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El hemocitómetro es un portaobjetos especial que se puede utilizar para contar celdas. El usuario
cuenta el número de celdas manualmente., dentro de un volumen de líquido, bajo un microscopio.
Tomando una descripción general rápida, se puede afirmar que el hemocitómetro tiene dos rejillas
que forman áreas cuadradas de tamaño definido (1 lado mm, ver figura a continuación) y,
colocando un cubreobjetos en el hemocitómetro, se forma un espacio de volumen definido.
Esta es la cámara de recuento en la que un volumen conocido de suspensión celular (10 µl) se
puede pipetear.
A continuación, el personal de cultivo celular puede contar fácilmente las células mirando el
portaobjetos con un microscopio..
hemocitómetro
rejilla de hemocitómetro
rejilla de hemocitómetro
CÁLCULO DEL NÚMERO DE CELDA
Cada una de las dos rejillas del hemocitómetro (cámara 1 y 2) es un cuadrado con un lado de 3
mm.
El cuadrado está dividido por 3 líneas equidistantes verticales y horizontales que forman 9
cuadrados con un lado de 1 mm.
El área de cada cuadrado (rojo en el diagrama de arriba) es, por lo tanto 1 mm2.
Colocar un cubreobjetos en el hemocitómetro forma una cámara que es 0.1 mm de alto (ver la
segunda figura).
En otras palabras, EL NÚMERO de celdas incluidas en el área de un cuadrado (rojo), son los
contenidos en 10-4 ml de suspensión celular.
Para saber la cantidad de celdas en 1 ml, bastará con dividir el número de células contadas en un
pequeño cuadrado rojo por 10-4 ml, es decir. multiplica el número de celdas x 104.
La 4 los cuadrados de las esquinas de la cuadrícula principal se dividen en 16 celdas más pequeñas.
El cuadrado central de la cuadrícula principal se divide en 16 cuadrados más pequeños, cada uno
de los cuales se divide nuevamente en 16 cuadrados más pequeños.
TEstas divisiones adicionales se realizan para contar las celdas más pequeñas., como los glóbulos
rojos, pero generalmente no se usan para cultivos celulares.
Prepare el hemocitómetro:
Limpiar cuidadosamente el vidrio con 70% alcohol y un pañuelo de papel suave para evitar rayar la
superficie
Si las células crecen en suspensión, sólo necesitará pipetear una cantidad adecuada (10 la)
volumen de suspensión celular en la cámara del hemocitómetro.
Si las células crecen adhiriéndose al soporte, primero necesitarás tripsinizarlos (según el protocolo
específico para sus células), centrifugarlos y resuspenderlos en un (conocido!) volumen de medio
fresco en un tubo de epp o Falcon.
Consejos
Si hay demasiadas células en suspensión (número > 100 por cuadrado de conteo, área roja en la
imagen de la cuadrícula del hemocitómetro), será necesario diluir la suspensión por ejemplo 1: 1,
agregando 10 ul de suspensión celular y 10 ul de medio fresco en un nuevo epps. Pipeta 10 ul de
esta suspensión (diluido 1: 2) y contar (multiplicar por el factor de dilución para los cálculos, pero
veremos más adelante en esta publicación)
si las celdas son muy pocas (< 30 por recuento cuadrado), ellos necesitarán estar concentrados.
Bastará con centrifugar la suspensión celular. (100 g para 5 minutos) y resuspenderlo en un
(conocido!) menor volumen de medio.
Antes de cualquier muestreo, es necesario resuspender las células con cuidado., recuerde que las
células tienden a asentarse en poco tiempo.
y pipetear la suspensión celular, que entrará en el pequeño espacio de la cámara de recuento por
capilaridad.
Para que esté bien cargado, debe observar que el fluido se distribuye uniformemente para cubrir
toda la rejilla y la cámara de conteo
En presencia de burbujas es necesario rehacer el relleno., porque con estos pequeños volúmenes,
incluso pequeñas burbujas de aire pueden causar grandes errores!
contar celdas
Mueva la diapositiva para que el campo que ve sea el cuadrado rojo en la imagen, que es el área
más grande que puedes ver delimitada por tres líneas paralelas. Esta zona es 1 mm2.
Con un estándar 10 × lente esta área casi llenará el campo, o las esquinas estarán ligeramente
fuera del campo. Debería ver algo como esto (Vea el inserto que representa una ampliación del
área roja observada bajo el microscopio con un 10 x objetivo)
Empiece a contar en las celdas incluyendo en el recuento los incluidos en el área del cuadrado y
los que están en las líneas fronterizas de la cámara derecha y superior. (celdas negras-puntos – en
la foto), y no las células que entran en contacto con las líneas fronterizas en izquierda y abajo
(glóbulos blancos-puntos – en la foto).
Esto se hace para evitar contar las células dos veces., una vez que cuentes el cuadrado al lado.
Repita la cuenta al menos 4 cuadrícula (tener una buena media) y, si quieres tener un recuento
más preciso, repetir también en la otra cámara del hemocitómetro.
