ICBClase 5.

Proteínas: unión peptídica, secuencia,

I. 2004.
conformación
Unidad 2
Clase 4
Docente: Alvaro Díaz

Las proteínas
Objetivo iv de la guía de estudio disponible
en el sitio web:
http://bilbo.edu.uy/~biol/estudiantes/guiaestudio/icb1/
Unidad2/unidad2_1.html
Las proteínas son polímeros de aminoácidos, es decir de moléculas que tienen
un grupo amino y un grupo ácido carboxílico

Un aminoácido:
la alanina
 Los aminoácidos que forman las proteínas son un subconjunto de los
aminoácidos, caracterizado porque el grupo amino y el carboxilo están unidos
al mismo átomo de C

Carbono “alfa”
H

H2N C COOH
Grupo Grupo carboxilo
amino R

Cadena lateral

El sustituyente llamado “cadena lateral” es que el distingue a cada uno de los 20

aminoácidos formadores de proteínas
 Las cadenas laterales de los
aminoácidos formadores de proteínas
tienen un amplio rango de propiedades
químicas diferentes
Los aminoácidos polimerizan a través de uniones amida, llamadas
en este contexto “uniones peptídicas”

A las moléculas formadas de

esta forma las llamamos
péptidos.

No todos los péptidos son

proteínas: las proteínas son
péptidos grandes (polipéptidos)
que tienen, como veremos más
adelante, una forma
(conformación) definida, y una
función biológica

Como explicamos antes, la condensación entre carboxilo y amino no es espontánea en el medio

acuoso: la reacción en realidad ocurre con un paso intermedio, que aquí no está mostrado
En los péptidos (incluyendo las proteínas) se puede distinguir un “esqueleto
principal” y múltiples “cadenas laterales”

Los péptidos y proteínas son polímeros

lineales. En un extremo hay un grupo
amino libre, y en el otro, un grupo
carboxilo libre (extremo amino y
extremo carboxilo).

La parte del péptido que proviene de

un aminoácido individual (menos
algunos átomos que se perdieron en la
condensación) se llama un residuo
aminoacídico.
 Cada péptido se caracteriza por su secuencia de residuos
aminoacídicos, la cual se escribe de extremo amino a extremo carboxilo

