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Oleeeee (Talleres 1 y 2 –
Primeras 6 síntesis conceptuales)
Seminario 1. Mantenimiento y variabilidad del genoma nuclear.
El genoma humano no es estático, hay mecanismos que median la variabilidad
genética.
Información básica para entender esto
Las líneas son un cromosoma. Estos tienen porciones de ADN repetitivo que no son
codificantes, pero sí tienen información estructural para poder mantener el ciclo vital de los
cromosomas en el ciclo celular.
- Los centrómeros son porciones de los cromosomas que van a permitir que los
microtúbulos se unan durante la división celular, permite que las cromátides hermanas
se separen.
- Las porciones de origen de replicación son puntos en los cromosomas que permiten el
inicio de la replicación
- Los telómeros son los extremos de los cromosomas, fundamentales para mantener su
longitud de los cromosomas.
El resumen incluye tanto los seminarios como info de los caps correspondientes de la
bibliografía de la cátedra (Cooper + PDFs dados por la cátedra)
- Hay procesos que hacen la copia más fiel
- Muchas proteínas se asocian en las horquillas de replicación
La replicación del ADN siempre se da en el sentido 5´- 3´ (posición de la desoxirribosa)
siempre se agregan al oxidrilo que se encuentra en la posición 3´. Y para unirse los
nucleótidos cuentan con 3 fosfatos de los cuales pierden 2 para unirse a la cadena. Es
una ventaja evolutiva porque permite que el nucleótido se desprenda si se detecta un
error durante la lectura de prueba y se coloque uno correcto, porque el que tiene la
energía para que se produzca la polimerización es el nucleótido, no la cadena.
Fases de la replicación:
1- Fase de iniciación: Proteínas
reconocen los sitios de origen de
replicación (zonas repetitivas
reconocidas por un complejo
proteico)
2- Fase de elongación: Las ADN
polimerasas polimerizan el ADN y lo
copian
3- Terminación: Cuando todo el ADN se
copió a excepción del extremo del
telómero. La copia del telómero es
mediada por la telomerasa.
Múltiples orígenes de la replicación es
una ventaja evolutiva, hace que el
genoma se copie más rápido.
5´fosfato – 3´hidroxilo
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¿Cómo se producen estos eventos?
El complejo de reconocimiento del origen (Complejo proteico[ORC]) va a reconocer
los puntos de origen (G1), zonas del
ADN ricas en adenina y timina. Y va a
permitir a posteriori la unión de
otras proteínas, entre ellas la
helicasa MCM (S), que permite la
separación de las dos cadenas, y
también la unión de las ADN
polimerasas
La ADN polimerasa lee en el sentido
3´-5´y polimeriza dNTPs
(Desoxirribonucleósidos triosfato,
osease A-T, G-C) en el sentido 5´-3´
Al terminar el periodo S se liberal las
helicasas y no pueden volver a
unirse hasta que haya una nueva
etapa de duplicación del ADN
celular. Eso evita la reduplicación del
ADN en un mismo ciclo.
Las ADN polimerasas no pueden iniciar la síntesis de nucleótidos por sí mismas (No
sintetiza denovo), necesitan un oligonucleótido (segmento) con un extremo 3´que
les permita continuar. Este segmento de ARN es creado por la primasa, una ARN
polimerasa dependiente de ADN sintetiza los primers para que las ADN
polimerasas puedan iniciar (Sintetiza denovo) También sintetiza en sentido 5´- 3´
leyendo en sentido 3´- 5´.
(Fase de iniciación)
Fase de elongación:
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La primasa sintetiza primers para que la ADN polimerasa pueda sintetizar la nueva
cadena. En el caso de la cadena adelantada solo va a sintetizar el primer primer (La
de arriba) pero para la cadena atrasada va a sintetizar múltiples fragmentos de
okazaki, que van a permitir sintetizar la cadena retrasada. Los fragmentos de
okazaki no se van a quedar ahí, van a irse después, este proceso se va a dar gracias
a la acción ARNasa H (Esta ARNasa H es parte de la ADN polimerasa) que degrada al
primer en dirección 5´-3´, después vienen las ADN polimerasas, y reemplaza el
primer (Que ya no está) por la cadena de ADN. La ligasa se va a encargar de luego
unir los segmentos que se sintetizaron a partir de fragmentos de okazaki con los
que se crearon después de que el fragmento de okazaki se retiró.
Algunas ADN polimerasas son también exonucleasas, si el nucleótido está mal, o
pierde la union a través de puentes de hidrógeno con su base complementaria,
entonces la ADN polimerasa con función de exonucleasa lo “corta”, y lo reemplaza
con el correcto.
Hay varios tipos de ADN polimerasas, pero todas comparten dos detalles:
- Todas sintetizan en sentido 5´-3´.
- Todas necesitan de un primer para poder iniciar la síntesis (No sintetizan
denovo).
La única ADN polimerasa que tiene primasa asociada es la alfa. Esta va a sintetizar
el primer fragmento de la hebra nueva luego del primer. Luego la reemplaza la
épsilon o la delta dependiendo de qué cadena sea.
La épsilon va a actuar en la polimerización de la cadena adelantada, mientras que
la delta va a actuar en la polimerización de los fragmentos de okazaki (Ambas
tienen la función de lectura de prueba, pero no están asociadas a la primasa,
osease no sintetiza a los primers). La delta además tiene función exonucleasa 5´-3´
entonces elimina los fragmentos de okazaki y sintetizan ya de cruce lo que va en su
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lugar, por eso va a en la cadena atrasada, porque ahí hay más fragmentos de
okazaki.
La capacidad de las ADN polimerasas de escindir nucleótidos en sentido 3´- 5´ es la
LECTURA DE PRUEBA, mientras que la capacidad de escindir nucleótidos en sentido
5´- 3´es la capacidad de QUITAR LOS FRAGMENTOS DE OKAZAKI O PRIMERS. No es
lo mismo.
ADN polimerasas que participan en la Síntesis de ADN:
- Alfa - Epsilon
- Delta
Al final la ligasa utiliza ATP para unir los baches que fueron dejando los fragmentos
de okazaki. Osease liga los fragmentos de okazaki entre sí.
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que hay un rulito (No estático) que las mantiene cerca de la horquilla, sino se irían
alejando de la horquilla y eso no serviría
PCNA y RPC
Terminación:
Las células eucariotas tienen cromosomas con extremos libres, esto es un
problema para la replicación del ADN.
Estos extremos se llaman telómeros, y se componen de repeticiones en tándem de
secuencias simples de ADN. Estos extremos de la cadena son replicados por la
telomerasa. Una enzima transcriptasa inversa, osease que sintetiza ADN a partir de
una cadena de ARN que es complementaria con la secuencia de bases de los
telómeros. Entonces se une al extremo de la cadena de ADN por
complementariedad de bases, y así permite que se extienda el telómero de la
cadena molde, de ahí se crea otro fragmento de okazaki en la cadena hija para
continuar con la síntesis de esa nueva cadena de ADN, eso permite que las
moléculas de ADN no pierdan su extensión, después la ligasa va y une todo.
Nosotros hay partes de la cadena de ADN que no podemos perder. Pero el extremo
de la cadena molde, que va a ser el telómero, siempre va a quedar más largo que la
nueva cadena, entonces cuando se termine de crear la nueva molécula de ADN,
ese extremo de la cadena molde que quedó más largo se va a enrrollar para darle
más estabilidad a la molécula de ADN, si no existieran los telómeros, esa rosca que
se hace se comería parte importante de la cadena y sería perjudicial para la
molécula. Los telómeros son secuencias simples, que van a evitar que eso pase
cuando se enrosque la cadena al final. La telomerasa va a permitir mantener la
longitud del ADN en su etapa de replicación.
La célula pierde la capacidad de replicación a medida que pasa el tiempo, esto se
debe a que los telómeros se acortan porque la expresión de la actividad de la
telomerasa va disminuyendo con el tiempo.
Todo esto causa la senescencia proliferativa de las células somáticas. Muerte
programada.
La duplicación del ADN va a estar acompañada por el aumento de la síntesis de
histonas, aumento de formación de octámeros y de nucleosomas, para formar la
cromatina que necesitan las moléculas de ADN
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La expresión continua y de altos niveles de las telomerasa impide que se acorten los
telómeros e impide el proceso de seecencia proliferativa, esto se ve en celulas
tumorales, celulas madres y celulas germinales.
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4- Escisión de nucleótidos: El daño es mayor, en varias bases al mismo tiempo. Una
escinucleasa va a cortar el nucleótido (15 pares de bases aprox), la helicasa lo va a separar
del complejo, la ADN polimerasa lo va a rellenar y la ligasa lo va a unir con el resto de la
cadena. Ocurre en cualquier momento del ciclo celular.
Es una reparación directa. A una base se le puede agregar un grupo alquilo, lo que altera
la estructura de la base. Las enzimas metil guanin ADN metil transferasa van a actuar
sobre esta base. Ocurre en cualquier momento del ciclo celular.
Si hay una rotura de doble cadena, lo que se va a hacer es tomar ambos extremos de la
hebra molde y se van a unir entre sí, el problema es que en ese proceso se pierden muchos
pares de bases.
Es propenso a errores porque mantiene la estructura del ADN, pero es probable que se
desarrollen mutaciones por la pérdida de pares de bases.
Suele darse en G0/G1
7- Recombinación homóloga
Si el daño se produce en G2 donde una cromátide hermana está unida a otra cromátide
hermana. La sana puede ser usada como molde para sintetizar el pedazo roto de la cadena
rota. Si copia la cromátide hermana va a copiar la misma secuencia que la original. Y si se
copia de un cromosoma homologo la secuencia va a cambiar, pero probablemente siga
siendo codificante.
La proteína clave es Rad51, que se une a la secuencia de ADN monocaternario y forma
filamentos proteína-ADN. Luego se une a otra secuencia de ADN bicaternario y forma un
complejo entre los 2 ADN y cataliza el intercambio de hebras entre secuencias homologas.
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Los cromosomas tienen una sola cromátide en G0 y G1, pero a partir de G2 son dos
cromátides hermanas, por la síntesis de las nuevas cadenas de ADN en S, entonces ahí se
pueden arreglar por recombinación homóloga, pero los cromosomas homólogos son el
paterno y el materno, que en G1 tienen una sola cromátide, y en G2 tienen dos cromátides
hermanas. Esa es la diferencia entre cromosomas homólogos y las cromátides hermanas.
Variabilidad genética:
- Mutaciones: Cambios en la secuencia de nucleótidos que escapan a los mecanismos de
reparación del ADN. Llevan a la variabilidad del genoma. No necesariamente tienen un
efecto negativo.
Inserción: Se añaden bases
Deleción: Se pierden bases
Sustitución: Se cambian bases.
- Reorganización del ADN: Se combinan de distintas formas segmentos de ADN.
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Transposición: Segmentos de ADN que pasan de un lugar a otro por acción
de la enzima transposasa.
Transposición a partir de ARN: El ARN sirve de molde para crear una hebra
de ADN.
Sexo
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Saber:
- Mecanismo de replicación del ADN + componentes enzimáticos, en qué
momentos del ciclo celular se produce.
- Mecanismos de reparación del ADN, en qué circunstancias participan y en
qué momentos del ciclo celular se dan.
- Principales mecanismos de variabilidad genética
Amplificación:
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- Es exponencial.
- La región objetivo va a ser copiada múltiples veces y a más se copie más
moldes vamos a tener.
Tenemos que el ADN se desnaturaliza y tenemos 2 cadenas, eso son las
líneas negras. La porción a amplificarse es la línea roja. Los primers son
las rayitas celestes, que van a determinar el inicio de la síntesis de la
nueva cadena de ADN dada por la Taq polimerasa. Si sabemos que la
ADN polimerasa siempre sintetiza en sentido 5´-> 3´ (Leyendo de 3´a 5´),
la síntesis se va a dar en el sentido que indican las flechas violetas. Y el
producto que vamos a tener es el que muestra la última imagen, a partir
de esas dos últimas cadenas se va a generar exactamente el mismo ciclo
y va a seguir como muestra el gráfico. Así es cómo vemos un aumento
exponencial de la secuencia que buscamos amplificar.
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A medida que los ciclos avanzan la replicación es más lenta, porque nos quedamos
sin ADN polimerasas, primers, dNTPs, etc. suficientes.
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Las bandas más intensas tienen más cantidad de ADN.
PCR punto final: Información cualitativa
(Presencia/Ausencia del producto del amplificación)
(No suele ser cuantitativa)
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- ARN cADN
- Utiliza transcriptasas reversas (Familia de ADN polimerasas que pueden usar
ARN para hacer ADN) para pasar de ARN a cADN.
Después de este paso, la técnica se vuelve similar a la PCR normal, punto final o en
tiempo real.
RT-qPCR: Usada para detectar al covid, también sirve para detectar VIH (Porque el
material genético de estos virus es ARN) (Es una PCR cuantitativa que previamente
creó cADN a partir de ARN).
Conceptos:
- Ciclo celular: Periodo cíclico en el cual las células entran en
diferentes fases. Suele durar 24 horas
- Citocinesis: División celular
- Interfase: Intervalo entre 2 mitosis.
- G1,2: gap1,2
- G0: Reposo del ciclo. La célula es activa metabólicamente pero no
prolifera. Las neuronas y las celulas musculares suelen estar en G0.
- Fase S: Síntesis
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Mecanismos moleculares que regulan el ciclo celular: (Regulación
Intracelular) CDK y Ciclinas
- Quinasas dependientes de ciclinas y Ciclinas que se asocian a las quinasas
- Quinasas: Proteínas que pueden fosforilar otras proteínas. Agregan un grupo
fosfato a otras proteínas. Solo pueden estar activas cuando están unidas con las
ciclinas. La unión de la ciclina expone el sitio activo de la quinasa que va a
fosforilar otras proteínas. Está presente todo el tiempo, pero necesita a la ciclina
para poder ser activa.
- Ciclina: Aparece o desaparece dependiendo del momento del ciclo.
Las Ciclinas y las quinasas van a permitirle a la célula pasar diferentes fases
dependiendo de si el ambiente y las condiciones se encuentran favorables, si se
detecta algún error el ciclo de va a frenar.
- En el final de G1, las Ciclinas y las quinasas deben interactuar para permitirle a la
célula entrar en fase S. Luego se degradará la ciclina y la quinasa quedará
inactiva.
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Checkpoint: Hay mecanismos moleculares que regulan las proteínas dependientes del
ciclo celular y detenerlo en caso de detectarse X información celular.
- Start: Es uno de los primeros puntos de regulación se encuentra a finales de G1
y permite el paso a fase S. Se reciben señales que indican si las condiciones del
ambiente son favorables y si la célula es lo suficientemente grande. Si todo está
OK se activan las ciclinas que se unen a las quinasas y permiten el paso a la
siguiente fase, porque van a fosforilar proteínas necesarias para la síntesis de
ADN como las polimerasas, helicasas, etc.
- En S vamos a tener un checkpoint: La célula va a chequear que todo el ADN
replicado esté bien y no haya problemas, (lo que vimos en el seminario 1), ahí se
vuelven a activar las ciclinas que se van a unir a las kinasas y va a pasar a G2.
- En G2 vamos a tener otro checkpoint: Este checkpoint se va a preguntar si todo
el ADN está compactado, y si todo está okay va a continuar y pasar a M.
- En M hay otro checkpoint que va a chequear que los cromosomas estén
alineados para poder realizar la división y si todo está bien la célula se va a
dividir y va a resultar en dos células en fase G1.
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Los factores de crecimiento son proteínas, moléculas solubles, etc. que se unen a
receptores de membrana y generan una cascada de señales que llegan al núcleo, y va a
permitir la expresión de genes, probablemente genes de producción de ciclinas.
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proteínas. Las más importantes son Cdk 25 y p53 (Muerte celular
programada/activador de p21 para arresto celular).
El incremento de p53 produce un aumento en la síntesis de p21 que produce el arresto
del ciclo celular.
Si p53 se activa en mayor modo se va a llevar a una muerte celular programada.
Fase S:
La entrada a fase S va a estar regulada por la CdK 2 y la ciclina E. La ciclina E es
sintetizada gracias a la expresión de E2F.
CdK2/Ciclina E activan la síntesis de ADN en los orígenes de replicación.
En esta fase se activan cohesinas, porque el ADN que se está duplicando debe
compactarse, para llegar a G ya compactado.
Fase M:
En la metafase necesitamos tener el máximo grado de compactación del cromosoma.
Para separar las células de manera controlada vamos a necesitar microtúbulos, estos
van a formarse a partir de dos centrosomas, que van a ser centros organizadores de los
microtúbulos. La función de los microtúbulos en la profase va a ser alinear a los
cromosomas en el ecuador.