RESULTADOS FINALES
N x 104 células / ml
Si ha diluido las células porque son demasiado densas, o con azul tripán para la prueba de
viabilidad, también debes multiplicar el número por el factor de dilución.
N x 104 x f
Por ejemplo: si diluyes las células 1: 2, poniendo un volumen igual de celdas (decir 10 la) y medio
(o azul tripán), entonces la fórmula será Nx 104 X 2
Si ha diluido las células 1: 3, poniendo el doble del volumen de medio (decir 20 la) en comparación
con el volumen de células (decir 10 la), entonces tendrás que multiplicar por 3 N x 104 X 3 y así.
(para 25 cm2 matraz, con células epiteliales en 80% confluencia, Normalmente resuspendo en 3
ml de medio para tener una buena densidad celular para que las células se cuenten fácilmente).
error estimado
Ten cuidado! Hay diferentes tipos de cámaras de recuento disponibles., con diferentes tamaños de
cuadrícula. Algunas cámaras de conteo también tienen rejillas de diferentes tamaños.. Tenga
cuidado de conocer la altura y el tamaño de la cuadrícula, de lo contrario cometerá errores de
cálculo.
¿En cuánto volumen resuspender las células para colocarlas en la densidad celular deseada?? leer
aquí
Índice de técnicas
Hay retículas trazadas en cada cámara de recuento que la dividen en 9 zonas cuadradas, de 1 mm
de lado cada una.
Las 4 zonas de las esquinas tienen una retícula interior más espaciada, la central una retícula más
densa.
Para evitar ignorarlas o contarlas dos veces, en cada recuadro se cuentan las que tocan dos de los
lados, siempre los mismos, y se ignoran las que tocan los otros dos.
Por ejemplo, se cuentan las que tocan los lados izquierdo o superior:
Ejemplo y ejercicio
Tu respuesta:
×10
cél. / mL
Esquema del hemocitómetro: imagen tomada de Cell Cultures, por Daniel Focosi (2014). Se
reproduce aquí de acuerdo a los términos de uso educativo. Molecular Medicine © Daniele Focosi
[url] 2001-2014 [Consultado 8 nov. 2016]
Fotografía del hemocitómetro con células: retocada de la imagen tomada de Flickr, por Joseph
Elsbernd (CodonAUG). Licencia Creative Commons Atribución [url] [Consultado 19 ago. 2020]
Mutaciones en procariotas
ÍNDICE:
2 MUTACIONES ESPONTÁNEAS.
2.4 INVERSIONES
2.5 TRANSLOCACIONES
6.1.1 RADIACIÓN UV
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recombinaciones subsiguientes a intercambio genético. En la mayoría de los eucariotas, pueden
ocurrir recombinaciones entre genotipos individuales de una misma población. En los fenómenos
de sexualidad se origina una variedad casi infinita de nuevas ordenaciones o genotipos, sin
necesidad del aporte de nuevas mutaciones. Ello suministra una materia prima sobre la que puede
actuar la selección, de modo que las poblaciones pueden ir evolucionando con el paso del tiempo,
en función de presiones ambientales.
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Los procariotas son organismos con tiempos cortos de generación: se reproducen rápidamente y
pueden dar origen en poco tiempo a grandes poblaciones. Por supuesto, experimentan
fenómenos de mutación, por lo que las poblaciones pueden acumular gran número de
mutaciones. Estudiaremos la mutación (y los modos posibles de su eliminación) en el presente
capítulo.
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Pero la mutación no es el único tipo de variación genotípica en bacterias. Aunque los procariotas
carecen de fenómenos de sexualidad auténtica, existen variaciones genéticas asociadas a la
adquisición por una bacteria de parte del material genético de otra bacteria o de un bacteriófago.
Los posibles mecanismos de transferencia de información genética entre bacterias son:
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Definiciones básicas:
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Alelo es cada una de las distintas versiones en que puede presentarse un gen.
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alelo silvestre: “forma” (secuencia) de un gen en las bacterias aisladas de su hábitat natural
(estirpes silvestres). En la naturaleza es muy frecuente la existencia de polimorfismo:existen
diversos alelos silvestres diferentes para un mismo locus.
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alelos mutantes: las distintas “formas” (secuencias) que resultan de mutaciones del alelo silvestre.
Una pareja de conceptos que también conviene incluir aquí es la diferenciación entre mutaciones
espontáneas y mutaciones inducidas:
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Mutaciones inducidas: aquellas provocadas por previa alteración experimental del ADN, bien sea
directamente, o indirectamente, por agentes físicos o químicos denominados mutágenos.
2 MUTACIONES ESPONTÁNEAS.
4) Inversiones
5) Traslocaciones
6) Duplicaciones en tándem
Las transiciones suponen cambios de una pareja purina: pirimida a otra purina:pirimidina:
A:T ßà G:C
A:T ßà T:A
G:C ßà C:G
forma tautomérica
Se comporta como
A* (imino)
G* (enol)
C* (imino)
T* (enol)
Por lo tanto, los emparejamientos propiciados por las formas tautoméricas serían:
A* : C
C* : A
T* : G
G* : T
(Modelo de Topal & Fresco:observen en el gráfico los emparejamientos de las formas sin y anti)
El modelo predice que la frecuencia de mutaciones puntuales en un par de bases dependerá de:
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constante de equilibrio (k) de tautomerización del par de bases (unos 10-4 - 10-5);
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frecuencia de dNTPs en forma sin. (G sin aparece con frec. de 10-1, A , con 5·10-2).
