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CURSO 2023/2024
Organismos transgénicos
Para eliminar las malas hierbas tengo que añadir herbicidas(glifosato) así que haré plantas
resistentes a herbicidas. Introduzco el gen (en un plásmido) de una enzima que degrada el
glifosato, a su vez en una bacteria que infectará a la planta y ya tendre una planta
transgénica y podré añadir herbicidas a las plantas. También podré añadirles genes que
codifiquen toxinas para resistir ante los insectos. De esta forma se podrían llegar a crear
vacunas comestibles mediante las plantas transgénicas y los genes humanos patológicos.
MODELO EN PROCARIOTAS
1. Apertura de la doble hélice por DNA helicasa y estabilización por proteínas SSBPs
(burbuja de replicación).
2. La apertura aumenta la tensión en el resto de la estructura que es relajada por la
DNA girasa (un tipo de DNA topoisomerasa).
3. La replicación se lleva a cabo en ambas direcciones de la burbuja de replicación.
4. La DNA primasa (actividad RNA polimerasa) junto con otras (primosoma) sintetiza
un cebador de RNA de 10 a 12 nucleótidos.
5. La DNA polimerasa III añade nucleótidos en dirección 5’-3’ en ambas hebras.
6. La síntesis es en dirección 5’-3’ comienza en un punto y las cadenas son
antiparalelas, por ello en una hebra la síntesis será continua y en la otra discontinua
(en fragmentos de Okazaki de 1.000 a 2.000 nucleótidos).
7. Los cebadores RNA se eliminan y se sustituyen por DNA por la DNA polimerasa I, el
enlace final es sellado por la DNA ligasa.
(para mayor comprensión en las últimas páginas se encontrará la explicación del proceso
estudiada en bioquímica)
El genoma bacteriano es circular por lo que solo tiene un origen de replicación (oriC) y se
comienza a replicar en los dos sentidos. El genoma del virus, tambien circular, en cambio se
replica en un único sentido.En el genoma de eucariotas hay múltiples origenes de
replicación y se realiza en ambas direcciones.
Replicación en eucariotas
1. El modelo general es similar
2. Tenemos mucho más DNA y unido a proteínas
3. Debe haber una disociación de las histonas y ser un proceso unido a la síntesis de
éstas
4. Mayor número de polimerasas y tipos (alfa, delta, epsilon, gamma…)
5. Muchos orígenes de replicación (25000 en mamíferos)
6. La velocidad de síntesis es inferior pero la velocidad de replicación global es
superior
7. Fragmentos de Okazaki menores (100-150 bp frente a 1000-2000 bp)
8. Problema importante: naturaleza lineal del genoma de eucariotas →
¿Qué es un gen?
Un gen es una enzima, una proteína, una cadena polipeptídica.
Por definición, un gen es el segmento de DNA necesario para codificar un producto
funcional. RNA maduro o polipéptido funcional. En mucha gente ha recalado que el gen es
un segmento de DNA que codifica para una proteína pero eso no es del todo correcto.
Un gen es la unión de secuencias genómicas que codifican un conjunto coherente de
productos funcionales potencialmente solapantes.
Sintesis de RNA
Proceso muy regulado
El RNA siempre se sintetizará en sentido 5’-3’
La síntesis de semejante a la de DNA pero con NTPs en lugar de dNTPs y U en lugar de T
Si tengo un DNA y lo abro en un punto con sus dos cadenas antiparalelas ¿cual es la
cadena que se copia? La cadena de abajo (la de sentido 3’-5’) y la síntesis irá sentido 5’-3’.
Es igual a la cadena de arriba este nuevo RNA solo que donde hay timinas en una habrá
uracilos en la otra.
La síntesis la cataliza una RNA-polimerasa que no necesita cebador inicial y no tiene
capacidad correctora.
- procariotas: una enzima, varias subunidades
- eucariotas: tres y mayor número de subunidades
1. RNA polimerasa I, síntesis de RNA (salvo SS)
2. RNA polimerasa II, síntesis de RNAm y RNAsn
3. RNA polimerasa III, síntesis de RNAt y RNAr
(modelo en procariotas)
(modelo en procariotas)
En eucariotas:
(procariota vs eucariota)
- Existe una mayor regulación
- El transcrito de pre-RNAm inmaduro que debe modificarse y salir del núcleo para ser
traducido
- Los RNAm procariotas pueden ser policistrónicos (contienen información de más de
un gen, es decir, al transcribirse un mismo RNA tendría información para varios
productos) en eucariotas suelen ser monocistrónicos (con información para un
producto)
- En procariotas (izquierda), la mayor parte de los genes codifican una sola molécula
de RNAm que contiene más de un ORF (o cistrón) para su traducción (son
policistrónicos). Los distintos ORFs codifican proteínas de distinta secuencia
aminoacídica y función, aunque algunas veces esta función esté relacionada en la
misma vía metabólica o reguladora (operón)
- En eucariotas (derecha), la mayor parte de los genes transcritos por la RNA
polimerasa II son monocistrónicos, pero la mayor parte son capaces de codificar
más de un RNAm mediante su procesamiento alternativo. La figura muestra el
procesamiento alternativo de un exón cassette (que puede estar o no estar en el
producto final), que da lugar a dos RNAm y proteínas similares pero no idénticas
(modelo en eucariota)
Maduración alternativa
¿Para qué voy a sintetizar un proceso de 20000 nucleótidos si voy a eliminar la mitad
mediante splicing? La razón es que puede haber algunos exones que se utilicen en algunas
circunstancias sí y en otras no. Es decir, que un gen pueda dar a varias proteínas. A partir
de la misma secuencia genética puedo tener distintos productos, distintas isoformas. Esto
debería estar increíblemente regulado y cada célula debería saber si dar la isoforma 1, la
2….
La distrofia muscular de Duchen → Falta de una proteína llamada distrofina. El niño a partir
de los primeros movimientos empiece a andar muy mal y rara vez pasa de los 20 años. Hay
casos en esta enfermedad que lo que les pasa es que les falta el exón 50. En la traducción
al cambiar un exón se corre toda la lectura y aparece un codón de parada que hace sea
incompleto. Se descubrió la tecnología exon skipping….. (volveremos a ello)
Edición de RNA
Existen situaciones en las que el RNA que se me produce en alguna posición tiene bases
distintas al DNA del que proviene. El codón 153 es CAA en el higado pero en el intestino es
UAA. Cambios en la secuencia una vez se ha formado el RNA.
- Proceso por el cual se producen cambios en la información en el RNAm a través de
RNA guías (complementarias al RNA preeditado) mediante
─ la adición o deleción de nucleótidos o
─ cambios químicos de nucleótidos
- Esto provoca que la secuencia de RNAm no es exactamente la complementaria del
DNA del que proviene
- Es un proceso específico de determinadas células o tejidos
- Se produce en RNAm, RNAt, RNAr de un amplio espectro de organismos
Edición del DNA vs edición del RNA → LA edición del DNA es modificación del material
genético y si esto pasa todos los descendientes tendrán esta modificación (si afecta a linea
germinal). Si lo quiero hacer para curar enfermedad genética deberia ser en estado
embrionario.
Se está trabajando en modificar el mensajero de una proteína mala. Sería un efecto mejor
que el anterior porque no afectará a linea germinal.
RNAr
Los ribosomas son diferentes en eucariotas y procariotas, su estructura básica es la misma
solo que en procariotas es 30S y 50S (ribosoma de 70S) y en eucariotas 40S y 60S
(ribosoma de 80S). Los ribosomas están formados por RNA. Los ribosomas contienen el
80% de todo el RNA celular y el 10% de las proteínas de la célula. Tenemos muchos genes
de RNA ribosomal pues necesitamos mucho. Los genes RNAr forman bloques repetidos en
tándem (transcritos por la RNA polimerasa I, 5S RNA polimerasa III). En el hombre se
encuentran en los extremos de los cromosomas 13, 14, 15, 21 y 22; y 5S en el
cromosoma1. Los RNA son moléculas muy largas que se pliegan.
RNAt
Los RNAt son moléculas
adaptadoras o lectoras que
transportan los aminoácidos,
pequeñas (74-95 nt), con una
estructura 2ª en trébol y con bases
nitrogenadas únicas
(modificaciones químicas
posteriores a la transcripción
(eliminación del intrón de 5’)).
Cada organismo sintetiza varias
moléculas de RNAt distintas en
función de la secuencia en el
anticodón y el aminoácido que
transporta; para que sean
funcionales deben sufrir un
proceso de activación. Sus genes también se encuentran en varias copias y son transcritos
por la RNA polimerasa III .El anticodón se va a poner encima del mensajero. HAy 61
distintos y son transcritos por RNA polimerasa 3. En función del anticodón introducirá una
enzima un aa distinto.
Traduccion
─ La síntesis proteica ocurre asociada a los ribosomas, los aminoácidos son transportados
al ribosoma por los RNAt
─ Existe complementariedad de bases entre la secuencia del codón en el RNAm y la
secuencia del anticodón del RNAt
─ El RNAm es traducido en dirección 5’ a 3’; la proteína se sintetiza en dirección extremo-N
(amino) a extremo-C (carboxilo)
─ En eucariotas el proceso está más regulado, los ribosomas son mayores y los RNAm
tienen una mayor vida media
Etapas
1. Inicio: se requieren factores de iniciación proteicos (IF) y la secuencia Shine-Dalgarno
(-10, AGGAGG) en procariotas y estructura cap y secuencia Kozak en eucariotas. Un poco
después, auna determinada distancia se encuentra el codón de inicio. TAnto en procariotas
como en eucariotas el ribosoma se sienta (primero una subunidad y después la otra) en la
secuencia citada, conociendo así pues a partir de donde comenzarán la traducción. Al
acoplarse todo esto se crean los sitios peptídicos y aminoacídicos. El codón de inicio en
primer lugar se pega un RNAt que lleva formilmetionina o metionina. Sobre eso va la
sububnidad mayor y se forman los sitios peptídicos y aminoácidos. Entraría un nuevo tRNA
complementario al codón que hay, y se transfiere la metionina al aminoácido siguiente. El
ribosoma va avanzando, la cadena salta al sitio peptídico y entraría un nuevo tRNA en el
sitio aminoacídico
2. Elongación: Se requieren factores de elongación proteicos (EF) y se forman los sitios
peptídico (P) y aminoacídico (A). Se generan 3 sitios.
3. Terminación: Se requieren factores de terminación proteicos (TF) y depende de los
codones de terminación sin RNAt complementario (sitio E). Una vez llegue el codón de
parada no hay tRNA que se pegue. No pasa la cadena al sitio E y se desmonta todo.
Antibióticos
Las tetraciclinas se unen al sitio A de los ribosomas procariotas (30S) bloqueando la
entrada de los RNAt.
La estreptomicina se une a la subunidad menor del ribosoma procariota (30S) inhibiendo el
inicio
El cloranfenicol se une a la subunidad mayor del ribosoma procariota (50S) bloqueando la
formación del enlace peptídico
La neomicina se une a un sitio cercano al A (subunidad 30S) provocando errores en la
unión ARNAt
Terapia anticancerosa: La puromicina se asemeja al extremo 3’ de un RNAt cargado, entra
en el sitio A de un ribosoma e inhibe la entrada de otros RNAt y la elongación de la cadena
polipeptídica tanto en eucariotas como en procariotas (terapia oncológica)
Nos encontramos con un codón de parada y el complejo se llena con una serie de proteínas
que provocan que se desmonte. UTR→ region untranslated, una va a ser 5’UTR (antes del
codón de inicio) y la otra 3’UTR (después del codón de parada). En la región 5’UTR van a
llegar miRNA que rompen el RNAm. LA traducción puede ser de un RNAm por varios
ribosomas distintos, los poliribosomas.
Proteínas
1. Estructura primaria: secuencia de aminoácidos determinada por la secuencia del RNAm a
través del código genético
2. Estructura secundaria: plegamiento de la cadena polipeptídica resultado de interaciones
electrostáticas, etc. (hélices alfa y láminas beta)
3. Estructura terciaria: conformación tridimensional en función de los grupos funcionales
aminoacídicos
4. Estructura cuaternaria: resultado de la asociación entre polipéptidos, etc.
- Modificaciones post-traduccionales
a. Modificación o eliminación de aminoácidos en el extremo N-terminal
b. Modificación de otros aminoácidos
c. Unión de carbohidratos
d. Eliminación de ciertos segmentos
e. Eliminación de secuencias señal
TEMA 3 ORGANIZACIÓN GENÓMICA
EN VIRUS Y BACTERIAS -
RECOMBINACIÓN Y
CARTOGRAFIADO GENÉTICO
Genoma → Conjunto del material genético de un organismo u orgánulo (mitocondrias o
cloroplastos).
Para tener vida libre, el número mínimo de genes de una bacteria de vida libre son 1500.
Bacterias y virus
Cultivo sencillo en el laboratorio y reproducción muy rápida y asexual (cepas geneticamente
puras, iguales)
Genomas pequeños y facilmente aislables y manipulables.
Una copia (haploide) → Esto hace que las mutaciones se expresan siempre, algo que no
pasa en los diploides.
Importancia como agentes infecciosos y agentes productores de biomoléculas de valor
comercial modificables mediante ingeniería genética.
