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Descripción de utilidad del producto
La diabetes es una enfermedad que se presenta cuando el nivel de glucosa en la sangre
(también conocido como azúcar en la sangre) es demasiado alto. La insulina es una
hormona peptídica (Olivares & Arellano, 2008) que se libera de las células β en el islote de
Langerhans (también conocido como islote pancrático), esta ayuda a regular el nivel de
glucosa en la sangre, además regula el metabolismo de carbohidratos, lípidos y proteínas,
también, promueve la división y crecimiento celular, esto, por medio de su transporte y
almacenamiento en las células, dadas diversas señales por medio del receptor de
membrana celular específico, IR (Olivares & Arellano 2008).
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Planteamiento del problema
Actualmente la insulina se produce predominantemente en E. coli debido a que su
metabolismo es simple y no tiene requerimientos nutricionales. La producción va dirigida
específicamente a la molécula BL-21 (DE3), por su alta densidad celular y reducción
significativamente de costos de incubación. Actualmente la alta demanda en pacientes
que padecen de diabetes tipo 1 o 2 exige requerimiento de insulina en grandes
cantidades, por lo que se busca obtener una planta con una producción de 80 g/L de
materia prima, (E. coli BL21 (DE3) con una pureza del 98%. La producción requiere de una
alimentación de 20 L de medio de cultivo en una fermentación discontinua (batch),
obteniendo 4 g/L de masa celular seca a partir de una biomasa inicial de 7 g. (Baeshen et
al, 2014).
Proceso general de producción considerando las etapas desde la materia prima hasta
el tratamiento de desechos.
Materia prima
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Buffer 150 mM sulfato de sodio que contiene 25% acetonitrilo y 20 mM ácido
cítrico a pH 3.5.
Buffer de elución 100 mM Tris pH 9.5.
Buffer 200 mM sulfato de sodio, pH 2.3 con combinación de acetonitrilo (buffer A
contiene 10% acetonitrilo y el solvente B contiene 50% acetonitrilo).
Ácido cítrico.
Ácido clorhídrico.
Cloruro de sodio.
Hidróxido de sodio.
Ácido citracónico.
Peróxido de hidrógeno.
Carboxipeptidasa-B.
Cloruro de zinc.
Equipos requeridos:
Proceso de producción
Para la producción de insulina recombinante posterior a la obtención del vector, se
consideran 8 etapas: fermentación, homogeneización, recuperación, concentración,
purificación, pulido, secado y almacenamiento.
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Al ser una molécula difícil de conseguir en cantidades abundantes la planta industrial se
acoplaría producciones pequeñas, es decir, no requerirá de instalaciones y equipos
grandes, lo que permitirá reducir costos de operación.
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10. Incubación 1: adición de anhídrido citracónico por goteo a la proinsulina replegada
(2 g/g de proteína), y mantenimiento de pH a 8.5 por adición de NaOH 6 M, adición
de peróxido de hidrógeno 10 mM, incubación por 2 h a temperatura ambiente.
11. Incubación con agitación 2: adición carboxipeptidasa-B a concentración 1:2000
(peso/peso), incubación por 6 h a temperatura ambiente.
12. Incubación 2: ajuste de pH a 2 por adición de HCl 0.1 M por 6 h a temperatura
ambiente.
13. Cromatografía de intercambio catiónico 2: solución anterior cargada en resina
empaquetada SP-Sefarosa FF en una columna XK 50 conectada a purificador Akta.
Elución por 150 mM sulfato de sodio que contiene 25% acetonitrilo y 20
mM ácido cítrico a pH 3.5.
14. RP-HPLC: fracciones cargadas en columna YMC DAC 50 mm (50 x 250 mm)
empacada con resina YMC-Triart C8 (tamaño de partícula 10 µm), la cromatografía
es ejecutada utilizando buffer 200 mM sulfato de sodio, pH 2.3 con combinación
de acetonitrilo. El buffer A contiene 10% acetonitrilo y el solvente B contiene 50%
acetonitrilo a un flujo de 75 cm/h.
La proteína es eluida aplicando un gradiente linear de 35.0%-38.0% B en 6
volúmenes de columna y monitoreadas a 280 nm.
15. Precipitación: 1.0% cloruro de zinc (peso/peso)
16. Centrifugación 5: 5000 g por 20 minutos.
17. Liofilizado: 20 pascales de vacío por 24 h.
18. Almacenamiento: polvo -30°C.
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Diagrama de procesos simple
Materia
prima
Aire
Inoculo
Secado Almacenamiento
Redacción propuesta
El proceso propuesto de downstream y purificación del producto se expone en el artículo
“Industrial Scale Production of Recombinant Human Insulin using Escherichia coli BL-2”,
con ligeras adecuaciones para cálculos de las etapas como lo son rendimientos y flujos,
igualmente, los vectores y microorganismos para la transformación de cepas.
