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cambio de energa libre estandar y el cambio de energa libre de una reaccin redox. Reacciones
acopladas. Energtica del transporte activo. Compuestos con alto potencial de transferencia de fosfato:
factores que influyen en el cambio de energa libre estandar durante la hidrlisis.
8. Enzimologa
Enzimas clasificacin y nomenclatura. Ribozimas. Cofactores. Coenzimas: definicin: estructura qumica y
clasificacin. Coenzimas de oxido-reduccin: nicotinamida adenina dinucletido (NAD), nicotinamida
adenina dinucletido fosfato (NADP), flavina adenina dinucletido (FAD), coenzima Q (CoQ) y cido
lipoico. Coenzimas que transfieren grupos fosfato; que transfieren grupos acilo: Coenzima A (Co A). Que
transfieren grupros glicosilo. Que intervienen en reacciones de decarboxilacin: piridoxal fosfato y biotina.
Otras coenzimas. Vitaminas hidrosolubles que forman parte de coenzimas. Vitaminas liposolubles,
estructura y funcin. Estrategias catalticas.
9. Cintica Enzimtica
Mecanismo de la actividad enzimtica. Cintica. Reacciones monosustrato: el modelo de MichaelisMenten; determinacin de la Km y Vm por el mtodo deLineweaver-Burk. Activadores e inhibidores. Tipos
de inhibicin. Anlogos del estado de transicin. Anticuerpos catalticos (reconocen el estado de
transicin). Reacciones bisustrato: de desplazamiento simple y desplazamiento doble. Estrategias
reguladoras: enzimas alostricas (cintica y modelos), isozimas, modificacin covalente, escisiones
proteolticas.
10. Glcidos y Lpidos
Glcidos: Monosacridos, carbohidratos complejos, glicoprotenas, lectinas.
Lpidos: lpidos de membranas, balance hidroflico-hidrofbico, estructuras de autoagregacin.
11. Biomembranas
Estructura y funcin de la membrana biolgica. El modelo del mosaico fluido. Membranas internas de
clulas eucariotas. Membranas de clulas procariotas. Tipos de movimientos de las molculas
constituyentes. Difusin (FRAP, SPT). Fluidez (anisotropa) y curvatura. Efectos de factores fsicoqumicos y de la composicin. Protenas de membrana: extrnsecas, ancladas, intrnsecas. Prediccin de
secuencias transmembrana a partir de la estructura primaria. Secuencias sealizadotas de
direccionamiento de protenas. Fusin de membranas.
12. Transporte
Difusin: Difusin facilitada. Transporte activo.:Las bombas de Na+, K+ y Ca2+. Cotransporte y
contratransporte. Antibiticos de transporte. Medidas de conductancia: platch clamp. Sinapsis. Potenciales
de accin. Canales activados por voltaje. Canales activados por ligando. Nexus o uniones ntimas.
13. Transduccin de la informacin
Receptores de superficie. Curvas de saturacin. Receptores ionotrpicos. Receptores 7TM. Segundos
mensajeros. Conversacin cruzada. Sistema nervioso. Ultraestructura de la sinapsis. Teora qumica de la
transmisin nerviosa. El potencial de membrana. Liberacin, recaptacin y degradacin de los
neurotransmisores. Unin mioneural. El receptor nicotnico de acetilcolina: inhibidores. La acetil
coilinesterasa: inhibidores. Receptores de otros neurotransmisores.
14. Metabolismo
Metabolismo: visin de conjunto. Reacciones aclopladas. El ATP como divisa universal de energa libre.
Potencial de transferencia de grupos fosfato. Potencial de fosforilacin. Motivos recurrentes en las vas
metablicas. Transportadores activados. Evolucin de las vas metablicas.
Oxidaciones biolgicas. Enzimas de oxido-reduccin: Clasificacin y ejemplos. Metabolismo del
superxido. Gluclisis : reacciones, consumo y generacin de ATP a nivel de sustrato. Generacin de
NADH. Balance energtico. Destinos del piruvato: formacin de acetil-CoA, de etanol y de lactato. Entrada
de fructosa y galactosa. Gluconeognesis : reacciones. Ciclo de Cori: rendimiento de ATP del lactato.
15. Ciclo de Krebs
Ciclo de Krebs o de los cidos tricarboxlicos (TCA): reacciones, formacin de coenzimas reducida y ATP
a nivel de sustrato. Acoplamiento de las reacciones. Interaccin de los metabolismos de glcidos , lpidos
y proteinas. rendimiento de ATP en la oxidacin total de glucosa. Ciclo del glioxalato.
16. Fosforilacin oxidativa.
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Fosforilacin oxidativa. Ubicacin submitocondrial. Cadena Respiratoria Componentes. Niveles de
formacin de ATP. La hiptesis quimio-osmtica. Motores moleculares: ATPsintasa. Bioenergtica.
Regulacin de la fosforilacin oxidativa. Inhibidores.
17. Metabolismo de glcidos
Via de las pentosas-fosfato. Biosntesis del cido ascrbico. Degradacin intracelular del almidn y del
glucgeno: reacciones. Digestin. Interconversin de hexosas. Biosntesis del glucgeno, almidn y
celulosa: reacciones. Regulacin del metabolismo del glucgeno via AMPc. Biosntesis de disacridos.
18. Fotosntesis
Fotosntesis: ecuacin global. Ubicacin del proceso en el cloroplasto, pigmentos. Reaccin de Hill. Las
reacciones luminosas: fotosistemas I y II. Cadena transportadora de electrones. Formacin de ATP y
NADPH. Bioenergtica. Mecanismo de formacin de ATP. Reacciones enzimticas: ciclo de Calvin.
Eficiencia de la fotosntesis.
19. Metabolismo de lpidos
Biosntesis y degradacin de los triglicridos, glicerofosfolpidos y esfingolpidos. Biosntesis del colesterol
a partir de acetato. Formacin de colecalciferol y cidos biliares
Metabolismo de los cidos grasos, degradacin por -oxidacin de cidos grasos saturados de cadena
par e impar y de cidos grasos insaturados. Balance energtico.
y oxidacin. Ubicacin subcelular.
Biosntesis: sistema del citosol, reacciones. Sistemas microsomal y mitocondrial.
20. Metabolismo de amino cidos
Metabolismo de los aminocidos. Ciclo de fijacin del nitrgeno. Degradacin de los aminocidos:
reacciones de tipo general: desaminacin por transaminacin, desaminacin oxidativa, desaminacin no
oxidativa y descarboxilacin, ejemplos. Transporte del amonaco. Ciclo de la urea: reacciones. Los
aminocidos como precursores de otras biomolculas: metabolismo del triptofano, fenilalanina, tirosina,
histidina y glutamato. Glutatin. Porfirinas. Biosntesis del Hem. Hemoglobinas A, F y A2. Derivados de la
hemoglobina: oxihemoglobina, carboxihemoglobina, metahemoglobina y carbohemoglobina. Degradadcin
de la hemoglobina. Formacin de pigmentos biliares.
21. Metabolismo de cidos nucleicos
Sntesis de novo de pirimidinas. Biosntesis de bases pricas y desoxiribonucletidos. Sntesis de NAD+,
FAD, Coenzima A.
Uratos. Replicacin, recombinacin y reparacin del DNA, polimerasas,
topoisomerasas y helicasas. Fragmentos de Okazaki. Sntesis de DNA en eucariotas, ciclo celular,
telomerasa. Sntesis y maduracin del RNA. El ribosoma como estructura desupramolecular.
22. Metabolismo de protenas
Biosntesis de protenas. Codigo gentico: caractersticas. Formacin de aminoacil-ARNt. Mecanismo de
la sntesis de protenas: etapas de iniciacin, elongacin y terminacin. Modificaciones posttraduccionales. Antibiticos inhibidores. Endo y Exopeptidasas. Tipos de mutaciones.
23. Integracin metablica y control de la expresin gnica
Regulacin metablica. Control de la expresin gentica en procariotas. Oopern lac y opern trp:
induccin y represin. Control en eucariotas. Regulacin por modificacin de la actividad de la enzima:
activacin por precursor e inhibicin por producto final. Regulacin hormonal. Hormonas de mamferos:
bases moleculares del mecanismo de accin. Receptores de hormonas de estructura esteroide, peptdica
y derivada de aminocidos. Endocitocis y reciclo de los receptores. Hormonas vegetales y de insectos.
24. Inmunoqumica
Inmunoqumica. Induccin de anticuerpos especficos. La unin Ag-Ac. Heterogeneidad de los
anticuerpos. Estructura qumica de las inmunoglobulinas. Teoras sobre la formacin de anticuerpos.
25. Bioqumica de sistemas sensoriales
Olfato, gusto, visin, audicin y tacto, aspectos bioqumicos. Receptores y mecanismos de transduccin
de seales involucrados.
26. Motores moleculares
NTPasas de lazo P. Mecanismo de la contraccin muscular, asociacin cclica de la actina y miosina.
Microtbulos, tubulina, quinesina y dinena. Movimiento flagelar en bacterias, motor rotativo; quimiotaxis.
TRABAJOS PRACTICOS
TP 1: Espectrofotometra.
TP 2: Purificacin, cuantificacin y anlisis estructural de protenas
TP 3, 4 y 5. Cintica Enzimtica
TP 6: Fotosntesis.
TP 7: Mecanismos de transduccin de energa
BIBLIOGRAFIA
Bioqumica General
- Blanco, A. Qumica biolgica, Ed.El Ateneo, 2006.
- Bezkorovainy, A, Rafelson M.E. Concise Biochemistry. Ed. Marcel Dekker, New York, 1996*.
- Harper, H.A, Manual de Qumica Fisiolgica. Ed. El manual moderno 1980*
- Horton, R.H, Moran, L.A., Ochs, R.S., Rawn, J.D., Scrimgeour, K.G. Bioqumica. Ed.Pentice Hall,
Hispanoamericana, SA. Mexico, 1995, 1999*.
- Lehninger, Albert L.. Principios de bioqumica . 2Ed., Omega, Barcelona, 2001.
7
- Nelson, David L.. Lehninger : principios de bioqumica .3 Ed., Omega, Barcelona, 2001.
- Stryer L, Berg, JM y Tymoczko, JL. Bioqumica, 5 Ed., Revert SA, Espaa, 2003.
- Torres, H.M., Carminatti H. Y Cardini E. Bioqumica General. Ed. El Ateneo, Bs.As. 1983*.
- Voet D., Voet JG, Pratt C.W. Fundamentos de Bioqumica. La vida a nivel molecular, Ed. Mdica
Panamericana. 2006.
- Walker, J. M.. Biologa molecular y biotecnologa .2 Ed. Acribia, Zaragoza, 1997.
Problemas
- Esteban J.M. y Cavanillas J.M.. Problemas de Qumica. Ed. Alhambra. 4a. Espaa. 1976.
- Holme, David J. . Resolucin de problemas de bioqumica analtica, Acribia, Zaragoza, 1996.
- Segel I.J. Clculos en Bioqumica. Acribia. Saragoza. Espaa. 1972.
Bibliografa de consulta sobre temas especficos
Qumica General, Qumica Orgnica y Qumica-Fsica
- Atkins, P.N y M.J Clugston. Principios de Fisicoqumica. 1986. Addisson-Wesley. Ed. Iberoamericana.
Mxico.
- Atkins, P.W. Fisicoquimica. Ed. Addison-Wesley Iberoamericana, S.A. Wilmington, Delaware, USA.1991
- Brown, T. L., LeMay, H. E.
y Bursten, B.E.. Qumica, La Ciencia Central. Prentice-Hall
Hispanoamericana, S.A., Quinta Edicin. 1993.