La célula eucariota se diferencia de la procariota en la presencia de compartimentos
internos: a nivel genético el genoma está fragmentado, fundamentalmente en el nucleo y
algo en otros orgánulos en el caso de eucariotas, en el caso de procariotas el genoma no
está fragmentado y se encuentra en el nucleoide y en los plasmidos
Genoma bacteriano
El genoma del nucleoide es enorme con respecto a lo que es la bacteria y está
superenrrollado formando bucles y demás. Tienen una serie de proteínas para el andamiaje.
Hay cepas de E.coli muy variadas, pueden tener hasta 5 millones y medio de nucleobases y
se siguen denominando E.coli. Hay muy poco genoma que no tenga función, pero la mitad
de su genoma no se conoce su función.
Plásmidos
Los plásmidos son pequeñas moléculas de DNA bicatenario circular que pueden estar o no.
Tienen una existencia independiente al DNA del nucleoide (aunque los episomas pueden
insertarse en él) presentando así un origen de replicación, suelen llevar uno o varios genes
utiles para la bacteria (aunque no esenciales) y tienen capacidad de autorreplicarse. Por
ejemplo: tienen el gen de las beta-lactamasas, un gen de resistencia a los antibióticos
beta-lactámicos. No son indispensables para la vida de la bacteria. Algunos de estos
plásmidos han sido utilizados como vectores, engañaremos a la bacteria, cojo un plásmido,
lo abro, meto el gen que me interesa y vuelvo a introducir el plásmido.
Los plásmidos integrativos o episomas pueden integrarse (y escindirse) del genoma del
nucleoide y copiarse junto a él.
- Todos los plásmidos tienen número de copia, número de veces que se puede
replicar
- Hay plásmidos incompatibles→ determinados plásmidos pueden ser incompatibles
entre sí en la misma célula, hay grupos de incompatibilidad
- Espectro de infectividad propio. Hay plasmidos de E.coli que podré usar en E.coli
pero no en Salmonella.
Sistemas genéticos de inmunidad bacteriana
1. Sistema de restricción-modificación → Sistema de defensa frente al DNA exógeno
que tiene el 25% de las bacterias. Se asemeja a un sistema de inmunidad innata.
Frente a un genoma extraño, la bacteria lo reconoce como extraño y lo corta
mediante una enzima de restricción (endonucleasa), lo reconoce como extraño por
un patrón de metilación, el DNA está metilado en determinadas partes que son
reconocidos. Cuando entra un genoma extraño con una diana no metilado la enzima
corta este genoma, si estuviese metilado no lo reconocería. Las endonucleasas
cortan este DNA por secuencias específicas palindrómicas de 4-6 bases, son
herramientas en ingeniería genética.
2.Sistema CRISPR /Cas →
Es un sistema de inmunidad
adaptativa frente a ácidos
nucleicos extraños. Frente a
una previa infección la
bacteria va a reconocer una
nueva infección debido a que
habrá generado unos
‘’anticuerpos’’. Se adquieren
secuencias genéticas de
organismos que hayan
infectado a una bacteria
antecesora suya o a ella
misma. Un fago inyecta su
genoma que infecta a una
bacteria pero algunos trozos
del genoma son reconocidos
por alguna proteina de la
bacteria. Este trocito tendrá su homólogo en una secuencia de la bacteria y la
bacteria generará una especie de ‘’anticuerpos’’, así pues el genoma del nuevo virus
será roto por esta enzima CRISPR-Cas. La edición de genomas in vivo mediante
CRISPR/Cas9 se lleva a cabo con el sistema de tipo II que incluye Cas9, CRISPR
RNA (crRNA), crRNA transactivador (tracrRNA) y un DNA molde para la reparación
VIRUS
Los virus no tienen metabolismo propio y tienen dos componentes básicos
- Cápside: Proteína que adopta distintas formas. Icosaédrica, filamentosa - helical,
cabeza y cola
- Puede rodearse de una membrana lipídica, la envuelta, proveniente de la célula
hospedadora.
- Acidos nucleicos: DNA o RNA, mono o bicatenarios (tener una hebra o dos hebras
en doble helice), no tienen genomas circulares, sino genomas fragmentarios.
Tipos
- DNA monocatenario → Una sola hebra. Suelen convertirse a genomas bicatenarios
en el hospedador. Bacteriofagos phix 174 y M13
- DNA bicatenario→ Adenovirus, virus Epstei-Barr, bacteriófago lambda
- RNA monocatenario→
a) Sentido + : Con la misma secuencia que el RNA codificante; dentro de la
célula puede traducirse directamente (HCV)
b) Sentido - : Con la secuencia complementaria al mRNA; requiere una
polimerasa para convertirlo a éste (generalmente presente en el virión
infectante). Influenza
c) Ambisentido: Mezcla de ambas (arenavirus)
- RNA bicatenario → Rotavirus
Los más sencillos son los bacteriófagos. Generalmente tienen pocos genes, cuantos más
genes, ciclos más complejos y pueden existir genes solapados, es decir que la misma hebra
contenga información para varios genes distintos, depende de donde se empiece a leer la
hebra darán un mensaje u otro (nosotros tenemos alguno en el genoma mitocondrial).
TIenen dos ciclos (pueden ser a la vez)
- Ciclo lítico: El fago infecta a la bacteria con su material genético, pasan unos
minutos que parece que no ocurre nada, pero se está haciendo toda la maquinaria
transcripcional y traduccional. La bacteria se replica continuamente su genoma y
produciendo proteínas de su cápside, hasta que la bacteria estalla y libera miles de
viriones
- Ciclo lisogénico: Se inserta en el genoma de la bacteria, en el genoma bacteriano.
La bacteria al replicarse, replica tanto su genoma como el del profago (bacteria
lisogenizada), y en un momento determinado puede hacer que el propio virus se
escinda y entre en ciclo lítico, soltando viriones
Virus HIV
El virus HIV es un virus RNA. El HIV 1 tiene dos copias idénticas de un genoma RNA
monocatenario de polaridad negativa de aprox 10000 nucleótidos. Produce 9 transcritos que
codifican 15 proteínas. CAda transcrito codifica varias cosas distintas.
- En transcrito gag codifica cuatro proteínas estructurales
- El transcreito pol codifica tres enzimas (proteasa, transcriptasa inversa e integrasa)
- Los transcritos tat y rev se produce por splicing alternativo y controlan la expresión
Retrovirus que al entrar en la célula
se fusiona la célula y el RNA se copia
a DNA. Este DNA entra en el nucleo
y se inserta en un cromosoma de la
célula hospedadora. Una vez dentro,
produce sus RNA y se lleva a cabo la
reproducción del virus que va dando
viriones que llegarán a otras células.
Esta transcripción de RNA a DNA es
gracias a la transcriptasa inversa.
Hay individuos inmunes al HIV, tienen
una mutación en uno de sus
receptores que les salva de
infectarse.
Influenza A
El segundo virus muy interesante es el virus INfluenza A. El genoma de este virus es RNA
monocatenario de polaridad negativo fragmentado. Está formado por 13600 nucleótidos en
8 moléculas de RNA monocatenario de polaridad negativa. SOn importantes la
hemaglutinina de la membrana que deterimna que especie será infectada y la
neuraminidasa que es responsable de la salida del virus durante la infección. Cada uno de
ellos al entrar ha de pasar a RNA positivo y traducirse. El genoma no se inserta en el
cromosoma de las células
Ébola
Es un RNA grande. Tenemos una cápside filamentosa y dentro una molécula de unos 20000
nucleótidos del mismo tipo del anterior. Generalmente el ébola no causa pandemias debido
a su alta mortalidad, pero ahora se está adaptando a la especie humana causando menos
mortalidad y aumentando su transmisión.
SARS-COV 2
Pertenece a los coronavirus. Son 30000 nucleótidos y una molécula de RNA de polaridad
positiva. Tiene una membrana lipídica que si la eliminamos eliminamos el virus. El
SARS-COV2 interactua con un receptor de la membrana celular llamada ACE2. Una cepa
mutante solo va a generar infección cuando el individuo con la cepa mutante infecta a otro
individuo, si en mi se dan dos mutaciones y yo no contagio a nadie, esas dos mutaciones se
acaban en mi.
Virus DNA
Los virus DNA son mayores y hay algunos que tienen incluso más genes que algunas
bacterias. Existen virus gigantes que pueden ser infectados por otros virus. Un ejemplo es la
acanthamoeba
Viruela del mono: Es uno de los virus más grandes y complejos. El virión contiene al menos
80 proteínas virales. Su replicación ocurre en el citoplasma.
Recombinación genética en
fagos
Tenemos un fago que es
mutante para el gen r pero no
para el h y otro que lo es para
el gen h pero no para el r. Si
estos se encuentran en un
organismo se comenzarán a
replicar y en un momento
darán una recombinación entre
cromosomas cercanos.Es una
recombinación muy
infrecuente. El valor de la
frecuencia de recombinación
es proporcional a la distancia
entre ambos genes
La estructura de un gen
─ Al poder analizar gran cantidad de descendientes será posible observar recombinantes
muy raros (entre posiciones muy cercanas, recombinación intragénica).
─ Esto permitió el análisis detallado de la localización de diversas mutaciones DENTRO de
un gen → análisis de la estructura del locus rII del fago T4 que llevó a determinar que rII era
subdivisible en >300 lugares mutables
Cojo un cultivo de E.coli B y muchos fagos de los dos tipos lo que me asegura que en estas
bacterias se darán recombinaciones. Ambos fagos individualmente no pueden lista a la
E.coli K12, echaremos los fagos nuevos a unas placas con K12 y observamos lo que
ocurre. Solo los fagos recombinantes con el genotipo silvestre (sin mutaciones) pueden lisar
E. coli K12
Complementación
− Dos fagos se complementan cuando tienen
mutaciones en genes diferentes (pueden
coinfectar E. coli K12)
− Dos fagos no se complementan cuando
las mutaciones afectan al mismo gen (no
pueden coinfectar E. coli K12)
Lo que decubrió es que no participaba un
gen, sino dos, lo denominá cistrón (unidad
genética más pequeña (sinónimo de gen, en
ese momento pensaban que rII era un solo
gen; en realidad son dos genes). Si los dos
fagos no pueden dar esta lisis, no se complementarán y tendrán la mutación en el mismo
cistrón.
Permite determinar si dos mutaciones distintas afectan al mismo gen o no
No complementan→ mutaciones en mismo gen
Complementan → mutaciones en genes distintos
Prueba de deleción
Dos moléculas de DNA con mutaciones en la misma posición (ej: una deleción y una
mutación puntual) no podrán generar una molécula de DNA sin mutación por
recombinación. Esto permite localizar de manera aproximada la situación de las
mutaciones.
Tengo un fago cuya mutación desconozco su ubicación pero se que recombina solo con los
fagos 6 y 7. LA unica zona que tienen esos fagos y no el siguiente es la A5. Paso al
siguiente nivel y repito el proceso con el fragmento A5 y observo que la mutación está en
A5c…
1. Dio sentido físico a la unidad abstracta gen → dijo que estaba formado por unidades
mutacionales que a día de hoy sabemos que son los nucleótidos
2. Demostró que un gen no es una partícula indivisible sino que está formada por unidades
mutacionales puestas en un orden determinado linear (secuencia de nucleótidos)
3. También propuso que existían distintas clases de mutaciones
Hay puntos que mutan muy frecuentemente, se llaman puntos calientes mutacionales. El
98% de los pacientes de una patología? con tienen una mutación en un determinado
nucleótido de un determinado gen. De la misma manera que encontramos puntos calientes
hay zonas en las que no hay mutaciones, estoy es porque hay mutaciones que hacen que el
virus no sea viable, probablemente esta zona codifique una zona muy importante para el
metabolismo del virus.
TEMA 4 GENOMA DE EUCARIOTAS
Todas las células de nuestro organismo tienen el mismo genoma pero tenemos algunas
especializadas que se comportan de manera distinta, pero con el mismo libro de
instrucciones, cada célula lo leerá de una manera. En eucariotas, por tanto, una misma
información genética conduce a una diversificación de tipos celulares y una especialización
de funciones.
Genoma humano
El genoma humano es el conjunto de moléculas de DNA presentes en cada una de las
células del cuerpo humano.
El genoma nuclear es el 99,9995% de la información, el resto 0,0005% en la mitocondria.
a) Nuclear: Dividido en 46 cromosomas. En la mayoria tendremos dos copias del gen,
uno de la madre y otro del padre porque somos diploides. Son moléculas lineales.
b) Orgánulos: Es similar al de procariotas, genoma de moléculas circulares. La célula
somática tiene entre 100 y 1000 mitocondrias, dentro de cada mitocondrias podemos
tener entre 2 y 10 copias de genoma mitocondrial. Este genoma se hereda por parte
materna. Cuando hablamos de genoma mitocondrial hablamos de mtDNA.
