Planeación del Docente en línea

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Genética Molecular Bacteriana
Unidad 3

Ingeniería en Biotecnología
Bloque 2 Semestre 2022-1

Unida

Universidad Abierta y a Distancia de México | DCSBA 3

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Nombre del docente: M.B. Yajaira Sulim Vigueras-Morales

Correo del docente: yajaira.vigueras@nube.unadmexico.mx

Matrícula: DL19VIMY00040

Asignatura: Genética Molecular Bacteriana

Unidad: U.3 “Obtención de proteínas recombinantes”.

Competencia general de asignatura:

Asociar el flujo de información genética con diseños biotecnológicos mediante el

análisis de estrategias moleculares para la obtención de bacterias genéticamente
modificadas.

Competencia específica de la unidad:

Aplicar estrategias de regulación genética y de purificación de proteínas mediante

el uso de tecnologías moleculares para la obtención de proteínas recombinantes.

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Secuencia de trabajo:

1. Lee el contenido de la unidad 3.

2. Revisa la planeación docente de la unidad 3.
3. Entra al Foro de Dudas U3.
4. Revisa los materiales de apoyo.
5. Participa en la actividad 1: Foro U3 “Regulación de la expresión génica”.
6. Elabora y envía la actividad 2: “Purificación de proteínas recombinantes”.
7. Elabora y envía la actividad 3: Evidencia de aprendizaje “Obtención y
purificación de la insulina mediante Escherichia coli”.
8. Elabora y envía la actividad 4: “Autorreflexiones U3”.
9. Elabora y envía la actividad 5: Asignación a cargo del docente en línea
“Obtención de proteínas recombinantes”.

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Actividad 1. Foro U3 “Regulación de la expresión génica”.

Fecha de entrega: domingo 29 de mayo antes de las 23:50 h.

Instrucciones

1. Lee el contenido de la unidad 3.

2. Investiga cómo se lleva a cabo la expresión génica a través del operón de la lactosa
y el operón del triptófano.
3. Diseña dos infografías en Canva (https://www.canva.com/), en la primera debes
explicar cómo funciona el operón de la lactosa y en la segunda explicar cómo funciona
el operón del triptófano, cada infografía debe contener lo siguiente:
a) Definición del operón
b) Genes que componen al operón
c) Cómo se lleva a cabo la inducción del operón, cuáles son los sustratos y enzimas
que se ven involucrados en el proceso
d) Utilidad del operón en la biotecnología
4. Participa en el foro compartiendo las dos infografías directamente en el foro, o bien
compartir la liga de acceso a tus infografías.

5. Retroalimenta a dos de tus compañeros de manera enriquecedora, compartiendo

tu postura referente al proceso y funciones de los operones de la lactosa y del
triptófano.
6. Cuida la redacción y tu ortografía.
7. Cita las referencias en formato APA.
8. Coloca la bibliografía correspondiente en cada infografía al final de la misma.

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Criterios de evaluación:

Materiales de apoyo:
• Claros, G. (s.f). El operón de la lactosa en E. coli. Disponible en:
http://www.biorom.uma.es/contenido/av_bma/apuntes/T10/opeLac.html
• Merino-Pérez, J., y Noriega-Borge, M.J. (s.f). Regulación de la expresión genética.
Disponible
en:https://ocw.unican.es/pluginfile.php/879/course/section/967/Tema%25208-
Bloque%2520I-Regulacion%2520Genetica.pdf
• Rojo-Carlón, J.M. (2018). Tutorial para hacer una infografía en Canva. [Video de
YouTube]. Disponible en:
https://www.youtube.com/watch?v=uGzVpZHWQzc&t=16s
• Xie, Y., y Reeve, J. N. (2005). Regulation of tryptophan operon expression in the
archaeon Methanothermobacter thermautotrophicus. Journal of bacteriology.
187(18): 6419–6429. Disponible en:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC1236654/

Software de apoyo:
• No aplica.

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Actividad 2. Entregable “Purificación de proteínas recombinantes”.

Fecha de entrega puntual: miércoles 01 de junio antes de las 23:50 h.
Fecha de entrega tardía: miércoles 08 de junio antes de las 23:50 h.

Instrucciones

1. Revisa los temas y subtemas de la unidad 3.

2. Investiga un artículo científico donde se describa el procedimiento y aplicación de
la recuperación de proteínas bioactivas de cuerpos de inclusión.
3. Elabora un documento de texto en formato PDF, en letra Arial 11, texto justificado,
máximo 6 cuartillas (con portada incluida), interlineado sencillo que incluya lo
siguiente:
a) Portada con los siguientes elementos: nombre completo de la universidad,
carrera, nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la
actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la actividad
(evita colocar los logos de la universidad y carrera).
b) Elabora un diagrama donde describas cómo se lleva a cabo la purificación de
los cuerpos de inclusión de la bacteria de tu interés. Tu diagrama debe describir
de manera clara y ordenada cada una de las etapas.
c) Describe cuál es la aplicación de la purificación de cuerpos de inclusión y qué
proteína se pudo activar con el procedimiento que describiste en el diagrama
anterior.
d) Diseña un cuadro informativo donde describas la definición, fundamento,
ventajas y desventajas, y aplicación (dirigida a la purificación de las proteínas
recombinantes), de la cromatografía de exclusión, cromatografía por
intercambio iónico y cromatografía de afinidad.
4. Cuida la ortografía y redacción. No olvides citar las fuentes en formato APA.
5. Guarda la actividad con la nomenclatura BGMB_U3_A2_XXYZ. (Sustituir las “XX” por
las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer apellido y
la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
6. Sube la actividad al apartado de tareas correspondiente.

