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Biología
Bogotá D.C
2023
UNIVERSIDAD MANUELA BELTRÁN
MACROPROCESO DE RECURSOS E INFRAESTRUCTURA ACADÉMICA
FORMATO PARA PRÁCTICAS DE LABORATORIO UMB - VIRTUAL
Fecha: 7 de octubre de 2016 Código: Versión: 1.0
INFORMACIÓN BÁSICA
ASIGNATURA
Biología
TEMA DE LA PRÁCTICA
http://virtual-pcr.ico2s.org/pcr/
A QUIEN VA DIRIGIDO
CONTENIDO DE LA GUÍA
(Para elaborar por el Docente)
COMPETENCIAS
Identifica los fundamentos teóricos de la genética mendeliana y la biología molecular a través
del reconocimiento de las leyes de Mendel y los procesos de replicación, transcripción y
traducción del ADN, con el fin de reconocer cuales son los mecanismos de la herencia, como se
transmite la información genética y que aplicaciones tienen estos conocimientos en el ámbito
biotecnológico.
INTRODUCCIÓN
La replicación del ADN es un proceso que llevan a cabo las células de manera natural. En este, se
generan copias a partir de una hebra molde de ADN, la cual debe sufrir una serie de cambios como: la
separación de la hebra, en dos cadenas, la participación de enzimas que desenredan y evitan que se
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vuelvan a pegar las cadenas (topoisomerasa) otras que ayudan a la ruptura de puentes de hidrógeno
(helicasa) y aquellas que generan copias de una nueva cadena (ADN-polimerasas).
La complejidad de este mecanismo es tal, que tardaron muchos años para poder replicarlo en un
laboratorio, no obstante, lo lograron y es lo que hoy en día se conoce como: reacción en cadena de la
polimerasa. Esta técnica, consiste en obtener copias de un fragmento de ADN que tenga algún interés
para luego aplicar herramientas de identificación como la secuenciación.
PALABRAS CLAVE
ADN
BIOLOGÍA MOLECULAR
PCR
REPLICACION DEL ADN
MARCO CONCEPTUAL
Proteína SSB Impide que las cadenas de ADN se vuelvan a unir mientras está
ocurriendo la replicación
ADN polimerasa Añade nucléotidos a las cadenas moldes para formar una nueva
cadena
ADN primasa Produce pequeños fragmentos de ADN llamados cebadores para
pegarlos a la cadena retrasada
ADN ligasa Enlaza los fragmentos de Okazaki en la hebra retrasada
El siguiente diagrama, explica con mayor detalle como ocurre el proceso de replicación del ADN:
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Fuente: Solomon, E. P., Martin, L. R., Solomon, D. W., Berg, L. R., y Martin, D. W. (2013). Biología. México
D. F., México: McGraw Hill Interamericana.
La PCR es una técnica que permite replicar fragmentos de ADN en un laboratorio, para ello, requiere de
nucleótidos, oligonucleótidos o primers, ADN-polimerasa, soluciones amortiguadoras, iones y por
supuesto, el ADN molde.
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PREPARACIÓN DE LA PRACTICA
Es importante que antes de realizar esta práctica sea consciente de haber efectuado cada uno de
los siguientes aspectos:
1. Lectura completa de la guía.
2. Lectura y análisis de las temáticas propias del módulo 3 correspondiente a la asignatura de
Biología.
Consulta Previa
Pre – Informe
1. Consulte acerca del proceso de replicación del ADN y elabore un diagrama de flujo en el que
explique detalladamente los pasos.
2. ¿Por qué se habla de una hebra adelantada y una retrasada en la replicación del ADN?
Hebra adelantada: Es la hebra que se sintetiza en el mismo sentido que avanza la horquilla de replicación y
se sintetiza de forma continua por la ADN polimerasa.
Hebra retrasada o rezagada: hebra que se sintetiza en sentido contrario al avance, cuya síntesis es
discontinua y espera a que la horquilla de replicación avance para disponer de una cierta longitud de ADN
molde
Material
Micropipetas
Puntas para PCR
Autoclave
Tubos para PCR
Gradilla para tubos de PCR
Termociclador
Reactivos
ADN molde: fragmentos de ADN donde se obtendrá la parte de la que se desea generar muchas copias.
