Planeación del Docente en línea

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Asignatura: Biología Molecular II

Unidad 1. Biología molecular de ácidos
nucleicos

Ingeniería en Biotecnología
Bloque 1 Semestre 2022-2

Universidad Abierta y a Distancia de México | DCSBA 3

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Nombre del docente: Alicia Ruiz López

Correo del docente: are1421000459@nube.unadmexico.mx

Matrícula: DL19RULA00150

Asignatura: Biología Molecular II

Unidad 1. Biología molecular de ácidos nucleicos

Competencia general de asignatura: Asociar los proceso genéticos con la

ingeniería genética a través del estudio de sus técnicas para inferir sus aplicaciones
en el campo de la biotecnología.

Competencia específica de la unidad: Asociar los proceso genéticos con la

manipulación de los ácidos nucleicos a través del estudio de técnicas de biología
molecular para identificar sus aplicaciones en el campo de la biotecnología.

Secuencia de trabajo:

1. Leer el contenido de la Unidad 1.

2. Revisar las actividades sugeridas en la Planeación Docente en Línea Unidad
1.
3. Revisar con detenimiento, el material y recursos de apoyo (Propuestos por el
Docente en Línea).

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4. Participar en la actividad 1. “Foro de construcción del conocimiento” Unidad

1.
5. Elaborar y enviar correctamente la Actividad 2 entregable de la Unidad 1.
6. Elaborar y enviar correctamente la Evidencia de Aprendizaje de la Unidad 1.
7. Elaborar y enviar las Autorreflexiones de la Unidad 1.

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Actividad 1. Foro: Técnicas de extracción de ácidos nucleicos.

Fecha Límite de entrega: Sábado 16 de julio.

Debido a su complejidad macromolecular, la separación de los ácidos nucleicos

de los componentes de membrana es difícil, ya que al aislarlos se puede alterar su
estructura y características, por ello se deberán emplear los métodos más
adecuados para eliminar las impurezas de las preparaciones, basados en sus
propiedades físico-químicas.

Instrucciones:

1. Revisa el contenido de la unidad 1 y los materiales de apoyo sugeridos para

la actividad.

2. Investiga los siguientes temas para reforzar tu conocimiento, para la

elaboración de la actividad: Obtención y preparación de muestras para la
obtención de ADN, tipos de muestras, separación de células, tipos de
técnicas (sedimentación, centrifugación diferencial), extracción de ácidos
nucleicos (ADN y ARN), identificación (electroforesis en gel de agarosa y
cromatografía).

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3. Publica tu participación en el “Foro de construcción del conocimiento” de

manera directa, utilizando el editor de la plataforma (no subas archivos de
Word, PDF, links o enlaces con tu trabajo, ya que no serán considerados
para tu evaluación) Tu actividad en el foro debe ser completa y clara para
poder ser visualizada por todos los integrantes. Recuerda que debes
comentar de forma respetuosa y siguiendo las reglas de convivencia.

Tu participación deberá contener lo siguiente:

a) * Señala los pasos que integran la técnica de extracción de ácidos

nucleicos. (menciona brevemente cada paso en un renglón)
• De la Lisis celular, menciona tres procedimientos que son
comúnmente utilizados. (explica brevemente, no más de 5 renglones)

b) Dirígete al siguiente enlace:

https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/extraction/

• Elabora la práctica, mediante el simulador, de la extracción de ADN y

contesta:

• Además de las células animales (epiteliales de la mucosa bucal que se

utilizaron en el simulador) ¿de qué otros organismos se puede extraer
ADN de sus células? Explica brevemente.

• ¿Qué diferencias existen entre la técnica de extracción de ADN y la de

ARN? Explica brevemente (no más de 4 renglones).

c) Ahora que has aprendido como se extrae ADN, es hora de practicar la

técnica.

• Dirígete al siguiente enlace:

https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/extraction/howto/

Y realiza la práctica casera de extracción de ADN siguiendo los pasos

ilustrados (puedes utilizar chícharos, espinacas, fresas o brócoli).

Una vez concluido tu experimento, obtén una captura de pantalla del

ADN obtenido (a un lado del frasco, recipiente o tubo de ensaye que
utilizaste, en donde se observa el ADN que obtuviste, pon una etiqueta
con tu nombre, fecha y grupo) y compártela en el foro para que pueda
ser apreciado tu gran trabajo de extracción de ADN realizado.

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4. Argumenta tu participación en el foro y susténtala con fuentes bibliográficas

confiables.