Durante la división celular necesitamos varios microtúbulos:
Los microtúbulos son el esqueleto de la célula, salen de los centriolos, los centriolos
son tubitos que están en el citoplasma que van a dividirse en dos, para darle uno a
cada célula hija.
- Cinetocóricos: Van a unir los microtúbulos a los cinetocoros de los cromosomas
- Polares: Unen microtúbulos de un extremo del centrosoma con los microtúbulos
del otro extremo del centrosoma.
- Astrales: Van a adherirse a la membrana plasmática.
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Para que se produzca la mitosis tiene que actuar el factor promotor de la mitosis (Es
una kinasa dependiente de ciclina) y el COMPLEJO PROMOTOR DE LA ANAFASE(Es una
ubiquitin ligasa, osease que le agrega una ubiquitina a las proteínas para que después
se degraden por proteosoma, es como que las marca para el matadero). Para activar el
complejo promotor de la anafase necesito que esté fosforilado, y esa fosforilación la va
a hacer el complejo promotor de la mitosis, que me fosforila el complejo promotor de
la anafase, que me ubiquitina el factor promotor de la mitosis, osease que se degrada
la ciclina del complejo promotor de la mitosis y deja de andar. Pero también
ubiquitiniza la securina, la securina es una proteína que inhibe la acción de la separina,
entonces al ser ubiquitinizada la securina puede ser degradada y puede permitir la
acción de la separina, esa separina va a ir al cromosoma y va a romper la cohesina, la
cohesina es una proteína que mantiene MUY unidos a los cromosomas y da igual que
tiremos con los microtúbulos que no lo vamos a separar, pero cuando ya no tenemos
cohesina los cromosomas sí pueden separarse.
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desregulan puede haber proliferación en Codifican proteínas que cuando
exceso y crearse tumores) aumentan su número/actividad
favorecen el desarrollo tumoral. (Se los
llama oncogenes si ya existieron
mutaciones que facilitaron el fenómeno).
En algunos casos codifican proteínas que En algunos casos codifican proteínas que
detienenel ciclo celular: Actúan en estimulan la progresión del ciclo celular.
checkpoints (p53,p21,BRCA,ATM) (Ciclina D, EGFR, Ras, Raf, Erk)
Se requiere que ambos alelos estén Uno de los alelos muta. Se gana función
mutados para favorecer el desarrollo (Un oncogén es un protooncogen que mutó
generando una mutación que puede,
tumoral. Se observa pérdida de función.
potencialmente, llevar a una proliferación
(Los genes supresores de tumores tienen descontrolada que podría terminar en
que perder su función para que se cáncer)
desarrolle un tumor)
Proteínas proapoptóticas: Bax, Bad Proteínas antiapoptóticas: bcl12
Inhibidores de vías de crecimiento: PTEN Aumento de la actividad de la
Inhibidores de angiogénesis: VHL telomerasa: c-myc
Adquiere un fenotipo invasivo: Wnt1
Arresto de la célula:
P53 en condiciones normales se reconoce y se degrada a través de la ubiquitinligasa
(Condiciones normales). Pero si hay daño en el ADN, p53 es fosforilada y se vuelve
estable, no es reconocida por la ubiquitinligasa. Por eso va a producir mensajeros de
p21 que llevan a la inhibición de la replicación, inhibiendo la activación de las quinasas
y entonces se arresta el ciclo celular.
Poblaciones celulares:
Para generar un tejido vamos a necesitar los procesos de división celular.
Durante el inicio de un organismo, las células están constantemente replicándose.
Pero una vez el tejido ya se estableció, las células empiezan a entrar en G0, donde no
proliferan, pero sí son activas metabólicamente. Estos tejidos van a mantenerse de
diferentes formas:
1- Mantenimiento de tejidos por división de células diferenciadas.
Las células del tejido pueden dividirse o permanecer en G0 y así mantienen el
tejido.
2- Mantenimiento por las células madre en tejidos de alto nivel de renovación
celular.
Las células madre del tejido son las únicas con la capacidad de dividirse y generar
células diferenciadas.
3- Tejidos con células permanentes
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Ej. Tejido nervioso. Existen nichos de células madre los cuales repueblan zonas muy
específicas y vitales, pero no son capaces de repoblar todo el tejido.
EL mARN debe ser regulado para que no salga al citosol y sea degradado.
Los procesos que se necesitan para estabilizar el ARNm y hacerlo capaz de sobrevivir en el citosol son
co-transcripcionales (Se dan a medida que se transcribe el ARNm) debido a que muchas de las enzimas y
proteínas que llevan a cabo estos procesos se encuentran en uno de los dominios de la ARN polimerasa
2 (en el extremo carboxi terminal). Y son las siguientes:
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Para producir el Cap (Sombrero) tenemos un complejo de unión a Cap (CBC)
2- Splicing (empalme):
A partir de un gen, el mensajero maduro va a tener que
haber eliminado las zonas no codificantes (intrones) y
empalmado las zonas codificantes (exones) para dejar un
transcripto maduro.
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El lazo va a permitir dejar un extremo oxidrilo libre en el ARNm que va a permitir el splicing, el
empalme.
No tenemos tanta variedad de genes, pero el splicing genera un aumento en la variabilidad de
proteínas que pueden ser producidas.
A partir de un gen se pueden crear múltiples proteínas.
Este proceso está mediado por el spliceseosoma.
Splicing alternativo:
En el splicing alternativo en vez de unir exón 1 con 2, 2 con 3, 3 con 4, 4 con 5 etc., vamos a poder
elegir combinar los exones, puede ser la unión del exón 3 con el 4, el 5 con el 5 con el 1, etc.
Así podemos empezar a generar mensajeros que van a codificar variantes de proteínas a partir de un
mismo gen. 2/3 de los genes en nuestro cuerpo pueden hacer este mecanismo.
El plicing alternativo está regulado por el spliceosoma, y ese spliceosoma puede estar regulado
positiva o negativamente por otras proteínas o factores.
Control positivo Un activador induce al spliceosoma a la remoción de un intrón
Control negativo Un represor impide al spliceosoma la remoción de un intrón.
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5- Modificación del extremo 3´ para que el mensajero sea estable y no se
degrade el ARNm – Agregado de la cola de poli A
La región final del mensajero tiene una señalización AAUAAAA, y es la región de POLI-
ADENILACIÓN. En esta región las poli A polimerasas y proteínas que se pegan a la cola de poli A
van añadiendo ADENINA a la región, además, le pegan proteínas de protección que mantienen la
estabilidad de la cola y en el citoplasma regulan la estabilidad del mensajero.
La cola de poli A va a reclutar PABPs (Proteínas de unión a la cola de polli A). Y va a impedir la
degradación del extremo 5´por exonucleasas al salir del núcleo. También va a permitirle al ARNm
salir del núcleo.
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Transcripción y procesamiento de los tARNs (ARN de transferencia)
Los tARN son ARNs con forma de trébol que se encargan de proveer los aminoácidos para la
producción de proteínas. Estos transcriptos están hechos por las ARN polimerasas 3, y tiene puentes
de hidrogeno para formar el trébol, y existen mecanismos de splicing distintos al splicing del
ARNmensajero. La producción del los tARNs se produce en el nucléolo.
Los ARN ribosomales también son producidos y procesados principalmente en el núcleo, producido
como un gran ARN precursor y es cortado para generar distintos pedacitos de ARN que van a
ensamblarse en el ribosoma para formar la subunidad mayor y menor del ribosoma y se van a
ensamblar entre sí para a posteriori producir o traducir proteínas en el citoplasma.
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Traducción del mensajero:
Iniciación:
Los procesos de traducción empiezan con cap (El capuchón) y la cola de poli A (Porque son las partes
del ARN que salen primero). Para la traducción necesitamos los ribosomas, y reconocer secuencias
específicas dentro de los mensajeros.
La cosa va a así, yo en el ARN mensajero tengo una secuencia que quiero traducir a una proteína, esa
secuencia empieza por un codón de iniciación, que es el que le permite al ARN de transferencia
identificar que esa secuencia codifica para la proteína X.
Entonces, un ARN de transferencia lee el codón de iniciación de un ARN mensajero e identifica cómo
armar una proteína. El ARNt tiene una secuencia que es complementaria a la secuencia del codón de
inicio que está en el ARNm, pero para que ese ARNt se una a ese codón de inicio, primero vamos a
necesitar que la subunidad menor del ribosoma reconozca el capuchón (La subunidad menor del
ribosoma está formada por un ARNribosomal + proteínas), después el complejo de iniciación va a
llevar al ARNt desde el capuchón en el extremo 5´del ARNm hasta el codón de inicio. El complejo de
iniciación son factores de iniciación + un activador en forma de GTP activo (Para darme energía), y
NO FORMAN parte de la subunidad menor del ribosoma, sino que ayudan al ARNt a moverse para
que la subunidad menor del ribosoma pueda empezar a sintetizar la proteína cuando el ARNt llegue
al codón de inicio del ARNm. Así es cómo el ARNt, el factor de iniciación y el activador en forma de
GTP van a caminar desde el capuchón hasta el codón de inicio, donde el ARNt se va a unir, y va a
dejar libres a los factores de iniciación y de ahí la subunidad menor del ribosoma empieza la síntesis
de la proteína, para recibir la subunidad mayor del ribosoma (La subunidad menor sigue estando ahí).
Ahí las dos subunidades van avanzando de a poco a medida que se incorporan ARNt, osease, después
del primer ARNt viene otro que hace complementariedad de bases con la secuencia del ARNm y le
dice al ribosoma qué aminoácidos usar para formar la proteína y así sigue y sigue, primero se corre la
subunidad mayor del ribosoma y después la subunidad menor del ribosoma. La subunidad mayor del
ribosoma hace una unión peptídica entre los aminoácidos.
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Nota: Un codón es una secuencia de 3 nucleótidos. Un codón de iniciación es una secuencia de 3
nucleótidos específicos que le indican a las proteínas traductoras dónde unirse para empezar a
traducir una proteína en base a un pedazo de ARN.
Elongación:
Se incorporan los nuevos ARNt, la subunidad mayor del ribosoma hace uniones peptídicas entre los
aminoácidos que crea, de ahí se libera el ARNt que ya se tradujo y la subunidad mayor y menor del
ribosoma se corre para seguir con el siguiente ARNt.
La subunidad menor tiene dos bolsillos mientras que la subunidad mayor del ribosoma tiene 3
bolsillos.
Factores de elongación:
Los factores de elongación son factores que acercan los ARNt a los bolsillos vacios de la
subunidad mayor del ribosoma para que se produzca la unión peptídica entre los
aminoácidos.
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En caso de incorporación incorrecta hay un factor que reconoce y saca las estructuras mal
apareadas para que se pueda volver para atrás y permitir la entrada de un ARNt correcto.
Terminación:
Los mecanismos de terminación se producen cuando se llega las secuencias de terminación,
porque no hay ARNt que se unan a las secuencias que siguen (porque justamente la
secuencia del ARNm tiene una porción 3´no codificante), entonces no hay un ARNt que se
meta en el bolsillo de la subunidad mayor del ribosoma, eso se detecta por un factor de
terminación y las subunidades mayor y menor del ribosoma se desprenden dejando libres la
proteína y al ARNm para que vaya a hacer más proteínas a otro lado.
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Pero si por el contrario en la celula yo tengo DEMASIADO HIERRO SUELTO, lo que va a pasar es
que la conitasa va a salir del mensajero de la transferrina, lo que va a hacer que tenga menos
estabilidad la proteína y entonces dure menos (Porque hay demasiado calcio y no necesitamos
tantos receptores que metan calcio), y, además, va a salir del inicio del mensajero de la
ferritina, entonces las subunidades de los ribosomas van a poder pasar y van a poder sintetizar
las ferritinas para poder almacenar todo ese calcio que hay suelto en el citoplasma celular
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estables y tengan vidas medias de varias horas, coo las proteínas de importancia funcional, por
ejemplo, el colágeno.
Esa diferencia en el tiempo de vida media aumenta o disminuye dependiendo del extremo 5´UTR y el
extremo 3´UTR del mensajero, que contiene una secuencia que puede atraer factores que estabilicen o
que por el contrario desestabilicen el mensajero.
Esto se pone en juego en situaciones de alteraciones o mutaciones, donde se puede generar un codón
de stop prematuro en el mensajero, la maqqquinaria de traducción lo lee y produce la proteína, y
cuando llega al codón de stop prematuro la maquinaria se desensambla y se degrada selectivamente al
mensajero. Los codones de stop prematuro hacen que el mensajero sea degradado selectivamente.
A esto se le llama NMD: Nosense-mediated decay = Degradación por un codón de stop prematuro/Sin
sentido)
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Uno de los últimos controles de la expresión génica es ya cuando tenemos la proteína formada, osease
la regulación de la actividad de la proteína, esto puede darse de distintas formas:
- Sintesis de una proteína: Antes no estaba y se sintetizó para que actúe.
- Unión de un ligando: La proteína está inactiva y cuando se le une un ligando se activa
- Fosforilación de la proteína: La proteína se activa si la fosforilan
- Acción de una segunda subunidad: Un complejo de proteínas se unen a la proteína para
poder hacerla funcionar (Como el complejo Kinasa dependiente de ciclina-ciclina)
Y después también hay métodos para desactivar las proteínas:
- Liberar un inhibidor que mantiene la proteína inactiva: Por ejemplo retinoblastoma, que
cuando es fosforilada libera el factor de inicio de la transcripción.
- Se cambia la localización de una proteína, para que así el inhibidor se despegue de la
proteína. Y la proteína es reconocida
- Corte de proteínas que hace que una subunidad se vuelva activa.
Ej.: Ciclinas que se unen a las Quinasas. Las ciclinas están degradándose y sintetizándose todo el rato, y
su degradación está dada por la acción de la ubiquitinligasa que va a ponerle la cadena de ubiquitinas y
esa cadena va a atraer a los proteosomas que van a degradar a las ciclinas.
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Las técnicas para el estudio de las proteínas van a estudiar proteínas provenientes de muestras, estas
muestras pueden tener distintos orígenes, si se consiguen de una biopsia vamos a tener una muestra
cuyas células van a conservar su estructura, para esto vamos a usar la
inmunoistoquímica/inmunofluorescencia; pero si sacamos la muestra de plasma/tejido
homogeneizado entonces no se va a conservar la estructura, para eso usamos el Western bolt.
Para concentrar o purificar el plasma y tejido homogeneizado vamos a usar una técnica
llamada fraccionamiento subcelular, que tenemos que combinar con el western bolt.
B- Inmunohistoquímica/Inmunoflueorecencia
1- Técnica de análisis que utiliza la reacción antígeno-anticuerpo para conocer aspectos sobre
las proteínas.
2- Se utiliza en macromoléculas o moléculas más sencillas.
3- Técnica asociada a los microscopios para ver la proteína de interés.
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Inmunofluorecensia/Inmunohistoquímica directa: Se le agrega al anticuerpo una enzima
fluorescente que va a verse en el preparado cuando el anticuerpo se una a la proteína. Veo la reacción
antígeo-anticuerpo de forma directa
C- Fraccionamiento subcelular
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Es una técnica que sirve para purificar. Yo puedo querer estudiar una enzima específica en un
compartimiento específico. Técnica preparativa que no usa anticuerpos, sino que utiliza otras técnicas
de detección para distinguir los distintos componentes de las células de un tejido específico. Permite
separar distintos componentes celulares para estudiarlos de manera específica.
Etapas:
1- 1er etapa: Homogeneización
Implica romper mecánicamente el tejido del cual queremos separar los componentes
subcelulares. Se genera un homogenato que va a contener muchos componentes subcelulares
dentro de vesículas llamadas microsomas, que son básicamente lo que quedó de las membranas
plasmáticas. El núcleo, mitocondrias, etc. están todos ahí dentro de vesículas, lo que necesitamos
es separarlos. (Este homogenato también puede servir para hacer un westernbolt)
2- 2da etapa:
Se produce la separación de los componentes. Esto se logra por la centrifugación diferencial (Una
maquinita que gira muy rápido). El giro hace que los componentes más densos se vayan al fondo,
así nos queda un Pellet (Precipitado) y un sobrenadante.
Los núcleos más densos van a tender a ir hacia abajo más rápido que los componentes más
pequeños y menos densos. Pero esto de forma natural tardaría una eternidad, por eso tenemos
la maquinola que va a rotar la muestra a altas velocidades para poder aumentar la fuerza
gravitatoria ejercida en cada tubito y así hacer que las sustancias se movilicen más rápido.
Entonces la fracción subcelular me permite separar las partes de las celulas para poder
estudiarlas por separado, mientras que la inmunohistoquímica era una técnica para
identificar proteínas dentro de un tejido o dentro de una célula
D- Western bolt/Inmunoblot
1- Permite determinar los niveles de expresión de una proteína, pero en una fracción subcelular o en un
homogenato (Combinación con el fraccionamiento subcelular)
2- Técnica de análisis que utiliza la reacción antígeno-anticuerpo para conocer aspectos sobre las
proteínas.