Iniciadores o “primers”: son dos secuencias cortas de ADN que se unen al ADN molde. Están constituidos por
20 nucleótidos o más y su función es dar inicio a la reacción de PCR.
dNTPs: son nucleótidos que sirven para generar las nuevas cadenas de ADN.
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PCR anidada: se trata de una variante de la PCR básica que utiliza dos pares de cebadores. En un primer paso,
se realiza la amplificación de una región del genoma, para después concretar más la región mediante una
segunda amplificación más específica. Esta PCR se utiliza para amplificar fragmentos muy específicos del
genoma.
RT-PCR: Esta técnica convierte el ARN de una muestra en ADN. Para ello utiliza la transcriptasa inversa, una
enzima utilizada por los retrovirus Se utiliza para múltiples objetivos. Por ejemplo se puede utilizar para saber
si un gen se está expresando en una muestra biológica. También se utiliza para genotipar diferentes virus de
ARN, como el SARS-Co-V o el VIH.
PCR cuantitativa: es una PCR que permite medir en tiempo real la cantidad de fragmentos que se van
produciendo. Se utiliza a menudo para analizar la expresión de los genes.
PCR múltiple: en este tipo de PCR se realizan amplificaciones simultáneas de más de un fragmento de ADN.
Para ello, se utilizan varios cebadores diferentes en una misma reacción.
PCR in situ: esta PCR se realiza en células o tejidos. Se utiliza para poder detectar secuencias de ADN en el
interior de las células que no son detectables mediante otras técnicas.
PCR digital: es una de las últimas generaciones en técnicas de amplificación de ADN. Está basada en la
separación de cada muestra en múltiples particiones (microgotas), de forma que la reacción de amplificación
se produce de forma independiente cada una de ellas.
Estos solo son algunos de los tipos más conocidos de PCR, aunque también existen muchas otras variaciones
de la PCR, como la PCR asimétrica, o la PCR específica de alelo, que consiguen diferentes resultados a partir
de las muestras de ADN obtenidas.
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Aplicaciones
Huella Genética
Detección de enfermedades hereditarias
Detección de la expresión genética
Genotipificación del polimorfismo
Análisis de DNA antiguo
Clonamiento de genes
Mutagénesis
Diagnóstico del Cáncer
Huella Digital
La huella digital genética es una técnica empleada para distinguir a dos organismos de la misma especie por
medio de su ADN. Esta nueva técnica fue creada en 1984 por Alec Jeffreys, de la universidad de Leicester. Su
primera aplicación práctica sirvió para condenar a Colin Pitchford por dos asesinatos con agresión sexual.
La huella genética se basa en que dos seres humanos tienen una parte de su secuencia de ADN idéntica y otra
que presenta gran variabilidad entre los individuos, estas secuencias altamente variables se llaman
microsatélites o satélites y su análisis permite diferenciar dos individuos distintos. El número de satélites de
dos personas que no tienen parentesco varia.
Los microsatélites muestran una mayor variación que el resto del genoma ya que en ellos se encuentran unas
secuencias en distinta repetición y con diferente grado de recombinación debido a la inestabilidad del locus.
La reacción en cadena de la PCR se emplea para obtener una cantidad mayor de ADN que permita detectar las
repeticiones en varios loci. Salvo en gemelos idénticos es muy improbable (por no decir imposible) encontrar
dos individuos que tengan perfiles genéticos iguales.
Consiste en utilizar la técnica de PCR para ampliar las regiones específicas con los cebadores
correspondientes. Con la invención de esta técnica (PCR) la tecnología genética dio un gran paso en la
recuperación de información a partir de muestras muy pequeñas. Se utiliza amplificando regiones específicas
de ADN usando temperatura y una enzima polimerasa termoestable junto con fluorescencia etiquetada en una
secuencia específica del ADN.
Esta técnica tiene multitud de aplicaciones en diversos campos. La huella genética ha sido la base de la prueba
de paternidad (explicaremos más adelante), así como en medicina forense ha servido para identificar restos
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humanos y ha permitido identificar sospechosos mediante pruebas de sangre saliva o semen. Otra aplicación
de esta técnica está presente en estudios históricos y geográficos como el seguimiento de migraciones del ser
humano en la prehistoria o el estudio de la evolución entre especies.
Los ensayos de PCR son extremadamente valiosos para identificar nuevos miembros de una familia génica.
Los métodos basados en PCR requieren menos cantidades de ADN lo cual es una ventaja sobre otros métodos
como por ejemplo el RFLP que es criticado debido a su lentitud y la necesidad de tener grandes cantidades de
ADN necesario para obtener resultados útiles.