- Morris, J.G. Fisicoqumica para bilogos. Ed. Revert. Barcelona. 2002.
- Whitten, W.K y K.D Gailey. Qumica General. Ed. Interamericana. Mxico. 1986.
Biofsica-Qumica y Biologa Celular
- Alberts, B. . Biologa molecular de la clula , 3 Ed., Omega, Barcelona, 1996-2002.
- De Robertis, E.M.F.. Biologa celular y molecular de Eduardo D. P. De Robertis .12 Ed., El Ateneo,
Buenos Aires, 1998.
- Estrada Cerqueda, C.. Cintica del transporte a travs de membranas, Ed. Blume, Madrid, 1976.
- Grigera, J.R. Introduccin a la biofsica del agua, Eudeba, Buenos Aires, 1976.
- Maggio B. Introduccin a la biofsico-qumica. Ed.Gonzalez Truccone. Crdoba, Argentina. 1987*.
- Vicente Crdoba, C.. Biofsica, Ed.Sntesis, Madrid, 1992
Cintica enzimtica
- Segel I.H.. Enzyme kinetics. Behavior and analysis of rapid equilibrium and steady-state enzyme
systems. Wiley Classics Library Editions. Wiley Intersci.Pub., New York. 1993*.
- Neilands J.B., Stumpf P.K., Principios de enzimologa. Ed Aguilar. 1967.
- Methods Enzimology ed. Colowick-Kaplan vol. XXXI
Fotosntesis
- Andreo C., Vallejos R. Fotosntesis. Serie Biologa, monografa no 30 OEA, 1984.
- Hall D.O., Rao K. Fotosntesis. Ed. Omega, Barcelona, 1977.
- Tribe M y Whitaker P. Cloroplastos y motocondrias. Ed.Omega, Barcelona, 1977.
Anlisis Bioqumico e Instrumental
- Gore M.G.. Spectrophotometry and Spectrofluorometry A practical Approach. Ed. Oxford University
Press. Inc. NY. USA. 2000.
- Henry RJ, Cannon D.C. y Winkelman J.W. Qumica Clnica: Bases y Tcnicas. Tomo I. 2a Ed. Jims.
Barcelona. Espaa.1980*.
- Willard H.H. Merritt Jr. .L, y Dean J.A.. Mtodos Instrumentales de Anlisis. Ed. CECSA. Mxico. 1974.
- Skoog D.A. y West D.M.. Anlisis Instrumental. Ed.Interamericana. Mxico. 1975.
- D'Ocon Navaza, Mara Carmen. Fundamentos y tcnicas de anlisis bioqumico, Paraninfo, Madrid,
1999.
Bibliografa especializada
- Aon M.A. and Cortassa S. Dynamic Biological Organization. Fundamentals As Applied To Cellular
Systems. Chapman and Hall, London, UK. 1997*.
- Daune, M.. Molecular Biophysics. Structures in motion, Oxford University Press, Oxford. 1999*.
- Makishima, Shoji. Pattern dynamics : a theory of self-organization, Ed. Kodansha Scientific, Tokio, 2001.
La bibliografa citada est disponible en la Biblioteca Ricardo Lutti" (Centro) de la FCEFyN, UNC.
* disponibles en la Ctedra de Qumica Biolgica.
CRONOGRAMA
CLASES TERICAS:
Finalizan: 26 de junio
TRABAJOS
PRCTICOS
Semana
CLASES TERICAS
Aulas 219 o 218
Mircoles
1215-1415 hs
Aula 219
Laboratorio 13
2o Semana
1o Semana
Comisiones Comisiones
1-3-5
2-4-6
TEMA
Viernes
10-12 hs
Aula 218
TEMA
11/03/09
La lgica molecular de la
vida
13/03/09
Metabolismo.
Evolucin Bioqumica
18/03/09
Protenas
20/03/09
Protenas
25/03/09
cidos nucleicos
27/03/09
Investigacin en
gentica
01/04/09
Investigacin en evolucin
/ Bioenergtica
03/04/09
Cintica Enzimtica
08/04/09
Cintica Enzimtica
10/04/09
Feriado
(Semana Santa)
15/04/09
Enzimologa
17/04/09
Glcidos / Lpidos
22/04/09
Biomembranas
24/04/09
Transporte
29/04/09
Transduccin de seales
01/05/09
06/05/09
Gliclisis
Gluconeognesis
Glucgenolisis
08/05/09
10
13/05/09
Ciclo de Krebs
Cadena Respiratoria
15/05/09
TP5
PRIMER EXAMEN
Cintica III y
PARCIAL
Seminario 1
11
20/05/09
Fotosntesis
22/05/09
Fotosntesis / Ciclo de
Calvin
12
27/05/09
Metabolismo de lpidos
29/05/09
Metabolismo de
lpidos
13
03/06/09
Metabolismo de
aminocidos/ Biosntesis
de Nucletidos
05/06/09
Biosntesis de cidos
nucleicos
12/06/09
Regulacin de la
expresion gnica
19/06/09
Bioqumica de
sistemas sensoriales
14
10/06/09
Biosntesis de protenas
15
17/06/09
Integracin metablica /
Inmunoqumica
16
24/06/09
01/07/09
SEGUNDO EXAMEN
PARCIAL
Recuperatorio
Ex.Parciales
26/06/09
Feriado (Da de
Trabajador)
Interconversin de
hexosas; Va de las
pentosas
Recuperatorio TP
y FIRMA REGULARIDAD
TP 1
Espectrofoto
metra
TP 1*
Espectrofoto
metra
TP 2*
Protenas
TP2
Protenas *
TP3
Cintica I
TP3
Cintica I
TP4
Cintica II *
TP4
Cintica II
TP5
Cintica III y
Seminario 1
TP6
Fotosntesis
TP6
Fotosntesis
TP7
Transduccin
de energa y
Seminario 2
TP7
Transduccin
de energa y
Seminario 2
TRABAJOS PRCTICOS
Concurrir con guardapolvo, gafas, guantes, calzado adecuado (cerrado) y cabello recogido.
No podr realizar el TP aquel alumno que concurra sin estos elementos mnimos de seguridad personal.
ASISTENCIA:
Clases Tericas: no obligatoria
Trabajos Prcticos: 80% obligatoria
ACTIVIDADES
Clases tericas: Exposicin.
Discusin de problemas tericos.
Trabajos prcticos:
Resolucin de problemas.
Trabajos de laboratorio.
Seminarios de discusin de trabajos cientficos.
EVALUACIONES
I. Trabajos Prcticos:
a) Evaluacin oral durante el desarrollo del TP. Se tendr en cuenta: desempeo, destreza, atencin, participacin,
puntualidad, y la presentacin de Trabajos Cientficos (cuando corresponda).
b) Una evaluacin escrita al final de cada TP. El resultado de la evaluacin estar disponible en el TP siguiente.
II Exmenes Parciales:
Se tomarn 2 (dos) exmenes parciales sobre temas desarrollados en clases tericas y prcticas.
Los alumnos debern inscribirse para rendir estos parciales durante la semana previa al parcial (al final de las clases
tericas). La inscripcin no es personal.
CONDICIONES PARA LA REGULARIZACIN
Desempearse satisfactoriamente durante los TP (item a) y aprobar el 80% de los TP (6 de las 7 evaluaciones escritas
de los Trabajos Prcticos (item b). Las evaluaciones de los TP se aprueban con el 60% de las respuetas correctas o
alcanzando el 60% de los contenidos de TP.
CONDICIONES PARA LA PROMOCIN:
Correlativas Aprobadas (al comenzar el cursado): Qumica Orgnica y Fsica I
Aprobar el 80% de los TP
Alcanzar un promedio de 7 puntos entre ambos Exmenes.Parciales, con una nota no inferior a 4 puntos.
RECUPERATORIOS (al final del cuatrimestre)
Se podr recuperar:
- Un TP que haya resultado reprobado, para alcanzar las condiciones indicadas ms arriba.
En caso de inasistencia, podr recuperarse el TP, slo por causa debidamente justificada, en alguna Comisin donde
el mismo an no se hubiera dictado. En el caso de inasistencias no habr recuperatorio al final del cuatrimestre..
- Un examen parcial (por cualquier razn: inasistencia, reprobado o para aumentar nota).
FIRMA DE REGULARIDADES
Se realizar el mismo da y horario del recuperatorio de TP. La firma de libretas se realiz unicamente ese dia.
El trmite no es personal.
10
Pg.
11
11
12
14
14
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TEMAS
1. ORGANIZACIN DEL TRABAJO
La organizacin del laboratorio, debe ser estudiada a fondo y procurar que sea adecuada para
el mantenimiento de un buen nivel preventivo.
No debe trabajar nunca una persona sola en el laboratorio fuera de horas habituales, por la
noche o en operaciones con riesgo.
Cuando se realicen operaciones con riesgo, incluso las personas que no intervengan en ellas
deben estar informadas de las mismas.
Deber trabajarse en las campanas extractoras siempre que se manipulen productos txicos,
inflamables y/o que se desprendan en el proceso. En stas deber comprobarse
peridicamente el funcionamiento del extractor, su estado general, el cumplimiento de los
caudales mnimos de aspiracin, que su uso sea el adecuado, etc.
La programacin de trabajos con productos qumicos, deber ir acompaada de la adopcin de
medidas preventivas que se requiera en cada caso.
Deber comprobarse la ventilacin general del laboratorio.
Los reactivos almacenados en el laboratorio deben preservarse del sol, no guardarse en
estanteras altas, cuidar su etiquetado y mantenerlos en las cantidades imprescindibles. No
deber haber botellas con lquidos inflamables, incluso las botellas empezadas o los reactivos
preparados con mezclas de productos inflamables. Ha de controlarse que las botellas una vez
utilizadas, se cierren correctamente.
Est prohibido fumar, beber y comer en los laboratorios.
Los envases para recuperar se enjuagarn y colocarn, sin taponar, para el posterior proceso
de lavado.
No se permitir la presencia de personas no autorizadas y debidamente informadas de los
riesgos inherentes en el laboratorio.
2. HABITOS PERSONALES
Mantener en todo momento guardapolvos, camisas y vestidos abrochados.
No abandonar objetos personales en mesas de trabajo o poyatas.
No comer o beber en los laboratorios.
No guardar alimentos ni bebidas en las heladeras del laboratorio.
No fumar en los laboratorios.
Llevar recogidos los cabellos.
No llevar pulseras, anillos, colgantes o mangas anchas que pudieran engancharse en
los montajes.
Los guardapolvos no debern llevarse a lugares de asistencia comn como son las bibliotecas,
cafeteras, salas de reuniones, comedores etc.
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No es aconsejable guardar la ropa de calle en la mesada del laboratorios, para lo cual deber
disponerse de armarios o lugares especficos fuera del rea de trabajo.
Es recomendable usar gafas de seguridad cuando se manipule con productos qumicos
lquidos de cualquier tipo en ebullicin.
Si la naturaleza del trabajo lo requiere, el personal del laboratorio deber utilizar los medios de
proteccin adecuados.
No utilizar lentes de contacto en el laboratorio, ya que en caso de accidentes por salpicaduras
de productos qumicos o sus vapores, al pasar por detrs de las lentes, podran provocar
lesiones en el ojo antes de retirarlas. En estos casos se recomienda el uso de gafas graduadas.