3- Sólo se puede usar con proteínas.
Etapas:
1- Etapa 1: Las proteínas presentes en el homogenato/fracción subcelular, se separan por tamaño
usando un procedimiento similar a la electroforesis en gel. Se lleva a cabo una electroforesis entre
campos eléctricos a través de un gel (el gel cambia). Las proteínas no son iguales a los ácidos
nucleicos. En un pH neutro no tienden a migrar a un único lado, porque según los aminoácidos que
las componen tienen cargas positivas o negativas. Por esto antes de hacer las electroforesis se les va
a hacer un pretratamiento en un detergente aniónico, osease un detergente con carga negativa (SDS)
donde se las va a incubar y se las va a desnaturalizar y dar una carga negativa. Ahora sí todas las
proteínas se comportan como polianiones y migran todas hacia el polo positivo en la misma dirección
y sentido.
2- Etapa 2: Se transfieren las proteínas a una membrana. ¿Por qué? Porque los geles donde las
proteínas se prepararon son inestables. Pasar las proteínas a un medio estable va a permitir
manejarlas con mayor seguridad y menos riesgo de ruptura. Esta transferencia le da a la técnica su
nombre (Blot=Transferir). En la parte superior tengo la parte postiva, y en la parte inferior la carga
negativa, yo pongo las proteínas cerca del polo negativo, cuestión de que migren al polo positivo a
través del gel. Ese gel es una red que va a dejar pasar solamente a las proteínas más chiquitas,
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entonces las proteínas más grandes van a quedar acumuladas más abajo y las proteínas más chiquitas
van a tender a subir más. Pero si hago esto solamente no veo una proteína específica, veo muchas
proteínas, y si uso un colorante cualquiera entonces se me van a marcar TODAS LAS PROTEÍNAS, y
eso a mí no me sirve para nada, yo quiero identificar una proteína específica, y ahí es dónde entra la
reacción antígeno- anticuerpo.
Pero yo no puedo hacer la reacción antígeno-anticuerpo en un gel, necesito hacerlo en una superficie
solida. Entonces necesito pasar las proteínas del gel a una membrana de nitrocelulosa, para eso pongo el
gel con las proteínas ya separadas cerca de una membrana de nitrocelulosa y ahí pongo otra vez
electricidad, que va a correr desde el gel a la membrana, pasando las proteínas desde el gel a la
membrana, a esa “TRANSFERENCIA” en inglés se le dice “BLOT” (De ahí el nombre) ahí sí se puede dar la
reacción antígeno-anticuerpo.
En este punto vamos a incubar a las membranas con una solución que tenga un anticuerpo específico
para la proteína que nos interesa. (Puede incubarse primero con anticuerpos primarios y después con
secundarios). Entre cada incubado se va a lavar la muestra para poder evitar que queden proteínas que
no queremos que queden ahí.
Ej.: ¿Cuál es la localización subcelular de la aromatasa?
Western bolt
Sirve para saber si está o no está la proteína y en qué cantidad, pero si yo uso un homogenato para el
western blot entonces no voy a saber en QUÉ PARTE de la celula está la proteína. Osease: Western blott =
si está la proteína o no y en qué cantidad está. Inmunohistoquímica = Dónde está la proteína.
Pero también puedo usar las distintas fracciones subcelulaes para hacer el western blot. Como está hecho
allá arriba en el ejemplo. La proteína de interés en el homogenato es mucho menos coloridda que la
proteína de interés encontrada dentro de un fraccionamiento subcelular donde están solametne los
microsomas, eso pasa porque hay TANTAS proteínas dentro del homogenato que las proteínas de interés
están diluida. Si uso el western blot en fracciones subcelulaes entonces sí podemos detectar ubicaciones,
pero si usamos un homogenato entonces no vamos a saber la ubicación de la proteína de interés.
Otro ejemplo: En este western blot se hizo una biopsia de tumores de mama para buscar en ellos la
expresión de la proteína E- Caderina. La proteína E-caderia es una proteína que une las celulas entre sí.
Una de las características de los tumores es la transformación de las celulas epiteliales a celulas
mesenquimaticas para poder viajar y así ir a otras partes del cuerpo. Para ser celulas mesenquimáticas
tienen que perder las E-caderinas, entonces vemos esste Western blot
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La expresión de E-caderinas en la paciente D es nula, es decir que hay muchísimas celulas
mesenquimáticas, osease que el tumor está viajando más que el tumor de la paciente A, porque ella sí
presenta E-cadherinas y las E-caderinas son proteínas presentes en los epitelios, entonces esa paciente
todavía tiene celulas epiteliales y no tantas mesenquimáticas.
A veces los anticuerpos no son buenos y se unen a cualquier cosa, como en este caso:
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Seminario 7. Técnicas de amplificación/clonación de ácidos nucleicos in vitro y
Técnicas de recombinación del ADN.
Amplificación y clonación de ácidos nucleicos:
1- Técnicas que me permiten aumentar el número de copias de los ácidos nucleicos.
Pueden clasificarse en dos tipos de técnicas:
Todo esto es importante porque es una forma de amplificar una región del ADN específica dentro
de la célula in vivo. Por ejemplo, podemos insertar un vector, un punto de inicio de la replicación
cerca de una secuencia de ADN de interés, y al iniciar la replicación se va a replicar la secuencia
requerida dentro de la celula viva. O podemos implantar un gen específico que puede estar
mutado, y cuando se exprese ese gen podemos ver qué hace, si codifica para una proteína o si no
tiene función y qué le pasa a la célula gracias a esa pérdida de función. Es una estrategia de
identificación de funcionalidad.
Cuando hablamos de vectores hablamos de muchos tipos de vectores, como vectores plasmídicos,
virus (Para generar vacunas), cromosomas artificiales de bacterias para estudiar la regulación de la
expresión de un gen.
El inserto de la insulina:
Si tengo un plásmido al que le inserto un promotor eucarionte que sea reconocido por el ARN
polimerasa 2 y por factores de transcripción basales y le inserto el gen de la insulina. Entonces eso
lo amplifico en una bacteria lo purifico en ADN y lo introduzco en células eucarionte (transfección)
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Los vectores que permiten que se exprese el inserto de interés los llamamos VECTORES DE
EXPRESIÓN.
Para saber la localización de una proteína en X tejido y no funcionan los anticuerpos en
inmunohistoquímica ni en el westernbolt, podemos usar las técnicas de recombinación del ADN.
Metemos en el vector un injerto del gen de una proteína, y así esa proteína puede ser sintetizada
y llegar a la matriz extracelular. ¿Cómo la localizo?
Luego del promotor insertamos el gen de la proteína que queremos expresar, y después
insertamos la porción codificante del gen de una proteína fluorescente, o una proteína que sé
que puede detectar un anticuerpo. Si puedo mantener el medio celular, luego voy a poder llevar
a cabo una inmunohistoquímica y detectar dónde está esa proteína.
Otra forma es fusionar a la proteína con una proteína fluorescente, así con un microscopio
vamos a poder detectar esa proteína.
Si queremos saber la función de la proteína que se produce con el injerto, puedo introducir un
injerto con una mutación. Así cultivo dos proteínas, una con mutación y una sin mutación (Wild
type), para ver qué efectos tiene esa mutación sobre la proteína, y así entender la función de la
proteína con un aminoácido correcto o con un aminoácido mutado y cuales son las consecuencias
en la celula de tener esa proteína mutada.
La técnica también me permite modificar el genoma de una célula directamente, pudiendo
reemplazar genes, inactivar genes (knockout) o adherir genes a la secuencia.
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Si puedo modificar el genoma, voy a poder crear animales con capacidades que van a ser
heredadas a su descendencia.
Para lograr que la expresión aumente o disminuya vamos a usar promotores y silenciadores.
Hay dos tipos de manipulaciones génicas que permiten inducir la función de su producto:
2- Disminuir/eliminar la expresión:
Elimino la expresión de un gen para ver qué le pasa al organismo cuando no se expresa.
Esto se logra generando un vector que codifica un gen para la intervención de un ARN
específico, cuando la molécula de ARN se produce, es preparada dentro del núcleo para
salir al citoplasma, luego al salir del núcleo y ser reconocido por la molécula Dizer. Si la
complementariedad de bases entre Dizer y la molécula de ARN es completa (Homología
completa), entonces se pierde estabilidad y se degrada, y si es incompleta (homología
incompleta) se reducen los mecanismos de expresión del gen. (En pocas palabras, se
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inserta una secuencia de genes que codifica para un mecanismo análogo a los microARN
que intercepte al ARNm que lleva la info para codificar la proteína de interés, cuestión de
interceptarlo y que esa proteína no se exprese).
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Generalmente los genes que queremos expresar los generamos como ADN complementario, osease que
los fabricamos a base de un ARN, y los hacemos o más chiquito posible, para hacerlo bien chiquito
vamos a eliminar los intrones, porque no podemos tener cosas al pedo. Osease para generar el gen de
interés lo retrotranscribimos en base a un ARNmensajero.
Para meter el ADN a la celula lo podemos meter en un liposoma, meterlo a la celula y que el ADN vaya al
núcleo, o sino también podemos hacer un shock eléctrico para labilizar la membramna, meter el ADN y
después devolver la membrana a la normalidad.
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Fin del primer bloque
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La síntesis de proteínas inicia en el mensajero maduro que salió al citoplasma y es reconocido
por ribosomas que están libres en el citosol, así inicia la traducción.
Hay señales dentro de las proteínas que pueden hacer que los ribosomas permanezcan libres en
el citosol o se dirijan hacia el RER (para así ser como un taxi, se desarrolla un poquito en el
ribosoma y después va hasta el RER para terminar de sintetizarse la proteína). Para ir del
citoplasma al núcleo tiene que atravesar una doble membrana llamada la ENVOLTURA
NUCLEAR.
Envoltura nuclear:
Si una proteína necesita residir dentro del núcleo, va a tener señales que la hagan reingresar a
través de los poros al núcleo de nuevo. El núcleo tiene como límite una doble membrana, que
permite la regionalización de la producción de mensajeros. Y eso va a delimitar dónde está el
material genético y se producen los mensajeros y dónde se sintetizan proteínas.
La membrana permite un acceso limitado, y está conformada por una membrana interna, una
externa y poros nucleares. El pasaje para entrar al núcleo debe reconocerse por los poros
nucleares y que dejen pasar las sustancias/lo que sea (Los poros nucleares son como patovicas
de discoteca).
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Para entrar al núcleo sí o sí se pasa por acá, entonces las proteínas se pueden dirigir
hacia acá a través de
señales, esas son señales
de reconocimiento de
poro nuclear. Esas señales
pueden estar codificadas
en algún lugar de la
proteína, o en múltiples
lugares de la proteína y
necesitar una estructura
terciaria para poder verse
esas señales.
El transporte por el
núcleo requiere una señal
que va a generar un loop
a través del núcleo.
Señales:
2- NLS: Señal de localización
nuclear:
Hay señales que indican qué proteína entra o sale del núcleo, para entender eso podemos unir una
secuencia que creemos que lleva proteínas al núcleo a una proteína fluorescente y seguir la proteína, si esa
proteína va al núcleo, entonces podemos saber que la secuencia X es la que permite transportar las
proteínas al núcleo.
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Las proteínas pasan por el poro nuclear gracias a las RAN Proteínas direccionadoras del transporte del
núcleo. Son capaces de unirse al GDP (Molécula pequeña de alta energía) en el citoplasma. La unión de
RAN a GDP va a dirigir su ciclo de salir o entrar dentro del núcleo. Unida a GDP la RAN puede ser
reconocida por el lado filamentoso de los poros nucleares y así ingresar al núcleo.
Las importinas son las encargadas de mediar el transporte de entrada de proteínas y las exportinas son las
encargadas de mediar el transporte de salida de proteínas.
Si RAN va con GDP desde el citosol hasta el poro nuclear, entonces va a ser reconocido por el poro
nuclear y va a ingresar a ambos al núcleo. Una vez ahí es reconocido por RanGEF que le va a sacar el GDP
a Ran y le va a poner GTP. Ran unida a GTP va por los poros nucleares y así puede salir del núcleo al
citoplasma, donde una RanGAP le va a sacar un fosfato a RanGTP para que vuelva a ser una RanGDP. Este
circuito dirige el transporte a través del poro nuclear, RAN GDP entra – RAN GTP Sale
Para salir del núcleo las proteínas se unen a RanGTP, y se disocian cuando se vuelve RanGDP, mientras
que para entrar al núcleo
las proteínas se van a unir
a RanGDP, y se van a
disociar cuando se vuelva
Ran GTP, así es cómo
podemos dejar proteínas
dentro del núcleo o fuera
del núcleo
Okay eso para las
proteínas, pero del
núcleo salen más que
solo proteínas, como por
ejemplo los ARNm, este
no utiliza el sistema RAN,
sino que utiliza otras
transportinas específicas
que desenvuelven el
ARNm.
Los microARN y los ARNt sí salen por RAN GTP
En el núcleo el ARNm está hecho un bollito, bien compactado, pero para pasar tiene que ser lineal,
porque sino no pasa. Muchas proteínas se van a quedar con el mensajero para mantener su estructura,
pero muchas otras se van a quedar en el núcleo para acompañar a un nuevo mensajero
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Para llegar a la matriz mitocondrial, las proteínas van a ser traducidas en ribosomas libres. Y deben
presentarse en los translocadores que en la membrana externa va a llamarse TOM (Mitocondrial outer
translocator) y en la membrana interna va a ser TIM (Mitocondrial internal Membrane).
Para que una proteína pase por estos translocadores debe estar desplegada (Las chaperonas la
mantienen desplegadas) y con gasto de ATP pasan a través de los translocadores. Desplegada no es
funcional, así que dentro de la mitocondria se va a volver a plegar con ayuda de otras chaperonas
(Hps60).
Diferentes proteínas pueden traspasar solo TOM y si tienen una región hidrofóbica ser traslocada a la
membrana externa de la mitocondria. O pasar al TIM y si tienen una región hidrofóbica quedarse anclada
en la membrana interna. Estas son proteínas de membrana mitocondrial. Pero también puede ser que
proteínas no atraviesen el TIM y queden atrapadas en el espacio inter-membrana.
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síntesis en ribosomas libres, pero esa síntesis se detiene cuando una proteína que tiene que ir al RER, ahí
es cuando produce una péptido señal específica, y no continúa hasta el ribosoma se adhiere al RER. Al
mismo tiempo existe una peptidasa que corta la señal para que la síntesis continúe.
Dentro del RER se realizan modificaciones en las proteínas que van a ser las que las dirijan a diferentes
lugares, entre esas modificaciones tenemos:
1- Glicosilación:
Dentro del RER se INICIA la glicosilación, es el agregado de un oligosacárido por unión covalente con un
aminoácido, en este caso ese aminoácido es la asparagina (N), ahí es donde se produce la N-
glicosilación. En la N se adhiere un oligosacárido y se la transforma en una glicoproteína.
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2- Formación de uniones GPI (glico-fosfatidil-inositol) a la membrada del RER
Proteínas pueden ser unidas a lípidos dentro del RER. Una proteína que se está sintetizando y es soluble
en el lumen del RER, va a ser unida a un lípido a través de un grupo GPI, lo que la va a hacer soluble y le va
a permitir a posteriori dirigirse hacia la membrana y formar parte de las proteínas de membrana
plasmática. Esto es la adición de una proteína a un fosfolípido de membrana
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Dentro del retículo, las chaperonas (Ej. Calnexina, o calreticulina) van a ayudar al pliegue de la proteína
para luego ser transportadas al Golgi a través de vesículas. Si esa proteína no está bien plegada se
reconoce por otras proteínas que van a hacer que se degrade a través del sistema ubiquitin-
proteosoma.
Funciones:
1- Síntesis del fosfolípido esfingomielina y de
glicolípidos.
2- Procesamiento y glicosilación de proteínas N- y O-
glicosilación (Agrega carbohidratos a los residuos de
serina y treonina)
La unión N-glucosílica que se dio en el RER va a
evolucionar en el Golgi, y va a variar según el
podado o unión del oligosacárido.
A partir de esta opción podemos llegar a tener:
3- Manosa 6 fosfatos (Man-6P): Oligosacárido rico en
manosa. Este va a ir a un lisosoma.
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4- Estructura compleja de
oligosacáridos con cargas
negativas. Y este va a ir hacia la
membrana plasmática y va a
situar sus oligosacáridos
negativos hacia el lado
extracelular.
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Fraccionamiento celular del REL y el RER.
El RER va a estar cargado con una cantidad de ribosomas llenos de vesículas con proteínas listas para
largarse, mientras que el REL carece de esos ribosomas, es por eso que su peso molecular va a ser distinto.