En esta prueba el producto de la PCR se mide al final de cada ciclo. Los datos pueden ser analizados mediante
un programa informático y la expresión génica relativa entre varias muestras puede calcularse.
Uno de los usos que se desprende de la tecnología utilizada en la PCR en tiempo real es la realización de
pruebas diagnósticas moleculares en el mismo lugar en donde se toma la muestra a ser estudiada y no en
laboratorios lejanos. Esto no solo volvería a este tipo de tecnologías más baratas, sino que hará que los datos
colectados sean más fáciles de procesar y estén a disposición de los investigadores de manera inmediata. Estas
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visiones, conjuntamente con el desarrollo de plataformas de hardware portátil, darán paso al inicio de la era de
pruebas genéticas individualizadas.
Genotipificación de Polimorfismo
¿A qué se aplica?
El genotipado se puede aplicar a todo organismo biológico incluyendo los microorganismos, es decir pueden
ser objeto de genotipado desde un ser humano hasta Virus o Bacterias.
Usos:
El genotipado de virus o bacterias puede ayudar a controlar la extensión de patógenos, localizando el origen
de los focos de infección. Esta tecnología es importante en la investigación clínica para la caracterización de
genes asociados a enfermedades y a esta área de la ciencia se la suele denominar epidemiología molecular o
microbiología forense.
¿Qué es un polimorfismo?
El polimorfismo genético hace referencia a la existencia en una población de múltiples alelos de un gen. Es
decir, un polimorfismo es una variación en la secuencia de un lugar determinado del ADN entre los individuos
de una población.
Hay polimorfismos que pueden traducirse en diferentes fenotipos (por ejemplo, el color de ojos). Los cambios
poco frecuentes en la secuencia de bases en el ADN no se llaman polimorfismos, sino más bien mutaciones.
Hay diferentes tipos de polimorfismo, tales como el polimorfismo de nucleótido simple (SNP),
polimorfismos de longitud de fragmentos de restricción (RFLP), en este último la metodología se basa en
que el ADN de un individuo se extrae y se purifica. El ADN purificado puede ser amplificado usando la
técnica molecular Reacción en cadena de la polimerasa o PCR (del inglés Polymerase Chain Reaction), luego
tratado con enzimas de restricción específicas para producir fragmentos de ADN de diferentes longitudes.
Estas enzimas de restricción hacen un proceso de digestión restrictiva en el cual reconocen cortas secuencias
específicas en el ADN donde cortan formando fragmentos de distintas longitudes.
Usos:
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Un uso importante de los polimorfismos es la creación de perfiles genéticos. Para este cometido son
especialmente útiles aquellos polimorfismos que se basan en patrones repetidos un cierto número de veces.
El ADN antiguo es aquel obtenido de restos biológicos de organismos muertos o de restos humanos
comprendidos dentro del periodo histórico (últimos 30.000 años) o prehistórico ( Antes de esos 30.000 años)
. Con el ADN mitocondrial se puede evaluar patrones de residencia, migración y relaciones genéticas de los
grupos aborígenes y averiguar cambios genéticos de épocas pasadas.
El análisis del DNA antiguo se basa en técnicas orientadas a la obtención de información y material genético
a partir de muestras biológicas antiguas, a probar su autenticidad o sus características físico químicas.
Clonamiento de Genes
El clonamiento o la clonación es un proceso donde a partir de una célula se forma una otra de tipo asexual,
que resulta ser la copia exacta de esta misma.
Hoy la clonación ha conocido muchas transformaciones y maneras de utilizarse por esto la dividimos en
diferentes tipologías.
En Naturaleza: es una forma de reproducción de específicos organismos
Molecular: se utiliza en muchísimos casos de trabajos clínicos, donde se quiere crear un clon a partir de una
célula u otros organismos. Para hacerlo necesitamos pero de hacer una transfección (donde la secuencia de
DNA se introduce en las células) o de selección (donde se eligen las células que ya tienen bien la nueva
estructura). Esto pasa hasta que se llega a un momento donde se pone un vector de clonación que permite que
se formen fragmentos de DNA interesante para el estudio que se va a hacer.
Clonación Celular: es muy importante en los trabajos biológicos porque permite de trabajar con células apenas
creadas si estarán bien. Es un sistema que nos permite de tener siempre células iguales a la madre en con cuyo
trabajar sin problemas.