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La ruta metabólica que utiliza principalmente E. coli para crecer es glucolisis sin embargo
es importante destacar que es un microorganismo anaerobio facultativo y produce gases
de la fermentación de carbohidratos (Percival & Williams, 2014).
La cepa BL21 es preferida en el ámbito industrial, además de carecer de las proteasas Lon
y Omp-t (lo cual reduce considerablemente la degradación de la proteína dentro de la
bacteria), produce bajas cantidades de acetato, lo cual resulta estratégico (Lara, 2011).
Ruta metabólica
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reacciones incluidas que consumen ATP no han tenido intercambio redox.
(Madigan et al, 2015).
Etapa 2: producción de NADH, ATP y piruvato.
La primera reacción redox de la glicolisis se produce en la etapa II, durante la
oxidación de gliceraldehido-3-fosfato a ácido 1,3-bifosfoglicérico. En esta reacción
(que se lleva a cabo dos veces, una por cada molécula de gliceraldehido-3-fosfato
producido a partir de glucosa), la enzima de gliceraldehido-3-fosfato
deshidrogenasa, reduce su coenzima NAD + a NADH. Simultáneamente, cada
molécula de gliceraldehido-3-fosfato es fosforilada por adición de una molécula de
fosfato inorgánico. Esta reacción, en la que el fosfato inorgánico pasa a estar en
forma orgánica, prepara el escenario para conservación de energía. La formación
de ATP es posible porque el ácido 1,3-bifosfoglicérico es un compuesto de alta
energía. Así, se sintetiza ATP cuando cada molécula de ácido 1,3-bifosfoglicérico se
convierte en ácido 3-fosfoglicérico, y cada molécula de fosfoenolpiruvato se
convierte en piruvato. (Madigan et al, 2015).
Durante la etapa I y II de la glicólisis se consumen dos moléculas de ATP y se
sintetizan cuatro moléculas de ATP. Por tanto, el rendimiento neto de energía de la
glicolisis es de dos moléculas de ATP por molécula de glucosa fermentada.
(Madigan et al, 2015).
En la glucolisis hay dos enzimas clave que regulan la dirección del flujo de carbono:
fosfofructocinasa y fructosa 1,6 bisfosfato fosfatasa. Que catalizan reacciones
fisiológicamente irreversibles.
Cuando ADP y AMP son altos, los niveles de ATP son bajos.
AMP inhibe a fructosa 1,6 bisfosfato fosfatasa en su reacción, por eso los niveles
de ATP son bajos, la célula no tiene necesidad de producir energía, por tanto, la
glucolisis es de baja velocidad.
Se tendrá más G6P si no hay demanda energética. Una vez que baje la
concentración de G6P se dejará de inhibir la reacción.
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Se ve inhibida por el citrato y el ATP en exceso, se bloquea y ese exceso se utiliza
para sintetizar otras moléculas.
El ATP en exceso favorece la formación de ácidos grasos y síntesis de biomasa.
Mientras se forman otras moléculas y bajan los niveles de intermediarios y ATP, la
glucolisis es lente, cuando los niveles vuelven a la normalidad, entonces la
velocidad de la glucolisis también.
La G6P va a la vía de las pentosas, para producción de NADP NADPH para
síntesis de ácidos grasos, ácidos nucleicos, síntesis de pared celular y otros
intermediarios (aminoácidos) exceso de ATP.
Producción de Insulina
La insulina es un polipéptido con actividad hormonal formado por 51 residuos de
aminoácidos. Su peso molecular es de aproximadamente 5.8 kDa (insulina humana) y está
compuesta por dos cadenas de aminoácidos (A y B) unidas por puentes disulfuro. La
cadena A tiene 21 aminoácidos, y la cadena B 30 (García Reyes, 2018), que se puede
representar en la siguiente figura.
La insulina está compuesta por los aminoácidos: glicina (Gly), isoleucina (Ile), valina (Val),
glutamato (Glu), glutamina (Gln), treonina (Thr), cisteína (Cys), serina (Ser), leucina (Leu),
tirosina (Tyr), aspartato (Asn), fenilalanina (Phe), prolina (Pro), histidina (His), lisina (Lys),
arginina (Arg) y alanina (Ala), que se derivan de intermediarios del metabolismo central
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del carbono de la bacteria que sería glucolisis, asumiendo que G6P también va a vía de las
pentosas, y esta también sigue su curso por la glucolisis hasta llegar al Ciclo de Krebs por
tanto, se entiende que esta es la ruta que debe seguir en orden para generar insulina en la
maquinaría ribosomal como se ilustra en la siguiente imagen.
Ilustración 3. Metabolismo central del carbono y precursores de moléculas (Noor, Eden, Milo & Alon, 2010).