Fecundación
Tenemos dos individuos de género contrario, una mujer con 46 cromosomas (22 parejas de
autosomas y una de cromosomas sexuales XX) y un varon con otros 46 (22 parejas de
autosomas y una de cromosomas sexuales XY). Van a producir gametos (óvulos y
espermatozoides) con 23 cromosomas 22 autosomas y uno sexual.Existen dos tipos de
espermatozoides, aquellos con el cromosoma Y y aquellos con el cromosoma X. El
espermatozoide y el óvulo fecundan dando lugar a un cigoto diploide, XY o a uno XX. El
citoplasma del cigoto vendrá del del óvulo (pues en la fecundación se fusionan en realidad
los nucleos), por tanto las mitocondrias del cigoto serán las del óvulo. Esta nueva célula
conforma el nuevo individuo a partir del cual por divisiones sucesivas dará a millones de
células. Al principio se ha dado lugar la meiosis porque el material genético se divide a la
mitad y en el segundo caso se da la mitosis. Gemelos monocigóticos tienen el mismo
genoma, pero no el mismo epigenoma (cada vez más distinto)
Cromatina
A microscopio óptico vemos una masa amorfa que muestra zonas más oscuras y más
claras, esto es la cromatina (cromosomas descondensados), formada por DNA y proteínas.
Características
Lo que tenemos es un cromosoma, que es una molécula larga de DNA empaquetado lo cual
hace que se reduzca mucho su tamaño.
─ La célula humana contiene el genoma nuclear en un núcleo de 5-10 μm de diámetro
─ El genoma haploide (una copia) tiene más de 3,2 x 109 pb distribuidos en 23
cromosomas; una célula diploide contiene dos copias (46 cromosomas). Cada célula
contiene casi 2 m en el núcleo (cada pb mide 0,34 nm)
─ El empaquetamiento debe permitir al genoma realizar sus funciones: cambios en la
estructura de la cromatina
─ En la condensación/descondensación de la cromatina juegan un papel importante la
acetilación, metilación y fosforilación de histonas y la metilación del DNA (procesos
epigenéticos que participan en la regulación de la expresión genética). Los mecanismos
epigenéticos son modificaciones químicas que hacen que la unión con las histonas sea más
o menos fuerte y pueda ejercer o no su función.
Centrómeros
Constricciones primarias en los cromosomas eucarióticos que los divide
en dos brazos.
Los centrómeros son el centro cinético, donde se forman los cinetocoros
responsables de la división celular.
– responsables de la cohesión de las cromátidas hermanas antes de la
división celular
− esenciales para el reparto adecuado del material genético entre las
células hijas en la división celular
Telómeros
Los telómeros son secuencias situadas en los extremos de los cromosomas y tienen
funciones estructurales y funcionales. Indicarán la antigüedad (ya visto), marcan,
dependiendo del número de repeticiones, la edad y el número de divisiones celulares que
aguantaba la célula. Cada vez que hay una división pierde un segmento del extremo.
Los cromosomas se pueden diferenciar por su tamaño, posición de sus centrómeros y una
tinción diferencial, el patrón de bandas (citogenética). Esto último nos permite averiguar la
localización cromosómica del gen (ejemplo→ siete q, dos, tres)
Cromosomas homólogos
Tenemos 46 cromosomas repartidos en 23 parejas de homologos. 22 de ellos no tienen
nada que ver con el sexo, por ello son autosomas, y hombres y mujeres tienen dos de cada
tipo. Tambien tenemos una pareja de cromosomas sexuales, las mujeres XX y los hombres
XY. Un par de cromosomas homólogos tienen los mismos genes, la misma longitud de
cromosoma y la misma posición del centrómero. Todos tenemos el gen del Alzheimer, pero
hay algunos que tienen el alelo que predispone al Alzheimer pero el gen del Alzheimer lo
tenemos todos. Los genes están en una posición del genoma denominada locus, cuyo plural
es loci. Dos cromosomas homólogos tienen los mismos genes pero pueden tener alelos
distintos pudiendo hablar de gen homocigótico o de gen heterocigótico
Plioidía
Concepto referido al número de grupos de cromosomas homólogos. Un individuo con una
carga genética, ese individuo sería haploide (23 cromosomas) Cuando tienen los dos (46)
son diploides, nuestras células somáticas son diploides y los gametos haploides. El número
haploide (n) varía según la especie, el nuestro es 23 pero por ejemplo en los gatos es 19.
Haploide: Un grupo completo de cromosomas distintos formado por uno de cada par de
cromosomas homólogos; la mitad del número diploide Es el número de cromosomas de los
gametos en las especies diploides
Ciclo celular
Es la secuencia ordenada de sucesos en la vida de
una célula somática, se compone de interfase
(cuando no se divide) (G1, S, G2) y división celular
(mitosis). La fase S es la más importante de la interfase en la que se replica el material
genético. La fase preparatoria a esto es la G1, algunas pasan de ahi a la G0 que será
cuando no se van a dividir. Si todo va bien pasa de la G1 a la S. Al final de esto cada
cromosoma tiene sus dos cromátidas hermanas y llega a la fase de G2 que es preparatoria
para la división. Si todo va bien pasa por el checkpoint G2 y llega a la mitosis.
Mitosis
Va a mantener la cantidad de material genético. Las células hijas serán geneticamente
iguales que la madre si entra una 2n saldrán dos 2n. Las células cancerígenas se saltan el
checkpoint y hacen mitosis a lo loco
1. Profase: Los centriolos van hacia los
extremos formándose las fibras del huso. La
cromatina se condensa formando los
cromosomas, y unen a las fibras del huso en los
cinetocoros; la membrana nuclear comienza a
desaparecer
2. Metafase: Los cromosomas se alinean en
el plano ecuatorial y desaparece la membrana
nuclear. Cada uno tiene una fibra del huso que
los organiza.
3. Anafase: Las cromátidas hermanas
migran hacia polos opuestos (la cohesina es
degradada por la separasa) transformándose en
cromosomas. Los centrómeros se rompen y
comienza la citocinesis (división del citoplasma).
Cada una de las fibras del huso tira hacia un polo dando lugar a dos células
hermanas
4. Telofase: Se forman las membranas nucleares, los cromosomas se descondensan y
se hacen progresivamente menos visibles; continúa la citocinesis
Meiosis
División celular en dos fases en los organismos de reproducción sexual que tiene como
resultado la producción de 4 células haploides (n) a partir de una célula 2n (gametos con la
mitad de los cromosomas de las células somáticas) Las cuatro células-hijas son
genéticamente distintas entre sí. Se dan dos divisiones celulares consecutivas. La meiosis 1
o reduccional (partimos de una célula 2n y cuatro homólogos; y acabamos en n
cromosomas y 2 homólogos) y la meiosis 2 o equilibrada (especie de mitosis que mantiene
el número de cromosomas)
Espermatogénesis y ovogéneisis
Un hombre sano puede formar diariamente 200 millones de espermatozoides. A la edad de
25 años para producir un espermatozoide han sido necesarias 310 divisiones celulares, a
los 40 años 610 divisiones. La primera división meiótica en espermatocitos primarios (2n),
dura 16 días y da lugar cada uno a dos espermatocitos secundarios (n) que tras otros 16
días dan lugar cada uno a dos espermátidas (n), que cuando maduran 16 días después dan
lugar al espermatozoide (n). La espermatogénesis tiene lugar de forma repetida a lo largo
de toda la vida del varón Cada uno de los espermatocitos primarios da lugar a un reparto
simétrico del citoplasma en cuatro espermatozoides iguales
Alteraciones en la meiosis:
aberraciones cromosómicas
Pueden surgir células con
composición cromosómica distinta
debido a procesos de mal reparto
de cromosomas. Si este mal
repaerto o no disyunción es
durante la meiosis llegan
individuos trisómicos o
monosómicos. El individuo
posterior puede tener más o
menos cromosomas. 13, 18 y 21
son las tres trisomias viables, la
21 tiene esperanza de vida de 2
años. Es más frecuente en el caso de células cancerosas que salgan células con
composición cromosómica distinta pero esto es debido a la mitosis.
A veces las mitosis inadecuadas dan lugar a individuos con composición genetica distinta
en sus células. Son individuos mosaico, tiene células con distinta composición genética
provenientes del mismo cigoto. ¿Puede haber individuos de distinta composición genética
provenientes de distintos individuos? Sí. En el trasplante de médula ósea se hace una
plasia completa y al cabo del tiempo se hace un seguimiento para saber que determinados
polimorfismos no son los suyos sino los del donante que indica que todo ha ido bien.
Genoma humano
Genoma nuclear → 50 a 60 mil genes. Unos 20 mil codificantes de proteínas (1,1%) y 25 mil
no codificantes de proteínas
Genoma mitocondrial → 37 genes. Todod codifican para RNA y proteinas, sin mucha
regulacion
En nuestro genoma el 4% es RNA y secuencias reguladoras.
El 45% es cromatina condensada cuya utilidad se desconoce y otro 45% son transposones
(genes provenientes de virus y secuencias que se mueven a lo largo del genoma)
Hubo un proyecto que dictó que el 80% de nuestro genoma se transcribía. Que cada gen
codificante tenía de media 6 transcritos. Había transcritos que formaban aparte de varios
genes.
Genoma nuclear
Podemos tener secuencias poco repetidas (1 o 2 veces) y otras repetidas cientos de
veces(caracteriza el genoma humano). Dentro de cada uno de los grupos tenemos DNA
que codifica producto y DNA que no. Dentro del primero encontraremos genes. Dentro del
segundo encontraremos intrones, secuencias reguladoras….
La longitud de un gen medio codificante de proteínas es de 50 mil nucleótidos. Cada gen
tiene aproximadamente 10 exones de una longitud media de 300 nucleótidos.En el genoma
nuclear encontramos un gen por cada 120.000 nucleótidos (poca densidad) y en el genoma
mitocondrial uno por cada 450 nucleótidos (pocos pero compactos).
Genes RNA
El mundo RNA ha evolucionado desde los que se pensaba antes (tRNA, rRNA, mRNA).
Pero este está evolucionando y ahora se han descubierto nuevos tipos de RNA funcionales
hay lincRNA (apagan genes), RNAi….
– Los rRNA 28S, 5,8S y 18S están codificados por una
única unidad multigénica de DNA ribosomal que se
repite en tándem (entre 30-40 repeticiones, 100 genes)
en los brazos cortos de varios cromosomas.
– Hay unos 500 genes de tRNA citoplasmático
clasificados en 49 familias en función de la
especificidad del anticodón. Más de la mitad de ellos
se encuentran en los cromosomas 1 y 6. El 5S
pertenece a tRNA.
─ Varias de las familias de snRNA (small nuclear RNA)
son importantes en la regulación de la expresión
génica (procesamiento post-transcripcional) se unen a
diversas proteínas formando ribonucleoproteínas
(snRNPs). Están implicados en el splicing
– Los miRNA (micro RNAs) son RNAs pequeños implicados en la regulación de la expresión
(interferencia por RNA, tema 06) Muy importantes y posibles herramientas terapéuticas
Puede haber más de 1.000. Se tienen que introducir en el gen.
– Los piRNA (piwi-proteininteracting RNAs) fueron descritos por primera vez en 2006, son
RNA que interaccionan con la proteína piwi. Parece que actúan limitando la transposición
por los retrotransposones en células de mamíferos, también podrían participar en la
regulación de la expresión Hay más de 15.000.
– Los endo-siRNA (short interfering RNAs endógenos) inducen silenciamiento de la
transcripción y regulación de la transposición. Puede haber más de 10.000 Algunos están
relacionados con los pseudogenes
– Hay varios miles de lncRNA (long non-coding RNAs) se definen como los RNAs no
codificantes de proteína mayores a 200 pb (a veces varias kb) Algunos son similares a
mRNAs (con cap, splicing y poliadenilación) pero no se traducen. Otros son transcritos
antisentido que regulan a los transcritos sentido. Otros se encuentran asociados a
complejos modificadores de la cromatina. Tienen papel regulador de la expresión génica
Uno de ellos, el más famoso (XIST) regula la inactivación de un cromosoma X, otros están
implicados en la impronta (esto hace que no sea posible un mundo de mujeres)
DNA repetitivo
El DNA repetitivo también puede ser codificante o no codificante pudiendo estar agrupado o
disperso cada uno de ellos.El DNA repetitivo son bloques que se repiten que pueden estar
agrupadas o dispersas por el genoma. Cuando está una detrás de otras son tandem (como
la defensa en tandem) Las unidades de repetición o secuencias repetidas tienen tamaños
dispersos, pueden estar dispersos por el genoma o agrupados en zonas concretas y el
número de copias repetidas varía entre cientos o miles (DNA moderadamente repetitivo) o
cientos de miles (DNA altamente repetitivo)
DNA codificante
- Genes repetidos en tándem con familias génicas clásicas: Las familias génicas
clasicas o denomnados genes repetidpos en tandem generalmente codifican el
mismo producto. Son copias casi idénticas o con mucha homología. Para las
histonas, se necesita que se generen muchas más, se repite el gen de las histonas
varias veces. Las histonas son una familia, tenemos una secuencia con unas 6
kilobases que está repetido entre 10 y 40 veces en mamíferos. Genes del RNA
ribosómico son otro ejemplo.
Mecanismos de duplicación
Todos estos genes duplicados provienen de mecanismos de duplicación génica durante la
evolución . Si un gen se duplica, una de las copias puede dar el producto funcional y otra
copia sufrir mutaciones para nuevas funciones.
Los genes parálogos se encuentran en el mismo organismo y su semejanza puede ser
debida a que uno procede de la duplicación del otro. Son genes que son una copia del otro
y han evolucionado de forma distinta.
Los genes ortólogos son semejantes por pertenecer a dos especies que tienen un
antepasado común (si estudio un gen en el ratón puedo saber que hace en el humano)
DNA satélite
Vamos a ver el DNA repetitivo no codificante que puede estar agrupado (DNA satélite) o
disperso (DNA minisaltelite, micosatélite, SINE, LINE).