De Organismo de Forma Natural: es un sistema muy parecido a aquello de las células porque nos da la
característica igual a la célula de partencia.
Artificial: es un proceso de laboratorio que consiste en tomar un embrión de 8 células y generar un otro
exactamente igual que va a ser implantado en el útero para su desarrollo.
Reproductiva: no se puede hacer a nivel humano porque comportaría la formación de un organismo
exactamente igual a aquello principal. Fue actuada por primera vez sobre de una oveja, Dolly, que vivió como
una oveja normal hasta morir.
Terapéutica: se clonan tejidos y órganos que pueden trasplantar al paciente donante y curar así enfermedades.
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Consiste en fusionar el núcleo y un ovocito para crear un embrión con el que trabajar.
De Sustitución: es una unión entre la clonación reproductiva y terapéutica. Se creará una clonación por parte.
Especies Extintas o en Vía de Extinción: todavía hoy es un sueño difícil de realizar.
Mutagénesis
Es aquella modificación del material genético que resulta estable y transmisible a las células hijas que surgen
de la mitosis. Las lesiones generadas por estos agentes mutagénicos pueden resultar en modificaciones de las
características hereditarias o la inactivación del ADN. Cuando el ADN afectado corresponde a células de la
línea germinal se relacionan con la aparición de enfermedades hereditarias, mientras que las mutaciones que
se dan en las células somáticas están relacionadas con enfermedades degenerativas y procesos carcinogénicos.
METODOLOGIA A SEGUIR
OBJETIVOS DE LA PRÁCTICA
DESCRIPCIÓN DE LA ACTIVIDAD
Esta práctica debe desarrollarse en tres etapas que se describen a continuación:
Los ingredientes clave para una reacción de PCR son Taq polimerasa, cebadores, ADN molde y nucleótidos
(los bloques básicos del ADN). Los ingredientes se colocan en un tubo, junto con los cofactores que necesite
la enzima, y se someten a ciclos repetidos de calentamiento y enfriamiento que permiten la síntesis del ADN.
Desnaturalización (96°C): la reacción se calienta bastante para separar, o desnaturalizar, las cadenas de ADN.
Esto proporciona los moldes de cadena sencilla para el siguiente paso.
Templado (55 - 65°C): la reacción se enfría para que los cebadores puedan unirse a sus secuencias
complementarias en el molde de ADN de cadena sencilla.
Extensión (72°C): la temperatura de la reacción se eleva para que la Taq polimerasa extienda los cebadores y
sintetice así nuevas cadenas de ADN.
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Este ciclo se repite 25 -35 veces en una reacción de PCR típica, que generalmente tarda
2 – 4 horas, según la longitud de la región de ADN que se copia. Si la reacción es eficiente (funciona bien),
puede producir miles de millones de copias a partir de una o unas cuantas copias de la región blanco.
Eso es porque no solo se usa el ADN original como molde en cada ciclo. En realidad, el nuevo ADN que se
produce en una ronda puede servir como molde en la siguiente ronda de síntesis de ADN. Hay muchas copias
de los cebadores y muchas moléculas de Taq polimerasa flotando en la reacción, por lo que el número de
moléculas de ADN casi puede duplicarse en cada ciclo. La siguiente imagen muestra este patrón de
crecimiento exponencial.
Procedimiento:
Habitualmente, los resultados de una reacción de PCR se visualizan (se hacen visibles) al usar electroforesis
en gel. La electroforesis en gel es una técnica en la que una corriente eléctrica impulsa fragmentos de ADN a
través de una matriz de gel y los fragmentos de ADN se separan según su tamaño. Típicamente se incluye un
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estándar, o marcador de peso molecular, para que pueda determinarse el tamaño de los fragmentos en la
muestra de PCR.
Los fragmentos de ADN de la misma longitud forman una "banda" en el gel que se puede identificar a simple
vista si el gel se tiñe con un pigmento que se una al ADN. Por ejemplo, una reacción de PCR que produce un
fragmento de 400pares de bases (pb) se vería así en un gel:
Como se puede observar en la siguiente imagen, para poder realizar la reacción en cadena de la
polimerasa necesitamos determinar ciertos parámetros previos, iniciando por el número de ciclos a
repetir, luego la desnaturalización, la hibridación o alineamiento, y finalmente la extensión o elongación.
