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EVALUACIÓN CONTINUA
BIOLOGÍA
GRADO EN FÍSICA
Apellidos:
Cayuela......................................................................................................................................
E-mail:
jose.m.cayuela@gmail.com....................................................................................................................
.......................
Teléfono:
608889105.......................................................................................................................................
En esta práctica se proponen una serie de ejercicios para aplicar los contenidos estudiados en el
temario de la asignatura relacionados con la estructura del DNA, la expresión génica, técnicas de
DNA recombinante y Ecología. Usted debe contestar a las cuestiones planteadas en cada uno de los
ejercicios.
1
EJERCICIO 1. EL GEN: SU ESTRUCTURA BÁSICA EN LOS EUCARIOTAS (2,5 puntos)
El gen es la unidad de transcripción básica. Consta de varios elementos que a lo largo del tiempo se
han identificado e incorporado a la definición del mismo. A pesar de que en un principio se definió un
gen como el fragmento de DNA que contiene información para codificar una proteína, hoy en día se
admite que un gen es aquel fragmento de DNA que contiene información para transcribir un RNA
funcional, es decir que no necesariamente se traduce en una proteína pero tiene una función celular.
En este ejercicio nos centraremos en un gen tipo que codifica para una proteína, pero el alumno ha de
tener presente que existen muchas variaciones sobre este esquema básico y que además de
productos proteicos los genes también codifican para RNAs con diversas funciones celulares.
1 2
3 4
DNA
5 6 7 8 9
Respuesta:
1. Secuencia reguladora
2. Secuencia de codificación
3. Exones
4. Finalizador
5. Intensificador
6. Elemento proximal del promotor
7. Promotor
8. Sitio de inicio
9. Intrones
Respuesta:
2
ADN, la ARN polimerasa construye una nueva molécula de ARN a través del apareamiento
de bases y en dirección 5’ - 3’.
Para comenzar la transcripción, la ARN polimerasa se une al ADN en una región llamada
promotor, que le indica dónde comenzar a transcribir. En eucariontes, proteínas auxiliares
llamadas factores basales de la transcripción se unen primero al promotor. Una vez
colocada la ARN polimerasa sobre el promotor, puede comenzar el siguiente paso de la
trascripción: la elongación, etapa en la que la hebra de ARN se alarga al agregar nuevos
nucleótidos. La ARN polimerasa seguirá transcribiendo hasta que reciba la señal para
parar. El proceso de finalizar la transcripción se conoce como terminación, y sucede una
vez que la polimerasa transcribe una secuencia de ADN llamada terminador.
En eucariontes, las moléculas de ARN deben ser procesadas después de la transcripción:
se empalman y se les añade un cap 5' y una cola de poli-A en sus extremos. Además,
muchos pre-ARNm eucariontes sufren empalme. En este proceso, partes del pre-ARNm
(intrones) se cortan y se eliminan, y las piezas restantes (exones) se vuelven a unir
1. Dada la secuencia:
5´…CCUCAUAUGCGCCAUUAUAAGUGACACACA…3´
3
Respuesta:
a) La secuencia pertenece a una molécula de ARN, ya que contiene uracilo entre sus bases.
b) 5 ́...CCU CAU AUG CGC CAU UAU AAG UGA CAC ACA... 3’. Iniciación: triplete AUG (codifica
la metionina). Terminación: triplete UGA (al no codificar ningún aminoácido, ocasiona el cese de la
síntesis)
c) Met - Arg - His - Tyr - Lys
d) 5’ ...GGA GTA TAC GCG GTA ATA TTC ACT GTG TGT... 3’
e) Las mutaciones sinónimas son las mutaciones que cambian una base por otra, dando como
resultado un codón diferente pero que sintetiza el mismo aminoácido.
El 12o nucleótido es C, que pertenece al triplete CGC, codificador del aminoácido arginina. En la
tabla, observamos que los tripletes GCU, GGA y CGG también lo codifican. Cualquier base errónea
que diera como resultado uno de estos tres codones produciría una mutación sinónima.