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Criterios de evaluación:

Materiales de apoyo:

• Amer, H.E.A. (2019). Purification of Proteins: Between Meaning and Different

Methods. Proteomics Technologies and Applications. Disponible en:
https://www.intechopen.com/books/proteomics-technologies-
andapplications/purification-of-proteins-between-meaning-and-
differentmethods.
• Medicilon. (2019). Comparison of protein purification methods and their
advantages and disadvantages. Disponible en:
http://www.medicilon.com/comparison-of-protein-purificationmethods-and-
their-advantages-and-disadvantages/.
• Singh, A., Upadhyay, V., Upadhyay, A.K. (2015). Protein recovery from inclusion
bodies of Escherichia coli using mild solubilization process. Microb Cell Fact: 14,
41. Disponible en:
https://microbialcellfactories.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12934-015-
0222-8#citeas

Software de apoyo:

• No aplica.

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Actividad 3. Evidencia de aprendizaje “Obtención y purificación de insulina

recombinante mediante Escherichia coli”.
Fecha de entrega puntual: domingo 05 de junio antes de las 23:50 h.
Fecha de entrega tardía: domingo 12 de junio antes de las 23:50 h.

Instrucciones:
1. Elabora un documento de texto en formato PDF, en letra Arial 11, texto justificado,
interlineado sencillo, que contenga lo siguiente:
a) Portada con los siguientes elementos: nombre completo de la universidad,
carrera, nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la
actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la actividad
(evita colocar los logos de la universidad y carrera).
b) Elabora protocolo de investigación donde describas las etapas completas para
la obtención de insulina recombinante expresada en Escherichia coli:
i) Título de tu protocolo
ii) Introducción: describe cuál es la importancia de la insulina y su obtención
como proteína recombinante
iii) Objetivo: describe el qué se hará en tu investigación, cómo y para qué, el
enfoque debe ser en la investigación.
iv) Metodología: describe las etapas para la obtención de la insulina, debes
basarte en artículos científicos, donde puedas observar que explican a
detalle cada etapa, desde la identificación del gen hasta la purificación de la
proteína.
c) Ingresa al siguiente software en línea y realiza la purificación de la proteína 3
proteínas de la mezcla “Example_Mixture”:
http://www.agbooth.com/pp_ajax/index.html?locale=es
i) Purifica la proteína iniciando con un método de baja resolución
(precipitación, tratamiento por calor o filtración en gel), seguido de uno de
alta resolución (cromatografía). Recuerda que el objetivo de la purificación
es que puedas quitar las demás proteínas de la mezcla, dejando solo a la
proteína 3.
ii) Coloca las capturas de pantalla de la tabla inicial, la tabla final (donde se
muestre las técnicas que utilizaste, el PAGE (dos dimensiones) y Western
Blot de la proteína purificada.

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2. Cuida la ortografía y redacción. No olvides citar las fuentes en formato APA.

3. Guarda la actividad con la nomenclatura BGMB_U3_EA_XXYZ. (Sustituir las “XX” por
las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer apellido y
la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
4. Sube la actividad al apartado de tareas correspondiente.

NOTA: No olvides que tu protocolo de investigación debe estar basado en artículos

científicos, pero no debe ser una copia de un solo artículo, de lo contrario se considera
plagio.

MICROTUTORIAL PARA EL USO DEL SOFTWARE “PURIFICACIÓN DE PROTEÍNAS”.

1. Selecciona el idioma de tu preferencia.

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2. Da clic en comience desde el principio y elige la opción comience desde el

principio.

3. Elija la opción “Example_Mixture” y da clic en ok.

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4. Selecciona la proteína 3 y da clic en ok.

5. Toma nota de las características que te da el software de la proteína.

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6. La siguiente imagen muestra la tabla de purificación de la proteína, aquí es donde

se irán registrando las técnicas que vayas realizando, en la parte superior (rectángulo
rojo) se encuentran las opciones de las técnicas que puedes realizar en el software.