5. Cuida, ortografía y redacción al argumentar.

6. Publicada tu participación en el foro, retroalimenta mínimo a dos de tus

compañeros. Recuerda que el intercambio de información y puntos de vista
sustentados en fuentes bibliográficas, nos permite entender más
claramente el tema, por ello, evita evaluar la participación de tus
compañeros o solo concordar con lo presentado por ellos, debes agregar
información nueva o ampliar la presentada para complementar la respuesta.
Considera que este aspecto equivale al 10% de la evaluación total de la
participación en foro, por lo que no debe omitirse.

7. Cita tus referencias, tanto en tu aportación al foro como en tu

retroalimentación en formato APA.

NOTA: Tu publicación debe ser redactada en propias palabras, puedes citar

fragmentos breves de otros autores (no más de dos renglones), siguiendo el
entrecomillado y el formato APA. Cualquier actividad en donde se detecte plagio
será anulada para evaluación.

Criterios de evaluación:

CONCEPTO PUNTAJE
a) Señala correctamente cuáles son los pasos que 20%
integran la técnica de extracción de ácidos
nucleicos.

Dentro de la Lisis celular, menciona acertadamente

tres procedimientos comúnmente utilizados.

b) Realiza acertadamente la simulación de la práctica 30%

extracción de ADN.

Menciona correctamente de que otras células de

diferentes organismos se puede extraer ADN.

Señala las diferencias en las técnicas de extracción

de ADN y ARN.

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c) Elabora de manera acertada y presenta evidencia 30%

de la práctica casera de extracción de ADN de células
vegetales.

d) Retroalimenta de manera enriquecedora el tema, 10%

de al menos dos de sus compañeros.

e) Redacción y ortografía correctas. 5%

f) Citas bibliográficas confiables y en formato APA. 5%

TOTAL 100%

Materiales de apoyo:
Alejos LP, Argón MC y Cornejo A (2014) Extracción y Purificación de ADN. [Archivo
PDF] Recuperado 8 de julio 2022 de
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/extraccion.pdf

Django-wiki (2021) Extracción de ARN con Trizol. En Labster theory.com.

Recuperado 08 de julio 2022 de
https://theory.labster.com/trizol-extraction-es/
Luque J. y Herráez A. (2001) Texto ilustrado e interactivo de Biología molecular e
ingeniería genética (1ª ed.) España: Elsevier. 117-136.

Sandoval AS, Martínez AB y López DA (2013) Extracción de ácidos nucleicos. En

Salazar A, Sandoval A y Armendáriz J. E Biología molecular Fundamentos y
aplicaciones en las ciencias de la salud. México: MacGraw Hill. 99-109.
Consultado el 8 de julio de 2022 en
http://dipsa.com/clandunant/Textos/TUM%20-
%20Biolog%C3%ADa%20molecular%20Fundamentos%20y%20aplicaciones%20en%20las%20ciencias%20de%20la%20salud%20-
%20Salazar.pdf

Software de apoyo
BIOHUB LABS: igbmgenetica.com

Actividad 2. Reacción en cadena de la polimerasa (PCR)

Fecha límite de entrega puntual: Viernes 22 de julio.

Fecha límite de entrega tardía: Jueves 28 de julio.

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Una de las técnicas de biología molecular más comúnmente utilizadas en la

obtención de copias de ADN es la PCR o Reacción en cadena de la polimerasa, la
cual en biotecnología se ha logrado aplicar de manera simple e innovadora para
el conocimiento de nuevas investigaciones sobre los organismos causantes de
enfermedades tan graves como el SARS-CoV-2.

Instrucciones:

1. Revisa el contenido de la Unidad 1.

2. Investiga los siguientes temas para reforzar tu conocimiento en la

elaboración de tu actividad: Reacción en cadena de la polimerasa,
componentes que la integran, fases que la componen, procedimiento de
elaboración de la técnica, aplicaciones.