Por ejemplo, podríamos cambiar la citosina (CGC) por una guanina (CGG) y tendríamos una
mutación sinónima.
Las enzimas de restricción son una herramienta habitual en los laboratorios que se dedican a la
investigación en biología molecular, así como en el diagnóstico de numerosas patologías. A menudo,
se combinan con otras herramientas, como pueden ser los plásmidos, dando lugar a potentes
métodos que, hoy en día, hacen que sean imprescindibles para el análisis del DNA. El objetivo de
este ejercicio es familiarizar al alumno con las enzimas de restricción y proporcionar un primer
contacto en relación a su uso para que aprecie su utilidad a la hora de realizar el mapa de un
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fragmento de DNA. Gracias a estas enzimas, podemos conocer la localización y orientación del
fragmento dado dentro del genoma y realizar posteriormente la clonación del mismo en plásmidos,
que se emplean para secuenciar el DNA, realizar estudios funcionales de ese DNA y/o de la proteína
que codifica.
Puede visitar la siguiente página web para aprender a interpretar geles de DNA cortados con enzimas
de restricción, y a continuación responda a las cuestiones planteadas en este ejercicio:
http://biomodel.uah.es/an/plasmido/3/index.htm.
1. En la figura 1 se muestra un plásmido (DNA circular de origen procariota) con un tamaño de 20.000
pares de bases (20kb). Contiene varios sitios de restricción, que corresponden a dos endonucleasas o
enzimas de restricción, BamHI y EcoRI. La presencia de 4 sitios de corte y sólo 2 enzimas indica que
una o las dos enzimas pueden tener más de un sitio de corte.
Bam HI
(1)
pX
Bam HI (20000pb)
(14000)
(12000)
Bam HI (8000)
EcoRI
Figura 1. Mapa del plásmido pX y puntos de referencia de la secuencia.
Marcador (I) - consiste en una serie de fragmentos de DNA con un tamaño conocido que
se emplean como referencia para conocer el tamaño de los fragmentos obtenidos en la
digestión con las enzimas de restricción.
II, III y IV - Corresponden a los fragmentos de DNA obtenidos al digerir el plásmido con
una enzima o con las dos enzimas.
b) Analice los resultados del gel y deduzca con qué enzimas ha sido digerido el DNA cargado
en los carriles II, III y IV. (0,5 puntos)
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Figura 2
Respuesta:
a.
Digestión con la endonucleasa Tamaños de los fragmentos esperados:
BamHI 12kb - 2kb - 6kb
EcoRI 20kb
BamHI/EcoRI 8kb - 4kb - 2kb- 6kb
b.
Carriles Enzimas utilizadas:
Carril II BamHI
Carril III BamHI/EcoRI
Carril IV EcoRI
5´- ATGCGAATTCCCGCCAGGTTATGCAATTCATG-3´
3´- TACGCTTAAGGGCGCTCCAATACGTTAAGTAC-5´
a) ¿Cuántos y cuáles serían los fragmentos que se originarían si se corta con la enzima de
restricción EcoRI? (0,25 puntos)
b) ¿Cuántos y cuáles serían los fragmentos que se originarían si se corta con la enzima de
restricción EcoRII? (0,25 puntos)
c) ¿Cuántos fragmentos se obtendrían si se cortara la secuencia de DNA con las dos enzimas
anteriores de forma simultánea? (0,25 puntos)
d) ¿Qué tipos de extremos en el DNA cortado generan estas enzimas de restricción? (0,25
puntos)
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Respuesta:
1)
1) Transferencia del vector que contiene el DNA de interés (vector recombinante) a
una célula en donde se replique, proceso llamado “transformación” de la célula
huésped.
2)
2) Obtención de un fragmento o fragmentos de DNA que han de utilizarse o
manipularse.
3)
3) Selección de aquellas células que llevan las moléculas de DNA recombinante
deseado, y su replicación como clones.
