Departamento de Química Orgánica y Bio-Orgánica

GRADO EN QUÍMICA

QUÍMICA BIO-ORGÁNICA Y
PRODUCTOS NATURALES

PRIMERA PRUEBA DE EVALUACIÓN CONTINUA

(PEC-1)

Temas (1-5) del programa

Temas (1-5) del texto base

Fecha límite de entrega online: 21 de noviembre

1. Definir los siguientes términos. Formular la respuesta utilizando estructuras o
ejemplos representativos: (1 punto)

a. Catálisis bifuncional
La realizan los llamados catalizadores bifuncionales activan simultáneamente tanto al
reactivo nucleófilo como al electrófilo. Un ejemplo es el ácido 2,2’-tolandicarboxílico en
etanol que reacciona muy rápidamente como catalizador ácido:

Ilustración 1: Catálisis bifuncional

b. Grupos bioisósteros
Son compuestos que tienen la forma, el volumen, la distribución y las propiedades
físico-químicas similares; son fundamentales en la farmacología a la hora de diseñar
nuevos fármacos a través de la modificación molecular. De esta manera se puede
optimizar el fármaco. En el siguiente ejemplo, podemos apreciar que se puede cambiar
el hidrógeno por un átomo de flúor debido a que tienen ciertas características similares:

Ilustración 2: Optimización de la molécula por cambio de átomo.

c. Iónoforos biológicos
Son receptores que pueden tener estructura de carbohidratos o péptidos cíclicos. Su
función es transportar iones metálicos, incluso los alcalinos, a través de medios no
polares como son las membranas biológicas. Un gran ejemplo es el macrociclo

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valinomicina, constituidos por 6 aminoácidos, 6 ésteres y 3 ácidos que están enlazados
alternativamente y cuya función es transportar cationes k+ a través de las membranas
celulares de manera selectiva en presencia del Na+.

Ilustración 3: Valiomicina formando un complejo con el catión K+

d. Calixarenos
Es un tipo de ciclofanos con fragmentos aromáticos unidos por puentes alifáticos, se
llaman calixarenos debido a que su conformación más estable parece un cáliz. Estos
macrociclos se obtienen por condensación de fenoles con formaldehidos en
condiciones que favorezcan la ciclación. Por su anatomía, los calixarenos son hosts
aptos para cationes, aniones y moléculas neutras.

Ilustración 3: Modelo de conformación más estable del p-terc-butilcalix[4]areno.

e. Hidrolasas
Son las enzimas que catalizan reacciones que son roturas hidrolíticas de enlaces: c-c,
c-o y c-n. Estas enzimas actúan extracelularmente y no necesitan coenzimas para
resistir reacciones severas. Las hidrolasas más importantes son las amidasas,
estereasas, proteasas, nitrilasas y las lipasas.

Ilustración 4:Reacción de la hidrolasa proteasa.

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2. Indicar para cada una de las siguientes afirmaciones si son verdaderas o falsas,
representando las fórmulas y esquemas de reacción en cada caso: (2 puntos)

a. El orden de energía de enlace para la siguiente serie es:

FALSO
El orden de energía de enlace es:

< < <

Las propiedades electrónicas de los sustituyentes juegan un papel importante ya que de

ellos depende la fuerza de interacción catión . Los grupos con efecto -I como el ciano
disminuyen la densidad de carga negativa en el sistema  debilitando la interacción. Por
otro lado, los grupos con efecto +I incrementan la separación de la carga de cuadrupolo y
fortalecen la unión catión-. El flúor tiene menor efecto -I que el grupo -CN y el benceno
menos que el flúor.

b. La biotina es una coenzima en cuya estructura química se encuentran dos anillos

heterociclos fusionados, y un ácido orgánico de cinco átomos de carbono. Su
función principal es la transferencia de grupos metilo.
FALSO
Si que es cierto que es una coenzima cuya estructura química se compone de dos
anillos heterocíclicos fusionados y un ácido orgánico de 5 carbonos, pero su función
principal es la transferencia de una molécula de CO2.

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c. La transformación biosintética del pirofosfato de geranilo en geraniol transcurre por
un mecanismo SN2.
FALSO
Esta transformación transcurre por sustitución nucleófila unimolecular (SN1) y su
mecanismo es el siguiente:

Ilustración 5: Transformación SN1 de pirofosfato de geranilo a geraniol.

d. Los cuatro compuestos de partida fundamentales para el metabolismo secundario

son: acetato en forma de acetilcoenzima A, mevalonato, shikimato y aminoácidos.
VERDADERO
Sus estructuras químicas son:

Ilustración 6:Building blocks del metabolismo secundario.