m d l y
 Un ejemplo de secuencia de una proteína ...
1 medtqyqfrv yavnkigysd psdvpdkhyp kdilippege ldadlrktli lragvtmrly 61 vpvkgrpppk itwskpnvnl rdrigldiks tdfdtflrce nvnkydagky iltlenscgk 121 keytivvkvl dtpgppvnvt vkeiskdsay
vtweppiidg gspiinyvvq krdaerksws 181 tvttecskts frvanleegk syffrvfaen eygigdpget rdavkasqtp gpvvdlkvrs 241 vsksscsigw kkphsdggsr iigyvvdflt eenkwqrvmk slslqysakd ltegkeytfr 301
vsaenengeg tpseitvvar ddvvapdldl kglpdlcyla kensnfrlki pikgkpapsv 361 swkkgedpla tdtrvsvess avnttlivyd cqksdagkyt itlknvagtk egtisikvvg 421 kpgiptgpik fdevtaeamt lkwappkddg
gseitnyile krdsvnnkwv tcasavqktt 481 frvtrlhegm eytfrvsaen kygvgeglks epivarhpfd vpdappppni vdvrhdsvsl 541 twtdpkktgg spitgyhlef kernsllwkr anktpirmrd fkvtgltegl eyefrvmain 601
lagvgkpslp sepvvaldpi dppgkpevin itrnsvtliw tepkydgghk ltgyivekrd 661 lpskswmkan hvnvpecaft vtdlveggky efriraknta gaisapsest etiickdeye 721 aptivldpti kdgltikagd tivlnaisil
gkplpkssws kagkdirpsd itqitstpts 781 smltikyatr kdageytita tnpfgtkveh vkvtvldvpg ppgpveisnv saekatltwt 841 ppledggspi ksyilekret srllwtvvse diqscrhvat kliqgneyif rvsavnhygk 901
gepvqsepvk mvdrfgppgp pekpevsnvt kntatvswkr pvddggseit gyhverrekk 961 slrwvraikt pvsdlrckvt glqegstyef rvsaenragi gppseasdsv lmkdaayppg 1021 ppsnphvtdt tkksaslawg kphydgglei
tgyvvehqkv gdeawikdtt gtalritqfv 1081 vpdlqtkeky nfrisainda gvgepavipd veiveremap dfeldaelrr tlvvraglsi 1141 rifvpikgrp apevtwtkdn inlknranie ntesftllii pecnrydtgk fvmtienpag 1201
kksgfvnvrv ldtpgpvlnl rptditkdsv tlhwdlplid ggsritnyiv ekreatrksy 1261 stattkchkc tykvtglseg ceyffrvmae neygigepte ttepvkasea psppdslnim 1321 ditkstvsla wpkpkhdggs kitgyvieaq
rkgsdqwthi ttvkglecvv rnltegeeyt 1381 fqvmavnsag rsapresrpv ivkeqtmlpe ldlrgiyqkl viakagdnik veipvlgrpk 1441 ptvtwkkgdq ilkqtqrvnf ettatstiln inecvrsdsg pypltarniv gevgdvitiq 1501
vhdipgpptg pikfdevssd fvtfswdppe ndggvpisny vvemrqtdst twvelattvi 1561 rttykatrlt tgleyqfrvk aqnrygvgpg itsacivany pfkvpgppgt pqvtavtkds 1621 mtiswhepls dggspilgyh verkerngil
wqtvskalvp gnifkssglt dgiayefrvi 1681 aenmagkskp skpsepmlal dpidppgkpv plnitrhtvt lkwakpeytg gfkitsyive 1741 krdlpngrwl kanfsnilen eftvsglted aayefrviak naagaispps epsdaitcrd 1801
dveapkikvd vkfkdtvilk ageafrlead vsgrppptme wskdgkeleg takleikiad 1861 fstnlvnkds trrdsgaytl tatnpggfak hifnvkvldr pgppegplav tevtsekcvl 1921 swfpplddgg akidhyivqk retsrlawtn
vasevqvtkl kvtkllkgne yifrvmavnk 1981 ygvgeplese pvlavnpygp pdppknpevt titkdsmvvc wghpdsdggs eiinyiverr 2041 dkagqrwikc nkktltdlry kvsglteghe yefrimaena agisapspts pfykacdtvf 2101
kpgppgnprv ldtsrssisi awnkpiydgg seitgymvei alpeedewqi vtppaglkat 2161 sytitglten qeykiriyam nseglgepal vpgtpkaedr mlppeielda dlrkvvtira 2221 cctlrlfvpi kgrpapevkw ardhgesldk
asiestssyt llivgnvnrf dsgkyiltve 2281 nssgsksafv nvrvldtpgp pqdlkvkevt ktsvtltwdp plldggskik nyivekrest 2341 rkaystvatn chktswkvdq lqegcsyyfr vlaeneygig lpaetaesvk aserplppgk 2401

