
de terminar el proceso. En humanos, MSH (muchas proteínas)
son homologas de MutS y MLH y PMS son homólogas de
MutL. Eucariotas carecen de MutH, porque no tienen cadenas
hemimetiladas. Pol δ y Pol 

5. Enzima Dam

La enzima Dam metil transferasa se encarga de hemimetilar

(es decir, metilada sólo una cadena) la cadena progenitora en
la secuencia 5´-GATC-3´

6. Mutaciones antinaturales del ADN

La desaminación de la C genera un U. También la

desaminación de la 5-metil citosina produce timina

7. Reparación directa del daño

Por fotorreactivación se repara de manera directa el daño de

dímeros de pirimidina. La DNA fotliasa capta energía de la luz
y rompe los enlaces formados entre las pirimidinas.

También la O6-metilguanina elimina por la metil transferasa

el grupo metilo

8. BER

La N-glicosilasa corta el enlace N-glicosídico. La base se elimina y se crea un sitio AP. La AP-endonucleasa
reconoce el sitio AP y elimina el residuo de azúcar. Pol β y ligasa. Hay que tener en cuenta que se tienen
multiples glicosilasas y endonucleasas específicas para cada tipo de daño y nucleótido

9. ¿Cuál es la diferencia entre reparación acoplada a la transcripción y del genoma global?

La diferencia principal, es que la acoplada a la transcripción ocurre cuando la ARN polimerasa detecta
daño en al ADN. Esto es debido a que el TFIIH, tienen como subunidades a XPA y XPD, por lo tanto el
TFIIH abre la cadena de ADN para la transcripción y para la NER (incluso acoplada a la transcripción).
10. Reparación por escisión de nucleótidos

La hidrólisis de ATP promueve la formación del complejo UvrA y

UvrB. El complejo UvrA/B busca dímeros de timina o daño químico
abultado. UvrA la detecta y abandona el complejo. UvrB
desnaturaliza el ADN y forma una burbuja monocatenaria alrededor
de la lesión. UrvB recluta a UrvC y forma un complejo para cortar en
dos sitios alrededor del daño (fragmento de 12nt). La UvrD (helicasa)
separa el fragmento monocatenario del dúplex. Luego DNA Pol I y
ligasa rellenan el espacio vacío.

XPC (homólogo de UvrA)

XPA y XPD (homólogas de UvrB) 
RPA (proteína de unión a monocadenas)
ERCCI-XPF corta en 5´ y XPG en 3´ (endonucleasas homóloga a
UvrC).

Pol sigma y delta

11. Reparación por homólogos recombinantes

RAD51 (estabilizada por RAD51B, RAD51C, RAD51D, XRCC2 y XRCC3) se une al ssDNA que queda en los
extremos, sintetiza y liga dos uniones de Holliday que luego serán resueltas por resolvasas. Puede
quedar un fragmento en el extremo 3´ que es resuelto por MUS81-EME1 o TOP3-RECQ.

En procariotas:
RecA y RecBCD (helicasa/nucleasa)
En eucariotas:
RAD51 (homóloga de RecA), RAD51C, RAD51D, XRCC2 y XRCC3.
MUS81-EME1 o TOP3-RECQ (resolvasas).

Pol sigma y delta

12. Reparación por extremos no homólogos

Los heterodimeros Ku70-Ku80 se unen a los extremos rotos de DNA y reclutan a DNA-PKcs. Está recluta
a Artemis, que se activa por fosforilación y con actividad exo y endonucleasa procesa los extremos para
que el complejo ligasa IV, XRCC4 y Cernunnos-XLF unan ambos extremos.

En procariotas:
proteína Ku y una DNA ligasa
En eucariotas:
Ku 70, Ku 80, DNA-PKcs, Artemis, XRCC4, Cernunnos-XLF y ligasa IV
Pol u