De este modo, teóricamente deberían darse las siguientes frecuencias de mutaciones puntuales:
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Sin embargo, en la realidad, las frecuencias observadas son mucho más bajas (del orden de
10-10). Esto implica que debe de existir un sistema que corrija los emparejamientos erróneos:
como ya sabemos, las ADN polimerasas poseen una capacidad correctora de pruebas (“editing”):
cada paso de elongación es seguido inmediatamente por una comprobación del emparejamiento.
Si este emparejamiento es erróneo, la polimerasa usa su actividad exonucleasa 3'à5' para
elimininar la base mal emparejada, y a continuación vuelve a polimerizar en el mismo lugar (por su
actividad polimerasa 5'à3').
Ejemplo: Durante la replicación puede ocurrir que la citosina pase a su forma imino, que se
empareja con la adenina:
Parece ser que en la naturaleza existe una selección natural que propicia una frecuencia
baja, pero no nula, de errores durante la replicación. El significado biológico es que de esta forma
se combina una alta tasa de fidelidad en la replicación, pero con suficiente flexibilidad
(oportunidad de errores) como para generar innovaciones sobre las que pueda actuar la presión
selectiva, lo cual permite evolución.
Puntos calientes de mutación (“hot-spots”): son puntos o zonas dentro del genomio donde se
concentran mutaciones con una frecuencia mayor que la esperada si se distribuyeran al azar.
Ejemplo: en el gen lacI hay una zona especialmente “caliente” cerca de la base 200, donde la
probabilidad de encontrar mutaciones es muy superior a la del resto de la secuencia de ADN de
ese gen.
Explicación: algunas bases, dentro de un determinado contexto de secuencia, son modificadas
químicamente por acción de alguna enzima (normalmente una metilasa), y ello provoca una
mayor susceptibilidad a la aparición de mutaciones puntuales:
CCAGG
GGTCC
es metilada por una metilasa específica (que reconoce precisamente a esas dos citosinas dentro de
esa secuencia), para dar 5-metilcitosina. La 5-metil citosina experimenta espontáneamente una
desaminación oxidativa, que la convierte en timina, de manera que se produce finalmente una
transición: C:G à 5-metil-C:G à T:G (emparejamiento anómalo)à T:A
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Determinadas mutaciones puntuales en el promotor impiden que la ARN polimerasa se una a esta
secuencia; entonces el promotor queda inactivado y no se produce la expresión de los genes del
operón.
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En otros casos los efectos son diferentes. Por ejemplo: se recordará que el promotor del operón
lac tiene una secuencia -10 atípica, que obliga a que la expresión a alto nivel requiera el concurso
de la proteína CAP activa. Pues bien, por medio de mutaciones puntuales se puede lograr que esa
secuencia atípica adquiera las características de las secuencias -10 típicas (a base de TATA, o
similar). En este caso, el efecto de estas mutaciones es que el operón lac se vuelve independiente
de la proteína CAP para su expresión eficiente: el operón se hará independiente de la represión
catabólica.
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1) Si la nueva tripleta (codón) codifica el mismo aa. que la antigua (debido a la sinonimia o
“degeneración” del código genético, que afecta sobre todo a la tercera base del codón) se origina
una mutación neutra, que es “silenciosa” (no hay ningún cambio en el fenotipo).
2) Si la nueva tripleta codifica un aa. diferente del original, tenemos varias posibilidades:
i) si el nuevo aa. es de un tipo químico similar al antiguo, puede cumplir una función semejante
en la proteína mutante, por lo que el fenotipo sería también una mutación silenciosa por
sustitución de aa.
ii) En otros casos el nuevo aa. provoca una inestabilidad estructural, que puede reflejarse en
que la proteína sea termosensible o criosensible, o más susceptible a efectores alostéricos. La
proteína termosensible es funcional a temperaturas moderadas, pero se inactiva a temperaturas
relativamente altas, a las cuales la correspondiente proteína silvestre es activa. La proteína
criosensible es funcional a temperaturas moderadas, pero se inactiva a temperaturas
relativamente bajas, a las cuales la proteína silvestre es activa. La proteína más susceptible a
efectores alostéricos es aquella que se inhibe por efectores de forma más acusada. En esta
categoría entran también las proteínas con actividad residual.
iii) Por otro lado, podemos encontrar proteínas que pierden su actividad biológica debido a que
la sustitución del aa. provoca la alteración de la estructura secundaria y terciaria de la proteína:
por ejemplo, la aparición por mutación de una prolina en mitad de una a-hélice destruye esta
estructura, y puede originar inactivación de la función.