diqscrhvat kliqgneyif rvsavnhygk 901

itlmdvtrns vslswekpeh dggsrilgyi vemqtkgsdk watcatvkvt eatitgliqg 2461 eeysfrvsaq nekgisdprq lsvpviakdl vippafkllf ntftvlaged lkvdvpfigr 2521 ptpavtwhkd nvplkqttrv naestennsl
ltikdacred vghyvvkltn sageaietln 2581 vivldkpgpp tgpvkmdevt adsitlswgp pkydggssin nyivekrdts tttwqivsat 2641 varttikacr lktgceyqfr iaaenrygks tylnseptva qypfkvpgpp gtpvvtlssr 2701
dsmevqwnep isdggsrvig yhlerkerns ilwvklnktp ipqtkfkttg leegveyefr 2761 vsaenivgig kpskvsecyv ardpcdppgr peaiivtrns vtlqwkkpty dggskitgyi 2821 vekkelpegr wmkasftnii dthfevtglv
edhryefrvi arnaagvfse psestgaita 2881 rdevdppris mdpkykdtiv vhagesfkvd adiygkpipt iqwikgdqel sntarleiks 2941 tdfatslsvk davrvdsgny ilkaknvage rsvtvnvkvl drpgppegpv visgvtaekc 3001
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hdyefrvsae naaglsepsp psayqkacdp 3181 iykpgppnnp kviditrssv flswskpiyd ggceiqgyiv ekcdvsvgew tmctpptgin 3241 ktnievekll ekheynfric ainkagvgeh advpgpiive ekleapdidl dlelrkiini 3301
raggslrlfv pikgrptpev kwgkvdgeir daaiidvtss ftslvldnvn rydsgkytlt 3361 lenssgtksa fvtvrvldtp sppvnlkvte itkdsvsitw epplldggsk iknyivekre 3421 atrksyaavv tnchknswki dqlqegcsyy
frvtaeneyg iglpaqtadp ikvaevpqpp 3481 gkitvddvtr nsvslswtkp ehdggskiiq yivemqakhs ekwsecarvk slqavitnlt 3541 qgeeylfrvv avnekgrsdp rslavpivak dlviepdvkp afssysvqvg qdlkievpis 3601
grpkptitwt kdglplkqtt rinvtdsldl ttlsikethk ddggqygitv anvvgqktas 3661 ieivtldkpd ppkgpvkfdd vsaesitlsw npplytggcq itnyivqkrd ttttvwdvvs 3721 atvarttlkv tklktgteyq frifaenryg
qsfalesdpi vaqypykepg ppgtpfatai 3781 skdsmviqwh epvnnggspv igyhlerker nsilwtkvnk tiihdtqfka qnleegieye 3841 frvyaenivg vgkasknsec yvardpcdpp gtpepimvkr neitlqwtkp vydggsmitg 3901
yivekrdlpd grwmkasftn vietqftvsg ltedqryefr viaknaagai skpsdstgpi 3961 takdevelpr ismdpkfrdt ivvnagetfr leadvhgkpl ptiewlrgdk eieesarcei 4021 kntdfkalli vkdairidgg qyilrasnva
gsksfpvnvk vldrpgppeg pvqvtgvtse 4081 kcsltwsppl qdggsdishy vvekretsrl awtvvasevv tnslkvtkll egneyvfrim 4141 avnkygvgep lesapvlmkn pfvlpgppks levtniakds mtvcwnrpds dggseiigyi 4201
vekrdrsgir wikcnkrrit dlrlrvtglt edheyefrvs aenaagvgep spatvyykac 4261 dpvfkpgppt nahivdttkn sitlawgkpi ydggseilgy vveickadee ewqivtpqtg 4321 lrvtrfeisk ltehqeykir vcalnkvglg
eatsvpgtvk pedkleapel dldselrkgi 4381 vvraggsari hipfkgrptp eitwsreege ftdkvqiekg vnytqlsidn cdrndagkyi 4441 lklenssgsk safvtvkvld tpgppqnlav kevrkdsafl vweppiidgg akvknyvidk 4501
restrkayan vsskcsktsf kvenltegai yyfrvmaene fgvgvpvetv davkaaepps 4561 ppgkvtltdv sqtsaslmwe kpehdggsrv lgyvvemqpk gtekwsivae skvcnavvtg 4621 lssgqeyqfr vkaynekgks dprvlgvpvi