Si un producto qumico salpica a los ojos, utilizar inmediatamente un lavaojos y lavarlos durante
15 minutos sin interrupcin. Actuar con urgencia en menos de 10 segundos. No dirigir una
corriente de alta presin directamente al ojo porque podria lesionarse. Es necesario mantener
los ojos abiertos con ayuda de los dedos para el lavado debajo de los prpados.
Lavarse las manos: antes de abandonar el laboratorio, siempre que se quiten los guantes
protectores y despus de toda operacin que haya comportado el posible contacto con material
irritante, custico, txico o infeccioso.
Para secarse las manos, en vez de toallas es preferible el uso de papel desechable o
secadores de aire.
La persona que al trmino de la jornada sea la ltima en abandonar el laboratorio deber
asegurarse que los procesos que no queden en funcionamiento, las conducciones de agua y
gas estn cortadas, la energa elctrica desconectada y que el local se encuentra en un estado
que excluya el riesgo de incendio.
3. MANIPULACIN EN LOS LABORATORIOS
Laboratorios con riesgo qumico
Toda persona que manipule un producto qumico, deber tener conocimiento de sus
caractersticas fsico-qumicas y toxicolgicas.
Debern conocerse, como mnimo, las frases de riesgo y seguridad (R y S ) de los productos.
Como norma general, cualquier manipulacin de una sustancia qumica deber realizarse
dentro de las vitrinas de laboratorio.
No llenar los tubos de ensayo ms de la mitad de su volumen total.
Calentar los tubos de ensayo de lado y utilizando las pinzas.
Utilizar en todo momento gradillas y soportes.
Tomar los tubos de ensayo con los dedos, nunca con las manos.
No llevar tubos de ensayo ni productos en los bolsillos.
No calentar nunca un recipiente totalmente cerrado. Cuando se caliente, dirigir siempre la
abertura en direccin contraria a uno mismo y a las dems personas cercanas.
Transportar los productos en bandejas o recipientes para evitar derrames en caso de
roturas.
No oler productos qumicos si no se est debidamente informado .
No tocar con las manos ni probar los productos qumicos.
En caso de producirse una contaminacin se limpiar la zona y no podr utilizarse
hasta tener seguridad de su descontaminacin utilizando los productos adecuados en cada
caso y que deben conocerse previamente.
No tocarse ninguna parte del cuerpo, material o instrumental con los guantes contaminados. En
el caso de que esta circunstancia hubiera ocurrido, limpiar con los productos adecuados y
eliminar los elementos utilizados en la limpieza, como residuos txicos.
No efectuar pipeteos con la boca. Se realizar con peras de goma para pipetas o pipetas de
seguridad.
No trabajar separado de la mesa.
Para el encendido de mecheros, utilizar encendedores piezoelectricos; no emplear fsforos
ni encendedores de bolsillo.
Los mecheros no debern dejarse encendidos sin vigilancia.
Asegurarse del enfriamiento de los materiales antes de aplicar directamente las manos
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para tomarlos.
Al finalizar una tarea u operacin, recoger materiales, reactivos, equipos, etc, evitando las
acumulaciones innecesarias y dejando la zona de trabajo en las debidas condiciones de
limpieza.
Al terminar el trabajo, asegurarse de la desconexin de los aparatos, agua, gases, etc.
Emplear y almacenar sustancias inflamables en las cantidades imprescindibles.
Deber ponerse especial cuidado en cerrar botellas y frascos inmediatamente despus de
su utilizacin.
No transportar frascos o recipientes tomados por la tapa o tapn.
Siempre que sea posible se trabajar en bandejas con el fin de confinar un posible
derrame. Ser muy conveniente forrar con papel de filtro dichas bandejas.
Siempre que sea necesario, debern utilizarse guantes especficos para los productos que
se manipulan.
Los guantes y todo material contaminado con productos txicos y /o infecciosos debern
descontaminarse y/o esterilizarse antes de ser eliminados. Cuando no se utilicen guantes en la
manipulacin de sustancias qumicas, las manos debern lavarse frecuentemente. Al finalizar la
sesin de trabajo, es aconsejable un lavado cuidadoso antes de abandonar el laboratorio.
Las puertas de los laboratorios debern permanecer cerradas durante la jornada de trabajo.
Deber mantenerse la limpieza y el orden en los laboratorios en todo momento.
Debern mantenerse libres los espacios de trabajo, as como las zonas de paso y salida de los
recintos.
No utilizar nunca un equipo o aparato sin conocer perfectamente su funcionamiento.
Antes de comenzar un experimento asegurarse de que los montajes y aparatos estn en
perfectas condiciones de uso. Ante cualquier mnima duda consultar con el responsable del
trabajo.
Los trapos o materiales ensuciados con aceite o sustancias inflamables debern colocarse en
recipientes cerrados que debern vaciarse diariamente y su contenido ser neutralizado.
Las instalaciones, aparatos e instrumentos destinados a reparacin, debern enviarse limpios,
sin trazas de sustancias qumicas nocivas.
Antes de utilizar sustancias inflamables deberemos asegurarnos de que no hay cerca
mecheros encendidos, calentadores etc.
No debe dejarse sin vigilancia ningn tipo de reaccin qumica.
Al finalizar un experimento los productos debern etiquetarse y colocarse en lugar seguro.
Las sustancias cuya disolucin sea exotrmica, debern disolverse por porciones, agitando y
enfriando continuamente.
Durante la destilacin de sustancias inflamables de bajo punto de ebullicin, deber controlarse
la llegada de agua al refrigerante y alejar del aparato cualquier otra materia inflamable.
Cuando se derrame alguna sustancia combustible se proceder a:
- Apagar el mechero, si ha lugar.
- Cortar la corriente elctrica en el exterior del laboratorio.
- Asegurar una ventilacin eficaz.
- Se absorber el lquido con un cuerpo poroso que posteriormente se depositar en
un lugar sin peligro.
- Se eliminar como residuo txico.
Las sustancias qumicas debern estar colocadas en recipientes con materiales adecuados y
etiquetados debidamente. Los recipientes debern estar cerrados.
Los recipientes que contengan lquidos debern estar protegidos contra la accin directa de los
rayos solares o contra el calentamiento.
Los metales alcalinos como sodio o potasio debern conservarse con una capa protectora de
un solvente con un punto de ebullicin elevado (petrleo, aceite de parafina) y el fsforo blanco
con una capa de agua.
Los productos incompatibles debern guardarse separadamente.
Los recipientes que contengan productos agresivos no debern almacenarse a una altura
superior a sesenta y cinco cm. Y sern recipientes de pequea capacidad para su fcil manejo.
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4. MEDIOS DE PROTECCIN
El trabajo en laboratorios requiere la utilizacin de guardapolvos, que en trabajos con riesgo
deber considerarse el tejido de los mismos.
Los guardapolvos debern tener los puos ajustados a las muecas. Asimismo, debern estar
cerrados en la parte delantera y en el cuello.
Tener siempre a disposicin las gafas de seguridad. Es recomendable el uso permanente de
las mismas. Estas sern de uso personal.
Utilizar los guantes adecuados para cada tarea que requiera el uso de tales prendas.
Conocer la proteccin brindada por los distintos equipos de proteccin individual para las
vas respiratorias.
Conocer la aplicacin de los productos de primeros auxilios del botiqun y los
mecanismos para recibir posibles ayudas exteriores.
Mantener en condiciones de uso las duchas de emergencia y lavaojos.
Conocer y ensayar el funcionamiento de equipos extintores.
5. ACTUACIN EN CASO DE ACCIDENTES
5.1 Derrames
. Lquidos inflamables
Absorber con carbn activado productos especficos.
Alejar cualquier foco de calor.
. cidos
Neutralizar con bicarbonato o emplear productos especficos comercializados para su
neutralizacin o absorcin.
Si por casualidad se ha producido un derrame sobre la piel, el remedio inmediato sera exponer
la zona afectada al chorro de agua del grifo durante cinco o diez minutos.
Las duchas de emergencia sern utilizadas en los casos en que la zona afectada del cuerpo sea
grande. Es necesario quitar la ropa contaminada de la persona afectada mientras est bajo la
ducha. Si se produjesen quemaduras se precisar la asistencia mdica.
No utilizar cremas ni pomadas grasas en las quemaduras graves.
.Bases
Emplear productos especficos comercializados para su neutralizacin y absorcin.
.Otros lquidos no corrosivos ni inflamables
Absorber con aserrn.
5.2. Salpicaduras.
En piel y ojos
Deben lavarse con abundante agua (si es en los ojos, mediante un lavaojos).
No intentar neutralizar. Acudir al mdico con prontitud.
En la ropa
Debe quitarse rpidamente la ropa, lavndola , o colocarse bajo la ducha, segn la magnitud de
la impregnacin.
Si hay contacto con la piel, lavar la zona afectada y acudir al mdico.
5.3. Cortes
Se debern lavar con abundante agua corriente durante diez minutos como mnimo. Si son
pequeos y dejan de sangrar en poco tiempo, Lavar con agua y jabn y taparlos con una venda
o apsito adecuados. Si son grandes y no dejan de sangrar, se requiere asistencia mdica
inmediata.
5.4. Ingestin
Si es un cido o una base. Beber abundante agua, salvo que la sustancia ingerida reaccione con
ella.
No provocar el vmito, salvo indicacin expresa.
14
44666666
BOMBEROS
100
4686868
SEGURIDAD INTERNA
ART
Taxi
EMI 4149093
0-800-8880200
4650303
15
Nombre y Apellido: ..
DNI: .
N de Matrcula:
Firma: ..
16
17
TRABAJO PRACTICO N 1
ESPECTROFOTOMETRA
Los problemas y la gua de estudio debern ser resueltos por los alumnos antes de concurrir a la clase. En
caso de necesitar aclarar dudas los docentes estrn disponibles en sus horarios de consulta, en la ctedra.
Los alumnos sern evaluados al final del TP (evaluacin escrita) y durante el desarrollo de la experiencia
prctica (evaluacin oral), sobre los contenidos que se encuentran en la gua de TP.
Debern concurrir con guardapolvo, gafas, guantes, cabello recogido y calzado cerrado.
OBJETIVOS:
- Conocer los fundamentos tericos y las aplicaciones de la espectrofotometra.
- Comprender las propiedades que deben reunir los mtodos experimentales de anlisis.
- Adquirir destreza en el manejo del espectrofotmetro.
- Valorar la importancia del dominio de tcnicas auxiliares para poderlas aplicar con criterio ante los problemas
planteados.
Disoluciones.
Estequiometra.
Luz. Teora ondulatoria. Teora cuntica.
Ondas electromagnticas. longitud, frecuencia,
perodo de una onda y unidades en que se miden.
Relacin entre velocidad, longitud de onda y
frecuencia. Energa de ondas electromagnticas.
18
estadsticos. Dada una cantidad de datos el analista puede estimar la incertidumbre introducida por
errores aleatoreos y concluir con respecto al efecto de esos errores en un resultado analtico.
ESPECTROFOTOMETRA
La espectrofotometra es una tcnica que permite medir la absorcin de radiacin electromagntica,
ultravioleta y visible de numerosas especies qumicas inorgnicas y orgnicas, para su anlisis cuali y
cuantitativo.
Las molculas son capaces de absorber radiaciones electromagnticas. Tanto la longitud de onda de la
radiacin absorbida como la eficiencia con que se absorbe, dependen de:
la estructura de la molcula y
el medio en que se halla.
En el proceso de absorcin de la radiacin, un fotn incidente cede su energa a una molcula, lo que da
lugar a la excitacin de la misma que pasa a un nivel de energa superior:
h.