3. Responder a las siguientes cuestiones: (1 punto)

a. ¿Qué son las enzimas? ¿Cuál es su importancia para los seres vivos?
Son proteínas cuya función es catalizar las reacciones bioquímicas del metabolismo
modificando sus velocidades de reacción. Su importancia para los seres vivos es
debida a su eficacia y especificidad como catalizadores ya que estabilizan el estado de

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transición reduciendo la energía de activación necesaria para que el proceso ocurra y
se recuperan al final de la reacción.
b. ¿Cuáles son las categorías principales de enzimas?
Las categorías principales son 6:
• Oxidorreductasas que catalizan reacciones redox.
• Transferasas que transfieren grupos funcionales de una molécula a otra.
• Hidrolasas que catalizan reacciones con rotura hidrolítica de enlaces C-C, C-O
o C-N.
• Liasas añaden o quitan grupos funcionales para formar dobles enlaces o
añaden un grupo a un doble enlace.
• Isomerasas que transforman sustratos de una forma isómera a otra.
• Ligasas que catalizan la formación de enlaces C-C, C-S, C-O y C-N (unión de
sustratos).

c. ¿De qué manera la formación del complejo enzima-sustrato (ES) permite explicar la
disminución de la energía de activación de las reacciones químicas?
Los centros de la enzima actúan como receptores en el proceso de reconocimiento
molecular tanto del sustrato como del estado de transición donde, sus interacciones no-
covalentes son energéticamente más favorables cosa que ayuda a disminuir la energía
de activación.
Al formase el complejo enzima-sustrato, se transforma una reacción intermolecular a
una intramolecular cosa que, esta última en general, es mucho más rápida debido que
los grupos que reaccionan están más próximos. Por otro lado, la unión E-S disminuyen
el número de grados de libertad de la molécula sustrato.

d. ¿Cuáles son los factores que influyen de manera más directa sobre la actividad de una
enzima?
Los factores que influyen de manera directa son:
• El pH: ya que las enzimas son muy sensibles a los cambios de pH y pueden
afectar a su actividad.
• Temperatura: al superar su temperatura óptima, las enzimas puedes
desnaturalizarse y perder su actividad catalítica.
• La concentración del sustrato: si se aumenta la cantidad de sustrato a unas
determinadas enzimas se produce un aumento de la velocidad de reacción. Pero

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 si este aumento de sustrato es excesivo, se produce una saturación de la
enzima.
• Presencia de inhibidores: ya sean irreversibles o reversibles que disminuyen
su actividad enzimática.

4. En la siguiente tabla se muestran los parámetros termodinámicos (en disolución

acuosa a 25 ºC) para la reacción del Cu2+(aq) con varios ligandos: (1 punto)

a. Con los datos mostrados, determinar las constantes de enlace (log K) para los
complejos metal-ligando 1:1.
1.- △G =△H-T△S -> △G = -105-7,1=-112,1 KJ/mol.
△G =-R ·T·ln k → ln k=45,223 → 45,223 =2,303· log k → log k= 19,64

2.- △G =△H-T△S -> △G = -90,4-24,3=-114,7 KJ/mol.

△G =-R ·T·ln k → ln k=46,272 → 46,272 =2,303· log k → log k= 20,09

3.- △G =△H-T△S -> △G = -76,6-64,0=-140,6 KJ/mol.

△G =-R ·T·ln k → ln k=56,478 → 56,478 =2,303· log k → log k= 24,54

b. Explicar las diferencias en la estabilidad de los diferentes complejos:

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Teniendo en cuenta los valores obtenidos en el ejercicio anterior, podemos predecir
que, a mayor energía de Gibbs, mayor estabilidad del complejo. Por tanto, el complejo
más estable es el tercero de la tabla, el 1,4,8,11-tetraazaciclotetradecano. Los
complejos formados por este macrociclo son más estables porque el host está mejor
preorganizado.

5. Identificar la naturaleza de las interacciones moleculares no covalentes, en cada uno

de los complejos siguientes, indicando su fortaleza (energía de la interacción). Señalar de
qué tipo de complejo supramolecular se trata: (2 puntos)

a. [18]Corona-6 y catión potasio (1:1)

Se trata de un éter corona que son receptores macrocíclicos capaces de funcionar
como ionóforo con átomos alcalinos. Este macrociclo posee oxígenos que
establecen interacciones ión-dipolo con cationes metálicos. Su complejo más
estable es con el catión K+.

b. Criptofano A - CH4 (1:1)

Es un ciclófano policíclico con orientación anti que se enlaza fuertemente con la
molécula de metano formando un clatrato mediante interacciones de Van der
Waals e hidrófobas.

c. -Ciclodextrina – piroxicam (1:1)