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Como la realización de la PCR se lleva a cabo in vitro, necesitamos recurrir a la temperatura como
herramienta para poder separar las dos cadenas de ADN, a diferencia la enzima Helicasa en el caso de una
célula (NIH, s.f.). En este caso, se conoce que para la desnaturalización necesitamos someter nuestra solución
a condiciones de temperatura de 80º a 10ºC durante un periodo de tiempo de 23 minutos. Por lo tanto,
aplicaremos una temperatura de 80ºC y un periodo de tiempo de 23 minutos.
-En esta fase annealing necesitamos determinar ciertas condiciones para favorecer el apareamiento de los
primers con la secuencia blanco. En este caso, se conoce que para la hibridación o alineamiento necesitamos
someter nuestra solución a condiciones de temperatura de 68ºC durante un periodo de entre 23 minutos, es
decir, tenemos que “enfriar” la solución (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura de
68ºC y el mismo periodo de tiempo anterior.
En esta parte del proceso de PCR a utilizar comienza con la extensión nucleótidos correspondientes que
fueron agregados al inicio, puesto que forman parte de los componentes químicos de esta técnica. Al final de
este paso obtendremos la hebra complementaria de ADN la cual denominan AMPLICÓN. En este caso, se
conoce que para la elongación o extensión necesitamos someter a nuestra solución a condiciones de
temperatura de 54ºC, ya que conocemos que la Taq polimerasa que utilizaremos tiene su mayor actividad
cuando la temperatura es cercana a los 70ºC (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura
de 54º centígrados durante otros 23 minutos.
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dNTPs: Este corresponde a los deoxinucleótidos trifosfato, los cuales son los ladrillos o bloques de
construcción usados para formar una nueva hebra de DNA. Se utilizó 1.5µL.
Primer: Este corresponde al cebador que delimitará la región de interés en el paso de hibridación. Se utilizó
2µL.
Polymerase: Esta es la enzima encargada de extender los cebadores o primers en la etapa de elongación, de
forma específica, utilizamos la Taq polimerasa. La cantidad fue 1U.
Como la realización de la PCR se lleva a cabo in vitro, necesitamos recurrir a la temperatura como
herramienta para poder separar las dos cadenas de ADN, a diferencia la enzima Helicasa en el caso de una
célula (NIH, s.f.). En este caso, se conoce que para la desnaturalización necesitamos someter nuestra solución
a condiciones de temperatura de 80º a 10ºC durante un periodo de tiempo de 24 minutos. Por lo tanto,
aplicaremos una temperatura de 80ºC y un periodo de tiempo de 24 minutos.
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-En esta fase annealing necesitamos determinar ciertas condiciones para favorecer el apareamiento de los
primers con la secuencia blanco. En este caso, se conoce que para la hibridación o alineamiento necesitamos
someter nuestra solución a condiciones de temperatura de 68ºC durante un periodo de entre 24 minutos, es
decir, tenemos que “enfriar” la solución (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura de
68ºC y el mismo periodo de tiempo anterior.
En esta parte del proceso de PCR a utilizar comienza con la extensión nucleótidos correspondientes que
fueron agregados al inicio, puesto que forman parte de los componentes químicos de esta técnica. Al final de
este paso obtendremos la hebra complementaria de ADN la cual denominan AMPLICÓN. En este caso, se
conoce que para la elongación o extensión necesitamos someter a nuestra solución a condiciones de
temperatura de 54ºC, ya que conocemos que la Taq polimerasa que utilizaremos tiene su mayor actividad
cuando la temperatura es cercana a los 70ºC (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura
de 54º centígrados durante otros 24 minutos.
dNTPs: Este corresponde a los deoxinucleótidos trifosfato, los cuales son los ladrillos o bloques de
construcción usados para formar una nueva hebra de DNA. Se utilizó 2.5µL.
Primer: Este corresponde al cebador que delimitará la región de interés en el paso de hibridación. Se utilizó
2µL.
Polymerase: Esta es la enzima encargada de extender los cebadores o primers en la etapa de elongación, de
forma específica, utilizamos la Taq polimerasa. La cantidad fue 1U.