Ilustración 4. Metabolismo central del carbono y precursores de moléculas (Noor, Eden, Milo & Alon, 2010).
Se asume que gracias a la ruta central (glucolisis) que sigue E. coli como microorganismo
anaerobio facultativo se generan los precursores de aminoácidos necesarios para la
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síntesis de insulina en cuerpos de inclusión, siguiendo los mismos puntos de control que
una glucolisis en un organismo no recombinante.
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limitación por oxígeno (Lara, 2011). Por ejemplo, en la cepa E. coli VH32, con sistema de
glucosa modificado, PEP no es consumido durante el transporte de glucosa, por la tanto,
la reducción de PEP intracelular se espera ser menos dependiente de consumo especifico
de glucosa que a su vez provee más PEP disponible para las rutas de biosíntesis como
biomasa y producción de proteínas recombinantes. Por tanto, el lento transporte de VH32
evidenciado por una tasa de consumo de glucosa más bajo, mantiene un metabolismo
más balanceado (Lara et al, 2008).
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Esto permite tener más PEP disponible para funciones biosintéticas, también, tiene un
mayor flujo de carbono hacía la vía de las pentosas fosfato, que incrementaría la cantidad
de precursores de ácidos nucleicos para mantener una mayor de plásmido (Lara, 2011).
Para una mayor afinidad de codones de la cepa modificada se deben planear los
constructos en simuladores de genes como AmplifX, para posteriormente pasar a una
optimización de codones adecuada para la cepa bacteriana de acuerdo con la preferencia
por la traducción de estos.
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Operones inducibles catabolitos (Oiseth, Jones & Maza, 2022):
Los operones que están apagados en el estado “normal” y se encienden bajo
ciertas condiciones. Por ejemplo, el operón lac, cuando la glucosa no está
disponible o hay lactosa presente, la presencia de esta induce al operón lac.
Región codificante: contiene genes que participan en el metabolismo de la
lactosa.
La región reguladora codifica para un represor y un activador (proteína
activadora de catabolitos).
Regulación génica a través del represor lac catabolitos (Oiseth, Jones & Maza,
2022):
La lactosa impide la unión del represor a la secuencia del operador.
En presencia de lactosa el represor es incapaz de unirse, por tanto, se
produce la transcripción de los genes.
Cuando no hay lactosa el represor se une a la secuencia operadora y se
inhibe la transcripción porque se bloquea la ARN polimerasa.
Regulación de genes a través de la proteína activadora por catabolitos (Oiseth,
Jones & Maza, 2022):
Cuando la glucosa es baja: se produce la proteína activadora por
catabolitos se une a la región potenciadora y activa/acelera la
transcripción.
Cuando la glucosa es abundante: no se produce la proteína activadora por
catabolitos no se potencia la transcripción.
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Con esto en mente se tiene claro que en el planteamiento de la mejora genética se deben
tener operones útiles para la inducción y síntesis de insulina. Esto por medio de la
regulación de los genes responsables de síntesis de aminoácidos.
En el caso de regulación de síntesis cinética no aplica, ya que no sé está buscando regular
la velocidad en la que suceden las reacciones, ya que no son catalizadas por enzimas, más
bien son temas que tienen que ver con la regulación genética de la bacteria.
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inmovilizado, pues la histidina ayudará a marcar la proteína de fusión de proinsulina, con
el fin de obtener una forma soluble, con un alto grado de pureza y en gran cantidad.
Una de las formas en las que se evaluaría si la cepa fue modificada correctamente es por
medio de su gen de resistencia a kanamicina, entonces esta se mostrará en el cultivo.