A
A*
A = molcula absorbente
A* = molecula absorbente en estado de excitacin energtica.
h. = energa de un fotn
donde h= Constante de Planck y : frecuencia de radiacin.
Los estados excitados de los tomos o molculas son de vida media corta (10-9 s) y, en
consecuencia, la molcula en estado excitado vuelve rpidamente al estado fundamental. Comunmente,
la energa es liberada al medio como calor, pero en ciertos casos la especie qumica excitada puede sufrir
un cambio (reaccin fotoqumica) o emitir parte de la energa absorbida como radiacin electromagntica
de longitud de onda mayor a la incidente (fluorescencia o fosforescencia).
LEYES DE LA ABSORCION
Cuando la luz atraviesa una muestra, slo una fraccin de ella es transmitida. La proporcin de luz
transmitida se denomina Transmitancia (T) y se calcula de la siguiente manera:
T = I / I0
Donde I = la intensidad de luz transmitida por la muestra
I0 = la intensidad de luz incidente
La transmitancia toma valores entre 0 1. Tambin se expresa como porcentaje si se multiplica por 100 y
sus valores estn en el rango de 0-100%:
%T = (I / I0 ) x 100
La relacin (I / I0 ), tambin puede ser expresada como luz absorbida en lugar de luz transmitida. En ese
caso nos referimos a la Absorbancia (A) de una muestra.
La Absorbancia es adimensional, vara en el rango de 0 - y se define como:
A = log 1/T = log10 (I0 / I)
19
Por sustitucin se comprueba que la absorbancia y el porcentaje de transmitancia estn relacionados
mediante la siguiente expresin:
A = log (100 / %T)
A = 2 - log( % T)
LEY DE LAMBERT:
La fraccin de luz absorbida por un medio transparente es independiente de la intensidad
de luz incidente, y cada capa sucesiva del medio, absorbe una fraccin igual de la luz que pasa a travez
de l.
Esto lleva a un decaimiento exponencial de la intensidad de luz a lo largo del paso ptico
en la muestra, que puede ser expresado matemticamente como sigue:
Log10 (I0/I) = A = K b
Donde b = la longitud del paso ptico de la cubeta de espectrofotometra y K es una constante del medio,
que fue descifrada por Beer.
LEY DE BEER:
La cantidad de luz absorbida es proporcional al nmero de molculas de cromforo que la
luz atraviesa.
La constante K, es proporcional a la concentracin de cromforo (c) : K = a c , donde a es
la absortividad o coeficiente de absorcin, una propiedad del cromforo en s misma.
La absortividad a es una constante que depende de:
la longitud de onda de la luz incidente,
la identidad de la sustancia analizada y
del medio en que sta se encuentre (pH, solvente e interaccin con otras sustancias)
La constante a representa la probabilidad de absorcin a una longitud de onda determinada
La LEY DE LAMBERT Y BEER queda resumida entonces, en la expresin:
Log10 (I0/I) = a c b
A=acb
Cuando el paso ptico est expresado en cm y la concentracin en M, la absortividad se denomina
-1
-1
coeficiente de extincin molar o absortividad molar (), entonces sus unidades son M cm .
Cuando b=1 cm, la absorbancia se denomina Densidad ptica (DO)
At=a.b.ct
Dado que el problema y el testigo son disoluciones de una misma sustancia cuyos valores de
absorbancia se determinan a la misma , los valores de absortividad sern iguales. Adems, dado que se
utiliza la misma cubeta para medir la A, los valores de b tambin sern iguales.
En consecuencia:
Dividiendo m.a.m.
a.b.cp
Ap/ At = __________
a.b.ct
20
Ap.ct
podemos simplificar a y b, y al despejar queda:
cp=
At
CURVA DE CALIBRACIN
Una curva de calibracin es un grfico de A o %T en funcin de la concentracin de soluto; su
empleo es necesario en los trabajos cuantitativos en los que hay que calcular la concentracin del
absorbente. En general se grafica A en funcin de la concentracin (Fig.1a) pero, hay instrumentos que
slo miden %T (Fig.1b). En ste caso, deben transformarse las lecturas de %T en valores de A, mediante
el empleo de la ecuacin A = 2 - log( % T).
Alternativamente, puede trazarse el grfico de %T en funcin de la concentracin en papel
semilogartmico (Fig.1c). De otro modo, resultara difcil utilizando un nmero limitado de puntos obtenidos
experimentalmente, comprobar grficamente si la lectura sigue o no la ley de Lambert y Beer .
Papel semilogartmico
b
%T
Concentracin (mg/ml)
%T
Concentracin (mg/ml)
Concentracin (mg/ml)
ESPECTRO DE ABSORCIN
Las soluciones absorben energa preferentemente en una ms regiones del espectro
electromagntico, siendo la absorcin inferior o nula en las dems regiones. Se denomina Espectro de
absorcin a la representacin grfica de la probabilidad de absorcin en funcin de la longitud de onda.
El espectro de absorcin se determina midiendo la absorbancia a distintas longitudes de onda para
establecer la longitud de onda de mxima absorcin ( max).
En el siguiente ejemplo, la max es aproximadamente 420nm (indicada por la fecha).
21
0.20
Absorbancia
0.15
0.10
0.05
0.00
300
max
350
400
450
500
ESPECTROFOTMETRO
Las mediciones de absorbancia se realizan en un espectrofotmetro, que bsicamente consta
de una fuente de luz, un monocromador para seleccionar la longitud de onda, una cubeta transparente
para contener la muestra, un detector de intensidad luminosa y un sistema de registro (Fig. 3).
Sistema de
Registro
MEDICION DE LA ABSORBANCIA
1) Si tenemos una solucin coloreada de concentracin desconocida, la denominamos tubo problema.
Podemos conocer su concentracin midiendo la absorbancia en el fotocolormetro o espectrofotmetro a
una longitud de onda apropiada.
2) Previamente a la lectura, el aparato es llevado a cero de absorbancia con un tubo que contiene
solvente sin la sustancia problema y se denomina blanco. Este tubo puede contener varias sustancias,
adems de disolvente, a la misma concentracin en que se encuentra en el tubo problema, excepto la
sustancia que se desea cuantificar. Por ej. si la sustancia coloreada problema se encuentra disuelta en
agua conteniendo NaCl al 1% e KOH al 2%, el tubo blanco contendr NaCl al 1% e KOH al 2% en agua,
sin la sustancia en estudio. La finalidad de usar el tubo blanco es descontar la absorcin de sustancias
que no sean especficamente la sustancia problema y as poder medir la absorbancia propia de la
sustancia en estudio.
3) Un tercer tubo que denominamos testigo corresponde a una solucin de concentracin conocida de la
sustancia en estudio. Se prepara disolviendo una cantidad conocida de soluto en un volumen conocido de
solvente conteniendo las mismas sustancias que la solucin problema: por ej. NaCl al 1% e KOH al 2%
para el caso que se est analizando. Se lee al espectrofotmetro, llevado previamente a cero de
22
absorbancia con el blanco, de la misma forma que se hizo con el tubo problema. Finalmente, la
concentracin del tubo problema se puede calcular mediante la interpolacin del valor de absorbancia en
una curva de calibracin (para lo cual es necesario la preparacin de varios tubos testigos) o mediante la
comparacin con un testigo.
4) Lo descripto en los puntos anteriores es vlido para medir la concentracin de sustancias incoloras
siempre que estas sustancias sean capaces de reaccionar con otras, dando productos de reaccin
coloreados y que el color finalmente obtenido sea proporcional a la concentracin de la sustancia en
estudio. El tubo blanco, el cual no contiene la sustancia que desarrolla color, deber ser tratado de forma
similar al tubo problema y a los testigos, es decir tendr los mismos reactivos y se los procesar de forma
similar y paralela a los otros tubos. Hay sustancias incoloras que tienen la propiedad de absorber la luz
ultravioleta; en estos casos pueden ser cuantificadas sin tratamiento previo, midiendo la absorbancia a
una comprendida entre 200 y 400 nm (correspondiente al rango de luz ultravioleta).
GUIA DE ESTUDIO
1. Observe el esquema del espectro electromagntico de la Fig.4 y compare c (velocidad), (longitud de
onda), (frecuencia) y energa de la radiacin electromagntica indicada.
2. Defina luz blanca y luz monocromtica.
3. Qu tipos de monocromadores conoce ?
4. Qu efecto produce la absorcin de la luz por una molcula?
5. Existe alguna restriccin con respecto a la longitud de onda de la luz que una sustancia puede
absorber?
6. Cul es la utilidad de un espectro de absorcin?
7. Concepto de ley de Lambert y Beer.
8. Definicin de absorbancia y transmitancia.
9. Cmo se preparan y qu utilidad tienen los tubos blanco, testigo y problema?
10. Cmo construye y qu utilidad tiene una curva de calibracin ?
11. Cmo elige la longitud de onda de trabajo?
12. Cul es el fundamento qumico del mtodo de Biuret para cuantificar protenas?
Color
(m)
x 10
Violeta
3.90 4.55
7.69 6.59
Azul
4.55 4.92
6.59 6.10
Verde
4.92 - 5.77
5.77 5.97
6.10 5.70
5.70 5.03
5.97 6.22
5.03 4.82
6.22 7.80
4.82 3.84
Amarillo
Naranja
Rojo
23
(Hz) x 10-17
E = h.
E=
h.c
PROBLEMAS
1- Una disolucin de protenas de concentracin desconocida, se diluye 5 veces con agua destilada. A
partir de esta dilucin, se vuelve a diluir 3 veces con agua destilada. Esta ltima dilucin di por mtodo
Biuret una absorbancia de 0,12 (testigo de concentracin = 4 mg/ml, di 0,25 de absorbancia).Cul es
la concentracin de la solucin original de protenas? R = 28,8 mg/ml.
2- Una solucin de protenas de concentracin desconocida, di por mtodo de Biuret una A = 0,09
(testigo de concentracin 4mg/ml di A = 0,25 ).De dicha solucin se desea tomar 100 ug. Qu
volumen de dicha solucin se debe pipetear? R = 69 l.
3- Interprete el significado de las sig. curvas de calibracin para la cuantificacin de protenas por el
mtodo de Biuret. Cul de ellas corresponde a un esquema de trabajo correcto?
2
1
Absorbancia
Concentracin (mg/ml)
4- Los datos de la Tabla 1 corresponden a absorbancias de una solucin de flunitrazepam 25 M en etanol 3% V/V y
en tris HCL 50 mM, pH 7,4 medidos a diferentes longitudes de onda:
210
220
250
260
270
280
290
320
330
340
350
360
370
0.2
0.604
0.446
0.407
0.320
0.286
0.272
0.250
0.190
0.120
0.070
0.040
0.020
24
Blanco
NaCl 1M
Testigo
Problema
1ml
ADN 100g/ml
1 ml
en Nacl 1M
ADN [ ] desc en
NaCl 1M
difenilamina
2ml
Volumen final
b) 0,2%
c) 0,8%
d) 1,52%
e) 68%.
7- Calcule el coeficiente de extincin molar del p-nitrofenol si A = 0,2 y la concentracin es 11.428 oles/l,
= 410 nm y b = 1 cm. R = 17.500
8- Se cuantific una solucin de tirosina por absorcin al UV. Esta solucin dio A = 0,16 ; calcule la
concentracin nM de tirosina considerando que dicha solucin haba sido diluida primero 3 veces y
luego 2 veces ms. = 14.000 l.mol-1 . cm-1 , = 274 nm. R = 6,85.10-5 M.