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Como la realización de la PCR se lleva a cabo in vitro, necesitamos recurrir a la temperatura como
herramienta para poder separar las dos cadenas de ADN, a diferencia la enzima Helicasa en el caso de una
célula (NIH, s.f.). En este caso, se conoce que para la desnaturalización necesitamos someter nuestra solución
a condiciones de temperatura de 80º a 10ºC durante un periodo de tiempo de 24 minutos. Por lo tanto,
aplicaremos una temperatura de 80ºC y un periodo de tiempo de 24 minutos.
-En esta fase annealing necesitamos determinar ciertas condiciones para favorecer el apareamiento de los
primers con la secuencia blanco. En este caso, se conoce que para la hibridación o alineamiento necesitamos
someter nuestra solución a condiciones de temperatura de 68ºC durante un periodo de entre 24 minutos, es
decir, tenemos que “enfriar” la solución (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura de
68ºC y el mismo periodo de tiempo anterior.
En esta parte del proceso de PCR a utilizar comienza con la extensión nucleótidos correspondientes que
fueron agregados al inicio, puesto que forman parte de los componentes químicos de esta técnica. Al final de
este paso obtendremos la hebra complementaria de ADN la cual denominan AMPLICÓN. En este caso, se
conoce que para la elongación o extensión necesitamos someter a nuestra solución a condiciones de
temperatura de 54ºC, ya que conocemos que la Taq polimerasa que utilizaremos tiene su mayor actividad
cuando la temperatura es cercana a los 70ºC (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura
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dNTPs: Este corresponde a los deoxinucleótidos trifosfato, los cuales son los ladrillos o bloques de
construcción usados para formar una nueva hebra de DNA. Se utilizó 3.5µL.
Primer: Este corresponde al cebador que delimitará la región de interés en el paso de hibridación. Se utilizó
2µL.
Polymerase: Esta es la enzima encargada de extender los cebadores o primers en la etapa de elongación, de
forma específica, utilizamos la Taq polimerasa. La cantidad fue 1U.
Como la realización de la PCR se lleva a cabo in vitro, necesitamos recurrir a la temperatura como
herramienta para poder separar las dos cadenas de ADN, a diferencia la enzima Helicasa en el caso de una
célula (NIH, s.f.). En este caso, se conoce que para la desnaturalización necesitamos someter nuestra solución
a condiciones de temperatura de 80º a 10ºC durante un periodo de tiempo de 25 minutos. Por lo tanto,
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-En esta fase annealing necesitamos determinar ciertas condiciones para favorecer el apareamiento de los
primers con la secuencia blanco. En este caso, se conoce que para la hibridación o alineamiento necesitamos
someter nuestra solución a condiciones de temperatura de 68ºC durante un periodo de entre 25 minutos, es
decir, tenemos que “enfriar” la solución (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura de
68ºC y el mismo periodo de tiempo anterior.
En esta parte del proceso de PCR a utilizar comienza con la extensión nucleótidos correspondientes que
fueron agregados al inicio, puesto que forman parte de los componentes químicos de esta técnica. Al final de
este paso obtendremos la hebra complementaria de ADN la cual denominan AMPLICÓN. En este caso, se
conoce que para la elongación o extensión necesitamos someter a nuestra solución a condiciones de
temperatura de 54ºC, ya que conocemos que la Taq polimerasa que utilizaremos tiene su mayor actividad
cuando la temperatura es cercana a los 70ºC (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura
de 54º centígrados durante otros 25 minutos.
dNTPs: Este corresponde a los deoxinucleótidos trifosfato, los cuales son los ladrillos o bloques de
construcción usados para formar una nueva hebra de DNA. Se utilizó 4.5µL.
Primer: Este corresponde al cebador que delimitará la región de interés en el paso de hibridación. Se utilizó
2µL.
Polymerase: Esta es la enzima encargada de extender los cebadores o primers en la etapa de elongación, de
forma específica, utilizamos la Taq polimerasa. La cantidad fue 1U.
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Como la realización de la PCR se lleva a cabo in vitro, necesitamos recurrir a la temperatura como
herramienta para poder separar las dos cadenas de ADN, a diferencia la enzima Helicasa en el caso de una
célula (NIH, s.f.). En este caso, se conoce que para la desnaturalización necesitamos someter nuestra solución
a condiciones de temperatura de 80º a 10ºC durante un periodo de tiempo de 30 minutos. Por lo tanto,
aplicaremos una temperatura de 80ºC y un periodo de tiempo de 30 minutos.