BALANCE ESTEQUIOMETRICO:
5.58-C-5.58
12.7-H-12.8
12.54-O-12.54
0.5-N-0.5
18
0.1-K-0.1
0.05-P-0.05
Reactivos:
Glucosa
180.156 g GLU
( 0.93 moles )=167.54 g GLu
1mol
Amoniaco
17.031 g NH 3 1
1 mol 2 ( )
moles =8.51 g N H 3
Oxigeno molecular
32 g O2
( 3.38 moles )=108.16 g O2
1 mol
Productos:
Biomasa
26.32 g Biomasa
( 2 moles )=52.64 g biomasa
1 mol
Agua
18.015 g H 2 O
( 4.32 moles ) =77.82 g H 2 O
1 mol
CO2
44.01 g C O 2
(3.58 moles )=157.55 g C O2
1 mol
KH2
174. g K H 2
( 0.1 moles )=17.42 g K H 2
1 mol
RENDIMIENTO DE BIOMASA
X 52.64 g
Y = =0.314=31.4 %
S 167.54 g
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Balance de masa teórico para la producción del metabolito
𝟕𝟗 𝑪𝟔 𝑯𝟏𝟐 𝑶𝟔 + 𝟏𝟓𝑶𝟐 + 𝟏𝟐𝑪𝟓 𝑯𝟏𝟏 𝑵𝑶𝟐 𝑺 + 𝟏𝟏𝟖𝑵𝑯𝟑 → 𝟐𝑪𝟐𝟓𝟕 𝑯𝟑𝟖𝟑 𝑵𝟔𝟓 𝑶𝟕𝟕 𝑺𝟔 + 𝟑𝟑𝟒𝑯𝟐 𝑶 + 𝟐𝟎𝑪𝑶𝟐
BALANCE ESTEQUIMETRICO
534-C-534
1434-H-1434
528-O-528
130-N-130
12-S-12
Relación sustrato-producto: 79 glucosa: 2 producto
Reactivos:
Glucosa
180.156 g GLU
( 79 moles )=14,232.32 g Glu
1mol
Metionina (sal del medio)
149.21 g C5 H 11 N O 2 S
( 12mol )=1,790.52 g metionina
1 mol
Oxígeno molecular
32 g O2
( 15 moles )=480 g O2
1 mol
Amoniaco
17.031 g N H 3
( 118 moles )=2,009.65 g N H 3
1 mol
Productos:
Insulina recombinante
5807.62 g insulina
( 2moles )=11,615.24 g insulina
1 mol
Agua
18.015 g H 2 O
( 334 moles )=6015.01 g H 2 O
1 mol
CO2
44.01 g C O 2
( 20 moles )=880 g C O2
1 mol
RENDIMIENTO DE PRODUCTO
20
P 11,615.24 g
Y = =0.816=81.61 %
S 14,232.32 g
Tabla 2. Comparación de valores obtenidos / utilizados en proceso industrial para el metabolismo de insulina recombinante
Como se puede observar los valores obtenidos a partir de balance de masa teórico son
totalmente diferente a los obtenidos en la literatura y simuladores, algunos son mayores y
otros menores, sin embargo, esto se debe a que el balance de masa permite evaluar cada
uno de los compuestos y sus cantidades requeridas de materiales brutos y de productos
obtenidos, además, al ingresar más fuente de carbono nuestra producción será mayor, sin
embargo, el balance de materia no toma en cuenta la cantidad que la cepa Escherichia
Coli BL21 es capaz de ingerir, por lo que tenemos valores mayores en comparación con los
propuestos por la literatura. Es por ello, que podemos decir que los rendimientos de
biomasa son menores en el balance de masa teórico, pues no considera la capacidad de la
bacteria y su productividad al darle grandes cantidades de fuente de carbono (glucosa),
mientras que la literaria se usan gramos que la bacteria podrá tomarlos y usarlos para una
mayor productividad sin que corra riesgos de excretar acetato como un metabolito de
desbordamiento debido a un desequilibrio entre la captación de glucosa y el metabolito
central (Steinsiek, et al,. 2012).
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Justificación del sistema de cultivo a utilizar considerando el comportamiento
metabólico del sistema biológico, velocidad de crecimiento, velocidad especifica
producción del metabolito, velocidad específica del consumo de sustrato, curva de
crecimiento donde se indique comportamiento de la biomasa, sustrato y producto en
función del tiempo.
Sistema de cultivo
El medio de cultivo a utilizar es TB modificado junto con kanamicina. Dicho medio está
formado por nutrientes que permitan obtener una adicción controlada de sustrato en
el fermentador, así como un mayor rendimiento y productividad de la bacteria
seleccionada. En la siguiente tabla (3) se menciona cada uno de sus elementos con
cantidades recomendadas (Baeshen, et al., 2014)
Velocidad de crecimiento
La velocidad de crecimiento fue establecida a partir de la recopilación de datos, donde
señalan que la bacteria Escherichia coli es capaz de producir insulina recombinante al
1
citoplasma a partir de una tasa de crecimiento de entre 0.08−0.12 , por lo que se
h
1
seleccionó una de 0.10 , pues a partir del simulador, comprobamos que es benéfico para
h
la producción del metabolito manteniendo un equilibrio de biomasa-producto en corto
tiempo. (Baeshen, et al.2014).
Curva de crecimiento
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Los datos propuestos surgen de investigaciones de artículos y revistas científicas. Iniciando
con una concentración de biomasa inicial del cultivo ( x 0) de 7 g y con una μ=0.1h−1
(Baeshen, N. A, et al.2014). Fue establecida la con la siguiente formula en un tiempo
logarítmico de 24 horas.
Dando los siguientes resultados mostrados en la tabla 4-5 y representados en la gráfica de
fase logarítmica (ilustración 8).
Baeshen, N. A., Baeshen, M. N., Sheikh, A., Bora, R. S., Ahmed, M. M., Ramadan, H. A.,
Saini,
growth factor I fusion protein in Escherichia coli by the coexpression of the down-
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