9- Una solucin de una sustancia de PM 600 a una concentracin de 40 g/ml tiene A = 0,3 a 540 nm,
medida en una cubeta de 1 cm de paso ptico. Calcule el coeficiente de extincin molar. R = 4.500
10- Una solucin contiene dos flavonoides : flavonoide 1 (F1) y flavonoide 2 (F2). Se quiere cuantificar
ambos sin una purificacin previa. Analizando la Fig. 6 se observa que entre 220 nm y 420 nm sus
espectros se superponen, por lo tanto la cuantificacin de cualquiera de ellos interfiere con la del otro.
A longitudes de onda superiores a 420 nm slo absorbe F1. Calcule la concentracin molar de F1 y
F2 en sa solucin sabiendo que:
Testigo de F1
Absorbancia
F1
Testigo de F2
c1 = 15 M
c2 = 15 M
A350 = 0,105
A350 = 0,195
A450 = 0,293
F2
c2 = ?
A350 = 0,25
A450= 0,3
Respuesta:
0
250
300
350
400
450 500
-5
concentracin de F1=1,54.10 M.
concentracin de F2=1,09.10-5 M.
25
EJERCITACION ADICIONAL
1- Calcule el nmero de moles, micromoles y milimoles que hay en 2g de Na(OH) (PM=40).
2- Qu cantidad de glucosa (PM=180) tiene que pesar para preparar 200 ml de una solucin 0,05 M?
R = 1,8 g.
3- Qu volumen de una solucin 10 mM se puede preparar con 1 g de glucosa (PM=180). R = 555,6 ml.
4- Si tiene 3 litros de una solucin de Na(OH) 0,5 M, Cuntos moles y que concentracin molar poseen
los siguientes volmenes: a) 50 ml; b) 0,25 ml; c) 1 litro.
R: a) 0.025 moles, 0.5 M; b) 1.25 x 10-4 moles, 0.5 M; c) 0.5 moles, 0.5 M
5- Qu molaridad tiene una solucin que contiene 60 gr de NA(OH) (PM=40) por litro? R: 1.5 M.
6- Qu cantidad de NA(OH) (PM=40) estan contenidos en 3 litros de una solucin 2.5 M ? R: 300gr.
7- Una solucin de cido sulfrico al 98% P/P, cuya densidad es 1.8 g/cm3, qu molaridad tiene? R: 18
M.
8- Cul ser la molaridad de una solucin de cido clorhdrico (PM=36.5) al 37% P/P cuya densidad es
1.19 g/cm3?. R: 12 M
9- Cmo procedera para preparar 2 litros de una solucin de ClK 10 mM a partir de una solucin 3 M ?
R: tomar 6.67 ml (3 M). colocarlos en un matraz de 2 litros enrasar con agua destilada.
10-Se quieren preparar 6 litros de una solucin 0.25 M de cido sulfrico a partir de una solucin 63% P/P
3
(densidad=1.7 g/cm ). Qu volumen debe tomar?. R: 137,28 ml.
11-Los siguientes son los resultados de la cuantificacin de H2SO4 en una misma muestra realizado por
un mtodo "A" por cuatro analistas diferentes:
a- 50,00 % P/P, densidad= 1,3952 g/ml
b- 70,00 % P/V
c- 7,00 M
d- 7100 mM
De acuerdo al enunciado anterior diga:
a-Cmo procede para comparar los resultados anteriores?
b-Que puede decir acerca de la precisin del mtodo empleado en la cuantificacin?
DATOS: PM H2SO4 = 98,08
12-Se desea investigar los efectos de flunitrazepam sobre el comportamiento de ratas en situacin de
"stress". Para ello cuenta con dos lotes de cinco ratas de 300 g cada una. El lote N1 (experimental) es
inyectado con una solucin de flunitrazepam 67M en cloruro de sodio 0,8775 % P/V (solucin
fisiolgica).
a) Cmo procede para preparar 100 ml de dicha solucin ?
b) Cul es la utilidad del segundo lote de ratas? Con qu inyecta esas ratas? Cmo prepara esa
solucin?
c) Si la dosis de flunitrazepam cuyo efecto se desea investigar es 70 g/kg de peso corporal, qu
volumen debe inyectar a cada animal?.
DATOS: flunitrazepam = droga slida , PMflunitrazepam = 313,3 PACl = 35,5 PANa = 23
13-
26
con un espectrofotmetro? Estos espectros fueron obtenidos con un espectrofotmetro o con un
fotocolormetro? Podria obtener un espectro como el B si slo dispusiera de un fotocolormetro para
analizar su muestra?
Absorbancia
0.4
0.3
B
A
0.2
0.1
0.0
300
450
600
750
14- La siguiente tabla corresponde a absorbancias de soluciones estndares de albmina srica bobina:
[Albmina] (Mx103)
0.2
0.033
0.5
0.081
1.25
0.195
3.12
0.440
7.81
0.703
15- Se desea investigar el contenido de glucosa en sangre despus de la administracin por va oral de
0,5 g de dicho compuesto. Se trabaj con un grupo de 20 ratas de 2 meses de edad, peso promedio
300 g. Se tomaron muestras de sangre a 0, 30, 45, 60, 90 y 120 minutos despus de la ingestin y se
determin en suero la cantidad de glucosa por un mtodo fotocolorimtrico, expres como el valor
promedio en mg % P/V de glucosa en sangre. (Tabla 4). En otro experimento se tom otro grupo de
20 ratas con las mismas caractersticas y sometidas al mismo tratamiento que las anteriores. Una
hora antes del experimento fueron inyectadas por va endovenosa con 200 l de una solucin 20 M
de Glucagn (el glucagn es una hormona pancretica que incrementa el nivel de glucosa por la
estimulacin de la degradacin de glucgeno en higado) (Tabla 5).
a) Identifique para cada experimento la variable dependiente y la independiente. J.S.R
b) Grafique los resultados y coloque ttulo a los mismos.
c) Indique la ecuacin matemtica a la que se ajustan los datos.
TABLA 4
mg % p/v glu/sangre
TABLA 5
tiempo min
mg % p/v glu/sangre
tiempo min
70
140
105
30
175
30
122
45
195
45
140
60
210
60
175
90
260
90
210
120
290
120
27
PARTE PRACTICA
CUANTIFICACIN DE ALBMINA POR EL MTODO DE BIURET
FUNDAMENTO DEL MTODO DE BIURET (Gornall, A.G et al., 1949, J. Biol. Chem., 177-766):
Las sustancias que contienen dos -CONH2 ; -CH2NH2; -C(NH)(NH2); o -CSNH2, unidos, sea
directamente entre s, o a travs de un tomo de carbono o nitrgeno; y las estructuras peptdicas que
contengan como mnimo dos enlaces peptdicos, en presencia de Cu++y en solucin alcalina, forma un
complejo de color violeta, el complejo de Biuret.
O
NH
RC H
O
C
NH
RC H
HN
Cu2+
H CR
C
HN
H CR
Violeta-prpura
Complejo protena-Cu(II)
El nombre de la reaccin procede del compuesto coloreado llamado Biuret que se forma cuando
se calienta la urea a una temperatura de unos 180C, en presencia de Cu++y en medio alcalino.
NH2
O
180 C
NH2
UREA
2+
NH
O
C
NH
NH2
NH2
NH2
C
NH2
+ NH2
NH2
Cu
NH2
C
NH
BIURET
O
NH2
Cu2+
NH2
O
HN
HN
NH2
NH2
Complejo Cu-Biuret
Esta reaccin tambin es producida, naturalmente, por los enlaces peptdicos de las protenas y
es el fundamento de la tcnica del biuret para la determinacin de protenas en suero u otros lquidos
biolgicos.
El mtodo de biuret desarrollado por Gornall et al. permite cuantificar soluciones que contengan entre 1 y
10 mg de protenas por mililitros.
MATERIALES Y MTODOS:
Reactivo de biuret: Disolver 1,5 g de sulfato de cobre (CuSO4.5H2O) y 6g de tartrato de sodio y potasio
tetrahidratado en 500ml de agua destilada. Agitando constantemente, aadir 300ml de Na(OH) al 10%.
Diluir hasta 1 litro con agua destilada y guardar en frasco de plstico.
Solucin testigo: Albmina bovina a una concentracin de 5mg/ml en agua destilada.
28
Protocolo: En el tubo blanco colocar 1 ml de agua destilada; en el tubo testigo colocar 1 ml de solucin
testigo de albmina; en el tubo problema colocar 1 ml de la solucin problema. Agregar a cada uno de los
tubos 4 ml de reactivo de biuret, agitando y dejar en reposo a temperatura ambiente durante 30 minutos.
Con el tubo blanco llevar a cero de absorbancia al fotocolormetro (550 nm). Luego leer el tubo problema y
el tubo testigo.
En el trabajo prctico se prepararn varios tubos testigos a los fines de construr una curva de calibracin
RESULTADOS
Tubo
T1
T2
T3
P
Absorbancia
[Proteinas] (mg/ml
29
DISCUSIN
BIBLIOGRAFA
- Problemas de Qumica. J.M. Esteban y J.M. Cavanillas. Ed. Alhambra. 4a. 1976. Espaa.
- Clculos en Bioqumica. I.J.Segel. Ed. Acribia. Saragoza. Espaa. 1972.
- Mtodos instrumentales de anlisis. H.H. Willard,.L.Merritt Jr., y J.A.Dean. Ed. CECSA. Mxico. 1974.
- Anlisis Instrumental. D.A. Skoog y D.M. West. Ed.Interamericana. Mxico. 1975.
- Qumica Clnica: Bases y Tcnicas. R.J. Henry, D.C. Cannon y J.W. Winkelman. Tomo I. 2a Ed. Jims. Barcelona.
Espaa.1980.
- Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth Publishers. 3 Ed. NY. USA.2000
- Spectrophotometry and Spectrofluorometry A practical Approach. Edited by Michael G. Gore. Ed. Oxford University
Press. Inc. NY. USA. 2000.
30
TRABAJO PRACTICO N 2
PURIFICACIN, CUANTIFICACIN Y ANLISIS ESTRUCTURAL DE PROTENAS
Los alumnos debern concurrir con la tarea de investigacin (por escrito) sobre tcnicas para estudios de
protenas que les fue asignada por el docente en el TP anterior. Se har una puesta en comn de la
informacin obtenida por cada grupo. Sern evaluados en forma escrita al final de esta clase.
OBJETIVOS
- Conocer los fundamentos tericos de las tcnicas utilizadas en la purificacin y caracterizacin de protenas.
- Valorar la importancia del dominio de diferentes tcnicas y del conocimiento acerca de las caractersticas
particulares de la protena a purificar, para poder aplicarlos con criterio.
- Adquirir y aplicar herramientas tericas para la resolucin de los problemas planteados.
1- Fraccionamiento subcelular
por centrifugacin diferencial y
por gradiente de sacarosa.
2- Precipitacin salina.
1-Espectrofotometra
ANALISIS DE
ESTRUCTURA
1- Espectrofluorimetra
2- Espectrofluorimetra
2- Dicroismo circular
3- Dilisis.
3- Elisa
3- RMN
PURIFICACIN
CUANTIFICACIN
4- FTIR
5- MALDI-MS
6- Secuenciacin
7-Perfil hidroptico
8-Difraccin de rayos X
9- Comparacin de
secuencias.