3. Elabora un documento con letra Arial 11 (con un máximo de 6 cuartillas,

portada incluida), que integre:

a) Portada con los siguientes elementos, Nombre de la Universidad, carrera,

nombre de la asignatura, grupo, unidad, nombre del alumno, matrícula y
fecha de entrega.

b) Explica lo siguiente:
¿Qué es la Reacción en cadena de la Polimerasa?
¿Qué componentes son necesarios para su elaboración?

c) Describe brevemente e ilustra cada una de las etapas o fases que

componen el proceso de la técnica de Reacción en Cadena de la
Polimerasa (PCR).
*Describe los eventos que ocurren en cada etapa de la técnica y apóyate
en ilustraciones, deben ser ambas cosas, no será válida solo la
presentación de las imágenes, aunque estás estén explicadas, la
descripción debe ser en tus propias palabras.

d) Menciona brevemente: ¿ Cuántos tipos de PCR existen? Y

¿Cuál es la utilidad de la técnica de PCR?

e) Accede al siguiente sitio mediante el enlace y realiza la simulación para

complementar lo aprendido de la PCR:

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https://learn.genetics.utah.edu/content/labs/pcr/

Realiza una captura de pantalla de la página final de la simulación para

evidenciar que realizaste la revisión. Agregala a tu archivo de entrega en la
parte correspondiente a este inciso.

4. Cuida, ortografía y redacción.

5. Cita tus fuentes de consulta en formato APA (recuerda que debes apoyarte
en fuentes confiables, libros, archivos PDF, páginas de Instituciones
confiables, universidades, bibliotecas de Instituciones educativas, etc., NO
Wikipedia, NO buenas tareas, ni hipertextos, tampoco páginas de conceptos
y definiciones).

6. Guarda tu actividad en formato Word o PDF con la nomenclatura

BBM2_U1_A2_XXYZ (Sustituir las “XX” por las primeras letras de tu nombre, la
“Y” por la inicial de tu primer apellido y la “Z” por la inicial de tu segundo
apellido).

7. Sube tus actividades al apartado correspondiente en la plataforma (NO dejes

en borrador, porque puede evitar que tu actividad sea evaluada).

Criterios de evaluación:

CONCEPTO PUNTAJE
a) Explica correctamente: ¿Qué es la Reacción en 20%
cadena de la Polimerasa? Y
¿Qué componentes son necesarios para su
elaboración?

b) Describe e ilustra acertadamente las etapas de 40%

la PCR y los eventos que ocurren en ella.

c) Señala de manera acertada ¿Cuántos tipos de 20%

PCR existen? Y ¿Cuál es su utilidad?

d) Revisa y realiza la simulación de la PCR. 10%

d) Redacta de manera breve, en propias palabras, 5%
con buena ortografía.

e) Fundamenta su actividad con por lo menos 5 5%

fuentes bibliográficas confiables y en formato APA.

TOTAL 100%

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Materiales de apoyo:

Karp G. (2017) Técnicas de Biología Celular y Molecular. En Biología Celular y

Molecular. Conceptos y Experimentos (7ª. Ed.) McGraw Hill. Consultado en
https://accessmedicina.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2036&sectionid=153038861

Luque J. y Herráez A. (2001) Texto ilustrado e interactivo de Biología molecular e

ingeniería genética (1ª ed.) España: Elsevier. 187-195.

Serrato A, Flores R, Aportela J. Sierra P. (2014) PCR REACCIÓN EN CADENA DE LA

POLIMERASA. En Cornejo A, Serrato A, Rendón B y Rocha MG. Herramientas
Moleculares Aplicadas en Ecología: Aspectos Teóricos y Prácticos. Consultado 08
de julio 2022 de:

https://www.researchgate.net/publication/266856169_PCR_reaccion_en_cadena_de_la_polimerasa

Yerena CL y Ramírez J. (2018 Manual de Prácticas para Biología Molecular Aplicada.

[Archivo PDF] Recuperdo 07 de julio 2022 de
https://www.uv.mx/qfb/files/2020/09/Guia-de-Biologia-Molecular-Aplicada.pdf

Software de apoyo:
BIOHUB LABS: igbmgenetica.com

Evidencia de aprendizaje: Análisis de ácidos nucleicos

Fecha límite de entrega puntual: Jueves 28 de julio.

Fecha límite de entrega tardía: Miércoles 03 de agosto.

Además de las distintas técnicas para la extracción y duplicación de los ácidos

nucleicos, se encuentran aquellas que complementan el trabajo fino para que
los resultados sean óptimos. Consideradas técnicas de análisis, identificación y
pureza de los ácidos nucleicos.

Instrucciones:

1. Revisa el contenido de la unidad 1.

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2. Investiga los siguientes temas para reforzar tu conocimiento en la

elaboración de tu actividad: Electroforesis, principios, componentes y
proceso. Espectrometría, bases teóricas, proceso y utilidad. Secuenciación,
fundamentos y proceso.