Los DNA satélites tienen este nombre por lo que hablamos de que sedimentaba a distintas
alturas, se observó que en genomas muy complejos habia determinadas bandas que
quedaban cerca de esta, pero fuera de la zona principal, es una cuestión histórica.
SINEs y LINEs
Secuencias que se repiten miles de veces en el genoma de manera dispersa (no agrupados
en tándem)
− 45 % del genoma humano
− Secuencias móviles a lo largo del genoma (transposones)
a) SINE, (Short Interspersed Nuclear Elements, elementos nucleares cortos dispersos)
i. Ocupa 13% del genoma humano
ii. Son retrotransposones no autónomos, unidades de 100-500 pb repetidas hasta
500.000 veces o más (no codifican para transcriptasa inversa)
iii. Los más numerosos son los elementos Alu (250-280 pb y 1.500.000 copias, una
copia cada 4 kb)
b) LINE, (Long Interspersed Nuclear Elements, elementos nucleares largos dispersos)
i. Ocupan 20% del genoma humano
ii. Las copias íntegras (6-8 kb) pueden codificar una transcriptasa reversa
(retrotransposones autónomos), pero la mayor parte son copias truncadas
iii. La más numerosa es la familia L1, LINE-1 o secuencias Kpn (hasta 6,4 kb y unas
100.000 copias)
hasta aquí
Genoma de los orgánulos
DNA mitocondrial (DNAmt) y en plantas también DNA cloroplástico (DNAcp)
− Responsable de la herencia citoplasmática (en la mayoría de organismos se transmite a
través del óvulo -herencia uniparental materna-)
− Análisis de transmisión complicado:
a. la función de mitocondrias y cloroplastos depende de productos del genoma nuclear y del
orgánulo. si hay un problema en la mitocondria igual el problema se encuentra en el nucleo.
b. Hay muchos orgánulos en el interior celular que contribuyen a la función
− Usado para estudios forenses (DNAmt) → Es más estable porque es circular
− Su parecido con los genomas de procariotas ha dado lugar a la hipótesis endosimbionte
En una célula humana tenemos miles de copias de genoma mitocondrial. Puede haber
hasta 100000 copias en los óvulos. Ahí hay 37 genes de los cuales 2 codifican para RNA
ribosomal, 22 para RNAt y 13 para genes polipéptidos.
DNA mitocondrial
− Molécula de DNA bicatenaria circular con genes en ambas hebras
− Su replicación es semiconservativa con peculiaridades
− Su tamaño varía entre organismos (entre 16-18 kb). El de levadura (78 kb) es mayor que
el del hombre y tiene grandes regiones no codificadoras e intrones. En vegetales puede
llegar a 100 kb.
− En vertebrados existen unas 5-10 moléculas por orgánulo y hay múltiples orgánulos por
célula (hay poliplasmia)
− En el hombre contiene genes para: RNAt, RNAr, citocromo oxidasa,
NADH-deshidrogenasa, subunidades de ATPasa
− También hay información genética mitocondrial en el genoma nuclear: DNA polimerasa y
factores de replicación, RNA polimerasa y factores de transcripción, proteínas ribosomales,
factores de traducción, sintetasa aatRNA, citocromo oxidasa adicional, otras subunidades
de ATPasas
− Codifica todos los RNAr y RNAt necesarios para sintetizar los polipéptidos en la
mitocondria
− Los 13 polipéptidos codificados son subunidades de los complejos que intervienen en la
fosforilación oxidativa (producción de ATP)
− Hay unas 100 subunidades proteicas que intervienen en este sistema y su mayoría son
codificadas por genes nucleares que se traducen en el citoplasma y son importadas a la
mitocondria
El genoma mitocondrial tiene una elevada tasa de mutación, dentro de una misma
mitocondria pueda haber heterogeneidad en la secuencia de los diferentes genomas incluso
de una misma mitocondria
La poliplasmia y la segregación aleatoria de los genomas durante la mitosis conducen a la
coexistencia de genomas mitocondriales normales y mutantes en el mismo individuo e
incluso en la misma célula en distintas proporciones (heteroplasmia)
Sólo cuando la cantidad de genomas mitocondriales con una determinada alteración
alcanzan un nivel crítico se manifiesta el fenotipo alterado (efecto umbral), lo que produce
que las enfermedades causadas por alteraciones en el DNAmt muestren una gran
variabilidad clínica. Si tengo una mitocondria y tengo varias moléculas correctas y una o dos
mutantes las correctas codificarán las proteínas correctas, si efectivamente tengo varias
mutantes que hagan que las no mutantes no puedan sufrir la función se alcanza un efecto
umbral que hace que no se pueda ejercer la función. Las mitocondrias se reparten al azar
durante la cariocinesis, dependiendo de donde caigan, habrá unas mayores características
fenotipicas de la enfermedad o ninguna.
Tiene herencia materna → consecuencias en el consejo genético
El cloroplástico suele ser más grande. Molécula de DNA bicatenaria circular de replicación
semiconservativa. Su tamaño es mayor que el DNAmt (85 kb- 2.000 kb). Está presente en
múltiples copias (poliplasmia) con genes en ambas hebras. El cloroplasto tiene un sistema
de traducción completo, el codón iniciador también se une a fMet-RNAt y sigue el código
genético universal. La función cloroplástica también depende de componentes codificados
por el genoma nuclear
Hipotesis endosimbionte
El genoma
mitocondrial
probablemente se
originó tras la
endocitosis de una
célula procariota por
una célula precursora
eucariota (muchas
proteínas necesarias
para el funcionamiento
de cloroplastos y
mitocondrias son
codificadas por genes nucleares y las células procariotas quedaron atrapadas por
transferencia génica).
Operón
Grupo de genes situados de
manera continua (sin DNA
espaciadorr) que comparten un
promotor común y se transcriben
como una unidad de RNAm, que
va a ser policistrónico. Este puede
empezar a traducirse en un lado u
en otro dependiendo de la proteína
que necesitemos. Estos genes
suelen codificar para enzimas de
una misma vía o de actividades muy relacionadas. Los genes se transcriben como una
unidad en forma de RNAm policistrónico o poligénico (un RNAm que codifica para varias
proteínas) que facilita la regulación de su expresión y asegura la presencia de todos los
productos necesarios. El grupito de genes comparten un promotor común
Dentro de estos dos tipos nos podemos encontrar las siguientes soluciones:
1. Negativo:
a) Negativo inducible: De manera habitual el represor es activo. Puede haber una
molécula que se una al represor, lo que va a impedir que el represor se una al
operador y por tanto que comience la transcripción. EJ: operón lactosa. Es decir, el
represor va a impedir la transcripción hasta que se le una una molécula que le
impida cumplir su función
b) Negativo reprimible: El represor no es funcional y necesita otra molécula para
realizar su función represora y que se reprima así la transcripción. Es decir, el
represor no pude cumplir su función de impedir la transcripción hasta que se le una
otra molécula
2. Positivo:
a) Positivo inducible: el activador por sí solo no es capaz de activar la transcripción.
Necesitamos una molécula para que se una al activador y que por tanto comience la
transcripción. Es decir, el activador no puede cumplir su función de activar la
transcripción hasta que se le una otra molécula
b) Positivo reprimible: el activador se sintetiza activo y necesito una molécula que
inactive para que no se produzca la transcripción. Es decir, el activador estará
cumpliendo su función de activar la transcripción hasta que otra molécula se le una y
le impida hacerlo
Operon lac, lactosa (E.coli)
Es un ejemplo de control negativo inducible. El represor está cumpliendo su función de
inhibir la transcripción hasta que otra molécula, en este caso la lactosa, se le una y le impida
así cumplir con su función. La lactosa actúa como inductor, estimulando la expresión de las
proteínas necesarias para su metabolismo, y los genes que controla son los genes:
E. coli expresa constitutivamente los genes necesarios para el metabolismo de la glucosa
pero para otros azúcares como la lactosa (= glucosa + galactosa) la expresión está regulada
La lactosa actua inactivando al represor y estimulando así la expresión de las proteínas
necesarias para su metabolismo:
• ß-galactosidasa (gen lacZ): Rompe la lactosa en glucosa y galactosa y convierte la lactosa
en alolactosa.
• Permeasa (gen lacY): Transporta la lactosa a través de la pared bacteriana.
• Transacetilasa (gen lacA): Se cree implicada en la eliminación de los metabolitos tóxicos
de la lactosa.
Se produce un solo RNAm policistrónico (Z-Y-A). Cuidado, diferenciar entre operon y
operador. El operador (lacO) es la secuencia reconocida por la proteína reguladora.
En ausencia de lactosa no necesitamos las enzimas por lo que el represor (lacI) se genera y
se pega a lacO. Sin embargo, esta unión no es completa y siempre queda un cierto nivel
basal de transcripción.
La proteina CAP impide la expresión del operon cuando hay glucosa en el medio. Cuando
hay mucha glucosa el AMPc es bajo y cuando hay poca el AMPc es alto. En la represión por
catabolito, el AMPc tiene una relación inversa con la glucosa a nivel de concentración. Este
AMPc se une a una proteína, denominada CAP, que reprime por completo la expresión del
operón cuando hay glucosa en el medio. Si no hay glucosa, tendremos AMPc. La unión con
CAP también promueve la unión de la RNA polimerasa y por tanto, podemos metabolizar la
lactosa. Si hay glucosa, la RNA polimerasa no se une (ni hay síntesis de los genes
estructurales).
Control negativo reprimible; hay una proteína represora que se activa por unión al triptófano
y bloquea la transcripción haciendo que el operón no se exprese (y que el triptófano no se
sintetice). Si los aminoácidos están en el medio no será necesario sintetizarlos por lo que el
triptófano se une al represor haciendo que este pueda cumplir su función de inactivar la
transcripción.
Dicho de otra forma…En la región lider siempre se produce RNA, que tiene un codón de
inicio de la traducción, una región y un codón de parada. Además, la región de codones
para trp es complementaria (puede formar emparejamiento con otra región que es
complementaria con otra y así sucesivamente. Luego llegarán los ribosomas para empezar
la traducción y llegarán a la región rica en codones para trp, por lo que si hay trp, la
traducción llegará al final, sino, parará (no encuentran el tRNA del trp)
Si no hay trp: Si hay parada del ribosoma, la primera región no empareja con la segunda. La
cuarta región queda libre y entran nuevos ribosomas para liberar la RNA polimerasa y, la
producción del resto de enzimas que hay después (para síntesis de trp). Por tanto, la
atenuación afecta a la transcripción y no a la traducción, pero los efectos de la traducción
afectan a la transcripción (pero ambas se tienen que seguir dando).
Si hay trp: Se empieza a producir un péptido porque el ribosoma llega al final y termina con
el emparejamiento de las regiones 3 y 4. Este emparejamiento provoca el bloqueo de la
traducción y no se producen las enzimas de la síntesis de trp.
Otros reguladores
sRNA→ Puede tener entre 50-500nt, pueden regular negativamente porque se unen a los
sitios de unión de los ribosomas. Pueden actuar inhibiendo o activando la expresión. Están
implicados en la regulación de la expresión y modificación de funciones de proteínas en
bacterias
En la regulación negativa, el emparejamiento del sRNA al mRNA inhibe la unión del
ribosoma
En la regulación positiva, esta unión facilita la unión del ribosoma
TEMA 6 - REGULACIÓN DE LA
EXPRESIÓN GÉNICA EN UNA
CÉLULA EUCARIOTA
En eucariotas el control de la expresión génica es la base de la especialización celular, no
como respuesta al medio ambiente. LA expresión depende de: fase del desarrollo, tejido y
fase del ciclo celular.
Genes de mantenimiento→ Serie de genes que todas las células van a expresar (histonas,
genes de RNAr…) Generalmente tienen bajos niveles de expresión salvo cuando se
necesitan mucho.
Genes de expresión específica de tejido (TSG) → Genes que no se expresan en todas las
células pero cuando lo hace lo hace a niveles más altos (ej: insulina).
Hay que tener presente que hablamos de eucariotas en las que tenemos el nucleo
(transcripción) y el citoplasma (traducción) habiendo regulación en ambas. Una vez se
genera un RNAm este tendrá una vida media. Una vez se ha producido este RNAm seguiría
traduciendose hasta que se degrade, podría estar horas codificando pero esto no me
interesa, tiene que haber un control
Regulación pre-transcripcional
Arquitectura del nucleo en interfase
El nucleo es una estructura organizada.En un momento determinado del desarrollo los
cromosomas están en un determinado sitio, el nucleo no es una estructura al azar, tiene una
organizaciíon, es una estructura dinámica que va cambiando. Los cromosomas ocupan
zonas concretas (territorios cromosómicos) separadas por dominios intercromosómicos. En
estos territorios el cromosoma se mueve continuamente, los genes que se expresan pasan
a los bordes cercanos a los dominios intercromosómicos (estos son zonas en las que se
forman los pre-RNAm y son transportados al citoplasma por canales) Para ello, antes de la
transcripción se requiere el remodelado de la cromatina
Efecto de posición
Un gen en el genoma puede expresarse o no dependiendo de la posición que ocupa, así en
determinados casos, los genes pueden moverse a zonas y activarse o desactivarse de esta
forma. Dependiendo de donde esté, se expresará o no. LA expresión de un gen depende
tanto de la secuencia de DNA como de la estructura de la cromatina en esa región
Impronta genómica
¿Podría haber un mundo de homo sapiens
en el que todo fueran mujeres?