ANALISIS DE
ACTIVIDAD
1- Actividad
enzimtica
2- Unin de
radioligandos
3-Formacin de
complejo Ag-Ac
4- Conductancia
a iones
31
PROBLEMAS
1-
Forma y Dimensin (a) La tropomiosina, una protena muscular de 70 kDa, est formada por un
superhelicoide de -hlices con dos hebras. Calcular la longitud de la molcula. (b) Suponer que un
segmento protico de 40 residuos se pliega en una estructura -antiparalela de dos hebras con un
giro en horquilla de 4 residuos. Cul es la longitud mxima de este motivo?
2-
3-
4-
Mensaje oculto. Traducir la siguiente secuencia de aminocidos en cdigo de una letra: Leu-Glu-AlaArg-Asn-Ile-Asn-Gly-Ser-Cys-Ile-Glu-Asn-Cys-Glu-Ile-Ser-Gly-Arg-Glu-Ala-Thr.
5-
Concentrado en la concentracin. Una disolucin de una protena cuya secuencia incluye tres
residuos de triptofano, sin residuos de tirosina, ni de fenilalanina, tiene una absorbancia de 0,1 a 280
nm en una celda de 1 cm de paso ptico. Obtener la concentracin de la protena en unidades de
molaridad. Si la protena tiene una masa molecular de 100 kd, hallar la concentracin en miligramos
de protena por mililitro de disolucin.
6-
7-
8-
Determinacin del tamao. Las movilidades electroforticas relativas de una protena de 30 kDa y
una de 92 kDa utilizadas como estndar en un gel de SDS-poliacrilamida son, respectivamente, 0,8 y
0,41. Cul es la masa aparente de una protena que tiene una movilidad de 0,62 en este gel?
9-
Una asociacin nueva? El gen que codifica una protena que tiene un nico puente disulfuro
experimenta una mutacin que sustituye un residuo de serina por uno de cistena. Se quiere
comprobar si el apareamiento de los sulfhidrilos en este mutante es el mismo que en la protena
original. Proponer un experimento que resuelva esta cuestin.
10- Elegir la columna. El octapptido AVGWRVKS se digiri con tripsina. a) Sera el intercambio inico o
la exclusin molecular la tcnica ms apropiada para separar estos productos? Explicarlo (b) Suponer
que el pptido se digiere con quimiotripsina. Cul sera la tcnica de separacin ptima? Explicarlo
11- Haciendo ms enzima? Durante la purificacin de una enzima un investigador realiza un paso de
purificacin que produce un incremento en la actividad total dando un valor mayor que el que est
presente en el extracto crudo. Explicar como se puede incrementar la actividad total.
32
12-
Precipitacin con
(NH4)2SO4
Cromatografa DEAEcelulosa
Cromatografa de
exclusin molecular
Cromatografa de
afinidad
Protena
total (mg)
Actividad
total
20 000
4.000000
5000
3.000000
1500
1.000000
500
750 000
45
675 000
Actividad
especfica
Nivel de
purificacin
Rendimiento
(%)
100
13- Estructura cuaternaria. Una protena se purific hasta la homogeneidad. La determinacin del peso
molecular por cromatografa de exclusin molecular da 60 kDa. La cromatografa en presencia de
urea 6 M da una especie de 30 kDa. Cuando se repite la cromatografa en presencia de urea 6 M y mercaptoetanol 10 mM, aparece una especie molecular nica de 15 kDa. Describir la estructura de la
molcula.
14- Secuencia de protenas I. Determinar la secuencia de un hexapptido basndose en los siguientes
datos. Nota: Cuando no se conoce la secuencia, los aminocidos se separan con una coma.
(ver datos en la Tabla de ruptura especfica de los polipptidos, al final de la gua).
Composicin de aminocidos
Anlisis N-terminal del hexapptido
Digestin por tripsina
Digestin por carboxipeptidasa
Digestin por quimiotripsina
15-
(2R,A,S,V,Y)
A
(R,A,V) y (R,S,Y)
no hay digestin
(A,R,V,Y) (R,S)
Composicin de aminocidos
Anlisis N-terminal del pptido
Digestin por carboxipeptidasa
Digestin por tripsina
Digestin por quimiotripsina
Anlisis N-terminal del pptido
Tratamiento con bromuro de ciangeno
(4S,2L,F,G,I,K,M,T,W,Y)
S
L
(3S,2L,F,I,M,T,W) y (G,K,S,Y)
(F,I,S) (G,K,L) (L,S) (M,T) (S,W) (S,Y)
(F,I,S), S
(2S,F,G,I,K,L,M*,T,Y) (2S,L,W)
33
DATOS
1 residuo de -hlice contribuye con 1.5 a la longitud total de la -hlice.
1 residuo de hoja plegada contribuye con 3.5 a la longitud total de la estructura .
1 residuo = 110 D
trombina
quimiotripsina
Carboxipeptidasa A
BIBLIOGRAFA
- Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth Publishers. 3 Ed. NY.
USA.2000
- Stryer L, Berg, JM y Tymoczko, JL. Bioqumica, Ed. Revert SA, 5Ed. Espaa 2003.
34
TRABAJO PRCTICO N 3
CINTICA ENZIMTICA I
En la primera semana (Cintica Enzimtica I) se discutirn los aspectos tericos y, en la segunda y tercera
semana (Cintica Enzimtica II y III) se desarrollar la parte experimental. Los alumnos sern evaluados al
finalizar cada T.P de cintica (I, II y III) acerca de todos los apectos tericos del tema y de los fundamentos
de las tcnicas utilizadas.
Debern concurrir con guardapolvo, gafas, guantes, cabello recogido y calzado cerrado.
OBJETIVOS
- Conocer el mecanismo por el cual transcurren las reacciones catalizadas por enzimas.
- Comprender como influyen el tiempo de incubacin, la concentracin de enzima, la concentracin de sustrato,
temperatura, pH, y la presencia de inhibidores sobre la velocidad inicial y la concentracin de producto formado en
reacciones catalizadas por enzimas Michaelianas. - Interpretar el significado de las constantes cinticas KM y Vmax.
- Valorar la importancia del trabajo prolijo y ordenado para la obtencin de resultados confiables.
INTRODUCCIN
Las enzimas son catalizadores biolgicos de naturaleza protica. Una determinada enzima (E) se combina
con un determinado sustrato (S) formando un complejo enzima-sustrato (E-S) el cual se descompone para
dar el producto (P) y enzima libre (E):
E+S
ES
E+P
La mayora de las reacciones biolgicas transcurren lentamente si no son catalizadas; las enzimas hacen
que el equilibrio de esas reacciones sea alcanzado rpidamente. Varios factores como a) el tiempo de
incubacin; b) la concentracin de enzima; c) la temperatura del medio; d) el pH y e) la concentracin de
sustrato influyen en el transcurso de la reaccin.
a) TIEMPO DE INCUBACIN: en la Fig. 1 se observa la variacin de las concentraciones de complejo enzimasustrato (E-S), de sustrato [S] y de producto [P], en funcin del tiempo. La velocidad inicial (Vo)
corresponde a la velocidad medida dentro de un lapso de tiempo lo suficientemente corto como para que
la cantidad de sustrato consumido sea despreciable respecto a la cantidad de sustrato inicial (en la
prctica menos del 5% del total). La velocidad se expresa como la cantidad de producto formado por
unidad de tiempo (por ej. moles/min)
[P]
[S]
[E]
[ES]
tiempo
35
b) CONCENTRACIN DE LA ENZIMA: Velocidad en funcin de la concentracin de enzima. La concentracin
de enzima ptima se elige un rango de concentracin de enzima tal que la velocidad inicial (Vo) sea
directamente proporcional a la concentracin de la enzima
E
Concentracin
de enzima ptima
c) EFECTO DE LA TEMPERATURA DE INCUBACIN: Dentro de ciertos lmites, la velocidad de reaccin aumenta
con la temperatura. En general la velocidad se duplica a cada incremento de unos 10C y viceversa.
Existe una temperatura ptima, por encima de esta, la velocidad decrece rpidamente por
desnaturalizacin de la enzima. La temperatura de mxima actividad no corresponde necesariamente a la
temperatura de mxima estabilidad.
Fig.4. Actividad enzimtica vs temperatura
% Actividad
mxima
Temperatura
d) EFECTO DEL PH DEL MEDIO DE INCUBACIN: Cambios moderados en el pH afectan el estado inico de la
enzima y con frecuencia tambin del sustrato. En general , la actividad ptima se encuentra entre pH 5 y
pH 9 como la tripsina. ver Fig.5., sin embargo algunas enzimas como la pepsina Fig.6 tiene su ptimo a
valores de pH bastante alejados de dichos lmites. A valores extremos de pH se produce desnaturalizacin
de la enzima.
Actividad
Actividad
10
pH
pH
A partir de estos grficos se puede determinar las constantes cinticas que caracterizan a una enzima: KM
(constante de Michaelis) y Vmax (velocidad mxima), para un sustrato y en condiciones determinadas.
KM: este valor corresponde a la concentracin de sustrato necesaria para alcanzar una velocidad igual a la
mitad de la Vmax
36
Vmax: es la velocidad que se alcanza cuando la enzima est saturada con sustrato (a altas
concentraciones de sustrato).
e) EFECTO DE LA CONCENTRACIN DE SUSTRATO: Variacin de la velocidad inicial en funcin de la
concentracin de sustrato. Si aumenta la concentracin de S, mientras permanecen constantes las dems
condiciones, V0 crece hasta un valor mximo. La velocidad crece hasta que la enzima es saturada por el S
y se alcanza la velocidad mxima (Vmax).
Vo
1
Vo
(a)
(b)
Vmax
1
Vmax
Vmax
2
[S]
1
KM
1
[S]
GUA DE ESTUDIO
1. Catalizadores.
2. Enzimas. Caractersticas. Sitio activo de una enzima: caractersticas. Cofactor. Coenzima. Holoenzima.
3. Clasificacin de enzimas.
4. Ubicacin de las enzimas en la clula.
5. A que se llama sustrato y producto?.
6. Mecanismo de accin de las enzimas.
7. Alteran las enzimas el equilibrio de la reaccin?
8. Cmo se mide la concentracin de una enzima?.
9. Qu es la actividad especfica de una enzima y en qu unidades se expresa?.
10. Factores que influyen en una reacin catalizada por enzimas.
11. Funcin de Michaelis Menten. Representacin grfica.
12. Velocidad inicial. Velocidad mxima. Unidades.
13. Porqu se debe trabajar a velocidad inicial?
14. KM. Unidades. Cmo se determina?
15. Ecuacin de Lineweaver-Burk. Representacin grfica.
16. Inhibicin reversible e irreversible, concepto. Inhibidores competitivos y no competitivos, concepto.
Cmo se diferencian? cmo son las curvas de las directas e inversas de la velocidad en funcin de la
concentracin de sustrato?.
37
PROBLEMAS
1. Explique el siguiente grfico
V
Tiempo
38
[Propionamida]
VELOCIDAD INICIAL
(moles de NH3 liberados/min/mg de protena)
SIN INHIBIDOR
CON INHIBIDOR (Urea)
1 mmol/ml
5
6.7
10
20
50
160
194
263
400
576
2 mmol/ml
111
140
183
279
400
76
95
123
188
277
Determinar la Km para las diferentes condiciones. Acta la urea como un inhibidor competitivo o no
competitivo?
10. A partir de los siguientes datos de una reaccin enzimtica, determinar a) tipo de inhibicin b) KM del
sustrato.
Concentracin de S (mM)
VELOCIDAD
(g de producto formado/hora)
Sin inhibidor
2
3
4
10
15
139
179
213
313
370
Con inhibidor 6 mM
88
121
149
257
313
39
TRABAJO PRCTICO N 4
CINTICA ENZIMTICA II
PARTE PRACTICA I
ESTUDIO SOBRE LA FOSFATASA CIDA DE HGADO
OBJETIVOS
- Medir la formacin de producto en funcin del tiempo de incubacin.