akdltiqpsl klpfntysiq agedlkieip 4681 vigrprpnis wvkdgeplkq ttrvnveeta tstvlhikeg nkddfgkytv tatnsagtat 4741 enlsvivlek pgppvgpvrf devsadfvvi sweppaytgg cqisnyivek rdtttttwhm 4801
vsatvartti kitklktgte yqfrifaenr ygksapldsk avivqypfke pgppgtpfvt 4861 siskdqmlvq whepvndggt kiigyhleqk eknsilwvkl nktpiqdtkf kttgldegle 4921 yefkvsaeni vgigkpskvs ecfvardpcd
ppgrpeaivi trnnvtlkwk kpaydggski 4981 tgyivekkdl pdgrwmkasf tnvleteftv sglvedqrye frviarnaag nfsepsdssg 5041 aitardeida pnasldpkyk dvivvhaget fvleadirgk pipdvvwskd gkeleetaar 5101
meikstiqkt tlvvkdcirt dggqyilkls nvggtksipi tvkvldrpgp pegplkvtgv 5161 taekcylawn pplqdggani shyiiekret srlswtqvst evqalnykvt kllpgneyif 5221 rvmavnkygi geplesgpvt acnpykppgp
pstpevsait kdsmvvtwar pvddggteie 5281 gyilekrdke gvrwtkcnkk tltdlrlrvt glteghsyef rvaaenaagv gepsepsvfy 5341 racdalyppg ppsnpkvtdt srssvslaws kpiydggapv kgyvvevkea aadewttctp 5401
ptglqgkqft vtklkentey nfricainse gvgepatlpg svvaqeriep peieldadlr 5461 kvvvlrasat lrlfvtikgr pepevkweka egiltdraqi evtssftmlv idnvtrfdsg 5521 rynltlenns gsktafvnvr vldspsapvn
ltirevkkds vtlsweppli dggakitnyi 5581 vekrettrka yatitnnctk ttfrienlqe gcsyyfrvla sneygiglpa ettepvkvse 5641 pplppgrvtl vdvtrntati kwekpesdgg skitgyvvem qtkgsekwst ctqvktleat 5701
isgltageey vfrvaavnek grsdprqlgv pviardieik psvelpfhtf nvkareqlki 5761 dvpfkgrpqa tvnwrkdgqt lkettrvnvs ssktvtslsi keaskedvgt yelcvsnsag 5821 sitvpitiiv ldrpgppgpi ridevscdsi
tiswnppeyd ggcqisnyiv ekkettsttw 5881 hivsqavart sikivrlttg seyqfrvcae nrygkssyse ssavvaeypf sppgppgtpk 5941 vvhatkstml vtwqvpvndg gsrvigyhle ykerssilws kankiliadt qmkvsgldeg 6001
lmyeyrvyae niagigkcsk scepvpardp cdppgqpevt nitrksvslk wskphydgga 6061 kitgyiverr elpdgrwlkc nytniqetyf evteltedqr yefrvfarna adsvsepses 6121 tgpiivkddv epprvmmdvk frdvivvkag
evlkinadia grplpviswa kdgieieera 6181 rteiistdnh tlltvkdcir rdtgqyvltl knvagtrsva vnckvldkpg ppagpleing 6241 ltaekcslsw grpqedggad idyyivekre tshlawtice gelqmtsckv tkllkgneyi 6301
frvtgvnkyg vgeplesvai kaldpftvps pptsleitsv tkesmtlcws rpesdggsei 6361 sgyiierrek nslrwvrvnk kpvydlrvks tglregceye yrvyaenaag lslpsetspl 6421 iraedpvflp sppskpkivd sgkttitiaw
vkplfdggap itgytveykk sddtdwktsi 6481 qslrgteyti sglttgaeyv frvksvnkvg asdpsdssdp qiakereeep lfdidsemrk 6541 tlivkagasf tmtvpfrgrp vpnvlwskpd tdlrtrayvd ttdsrtslti enanrndsgk 6601
ytltiqnvls aasltlvvkv ldtpgpptni tvqdvtkesa vlswdvpend ggapvknyhi 6661 ekreaskkaw vsvtnncnrl sykvtnlqeg aiyyfrvsge nefgvgipae tkegvkitek 6721 psppeklgvt siskdsvslt wlkpehdggs
rivhyvveal ekgqknwvkc avaksthhvv 6781 sglrenseyf frvfaenqag lsdprelllp vlikeqlepp eidmknfpsh tvyvragsnl 6841 kvdipisgkp lpkvtlsrdg vplkatmrfn teitaenlti nlkesvtada gryeitaans 6901