-En esta fase annealing necesitamos determinar ciertas condiciones para favorecer el apareamiento de los
primers con la secuencia blanco. En este caso, se conoce que para la hibridación o alineamiento necesitamos
someter nuestra solución a condiciones de temperatura de 68ºC durante un periodo de entre 30 minutos, es
decir, tenemos que “enfriar” la solución (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura de
68ºC y el mismo periodo de tiempo anterior.
En esta parte del proceso de PCR a utilizar comienza con la extensión nucleótidos correspondientes que
fueron agregados al inicio, puesto que forman parte de los componentes químicos de esta técnica. Al final de
este paso obtendremos la hebra complementaria de ADN la cual denominan AMPLICÓN. En este caso, se
conoce que para la elongación o extensión necesitamos someter a nuestra solución a condiciones de
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temperatura de 54ºC, ya que conocemos que la Taq polimerasa que utilizaremos tiene su mayor actividad
cuando la temperatura es cercana a los 70ºC (Khan Academy, s.f.). Por lo tanto, aplicaremos una temperatura
de 54º centígrados durante otros 30 minutos.
dNTPs: Este corresponde a los deoxinucleótidos trifosfato, los cuales son los ladrillos o bloques de
construcción usados para formar una nueva hebra de DNA. Se utilizó 5.5µL.
Primer: Este corresponde al cebador que delimitará la región de interés en el paso de hibridación. Se utilizó
3µL.
Polymerase: Esta es la enzima encargada de extender los cebadores o primers en la etapa de elongación, de
forma específica, utilizamos la Taq polimerasa. La cantidad fue 7U.
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La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) es una técnica de laboratorio que permite amplificar pequeños
fragmentos de ADN para identificar gérmenes microscópicos que causan enfermedades. Habitualmente el
resultado de la PCR se puede resumir en positiva o negativa. Es decir, se ha encontrado el ADN que
esperábamos, o no. Eso es esencial para poder identificar gérmenes concretos y proporcionar un antibiótico
específico, o poder diagnosticar una enfermedad genética y medir la cantidad de ADN mutado.
Análisis de datos
El elemento principal en la PCR es el ADN, cuya naturaleza química ofrece ventajas para su manipulación.
Para entrar en contexto, es importante recordar que la molécula de ADN está formada por tres componentes:
un azúcar (desoxirribosa), un grupo fosfato y una base nitrogenada (adenina, timina, guanina o citosina) que es
complementaria con la base de otra cadena de tal forma, que el ADN se estructura en una doble hélice. La
complementariedad entre las bases está por puentes de hidrógeno e interacciones hidrofóbicas, generando
estabilidad a la doble hélice, la carga eléctrica del ADN es negativa y está dada por los grupos fosfatos. En la
PCR, el templado son las cadenas de ADN que se separan y funcionan como molde para que la enzima
sintetice las nuevas cadenas que llevan la secuencia blanco de interés. Por su parte, la ADN polimerasa se
encarga de la catálisis de la reacción, sintetizando las nuevas cadenas de ADN que llevan la secuencia blanco.
La combinación adecuada de todos los elementos químicos mencionados en este laboratorio hacen posible la
síntesis in vitro del ADN utilizando la PCR. Los cambios que ha sufrido la PCR como plataforma tecnológica
han sido muy notables; conforme los paradigmas de estudio de los ácidos nucleicos han ido cambiando, la
necesidad de ir mejorando la técnica se convirtió en una prioridad para los científicos; es por ello que la PCR
ha sufrido modificaciones para ofrecer una tecnología más innovadora apegada a los retos inherentes que
implica el estudio del ADN.
UNIVERSIDAD MANUELA BELTRÁN
MACROPROCESO DE RECURSOS E INFRAESTRUCTURA ACADÉMICA
FORMATO PARA PRÁCTICAS DE LABORATORIO UMB - VIRTUAL
Fecha: 7 de octubre de 2016 Código: Versión: 1.0
Conclusiones
Se observó y analizo la utilización de la PCR en tiempo real, así como también sus fundamentos v
características, utilizada para amplificar y simultáneamente cuantificar de forma absoluta el producto de la
amplificación de ácido desoxirribonucleico, para esto se emplea un molde de ADN y un par de cebadores
específicos, La PCR cuantitativa o PCR en tiempo real junta con los chip de ADN, representan una moderna
metodología para el estudio de la expresión genética.