iv) La alteración del centro activo suele provocar inactivación total o parcial. NOTA: Aquí se
plantea la siguiente pregunta: si la mutación inactiva totalmente la capacidad funcional de la
proteína, ¿cómo podemos reconocer que esa proteína alterada está presente en la célula? La
proteína se puede identificar por medio de anticuerpos (Ac) obtenidos frente a la proteína
silvestre. Si ponemos en contacto estos Ac con un extracto de las células mutantes, se producirá
una reacción antígeno-anticuerpo. Las proteínas inactivas caracterizadas de esta manera se suelen
denominar como “CRM” iniciales de “cross-reactive material” (material que da reacción cruzada
respecto de la proteína silvestre).
b) mutaciones “sin sentido” (“nonsense”), o sea, aquellas que cambian un codón original a una
de las tres tripletas que significan “señal de parada” de la traducción:UAG (codón “ámbar”), UAA
(codón “ocre”), UGA (codón “ópalo”). Obviamente, el efecto de estas mutaciones sin sentido es
producir la detención de la lectura del ARNm por parte de los ribosomas. Por lo tanto se produce
una proteína truncada, que suele ser inactiva.
Base molecular: Suelen ocurrir en zonas del ADN con secuencias repetitivas. En este tipo de
secuencias, durante la replicación o la recombinación, se pueden producir malos alineamientos
por desplazamiento de una o varias copias de la secuencia repetitiva.
Ejemplo:
GTCCGTCCGTCCGTCC
CAGGCAGGCAGGCACC
Se produce un cambio total en el sentido del mensaje genético, a partir del sitio de la mutación se
sintetiza una proteína inactiva, a menudo truncada (debido a que al cambiar la pauta de lectura,
pueden aparecer tripletas sin sentido).
Si la pérdida es de 3 nucleótidos (o múltiplo de 3), y la pequeña delección no afecta a una zona
importante de la proteína, se puede producir un producto que aún tenga actividad biológica.
Base molecular: Formación de grandes bucles intracatenarios, con posterior escisión de dichos
bucles. Normalmente en los extremos del material que se va a delecionar existen secuencias de
ADN que son repeticiones directas una de otra, lo que facilita algún fenómeno de recombinación
que lleva a la eliminación del material (bucle) intercalado entre esas secuencias.
2.4 INVERSIONES
2.5 TRANSLOCACIONES
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desplazamientos de la pauta de lectura, que como antes indicamos, generan frecuentes señales de
fin de traducción;
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terminación de transcripción dependiente de Rho, con efectos polares (debido a que las IS llevan
frecuentes señales de terminación compleja de la transcripción, dependiente de r).
Una vez que ha ocurrido una inserción de una IS o de un Tn, pueden producirse ulteriores
delecciones secundarias de todo o de parte del elemento transponible, y a veces también
delecciones del material genético adyacente (fenómenos de escisión imprecisa del IS o Tn).
Por otro lado, dadas dos secuencias IS del mismo tipo, situadas a cierta distancia una de la
otra, por fenómenos de recombinación propiciados por dichas IS se pueden producir:
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translocaciones del material intercalado entre esas secuencias de inserción.
Repasemos algunos conceptos y términos que son igualmente de uso común en muchos
estudios de genética:
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mutaciones de alteración fenotípica que suponen la pérdida o la merma de alguna función que no
sea esencial para la viabilidad del organismo. Dentro de ellos están los mutantes condicionales (su
fenotipo alterado se manifiesta en determinadas circunstancias).
Las mutaciones condicionales (incluidas las condicionalmente letales) son muy útiles para
estudiar aquellos genes esenciales para la bacteria. En estos mutantes hay que distinguir dos tipos
de condiciones:
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condiciones permisivas: son aquellas bajo las cuales el producto del gen mutado es aún funcional.
mutantes sensibles al calor (termosensibles). Se suelen denominar con las siglas ts. El producto del
gen mutado es más sensible al calor que el producto silvestre
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mutantes suprimibles por supresores extragénicos (por ejemplo, por ARNt supresores, mutantes);
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Otro tipo de mutantes condicionales muy empleados en bacterias son aquellos con
mutaciones sin sentido. Como se recordará, cuando el ribosoma llega al codón sin sentido, se
detiene la traducción ulterior. Sin embargo, si esa bacteria tiene simultáneamente una segunda
mutación de tipo supresor extragénico, a saber, un ARNt mutante adecuado, se puede restablecer
el fenotipo silvestre (al menos parcialmente).
Para caracterizar genéticamente una mutación (es decir, para conocer qué tipo de mutación
es) se recurre normalmente a pruebas de reversión de cada mutante.
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Las mutaciones puntuales pueden revertir o ser suprimidas por una 2ª mutación (ver más
adelante, en este mismo capítulo).
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Las inserciones sólo pueden revertir por una delección exacta del material insertado.
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Por otro lado, las mutaciones generadas por elementos genéticos transponibles no aumentan su
frecuencia por tratamiento con agentes mutagénicos, mientras que el resto sí lo hacen.