- Determinar la variacin de la velocidad inicial en funcin de la concentracin de la enzima.
Es decir, se determinarn las condiciones ptimas de tiempo de incubacin y de concentracin de enzima, las que
sern usadas durante el trabajo prctico siguiente para determinar KM y Vmax.
FUNDAMENTO DE LA REACCIN
La fosfatasa cida de hgado cataliza la siguiente reaccin:
p-nitrofenol + PO43-
p-nitrofenilfosfato + H2O
HO
OH
O
OH
Enzima
+ Enz + PO4-3
H+
O2N
p-nitrofenilfosfato
O2N
O-
OH-
+ H2O
O2N
p-nitrofenol
p-nitrofenolato
El sustrato p-nitrofenilfosfato disdico, es una reactivo artificial que tiene la propiedad de ser hidrolizado
por esta enzima del hgado y de otros tejidos, por ello puede ser usado para estudiar dichas enzimas. La
reaccin es medida siguiendo la cantidad de producto formado, el p-nitrofenol, el cual se puede medir
mediante fotocolorimetra en un medio alcalino a 410 nm (Coeficiente de extincin molar: 17500) (ref.
Methods Enzimology ed. Colowick-Kaplan vol. XXXI).
MATERIALES Y MTODOS
Preparacin de la enzima:
Homogeneizar (en homogeneizador a embolo) 0.25 g de hgado en 15 ml de agua destilada. Dejar en
bao de hielo durante 10 min. En esas condiciones hipo-osmticas, se rompen los lisosomas que
contienen la enzima, la cual queda soluble. Luego llevar la suspensin a 30 ml con buffer actico- acetato
de sodio, pH 5, y 0,2 M. La suspensin queda con una concentracin de 1 mg de protena por ml.
40
Sistema de incubacin:
Contiene cantidades variables de los siguientes componentes:
Sustrato: p-nitrofenilfosfato, 25 mM. PM 371,12.
Buffer: acido actico- acetato de sodio, pH 5, 0,1 M.
Enzima: homogeneizado de hgado 1 mg de protena / ml.
Activador: Cl2Ca 11 mM.
Inactivador: NaOH 0,1M
Recomendaciones:
Colocar en un tubo todos los componentes menos la enzima. La reaccin comienza con el agregado de la
enzima y la incubacin a 37C. Mezclar rpidamente y continuar la incubacin durante un tiempo que se
indicar en cada caso. La reaccin se detiene por el agregado de 5 ml de NaOH 0.1 M. El lcali, por un
lado inactiva a la enzima y por otro da el medio alcalino necesario para que el producto (p-nitrofenol)
desarrolle color. Es importante hacer en cada caso un tiempo de cero de incubacin, este tubo contiene lo
mismo que los tubos problema pero con la enzima agregada despus del NaOH. Este tubo se usa como
blanco para el fotocolormetro.
PROTOCOLO
A) CURVA DE TIEMPO :
o
Tubo N
sustrato l
Cl2Ca l
buffer l
enzima l
tiempo
(min)
100 (5 mM)
100
250
100 (0,1 mg
10
prot)
2
100
100
250
100
15
100
100
250
100
20
100
100
250
100
25
100
100
250
100
30
blanco
100
100
250
100
Incubar a 37C. Al cabo del tiempo de incubacin frenar la reaccin agregando 5 ml de NaOH 0.1 M. En el
blanco la enzima debe aadirse despus del alcali. Leer en el fotocolormetro a 410 nm y calcular los
moles de producto formado.
RESULTADOS
Tubo No
1
2
3
4
5
Absorbancia
moles de P
moles de p/min
41
GRFICO
CONCLUSIONES
Sustrato (l)
Cl2Ca (l)
Buffer (l)
enzima (l)
tiempo (min)
100 (5 mM)
100
300
50 (0,05 mg prot)
SEGN
100
100
250
100 (0,1 )
100
100
200
150 (0,15 )
DETERMINADO
100
100
150
200 (0,2
EN: A
100
100
100
250 (0,25 )
blanco
100
100
100
250 (
LO
Incubar a 37C durante el tiempo determinado en A. Frenar la reaccin agregando 5 ml de NaOH 0.1 M.
En el blanco la enzima debe aadirse despus del lcali. Leer en el fotocolormetro a 410 nm y calcular los
moles de producto formado.
RESULTADOS
42
o
Tubo N
1
2
3
4
5
GRFICO
CONCLUSIONES
Absorbancia
moles de P
moles de p/min
43
TRABAJO PRCTICO N 5
CINTICA ENZIMTICA III
PARTE PRCTICA II
ESTUDIO SOBRE LA FOSFATASA CIDA DE HGADO
OBJETIVO
- Determinar los valores de KM y Vmax de la fosfatasa cida de hgado.
PROTOCOLO
PREPARACIN DEL SISTEMA DE INCUBACIN:
Tubo
sustrato (l)
Cl2Ca (l)
Buffer (l)
enzima (l)
tiempo (min)
50 (2,5 mM)
100
250
SEGN
SEGN
100 (5 mM)
100
200
LO
LO
100
150
ESTIMADO
ESTIMADO
100
100
EN: B
EN: A
100
50
blanco
100
100
200
Incubar a 37C segn el tiempo determinado en A. Luego agregar a cada tubo 5 ml de NaOH 0.1 M. En el
blanco la enzima se aade despus del alcali. Leer en el fotocolormetro a 410 nm y calcular los moles
de P formado.
ANLISIS DE DATOS:
a) Calcular las inversas de la concentracin de sustrato indicadas en la tabla.
b) calcular las inversas de moles de producto formados en cada tubo.
c) graficar 1/Vo en funcin de 1/[S]. d) Determinar los valores de KM y Vmax.
RESULTADOS:
Curva de Saturacin
Tubo No
1
2
3
4
5
Absorbancia
moles de P
moles de P/min
44
1/V
1/[S]
45
CONCLUSIONES
46
Trabajo cientfico:
Jung G.Y. and Stephanopoulos G. (2004). A functional protein chip for pathway optimization and in
vitro metabolic engineering. Science 304: 428-431.
1. Escriba la cita bibliogrfica completa (busque en bases de datos tales como PubMed).
2. Optimizacin de vas metablicas: a) cul es su inters?, b)dnde reside su dificultad?, cmo puede
encararse?.
3. Qu son los microarreglos?, en qu contexto se comenzaron a desarrollar?.
4. Cul es el objetivo del presente trabajo?
5. Cul es la estrategia experimental elegida? (palabras clave: fusin RNA-protena, polilisina, DNA,
hibridizacin).
6. Cules son las dos reacciones acopladas que se usan para poner apunto el sistema experimental?.
Cul es la utilidad del DNA marcado con fluorescena?. Cmo se detecta el producto de estas
reacciones acopladas?. Describa los experimentos realizados para poner a punto la tcnica (Figs. 1 y 2).
7. Qu es la trehalosa y cul es su importancia?
8. Cul es la va metablica a cuyo estudio se aplica la tcnica desarrollada?
9. Describa la Fig. 3.
10.Cules son las conclusiones alcanzadas respecto al funcionamiento de esta va metablica? Es
posible generalizar estas conclusiones a otras vas metablicas?.
BIBLIOGRAFA
. Stryer L, Berg, JM y Tymoczko, JL. Bioqumica, Ed. Revert SA, 5Ed. Espaa 2003.
. Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth Publishers. 3Ed. NY.
USA. 2000.
. Harper H.A, Manual de qumica fisiolgica. Ed. El manual moderno 1980
. Neilands J.B., Stumpf P.K., Principios de enzimologa. Ed Aguilar. 1967.
. Morris J., Fisicoqumica para bilogos.
. Bezkorovainy, A, Rafelson M.E. Concise Biochemistry. Ed. Marcel Dekker, New York, 1996.
. Horton R.H, Moran L.A., Ochs R.S., Rawn J.D., Scrimgeour K.G. Pentice Hall, Hispanoamericana, SA.
Mxico, 1995.
- Methods Enzimology ed. Colowick-Kaplan Vol. XXXI.
47
TRABAJO PRCTICO N 6
FOTOSNTESIS
Los problemas y la gua de estudio debern ser resueltos por los alumnos antes de concurrir a la clase. En
caso de necesitar aclarar dudas, los docentes estrn disponibles en sus horarios de consulta en la ctedra.
Los alumnos sern evaluados al final del TP (evaluacin escrita) y durante el desarrollo de la experiencia
prctica (evaluacin oral), sobre los contenidos que se encuentran en la gua de TP.
Debern entregar un informe escrito de la experiencia prctica en donde se detallen claramente: Objetivos,
Hiptesis, Materiales y Mtodos, Resultados y Discusin.
Debern concurrir con guardapolvo, gafas, guantes, cabello recogido y calzado cerrado.
OBJETIVOS
- Valorar la importancia de la fotosntesis como proceso necesario para la vida en el planeta
- Conocer los procesos bioqumicos y termodinmicos involucrados en el proceso.
- Comprobar algunos aspectos de la fotosntesis por medio de experimentos.
INTRODUCCIN
La fotosntesis es un proceso que puede tener lugar tanto en clulas de plantas y como de bacterias
verde-azules; por medio de este proceso estos organismos son capaces de utilizar la luz solar como
fuente de energa para efectuar la sntesis de ciertos compuestos.
La ecuacin global de la fotosntesis es :
Luz
6 CO2 + 6 H2O -----------------> C6H12O6 + 6O2
Puede resolverse en dos procesos caracterizados por el tipo de reacciones que se realizan en cada uno,
estas son:
reacciones dependoentes de la luz ( o reacciones claras): la energa luminosa es captada por los
pigmentos y la transforman en ATP y NADPH y simultaneamente se libera oxgeno molecular.
Reacciones de fijacin del carbono (o de fase oscura): llamada as porque no es necesaria la luz para
llevarse a cabo; aqu el ATP y el NADPH se emplean como fuentes de energa y poder reductor,
respectivamente, y se produce la reduccin del CO2 y la sntesis de glucosa.
Fotlisis del agua:
Esta reaccin se conoce como reaccin de Hill:
H2O + A ----------------> AH2 + 1/2 O2
El estudio del transporte electrnico inducido por la luz comienza con el descubrimiento de R.L Hill: "La
iluminacin de cloroplastos en presencia de aceptores electrnicos artificiales provocaba el
desprendimiento de oxgeno y la simultnea reduccin del aceptor.
En la fotosntesis normal el aceptor es el NADP pero en la reaccin de Hill se utiliza un aceptor
artificial por ejemplo, un colorante que al reducirse se decolora.
48
GUIA DE ESTUDIO
1. Concepto de fotosntesis.
2. Concepto de reacciones dependientes de la luz y de fijacin del carbono.
3. Formas de captacin y transferencia de Energa.
4. Fuerza electrn-motriz.
5. Fuerza protn motriz.
6. Diferencia entre mitocondrias y cloroplastos.
7. Dadores y aceptores de electrones.
8. Importancia de la reaccin de Hill
9. Diferencias entre fosforilacin a nivel de sustrato, fosforilacin oxidativa y fotofosforilacin. Ejemplos.
Rol Dual de citocromo b6f (cytochrome b6f) y citocromo c (cytochrome c) en cianobacterias como
ejemplo de transporte electrnico y fosforilacin en la fotosntesis y en la cadena respiratoria.
