FORMULARIO DE GUÍAS PRÁCTICAS DE APLICACIÓN Y EXPERIMENTACIÓN DE LOS

APRENDIZAJES
APE 4.1 y 4.2

I. INFORMACIÓN GENERAL
ASIGNATURA Biotecnología Agrícola NIVEL VII
Unidad de ABRIL –
CICLO
organización Formación Profesional SEPTIEMBRE 2022
ACADEMICO
Curricular
DOCENTE DR. WILLIAM CALERO
II. INFORMACIÓN SOBRE LAS ACTIVIDADES PRÁCTICAS
Tema:
Estrategias de control biológico de plagas y enfermedades

Actividad 1 y 2: Identificación molecular de bacterias por medio de la técnica 16S rDNA y MALDI-ToF.

Objetivos:
1. Desarrollar métodos de control biológico de plagas y enfermedades.

Modalidad:
Presencial
Tiempo de Duración: 6 horas presenciales.
Instrucciones

Actividad presencial

Analizar el siguiente caso de estudio:

Como ingeniera/o en biotecnología,tricho es contratado por una empresa productora de

tomate para identificar una plaga de origen bacteriano que se encuentra destruyendo a
los lotes de producción. Usted analiza por medio de la técnica 16S rRNA y DGGE las
composiciones microbianas del suelo sano (A) y del suelo donde se encuentra la plaga
bacteriana (B). Adicionalmente, se aplicaron diferentes tratamientos a los suelos, los
cuales tuvieron un diverso grado de efectividad.
(C) adición de Trichoderma spp.
(D) adición de Trichoderma spp y regulador de pH nitrogenado.
(E ) desinfección térmica más adición de materia orgánica vegetal.
(F ) cóctel de bacteriófagos.

Discuta:

A qué microorganismos puede aducir la manifestación de la enfermedad.

Cuáles tratamientos serían más apropiados para eliminar a los potenciales patógenos.
Qué tratamientos serían los más apropiados y menos apropiados para su utilización en el
cultivo de vegetales.

Imagen 1. DGGE de las poblaciones microbianas detectadas en cada tratamiento.

Las secuencias 16S se encuentran disponibles en el archivo adjunto.

Listado de equipo, materiales y recursos:
- Ordenador con conexión a internet.
- Material de papelería.
- Bases de datos de libros on line.
- Base de datos Sciencedirect, Pubmed o Scholar Google.
- Programa MEGA.
 I. ACTIVIDADES POR DESARROLLAR:

1) Analice la imagen DGGE y detecte patrones específicos.

2) Compare las secuencias utilizando el método BLAST en la página web del NCBI.
Presente estos resultados en formato libre, tal y como lo haría cuando sea
ingeniero/a.
3) Para cada experimento, elabore un árbol de relación filogenética de tipo
Neighbor Joining Tree entre las secuencias 16 S rRNA en el programa MEGA,
alineándolas previamente por el método MUSCLE. Mantenga las
configuraciones default del software MEGA.
4) Exporte su árbol en formato newick y edítelo en el software online iTOL,
añadiendo anotaciones según su criterio.
5) Interprete los resultados obtenidos utilizando una adecuada cantidad de
referencias bibliográficas.

Resultado de Aprendizaje:

Desarrolla métodos de control biológico de plagas y enfermedades.

Conclusiones:

Productos APE Presencial

Informe de laboratorio.
El informe debe contener:

1) Tabla de participación.
2) Introducción (1 página).
3) Objetivos.
4) Materiales y métodos.
5) Resultados.
 6) Discusión, dando respuesta a las preguntas dadas.
7) Conclusiones.
8) Referencias (APA).

Recomendaciones:

Se recomienda utilizar referencias arbitradas como libros, reportes científicos de

entidades de referencia (IWA, FAO, AOAC), artículos científicos y de revisión.

Bibliografía:

Artículos científicos publicados en repositorios Pubmed, Sciencedirect, Scielo,

Redalyc, Scholar Google.
 Notas:

VALIDACIÓN DE LAS GUÍAS DE PRÁCTICAS

Fecha de elaboración: 22/11/2021