sgttkafini vvldrpgppt gpvvisdite esvtlkwepp kydggsqvtn yillkretst 6961 avwtevsatv artmmkvmkl ttgeeyqfri kaenrfgisd hidsacvtvk lpyttpgpps 7021 tpwvtnvtre sitvgwhepv snggsavvgy
hlemkdrnsi lwqkanklvi rtthfkvtti 7081 sagliyefrv yaenaagvgk pshpsepvla idacepprnv ritdisknsv slswqqpafd 7141 ggskitgyiv errdlpdgrw tkasftnvte tqfiisgltq nsqyefrvfa rnavgsisnp 7201
sevvgpitci dsyggpvidl pleytevvky ragtsvklra gisgkpapti ewykddkelq 7261 tnalvcvent tdlasilikd adrlnsgcye lklrnamgsa satirvqild kpgppggpie 7321 fktvtaekit llwrppaddg gakithyive
kretsrvvws mvsehleeci itttkiikgn 7381 eyifrvravn kygigeples dsvvaknafv tpgppgipev tkitknsmtv vwsrpiadgg 7441 sdisgyflek rdkkslgwfk vlketirdtr qkvtgltens dyqyrvcavn aagqgpfsep 7501
sefykaadpi dppgppakir iadstkssit lgwskpvydg gsavtgyvve irqgeeeewt 7561 tvstkgevrt teyvvsnlkp gvnyyfrvsa vncagqgepi emnepvqakd ileapeidld 7621 valrtsviak agedvqvlip fkgrppptvt
wrkdeknlgs darysientd ssslltipqv 7681 trndtgkyil tiengvgepk sstvsvkvld tpaacqklqv khvsrgtvtl lwdpplidgg 7741 spiinyviek rdatkrtwsv vshkcsstsf klidlsektp fffrvlaene igigepcett 7801
epvkaaevpa pirdlsmkds tktsvilswt kpdfdggsvi teyvverkgk geqtwshagi 7861 sktceievsq lkeqsvlefr vfaknekgls dpvtigpitv keliitpevd lsdipgaqvt 7921 vrighnvhle lpykgkpkps iswlkdglpl
kesefvrfsk tenkitlsik nakkehggky 7981 tvildnavcr iavpitvitl gppskpkgpi rfdeikadsv ilswdvpedn gggeitcysi 8041 ekretsqtnw kmvcssvart tfkvpnlvkd aeyqfrvrae nrygvsqplv ssiivakhqf 8101
ripgppgkpv iynvtsdgms ltwdapvydg gsevtgfhve kkernsilwq kvntspisgr 8161 eyratglveg ldyqfrvyae nsaglsspsd pskftlavsp vdppgtpdyi dvtretitlk 8221 wnpplrdggs kivgysiekr qgnerwvrcn
ftdvsecqyt vtglspgdry efriiarnav 8281 gtisppsqss giimtrdenv ppivefgpey fdgliiksge slrikalvqg rpvprvtwfk 8341 dgveiekrmn meitdvlgst slfvrdatrd hrgvytveak nasgsakaei kvkvqdtpgk 8401
vvgpirftni tgekmtlwwd aplndgcapi thyiiekret srlawalied kceaqsytai 8461 klingneyqf rvsavnkfgv grpldsdpvv aqiqytvpda pgipepsnit gnsitltwar 8521 pesdggseiq qyilerrekk strwvkvisk
rpisetrfkv tgltegneye fhvmaenaag 8581 vgpasgisrl ikcrepvnpp gpptvvkvtd tskttvslew skpvfdggme iigyiiemck 8641 adlgdwhkvn aeacvktryt vtdlqageey kfrvsainga gkgdscevtg tikavdrlta 8701
peldidanfk qthvvragas irlfiayqgr ptptavwskp dsnlslradi httdsfstlt 8761 vencnrndag kytltvenns gsksitftvk vldtpgppgp itfkdvtrgs atlmwdapll 8821 dggarihhyv vekreasrrs wqvisekctr
qifkvndlae gvpyyfrvsa vneygvgepy 8881 empepivate qpapprrldv vdtskssavl awlkpdhdgg sritgyllem rqkgsdfwve 8941 aghtkqltft verlvektey efrvkaknda gysepreafs sviikepqie ptadltgitn 9001
qlitckagsp ftidvpisgr papkvtwkle emrlketdrv sitttkdrtt ltvkdsmrgd 9061 sgryfltlen tagvktfsvt vvvigrpgpv tgpievssvs aescvlswge pkdgggteit 9121 nyivekresg ttawqlvnss vkrtqikvth
ltkymeysfr vssenrfgvs kplesapiia 9181 ehpfgptkrs yqt