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Este proceso de generación de fosfolípidos en una sola cara de la membrana genera un desbalance. El
desbalance lo resuelve la flipasa (Enzima) que intercambia fosfolípidos de un lado a otro de la bicapa lipídica.
La membrana externa tiene distintas cargas asociadas porque hay distintos componentes de fosfolípidos en
la cara exterior de la membrana plasmática (Cargados negativamente) y en la cara interior de la membrana
citosólica (Cargados positivamente) ordenada de una manera específica.
¿Por qué están ordenados si estaban desordenados?
Porque existe otra flipasa que va ordenando de manera controlada para hacer que tengan la polaridad
definida que tiene la membrana plasmática.
El REL también es un importante reservorio de Ca +2, el cual puede liberarse al
citoplasma a través de poros. Esto se da gracias a la acción de señales
específicas, como el inositol-3-fosfato que se encuentra en la cara interna de la
membrana plasmática y se produce por el corte de fosfolípidos de la membrana
y se libera ese IP3.
El IP3 tiene la capacidad de asociarse a un canal de calcio y así abre el canal
permitiendo liberar calcio.
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Endocitosis: Proceso de invaginación de membranas a partir de la membrana plasmática. Es
una entrada de material extracelular en vesículas formadas a partir de la membrana
plasmática. A veces hay cosas fuera de la membrana que son necesarios de incorporar,
pueden ser señales, nutrientes, organismos tóxicos, etc. Se pueden reconocer e introducir a
través de membranas. Ese sistema de membranas suele terminar llegando a los lisosomas.
Esas vesículas son los endosomas, parte del sistema de endomembranas.
La endocitosis puede ser fagocitosis, osease entrada de partículas grandes. O pinocitosis, que
es la entrada de fluidos o moléculas a través de vesículas pequeñitas.
2- Endocitosis mediada por receptor: Entrada selectiva de macromoléculas reconocidas por un receptor,
ubicadas en un lugar cercano a la membrana y eso genera señales intracelulares que van a generar una
canasta de invaginación que va a permitir la generación de la vesícula que contenga esas
macromoléculas.
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Endocitosis del LDL (Es una molécula compleja de lípidos y colesterol):
¿Cómo se incorpora?
Por este sistema de endocitosis mediada por receptor. La vesícula va a entrar y la cubierta de la vesícula, en
este caso cubierta por clatrinas, se va a desprender. La vesícula va a llegar a un endosoma temprano, y
luego irá a un endosoma tardío, para finalmente ir a un lisosoma y luego liberar los lípidos y el colesterol al
citosol donde las moléculas podrán ser usadas.
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Transporte vesicular:
¿Cómo sabe a dónde ir?
Hay proteínas reguladoras específicas que les indican
a las vesículas para dónde rumbear.
Proteína RAB (Parecida a RAN): Cuando está unido a
GTP se pega a la membrana y le dice dónde ir, si hay
que ir a la vía endocítica va a ser unida a GTP,
reconocida por un receptor de ahí para acercar la
membrana de la vía endocítica.
Proteína SEGNARE: La SEGNARE B de la vesícula y la
SEGNARE T del receptor. Al acercarse la vesícula
ambas SEGNARES se enlazan que acercan tanto las
membranas que terminan uniéndolas.
El GTP de las RAB se hidroliza cuando la vesícula se
une a la membrana, al hidrolizarse el GTP, nos
quedamos con RAB GDP (Que es la versión sin energía
de RAB GTP) que queda soluble en el citoplasma, y
vuelve al inicio luego de volverse otra vez RAB GTP.
Las vesículas son transportadas por filamentos de
actina o por microtúbulos
Lisosomas:
Los lisosomas son organelas de membrana que
contienen una serie de enzimas que funcionan en pH más ácido que el del citosol. Son capaces de degradar
toda clase de polímeros biológicos (proteínas, ácidos nucleicos, carbohidratos y lípidos). Dentro de los
lisosomas vamos a tener proteínas que funcionen a un pH ácido. Es algo así como un sistema digestivo de la
célula.
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El lisosoma es ácido gracias a una bomba de ATP que incorpora protones dentro del lisosoma para matener
el PH ácido. Para que todas las hidrolasas (enzimas que entraron al lisosoma) que eran inactivas, se puedan
activar (porque esas enzimas solo funcionan en pH ácido). Entonces si el lisosoma se llega a romper no pasa
nada, porque las hidrolasas se inactivan y no dañan al resto de la célula.
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Defectos en señales pueden causar enfermedades:
Al tener problemas con las proteínas de direccionamiento vamos a tener enfermedades de depósito
lisosómico. El problema no son las enzimas, sino las proteínas que guían el proceso y no dejan que estas
lleguen al lugar al que tienen que estar.
La enfermedad se reduce por el sustrato acumulado en el lisosoma. Los depósitos en los lisosomas no
pueden ser degradados.
Las enfermedades de Tay-sachs, de gaucher, de nieman pick, de hurler son causadas por estos problemas
en las señales.
Las enfermedades están relacionadas a anomalías esqueléticas, retraso mental, rasgos toscos.
Otro ejemplo es la enfermedad de fibrosis quística, producida por una anomalía en el transportador del
cloro relacionada a varias posibles mutaciones.
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Seminario 9. Dinámica de citoesqueleto y membranas celulares:
Temas:
1- Dinámica de embranas: Transporte vesicular
2- Citoesqueleto
3- Moléculas de adhesión
Ejemplos:
1- Polaridad celular
2- Migración celular
3- División celular
4- Cilios
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Citoesqueleto:
Está formado por un conjunto de proteínas que constituyen la estructura que le da forma a la célula y le
permite transportarse, está formado por 3 componentes filamentosos:
1- Microtúbulos: Se forman a partir de los centrosomas. (Verde)
2- Filamentos de actina: Se concentra en la periferia de la célula. (Marrón)
3- Filamentos intermedios: Forman una estructura esférica alrededor del núcleo y se dirigen a la
periferia. (Celeste)
“Todos son polímeros de subunidades proteicas constituidos por múltiples protofilamentos que se
polimerizan y despolimerizan según las proteínas que los regulen”.
Todos están formados por subunidades que se polimerizan formando esos filamentos y se ensamblan o
desensamblan según proteínas que los regulan. Todos están formados por microfilamentos.
1- Microtúbulos:
Estructuras tubulares huecas con un diámetro de 25 nanómetros apróx. Y están formados por
protofilamentos de dineína. 13 protofilamentos paralelos forman un microtúbulo.
Cada protofilamento se forma por la polimerización de un heterodímero, la beta tubulina y alfa tubulina.
La polimerización siempre tiene el mismo sentido, beta- alfa – beta – alfa- beta - alfa
Los microtúbulos son moléculas polares, porque de un lado vamos a tener alfa tubulina (Extremo menor,
positivo) y en el otro beta tubulina (Extremo mayor, negativo).
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Cada tubulina
tiene asociado
GTP (Moléculas
de alta
energía).
Esta estructura
puede
polimerizarse o despolimerizarse. Al polimerizarse, los únicos heterodímeros que pueden unirse son los
que tienen GTP, una vez que se unen, el GTP de la betatubulina tiende a hidrolizarse, y esa hidrolización
favorece la despolimerización. Pero en el extremo que se está polimerizando se genera un capuchón de
betatubulinas con GTP, que van a ir hidrolizándose a medida que se agregan betatubulinas nuevas para
reponer el capuchón. Si en algún momento la hidrolisis de GTP es más rápida que la unión de nuevas
betatubulinas para mantener ese capuchón, entonces el microtúbulo va a despolimerizarse.
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En una solución tenemos un extremo positivo, que tiene una unión rápida de los heterodímeros y un
extremo negativo de los microtúbulos, el extremo negativo se estabiliza en una unidad llamada
centrosoma, formada por una atmósfera protéica,donde está presente la gamatubulina, que favorece la
asociación de las alfa y beta tubulinas (Nucleación). El centrosoma tiene en su centro dos centriolos
perpendiculares, formados cada uno 9 tripletes de microtúbulos paralelos. El centrosoma permite la unión
inicial de los microtubulos. Entonces los microtúbulos crecen desde el centrosoma hacia afuera.
La parte negativa de los microtúbulos tiende a despolimerizarse en soluciones acuosas, por eso está
albergada en el centrosoma.
Entonces, todos los microtúbulos van desde el centrómero, donde está el polo negativo del microtúbulo
hasta la periferia de la célula con su extremo positivo.
Algunos microtúbulos mantienen una inestabilidad dinámica de polimerización y despolimerización, que
hace que crezca o se acorte. Esto se regula por proteínas específicas.
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Dineínas: Caminan hacia el extremo negativo.
Conjunto de 3 proteínas que les permiten a los microtúbulos relacionarse entre sí:
1- TAU: Permite que se asocien microtúbulos de forma paralela. Se encuentran principalmente entre los
axones de las neuronas
2- MAP2: Asociación entre los microtúbulos de forma desorganizada y separada. Suele darse entre las
dendritas de las Neuronas.
3- Plectina: Permite la relación entre los microtúbulos y los filamentos intermedios.
El accionar de los microtúbulos es uno de los procesos que participan en el mantenimiento de la polaridad
celular. A más largos se hagan más va a crecer la célula. Y además van a transportar las organelas.
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Rol de los microtúbulos en la distribución de organelas:
El aparato de Golgi está cerca de los centrosomas y el núcleo. ¿Por qué? Porque sus cisternas son
transportadas hacia el extremo negativo por las dineínas.
El RER es más periférico, porque es transportado por las kinesinas que van hacia el extremo positivo. Las
mitocondrias pueden ser transportadas por las kinesinas o las dineínas según las necesidades de la célula.
Las vesículas de secreción son más periféricas entonces son transportadas por las kinesinas. Los lisosomas
son más centrales que los endosomas tardíos y estos son más centrales que los endosomas tempranos (de
profundo a superficial: lisosomas- endosomas tardíos. Endosomas tempranos) las dineínas transportan a los
lisosomas y los endosomas tardíos mientras que los endosomas tempranos los transportan las kinesinas.
2- Filamentos de Actina:
Participan en procesos dinámicos en la célula y también están formados por moléculas globulares. Es un
polímero, pero es más delgado que los microtúbulos y se forman por la polimerización de la actina globular.
La actina está unida a ATP, cuando está unida a ATP se favorece la polimerización y cuando está unida a ADP
se favorece la despolimerización.
La estructura del filamento de actina también es polar, el extremo negativo es el que más fácilmente se
despolimeriza en presencia de monómeros solubles, porque en el extremo negativo es donde predomina la
actina unida a ADP. Pero eso es mediado por proteínas. Puede alargarse por un lado y acortarse por el otro
(Pérdida de actina globular de un lado y ganancia del otro), sin embargo, el extremo positivo es el que tiene
mayor facilidad para alargarse. Trismiling. Los filamentos de actina no tienen centrosomas, pero sí tienen
proteínas que la ayudan.
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Los filamentos de actina pueden formar ramificaciones, que se ven favorecidas por el complejo Arp 2/3 que
facilita la polimerización del extremo negativo y la formación de nuevos filamentos.
1- Profilina: Favorece la despolimerización.
2- Arp 2/3: favorece la polimerización del extremo negativo y el alargamiento de los microfilamentos.
Permite que se formen estructuras bidimensionales. Favorece la formación de filamentos ramificados
3- Formina: Estabiliza los filamentos de actina y favorece la polimerización.
4- Timosina + Actina G soluble: Impide el proceso de polimerización
5- Cofilina: Acelera el proceso de despolimerización del extremo negativo
6- Gelsolína: Corte de los filamentos
7- Proteínas cap. Estabilizan el extremo positivo
8- Tropomodulina: Previene la despolimerización del extremo negativo.
Proteínas que regulan la relación entre los filamentos de actina y con otros componentes
celulares:
1- Fimbrina: Se une a los filamentos de actina y permite que formen enlaces paralelos entre los filamentos
2- Alfa actimina: Permite que las fibras de actina se unan en forma antiparalela y poner miosina entre
medio, para que pueda deslizar los filamentos de actina antiparalelos
3- Filamina: Permite que los filamentos se unan de forma cruzada, formando redes.
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Los filamentos de actina también tienen proteínas motoras:
Esas proteínas motoras pertenecen a la familia de las Miosinas: Tienen dos dominios, uno se une a los
filamentos de actina y el otro se une a membranas o macromoléculas (Como si fueran un ancla). También
hidrolizan ATP para obtener energía. También tiene que ver con la polaridad celular. Permite mover los
filamentos de actina. Tenemos:
- Miosina tipo I: Se une a una membrana y se usa como ancla para acercar el filamento de actina a la
membrana
- Miosina II: Es un bastoncito que une filamentos de actina antiparalelos (Osease que están al revés, uno
tiene el más para un lado y el otro tiene el más para el otro lado opuesto) que acercan los filamentos de
actina entre sí
- Miosina tipo V: Va a unirse al filamento de actina y va a caminar por el filamento mientras transporta
vesículas.
Los microtúbulos suelen estar más centralizados, así que mueven cosas del núcleo al Ribosoma, del ribosoma
al RE y del RE al Golgi, del Golgi a las vesículas de secreción, mientras que los filamentos de actina están más
cerca de la membrana. Pero ambos están formados por moléculas globulares, ambos usan moléculas de alta
energía (GTP y ATP), ambos se polimerizan y despolimerizan a base del accionar de proteínas. Ambos
participan en la polaridad de la celula, el transporte de organelas y vesículas, y en la motilidad celular.
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3- Filamentos intermedios:
Se forman por polimerización de monómeros, pero son filamentosas, de distinto tipo, y no se encuentran en
todas las células (No son necesarias para la supervivencia de todas las células a diferencia de la actina y la
miosina). Hay distintos tipos, y se los llama intermedios porque tienen un tamaño intermedio entre el de los
microtúbulos y los filamentos de actina. No participan en migración celular ni transporte celular, tampoco
tienen proteínas asociadas. Los filamentos intermedios no están en todas las celulas, son filamentos más
estables que pueden ser característicos de cada célula y participan en mantener la resistencia a la tracción
de la celula.
Todos están sólo en el citosol, excepto el tipo 5, que se encuentra en el núcleo de todas las células nucleadas
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Tienen un extremo amino y un extremo carboxilo terminal y se unen entre sí formando dímeros, que se
asocian con otros dímeros que se disponen de forma antiparalela, fomando un tetrámero. Ese tetrámero es la
unidad estructural. (Otra diferencia con los filamentos de actina y los microtúbulos, estos son polarizados
mientras que los filamentos intermedios no lo son).
Estas estructuras básicas se asocian formando protofilamentos y a su vez se asocian 8 tetrámeros en forma
longitudinal formando la unidad del filamento intermedio. (Son estructuras más estables que los
microtúbulos y los filamentos de actina). No participan en funciones motrices, sólo dan resistencia mecánica.
Los extremos de los filamentos intermedios no son polares y no tienen proteínas asociadas, así que se
relacionan entre sí por sus extremos amino y carboxilo terminales.
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Fenómenos celulares en los cuales participan el citoesqueleto, las membranas y las
proteínas:
1- Polaridad celular: Organización estructural y macromolecular asimétrica de las células.
Uno de los fenómenos fundamentales. La
polaridad de se relaciona con los microtúbulos.
En el epitelio se evidencia mucho más esa
polaridad, pero no es en el único lugar donde
está esa polaridad.
La polaridad celular puede llevar a la formación
de dos células distintas. Por ejemplo, una célula
madre que tiene X polaridad va a dar origen a
dos tipos celulares distintos, ¿Por qué? Porque
al estar polarizada, ciertos componentes de la
misma se van a encontrar de un lado y otros del
otro lado, entonces al dividirse cada célula va a
tener componentes citosólicos distintos.
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Moléculas de adhesión:
Son moléculas que permiten que las celulas se adhieran entre sí. En el complejo de uniones laterales entre
una célula y otra hay varias uniones:
1- Uniones estrechas: Impiden que proteínas de la membrana apical pasen a la basolateral (Mantienen la
polaridad). Formado por Ocluinas y claudinas.
2- Uniones adherentes: Permiten el anclaje/Adhesión entre células vecinas. Se relacionan con los
filamentos de actina. Formado por E-Cadherinas: Participan en las uniones adherentes.
3- Desmosomas: Tiene una estructura más focalizada y permite la relación entre células vecinas. Se
relacionan con los filamentos intermedios (los de queratina). Formado por: Las desmocolínas y
hemogleínas (Familia de las caderínas)
Nota:
Moléculas homofílicas: Solamente tienen interacción con moléculas iguales a ellas
Moleculas heterofílicas: Tienen interacciones con moléculas diferentes a ellas, como moléculas
de la matríz extracelular.
Transitosis: transporte de componentes extracelulares desde el medio extracelular hasta la membrana basal
a través de vesículas sin pasar por el Golgi.