4 TASA DE MUTACIÓN
NOTA 1: La tasa T de mutación espontánea es constante para cada división celular a distintas tasas
de crecimiento
Por ejemplo, se puede combinar un experimento de tipo de Luria y Delbrück con la distribución de
Poisson. Imaginemos que sembramos 20 tubos independientes con la misma cantidad inicial de
bacterias sensibles a la estreptomicina e incubamos el mismo tiempo en las mismas condiciones,
de modo que la N-N0 sea 5.6X108; imaginemos que en esa prueba de las fluctuaciones en 11 de
los 20 tubos no han surgido mutantes resistentes al antibiótico. De acuerdo con la aproximación
de Poisson a la distribución normal, la probabilidad de tener cero (0) mutaciones en un cultivo
sería:
P0 = m0·e-m/0!
P0 = 11/20 = 1·e-m/1
Y por lo tanto, podemos despejar y resolver el valor de m = -ln11/20 = 0.59. Ahora podemos
calcular la tasa de mutación:
T = 0.6·0.59/5.6X108 = 7.3·10-9
NOTA 2: Obsérvese que hemos definido la tasa de mutación respecto de un fenotipo. Esto significa
que aquellos fenotipos que dependan de varios genes tendrán tasas de mutación superiores a las
de aquellos que dependan de un solo gen. Por ejemplo, la tasa de mutación hacia auxotrofía para
la histidina o el triptófano (cuya biosíntesis depende de varios genes) está en torno a 10-7,
mientras que la tasa de mutación a resistencia a estreptomicina (que, como se recordará, depende
de la alteración del gen de la proteína ribosómica S12) es de sólo 10-10 o 10-11.
5 REVERSIBILIDAD DE LAS MUTACIONES BACTERIANAS
Las variaciones fenotípicas producidas por las mutaciones no-silenciosas son transmisibles a
la descendencia. Es decir, una vez producido el cambio, éste es permanente, pero no
necesariamente irreversible (como ya dijimos, solamente las grandes delecciones son
irreversibles).
La reversibilidad de las mutaciones suele deberse a una segunda mutación que restaura el
fenotipo original. Esta 2ª mutación puede ser de dos tipos principales, y varios subtipos:
1) Reversión (en sentido estricto), que restaura el genotipo original. Esto equivale a una
retromutación (“back-mutation”).
a) Supresión indirecta: no se corrige el producto del primer gen, pero la 2ª mutación anula las
consecuencias fenotípicas. Ejemplos:
i) Se abre una nueva vía para la síntesis del producto afectado por la 1ª mutación.
iii) Se provoca un cambio en el medio intracelular, que hace que el producto alterado de la
primera mutación vuelva a ser funcional.
b) Supresión directa: la 2ª mutación corrige el producto del primer gen mutado. Puede ser de
dos tipos principales:
2. Supresiones en el mismo codón que quedó afectado por la 1ª mutación, de modo que se
codifica un aminoácido distinto del silvestre y distinto del aa. del primer mutante, pero que
restaura la funcionalidad de la proteína. A este tipo de supresión se la denomina también
pseudorreversión.
Normalmente reconoce
ARNtSer
UCG
ARNtGln
CAG
ARNtTyr
UC
ARNtLys
AAG
b) El codón sin sentido UAA (“ocre”) puede ser suprimido por una versión mutante de ARNtGly
à GAA
c) Existen supresores más raros que suprimen mutaciones de sentido erróneo (“missense”):
Ejemplo: El ARNtGly cuyo anticodón es UCC, por mutación se convierte en un ARNt supresor cuyo
anticodón es UCU, que entonces reconoce al codón AGA (de la Arg). Por lo tanto, este supresor
inserta Gly frente a cada codón AGA.
a) mutaciones ram, que afectan a las proteínas S4 y S5 de la subunidad 30S del ribosoma, de
modo que éste puede suprimir una gran variedad de mutaciones sin sentido y por desfases. (El
nombre de ram corresponde a las iniciales de ribosomas ambiguos).
b) Mutaciones StrR: tienen afectada la proteína S12 del ribosoma. Hacen que las mutaciones sin
sentido sean menos defectuosas (“leaky” = débiles).
Cada supresor tiene una eficacia característica de supresión, que se refleja en la proporción
de cadenas polipeptídicas mutantes que son terminadas de forma normal (en lugar de quedarse
truncadas). Esta eficacia depende, esencialmente de:
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afinidad del aa-ARNt por el ribosoma, en competencia con los factores de terminación de
traducción que reconocen el mismo codón “sin sentido” (de parada de lectura).
Los supresores han de ser, por fuerza, poco eficientes, como para no hacer que la célula
muera por introducción de demasiados errores en la lectura de los ARNm normales (es decir, la
mayor parte de las veces, los supresores introducen el aminoácido correcto). Pero por otro lado,
han de ser suficientemente eficicientes como para poder introducir aminoácidos en codones
mutantes con la frecuencia adecuada para suprimir la mutación primaria. Normalmente, los
supresores típicos suprimen 5-10% de las veces. Es decir, la mayoría de las veces se introduce el
aa. correcto frente al codón correcto.
Anteriormente comentamos que el medio ambiente no induce mutaciones concretas (p. ej.,
el antibiótico no provoca la aparición de los mutantes resistentes). Ahora bien, lo que sí pueden
hacer determinadas condiciones ambientales es elevar la tasa global de aparición de mutaciones.