Si bien el ejemplo corresponde a una proteína “gigante” (más de 9000 residuos), la

mayoría de las proteínas tienen 100-1000 residuos
Considere las secuencias peptídicas:

WAGV
VGAW

Las secuencias corresponden a:

a. Moléculas iguales
b. Molécules diferentes, que al ser parcialmente o totalmente hidrolizadas dan
mezclas de moléculas iguales
c. Molécules diferentes, que al ser parcialmente hidrolizadas dan mezclas de
moléculas diferentes, pero al ser completamente hidrolizadas, dan mezclas de
moléculas iguales
d. Molécules diferentes, que al ser parcialmente o totalmente hidrolizadas dan
mezclas de moléculas diferentes
WAGV VGAW

Hidrólisis total: Hidrólisis total:

W, A, G, V W, A, G, V

Hidrólisis parcial: Hidrólisis parcial:

WAG VGA
AGV GAW
WA VG
GV AW
W, A, G, V W, A, G, V
 Para las 2 preguntas siguientes,
considere el péptido

De los átomos de C indicados como I y II, ¿cuál(es), si es que alguno es un Ca?

a. I solamente
b. II solamente
c. I y II
d. ni I ni II

¿Cuál de los átomos de N indicados de 1 a 4 corresponde al N-terminal del

péptido?

a. 1
b. 2
c. 3
d. 4
Cada secuencia de residuos aminoacídicos se corresponde con
una forma (y función) proteica

anplyqkhii sindlsrddl nlvlataakl

kanpqpellk hkviascffe astrtrlsfe
tsmhrlgasv vgfsdsants lgkkgetlad
tisvistyvd aivmrhpqeg aarlatefsg
nvpvlnagdg snqhptqtll dlftiqetqg
rldnlhvamv gdlkygrtvh sltqalakfd
gnrfyfiapd alampqyild mldekgiaws
lhssieevma evdilymtrv qkerldpsey
anvkaqfvlr asdlhnakan mkvlhplprv
deiatdvdkt phawyfqqag ngifarqall
alvlnrdlvl
 La secuencia determina la forma en que el péptido se pliega en
las tres dimensiones del espacio, es decir su conformación

DDDLVDAEGNLVENGGTYYLLP
HIWAHGGGIETAKTGNEPCPLT
VVRSPNEVSKGEPIRISSQFLS
LFIPRGSLVALGFANPPSCAAS
PWWTVVDSPQGPAVKLSQQKLP
EKDILVFKFEKVSHSNIHVYKL
LYCQHDEEDVKCDQYIGIHRDR
NGNRRLVVTEENPLELVLLKAK
SETASSH