Afortunadamente no, los 23 y 23
cromosomas tienen sus cositas. No se
pueden fusionar dos óvulos y dar una
mujer. Muchos genes muestran una expresion bialelica, pero en otro se expresa solo uno de
los alelos y el que no se expresa está imprentado. Hay genes en los cuales se tiene que
silenciar el del padre o el de la madre. Dentro del cigoto hay un mecanismo que reconoce
que alelos son de origen materno y cuales son de origen paterno, teniendo presente que yo
tengo alelos en todas mis células de mi madre y de mi padre. Pero cuando yo los transmito,
como hombre, los transmitiré como alelos del padre y mi pareja como los de la madre. Los
genomas materno y paterno no son equivalentes. Existen alteraciones en la impronta
implicadas en desarrollo embrionario anormal, alteraciones del comportamiento,
enfermedades genéticas y desarrollo de tumores.
La impronta no puede afectar a la secuencia y debe ser reversible, ya que un alelo paterno
puede pasar a ser materno y viceversa. Por ello, el silenciamiento de uno de ellos se
produce mediante mecanismos epigenéticos que hagan posible que la impronta pueda
borrarse y reescribirse en la gametogénesis. Estas marcas epigenéticas se producen en
regiones metiladas de manera diferencial (DMRs) en ambos alelos. Debe existir una
posibilidad de reprogramación durante el desarrollo en función de las necesidades de éste
(plasticidad de la impronta). Debe existir la posibilidad de reprogramación durante la
gametogénesis. En la imprenta hay variación entre individuos, dentro del individuo incluso
puede haber tejidos que expresen el alelo femenino y otros el alelo masculino.
Reprogramación en la gametogénesis
Todos nosotros provenimos de un gameto
masculino y otro femenino. Si en el embrión, el
silenciado es el masculino y el secuenciado es
el femenino, y el embrión es varón, ha de
decirle a sus espermatozoides que cualquiera
de sus cromosomas tiene la marca azul
(deberá borrar el color y ponerle nuevo color).
Es decir, quitar y poner determinados grupos
metilos en función del sexo del embrión.
Regulación transcripcional
• Elementos reguladores en cis: Secuencias de DNA cuya función reguladora se limita a la
molécula de DNA en la que se encuentra (promotores). En el caso de que existan dos
alelos, los elementos en cis de cada uno de ellos regulan de manera individual el alelo en el
que se encuentran. Actúan sobre la secuencia de DNA que viene a continuación. Los
elementos en cis se denominan promotores.
• Elementos reguladores en trans: Molécula reguladora (proteína o RNA) que reconoce y se
une a secuencias del DNA específicas y cortas. Pueden regular la expresión de los dos
alelos o de varios genes localizados en distintas posiciones del genoma.
Transcripción
1. Promotores (elementos reguladores en cis)→ Segmentos de DNA que intervienen
en la regulación de la sintesis del RNA mediante la unión con RNA polimerasa y los
factores de transcripción. Conjuntos de secuencias cortas concentradas en las
cercanías de los TSS.
2. Factores de transcripción (elementos reguladores trans)→ Proteínas que se unen al
promotor y otros elementos regulando la síntesis del RNA.
Clases de genes:
1. Genes de clase I: Transcritos por la RNApol I (rRNA 28S, 18S ,5 ,8S).
2. Genes de clase II: Transcritos por la RNApol II (mRNA, algunos lncRNA, miRNA).
3. Genes de clase III: Transcritos por la RNApol III (tRNA y rRNA 5S, RNAs
pequeños).
Promotores basales→ Nos van a marcar el punto de inicio y es donde se unirá la rna
polimerasa. Determinan el punto de inicio de la transcripción. Un ejemplo es la caja TATA.
Factores de transcripción
SOn proteínas que se pegan a una determinada secuencia. Deben de tener dominios que
permitan su interacción con el DNA y dominios de activación. Se pegan al DNA y activan.
Existen específicos y generales
- Generales: Necesarios para la transcripción de la mayor parte de los genes y se
asocian a niveles basales de transcripción
- Específicos: Específicos de determinados tejidos y/o grupos de genes. Aumentan o
disminuyen los niveles basales de transcripción.
Promotores alternativos
Un gen puede tener varios promotores distintos que dan lugar a productos alternativos o
isoformas. El uso de uno u otro puede depender del tejido, estado de desarrollo, localización
subcelular (isoformas solubles o insolubles), función, sexo… Los promotores alternativos
con exones alternativos hacen que tengamos terminaciones alternativas, que hace que la
manera de expresar sea infinita.
Regulación post-transcripcional
Formación de diferentes RNAs
– Promotores alternativos.
– Exones alternativos (ayuste o corte y empalme alternativo).
§ La maduración alternativa por corte y empalme (un único pre-mRNA puede producir
diferentes mRNA) permite la formación de diferentes transcritos RNA por combinación de
distintos exones.
§ Hay exones que pueden ser mutuamente excluyentes, otros no, otros aparecen siempre.
– Terminaciones alternativas.
§ Pueden existir varias señales de poliadenilación que pueden ser específicas de tejido o
consecuencia del propio ayuste alternativo.
Gracias al splicing, un único pre-RNAm puede producir diferentes RNAm
Edición de RNA (recordatorio)
En algunos RNA, su secuencia no coincide con la del gen. Esto es un proceso por el cual se
porducen cambios en la información en el mRNA por medio de RNA guías (moléculas
complementarias al RNA preeditado), mediante la adición o deleción de nucleótidos o
cambios químicos de estos.
Esto provoca que la secuencia de mRNA no sea exactamente complementaria de la
secuencia de DNA de la que proviene.
RNAs
− Son RNAs mayores de 200 nt que no codifican proteína, (XIST es un lncRNA)
− Se producen de manera similar a los RNAm, tienen cap en 5’ y poli(A) en 3’ y sufren
splicing, pero carecen de codones de inicio y terminación de la traducción
− Tienen funciones diversas en la regulación de la transcripción:
- pueden influir en modificaciones de la cromatina
- pueden asociarse a factores de transcripción
- algunos tienen funciones en la regulación post-transcripcional −Su papel en la
regulación de la expresión génica puede ser por: − Hibridación con un RNAm −
Excluyendo exones del splicing − Generando híbridos lncRNA-mRNA que produzcan
dsRNAs que puedan ser procesados en siRNAs − Funcionando como RNA
endógeno competidor (competing endogenous RNA, ceRNAs) que atrapan miRNAs
a modo de “esponjas”, secuestrándolos e impidiendo la unión a sus dianas
funcionales
RNAs circulares
SOn conformaciones circulares, resistentes a las exorribonucleasas, muy estables
TEMA 7: VARIACIÓN GENÉTICA,
POLIMORFISMOS Y MUTACIONES
Mutación
Es un fallo en la fidelidad del almacenamiento de la información ya que hay un cambio de la
información genética guardada:
– Puede encontrarse a nivel de secuencia o cromosómico
–Pueden ocurrir de manera inducida (por radiaciones o productos químicos) o de manera
espontanea (por procesos químicos dentro de nuestras células).
– Las mutaciones pueden transmitirse o no a la descendencia, si afecta por ejemplos una
célula de mi piel, si afecta a una célula que va a dar lugar a los gametos afectará a la
descendencia y entrará en la llamada linea germinal. Hay que diferenciar bien entre las
mutaciones somáticas que afectan a tejidos adultos de las mutaciones germinales que
afectan a gametos o al individuo completo.
– Algunas tendrán efectos fenotípicos y otros no
– En biología las mutaciones son fundamentales, de hecho en algunos casos son
beneficiosas. El homo sapiens tambien ha sufrido muchas mutaciones a lo largo de su
historia (ej: algunos humanos son tolerantes y otros intolerantes a la lactosa, pero de
primeras, todos los mamíferos son intolerantes a la lactosa, lo que pasa que el ser humano
ha evolucionado, ha mutado). Habrá mutaciones preponderantes (se mantendrán en la
evolución) o perjudiciales (se eliminarán), o neutrales (su frecuencia dependerá del azar).
– El conocimiento de la función de la mayor parte de los genes ha sido posible gracias a la
existencia de mutaciones
Distintas escalas de las mutaciones
Pueden afectar desde a unos pocos nucleótidos hasta miles de millones de nucleótidos o
incluso a cromosomas completos. La aparición de mutaciones está más relacionada con el
progenitor paterno, los gametos de un hombre de 40 años han pasado por más divisiones
que los de una mujer de 40 años y en cada una de estas divisiones ha habido mutaciones.
Las polimerasas se equivocan 1 decada 1000 millones de veces. El genoma nuclear son
6400 millones de pares de bases, si me equivoco 1 de cada 1000 millones, en cada
replicación introduzco 6,4 mutaciones, 6,4 errores cada vez que una célula se divide. Hay
errores que no pasa nada porque están en medio de un intrón o en medio de la nada pero
otros sí.
Conceptos importantes
Locus: porción de una secuencia o cromosoma ocupada por un gen o un marcador genético
Todo gen ocupa un locus pero no todo loci está ocupado por un gen. Las variante de un gen
se van a llamar alelos y estos surgen por mutación, sino tendríamos todos los mismos 2
alelos. Todos estos alelos se forman a partir de un único alelo que ha ido mutando.
Por tanto la mutación va a ser el proceso por el que se origina un alelo a partir de otro.En el
caso de que en la población haya suficientes variantes para no considerar que son
mutaciones, como no sabemos cual es el origen, se dice que cuando un gen tiene varias
variantes es polimórfica. Así se llama polimorfismo a toda variante genética que aparece en
más del 1% de la población. Si en una determinada posición el 90% de los individuos tienen
una T, pero el 10% tiene una C a esto no se le llama mutación, sino polimorfismo.
En algunos casos, hay variantes que han aparecido solo en un genoma y por ahora se les
llama singleton (variantes raras o solteras). Las variantes de un gen (alelos) se pueden
formar por:
- Sustitución de un nucleotido, los más frecuentes son los polimorfismos de un único
nucleótido (SNP)
- Variantes indel → Es una variante por inserción o deleción, en un alelo no hay
nucleótido y en otro hay una A, y no sé cual es el original, no sé si la A se ha
eliminado o se ha añadido.
- Cambios en el número de copia (CNV)
• Genotipo: conjunto de genes (y alelos) de un organismo
• Fenotipo: forma en la que se expresa un carácter, características observables. Dependen
del genotipo y de los componentes ambientales.
En la zona que codifica proteína un cambio en la secuencia puede provocar un cambio en el
mensaje. Una mutación, a veces puede ser la causante de una enfermedad, sin embargo,
en otros casos, hay individuos con la misma mutación que no manifiestan el fenotipo, es
decir, en el fondo el fenotipo va a depender de varias cosas
Tipos de mutaciones
Las mutaciones de secuencia van a tener distintas características en función de un adjetivo
que les vamos a poner, ese adjetivo se lo vamos a poner en función de cómo afectan:
1. Secuencia de DNA: Las mutaciones pueden ser:
→ Sustituciones o mutaciones puntuales: Se dividen en transiciones, si el cambio es
entre purinas o entre pirimidinas, y en transversiones, si el cambio es entre purina y
pirimidina. A pesar de que las transversiones son el doble de probables, son mucho
más frecuentes las transiciones.
→Inserciones: Uno o varios nucleótidos se insertan en una determinada posición
→Deleciones: Pérdida de uno o varios nucleótidos
→ Inversiones: Un segmento de DNA se ha invertido
2. Efectos sobre el gen/proteína codificada:
→ Sense: Cuando la mutación no cambia el aa se denomina silenciosa o sinónima,
→ Missense: Cuando hay un cambio del aa se denomina cambio de sentido. Si el aa
tiene caracteristicas parecidas se denomina neutral o conservadora, y sino, no
conservadora
→ Non sense: Cuando la mutación genera un codón de parada y me van a dar lugar
a proteínas más cortas se denominan sin sentido
→ Con terminación retrasada: cuando eliminan codones de parada y la traducción
continua
→ Frameshift: Por último tenemos otras que son inserciones o deleciones de
nucleótidos no multiplos de 3 que me van a cambiar el marco de lectura
codificandome proteínas muy diferentes, se denominan mutaciones con cambio de
fase.
La mutación no tiene porque afectar unicamente a la región codificante sino que
pueden afectar tambien por ejemplo al promotor.
3. Efectos sobre la función del producto→ La mutación nos va a dar una eliminación o
reducción de la función de este producto (loss of function). En segundo lugar, la
ganancia de función puede tener dos significados, el producto funciona más de lo
debido o incluso puede tener funciones adicionales, puede ser una u otra. Por último
podemos tener una mutación supresora que revierte los efectos de otra mutación,
puede ocurrir en el mismo gen (intragénica) o en otro gen (intergénica)
En la pérdida de función…
- Nula→ Pérdida completa
- Recesivo→ Tiene el alelo normal y el mutante, los efectos no los vamos a ver
- Dominante→ Vamos a ver los efectos aunque tengamos otro alelo normal
- Dominante negativa→ Esto supone que cuando están los dos alelos el
mutante impide la función del normal. FUncionan como dímero, si uno de los
dos está mutado, esa proteína como dímero no puede funcionar
- Haploinsuficiente → Significa que el otro alelo, cuando está el solo no puede
suplir la función, se necesitan dos copias y el normal no es suficiente para
suplir la función.