Determinados agentes ambientales físicos o químicos pueden dañar el ADN o interferir con
la maquinaria replicativa, de modo que provocan una mayor frecuencia de aparición de
mutaciones (y en este sentido hablamos de “mutaciones inducidas”). A dichos agentes se les llama
mutágenos o agentes mutagénicos. Así pues, en última instancia, los mutágenos causan alguna
alteración en el ADN que
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o bien es un daño tan extenso que sobrepasa la capacidad de los mecanismos celulares normales
de reparación (consultar en el tema 13 el apartado sobre “Mecanismos de Reparación de los
daños al ADN”).
6.1.1 RADIACIÓN UV
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50% T-T
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40% T-C
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10% C-C
Las mutaciones aparecen principalmente como consecuencia del mecanismo posreplicativo
de reparación propenso a error (o sea, el sistema SOS). Con menor frecuencia la luz UV ocasiona
hidratación de la C, lo que da origen a transiciones.
Tienen mayor poder de penetración que los rayos UV, pero son de difícil manejo, por lo que
se emplean poco en bacterias. Los rayos X ocasionan daños reparables por el sistema SOS.
Las radiaciones ionizantes (p. ej., rayos g) provocan labilizaciones en el ADN, que terminan
en roturas en las hebras del ADN (por ataque al enlace fosfodiéster), que finalmente pueden
conducir a delecciones.
3) Agentes alquilantes.
4) Agentes intercalantes, que se introducen en la doble hélice del ADN, entre pares de bases
consecutivas.
Son sustancias con una estructura en anillo similar a las bases naturales de los ácidos
nucleicos, pero con propiedades químicas diferentes. Como ejemplos tenemos:
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5-bromouracilo (5-BrU)
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2-aminopurina (2AP).
Estas moléculas entran a las células y son convertidas a los correspondientes “dNTP”, de
modo que su estructura les permite ser incorporados durante la replicación del ADN.
1) El 5-BrU es análogo de la T. Propicia transiciones T:A àG:C debido a que experimenta frecuentes
cambios tautoméricos desde su forma ceto a su forma enol:
BUceto:AàBUenol:G
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labilizan las bases, de modo que éstas espontáneamente se modifican químicamente con gran
frecuencia.
1) Ácido nitroso: provoca una desaminación oxidativa de A y C, lo que origina transiciones
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sobre A (6-aminopurina) à hipoxantina (HX) (6-oxopurina), que en su forma ceto se empareja con
la citosina: A:T à HXceto:C à G:C
Introducen radicales alquílicos en una cadena (los alquilantes monofuncionales) o en las dos
cadenas (los bifuncionales) del ADN, produciendo efectos letales y mutagénicos.
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Los efectos letales fueron estudiados en el capítulo 19 (“Acción de los agentes químicos”).
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Cl-CH2-CH2-S-CH2-CH2-Cl : di-(2-cloroetil)-sulfuro.
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etil-etano-sulfonato (EES): CH3-CH2-SO2-O-CH2-CH3
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Todos estos agentes, excepto la NTG, actúan tanto in vivo como in vitro. La NTG sólo actúa in
vivo, ya que su efecto lo ejerce sobre la horquilla de replicación del ADN. La NTG es uno de los
mutágenos más potentes que se conocen, pero es un agente “sucio”, en el sentido de que genera
varias mutaciones en la misma célula. Induce reparación SOS propensa a error, dando origen a
transiciones, transversiones y desfases del marco original del lectura.
Como hemos dicho, estos agentes originan un daño premutagénico principal consistente en
alquilación del O6 de la G. Ello provoca una gran distorsión en la doble hélice, que posteriormente
se plasma en transiciones del tipo G:C à A:T.
Sin embargo, muchas bacterias poseen un sistema específico para reparar las lesiones de la
O6-alquil-guanina, que funciona de la siguiente manera:
1) La bacteria posee una O6-alquil-glucosilasa, que rompe el enlace N-glucosídico entre la O6-
alquil-guanina y la desoxirribosa. Esto provoca la creación de un sitio apurínico (sitio AP).
2) El sitio AP es reconocido por una endonucleasa correctora (apurinasa), que rompe el enlace
fosfodiéster del lado 5' del sitio apurínico.
Se introducen entre los pares de bases del ADN, dando origen a pérdida o ganancia de
nucleótidos (o sea, generan mutaciones de cambio de la pauta de lectura del mensaje genético).
Estas sustancias son moléculas planares con 3 o 4 anillos conjugados, que presentan un cierto
parecido con los pares de bases del ADN, pero no se pueden incorporar covalentemente al
esqueleto de éste, sino que se intercalan entre dos pares de bases consecutivas, con lo que
provocan distorsiones de la doble hélice.
Algunos ejemplos:
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bullet
bullet
bullet
benzo-a-pireno
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aflatoxina-B1
Modifican purinas, provocando grandes lesiones en el ADN, que inducen el sistema SOS de
reparación, lo que finalmente implica reparación propensa a error. Las aflatoxinas son unas
micotoxinas (producidas por hongos, como Aspergillus).