Estos organismos utilizan citocromo b6f, citocromo c y plastoquinonas para la fosforilacin oxidativa y la
fotofosforilacin. (a) En la fotofosforilacin los electrones fluyen desde el agua al NADP+ (b) En la
fosforilacin oxidativa los electrones fluyen desde el NADH al O2. Ambos procesos son acompaados por
el movimiento de protones a travs de la membrana.
49
Adaptado de : Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth
Publishers. 3Ed. NY. USA. 2000.
50
PARTE PRACTICA
Fig.1
a)
b)
c)
d)
e)
51
Fig. 2
CO2
Rojo
a)
b)
c)
d)
e)
52
2,6 di-Cl-fenolindofenol
f)
g)
h)
i)
j)
53
PROBLEMAS
1. Interprete el siguiente grfico en el que se observan varios factores que afectan la velocidad de la
fotosntesis:
*
Velocidad
de
fotosntesis
1. 25 C y CO2 0,4%
2. 15oC y CO2 0,4%
3. 25oC y CO2 0,01%
Concentracin
2. Explique las causas de las interconversiones entre RuDp (ribulosa difosfato) y PGA (cido
fosfoglicrico) en experimentos de fotosntesis, cuando varan la intensidad de iluminacin y la
concentracin de CO2.
Luz
1% CO2
Oscuridad
0,003% CO2
RUDP
PGA
PGA
RUDP
Tiempo (min)
Tiempo (min)
54
8. Cul es la diferencia entre las cadena transportadoras de electrones que tienen lugar en
mitocondrias y en cloroplastos? Calcule el G para la transferencia de electrones que ocurre en ambos
casos y justifique los resultados.
9. El aparato fotosinttico del alga verdeazulada contiene grandes cantidades de ficoeritrina y ficocianina,
adems de la clorofila A. La ficoeritrina tiene una absorcin mxima entre 480 y 680 nm; la ficocianina
a 620 nm. Sugerir la misin de estos pigmentos.
10. Observe y analice el siguiente grfico. Indique el tipo de fosforilacin y justifique su respuesta.
Tiempo
11. Observe y analice el siguiente grfico. Indique el tipo de fosforilacin y justifique su respuesta.
- - - moles de oxgeno liberado
___ moles de fosfato esterificado
Tiempo
DATOS: Para resolver los problemas.
Agua: +0,82 V
NADP+: -0,324 V
Ferredoxina: -0,4 V
P700: +0,4 V
P680: +0,95 V
P680*: -0,95 V
Feofitina (Pheo): -0.75 V
Plastoquinona: +0,1 V
Plastocianina: +0.13V
NAD+: -0.32V
BIBLIOGRAFA
. Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth Publishers. 3Ed. NY.
USA. 2000.
. Stryer L, Berg, JM y Tymoczko, JL. Bioqumica, Ed. Revert SA, 5Ed. Espaa 2003.
. Hall D.O., Rao K. Fotosntesis. Ed. Omega, Barcelona, 1977.
. Tribe M y Whitaker P. Cloroplastos y motocondrias. Ed.Omega, Barcelona, 1977.
. Andreo C., Vallejos R. Fotosntesis. Serie Biologa, monografa no 30 OEA, 1984.
. Molt A.S. et al. 1951, Plant Physiology, 26, 164-175.
. Torres H.M., Carminatti H. Y Cardini E. Bioqumica General Ed. El Ateneo, Bs.As. 1983.
. Harper H.A, Manual de qumica fisiolgica. Ed. El manual moderno 1980
. Morris J., Fisicoqumica para bilogos.
. Bezkorovainy, A, Rafelson M.E. Concise Biochemistry. Ed. Marcel Dekker, New York, 1996.
. Horton R.H, Moran L.A., Ochs R.S., Rawn J.D., Scrimgeour K.G. Pentice Hall, Hispanoamericana, SA.
Mexico, 1999.
55
TRABAJO PRACTICO N 7
MECANISMOS DE TRANSDUCCIN DE ENERGA
Los problemas y la gua de estudio debern ser resueltos por los alumnos antes de concurrir a la clase. En
caso de necesitar aclarar dudas los docentes estrn disponibles en sus horarios de consulta, en la ctedra.
Los alumnos sern evaluados al final del TP (evaluacin escrita) y durante la discusin del trabajo cientfico
(evaluacin oral), sobre los contenidos que se encuentran en la gua de TP.
OBJETIVOS
- Reconocer la aplicabilidad de las leyes de la fsicas a los sistemas biolgicos.
- Analizar fenmenos biolgicas desde un punto de vista termodinmico. Fotosntesis, respiracin y motores
moleculares como ejemplos.
GUIA DE PROBLEMAS
1- Condiciones estndar frente a la vida real. La aldolasa cataliza la siguiente reaccin en la gliclisis:
aldolasa
Fructosa 1,6-bifosfato
El G 0 para esta reaccin es de + 5,7 kcal.mol-1, mientras que el G en la clula es -0,3 kcal.mol-1.
Calcular la relacin entre reactantes y productos en el equilibrio y en condiciones intracelulares.
Utilizando los resultados obtenidos explicar: cmo puede resultar esta reaccin endergnica en
condiciones estandar y exergnica en condiciones intracelulares?
2- No siempre es lo mismo. Las concentraciones de ATP, ADP y Pi difieren segn el tipo de clula,
consecuentemente la liberacin de energa libre para la hidrlisis de ATP ser tambien diferente segn
el tipo de clula. Utilizando los datos de la tabla siguiente, calcular G para la hidrlisis de ATP en las
0
clulas de msculo, hgado y cerebro. Teniendo en cuenta que el G para esta reaccin es de - 7,3
-1
kcal.mol ,
Hgado
Msculo
Cerebro
ATP (mM)
3,5
8,0
2,6
ADP (mM)
1,8
0,9
0,7
Pi (mM)
5,0
8,0
2,7
4- Los opuestos se atraen. El grfico siguiente muestra como el G 0 para la hidrlisis de ATP vara en
funcin de la concentracin de Mg2+ (pMg=log 1/[ Mg2+ ]).
a) Cmo afecta el descenso de [Mg2+] al G para la hidrlisis de ATP?
b) Cmo se puede explicar este efecto?
8.4
8.2
34
8.0
7.8
33
7.6
32
7.4
31
-1
35
-G (kcal.mol )
-1
-G (kj.mol )
36
56
7.2
30
2
pMg 2
5- Cambio de divisas. Para una fuerza protn-motriz de 0,2 V (negativa en el lado de la matriz). Cul es
el valor mximo del cociente [ATP]/ [ADP] [Pi ] compatible con la sntesis de ATP? Calcular el valor de
este cociente de tres maneras, suponiendo que el nmero de protones translocados por cada ATP
formado es dos, tres, y cuatro respectivamente. La temperatura es de 25C.
6- Cruce de caminos. Es posible determinar el lugar exacto donde acta un inhibidor de la cadena
respiratoria gracias a la tcnica de punto y corte. Britton Chance diseo elegantes mtodos
espectroscpicos para determinar el cociente entre las formas oxidada y reducida de cada uno de los
transportadores. Este clculo es posible porque cada uno de los estados tiene un espectro de
absorcin caracterstico, tal y como se ilustra en el grfico adjunto para el caso de citocromo c. Si usted
se encuentra en posesin de un inhibidor y descubre que al aadirlo a mitocondrias que respiran, los
transportadores localizados entre el NADH y QH2 se encuentran ms reducidos y los transportadores
localizados entre el fitocromo c y el O2 se encuentran ms oxidados en qu punto acta el inhibidor?
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7- Distancia. Supongamos que la transferencia de energa entre dos molculas de clorofila a distantes
entre s 10 tiene lugar en 10 picosegundos. Supongamos que la distancia se incrementa hasta 20
manteniendo constantes el resto de los factores. Cunto tardar en ocurrir la transferencia de
energa?
8- Se dice que es lenta? A su mxima velocidad una molcula de quinesina se desplaza con una
velocidad de 6400 por segundo. Teniendo en cuenta que el tamao de la regin motriz del dmero de
quinesina es de 80 , calcular su velocidad en unidades de su tamao por segundo. Segn esta
relacin cul sera la velocidad correspondiente de un automvil que tuviera una longitud de 3
metros?
9- Levantamiento de pesos. Un nico dominio motor de la miosina puede desarrollar una fuerza de
aproximadamente 4 piconewtons (4pN) Cuntas veces puede levantar su peso un dominio motor de
miosina? Tener en cuenta que 1 newton = 1 kg fuerza (1kg masa m.s-2). Considerar que la masa
molecular del dominio motor es de 100 kd.
10- Las helicasas como motores. Las helicasas tales como la PcrA pueden utilizar una hebra sencilla de
ADN como gua. En cada ciclo la helicasa se desplaza una base en el sentido 3-5. Teniendo en
cuenta que la PcrA en presencia de un molde formado por una hebra sencilla de ADN puede hidrolizar
ATP con una velocidad de 50 molculas por segundo (se hidroliza una molecula por ciclo) y que la
longuitud de una base de ADN es 3,4 . Cmo es esta velocidad comparada con la velocidad de la
quinesina que es de 6400 por segundo?A qu se puede deber la diferencia de velocidad entre estos
dos motores moleculares?.
11- Nuevamente se mueve. Cuando a las bacterias tales como E. coli se las mantiene en ayunas durante
un perodo de tiempo suficiente, dejan de moverse. Sin embargo, cuando estas bacterias inmviles se
colocan en un medio cido nuevamente comienzan a moverse. Aportar una explicacin teniendo en
cuenta el mecanismo de movimiento del flagelo de una bacteria.
12- Arrastrar cargas. Considrese la actividad de una nica molcula de quinesina que transporta una
vescula a lo largo de un microtbulo. La fuerza necesaria para arrastrar una partcula esfrica de radio
a con una velocidad en un medio de viscosidad es: F= 6 a x
Supongamos que una esfera de 2 m de dimetro se transporta con una velocidad de 0,6 m. s-1 en un
medio acuoso con una viscosidad de = 0.01 g.cm-1. s-1.
a) Cunta es la fuerza desarrollada por la quinesina? Expresar el valor en dinas (1 dina= 1 g.cm. s-2)
b) Cunto trabajo realiza en un segundo? Expresar el valor en ergios (1 ergio=1 dina cm).
c) Un motor de quinesina hidroliza aproximadamente 80 molculas de ATP por segundo. Cunta es
la energa asociada a esta hidrlisis de ATP expresada en ergios? Comparar este valor con el
trabajo realizado.
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Trabajo cientfico:
Yasuda, R., Noji, H., Kinosita, K., & Yoshida M.. (1998). F1-ATPase Is a Highly Efficient Molecular
Motor that Rotates with Discrete Steps. Cell. 93: 11171124.
1. Cal es la funcin del ATP sintetasa? Cmo es su estructura? Cul es la funcin de cada una de las
subunidades?
2. Qu fenmeno se observa si la parte F1 se encuentra en ausencia de la parte F0 en un medio que
contiene ATP?
3. Cmo se logra experimentalmente observar la rotacin del F1-ATPase?
4. Explicar brevemente los resultados que se observa en la Figura 2a y 2b.
5. A cul de los experimentos que se realizaron en los T.Prcticos de la materia, se asemeja el
experimento del grfico 2b.
BIBLIOGRAFA
. Lehninger Principles of Biochemistry. David L. Nelson & Michael M. Cox. Worth Publishers. 3Ed. NY.
USA. 2000.
. Stryer L, Berg, JM y Tymoczko, JL. Bioqumica, Ed. Revert SA, 5Ed. Espaa 2003.