4. Las células a las que afecta → Pueden ser somáticas o germinales. Las primeras
son aquellas que solo afectan a una determinada proporción de las células del
organismo, pueden ser más o menos (ejemplo: una mutación que me genera un
cáncer). En la germinal o constitucional, el gameto dará lugar a un individuo que va a
tener esa mutación, el individuo completo, las tienen todas las células del individuo.
El cancer normalmente es mutación somática pero los hereditarios son germinales
5. Los efectos sobre el organismo → Puede ser letal si provoca la muerte del individuo
en cualquier momento. Es condicional cuando sus efectos aparecen solo bajo
determinadas condiciones ambientales (ejemplo: conejo himalaya y gato siamés que
forman un pigmento a una determinada temperatura en las extremidades)
6. Su origen→ Pueden ser espontaneas o endogenas porque se nos generan
mutaciones de manera constante en nuestro organismo o inducidas por el ambiente,
compuestos químicos o cuestiones físicas
Una misma mutación puede tener 6 adjetivos calificativos diferentes
Ej: Las poblaciones del himalaya soportan mejor las bajas presiones. La intolerancia a la
lactosa es el fenotipo normal, solo algunos humanos hemos evolucionado a mantener la
lactasa a lo largo del tiempo, más allá de la lactancia.
Barrido selectivo sobre una variante de SLC24A5 en poblaciones europeas: Gen implicado
en la sintesis de melanina. Hace unos años se cogieron 4 poblaciones (nigeriana, dos
poblaciones asiáticas (chinos de pekín y japoneses de tokio) y la población de
notreamericanos de origen europeo) Lo que se vio en una determinada región del genoma,
en las poblaciones europeas no hay heterocigotos, tenemos todos las mismas variantes
genéticas. En cambio, en la misma región, en poblaciones no europeas sí que había
heterocigotos
TEMA 8 LA REPARACIÓN
Los seres vivos tienen una serie de mecanismos que ayudan en la reparación del genoma.
Están adquiriendo protagonismo en la investigación biomédica.
Vías de reparación
1. Detoxificación: La eliminación de las especies reactivas de oxígeno gracias a la
superóxido dismutasa que transforman los radicales libres en agua oxigenada
2. Reversión directa: fotorreactivación y desmetilación
- La primera depende de la fotoliasa. La luz UV genera dimeros de timina. Esta
luz UV activa la enzima y corrige los dímeros de bases. No es un proceso
esencial. Nosotros no tenemos estas enzimas
- Las segundas son encargadas de desalquilar o desmetilar. Se usa la
S-adenosilmetionina. Aquí está la clave de que algunas personas respondan
mejor a tratamientos oncológicos. Tenemos un individuo al que le damos
alquilantes, su actividad desalquiladora es importante frente a otro individuo
al que le damos alquilantes pero su actividad desalquiladora es menos
importante ¿Quien responde mejor al tratamiento? El segundo. Va a ser una
de las razones por la que una misma dosis para unos será tóxica y para otros
no. La SAM es utilizada por las células como donante de grupos metilos para
metilar varias moléculas pero también ataca al DNA. Hay pacientes que
responden peor porque su actividad protectora del genoma es mejor, lo cual
es bueno para ellos pero no para el tratamiento.
3. Reparación por actividad correctora de la DNA polimerasa→ Corrección de errores
durante la replicación. Se basa en que la polimerasa se puede dar cuenta que se ha
equivocado y actua su actividad 3’-5’ exonucleasa para retirar este nucleótido
4. Reparación de bases emparejadas/emparejamientos incorrectos→ Tiene que haber
una serie de enzimas que reconozcan el error y reconocer cual de las dos bases
emparejadas están bien de las dos emparejadas. Aquí viene la segunda utilidad de
la metilación. Nuestro genoma esta metilado en determinadas posiciones y cuando
se replica, la hebra nueva tarda un poco en metilarse (la antigua ya estará metilada).
En este intervalo de tiempo ya tendre un mecanismo para reconocer esta metilación
diferencial, la que no tenga el metilo será la que tenga el nucleótido incorrecto.
(recordatorio: la metilación tambien sirve en la regulación de la expresión génica, en
procariotas cada bacteria tiene un factor de metilación distinto)
5. Reparación por escisión: Repara el daño causado por agentes internos y externos.
Es un proceso en varios pasos: Reconocer el daño, eliminarlo, sintetizar el trocito de
DNA y sellarlo. Hay dos tipos
- Reparación por escisión de nucleótidos: repara daños generales que
distorsionan la estructura como los dimeros de timina.
1. Reconocimiento de la distorsión por mediode un complejo enzimático
(distorsiones estructurales)
2. Se separan las dos cadenas de la región dañada; se corta el esqueleto
azúcar-fosfato de la cadena dañada a ambos lados de la lesión (entre tres y
nueve nucleótidos en dirección 3’ al daño y entre 16 y 25 nucleótidos en
dirección 5’)
3. Llenado por la DNA polimerasa I con nucleótidos complementarios a la
otra hebra
4. Acción de la DNA ligasa para unir el último OH en 3’ libre
- Reparación por escisión de bases: Repara daños concretos.
1.Reconocimiento de la base alterada por DNA glicosilasas específicas a los
distintos tipos de daño creando sitios AP(apurínicos, apirimidínicos)
2. Reconocimiento del daño por la AP endonucleasa, que elimina el azúcar
dañado creando una distorsión estructural
3. Acción de la DNA polimerasa I y DNAligasa
6. Reparación post-replicación→ Se activa una reparación por recombinación
homóloga. Se activa un sistema enzimático que hace que una hebra migre para que
se una con su antigua hebra complementaria y la que se replica es la nueva.
Tendremos en una de las cadenas nacientes todo nuevo y en la otra no. va a buscar
su zona homologa en el genoma, se la lleva y la replicación no se para. Interviene la
RecA.
Cariotipo
Son los cromosomas de un individuo ordenados. Es la disposición ordenada de los
cromosomas en metafase en función de su longitud, la posición del centrómero y la tinción
diferencial en bandas. Me da una visión global del genoma
¿cómo se hace?
Se coge sangre periférica (tubos de sangre de la analítica con un determinado coagulante).
Se añade sangre en un medio de cultivo que tiene un compuesto mitogénico, va a favorecer
la mitosis. Se deja 24-48 horas para que se dividan los globulos blancos de la sangre (que
son los que tienen nucleo). Añadimos colchicina que detiene la división celular en metafase,
se quedan congeladas. Ahi tendre los cromosomas en el plano ecuatorial. Rompo la célula y
el nucleo y hago una tinción (de giemsa) cuando vea un nucleo roto y con los cromosomas
separados le saco una foto con el ordenador y ordeno los cromosomas creando un cariotipo
que posteriormente analizaré.
Existe un sistema universal de clasificación de los cromosomas.
Cariotipo con bandas→ aparecen unas manchas más oscuras y más claras características
de cada cromosoma. Las bandas G se tiñen con giemsa. Las que se tiñen más son ricas en
adeninas y timinas y LINEs, son pobres en genes y de replicación tardía y condensación
temprana.
− Bandas G, tras una digestión previa con tripsina los cromosomas se tiñen con Giemsa
dando un patrón de bandas claras-oscuras
− Bandas Q, tinción con Quinacrina (regiones ricas en AT) tienen un patrón similar a bandas
G pero se observan bajo luz ultravioleta,
− Bandas R, patrón reverso de las bandas G, tinción con Giemsa tras una desnaturalización
previa
− Bandas T, tiñen específicamente bandas R de los telómeros (para ver el estado
telomérico)
− Bandas C, tiñen la heterocromatina constitutiva con Giemsa tras una desnaturalización
con hidróxido de bario
Citogenética molecular
Muchas veces las alteraciones citogenéticas son muy dificiles de ver por lo que se hacen
pruebas a nivel molecular.
Se pueden añadir sondas sobre el cariotipo. Una de ellas se basa en la hibridación de
ácidos nucleicos (FISH o hibridación in situ fluorescente). Se une así a una región del
genoma y puede observarse por fluorescencia
A veces las alteraciones son tan complejos que hay que pintar todo el genoma, cariotipo
espectral. Este es el método SKY (spectral KarYotyping)
Trisomía 21
La monosomía 14, monosomía 21 y
trisomía 21 no son viables
Leyes de Mendel
1. Propuso que los caracteres estaban controlados por factores unitarios (no habló de
genes) encontrados en los individuos en parejas en cada individuo.
2. Cuando coexisten en un individuo dos factores unitarios (alelos) distintos
responsables de un caracter uno de ellos es dominante sobre el otro que es
recesivo.
3. Durante la formación de los gametos, los dos factores unitarios presentes en
unindividuo se distribuyen o segregan de manera aleatoria. Cada gametorecibe uno
u otro con igual probabilidad, por lo que la mitad de los gametoslleva un factor
unitario y la otra mitad lleva el otro. El 50% de los gametos heredará r (recesivo) y el
otro R (dominante)
Cuando en un individuoestán los dos alelos iguales es geneticamente puro, homocigoto.
Cuando los dos alelos son diferentes tendremos un individuo heterocigoto.
Las plantas de la generación F1 son heterocigotas, los dos alelos son distintos (uno de ellos
es dominante). En la generación F2 aparecen plantas homocigotas y heterocigotas con el
carácter dominante.
El 100% de los gametos de la planta RR me va a dar R y el 100% de la planta rr me va a
dar r. Esto me da un individuo heterocigoto en el que se muestra el fenotipo dominante.
Pero esto me va a dar ya gametos que pueden ser R o r. De aquí de cada 4 individuos 3
van a tener el fenotipo dominate y 1 el fenotipo recesivo. Esto es la ley de la segregación, la
verdadera primera ley de Mendel.
(revisar)
3. Método probabilístico
Cruzamiento trihibirod
Tres caracteres de manera simultanea. La generación parental serian puras. Nos
daría lugar a F1 triplehomocigotos y la F2 podría dar 8 tipos de gametos distintos por
lo que tendriamos 64 casillas de punnet (en este caso es mejor utilizar el diagrama
ramificado fenotipico) 27. Cuando se tiene un número par
….
Probabilidad en genética
Las leyes de Mendel nos permiten aplicar toda la teoría de probabilidades al calculo
de descendientes.La estadística nació de la genética. La probabilidad nos va a
permitir predicir como va a ser la descendencia (el 50% de un tipo y el otro 50% de
otro, por ejemplo). La probabilidad se cumple cuando el número de descendientes
es alto, si juego con números bajos la probabilidad es probabilidad. La comprobación
estadística de la hipótesis permite demostrar si la predicción es correcta (y
establecer un modo de herencia para el carácter)
Probabilidad de un suceso
Lo puedo saber a partir de la observación del suceso (ejemplo: accidentes
observando el número de coches que hay circulando por la calle). La probabilidad de
un suceso seguro es 1 y la probabilidad de un suceso imposible es 0.
→ Regla de la multiplicación o regla del ‘’uno y otro’’: La probabilidad de ocurrencia
simultánea de dos sucesos independientes es el producto de las probabilidades de
ambos sucesos por separado
→ Regla de la suma o regla del ‘’uno u otro’’: La probabilidad de ocurrencia de un
suceso que puede ocurrir de diversas maneras (excluyentes) es la suma de las
probabilidades de ambos sucesos
Una vez tenga esta ecuación resuelta me dará un número, por ejemplo 2. Posteriormente
calcularé el número de gados de libertad que es el número de carácteres posibles -1. Si
estudio 2 carácteres mi GL será 1. VOy a una tabla en la que busco la fila del 1 (mi GL) y
veo entre que valores está mi resultado (2), ahi puedo ver si está por encima o por debajo
de 0,05.
Una genealogía es una representación gráfica que muestra la relación familiar / transmisión
de una o varias características. ¿Porque son útiles estas genealogías?
− el tiempo por generación es cercano a 20-30 años
− el número de descendientes es escaso comparado con otras especies
− es imposible la realización de cruzamientos experimentales
Es una representación de este tipo
Dominancia incompleta
Hasta ahora hablabamos de dominancia o
recisividad completa, el individuo mostraba uno de
los caractéres. En algunos casos el individuo
heterocigoto muestra un fenotipo intermedio. Si
cruzamos flores blancas y rojas, los descendientes
heterocigotos van a ser rosas. Si se parecen más
al rojo habría una dominancia incompleta del rojo
sobre el blanco y al revés. El individuo heterocigoto
es reconocible. Las proporciones fenotípicas observadas son iguales en proporciones
genotípicas.
Codominancia
No debemos confundirlo con el anterior. En esta se observa la expresión de los dos alelos,
concepto más molecular. Si analizo la flor y encuentro pigmentos rojos y pigmentos blancos
podré estar observando fenotipicamente una dominancia incompleta pero molecularmente
hablaremos de codominancia. Cada alelo da lugar a productos detectables y distintos.
El fenotipo del heterocigoto es la suma del fenotipo de ambos homocigotos o incluye ambos
fenotipos (aparecen ambos productos). Se puede confundir con una dominancia incompleta,
es decir, esta incluye cambios en fenotipo y fenotipo, sin embargo, la incompleta solo en el
fenotipo.