Las integrinas participan en las relaciones de adhesión y anclaje entre la matriz extra celular y las Cadherinas
las relaciones entre células vecinas. Y relacionan el citoesqueleto con las células vecinas o la matriz
extracelular.
En el establecimiento y mantenimiento de la polaridad celular de las células madre es importante la
ubicación de determinantes de polaridad solubles (ribonucleoproteínas o proteínas) que luego de la división
celular pueden dar distinta identidad a las células hijas.
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Polaridad del fibroblasto (Es importante porque hay que saber esto para entender migración
celular):
Este tipo de migración celular se llama “Mesenquimática” y es característica de los fibroblastos.
Esta célula también tiene polaridad, y se ve activamente en el citoesqueleto de actina que es el que participa
en el proceso de migración. En el frente de avance se generan estructuras que censan el ambiente, unas
tienen forma de lámina, Lamilipodias y las otras forma de dedo, filopodias.
En las estructuras filopoideas los filamentos de actina se organizan de forma paralela. Y en las lamilipoideas se
organizan en forma ramificada.
En las zonas laterales de relación con la matriz extracelular los filamentos de actina tienen forma de redes. Y
en la parte posterior, la zona de adhesión en forma de bandas antiparalelas donde el accionar de la miosina 2
permite el deslizamiento de los filamentos de actina y permite la retracción de la parte celular. En la zona de
avance hay más estabilidad de microtúbulos y en la zona de retracción los microtúbulos son más cortos, más
inestables. La membrana en el frente de avance se mantiene gracias a la exositosis, mientras que la
membrana en el frente de retracción se hace una endositosis que va a sacar membrana de la parte de atrás y
la va a llevar a la parte de adelante para que no se quede sin membrana el frente de avance.
En este caso las moléculas de adhesión que permiten la adhesión de la célula con la matriz extracelular son las
integrinas.
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Entonces en una celula que migra hay una distribución diferencial de los microtúbulos, una distribución
diferencial de los filamentos de actina, una distribución diferencial de las vesículas, una organización
espacilal diferencial del Golgi y de los endosomas tempranos, lo mismo con las proteínas de adhesión, van a
tener una distribución asimétrica. Y todo esto va a mantener la polaridad celular de la celula que migra.
Entonces la organización y distribución de moléculas de polaridad, más otros componentes del citoesqueleto
más el transporte de vesículas son lo que mantiene la polaridad celular.
- Desmosomas Se unen a filamentos intermedios
- Uniones adherentes Se unen a filamentos de actina
Migración celular:
Hay 4 procesos involucrados:
1- Señalización intercelular.
Hablando más en general, una celula secreta moléculas que van a unirse a receptores de la celula que
va a migrar, se une a una parte de esa celula y puede ATRAER ESA CELULA, o por el contrario puede
REPELER ESA CELULA, osease hacer que siga hacia una dirección o hacia la contraria. Por ejemplo, esta
celula está siendo atraída por esas señales.
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2- Censado de las señales.
La celula va a censar las señales que recibe, tiene receptores que van a hacer que esas señales se
vuelvan intracelulares.
3- Señalización intracelular.
Las señales ya estando dentro de la celula, hay moléculas que amplifican esas señales, la señales se
convierten en otras, a eso se llama traducción y esas señales van a actuar sobre el citoesqueleto,, sobre
las moléculas de adhesión y sobre el transporte vesicular. Y ahí es donde se produce la respuesta
motora de la celula, permitiéndole la celula moverse.
4- Respuesta motora.
Conceptos:
- Quimiotaxis: Proceso por el cual una celula migra como consecuencia de una señal soluble emitida en
forma de gradiente.
- Aptotaxis: Ese proceso de migración de la celula se da gracias a señales que no son solubles, eso significa
que están distribuidas en forma asimétrica formando parte de la matriz extracelular o formando parte de
la membrana de otras celulas.
- Durotaxis: Las celulas pueden migrar por una diferencia en la dureza de la matríz extraceluar, porque la
celula censa la matríz extracelular para chequear que sea apta para vivir ahí, y si es muy dura la celula
puede decidir irse.
- Topotaxis: Las diferencias en la organización de la matriz extracelular (No significa que sea dura), la matriz
puede estar organizada en forma de tubo o asimétrica y eso puede guiar la migración de la celula
- Galbanotaxis: Es una migración celular por ruptura de los epitelios. Hay diferencias en las cagas eléctricas.
Estas señales actúan en forma local, actúan cambiando la dinámica del citoesqueleto, y la señal tiene una
distribución asimétrica, no llega a toda la membrana de la celula, llega a un pedacito, eso es una distribución
asimétrica, esa distribución asimétrica va a ser censada por la celula a través de los Lipid Rafts, o también
llamados bolsas lipídicas/microdominios de membrana, son estructuras de la membrana plasmática que
tienen menor fluides de membrana y parecen balsas que flotan en la membrana gracias a tener lípidos,
colesterol y proteínas que participan en los fenómenos de señalización, como receptores de membrana. La
organización en baslas lipídicas ayuda a que la señalización se dé más rápido y que además, esa señalización sea
topográficamente limitada actúe de un solo sobre el citoesqueleto de este lado y no del lado contrario de la
celula, eso significa que actúan localmente.
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Ejemplo:
La migración de una celula puede clasificarse según su
mecánica
- Migración ameboide: Es característica de las celulas
tumorales o germinales y es más rápida que la
mesenquimática. Depende de la tracción por el
deslizamiento de los filamentos de actina y la modificación
de la corteza, que le permite a la celula se pueda deslizar
por los espacios de la matríz extracelular. Permite que el
nucleo se aplane para pasar por espacios chiquitos de la
matriz extracelular.
- Migración mesenquimática: Es característica de los
fibroblastos, y depende de la matríz extracelular. Depende
de la adhesión y de la degradación de la matríz.
- Migración colectiva: Las celulas migran como un conjunto,
la única diferencia con la migración de una sola célula es
que las celulas en la migración colectiva mantienen las
uniones intercelulares y se mueven juntitas. El único
detalle es que las celulas que estén adelante van a ser
celulas lideres que van a cumplir con el rol del frente de
avance y las celulas de atrás no van a estar especializadas en nada y solamente van a seguir a las líderes.
En cualquier caso, hay reciclaje de membrana, movilidad del citoesqueleto y regulación de la adhesión con la
matríz extracelular, y secreción de proteasas que degradan la matriz extracelular (Esto participa en la migración
mesenquimática)
Procesos involucrados:
1- Señalización intercelular.
Las células que viajan a través del torrente sanguíneo son células esféricas porque no tiene adhesión (Y
la forma esférica es la que más energía ahorra en ese sentido). El endotelio tiene una superficie
antiadherente para facilitar la circulación sanguínea, pero esa superficie, al detectar una inflamación, los
componentes de ese proceso inflamatorio (Neutrófilos o macrófagos) emiten señales y producen un
cambio en el genotipo del endotelio que por exocitosis libera moléculas de adhesión llamadas
selectinas y otros fosfolípidos en su superficie. Esas moléculas van a hacer que si la célula que viene
circulando por la sangre (En este caso un leucocito) toca el endotelio, se pegue a él. Entonces hablamos
de un proceso de adhesión celular.
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NCAM (CAM de la superfamilia de la Inmunoglobulinas): Son uniones homófilas (Entre moléculas
similares de dos células vecinas) pero son menos estables que las caderinas
Integrinas: Formados por heterodímeros y permiten la relación del esqueleto de la célula con
componentes de la matriz extracelular.
Familia de las selectinas: Glicoproteínas que relacionan una célula con glicoproteínas de otra
célula. Uniones menos estables.
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En la zona de retracción lo que va a pasar es que se produce una desadhesión y los contactos focales son
desliados por la miosina 2 y la parte posterior de la célula se retrae.
Adelante tiene que haber membrana, porque la célula avanza, entonces en esa zona hay exocitosis, para
hacer que haya más membrana. En el frente de avance hay polimerización de los filamentos de actina y
formación de contactos focales (Integrinas + filamentos de actina)
En la parte posterior las integrinas se desactivan las integrinas, la miosina 2 desliza los filamentos de actina
en los contactos focales y endocitosis.
Cambios en el citoesqueleto, en las membranas, y en la polimerización.
Lipid Rafts
Balsas lipídicas o microdominios de membrana, zonas de baja solubilidad donde hay mucho colesterol y
esfingolípidos, y dónde se concentran proteínas de señalización, las señales llegan, los receptores se
agrupan y la señalización se focaliza en donde está la bolsa lipídica. Es focalizada porque solo actúan en el
frente de avance, por eso determinan la movilidad de la célula, la exocitosis, y la reorganización de la
célula.
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En la anafase las cromátides hermanas se separan, y los
microtúbulos unidos a los cinetocoros por despolimerización y
por acción de proteínas motoras arrastran a los cromosomas a los
polos. El huso mitótico crece al mismo tiempo.
Formación de la envoltura nuclear: Las láminas nucleares al ser
fosforiladas llevan a la desorganización de la membrana nuclear,
pero en la telofase se desfosforilan, y se reorganiza esa
membrana.
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Dinámica del citoesqueleto en la división celular:
El citoesqueleto tiene una organización típica que describimos en la interfase, pero durante la división
celular cambia, más específicamente, cambia la organización de los microtúbulos. Los microtúbulos
durante la división celular van a volverse más inestables y se van a organizar a lo largo de los
centrosomas, porque durante la interfase los componentes del centrosoma se separan, pero siguen
formando un solo centrosoma, pero durante la división celular, en la profease, se separan los
centrosomas, se desorganiza la envoltura nuclear (Porque se fosforilan las láminas nucleares, osease
los filamentos intermedios) y pasa a ser todo un solo compartimiento entre el citosol y el núcleo, por
lo que los microtúbulos se relacionan con los cromosomas. Los microtúbulos polares de un polo se
relacionan con una cromátide hermana y los del otro polo con la otra cromátide hermana, y las fuerzas
de polimerización y despolimerización hacen que, con la acción de proteínas asociadas motoras, los
cromosomas se ubiquen en el plano ecuatorial en la metafase.
Los microtúbulos polares van a relacionarse con los cinetocoros para unirse a los centrómeros de las
cromátides.
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A partir de microtúbulos más inestables que los de la interfase se va a formar el huso mitótico. Eso se
va a dar porque los microtúbulos, a partir de dos centrosomas distintos (Uno de cada lado) van a
formarse microtúbulos:
- Microtúbulos polares: Van de extremo a extremo
- Microtúbulos cromosómicos/Cinetocóricos: Agarran a los cromosomas
- Microtúbulos “De laster”/Astrales: Que van hacia la membrana plasmática
En la anafasse se separan las cromátides y los microtúbulos se retraen por despolimerización, y a
través de la acción de proteínas motoras como las dineínas llevan los cromosomas hacia los polos
opuestos. Mientras eso pasa, se produce un anillo contráctil de filamentos de actina antiparalelos, que
entre ellos van a tener filaentos de miosina, que deslizan sobre sí a los filamentos de actina para
acogotar la celula y terminar de dividirla en dos.
En la telofase, las laminas nucleares, osease los filamentos intermedios se desfosforilan, por loque la
envoltura nuclear se vuelve a organizar para volver a dividir el núcleo del citosol.
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En la profase se separan en dos centrosomas para formar el huso mitótico y cada
centrosoma queda formando parte de una celula hija.
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esos pliegues se los llama “Crestas mitocondriales”, la composición proteica de la membrana interna es
diferente a las otras membranas celulares, esta tiene muchas más proteínas y tiene lípidos distintos a las otras
membranas. La membrana mitocondrial interna es mucho más permeable a iones que la membrana
mitocondrial externa.
El espacio entre las membranas externa e interna se llama espacio intermembranoso y el espacio dentro de la
membrana mitocondrial interna se llama espacio de la matriz mitocondrial.
Las mitocondrias son estructuras muy dinámicas
Las mitocondrias tienen un genoma propio, que es similar a los genomas bacterianos. Se cree que
las primeras celulas eucariotas no tenían mitocondrias, y las mitocondrias se crearon por una
incorporación de bacterias que generaron una relación de simbiosis, donde esas bacterias
quedaban protegidas dentro de las celulas eucariotas. El ADN mitocondrial se transcribe y ese
transcripto se queda dentro de las mitocondrias.
Nota:
Funciones de las mitocondrias que no tienen nada que ver, pero necesitamos saber:
1- Participan de las reacciones químicas que conducen a la síntesis de hormonas esteroideas
(Esteroideogénesis). Este proceso se da mayormente en el interior de membranas del REL. Pero algunos
pasos pasan en las membranas mitocondriales, por ejemplo, en la ruta biosintética desde el colesterol a
las hormonas esteroideas el primer pasaje de colesterol a pregnenolona, (Esto después se pasa al REL) y
en la última etapa de la síntesis de estas hormonas.
2- Son reservorios intracelulares de cationes de calcio, que cumplen un rol fundamental en los fenómenos
de señalización intracelular. En condiciones basales las concentraciones citoplasmáticas de Ca2+ son
reguladas. Son reservorios secundarios, porque el reservorio primario de calcio es el REL.
3- Cumplen un rol en los fenómenos de señalización intracelular asociados a la muerte celular
programada (Apoptosis).
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4- Bioenergética: Las mitocondrias sintetizan ATP celular, esta es la función más importante.
¿Cuál es la reacción que libera energía para permitir todas esas reacciones no espontaneas
que pasan en las células?
✨La hidrolisis del ATP✨
Es la reacción espontánea preferencial que se utiliza para dar energía a todas las reacciones no
espontáneas. El ATP es un nucleótido trifosfatado con una base nitrogenada de adenina. La ruptura de un
grupo fosfato de un ATP me da la energía para las reacciones no espontaneas.
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Para entender a las reacciones químicas que forman parte del metabolismo necesito entener el mecanismo
de óxido-reducción:
Químicamente, la oxidación es el proceso por el cual una molécula cede electrones a otra. Y está
acompañada siempre de un proceso de reducción, que es el proceso mediante el cual una molécula
incorpora electrones. De ahí los procesos de óxido-reducción, una molécula no se puede oxidar sin que
otra se reduzca. Muchas reacciones relacionadas a la generación de ATP, son reacciones de óxido-
reducción.
Muchas de estas reacciones pueden ser
espontaneas o no espontáneas, pero para
saberlo tenemos que hablar sobre el concepto
de potencial de reducción.
El potencial de reducción nos dice que las
moléculas tienden a ceder o capturar electrones.
A mayor potencial de reducción, mayor es su
tendencia a capturar electrones.
Una reacción de óxido-reducción es espontánea
cuando un electrón pasa de una molécula que tiene menor capacidad para capturar electrones a una
molécula que tiene una gran capacidad de capturar electrones . A mayor es la diferencia de potencial de
reducción de las moléculas implicadas, más energía se va a liberar.
Todo este proceso va a ser mediado por enzimas que de normal no pueden actuar sobre estas moléculas,
pero tienen la asistencia de coenzimas, que son moléculas orgánicas más pequeñas y asisten en catalizar
reacciones de óxido-reducción porque tienen la capacidad de ser aceptores temporarios de electrones.
La función de aceptores temporarios (Coenzimas) de electrones es cumplida por NAD+ y NADH/FAD y
FADH2.
- NAD+: Nicoteramida adenin dinucleótido. Forma oxidada, carece de electrones. Carga positiva.
- NADH: Forma reducida de NAD+ que es capaz de tener 2 electrones asociados. También se le agrega
un protón. Va a tener carga neutra.
- FAD: Forma oxidada. Carga eléctrica neutra
- FADH2: Forma reducida. Incorpora dos electrones que luego podrán ser reducidos.
Okay esto es todo lo que tenemos que saber conceptualmente, pero lo que voy a
explicarme ahora va a ser el paso previo a la regeneración de ATP
Catabolismo de los hidratos de carbono (Glucólisis).
La energía que se encuentra entre los enlaces carbono - carbono va a ser la que se use para reestablecer el
ATP a partir de ADP y fosfato.
Son 10 reacciones que van a catalizar al hidrato de carbono para formar 2 moléculas de 3 carbonos,
(piruvatos). Energéticamente es poco eficiente, porque se consumen 2 ATP para fosforilar al hidrato de
carbono y activarlo (Aumenta las probabilidades de que luego pueda reaccionar en las reacciones químicas)
y al final se generan 4 moléculas de ATP. Entonces solamente ganamos 2 moléculas de ATP. Esto no explica
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cómo generar todos los ATP que las celulas necesita. Pero este proceso también carga coenzimas reducidas
con electrones.
La glucolisis me deja:
- 2 moléculas de ATP
- Coenzimas reducidas
- 2 moléculas de piruvato. Estas van a ser transportadas al interior de la matriz mitocondrial, donde
van a ocurrir los próximos pasos del catabolismo de los hidratos de carbono.