Es un oligómero cíclico de 7 unidades de α-D-glucopiranosa de unión 1,4. Tiene
forma de cono y su interior tiene carácter no polar para permitir una interacción
hidrófoba con las moléculas incluidas en la cavidad y los hidroxilos periféricos
confieren al exterior carácter hidrófilo por lo que el complejo de inclusión es soluble
en agua.

d. Valinomicina -catión potasio (1:1)

Es un ionóforo biológico formado por 6 aminoácidos, 3 ácidos y seis ésteres que
forman un macrociclo cuya función principal es transportar cationes K+ a través de
membranas celulares de manera selectiva; estos cationes se incluyen en la cavidad
del macrociclo mediante las interacciones ión-dipolo con grupos carbonilo y el
complejo logra pasar a través de membranas gracias a su exterior hidrófobo.

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 e. El compuesto bisguanidinio cuya estructura se muestra a continuación y
R1R2C=NO− (1:1)
N

N N

H H

Se trata de un compuesto que se une a anfitriones para mejorar la complejación

entre aniones inorgánicos y orgánicos. Tiene una alta basicidad y su interacción es
mediante puentes de hidrógeno en un amplio rango de pH. En este caso, al unirse
al anión, su esqueleto hidrocarbonado reducirá dramáticamente la solvatación del
guanidinio y aumentará su liofilia permitiendo la creación del complejo.

6. Indicar para cada una de las coenzimas relacionadas a continuación: su nombre, si

son de naturaleza vitamínica o no vitamínica, y cual es su función química. Identificar
en cada una de ellas los fragmentos estructurales representativos. (2 puntos)

a) Esta es la molécula del fosfato piridoxal (PLP), una coenzima de naturaleza vitamínica y
un derivado de la vitamina B6. Trabaja en las reacciones enzimáticas como la
descarboxilación, transaminación, racemización, β -eliminación y retroaldólicas. Las partes
importantes son el piridoxal y el fosfato: Piridoxal

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 Fosfato
Ilustración 7: Molécula del fosfato de piridoxal (PLP).

b) La imagen nos muestra la molécula del ácido R(+)- lipoico, una coenzima de carácter no
vitamínico formado por 1,2-ditiolano y un ácido carboxílico de 5 carbonos y que su función
principal es la descarboxilación oxidativa. Desempeña un papel importante en la
degradación de la glucosa donde convierte el piruvato en acetil-CoA. Su forma activa es la
lipoamida donde el ácido está unido a un residuo de lisina.

Ilustración 8:Molécula del ácido R(+)-lipoico.

c) Se trata del trifosfato de adenosina (ATP), una coenzima de naturaleza no vitamínica

que su función principal es la transferencia de fosfatos y así proporcionar la energía para
activar las reacciones del metabolismo celular. En la siguiente imagen, podemos apreciar
la estructura de la molécula con sus tres partes importantes:

Trifosfato

Ilustración 9: Molécula del trifosfato de adenosina (ATP).

d) Por último, tenemos a la molécula del ácido ascórbico, es una coenzima de carácter
vitamínico de gran poder reductor (gracias a la lactona) combatiendo el estrés oxidativo
celular terminando las reacciones en cadena de los radicales libres. Se involucra en la
hidroxilación de la prolina y la lisina, en la síntesis de colágeno, en la biosíntesis de

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catecolaminas y en la degradación de la tirosina. Su carácter ácido es debido a que al
desprotonarse, su anión se estabiliza por resonancia; sus formas más importantes son:

Ilustración 10:Formas resonantes del ácido ascórbico.

7. Completar la siguiente transformación biosintética, indicando la estructura de los
compuestos formados en las etapas intermedias y las reacciones que han tenido lugar. (1
punto)
O
H
N + SCoA A
H H O
CH3
H
SCoA
H H

H2 O
C B

CO2
O

N
CH3
Higrina (racémico)

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 H (II) 2) H (II)
1) O B O B
O
H + H
+ SCoA SCoA
+ N
N SCoA
H H
CH3 forma enol acetil-CoA H3C
forma enol acetil-CoA

4) 3)
O O O O
H2O
N OH Hidrólisis N SCoA

H3C H3C
N-Metilpirrolidinacetoacetil-CoA
CO 2

5) Descarboxilación

H3C

Higrina (racémico)

Primeramente, se realiza una reacción de Mannich entre la sal N-metilpirrolidino y el ión

enolato (1) para obtener N-metilpirrolidinacetil-CoA. Después, ocurre una condensación de
Claisen con otra molécula de acetil-CoA (2) para producir N-metilpirrolidinaacetatocetil-CoA
(3). La siguiente reacción es una hidrólisis del tioéster y por último una descarboxilación
para obtener como producto la higrina racémica (5).

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