La anemia falciforme es una enfermedad recesiva pero si tenemos el alelo mutado sí da
producto mutado, da hemoglobina anormal. En un individuo heterocigoto puedo detectar las
dos, pero a nivel de la enfermedad no aparece porque es recesiva, es decir la hemoglobina
normal suple a la hemoglobina anormal. Solamente cuando seamos capaz de detectar los
dos productos será codominancia (yendo por el campo y viendo flores rosas nacidas de
blancas y rojas solo soy capaz de hablar de dominancia incompleta). Sin embargo a nivel de
enfermedad es recesivo porque solamente los homocigotos muestran fenotipo de
enfermedad.
Alelos múltiples
Un individuo diploide solo puede tener dos alelos. En la población un gen puede tener más
de dosalelos distintos. Pueden tener relaciones de dominancia distintas: Ejemplo grupos
sanguineos. A y B son codiminantes entre sí y ambos son dominantes sobre 0.
“A” → IA IA / IA i
“B” → IB IB / IB i
“AB” → IA IB → receptores universales por no tener anticuerpos ni para A ni para B
“0” → ii → pueden donar sangre a cualquiera pues no tienen antígenos
IA → agA
IB→ agB
i→ No da ningún antígeno
En verdad los antigenos a y b no son más que una modificación de una sustancia química
llamada sustancia h. El alelo IA condiciona una enzima que adiciona a esta sustancia h una
N-acetilgalactosamina. El alelo IB adiciona galactosa a esta estructura h y el alelo ino
codifica ninguna enzima funcional por lo que la estructura h no se ve modificada.
Alelos letales
Un alelo es letal cuando su producto es imprescindible
para la vida. Generalmente son recesivos pero puede
haberlos dominantes. A veces son letales recesivos pero
dominantes en cuanto a fenotipo, para expresar su
letalidad deberán estar en homocigosis pero si están en
heterocigosis son distinguibles. Por ejemplo, el carácter
amarillo en una determinada raza de ratones, que
generalmente son agutís. En esta tabla podemos
observar como ¼ parte de la descendencia muere (los
amarillos homocigotos)En heterocigosis observaremos el
amarillo, pero en homocigosis muere.
Expresividad
Grado o intensidad con que se expresa un genotipo determinado en un
individuo. Los distintos individuos muestran distinto grado de expresión.
Esto ocurre mucho en enfermedades mitocondriales.
Si se juntan la penetrancia incompleta y expresividad variable. Por
ejemplo, todos los individuos geneticamente iguales, algunos muestran la
enfermedad, otros no y entre los que la muestran unos la muestran más
y otros la muestran menos.
Interacción génica
Cuando un carácter está controlado por dos o más genes diferentes las
proporciones fenotípicas no son las esperadas por las proporciones
genotípicas.
Existen dos casos:
– La expresión de un gen influye sobre la expresión del otro, uno o más genes enmascaran
la expresión de otros y alteran el fenotipo (epistasia).
–Diferentes genes pueden influir sobre la expresión de un carácter; y algunas
combinaciones de alelos pueden dar lugar a un nuevo fenotipo
Fenotipos nuevos
A veces la comibnación entre alelos nuevos de
dos genes nos da la aparición de fenotipos
nuevos. De nuevo tenemos un carácter con dos
fenotipos. Tenemos unos pigmentos rojos y otros
crema, al cruzarlos F1 son rojos pero al
autofecundarlos aparecen tambien marrones y
naranjas. Esto surge por variantes que han sido seleccionadas durante siglos
¿Podríamos tener una variedad de pimientos que solo me diera naranjas? ¿y marrones? Sí,
si conseguimos un individuo yycc nos van a dar siempre individuos naranjas y YYcc
marrones.
Esto tambien se ha visto en gallinas: Cruzamiento entre cresta rose (RR/pp) y cresta pea
(rr/PP); la interacción de dos alelos dominantes (R, P) en ambos genes produce un tercer
fenotipo walnut en los descendientes (toda la F1 es walnut) – En la F2 aparece un cuarto
fenotipo single (rr/pp); se mantienen las proporciones mendelianas para el cruzamiento
dihíbrido 9:3:3:1 (walnut:rose:pea:single)
Otro tipo de interaccion génica es el que puede dar lugar a la aparición de caracteres que se
encuentran en un amplio rango (variación genetica continua o carácteres cuantitativos) y no
clasificables.
Si nos ponemos cada uno de nosotros por el carácter altura tendriamos tantas clases como
individuos (si fuesemos a medir al milímetro). La clasififcación de los individuos en cm
depende de la capacidad de medición. Los individuos no están en dos o tres clases
perfectamente distinguibles sino en un rango.
Esta variación es debida a su origen multifactorial:
- Influenciadas por varios genes de manera simultanea, son características poligénica
- Cada gen aporta un pequeño efecto
- Estos pequeños efectos se suman
- El ambiente modifica el efecto de cada gen disminuyendo las diferencias entre
fenotipos
Uno de los carácteres que estudio mendel era la altura, pero era ficticia porque ahbía solo
dos clases, enana y alta. Galton quiso hacer lo mismo y cruzó guisantes con diametro
pequeño y guisantes con diametro grande. Al cruzar los guisantes intermediosobtuvo
multiples clases con una distribución normal
F Galton y K Pearson (finales s XIX) establecen que hay correlación estadística en estos
caracteres entre progenitores y descendientes, pero no establecen su modo de transmisión.
Cuando el progenitor tenia un carácter más elevado, el descendiente tambien.
W. Johannsen (1903) demuestra que el peso de las alubias es heredable, pero también
ambiental.
R. Fisher (1918) es el primero en demostrar matemáticamente que el modelo de
segregación mendeliana se aplica en la herencia de estos caracteres basándose en
experimentos previos de East y Nilsson-Ehle. (demuestra que es cumplen las leyes de
mendel)
Los caracteres umbral muestran sólo dos fenotipos posibles (presencia o ausencia), cuando
la susceptibilidad (variación continua) excede un valor umbral el carácter aparece.
Correlación
Cuando dos o más características varían de manera conjunta y no son independientes, la
correlación indica que el cambio en uno de los caracteres se encuentra asociado al cambio
en otro
El coeficiente de correlación (r) mide el grado o fuerza de esta asociación pero no indica
causa y efecto
− 0, no hay relación (independientes)
− +1.0, el incremento en x se relaciona con el incremento en y
− -1.0, el incremento en x se relaciona con la disminución de y
Regresión
La correlación nos indica el grado y dirección de la asociación entre variables, pero la
regresión predice el valor de una variable dado el valor de la otra
Permite predecir las características de la descendencia de un determinado cruzamiento
Heredabilidad
Nos mide la proporción de la relación fenotípica que estamos viendo en la población. Se
define como la proporción de la variación fenotípica total debida a las diferencias genéticas.
Es decir, por ejemplo, cuanta de la variación existente entre los individuos es debida a la
variación genética y cuanta a la variación ambiental.
Hay dos tipos:
- heredabilidad en sentido amplio
- heredabilidad en sentido estricto (h2) → Permite predecir la respuesta del fenotipo a
la selección artificial. Es decir, si nosotros sabemos el valor de heredabilidad, por
ejemplo tenemos una población de vacas y seleccionamos las que superen la
media, van a dar lugar a la siguiente generación de vacas, si la heredabilidad es muy
alta se elevará el valor medio. Si es baja, aumentará un poquito el valor medio pero
si no hay heredabilidad no pasará nada
Cromosomas sexuales
En principio si no hay problema, las mujeres serán XX y los hombres XY. Los genes que se
encuentran en estos cromosomas se van a transmitir de manera distitinta a las predicciones
mendelianas, esto es la herencia ligada al sexo. Los cromosomas sexuales se encuentran
distribuidos de manera distinta en ambos sexos, los autosomas no. Los cromosomas X e Y
se reconocen durante la meiosis en deteminadas regiones
El talmud (libro judío) establece que si una mujer da a luz a dos hijos que mueren por
hemorragia después de la circuncisión, los próximos hijos que tenga están exibidos de ser
circuncidados. Además establece que los hijos de sus hermanas no deben de ser
circuncidados, mientras que los hijos de los hermanos sí deben serlo. Si ahora pensamos
en una herencia recesiva ligada al X, nos está diciendo que la mujer cuyos hijos mueren por
hemorragia es portadora, ella no tiene la hemofilia, es portadora, por tanto, es probable,
aunque no siempre se da el caso de que el siguiente tercer hijo sea hemofílico, si ella es
portadora sus hermanas tambien pueden serlo pero no tienen porque serlo. Sin embargo,
ninguno de los hermanos puede ser hemofílico porque ya han sobrevivido a la circuncisión.
P
Herencia ligada al Y
Hay muy pocos caractéres holándricos. El gen SRY está muy cerca de la fracción
pseudoautosómica lo cual hace que en algunos casos por recombinación, se escapen
genes SRY pudiendo haber varones con dos cromosomas X y mujeres con un cromosoma
Y. Hay algún otro gen pero poco importante
Herencia ligada al X e Y
Se comportaría de forma similar a los autosomas pero no exactamente igual porque los
cruzamientos no serían recíprocos, en este caso tanto varon como mujer tendrían dos
alelos.
Mutación bobbed (fallo en la diapo)→ Genera una mosca con unas determinadas alas. Si
cruzamos hembras salvajes con machos bobbed nos encontramos como en la F1, machos
y hembras son de tipo salvaje pero en la F2 al cruzar estos individuos los únicos que son
bobbed son la mitad de los machos. Sin embargo, si lo hacemos al revés son las hembras
las bobbed y los machos los salvajes, de nuevo todos los individuos lo que tenemos
también son salvajes, pero en F2 tenemos tambien una proporción 3-1 pero en este caso
tuvo las bobed son hembras.
Recombinación intracromosómica
Va a ser el resultad del entrecruzamiento en la fase I de la meiosis y nos va a generar una
frecuencia de recombinación siempre menor al 50% porque no ocurre en el mismo punto ni
en todas las meiosis y cuando ocurre los gametos son recombinantes.
Cuando en el 100% de la meiosis haya entrecruzamiento entre los dos genes se generará
en el 50% de los gametos recombinantes y esa será la frecuencia de recombinación
máxima que no va a ser superior a un 50%.
Cuando los genes están muy alejados en prácticamente el 100% de las meiosis habrá un
entrecruzamiento, mientras que se reducirá si los genes están más cerca. La frecuencia de
recombinación nos va a servir como estimación de la distancia entre dos genes.
Cuando los genes se segregan ligados, pertenecen al mismo grupo de ligamiento, en el
fondo, están en el mismo cromosoma
El grado de recombinación entre dos genes permite estimar su distancia. Para determinar si
los genes se heredan de manera independiente o no se realiza un chi cuadrado.
La proporciones de cada uno de los descendientes se obtendrán multiplicando la frecuencia
de cada uno de los gametos que los forma. En el ligamiento vamos a tener mucha más
proporción de gametos de un tipo y menos proporción de gametos de otro tipo.
Recombinación mitótica
Es menos frecuente que la meiotica. Similar en cuanto a la generación de nuevas
combinaciones de alelos. Se van a dar celulas somaticas. Es menos frecuente porque en la
mitosis los cromosomas homologos no van a buscarse entre sí pero a veces se encuentran
y recombinan
Tienen consecuencias genéticas en algunos casos relevantes
En la mitosis se dan dos cromatidas hermanas que se separan cada una a una célula hija.
Si entre dos cromátidas no hermanas se da recombinación nos va a dar cambios porque las
cromatidas se habrán intercambiado cachitos. De repente hemos pasado de una celula
progenitora heterocigota a una celula hija homocigota, se me ha dado una perdida de
heterocigosidad (LoH). NOs puede generar células hijas por tanto distintas a las madres
Cartografiado
PArticipa aquí Thomas
H.Morgan. F1 era lo que
él pensaba (machos con
cuerpo amarillo y blanco
y hembras silvestres),
pero en F2,
combinaciones como en
las de los cromosomas
preogenitores obtenia en
el 98,7% de los
descendientes mientras
que tipos que pensaba
obtener en el 25%
obtuvo un 1,3%.
Esto era posible si se daba una recombinación dentro del cromosoma. La frecuencia
variaba porque uno estaba más cerca del otro. Si los genes están muy lejos es más
probable la recombinación. Es decir, la frecuencia de recombinación es directamente
proporcional a la distancia entre genes.
Hoy en día se dice que la unidad de mapa es una distancia necesaria para que exista un
1% de recombinación. Una unidad de Morgan es 1centiMorgan. Aproximadamente, esto es
1 millon de nucleótidos pero es variable (1 megabase).
Los genes se van a encontrar siempre en los cromosomas en posicionoes determinadas y
fijas. La frecuencia de recombinación nos va a estimar la distancia entre genes.
Para calcular las distancias tapo uno de ellos. Si quiero calcular la distancia entre v y cv. Los
parentales son estos: v cv+ , v+ cv. Todas las combinaciones distintas a estas serán
recombinantes por lo tanto todo lo que sea v+ cv+, v cv, será recombinantes.
Así haremos con el resto.
Si yo sumo la distancia de v a ct y de ct a cv me da una distancia mayor que la de v a cv.
¿Porque?
He dejado de contar unos recombinantes cuando contaba la distancia entre los extremos.