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El AcetilcoA puede generarse de hiddratos de carbono, y también de los ácidos grasos. Este proceso
de generación de AcetilcoA como degradación de ácidos grasos se llama “Beta-oxidación“, y ocurre
dentro de la matríz mitocondrial.
Los ácidos grasos tienen energía en los enlaces carbono-carbono. Si los ácidos grasos están dentro de
la matriz mitocondrial se van a unir a AcetilcoA y va a ocurrir la “beta-oxidación”, que básicamente es
romper progresivamente las uniones del ácido graso, eso va a almacenar electrones en coenzimas y,
al final del ciclo, me va a dejar con un acetilcoA formado por dos carbonos. Osease, si yo tengo un
ácido graso de 28 carbonos, después de dar 14 vueltas, voy a tener 14 moléculas de acetilcoA y al
mismo tiempo genera más coenzimas reducidas.
¿Qué tiene que ver esto con la generación de ATP a base de ADP y de fosfato?
El enriquecimiento proteíco en la membrana mitocondrial interna tiene que ver con el proceso, son
complejos que participan en la creación de moléculas que acepten los electrones que estuvieron
almacenados en FADH y NADH, porque el potencial de reducción de estos complejos va a ser mayor al
potencial de reducción de las coenzimas (Acordate que el potencial de reducción es la capacidad de
robarle electrones a otras moléculas). Estas reacciones de óxido-reducción son espontaneas, así que
liberan energía, y esa energía se usa para que los complejos protéicos respiratorios bombeen protones
en contra de su gradiente de concentración, osease que bombeen protones desde la matriz
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mitocondrial hacia el espacio intermembrana. La alta permeabilidad de la membrana interna al pasaje
de iones, hace que, a medida que los complejos respiratorios oxidan a las coenzimas, obteniendo los
electrones, permitan que esos electrones se acumulen en el espacio intermembrana (Porque no pueden
volver a entrar).
Esos complejos respiratorios solamente funcionan por la presencia del oxígeno molecular, el que
agarramos cuando respiramos. El oxigeno ingresa por difusión simple a las mitocondrias donde va a ser
el último aceptor de electrones. Esto se da gracias a que tiene el máximo poder de reducción, tiene la
máxima capacidad para incorporan electrones, el oxígeno se reduce, puede unirse a protones que
también están ahí y así se transforma en dos moléculas de agua. Esta es la función del oxígeno, es el
último aceptor de electrones. Sin oxígeno, todos los complejos respiratorios se saturan de electrones y
así ya no pueden seguir sacando electrones de las coenzimas.
Los complejos respiratorios están multiplicados millones de veces en cada mitocondria, y la energía que
consiguen de los electrones va a ser utilizada para generar un transporte en contra de gradiente de
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consentracióndesde la matríz mitocondrial hacia el espacio intermembrana. Ese transporte de protones
en contra del gradiente de concentración gasta una enorme cantidad de energía, y esos protones van a
quedar atrapados en el espacio intermembrana, porque la membrana mitocondrial interna es altamente
impermeable a iones. Esta acumulación de protones dentro de la intermembrana tiene un gran
ppotencial de energía, que va a ser liberada si el gradiente se dicipa, y la energía liberada por la
disipación de ese gradiente es la que va a ser recolectada por un complejo enzimático presente en la
membrana mitocondrial interna, el complejo de la ATPsintasa, que a base de la energía del movimiento
de los protones atrapados dentro de la intermembrana, es capaz de fosforilar moléculas de ADP y
dejarlas siendo ATP. Los protones solamente pueden salir de la intermembrana por el complejo de la
ATPsintasa, así que sí o sí se hace el ATP.
Pensá la salida de los protones por la ATPsintasa como un río que mueve un molino y genera energía.
Entonces la cadena queda así:
Energía presente en enlaces carbono-carbono de hidratos de carbono y de ácidos grasos pasa a…
Electrones de alta energía contenidos en las coenzimas pasan su energía a…
Disicpación del gradiente de protones libera energía que pasa a…
ATPsintasa hace el ATP
Fenómeno de desacoplamiento:
Esto nos permite entender las moléculas llamadas “Desacoplantes”. El acoplamiento hace referencia a
un acoplamiento de energía en un gradiente de protones, que cuando se disipa libera una energía que
usamos para hacer ATP. Este “Acoplamiento” puede romperse gracias a agentes desacopladores, esos
agentes desacopladores van a hacer que los protones salgan del espacio intermembrana por una vía que
no es la ATPsintasa, entonces el gradiente de protones se disipa, entonces al no acumularse un
gradiente de protones y si no hay gradiente de protones, entonces no hay energía para hacer ATP,
entonces la energía de la disipación de este gradiente sale en forma de calor.
Preoxisomas:
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Seminario 11: Integración de células en tejido.
Las células se organizan en forma cooperativa formando X estructura, formando tejidos. La organización
es precisa espacial y temporalmente.
Dentro de estos tejidos células nacen, viven y mueren, pero eso no altera la organización
general del tejido. Esto se debe a diferentes factores:
1) Comunicación celular: Permite coordinar la función de las células, participa en la estabilidad de
los tejidos
2) Adhesión diferencial o selectiva: Mantiene estabilidad de los tejidos
3) Síntesis, interacción y remodelación de las matrices extracelulares: Se mantienen los patrones de
expresión de genes.
4) Memoria celular: Las células mantienen patrones de expresión de genes a lo largo del tiempo y
eso hace que el tejido mantenga sus características.
5) Nichos celulares: hogares de las células madre
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Hay 4 principales grupos de familias de moléculas de adhesión: Todas glicoproteínas
transmembrana.
1- Cadherinas: Forman homodímeros en la membrana de una célula y se relacionan con homodímeros
de moléculas vecinas. Su función depende de la concentración de calcio extracelular y permite una
adhesión estable. Relaciones homofílicas
2- CAM: Moléculas de adhesión celular. (CAM se llama la familia, y uno de los tipos de unión dentro de
esa familia también se llama CAM, es como el tío Dari y el abuelo Rubén). Pertenecen a la superfamilia
de las inmunoglobulinas. Están formadas por una glicoproteína que se relaciona con otra
glicoproteína similar en la célula vecina, median interacciones mecánicas entre células vecinas. Son
adhesiones menos duraderas que las canhesinas y no dependen del calcio del medio extracelular.
Participan en relaciones homofílicas intercelulares.
3- Integrinas: Heterodímeros formados por un péptido alfa y uno beta que se relacionan con
componentes de la matriz extracelular como la fibronectina. Hay distintas combinaciones que tiene
distinta afinidad con distintos componentes de la matriz extracelular. Es heterofílica y permite la
relación de la célula con la matriz extracelular. Principalmente permiten la adhesión a la matriz
extracelular. Las integrinas pueden estar activas o inactivas y participan en la migración celular.
Inactivas se enrollan y no tienen función. Activas, permiten el anclaje a la matriz extracelular. Activas,
también participan en fenómenos de adhesión y señalización celular, pueden modificar la dinámica
del citoesqueleto, la combinación de heterodímeros de X célula y la expresión génica.
Notas:
Las integrinas también pueden formar uniones heterófilas con proteínas de la familia CAM. Y formar
algunos enlaces intercelulares.
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Las moléculas de adhesión forman parte de las uniones de anclaje, son conglomerados de moléculas
de adhesión tan grandes que se pueden ver al microscopio.
2) Uniones ocluyentes:
Unen las células entre sí e impiden que moléculas externas pasen
entre medio de las células hacia la matriz celular. Están formadas por
proteínas de transmembrana (Ocludinas y claudinas) que impiden el
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pasaje de moléculas entre las células desde el exterior. Estas uniones también impiden que los
fosfolípidos y las proteínas de la membrana apical pasen a la cara de la apical a la basolateral y
viceversa, osease que mantienen la polaridad de la celula.
3) Uniones GAP:
Son canales que permiten el pasaje de pequeñas moléculas entre una célula y
otra que coordinan el funcionamiento de células vecinas (Uniones de
comunicación) Se forman por conexones, y cada conexón se forma por 6
unidades, 6 proteínas, que forman un canal por el que pasan pequeñas
moléculas. Permite coordinar el funcionamiento de células vecinas y están
formadas por proteínas llamadas conexinas. Esto es útil en el corazón por
ejemplo, porque sincronizan las funciones de las celulas del miocardio para que
lata todo al mismo tiempo.
4) Uniones de señalización.
Las otras también tienen señales, pero acá es la función principal. Tenemos
dentro de esta categoría a las sinapsis químicas, las sinapsis inmunológicas
(Entre linfositos). Uniones entre receptores y ligandos que participan en
procesos de anclaje y señalización celular.
Nota:
B- cadherina: Endotelio
P-cadherina: Placenta
E-cadherina: Epitelio
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Uniones de membrana basolateral: Uniones oclusivas, uniones de anclaje (Adherentes o
desmosomas), uniones GAP.
Unioones de membrana basal: Hemidesmosomas, y las uniones entre la actina de la celula y la
matriz extracelular
Estructura básica de todas las uniones de anclaje: Moléculas de adhesión – Proteínas de anclaje –
Proteínas del citoesqueleto.
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Las uniones intercelulares además de participar en fenómenos de anclaje (Mecánicos), van a producir
señalización intracelular y regular la expresión génica. Esa modificación, puede hacer que varíe la
expresión de las uniones o las moléculas que las forman.
Por ejemplo, en la formación del tubo neural el ectodermo general no se queda agarrado al tubo neural
porque tiene cadherinas distintas a las de las crestas neurales. Y las crestas neurales después van a poder
migrar porque no van a quedarse pegadas al tubo neural.
Las moléculas de adhesión también pueden participar entre otro tipo de uniones, como la sinapsis.
Sinapsis: Son zonas de comunicación entre un terminal sináptico con una porción post-sináptica. Muchas
moléculas de adhesión colaboran con el mantenimiento de la unión, muchas cadherinas y CAM. Entre el
medio de las dos células hay matriz extracelular. Es un tipo de unión para la comunicación.
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La resistencia mecánica de los tejidos conectivos no depende de las células sino de la matriz
extracelular, que al mismo tiempo funciona para regular la comunicación de la célula. En el epitelio la
resistencia la mantiene la citoqueratina.
+ Agua y electrolitos
Proteínas especializadas:
Fibronectina: Proteína especializada cuya función principal es la adhesión. Se pueden relacionar con
la célula y con la matriz extracelular.
Proteoglicanos: Son complejos macromoleculares formados por un eje proteico al cual se unen de
forma covalente hidratos de carbono lineales (No ramificados, suelen ser de carga negativa).
Proteoglicano VS glicoproteína:
Una Glicoproteína es una proteína que tiene un hidrato de carbono pequeño y ramificado unido en su
extremo. Mientras que los proteoglicanos son proteínas a las que se les unen hidratos de carbono de un
tamaño considerable, son lineales y no ramificados. Estos palitos son los glicosaminoglicanos unidos de
forma covalente a los proteoglicanos, pero también hay glicosaminoglicanos que no se unen a los
proteoglicanos, sino que tienen proteoglicanos unidos a ella de forma no covalente.
Glicosamninoglicanos:
Los glicosaminoglicanos tienen forma de malla tridimensional, por lo que pueden atraer agua e inones.
Facilitan la migración celular, porque generan agua que favorecen a la migración celular. Los
glicosaminoglicanos de estos grandes son abundantes en los tejidos más laxos.
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Remodelación de la matriz extracelular:
Las matrices no son estáticas, pueden ser degradadas y reorganizadas a través de enzimas.
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La plasmina puede ser secretada por celulas que necesiten migrar, esas celulas vana recibir señales que
le van a permitir sintetizar plasmina que va a ser liberada en la MEC por exocitosis, esa plasmina va a ser
activadora de las metaloproteasas que van a degradar los componentes de la MEC, permitiéndole a la
celula desplazarse.
- Circuitos de retroalimentación positivos: Si una proteína no se expresa en una celula, una vez
se generaron los cambios epigenéticos necesarios para que se exprese, esa misma proteína que se
expresó por primera vez va a ser la que se encargue de mantener la expresión de proteínas del
mismo tipo. La proteína puede volverse un factor de transcripción específico. La proteína no se
produce hasta que la señal aparece, y genera la proteína, pero cuando la señal desaparece, todavía
sigue expresándose la proteína, porque esa misma proteína hace que se siga sintetizando ese tipo
de proteína.
Nichos celulares:
Áreas específicas que mantienen un microambiente especial donde viven determinadas células. De normal
están ocupados por células madre. Pueden ser moléculas solubles de señalización, otras células, matriz
extracelular, etc.
Células madre: Son células indiferenciadas que tienen la capacidad de auto renovación, y también dar origen a
células diferenciadas con menos potencialidad evolutiva, y participan en el mantenimiento de los tejidos.
Osease que tienen la capacidad de proliferar, y cuando lo hacen, pueden dar origen a dos células madre
semejantes (División simétrica), o distintos tipos de células diferenciadas (División asimétrica). Las células
madre pueden convertirse en lo que sea, mientras que las células diferenciadas no. Las celulas madre también
puede crear otras celulas madre y al mismo tiempo dar celulas diferenciadas.
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Moléculas de adhesión celular
Fármacos
Señalización endócrina: Las emisoras y las receptoras están muy lejos, entonces las moléculas
químicas viajan por el torrente sanguíneo hasta las receptoras.
Señalizaciones de cercanía: Las células emisora y receptora están cerca entre sí, por eso la simple
difusión del mensajero va a hacer que pueda llegar hasta la célula diana. (Se tira por ahí y de seguro
llega a la otra). Hay dos tipos de señalización de cercanía:
-Parácrinas: Las células que emiten el mensaje y las que lo reciben son de diferente tipo
- Autócrinas: Las células que emiten el mensaje y las que lo reciben son del mismo tipo
Señalizaciones de tipo sináptica: Implican una cercanía importante entre la emisora de la receptora.
Como la sinapsis entre neuronas, el espacio entre las células es muy chiquito. También puede darse
en otras células que no sean las neuronas.
Yuxtácrina: Para que se produzca la señalización, ambas células deben tocarse, ya que la molécula
química que actúa como señal no es una señal soluble, sino que está anclada a la superficie de una
célula o en la matriz extracelular.
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La ubicación del receptor dentro de la celula va a depender de la composición química del mensajero.
Las señales bioquimicamente no polares, que pueden atravesar por difusión simple la membrana de
las celulas, tienen receptores localizados intracelularmente. Porque justamente pueden viajar, entrar a
la celula y ahí llegar a su receptor. Por ejemplo las hormonas esteroideas.
Las moléculas muy polares, muy grandes o cagadas suelen tener receptores en las membranas de las
células acoplados a canales iónicos, porque no pueden pasar fácilmente por la membrana entonces el
receptor está ahí dando hacia afuera de la celula cuestión de que la señal pueda ser recibida.
La unión de un ligando a su receptor causa una cascada de señalización intracelular que van a
conducir a última instancia a la producción de proteínas efectoras (Las que van a mediar la
transformación del fenotipo).
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Te lo explica con ejemplos:
Es una unión entre el terminal de un axón y las fibras musculares. Entre esa unión hay vesículas sinápticas
que contienen al mediador químico que son moléculas de neurotransmisores.
El Acetilcolina es la molécula que va a ser la mensajera, y está cargada positivamente, por eso se une a
receptores de membrana (Porque no puede atravesar esa membrana por culpa de su carga). Puede
unirse a distintos receptores en distintos tipos de células, porque tiene una carga positiva. Cuando nos
envenenan nos da parálisis muscular porque el veneno bloquea los receptores nicotínicos
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va a impedir las relaciones entre la interacción de la actina y la miosina, pero cuando el calcio se une a
ella, osease a la troponina va a permitir la interacción entre el filamento de actina y la proteína motora de
miosina. El deslizamiento de los filamentos de actina sobre la miosina va a causar la contracción muscular.
En la señalización sináptica, una señalización química (acetilcolina) se unió a un receptor de membrana de
tipo canal iónico, que a través de una cascada de señalización intracelular mediada por el cambio citsolico
de las cantidades de calcio, y eso produjo un cambio fenotípico del citoesqueleto y todo eso produjo la
contracción muscular.
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proteínas intracelulares que están reguladas por la unión a un GDP. El GDP mantiene las 3 proteínas
inactivas en condiciones basales, y cuando cambia a su forma GTP activa las proteínas.
¿Cómo interactúan las células para controlar las concentraciones del calcio?
Las proteínas G no son todas iguales, no todos los receptores
cumplen la misma función en las proteínas G. A veces el ligando
INACTIVA la proteína G en vez de activarla.
Cuando el GDP se cambia por GTP (Gracias a la acción de un
ligando) se va a activar a la subunidad alfa de la proteína G, eso
va a activar a las subunidades beta y gama. Y eso va a causar una
cascada de señalización intracelular que va a llevar a cambios
intracelulares.