3)
4) Unión de los fragmentos de DNA formando una molécula compuesta, DNA
recombinante, que puede actuar como vector, o ser incorporado en un vector para
su posterior transmisión.
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g) Vector recombinante
h) Secuencias de corte
de la enzima de
restricción
Respuesta:
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EJERCICIO 4. TECNOLOGIA DEL DNA RECOMBINANTE (2,5 puntos)
(Fuente:
http://biomodel.uah.es/epb/molecular_bio/problem_sets/Recombinant_DNA_Technology/
recombinant_dna.html)
El rápido avance de las técnicas en el campo de la biología molecular está revolucionando la práctica
de la medicina. Son muchos los usos de estas técnicas para el diagnóstico y el tratamiento de
enfermedades.
El término del DNA recombinante hace referencia a la generación de nuevas secuencias de DNA en
combinaciones nuevas (DNA recombinante) de segmentos o de moléculas de DNA que no se
encuentran juntas de manera natural.
La tecnología del DNA recombinante utiliza técnicas que provienen de la bioquímica de los ácidos
nucleicos unidas a metodologías genéticas desarrolladas originalmente para la investigación de
bacterias y de virus. La utilización del DNA recombinante es una herramienta muy poderosa para
explorar y manipular los genes, y actualmente son utilizadas para identificar genes defectuosos
asociados con enfermedades y para corregir defectos genéticos.
Con el conjunto de problemas que se proponen a continuación, se revisan algunas técnicas básicas
de DNA recombinante y su aplicación en la mejora de la salud humana.
1. Si fuera Ud. el analista de DNA, sacaría como conclusión (subraye la respuesta correcta):
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a. Los sospechosos 2 y 3 quedan excluidos como origen de la prueba del delito.
b. El sospechoso 4 tiene un patrón similar al del semen encontrado en la víctima y no se puede
descartar como culpable del delito.
c. El sospechoso 3 queda excluido como origen de la prueba del delito, pero no se puede descartar al
sospechoso 1.
d. El sospechoso 3 tiene un patrón idéntico al del semen encontrado en la víctima y se confirma como
culpable del delito.
Respuesta:
La PCR es una técnica de laboratorio que permite obtener una gran cantidad de copias de una
región de ADN in vitro. Consiste en colocar la enzima Polimerasa Taq, cebadores, ADN molde y
nucleótidos junto a los cofactores que necesite la enzima en un tubo y someter la mezcla a
repetidos ciclos de calentamiento-enfriamiento.
Primero el ADN se desnaturaliza a 96o, proporcionando un molde de cadena sencilla. A
continuación se baja la temperatura para que puedan actuar los cebadores, y finalmente la
temperatura vuelve a elevarse unos grados para que se sinteticen las nuevas cadenas.
Inserto rhoS
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EcIUCM01
EcIFJD23
EcIMJ44
EcIMK
1748pb
1225pb
917pb
Respuesta:
Lo presentan las estirpes 2 y 4 (EclMJ44 y EclMJD23) porque contienen los 1225 pares de bases
junto a los 523 pares de bases del inserto (Lo cual da los 1748pb de esas dos estirpes)
En la presente práctica el alumno deberá hacer uso del Laboratorio Virtual de Ingeniería Genética, al
cual puede acceder de las siguientes formas:
Mediante las herramientas que este Laboratorio proporciona, deberá responder a las siguientes
preguntas:
Tras llevar a cabo de manera virtual la identificación de transgénicos, responda a las siguientes
preguntas (subraye la respuesta correcta en cada caso):
Fases Temperaturas
A. Desnaturalización del DNA I. 95 ºC 30’’
B. Hibridación con los cebadores II. 72 ºC 45’’
C. Extensión III. 55 ºC 30’’
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a. I-A, II-B, III-C
b. I-A, II-C, III-B
c. I-B, II-C, III-A
d. I-C, II-A, III-B
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