Ames y sus colaboradores desarrollaron, a finales de los años 70, una prueba rápida,
sencilla y económica por la que se pueden ensayar compuestos como posibles carcinógenos. Su
base consiste precisamente en ver si son mutágenos frente a bacterias (es decir, se comprueba si
tras el tratamiento de un cultivo bacteriano con la sustancia en cuestión, aumenta la tasa de
aparición de mutantes.
TEST DE AMES
Usa una serie de cepas his- de Salmonella typhimurium, muy bien caracterizadas a nivel
genético-molecular.
1) Una suspensión de la bacteria se siembra masivamente (unas 108) en placas Petri que llevan
un medio mímino (MM) -por lo tanto, sin aminoácidos- .
3) Las placas se sacan de la estufa (a las 24 h., por ejemplo) y se cuentan las colonias surgidas en
cada placa, comparándolas con las colonias de una placa control que no llevaba la sustancia. Las
colonias habrán surgido por el crecimiento de bacterias que hayan experimentado reversiones
(=retromutaciones). Cada reversión en el alelo original his-- restituye el fenotipo silvestre His+, y
por lo tanto capacita a la bacteria a crecer y dividirse en el medio mínimo.
Si la prueba da resultado positivo (o sea, la sustancia induce altas tasas de mutación sobre
la bacteria), es muy probable que el compuesto ensayado sea también carcinógeno, por lo que
habrá que continuar estudiándolo a estos niveles. (El 90% de los compuestos que dan positivo en
el Test de Ames se ha demostrado que son carcinógenos).
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uso de cepas de Salmonella defectivas en reparación (uvrA--, uvrB--, uvrC--, etc). En estas cepas,
cualquier daño al ADN no puede ser corregido con total eficiencia. Esto hace que estas cepas sean
más sensibles frente a sustancias con menor potencial carcinogénico.
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Muchos agentes son mutágenos en humanos sólo tras su “activación” metabólica por el hígado,
pero son inactivas por sí mismas. Para detectar a estas sustancias, el test de Ames puede
modificarse incorporando un extracto microsomal estéril (fracción libre de células de hígado
animal o de cultivos de tejidos). El extracto microsomal posee oxigenasas que originan epóxidos a
partir de la sustancia a ensayar, y a su vez son estos derivados de tipo epóxido los que verifican la
acción mutagénica.
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Los rasgos culturales de las bacterias son muy fáciles de ver en los cultivos en placas de
Petri, por lo que igualmente es fácil detectar cambios en los aspectos de las colonias que pudieran
deberse a mutaciones. Antes de nada, vamos a describir brevemente tres tipos de colonias que
pueden darse en una misma especie:
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colonias S (lisas): son circulares, de borde liso o continuo; convexas obtusas (plano-convexas);
superficie lisa y brillante; se dispersan fácilmente en agua, dando suspensiones homogéneas.
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colonias M (mucosas): son parecidas a las S, pero son convexas más agudas; textura mucosa (al
cogerlas con asa de siembra, se arrastra un “moco”).
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colonias R (rugosas): a menudo presentan un borde ondulado o festoneado; son planas; textura
rugosa, y aspecto mate (no brillante); no se dispersan bien en agua, dando grumos más o menos
gruesos.
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En algunas bacterias se puede observar una disociación M à S, que se suele deber a la pérdida de
la capacidad de sintetizar cápsula.
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En estudios de genética bacteriana (p. ej., a la hora de elaborar mapas genéticos), es muy
habitual recurrir al empleo de mutantes auxotróficos (es decir, mutantes afectados en algún gen
de alguna ruta biosintética -de aminoácidos, bases nitrogenadas, vitaminas-). Por supuesto, estos
mutantes presentan interés por sí mismos, ya que su estudio permite “diseccionar” la base
genética de las vías metabólicas.
cultivo original à tratar con mutágeno à lavarà siembra placas de medio mínimo (MM)+
suplementos nutricionales à réplica a MM
Se comparan las colonias de la placa-matriz (medio con suplementos nutricionales) con las
colonias que hayan aparecido en la placa de réplica (carente de suplementos). La ausencia de
colonia en la placa de réplica en una posición en la que existe colonia en la placa-matriz incica que
la colonia de la placa matriz que no tiene “gemela” en la réplica es un mutante auxotrófico.
Una vez que sabemos que una colonia es un mutante auxotrófico, hay que determinar qué
requerimiento nutricional le hace falta (es decir, qué compuesto o compuestos no puede sintetizar
debido a la mutación). Para ello se realiza una sencilla prueba en placas de Petri, denominada
auxonograma.