La reacción en cadena de la polimerasa o PCR es una técnica de laboratorio común que sirve para hacer
muchas copias de una determinada región de DNA in vitro, esta región puede ser un gen cuya función es muy
variada, par ejemplo para ser comprendida por investigadores o como un marcador genético para científicos
forenses.
Etapa tres:
La nota del informe de laboratorio dependerá de la entrega del mismo en el formato asignado para tal
fin y de la entrega del pre informe; ambos en formato Word o PDF. El informe debe incluir lo siguiente:
Portada
Introducción
Objetivos
Materiales (imágenes)
Marco teórico (resumiendo la temática abordada)
Metodología
Descripción y tabulación de resultados
Análisis de datos
Conclusiones
Bibliografía
Materiales Cantidad
Aplicación de laboratorios virtuales (es un software libre), diseñados por
pcr.ico2 Link: http://virtual-pcr.ico2s.org/pcr/
MATERIALES Y EQUIPOS A UTILIZAR (Indicar las cantidades)
PROCEDIMIENTO A UTILIZAR
1. Ingrese al siguiente enlace: http://virtual-pcr.ico2s.org/pcr/ en donde podrá realizar una
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CRITERIOS DE EVALUACIÓN
Valor
No presentó Bajo Básico Alto Superior de
criterio Nota
0
Ponderada
0 2 3 4 5 100%
Redacta un
Redacta dos
objetivo donde
objetivos donde
se puede
Plantea se puede
Redacta dos identificar con
No plantea objetivos de identificar con
objetivos sin claridad el
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Planteamiento para el desligados de los verbo en tiempo
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el propósito y el infinitivo, el
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cómo lograr el
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presentados y
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Presento la
Presento la toma
toma de datos y
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en el desarrollo
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de la misma
misma no en el desarrollo
justifico
mostro los de la misma
parcialmente
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No presento Presento los procesos
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obtenidos, o resultados
no presentó pero no obtenidos, o
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Toma de datos y ninguna de las presento las presento
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preguntas preguntas parcialmente
preguntas sin respuestas
planteadas para planteadas para las respuestas
tomar en cuenta justificándolas
el análisis. el análisis. justificándolas
la realidad del desde los
desde los
concepto postulados
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abordado y teóricos
teóricos
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práctica de desde el módulo
desde el
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Presenta extrapolaciones
extrapolación extrapolaciones
extrapolaciones presentadas son
del concepto del concepto
que no están coherentes a la
Extrapolaciones No muestra abordado desde abordado desde
relacionadas con realidad del
o aplicaciones ninguna la práctica de la práctica de
el tema tema pero no se
de los conceptos extrapolación. laboratorio laboratorio 10% 0
abordados en el abordado en el derivan del
derivado de su derivado de su
laboratorio. desarrollo del análisis de su
aplicabilidad en aplicabilidad en
laboratorio. aplicabilidad en
su carrera. su carrera.
su carrera
La conclusión
La conclusión
La conclusión menciona
responde a los
retoma parcialmente
La conclusión no objetivos
parcialmente los elementos
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objetivos asociados a los
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No realizo las planteados al objetivos
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Conclusión trabajo de la embargo no laboratorio, 35% 0
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práctica de utiliza resultados y
presenta su extrapolaciones
laboratorio. argumentos análisis de los
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para reafirmar datos así mismo
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su postura en hace explicita
abordado. una postura
torno al tema su postura
sobre el tema
abordado. sobre el tema
trabajado.
abordado.
GLOSARIO
En las bases de datos de la UMB: Audesirk, T., Audesirk, G., & Byers, B. E. (2013). Biología: La vida la Tierra
Tierra. Pearson educación.
En las bases de datos de la UMB:Karp, G. (2014). Biología celular y molecular. McGraw-Hill Interamericana (7a.
ed.). México. Recuperado de: http://www.ebooks7-24.com
En las bases de datos de la UMB: Corvalán, R. (2009). Biología molecular: fundamentos y aplicaciones
diagnósticas. Rev. Méd. Clín. Condes, 8(1), 4-9.
https://es.khanacademy.org/science/ap-biology/gene-expression-and-
regulation/biotechnology/a/polymerase-chain-reaction-pcr
https://goldbio.com/articles/article/Como-Interpretar-Resultados-Electroforesis-Gel-ADN
ELABORÓ REVISÓ
APROBÓ
(Personas que elaboraron la (Director de Programa o
(Laboratorios)
guía) Área)