Criterios de evaluación:

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Materiales de apoyo:
• Alyas, J., Rafiq, A., Amir, H., Khan, S., Sultana, T., Ali, A., Hameed, A., Ahmad, I.,
Kazmi, A., Sajid, T., y Ahmad, A. (2021). Human Insulin: History, Recent Advances,
and Expression Systems for Mass Production. Biomedical Research and
Therapy. 8(9): 4540-4561. Disponible en:
http://www.bmrat.org/index.php/BMRAT/article/view/692
• Siew, Y. Y., y Zhang, W. (2021). Downstream processing of recombinant human
insulin and its analogues production from E. coli inclusion bodies. Bioresources
and bioprocessing. 8(1), 65. Disponible en:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC8313369/
• Zieliński, M., Romanik-Chruścielewska, A., Mikiewicz, D., Łukasiewicz, N.,
Sokołowska, I., Antosik, J., Sobolewska-Ruta, A., Bierczyńska-Krzysik, A., Zaleski,
P., y Płucienniczak, P. (2019). Expression and purification of recombinant human
insulin from E. coli 20 strain. Protein Expression and Purification. 157: 63-69.
Disponible en:
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1046592818305862

Software de apoyo:

• Andrew Booth. Purificación de proteínas. [Software]. Disponible en:

http://www.agbooth.com/pp_ajax/index.html?locale=es

Actividad 4. Autorreflexión U3
Fecha de entrega: domingo 12 de junio antes de las 23:50 h.

Instrucciones
1. Elabora un documento de texto en formato PDF, en letra Arial 11, texto justificado,
interlineado sencillo (máximo 3 cuartillas con la portada incluida), que incluya:
a) Portada con los siguientes elementos: nombre completo de la universidad,
carrera, nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la
actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la actividad
(evita colocar los logos de la universidad y carrera).
b) Responde las siguientes preguntas:

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i.De todas las aplicaciones que pudiste identificar de la materia de genética

molecular bacteriana en la biotecnología, ¿cuál te parece que es la más
sobresaliente? ¿Por qué?
ii.¿Cuáles son los conocimientos más significativos que te llevas de esta
materia?
iii.¿Cómo evalúas tu aprendizaje de la unidad 3? Con una calificación del 0 al 10.
¿Por qué?
iv.¿Te parece pertinente que en las actividades se realicen prácticas virtuales
y/o simulaciones? ¿Por qué?
v.¿Cuál fue la práctica y/o simulación que más te gustó y por qué?
vi.Menciona un punto positivo y uno negativo respecto al desempeño de tu
docente en línea.
2. Guarda tu documento con la siguiente nomenclatura: BGMB_U3_ATR_ XXYZ,
sustituye las XX por las dos primeras letras de tu primer nombre, la Y por la inicial de
tu apellido paterno, y la Z por la inicial de tu apellido materno.
3. Sube el archivo al apartado correspondiente.

Criterios de evaluación:

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Actividad 5. Asignación a cargo del docente “Obtención de proteínas

recombinantes”.
Fecha de entrega puntual: miércoles 08 de junio antes de las 23:50 h.
Fecha de entrega tardía: miércoles 12 de junio antes de las 23:50 h.

Instrucciones
1. Elabora un documento de texto en formato PDF, en letra Arial 11, texto justificado,
interlineado sencillo, que contenga lo siguiente:
a) Portada con los siguientes elementos: nombre completo de la universidad,
carrera, nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la
actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la
actividad (evita colocar los logos de la universidad y carrera).
b) Elabora un mapa mental en el software Lucidchart, que es gratuito y en línea
(https://www.lucidchart.com/pages/es), en el que describas todos los temas
analizados en la unidad 3, explica cómo se relacionan entre ellos, define cada
uno de ellos y coloca ejemplos claros de aplicación.
c) Ingresa al siguiente cuestionario en línea y responde a los 14
cuestionamientos planteados. Lee detenidamente las instrucciones y trata de
responder sin ver las tutorías, haz uso de ellas después de dar respuesta por
tu cuenta:
http://www.biologia.arizona.edu/molecular_bio/problem_sets/mol_genetics_of_prokaryotes/prokaryotes.html

d) Coloca las capturas de pantalla de tus 14 respuestas.

2. Cuida la ortografía y redacción. No olvides citar las fuentes en formato APA.
3. Guarda la actividad con la nomenclatura BGMB_U3_ADL_XXYZ. (Sustituir las “XX”
por las dos primeras letras de tu primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer
apellido y la “Z” por la inicial de tu segundo apellido).
4. Sube la actividad al apartado de tareas correspondiente.

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MICROTUTORIAL DE USO DEL CUESTIONARIO EN LÍNEA “PROBLEMAS DE

GENÉTICA MOLECULAR DE PROCARIOTAS”.

1. Ingresa al siguiente enlace:

http://www.biologia.arizona.edu/molecular_bio/problem_sets/mol_genetics_of_prokaryotes/prokaryotes.html

2. Da clic en comenzar.

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3. Inicia dando lectura a la tutoría.

4. Después de la lectura da clic en Problema 1, para dar respuesta a la pregunta 1.

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5. Selecciona una de las respuestas de opción múltiple.

6. Continúa dando respuesta al problema 2, hasta el problema 14.

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Software de apoyo:
• The Biology Project. (2006). Problemas de genética molecular de procariotas.
[Cuestionario en línea]. Disponible en:
http://www.biologia.arizona.edu/molecular_bio/problem_sets/mol_genetics_of_prokaryotes/prokaryotes.html

Verifica Los lineamientos de entrega semanal en la siguiente liga:

https://unadmex.sharepoint.com/sites/reglamentogral

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