La conformación está dada

sobre todo por cómo se
pliega el esqueleto principal,
que es lo único mostrado en
esta representación
stagkvikck aavlweekkp
fsieevevap pkahevrikm
vatgicrsdd hvvsgtlvtp
lpviagheaa givesigegv
ttvrpgdkvi plftpqcgkc
rvckhpegnf clkndlsmpr
gtmqdgtsrf tcrgkpihhf
lgtstfsqyt vvdeisvaki
daasplekvc ligcgfstgy
gsavkvakvt qgstcavfgl
ggvglsvimg ckaagaarii
gvdinkdkfa kakevgatec
vnpqdykkpi qevltemsng
gvdfsfevig rldtmvtals
ccqeaygvsv ivgvppdsqn
lsmnpmllls grtwkgaifg
gfkskdsvpk lvadfmakkf
aldplithvl pfekinegfd
llrsgesirt iltf
PLSPPTNLHLEANPDTGVLTVSWERSTTPDITGYRITTTPTNGQQGNSLEEVVHADQSSCTFDNLSPGLEYNVSVYTVKDDKESVPISDTIIPAVPP
PTDLRFTNIGPDTMRVTWAPPPSIDLTNFLVRYSPVKNEEDVAELSISPSDNAVVLTNLLPGTEYVVSVSSVYEQHESTPLRGRQKTGLDSPTGIDF
SDITANSFTVHWIAPRATITGYRIRHHPEHFSGRPREDRVPHSRNSITLTNLTPGTEYVVSIVALNGREESPLLIGQQSTVSDVPRDLEVVAATPTS
LLISWDAPAVTVRYYRITYGETGGNSPVQEFTVPGSKSTATISGLKPGVDYTITVYAVTGRGDSPASSKPISINYRT
DDDLVDAEGNLVENGGTYYLLP
HIWAHGGGIETAKTGNEPCPLT
VVRSPNEVSKGEPIRISSQFLS
LFIPRGSLVALGFANPPSCAAS
PWWTVVDSPQGPAVKLSQQKLP
EKDILVFKFEKVSHSNIHVYKL
LYCQHDEEDVKCDQYIGIHRDR
NGNRRLVVTEENPLELVLLKAK
SETASSH

Dijimos que la secuencia determina la forma en que la

cadena peptídica se pliega en el espacio, es decir la
conformación
 El tener conformación define a las proteínas funcionales; la
conformación se puede perder
Para que los polipéptidos sean útiles biológicamente, tienen que tener una conformación
definida

Son relativamente pocas las secuencias de dan lugar a conformación definida – la

evolución selecciona estas secuencias

Llamamos proteínas solo a los polipéptidos que tienen una conformación definida, y por
lo tanto una función biológica

Las proteínas pueden perder su conformación nativa. Pueden ser desnaturalizadas

¿Cómo es que
la secuencia
determina la
conformación?
Hay cadenas laterales aminoacídicas
polares e hidrofóbicas
Tres tipos de aminoácidos tienen cadenas laterales que son
polares porque se ionizan positivamente
Otros dos tipos de aminoácidos tienen cadenas laterales que son
polares porque se ionizan negativamente
 Y otros cinco tipos de
Con grupo alcohol Con grupo amida aminoácido tienen cadenas
laterales polares pero no
ionizables
Las restantes 10 cadenas laterales son no polares
 La conformación nativa es aquella que maximiza las interacciones
favorables entre grupos químicos de la cadena peptídica, así como
entre éstos y el agua

La cadena polipeptídica se pliega de forma que:

• puedan interaccionar los grupos químicos del propio polipéptido que tienen
afinidad entre sí

• puedan interaccionar con el agua los grupos químicos que tienen afinidad
por ella

• queden escondidos del agua los grupos químicos hidrofóbicos

Efecto
hidrofóbico
 Se dan interacciones entre grupos de la cadena peptídica por enlace de
hidrógeno, efecto hidrofóbico, enlace iónico, y fuerzas de Van de Waals

Interacciones
iónicas

Enlaces de
hidrógeno

Interacciones de Van der Waals

Enlaces iónicos, interacciones de Van der Waals, enlaces de hidrógeno

Los enlaces de hidrógeno son muy importantes en la estructura proteica
En los enlaces de hidrógeno intramoleculares de proteínas participan átomos
tanto cadenas laterales como del esqueleto principal
Clase 5. Proteínas: unión peptídica, secuencia,
conformación

Vocabulario y conceptos

Aminoácido
Carbono alfa
Unión peptídica (“enlace” peptídico)
Cadena lateral (aminoacídica)
Esqueleto principal (peptídico)
Secuencias (de residuos aminoacídicos)
Péptido
Proteína
Residuo aminoacídico
Extremo amino (amino- o N-terminal)
Extremo carboxilo (carboxilo- o C-terminal
Conformación (de proteínas)
Conformación nativa o plegamiento nativo