3. Elabora un documento en Arial 11 (con un máximo de 6 cuartillas incluyendo

portada) que integre:

a) Portada con los siguientes elementos, Nombre de la Universidad, carrera,

nombre de la asignatura, grupo, unidad, nombre del alumno, matrícula y
fecha de entrega.

b) ¿Qué es la electroforesis, cuál es su fundamento teórico? Y

¿Cuántos tipos de electroforesis hay?

En un diagrama menciona los pasos que integran el proceso de

electroforesis en gel de agarosa.

Dirigete al siguiente enlace:

https://www.labxchange.org/library/items/lb:LabXchange:5d12867d:lx_simulation:1

Elabora la práctica de simulación de electroforesis en gel de agarosa, al

finalizar la práctica en la sección de reflexión contesta el cuestionario y
obtén las capturas de pantalla de tus resultados, elabora las capturas
antes de dar finalizar o pasar a la siguiente sección. Incluye las imágenes
en tu archivo en la sección correspondiente en tamaño suficiente para
ser visualizadas sin ocupar demasiado espacio.

c) Menciona ¿Qué es la espectrometría, cuál es su fundamento teórico?

Y ¿Para qué se utiliza?

Dirigete al siguiente enlace:

https://biomodel.uah.es/lab/abs/espectrofot/pipeta.gif
Realiza la práctica virtual de la espectrometría de las siguientes opciones:

Lee las Instrucciones y elabora la práctica para la actividad 1 y la

hemoglobina sencilla sin redox. Realiza una captura de pantalla de cada
una de las muestras con sus gráficas, incluyendo el llenado de todas las
casillas solicitadas. Integra tu captura de pantalla en tu archivo de
entrega en la sección correspondiente.

d) Explica, ¿Qué es la secuenciación de ácidos nucleicos?

Define brevemente en que consiste el proceso de secuenciación del
método de Sanger (máximo 6 renglones).

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Ahora que ya conociste la PCR, la electroforesis y la secuenciación, realiza

La siguiente práctica virtual en donde se integran las técnicas que hemos
realizado. Dirígete al siguiente enlace:

https://media.hhmi.org/biointeractive/vlabs/bacterial_id2/content/index.html

Realiza la práctica virtual de identificación bacteriana, en donde deberás

realizar la PCR, la secuenciación del ADN de la bacteria y al final en el
análisis de la secuencia deberás identificar a la bacteria que corresponda
en la pantalla que aparece, realiza la captura de pantalla de tu resultado
e intégrala en tu archivo en la sección correspondiente.

4. Cuida, ortografía y redacción.

5. Cita tus fuentes de consulta en formato APA (recuerda que debes apoyarte
en fuentes confiables: libros, archivos PDF, páginas de Instituciones
confiables-universidades, bibliotecas, etc.), No Wikipedia, no buenas tareas,
no hipertextos, no la página de conceptos y definiciones.

NOTA: Recuerda que debes redactar con propias palabras, si tomas

fragmentos del trabajo original debes citarlo correctamente en formato APA,
cualquier actividad donde se detecte plagio será sancionada.
Tu documento no deberá pesar más de 5 MB.

6. Guarda tu actividad en formato Word o PDF con la nomenclatura

BBM2_U1_EA_XXYZ. (Sustituir las “XX” por las dos primeras letras de tu primer
nombre, la “Y” por la inicial de tu primer apellido y la “Z” por la inicial de tu
segundo apellido).

Criterios de evaluación:

CONCEPTO PUNTAJE
a) Responde de manera correcta a las preguntas: 10%
¿Qué es la electroforesis, cuál es su fundamento
teórico? Y
¿Cuántos tipos de electroforesis hay?

Además, realiza de manera acertada el diagrama con

los pasos del proceso de la electroforesis en gel de
agarosa.

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b) Realiza de manera correcta la práctica de 20%

simulación de electroforesis en gel de agarosa y
presenta evidencias de su realización.

c) Define correctamente ¿qué es la espectrometría, 10%

sus bases teóricas y su utilidad?

d) Realiza de manera eficiente la práctica virtual de la 20%

espectrometría de las opciones solicitadas y presenta
evidencia de su realización.

e) Explica correctamente las siguientes cuestiones: 10%

¿Qué es la secuenciación de ácidos nucleicos?

