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3. ENZIMAS IMPLICADAS
Las enzimas implicadas en la replicación del ADN son las nucleasas, que son enzimas
que cortan las cadenas de ARN (ARNasas) o ADN (ADNasas) en distintas zonas:
Exonucleasas → Realizan los cortes en los extremos de las cadenas.
Endonucleasas → Realizan los cortes en el interior de las cadenas.
Polimerasas → Sintetizan las nuevas cadenas.
Además, pueden cortar ambas cadenas por el mismo sitio, dando lugar a extremos
romos, o en distintas zonas, generando extremos cohesivos.
El centro activo de la ADN polimerasa I tiene 3 grupos aspártico y 2 grupos magnesio (casi
todas las ADN polimerasas tienen los mismos grupos en su centro activo)
POSIBLES ERRORES
A veces las bases nitrogenadas se encuentran tautomerizadas, por
lo que las enzimas las confunden:
Adenina→ Presenta 2 formas tautoméricas, amino (normal) e
imino, que se parece a la citosinay se aparea con guanina.
Guanina→ Presenta 2 formas tautoméricas, ceto (normal) y
enol, que se parece más a la timina. Se aparea con adenina.
Pueden formar puentes de hidrogeno con la base equivocada
puesto que su estructura tridimensional se parece a otra. Ocurre 1 de
cada 10000/100000 bases que pone la polimerasa.
CORRECCIÓN DE ERRORES
La mayoría de las ADN polimerasas tienen un sistema de corrección
de errores que consiste en una actividad exonucleasa (degrada el
ácido nucleico por el extremos 3’), va en dirección3´→5´(actividad
correctora de errores).
4. E. COLI
Tiene 5 polimerasas:
ADN polimerasa I→ Consta de 1 cadena polipeptídica y 3 centros activos:
~ Posibilidad de corrección deerrores → Ya que tiene actividad exonucleasa
en la misma dirección en la síntesis.
~ Es lenta → Pone entre 16 y 20 nucleótidos por segundo.
~ ↓procesividad→ Sirve para fragmentos pequeños.
~ Actividad exonucleasa 5’ → 3’. La III NO.
~ Actividad exonucleasa 3’ → 5’ en I, II y III.
ADN polimerasa II→ Implicada en un tipo de reparación(ADN polimerasa II y III
comparten 6 subunidades). No está implicada en la replicación.
ADN polimerasa III→ Consta de 10 cadenas polipeptídicas(complejo enzimático).
~ Posibilidad de corrección de errores.
~ Es rápida (+ rápida que la I y la II) → Pone entre 250 y 1000 nucleótidos por
segundo. (Velocidad de polimerización). Después es más rápida la II que la I.
~ ↑procesividad (cuanto tiempo ha estado unido al ADN), cantidad de
nucleótidos que puede poner antes de disociarse. Nucleótidos añadidos antes
de polimerizar. (> que la I y la II). Una vez que se engancha, coloca medio
millón de nucleótidos. Después es más rápida la II que la I.
ADNpolimerasa IV y V→ Implicadas en reparaciones. No están implicadas en las
replicaciones.
~ La polimerasa se disocia.
6. REPLICACIÓN EN BACTERIAS
6.1 INICIACIÓN
Es la fase de preparación de las cadenas para la posterior actuación de la ADN
polimerasa III. Se forman 2 horquillas de replicación, una hacia cada lado.
Hay 1 sólo origen de replicación, conocido como oriC(245pb)→ Región donde empieza
siempre la replicación, que posee secuencias consenso (lo que normalmente se da en la
mayoría de las bacterias) muy evolucionadas evolutivamente:
Zona DUE→ Elemento de desenrrollamiento del ADN. Zona en que se repite una
secuencia (GATCTNTTNTTTT) 3 veces. Es rica en pares deA-T, que son más
débiles, por lo que es la zona en que se abre la cadena.
Sitios Iy sitios R→ Sitios de unión a ADNa, una proteína clave que abre la hebra
de la zona DUEmediante el gasto de ATP.
SitiosIHFy FIS→ Se unen los factores que estimulan la iniciación.
REGULACIÓN
La regulación de la replicación del ADN se lleva a cabo en esta fase (regula la iniciación,
es parte de ella), mediante la regulación de diversas enzimas:
Dna A
Es la 1ª que se une al ADN, y dice cuando se inicia la replicación.
Es una enzima muy lenta, que tarda 20min en realizar toda su reacción. Además, la
división de la bacteria tarda también 20min.
Esto es así para evitar que haya más de una replicación para la misma célula, ya que
sólo puede haber una replicación en cada célula.