La proteína G ya activada va a estimular la producción de AMPc
(AMP cíclico), una enzima que fosforila
otras proteínas, ese AMPc va a ser un
segundo mensajero, osease que va a
generar cambios intracelulares al unirse
a otras moléculas intracelulares. Al
acumularse AMPc, va a unirse a
subunidades regulatorias de la quinasa
A para que deje de estar inhibida. El
AMPc va a fosforilar las subunidades
que normalmente inhiben la acción de
la quinasa, y así va a activar esa kinasa. Esa quinasa va a fosforilar a un sustrato,
que es un factor específico de la transcripción, la proteína Krebs (va a crear a
fofokreb), creando fofokreb, que va a modificar la expresión de genes de la
célula.
Esa expresión de genes va a dar una nueva señal llamada RANK ligando, que va
a ser producida por los osteoblastos, para que estos le indiquen a loss
osteoplastos que tienen que liberar más calcio al ambiente, estas señales son
parácrinas, porque los receptores están cerca de los osteoblastos, pero no son
la misma celula. Gracias a recibir esa señal los osteoplastos para que liberen
calcio, para así reestablecer el equilibrio de la calcemia. Una vez está todo
equilibrado vamos a tener un tercer fenómeno de señalización, este está dirigido por la proteína OPG.
Una hormona esteroidea (Que puede venir de dónde sea, viene de andrógenos, esos andrógenos pueden
venir hasta de los mismos osteoblastos) va a actuar como señal que va a llegar a los osteoblastos, las
señales esteroideas pueden atravesar las membranas de las celulas para llegar a la membrana del
núcleo.
Los receptores normalmente están inactivos, están unidos a chaperonas que los mantienen inactivos. Pero
cuando están activos, entonces son capaces de recibir a las señales, y después de recibirlas van a llamar a
integrinas que transporten esos mismos receptores dentro del núcleo, porque los receptores van a ser
usados como factores de transcripción específicos para la transcripción, que se van a unir a secuencias
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específicas, después van a llamar mecanismos epigenéticos que van a hacer que la cromatina se
descondense en ese lugar y eso va a permitir que se transcriba una proteína OPG, la molécula OPG
secuestra a RANKligando, para que ese RANK ligando deje de decirle a los osteoplastos que liberen calcio.
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Proceso que puede darse de dos formas, una muerte accidental, no programada, a eso se le llama necrosis.
Accidente por un tren
Pero también tenemos un sistema de muerte celular que se produce por la activación de ciertas proteínas
que llevan a la muerte celular de forma activa, programada. Eutanasia. Hay varias muertes celulares
programadas, la más importante es la apoptosis, las que no son apoptosis son formas de muerte celular no
apoptótica.
Necrosis:
La célula sufre un problema que supera los organismos de compensación, y lleva a la incapacidad de
mantener la homeostasis. La célula se hincha (reversible en una primera etapa, se puede salvar), si progresa
la hinchazón lleva a la muerte no programada de la célula. Durante la muerte, la membrana se rompe y los
componentes intracelulares son liberados al medio extracelular. Esa liberación, causa que los mecanismos
de defensa del organismo reconozcan esos componentes como extraños, y el sistema inmune
inato/inespecífico del organismo realiza un proceso de defensa, lo que causa hinchazón, causa inflamación.
En la apoptosis, la célula ante un determinado estímulo, tanto interno como externo, puede llevar a un
proceso de muerte, pero activando un mecanismo que lleva a la célula a contraerse, a fragmentar la
envoltura nuclear, y se produce un fraccionamiento celular, donde en cada pedacito hay núcleo y cromatina,
esos cuerpos se llaman cuerpos apoptóticos. Y luego cada fragmento es endocitado por celulas con
capacidad fagocítica. En este proceso no hay reacción inflamatoria. El proceso de apoptosis es llevado a cabo
por las caspasas (Conjunto de proteínas).
El resumen incluye tanto los seminarios como info de los caps correspondientes de la
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- Disminución del volumen celular
- Membrana plasmática con ampollas
- Organelas conservadas
- Cromatina sobre la membrana nuclear
- Los nucleos se rompen
- Fregmentos nucleares picnóticos
- Cuerpos apoptóticos
Funciones importantes:
- Nuestros órganos se mantienen por la proliferación y muerte celular, en un organismo normal hay
un equilibrio, osease que participa en la morfogénesis.
- En el desarrollo embrionario hay más proliferación que apoptosis.
- Hay genes inductores de la apoptosis, que, si su función se inhibe, disminuye la apoptosis, y alarga
la vida de las células, y eso puede favorecer el desarrollo de tumores.
- El aumento de apoptosis con relación a la proliferación celular (Se mueren más de las que nacen)
va a producir enfermedades neurodegenrerativas, donde distintos órganos van perdiendo su
capacidad funcional.
- Los protooncogenes son moléculas que estimulan la proliferación y sobrevida celular, si ganan
función pasan a ser oncogenes, y aumentan tanto la proliferación celular que favorece el
desarrollo de tumores.
- Para reconocer celulas podemos producir un homogenatos, hacer electroforesis y vamos a ver
bandas de cromatina cortadas en 200 pares de bases cada una, ese corte es característico de las
celulas apoptóticas. También podemos marcar proteínas para ver cómo esa proteína fragmenta el
Golgi, eso es signo de apoptosis. También podemos ver una proteína de membrana mediante
inmunohistoquímica, es la Nexina, que solamente aparece en la membrana cuando la celula está
en proceso de apoptosis.
Caspasas:
Son proenzimas encargadas de degradar proteínas intracelulares, que se activan al recibir señales
de apoptosis. Son las encargadas de destruir los inhibidores de los ADNasas, así estas pueden
fragmentar el ADN. Las caspasas cortan las láminas nucleares entonces llevan a la fragmentación
del núcleo. Llevan a la ruptura de los componentes del citoesqueleto (Actina, miosina, tubulina).
También fragmenta las proteínas de la matriz del Golgi, lo que va a romper el Golgi. Todo esto
fragmenta la célula y se producen burbujas de la membrana plasmática.
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Las células tienen receptores de muerte, y proteínas adaptadoras, que adaptan a los receptores con
otras proteínas de activación de la apoptosis.
- Receptores de muerte
- Proteínas aaptadoras
- Caspasas
- Protooncogenes
- Mitocondrias
- Antioncogen p53.
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Vía extrínseca:
Hay receptores de muetre celular, que si reciben un ligando, entonces el receptor se activa y permite
la activasión de las procaspasas 8, que se cortan y se activan. Eso lleva a la muerte por vía extrínseca.
Las caspasas 8 y 10 son de la vía extrínseca. La caspasa 8 activa a la procaspasas 3 y 7 y, activa una
proteína llamada VID, que lleva a la inactivación de BCLA2 y a veces a la activación de la vía
intrínseca.
Las caspasas 3 y 7 ya activadas son las encargadas de llevar a cabo la apoptosis por vía extrínseca.
A veces la muerte celular programada es mediada por linfocitos killer que expresan los ligando de
muerte. Cuando los linfocitos detectan una celula tumoral, por ejemplo, van y la matan.
El aumento de la sobrevida estaría mediado por protooncogenes, porque favorecen el aumento de la
proliferación y el aumento de la sobrevida, entonces BCL2 es un protooncogen, porque mantiene la
impermeabilidad de la membrana externa de la mitocondria, entonces favorece la sobrevida. Y la p53
es un antioncogen o gen supresor de tumores, porque puede activarse por daños en el ADN y llevar al
aumento de la permeabilidad de la membrana mitocondrial (Vía intrínseca).
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Hay dos tipos de caspasas:
Caspasas iniciadoras: Estas caspassas son características de las vías intrínsecas o extrínsecas. Y son las
que van a activar a las caspasas ejecutoras. Normalmente se encuentran en forma de monómeros, en
esta forma están desactivadas, pero cuando se activan se dimerizan. Y luego dimerizan a las caspasas
ejecutoras. Tienen una homoactivación, porque se pueden activar ellas solas.
Caspasas ejecutoras. Son caspasas comunes a ambas vías y van a ejecutar la ruptura de las proteínas de
las células. Tienen una heteroactivación, osease que dependen de la activación de las caspas iniciadoras.
La acción de las caspasas es favorecida por inhibidores de los inhibidores de la apoptosis, es una doble
negación, evita que otras proteínas eviten la apoptosis, estas son as proteínas Smac y DIABLO.
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Función de p53: Gen supresor de tumores
Es un factor de transcripción que cumple múltiples funciones, se activa ante, por ejemplo, los rayos UV, ante el
bloqueo de la transcripción, al recibir daños ionizantes, ante la activación de oncogenes, ante el daño del ADN.
P53 es el vigilante del genoma, porque se activa cuando hay daño en el genoma. Cuando se activa, primero
arresta el ciclo celular y activa los mecanismos de reparación del ADN. Si se arregla el ADN, la célula puede
volver al ciclo celular, si no es 100% reparado entra en senescencia, y envejece, la celula deja de proliferar. Pero
si no es reparado entonces puede activar la vía intrínseca de la apoptosis y llevar a la apoptosis.
P53 es tan importante, que el 50% de las neoplasias son causadas por defectos en el p53.
P53 es un factor de transcripción específico, osea que puede unirse al ADN y puede permitir la transcripción de
genes blanco. Uno de esos genes blanco es MDM2 que cuando se transcribe da una proteína que inhibe a p53,
porque permite que salga del núcleo y sea poliubiquitinizado en el citosol (marcado para destruir). La vida de
p53 es corta por su propio producto.
Si hay daño en el ADN hay sensores que se activan, y que activan una quinasa, y lleva a la activación de
checkpoint quinasas que llevan a la fosforilación de la proteína MDM2, las quinasas degradan MDM2, también
fosforilan a p53, y eso permite que p53 no se inhiba, y actúa como factor de transcripción específico activando
a otros genes.
P53 activa a P21 IMPORTANTE, es un factor de transcripción que lleva a la detención del ciclo celular,
permitiendo la reparación, si no se repara, p53 activa a BAX, que va a inestabilizar la membrana mitocondrial
externa, activando la vía intrínseca de muerte por apoptosis. P53, además, va a activar un gen que va a inactivar
moléculas que participan en la sobrevida celular, se las inactiva, así la celula no opone resistencia a su muerte.
P53 también puede mandar a crear receptores de muerte, que si se encuentran con un ligando, entonces van a
activar la muerte celular por vía extrínseca.
Factores tróficos: Activan la vía intrínseca
Necroptosis:
Muerte celular programada pero no apoptótica, donde hay liberación de componentes celulares, lleva a una
respuesta inflamatoria, pero no es pasivo (No es necrosis), es programado, pero no apoptótica, puede ser
causada por falta de oxígeno, la activación de FAS, catástrofe energética.
Esto pasa por el fallo de la procaspasa 8, esa señal que puede producir muerte apoptótica, esto hace que
proteínas vuelvan a la membrana más permeable, y que se liberen los componentes internos.
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Síntesis 15: Biología tumoral
Proceso canceroso/Neoplasia: Desregulaciones en los procesos celulares que van a llevar al desarrollo de dos
fenotipos, la desregulación de la proliferación celular (Solo esto no alcanza), y la capacidad de invadir tejidos. Son
procesos muy heterogéneos que dependen del órgano en el que desarrollan.
La mayoría se desarrolla en epitelios, en estos casos, la transformación cancerosa permite a las células epiteliales
romper la lámina basal y migrar hacia el tejido conectivo.
No siempre al hablar de cáncer hablamos de tumor.
Tumores benignos: Permanece confinado en su localización original, sin invadir el tejido sano adyacente ni
propagarse a lugares distantes del cuerpo.
Tumores malignos: Es capaz de invadir el tejido normal adyacente y de propagarse por el cuerpo mediante
los sistemas circulatorios o linfático (Metástasis). Hay distintos tipos de cánceres dependiendo de las
celulas que proliferen descontroladamente.
- Carcinomas: Derivados de las células de tejido epitelial. 80%
- Sarcomas: Derivados de células de tejido conectivo.
- Leucemias: Derivados de células madre de la médula ósea.
- Linfomas: Derivados de leucocitos localizados en ganglios linfáticos.
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3- Son resistentes a inducir apoptosis.
Luego de un determinado número de replicaciones, los cultivos celulares in vitro dejan de replicarse, aunque se
le sigan agregando factores de crecimiento, a esto se le llama senescencia, y se relaciona con el acortamiento
crítico de los telómeros. Esto en las células tumorales no pasa, los telómeros no son un problema.
El cáncer se produce por mutaciones en diversos genes, la adquisición de un fenotipo de las células tumorales
se va dando de a poco. En los tumores estas mutaciones se encuentran enriquecidas porque esa célula va a
tener más fácil la proliferación, heredando esas mutaciones a las células hijas.
Cuando una célula muta, y posee ADN dañado, si llega a terminar un ciclo celular, esa mutación se establecerá y
no podrá ser corregida.
La mayoría de los procesos tumorales se desarrollan en edades adultas, porque se necesita mucho tiempo para
que se acumulen las mutaciones. También tiene que ver con el ambiente, la exposición a rayos UV, etc.
¿Qué genes favorecen la proliferación tumoral?
- Genes cuyos productos ayudan a estimular la proliferación celular Proto-oncogenes
- Genes cuyos productos ayudan a inhibir la proliferación celular. Genes supresores de tumores.
Según esto hay dos formas para que la proliferación celular se descontrole:
1- Que un gen activador de la proliferación (protooncogen) se vuelva hiperactivo (ahí pasa a llamarse
oncogén). Mutaciones de ganancia de función, un gen activador de la proliferación gana función y se vuelve
hiperactiva (Nada es bueno en exceso en especial los activadores de la proliferación).
Ejemplos:
- Mitógenos
- Receptores mitógenos: Receptores se mantienen activos aún sin tener un ligando que lo active.
- Cdks
- MYC.
Clases de proteínas codificadas por protooncogenes:
Factor de trasmisión inducido por la cascada de señalización. MYC, está codificado por un
protooncogen y que está mutado hiperactivamente en muchos tumores. Induce positivamente a la
ciclina E y la Cdk2, pero inhibe la expresión de p21 (Catalizador de la proliferación celular), esa
combinación es perfecta para la proliferación sin control. Induce la sobreexpresión de telomerasa, lo
que hace que los telomeros estén tan largos, y le da inmortalidad replicativa. Esta única mutación de
MYC no va a darte cáncer, contribuye, pero no es suficiente.
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2- Que un gen inhibidor de la proliferación (Supresor de tumores) se inactive. Mutaciones de perdida de
función. Los frenos de proliferación se inactivan, y se prolifera sin control.
Ejemplos:
- p53
- Proteínas inhibidoras de Cdk-ciclinas (p27 y p21)
- Proteínas de sistemas de reparación del ADN
P53 va a inducir al arreglo del ADN, pero si falla, entonces la celula va a ir hacia apoptosis.
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Adquisición del fenotipo invasivo:
Transición epitelio mesenquimática (TEM):
Las células que han hiperprolierado van a desarrollar un cambio fenotípico que van a hacer que muchas de
las células epiteliales pierdan sus características de células epiteliales. Les van a permitir romper la
membrana basal para poder atravesar e ingresar al tejido conectivo, y luego moverse a otras localizaciones
del cuerpo. La transición epitelio mesenquimática es una de las primeras cosas que se dan en la invasión.
TEM no es exclusivamente patológico, es la reedición de un proceso que ya está desde antes en el individuo.
TEM es normal en el cuerpo, la cagada es que se reediten y pasen en un contexto patológico.
Adquisición de:
- N-Cadherina, en vez de E-cadherinas va a tener N-cadherinas e integrinas que le va a
permitir a la célula moverse.
- Vimentina
- Secreción de proteasas (MMP2- MMP9), estas proteasas le van a permitir degradar la
membrana basal.
- Secreción de la fibronectina, también va a
ayudar a la motilidad.
- Integrinas avB6, también ayudan con las
uniones móviles
- Receptor de PFGF
- Forma de fibroblasto
- Motilidad.
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subconjunto tiene las características de anclarse, sobrevivir y proliferar, de ahí que tarde tanto en
ocurrir.
Tropismo metastásico:
Es un concepto derivado de la clínica. Dependiendo de dónde esté el tumor primario, hay más
chances de tener tumores secundarios en órganos específicos. Por ejemplo, si tenés un tumor
primario en el colon, es más probable que haya metástasis en el hígado, la medula ósea o los
pulmones. Para explicar eso tenemos dos teorías.
Explicado por:
Teoría mecanística: Explica este fenómeno en función del patrón del flujo sanguíneo. Seguramente es por la
irrigación y qué irriga primero o después. Pero no explicaba la totalidad de los tropismos.
Teoría de “El suelo y la semilla”: Las celulas metastásicas tienen que tener un microambiente que
les favorezca la proliferación.
- Factores de crecimiento y componentes de la matriz extracelular.