Por eso es más eficaz sumar la distancia de los extremos al centro que calcular
directamente la distancia entre los extremos. Podemos no estar viendo las recombinaciones
dobles que se nos dan entre los extremos
Conforme más nos alejamos en el genoma la inexactitud va a ser mayor, la distancia
máxima en centimorgans que podemos obtener entre dos genes son 50 centimorgans (1%
es un centimorgans, 50% son 50 centimorgans). La posibilidad de medir los centimorgans
solo será posible si tenemos un punto intermedio.
En familias humanas no es
posible obtener tantos datos
como en los animales de
experimentación (número de
descendientes muy limitado) − Se aplica una aproximación estadística que permita tener en
cuenta los datos de varias familias y probar distintas frecuencias de recombinación. Lod nos
va a medri la probabilidad de que unos alelos estén ligados o no por el azar.
Ejemplo: Tengo una moneda, la tiro al aire 10 veces y cae 8 veces cara y 2 cruz. Como sé
que no está trucada o que sí lo está
Hipotesis 1: Está trucada
Hipotesis 2: No trucada
Se calcula el cociente de verosimilitudes (Odds ratio). En nuestro caso, 0,3015 / 0,0439 =
6,87. Es decir, la hipótesis de moneda trucada es 6,87 veces más verosímil. Pero para que
para que un cociente de verosimilitudes sea significativo estadísticamente al 95 % debe ser
mayor de 1000 (y su logaritmo superior a 3). Cuando el cociente es 1000 o mayor, puedo
decirle al señor del casino que está trucada. Para obtener un cociente de 1000 tengo que
tirar la moneda muchísimas veces.
Problema
La hija ha heredado A1 de la madre,
será el alelo mutado. En el caso de la
generación 3 hay 3 A1 con la
enfermedad y un A2 con la enfermedad.
Los otros alelos provienen del otro
individuo no enfermo. Según esto el
último de todos sería un recombinante,
siendo su frecuencia la frecuencia de
recombinación y la frecuencia de los
individuos no recombinantes es 1-Fr. La
probabilidad de esta descendencia
habiendo ligamiento es (1-Fr)5 x (Fr)1.
Si no están ligados (están en
cromosomas distintos) la probabilidad
será ½ elevado a 6. La primera
frecuencia la pongo en el numerador y lo
segundo en el denominador.
COmo no puedo calcular así como así la
frecuencia de recombinación. Es un
valor entre 0 y 0,5. En un ordenador pongo Z= log ((1-Fr)5 (Fr)1))/ (½)a la quinta. Esto lo
meto en una maquina y me empieza a probar valores entre 0 y 0,5. Si en algun momento Z
es mayor que 3 habré encontrado mi gen. La Z se denomina Lod score.
Siempre que el Lod score nos de un valor mayor que 3 (numerador 1000 veces mayor que
el denominador) se considera que existe una firme evidencia de ligamiento. Si tenemos
entre 0 y 1 necesitariamos más datos pero existe probabilidad de que haya ligamiento. Si
nos da entre 0 y -1 probablemente la asociación sea al azar. Si es menos de -2
efectivamente hay una asociación al azar
Hay enfermedades genéticas cuya mutación puede ser muy variada, hoy en día la
secuenciación es relativamente sencilla pero no se realiza siempre. Este ligamiento se ha
usado para seguir el rastro y poder decir si una persona era portadora o no. Nos
imaginamos que tenemos un niño en una familia que es aa, esto nos indica que los dos
padres tienen el gameto a, los dos padres son portadores. Yo determino que el niño tiene la
forma 2 en un cromosoma y la forma 4 en el otro para ese marcador genetico que está
cerca del gen causante de la enfermedad. Si analizo los cromosomas del padre tiene forma
1 y forma 2 y la madre tiene forma 3 y forma 4. Sé cuales se han transmitido al niño. Una
hermana del niño tiene la forma 1 y la forma 4 por lo que probablemente sea portadora.
Esta probabilidad será mayor cuanto más cerca este el marcador del gen porque habrá
menos probabilidad de recombinación. La probabilidad será menor cuanto más lejos esté el
marcador del gen porque habrá más probabilidad de recombinación No analizo la mutación
sino que sigo el rastro a los cromosomas mutados.
Omim
Fue creada por un médico hace más de 50 años. Este pediatra estaba desquiciado porque
no sabía organizar las enfermedad genéticas. Publicó el primer catálogo de enfermedades
genéticas humanas (de herencia mendeliana causadas por mutaciones en un gen). A lo
largo del tiempo, sacó ediciones hasta que se cansó y las pasaron a internet. Esta base es
tanto de enfermedades genéticas, pero también de genes. Se actualiza diariamente
mediante la facultad de medicina de Hopkins. Se usa para enfermedades o fenotipos, pero
también tiene fichas de genes. Para enfermedad, hay que buscar el símbolo #. Según el
primer número, se sabe su herencia.
Malacards
Creada en Israel. La diferencia con respecto a la otra es que no hay personas modificando
las fichas, sino que llama a otras bases de datos para mostrarlo en una única página. Son
tarjetas de enfermedades. Da acceso a ensayos clínicos o nuevos tratamientos de
enfermedades raras. Puede dar distintos tipos de enfermedades. Los nombres pueden
variar con respecto a OMIM. Es la unica otra base de datos de enfermedades.
Orphanet
Es la europea. Nos lleva a omim. No es muy buena, solo en algunas cosas. Está muy
incompleta pero es buena para directorio de centros o consulta de …e inventario de
medicamentos huerfanos. Un medicamento huerfano es un medicamento dirigidos a tratar
enfermedades tan infrecuentes que no se comercializan. Ninguna industria está dispuesta a
dedicar años de investigación para sacar unos medicamentos para un grupo de población
tan reducido.Se ha visto que estos medicamentos pueden tratar algunas dolencias para las
cuales no hay nada. Las enfermedades geneticas son raras, afectan a menos de 1 de cada
5000.
La mayor parte de las enfermedades considetadas genotipicas son de fenotipo mutante.
Las mutaciones pueden estar a distinto nivel: secuencia o cromosoma
La mutación puede tener distintos efectos que nos condicionen el genotipo.
Heterocigoto compuesto
Los dos alelos son no funcionales. Pueden ser iguales, en cuyo caso son homocigotos o
distintos y ser heterocigotos funcionales. Hay medicamentos que a veces funcionan con una
mutación. Si yo tengo una enfermedad y un alelo tiene la mutación y otro no puede no
funcionar el medicamento.
Nos podemos encontrar que distintas mutaciones causan una misma enfermedad, me
pueden causar distintas enfermedades.
Aminoacidopatías
Fenilcetonuria→ La más relevante es la fenilcetonuria. Se da por deficit de la fenilalanina
hidroxilada. NOs da una acumulación de fenilalanina con alteraciones en el desarrollo del
SNC. Se diagnostica mediante la prueba del talon. Sino se pilla a tiempo puede haber
problemas importantes en el SNC.
Alcaptonuria → Afecta a muy pocas personas Hay un deficti de la homogentístico
dioxigenasa lo que provoca acumulación de tirosina y fenilalanina. La orina adquiere un
calor negro-marrón
Enfermedad de la orina en jarabe de arce (AR). → Déficit del complejo descarboxilasa de
los cetoácidos de cadena ramificada. Tratamiento mediante evasión de leucina, isoleucina y
valina.
Enfermedades del ciclo de la urea
Conjuntamente 1:25k-50k. Se trata limitando el nitrógeno (proteínas) en la dieta e
intentando eliminar el exceso de nitrógeno. Todas son hiperamonemias (amoniaco en
sangre). Como ejemplo la hiperargininemia y la citrulinemia. Son todas AR, excepto el déficit
de ornitina-transcarbamilasa, que es ligada al X.
Enfermedades en el metabolismo de hidratos de carbono
Galactosemia→ Intolerancia a la lactosa neonatal
Fructosemia→ Intolerancia a fructosa, sacarosa o sorbitol. Se deben evitar dulces y fruta.
Es la enfermedad que te impide comer chuches.
Intolerancia hereditaria a la lactosa→ Somos el unico mamifero que toma leche después de
la lactancia. Lo normal como mamiferos sería ser intolerantes. Durante la evolución se ha
expandido porque presenta un beneficio a la hora de tener acceso a un alimento barato y
facil. En el sur de Asia, lo normal es ser intolerante a la lactosa, geneticamente (no porque
me sienta mal porque me da la gana). Hoy en dia podemos tomar leche sin lactosa porque
lleva lactasa
Diabetes mellitus tipo 1→ Dependiente de insulina
Diabetes mellitus tipo 2→ Resistente a la insulina
Diabetes juvenil de comienzo en la madurez→ aquí si que están descritos varios genes, en
las anteriores no.
Glucogenosis→ deficit de distintas enzimas que inducen a la degradación de glucógeno.
Están numeradas del 1 al 6. Son relativamente frecuentes en determinados grupos étnicos.
Son poblaciones que o alguno de sus fundadores han transmitido el alelo a sus
descendientes o son poblaciones pequeñas que han dado individuos heterocigotos y se ha
transmitido la enfermedad
Metabolismo de lípidos
Hipercolesterolemia familiar→Mutaciones en el receptor de LDL que provoca un aumento
del LDL en sangre y mayor predisposición al infarto de miocardio. Los heterocigotos son
hipercolesterolámicos y los homocigotos más, esto se denomina efecto de dosis génica.
Muy rara entre homocigotos y más frecuente entre heterocigotos. 1 de cada 20 individuos
con colesterol alto tienen esta patología. Hay más de 400 mutaciones distintas divididas en
clases funcionales, afectan a distintas partes de la proteína.
Metabolismo de purinas/pirimidinas
Síndrome de Lesch-Nyhan→ Ligado al X. Mutación del gen de la hipoxantina guanina
fosforribosil transferasa. Estas personas sufren de automutilaciones. Aumento de síntesis
de purinas y acumulación de ácido úrico y precursores.
Metabolismo de porfirinas
Déficit de las enzimas de la biosíntesis del grupo hemo (hemoglobina y citocromo P450);
dominantes. Afectación hepática (citocromo) o eritropoyética (hemoglobina). En algunos
casos recibimos el fármaco inactivo y el metabolismo lo activa, sino funciona, no lo puede
activar.
Afectación hepática
• Porfiria agua intermitente (AD): Enfermedad farmacogenética porque se agrava por
administración de esteroides, anticonvulsionantes y barbitúricos. Mutació
• Coproporfiria hereditaria (AD).
• Porfiria variegata (AD).
Afectación hepática o eritropoyética
• Porfiria eritropoyética congénita (AR): Fotosensibilidad extrema y anemia hemolítica.
• Protoporfiria eritropoyética (AR): Fotosensibilidad y enfermedad hepática crónica.
Hemoglobinopatías
Afectan al funcionamiento de la hemoglobina y siempre llevan a anemias. Hay gente con
anemias crónicas por anemias genéticas. Ahora se está probando CRISPR Cas porque esto
afecta a mucha gente, es una de las enfermedades monogénicas más numerosas. La
hemoglobina es fundamental en el transporte de oxígeno y está formada por dos cadenas ß
y dos cadenas alfa. Los genes de la globina forman familias ß y alfa. Cambian su expresión
a lo largo del desarrollo (cambian de letra). Se están tratando enfermedades ß por terapia
génica
Anemia de células falciformes→ Una de las más frecuentes, da lugar a eritrocitos en forma
de hoz que se acumulan formando trombos. Se cambia una glutamina por una valina en el
aminoácido 6. La ß-globina se produce en cantidades normales, pero es anómala (HbS) y
precipita en forma de agregados poco solubles dentro del eritrocito, perdiendo su actividad y
haciendo que tenga forma de hoz. El eritrocito pierde su actividad. Es asintomática en
heterocigotos. Es más frecuente en la zona endémica de la malaria. Parece que los
heterocigotos son resistentes a la malaria. Si erradicaramos la malaria la población africana
disminuiría mucho por esto. Los homocigotos mueren o bien por malaria o bien por la
anemia.
Alfa talasemias→ Una hemoglobina necesita 2 alfa y 2 beta. Si rompo el equilibrio, por
mucho que tenga de una, si no tengo la otra me va a ir mal. En esta tengo una ausencia de
la alfa-globina. Cada uno de nosotros tenemos 4 genes de la alfa globina, 2 en cada
cromosoma puesto que hay dos tipos de alfa globina, la 1 y la 2. Pueden estar afectados 1,
2, 3, 4. Cada vez que me vaya uno de los genes pierdo un 25% de la hemoglobina. Cuando
pierdo los dos de un cromosoma es talasemia tal-1 y cuando pierdo uno de cada es tal-2.
POr debajo del 50% tengo anemia. Los portadores silenciosos serían tal-2.
Alzheimer
Afecta al 2% de la población. Causa más frecuente de demencia. Pérdida crónica y
progresiva de memoria y funciones intelectuales. Enfermedad compleja y multifactorial; tres
formas raras autosómicas dominantes (7-10% casos), el resto susceptibilidad genética
(alelo epsilon4 del gen APOE).
Tipo 1→ Es dominante y tienen mutación en el gen que codifica la proteína beta amiloide.
Solo es un 2% del familiar, muy bajo.
Tipo 3→ Mutación en el gen presenilina 1
Tipo 4→ Mutación en el gen presenilina 2