Por ello, justo después de la replicación se da una hemimetilación →En cada cadena de
ADN, una de las hebras está metilada (la antigua), y la otra NO está metilada (la nueva).
Estas zonas hemimetiladas quedan secuestradas por la membrana plasmática, de
manera que el origen de replicación queda anclado y NO puede volver a iniciarse el
proceso.
6.2 ELONGACIÓN
La ADN polimerasa IIIlleva a cabo la adición de
desoxirribonucleótidos en extremos 5’ de los primer, que añadieron
anteriormentelosprimeros nucleótidos. Siempre en dirección 5’ → 3’.
Una de las hebras se replica en la misma dirección de la horquilla, y
otra en sentido contrario, pero ambas hebras se polimerizan gracias a
la misma polimerasa (ya que tiene 2 núcleos).
Para polimerizar la hebra continua → Añade nucleótidos
consecutivamente, sin soltarse de la hebra. NO necesita más
primers.
Para polimerizar la hebra discontinua → Gira la hebra y forma los fragmentos de
Okazaki, soltándose cada vez para formarlos de nuevo. Necesita primers por
cada fragmento:
~ El primosoma se forma de nuevo para la síntesis de un nuevo primer. Una
vez formado, la primasa se disocia.
~ El ‘complejo de carga’ va añadiendo abrazaderas a los orígenes de cada
fragmento de Okazaki, mientras que en la hebra continua hay una única
abrazadera.
Este proceso consume ATP, ya que se necesitan 3ATP para cerrar cada una de las
abrazaderas.
La ADN polimerasa I va eliminando el primer y va añadiendo los nucleótidos
correspondientes, hasta eliminar el primer. Es útil esta enzima porque tiene baja
procesividad → NO se ancla a la hebra, NO elimina todo el fragmento.
Finalmente ambos fragmentos de Okazaki están separados por un Nick, y se unen gracias
a la ligasa.
6.3 TERMINACIÓN
Si ambas horquillas de replicación van a la misma velocidad, la terminación de la
replicación se da en el extremo opuesto del ADN circular bacteriano. Si van cada una a
una velocidad distinta, es por un error, entonces la horquilla que se encuentra más errores
va más retardada.
Pero NO ambas horquillas van a la misma velocidad, por la presencia de errores, daños o
mutaciones en el ADN.
7. REPLICACIÓN EN HUMANOS
En eucariotas hay diversas diferencias, ya que los cromosomas son más grandes y
lineales. Nuestras células no se replican (no se dividen tan rápido como las bacterias).
7.1 INICIACIÓN
En los cromosomas humanos hay más orígenes de replicación (siempre son los mismos).
Además de las enzimas explicadas en la replicación bacteriana (otros nombres), también
hay otras enzimas:
ORC→ Originrecognitioncomplex.
CDC6→Cell division cycle (análoga a DnaC).
MCM→ Varias proteínas de mantenimiento, forman un complejo hexámero
(MCM2 a MCM7) (análogas a DnaB).
CDT1→Requerida por complejo MCM2-7.
CDC6 y CDT1 se separan del complejo mediante hidrólisis de ATP.
7.2 ELONGACIÓN
Los cromosomas humanos NO se replican a tanta velocidad como en las bacterias, ya
que NO necesitan dividirse tan rápidamente.
Además, en humanos hay 9 polimerasas diferentes, entre ellas:
Polimerasa α→ Proteína bifuncional, que tiene actividad primasa (ARN
polimerasa) y ADN polimerasa. Inicia la replicación colocando los primers y
elongando ligeramente (↓ la progresividad).
Polimerasa β→ Actividad de reparación.
Polimerasa γ(gamma) → Polimeriza la hebra discontinua (↑ la progresividad).
Se ocupa de la replicación mitocondrial del ADN.
Polimerasa Ȣ(delta)→ Se piensa que replica los fragmentos de Okazaki. Unida a
la épsilon.
Polimerasa Ԑ(épsilon) → Polimeriza la hebra continua (↑la progresividad).
Aunque haya distintas polimerasas encargadas de la síntesis de las cadenas, ambas están
unidas y actúa coordinadamente.
Además, los fragmentos de Okazaki son más pequeños que en bacterias.
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7.3 TERMINACIÓN
Dado que hay muchos orígenes de replicación, cuando van uniéndose unos a otros se va
formando la cadena, pero el problema está en los extremos.
El último fragmento de Okazaki tiene como extremo el primer que lo originó, pero éste NO
puede ser reemplazado por nucleótidos de ADN → En elciclo de replicación, la hebra
discontinua se acorta, los cromosomas son más cortos.
Para solucionarlo, llevamos a cabo la síntesis de nuevos telómeros, gracias a la enzima
telomerasa, pero NO está presente en todas las células.
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