- Sitios de adhesión compatibles en la superficie luminal del endotelio.
- Quimiotaxis selectiva mediante la liberación por parte del órgano blanco de agentes de atracción
solubles
Metástasis: Reproducción o extensión de una enfermedad o de un tumor a otra parte del cuerpo.
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Los tumores no pueden crecer si no pueden desarrollar vasculatura. Tienen que lograr inducir la remodelación
de los vasos sanguíneos circundantes. Un tumor que no está irrigado no puede crecer lo suficiente como para
representar un peligro. Este crecimiento y el desarrollo de la vascularización es fundamental para la
metástasis.
Angiogénesis tumoral:
Comienza con un proceso de regulación de la expresión génica que fisiológicamente ya estaba presente, pero
ahora se usa para el mal.
La hipoxia, la disminución de las concentraciones de oxígeno, va a conducir a la remodelación de la vasculatura
circundante.
A medida que el tumor se hace más grande, las celulas van a quedar tan juntas que el oxígeno no va a dar
abasto, de ahí la hipoxia. La hipoxia va a conducir a la expresión de un factor llamado HIF1 alfa y HIF1 beta
La central es la alfa, está constantemente siendo producida y degradada por la célula, debido al hecho de que
hay un conjunto de enzimas llamadas prolil-hidroxilasas, que hidroxilan al HIF1 alfa, para ser reconocido por la
ubiquitina y ser degradadas.
La cagada es que esas enzimas solamente van a funcionar cuando hay oxígeno, y en la condición de hipoxia en
la que están las células por estar tan sobrepoblada la región, es imposible tener oxígeno, es muy poco, la célula
usa el poco que hay para mantenerse viva, y esa función de degradación de HIF 1 alfa no se cumple. HIF 1 alfa
se acumula, se asocia con la unidad beta, y modula la expresión de los genes de esas células. Y empiezan a
expresar factores de crecimiento, mitógenos que son segregados por las células que expresaron HIF. Esos
factores de crecimiento son tantos que inducen a los vasos sanguíneos cercanos a crecer hacia su dirección.
Notas:
Replicación y mantenimiento de ADN
- La ADN polimerasa Y es la que transcribe el ADN mitocondrial.
- La topoisomerasa II en eucariotas también interviene en la condensación mitótica, es necesaria para la
separación de las cromátides hijas durante la mitosis.
- Las ADN polimerasas forman dímeros, para así sintetizar las dos cadenas al mismo tiempo.
- La lectura no puede ser en sentido 3´5´porque sino la energía tendria que venir de la hidrolisis del
grupo 5´ trifosfato y si se encajara un nucleótido equivocado, para sacarlo, tendríamos que eliminar
ese 5´trifosfato, eliminando así la fuente de energía necesaria para sacarlo, entonces la hebra quedaría
mal directamente.
- ARS (Secuencia de replicación autónoma) es la secuencia donde se va a unir el complejo del origen de
la replicación (ORC), ese ORC es el conjunto de enzimas que permite el inicio de la replicación.
- Uno de los mecanismos de reparación por ADN es puramente químico, se usa para reparar dímeros de
pirimidina, esos dimeros son causados por rayos UV, eso genera un impedimento para la replicación
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del ADN. Para resolverlo químicamente se utiliza energía proveniente de la luz visible, eso se usa para
romer el anillo de ciclobutano, por eso va a llamarse a ese proceso Fotorreactivación, pero como los
humanos no somos plantas como para andar usando la luz para repararnos este proceso realmente no
funciona en nosotros, solo en plantas.
- La escición de bases se da por una enzima llamada “ADN glucosilasa”, mientras que el corte del
nucleótido que contenía la base errónea se da por la “AP endonucleasa”.
- La escición de nucleótidos se dan por la enzima escinucleasa.
- El ADN puede ser leído después de ser transcripto porque se lee ANTES de metilarlo. Acordate que uno
de los mecanismos de memoria celular es heredar los cambios en la cromatina del ADN, lo que pasa es
que después de transcribirse va a ser leído ANTES de que se apliquen todos esos mecanismos
epigenéticos que implica la memoria celular. El orden es – Transcripción – Lectura de prueba –
condensación y aplicación de los mecanismos de memoria celualar (Metilación del ADN, por ejemplo)
- Cuando hay daños en el ADN, de normal la nueva hebra no puede seguir sintetizándose por las AND
polimerasas comunes, así que existen “ADN polimerasas translesión” que crean la hebra de ADN con
errores y todo, para que luego otro mecanismo de corrección se encargue de arreglarlo. De ahí que
puedan haber celulas con mutaciones del ADN, porque la ADN polimerasa translesión copió la hebra y
los mecanismos de reparación de esa hebra fallaron.
Ciclo celular:
- “G1” es la abreviación de GAP 1, GAP significa intervalo.
- El complejo kinasa dependiente de ciclinas-ciclinas se llama MPF (Factor promotor de la maduración)
- A finales de la mitosis, para poder realizar la citosinesis (Que las dos celulas ijas se dividan),
vamos a necesitar la degradación del complejo MPF, para que eso pase necesitamos una
ubiquitin ligasa llamada "Complejo promotor de la anafase/Ciclosoma" (APC/C), ese
complejo va a ubiquitinizar al complejo MPF y va a degradarlo. Degradando el complejo
MPF vamos a poder terminar la mitosis a través de la citocinesis y así tener por fin las dos
celulas hijas.
- Cada ciclina y kinasa tiene una función, pero si una ciclina se pierde por una mutación, otra puede
reemplazar la función que la ciclina perdida cumplía.
- Retinoblastoma es un gen supresor de tumores que va a mantener a E2F inactivo, pero cuando
retinoblastoma es fosforilado por un complejo ciclina-kinasa entonces E2F va a quedar libre y va a poder
transcribir tranquilamente, permitiendo el avance del ciclo celular y la proliferación
- Cuando hay una ruptura en el ADN hay proteínas que detectan eso y llaman a mecanismos de
reparación, esas proteínas se llaman ATR y ATM, la ATR se encarga de detectar y reparar una cadena
simple y el ATM se encarga de detectar y reparar roturas de doble cadena. Para llamar a esos
mecanismos y detener el ciclo celular, estas proteínas van a fosforilar las quinasas de los puntos de
control. ATM también es la encargada de fosforilar p53. Ya sabés, esa proteína super importante que
está constantemente siendo sintetizada y degradada, pero cuando es fosforilada no se puede degradar y
se empieza a acumular. P53 es un factor de transcripción específico que va a inducir las síntesis de
proteínas que detienen el ciclo celular, como p21 o p27.
Nota: Etapas de la mitosis, porque soy una inútil que no lo aprendió en el CBC:
La mitosis se divide en 4 primeras etapas:
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- Profase: Los cromosomas se condensan y los centrosomas se desplazan a lados opuestos del
núcleo, así se comienza la formación del huso mitótico. La ruptura de la envoltura nuclear le
permite a los microtúbulos anclarse en los cinetocoros de los cromosomas.
- Prometafase: Los cromosomas se agitan hacia adelante y atrás entre los centrosomas y el
centro de la celula para así alinearse en la zona media del huso.
- Metafase: Los cromosomas están alineados en la zona media del huso.
- Anafase: Las cromátides hermanas se separan y migran a polos opuestos del huso.
- Telofase: Las envolturas nucleares se reconstruyen y los cromosomas se descondensan.. Se
produce la citocinesis que me termina dando las dos celulas hijas ya separadas.
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- Profase: La celula al entrar en mitosis tiene sus cromátides hermanas condensadas que están unidas a
través del centrómero, que es una región cromosómica a la que se unen proteínas, eso va a crear el
cinetocoro, que va a ser el punto de anclaje para los microtúbulos. Además de eso en el citoplasma se van
a producir cambios que permitan formar el huso mitótico:
1. Los centrosomas (Duplicados en la interfase) se separan y migran a lados opuestos del núcleo,
donde van a volverse los dos polos del huso mitótico
2. Se rompe la envoltura nuclear dando fin a la profase.
- Prometafase: Transición entre la profase y la metafase. Los microtúbulos del huso mitótico se anclan en los
cinetocoros de los cromosomas condensados. Los cromosomas se sacuden para alinearse en el medio del
huso mitótico.
- Metafase: Las cromátides hermanas están alineadas en el centro del huso mitótico, y para pasar a la
anafase las cromátides hermanas tienen que separarse.
- Anafase: Las cromátides hermanas ya están separadas, ahora van a migrar a los polos opuestos del huso.
- Telofase: Las envolturas nucleares se regeneran y los cromosomas se descondensan y así termina la
mitosis.
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- La envoltura nuclear se despolimeriza gracias a la acción del complejo kinasas-ciclinas, que fosforilan a los
microtúbulos y así se despolimerizan.
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es la parte del video de ciclo celular que se hacía difícil de entender. Se relaciona con el punto anterior
porque si tenemos a MCC es porque las cromátides no están alineadas y si no están alineadas la APC/C
ubiquitin ligasa no va a estar activa, y si no está activa la cohesina no se puede degradar, y si no se degrada
la cohesina entonces las cromátides hermanas se quedan pegadas, y da igual cuánto tiren de los extremos
los mmicrotúbulos, porque la unión es tan tan tan fuerte que no se va a poder separar.
- Después de que se realiza este proceso las ciclinas y kinasas que llevaron a la anafase van a ser degradadas,
las envolturas nucleares van a voler a formarse, los microtúbulos van a volver a su estado normal y la
cromatina va a descondensarse.
- La meiosis es un tipo de división celular el cual divide los cromosomas entre las dos celulas hijas, dejando
así dos celulas haploides.
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La meiosis va a tener una meiosis 1 donde se va a replicar el ADN y una meiosis 2 donde se va a dar origen a las
celulas finales haploides.
La meiosis 1 tiene 5 etapas:
- Leptoteno: Es la profase temprana meiótica. En esta etapa hay muchas roturas de doble cadena que se
solucionan con la recombinación homóloga de los cromosomas.
- Zintógeno: En esta etapa los cromosomas homólogos van a relacionarse estrechamente. En esta etapa un
complejo proteíco llamado complejo sinaptonémico va a formarse a los largo de los cromosomas, este
complejo tiene forma de cierre y va a mantener a los cromosomas unidos y alineados durante la etapa del
PAQUITENO.
- Paquiteno: En esta etapa los cromosomas van a estar unidos y alineados gracias al complejo
sinaptonémico, en esta etapa los cromosomas van a terminar de combinarse por el crossing over, y van a
quedar unidos en los lugares de sobrecruzamiento (A esos lugares se los llama quiasmas)
- Diploteno: Los complejos sinaptonémicos desaparecen en esta etapa, y los cromosomas homólogos se
separan, pero permanecen unidos en los quiasmas, esto es necesario para que en la metafase se alineen.
- Diacinesis: Es la etapa final de la profase 1, es el paso a la metafase, acá se condensan los cromosomas al
100%.
En la metafase 1 los cromosomas se alinean en el huso, pero a diferencia de la mitosis, los cinetocoros de
ambas cromátides están para el mismo lado. La anafase 1 empieza con la rotura de los quiasmas, entonces
los cromosomas homólogos se separan, mientras que las cromátidas hermanas permanecen unidas por sus
centrómeros. Entonces después de que las celulas se separan cada una recibió un miembro de cada par de
homólogos, constituido por dos cromátides hermanas.
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- Los genes son secuencias de de ADn que se expresan para dar un producto funcional, un ARN o un
polipéptido. Pero existen algunos ADN no codificantes, los que vamos a llamar intrones, y los pedazos de
ADN que sí son codificantes se van a llamar “Exones”. El gen por completo se transcribe para dar origen a
una molécula de ARNm, para eso, se quitan los intrones mediante el proceso de splicing, y se unen los
exones entre sí.
- Los exones incluyen regiones de 5´y de 3´ del ARNm que no se traducen en proteínas, la parte del ARNm
que no se traduce (UTR: Untranslated regions)
- Los intrones son un 93% del genoma humano, y
el 3% son exones.
- Las histonas no tienen intrones casi, los intrones
suelen estar presentes en los genes que codifican
para proteínas.
- No todos los intrones son inútiles, existen
intrones que codifican para productos
funcionales como ARNm o proteínas. A eso se le
llama genes anidados: Es un gen contenido en un
intrón de un gen más grande.
- Los intrones pueden ser secuencias reguladoras
del genoma también. También son reguladores
del splicing, que es la fundamental en la
formación de ARNm funcionales, porque permite
que distintos exones se unan logrando dar
combinaciones diferentes (Splicing alternativo).
- Una forma de bloquear la expresión génica es
mediante los iARN (ARN de interferencia), son
ARN de doble cadena que pueden bloquear la
traducción. Los microARN son los ARN no
codificantes (Existen ARN no codificantes pero
que aún así tienen función) que controlan la
interferencia de otros ARN.
Parece ser que son ARNs que al principio tienen
forma de pinza, pero luego son cortados por
enzimas para que quede un ARN doble cadena,
ese ARN doble cadena después se va a separar
por la acción de otras enzimas y así me van a
quedar micrARNs de una sola cadena que
pueden reconocer otros ARNm y pueden evitar
que se expresen.
- ARN largo son codificanes (ARNlnc). Son ARN no
codificantes de más de 200 nucleótidos
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importantes para la regulación génica, como por ejemplo en el fenómeno de inactivación del cromosoma.
Eso que pasa de tener que desactivar parte de un cromosoma X, porque sino tendríamos el doble de
genes que los necesarios en las mujeres.
Cromosomas y cromatina:
- Los eucariotas tienen moléculas de ADN lineales organizados en diferentes cromosomas.
- Los complejos entre el ADN eucariota y las proteínas forman la cromatina, que contiene el doble de
proteínas que el ADN, las proteínas principales de la cromatina son las histonas (Proteínas chiquitas que
tienen gran proporción de arginina y lisina (Aminoáciddos básicos) que facilitan la unión con el ADN
cargado negativamente.
- La unidad básica de la cromatina es el nucleosoma.
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- Heterocromatina: Cromatina de la interfase. Es transcripcionalmente inactiva y contiene secuencias del
ADN repetitivas.
- Centrómero: es una región especializada del cromosoma cuyo papel es asegurar la distribución correcta de
los cromosomas entre las celulas hijas.
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- La secuencia de los telómeros en el humano es TTAGGG, y terminan en un rulo que luego se une a un
complejo protéico que protege el extremo de la cadena.
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- Los potenciadores pueden funcionar atra´ves de grandes distancias, o entre distintos cromosomas, a eso se
le llama “Transvección”.
- Los estimuladores funcionan río arriba y río abajo, incluso a distancia.
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Regulación de la expresión génica parte 2:
- La ARNasa que participa en el corte de los preARNribosomal (Que es un trébol que cuando lo cortás te
da 3 ARNr distintos) es una ribozima, osease que es una enzima que en vez de tener proteínas tiene
ARN como producto catalítico.
- Espliceosomas: Son complejos compuestos por proteínas y ARN, donde se realiza el splicing.
- Los ARN que forman parte del spliceosoma son de 5 tipos:
1. ARNsn: ARN nuclear de pequeño tamaño, forman un complejo entre 6 y q10 moléculas
proteínicas para dar partículas pequeñas de rinonucleoproteínas nucleares (RNPsn), que son
necesarias en el proceso de splicing.
La reacción del spliceosoma acompaña el corte con un reordenamiento de los ARNsn, esos ARNsn
reconocen la zona de corte, la cortan y empalman las dos partes correctas entre sí.
- Decaimiento de ARNm mediado sin sentido: Ocurre cuando los ribosomas detectan codones de
terminación prematuros, eso lleva a la terminación prematura de la traducción y conduce a la
degradación de los ARNm defectuosos.
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Diferenciación celular: 702-714
- Autofagia: Es un mecanismo de recambio gradual de los componentes celulares, que se basa en que las
organelas y proteínas viejas son atrapadas por autofagosomas, que son vesículas que luego se fusionan
con los lisosomas. Sirve para sobrevivir frente a la falta de nutrientes. Pero también se pueden degradar
componentes escenciales de la celula y por eso llevar a la muerte. Se distingue por la acumulación de
lisosomas, es una muerte programada NO APOPTÓTICA.
- Necrosis: Puede ser controlada y ser causada por lisis a base de una lesión grave a la celula y llamarse
“Necroptosis”. O también puede ser descontrolada.
- Los fibroblastos son un ejemplo de celulas diferenciadas que proliferan para formar más fibroblastos en
caso de que se produzca una herida, lo que extrañamente no es lo normal en otras celulas, en otras
celulas hay celulas menos diferenciadas creando celulas hijas que van a diferenciarse para reponer una
población celular X. Esto también le pasa a las células del hígado y a los capilares.
- “Celulas amplificadoras de tránsito” = Celulas de proliferación rápida.
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- IAP: Inhibidor de apoptosis.
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