Define brevemente en que consiste el proceso de

secuenciación del método de Sanger.

f) Realiza de manera acertada la práctica virtual 20%

identificación bacteriana, presentando la evidencia
solicitada de su realización.
d) Redacción, en propias palabras y ortografía 5%
correcta.
e) Sustenta su actividad con fuentes bibliográficas 5%
confiables y en formato APA.
TOTAL 100%

Materiales de apoyo:
Fierro F (2014) Electroforesis. En Cornejo A, Serrato A, Rendón B y Rocha M
Herramientas moleculares aplicadas en Ecología: Aspectos teóricos y prácticos. 27-
51.
https://www2.congreso.gob.pe/sicr/cendocbib/con4_uibd.nsf/770DBBBD5ADF759505257D4900580FE6/$FILE/HerramientasMolecularesAplicadasEcolog%C3%ADa.pdf

Gómez BC, Zúñiga GM, Vera J y Álvarez BA. Secuenciación del ADN y microarreglos.
En Biología molecular, Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de la salud.
México: McGraw Hill. 160-170

Karp G. (2017) Técnicas de Biología Celular y Molecular. En Biología Celular y

Molecular. Conceptos y Experimentos (7ª. Ed.) McGraw Hill. Consultado en
https://accessmedicina.mhmedical.com/content.aspx?bookid=2036&sectionid=153038861

López DA. Y Sandoval AS. (2013) Electroforesis. En Salazar A, Sandoval A y

Armendáriz J. En Biología molecular Fundamentos y aplicaciones en las ciencias de
la salud. México: MacGraw Hill. 110-118.

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Villarreal LJ, Iglesias AL y Pérez GL (2019) Biología Molecular: Manual de prácticas de

laboratorio. [Archivo PDF] Recuperado 07 de julio 2022 de
http://citecuvp.tij.uabc.mx/bio/wp-content/uploads/2020/07/11816-
Biolog%C3%ADa-Molecular.pdf

Software de apoyo
LABXCHANGE.COM ; BIOMODEL UAH.ES ; BIOHUB LABS igbmgenetica.com

Autorreflexión Unidad 1

Fecha de entrega: Jueves 28 de julio

Instrucciones:

1. Elabora un documento, en letra Arial 11 (de máximo 2 cuartillas con la

portada incluida), que comprenda:

a) Portada con los siguientes elementos: Nombre de la universidad, carrera,

nombre de la asignatura, grupo, nombre de la unidad, nombre de la
actividad, nombre del alumno, matrícula y fecha en que se entrega la
actividad.

b) Da respuesta a las siguientes preguntas:

I. ¿Consideras que las técnicas de análisis de ADN han permitido la

evolución de la biotecnología actual? ¿Por qué?

II. ¿Piensas que las técnicas de PCR y secuenciación han sido factores
clave en la investigación del COVID-19 para la producción de
vacunas? ¿Por qué?

III. ¿Consideras que los simuladores de prácticas virtuales han sido un

buen complemento en tu aprendizaje de los temas revisados en
esta unidad 1? ¿Por qué?

2. Cuida ortografía, redacción y citar las fuentes en formato APA.

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3.- Guarda la actividad en formato PDF con la nomenclatura

BBM2_U1_ATR_XXYZ. (Sustituir las “XX” por las dos primeras letras de tu
primer nombre, la “Y” por la inicial de tu primer apellido y la “Z” por la inicial
de tu segundo apellido).

4.- Sube la actividad al apartado correspondiente.

NOTA: Apóyate de fuentes confiables de información, pero debes redactar
todo con tus propias palabras.

Criterios de evaluación:
CONCEPTO PUNTAJE
a) Responde acertadamente a la pregunta: 30%
¿Consideras que las técnicas de análisis de ADN han
permitido la evolución de la biotecnología actual?
¿Por qué?

b) Analiza y contesta de manera correcta a la 30%

pregunta: ¿Piensas que las técnicas de PCR y
secuenciación han sido factores clave en la
investigación del COVID-19 para la producción de
vacunas? ¿Por qué?

c) Reflexiona sobre la cuestión: 30%

¿Consideras que los simuladores de prácticas virtuales
han sido un buen complemento en tu aprendizaje de
los temas revisados en esta unidad 1? ¿Por qué?

d) Redacta correctamente en propias palabras y con 5%

buena ortografía.
e) Argumenta con propias palabras y Cita de ser 5%
necesario fuentes bibliograficas en APA
TOTAL 100

Verifica Los lineamientos de entrega semanal en la siguiente liga:

https://unadmex.sharepoint.com/sites/reglamentogral

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