Sin embargo, aun cuando tratemos a un cultivo con un agente mutagénico, la frecuencia de
aparición de un determinado fenotipo mutante es relativamente baja. Esto significa que en el
experimento anterior, tendríamos que sembrar y replicar numerosas placas con grandes números
de colonias, con objeto de alcanzar el umbral de probabilidad para detectar mutaciones
auxotróficas. Para solventar este inconveniente, se suele recurrir a una modificación del método
anterior basada en enriquecer en mutantes auxotrofos el cultivo tratado con el mutágeno:
ß
mezcla de bacterias muertas (p. ej., el 90% del cultivo inicial) + bacterias vivas, entre ellas unos
pocos mutantes de diversos tipos
la penicilina mata a los prototrofos, pero los auxotrofos no mueren, porque no crecen en MM
(muerte selectiva de los parentales prototrofos)
recuperar los auxotrofos de las placas de medio rico, y caracterizarlos (hacer auxonograma)
Los mutantes resistentes a antibióticos surgen por varios tipos de mecanismos, entre los
que se encuentran:
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alteración de algún gen que codifica una diana (sitio de unión) del antibiótico;
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Ambos tipos de mutantes son de muy amplio uso para “marcar” cepas bacterianas en
experimentos de genética (especialmente los que implican algún proceso de transferencia de
material genético desde una estirpe donadora a otra receptora). Estos marcadores genéticos
permiten seleccionar directamente la cepa que los porte añadiendo al medio de cultivo el
correspondiente agente selectivo (antibiótico o fago), que obviamente mata o inhibe el
crecimiento de las cepas sensibles.
Por ejemplo: si quisiéramos aislar mutantes Lac-- de E. coli, sembraríamos en Agar Mac Conckey.
Los mutantes Lac-- dan colonias transparentes, mientras que el fenotipo silvestre Lac+ da colonias
rojas opacas con un precipitado alrededor de sales biliares (recordar el uso de este medio en las
prácticas).
Como ya sabemos, los plásmidos son material genético extracromosómico que se replican
independientemente del cromosoma (replicones autónomos), y que no son indispensables para la
viabilidad de la bacteria que los posee. Hay plásmidos crípticos que no dan ningún fenotipo
detectable (función desconocida), pero existen muchos plásmidos que codifican funciones como
resistencia a antibióticos o a metales pesados, virulencia a plantas o animales, capacidad de fijar
nitrógeno atmosférico, etc.
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Tratamiento del cultivo con agentes químicos que se intercalan en el ADN, interfiriendo con la
replicación, estabilidad o reparto del plásmido a las células hijas (bromuro de etido, naranja de
acridina, etc.).
NOTAS
[1] Escherichia coli tiene un segmento de ADN invertido respecto de su pariente evolutivo
Salmonella typhimurium
[2] Algunas bacterias patógenas han sacado provecho adaptativo de su facilidad para revertir
mutaciones de desfase de lectura. Por ejemplo, el agente de la tosferina (Bordetella pertussis)
posee genes para algunos componentes de su envuelta cuya secuencia tiene abundantes
secuencias repetidas. Ello hace que se den frecuentes mutaciones de desfase y reversiones o
nuevas mutaciones. De esta forma, va esquivando la acción defensiva del sistema inmune del
huésped.
[3].- El bromuro de etidio (BrEt) se emplea rutinariamente para teñir los geles de electroforesis
de ADN y ARN. Los geles se tratan durante unos minutos con 1mg de BrEt, y luego se iluminan con
luz UV. El ADN se visualiza porque el BrEt intercalado en él produce una fluorescencia de color
anaranjado-rojizo.
Principal
A veces la PCR se usa para identificar determinados cambios en un gen o cromosoma que ayudan
a detectar y diagnosticar una afección genética o una enfermedad, como el cáncer. También se
usa para identificar trozos de ADN de determinadas bacterias, virus o microorganismos para
diagnosticar una infección. También se llama RCP y reacción en cadena de la polimerasa.
Durante una prueba de PCR, una pequeña cantidad de material genético de una muestra se copia
varias veces. El proceso de copia se conoce como amplificación. Si en la muestra hay patógenos, la
amplificación hace que sean mucho más fáciles de ver.
• El proceso de copia se repite varias veces. Después de una hora, se hacen miles de
millones de copias. Si hay un virus o un agente patógeno, eso se indica en la máquina
• Algunos virus, como el que causa COVID-19, están formados por ARN en lugar de ADN. En
estos virus, el ARN se debe transformar en ADN antes de copiarse. Este proceso se conoce como
PCR de transcripción inversa (rtPCR).
• Las pruebas de PCR y de rtPCR detectan la presencia de un patógeno. Otro tipo de prueba
de PCR conocida como PCR cuantitativa (qPCR) mide la cantidad de patógenos en la muestra. La
qPCR se puede hacer al mismo tiempo que la PCR o la rtPCR.
Del mismo modo, la cantidad total de cada tubo dependerá del volumen que se necesite, siempre
que se mantenga la relación 1/10 en cada tubo respecto al anterior.
De igual forma que la dilución de 1/10, el factor permite que se continúen secuencias, pero en
este caso como el factor es 2, la secuencia va de la siguiente forma: 1/2, 1/4, 1/8, etc.
En conclusión, la muestra (suero, plasma, reactivo, etc.) puede ser diluida con los dos tipos de
diluciones. Pero, hay que considerar si la muestra que se busca diluir va a tener un solo valor
exacto se puede realizar una dilución simple. O sino, se puede ahondar más realizando una
dilución seriada para obtener un resultados específico.