Documentos de Académico
Documentos de Profesional
Documentos de Cultura
Introducción y Optimización
10 Abril 2013
Ariana Veiga
Western Blot
¿En qué • También llamado Inmunoblot
consiste el
Western • Técnica utilizada para identificar una proteína en una muestra que contiene
Blot? varias proteínas
• Las proteínas de la muestra se separan mediante electroforesis en gel en función de su
peso molecular
¿Cómo
funciona?
• A continuación se utiliza un anticuerpo específico para detectar la proteína de interés
• El resultado aporta información sobre el peso molecular de la proteína y su cantidad
relativa en la muestra
2
¿En qué casos es útil utilizar
Western Blot?
3
Organización del Webinar
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
4
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
5
Preparación de las muestras para la
electroforesis
Lisis: Las células o los tejidos se tratan con un tampón de lisis y seguidamente se
degradan mecánicamente para liberar las proteínas
• Células: mantenerlas en hielo, lavar con PBS frío y añadir el tampón de lisis (~1ml por
cada millón de células). Después agitar durante 30 minutos a 4 ºC
6
Lisis
Mantener las muestras en hielo o a 4ºC para evitar degradación de las proteínas
Lisis: Las células o los tejidos se tratan con un tampón de lisis y seguidamente se
degradan mecánicamente para liberar las proteínas
• Células: mantenerlas en hielo, lavar con PBS frío y añadir el tampón de lisis
(~1ml por cada millón de células). Después agitar durante 30 minutos a 4 ºC
• Tejido: diseccionar rápidamente el tejido y mantenerlo en hielo. Congelar
inmediatamente en nitrógeno líquido y homogeneizar en tampón de lisis (300 µl
por cada 5 µg de tejido). Aclarar las cuchillas del homogeneizador con 2 x 300
µl de tampón, y agitar después durante 2 horas a 4 ºC
• Centrifugar a 4 ºC durante 20 minutos, aspirar el sobrenadante y mantenerlo
en hielo
8
Condiciones reductoras y
desnaturalizantes
SDS y DTT/
β-mercaptoetanol
Nota: Algunos anticuerpos solo reconocen las proteínas nativas (no reducidas y/o no desnaturalizadas). En este caso SDS y/o β-mercaptoetanol o
DTT no deben añadirse a los tampones.
9
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
10
SDS-PAGE
-
Corriente eléctrica
Frente de migración
+
12
Geles
14
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
15
Objetivo de la transferencia
16
¿Cómo funciona la transferencia?
Montaje de la transferencia
17
¿Transferencia en medio
húmedo o semi seco?
Ventajas Inconvenientes
• El gel y la membrana se intercalan y fijan Adecuado El proceso de
firmemente entre finas esponjas y papel para proteínas transferencia es
absorbente grandes o más largo
• Este montaje “sándwich” se sumerge en un difíciles de
Medio compartimento que contiene el tampón de transferir
Húmedo transferencia donde se aplica a continuación
la corriente eléctrica
• Un tampón de transferencia se compone
normalmente de 25mM Tris, 190mM Glicina
y 20% de Metanol
19
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
20
¿Por qué se utilizan anticuerpos?
21
Inmunodetección
Bloqueo de la
membrana Leche, BSA, etc…
Epítopo
Lavado (TBST)
Incubación con
Proteína Proteína
anticuerpo secundario Anticuerpo
conjugado
Lavado (TBST)
Detección
Proteína
22
Detección
Sustrato (peróxido de hidrógeno + luminol)
Los sustratos cromogénicos (4-cloronaftol o DAB) también pueden utilizarse con las
enzimas HRP o AP, dando lugar a un producto coloreado que se deposita en la
membrana próximo a la zona del anticuerpo
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
24
Controles de carga
Los controles de carga son anticuerpos usados para asegurar que la carga de proteínas en cada calle del gel de
SDS PAGE es constante
Un anticuerpo control de carga detecta una proteína altamente conservada y presente en cantidades similares
independientemente del tipo de muestra
25
Controles de carga
Nota: la afinidad del anticuerpo puede variar según la especie o naturaleza de la proteína (nativa o
recombinante), etc…
26
Controles positivos y negativos
27
Péptidos de bloqueo
28
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
29
Adecuado para Western Blot
30
Inmunógeno y especificidad
La selección del inmunógeno permite producir un anticuerpo que reconozca y se fije sobre
una región específica de la proteína (epítopo)
NERTCRCDKP
NERTCRCDKP
31
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
32
Ausencia de bandas,
o bandas muy débiles
Origen del problema Solución
Incompatibilidad con el anticuerpo Seleccionar un anticuerpo secundario que sea
secundario compatible con la especie y el isotipo del anticuerpo
primario (ej. Anticuerpo secundario anti-IgM de ratón
con anticuerpo primario IgM hecho en ratón)
No hay suficiente proteína o Aumentar la cantidad de lisado, de anticuerpo
anticuerpo para producir una señal primario o de anticuerpo secundario (incluso una
combinación de los tres)
Tiempo de incubación insuficiente Incubar la membrana con el anticuerpo primario
para producir una señal durante la noche a 4ºC
La membrana no se ha bloqueado Bloquear durante menos tiempo o usando un agente
correctamente de bloqueo diferente. La adición de Tween 20 al
tampón de bloqueo reduce la fijación del anticuerpo
al agente de bloqueo
La proteína no se ha transferido Comprobar que se ha producido la transferencia
correctamente del gel a la usando un colorante como rojo de Ponceau. Es
membrana posible que sea necesario aumentar o disminuir el
tiempo de transferencia
Las proteínas hidrófobas son más Para este tipo de proteínas usar membranas de
difíciles de transferir PVDF
La muestra no expresa la proteína Revisar literatura y bases de datos sobre la proteína
de interés de interés
El anticuerpo no reconoce la Verificar que la secuencia del inmunógeno está
proteína de interés presente en la proteína a estudiar
33
Ruido de fondo
Origen del problema Solución
Exceso de lisado celular, anticuerpo Reducir la carga de proteína en el gel y/o diluir más
primario o secundario que provocan los anticuerpos
uniones no específicas
34
Exceso de proteína y/o anticuerpo
Dilución de
la muestra y
anticuerpo
primario
35
Optimización del tampón de bloqueo
5% leche 5% BSA
5% BSA 5% leche
36
Burbujas de aire, lavados insuficientes,
transferencia incompleta
Durante la transferencia,
contacto insuficiente entre
el gel y la membrana
Lavados insuficientes
37
Proteínas en estado nativo
Algunos anticuerpos presentan mayor afinidad por las estructuras nativas de las
proteínas que por las formas desnaturalizadas y/o reducidas
La imagen muestra un Western Blot de colágeno III humano purificado, en la
forma reducida y desnaturalizada a la izquierda, y en su forma nativa a la derecha
La estructura tridimensional del sitio de unión del anticuerpo al antígeno se
pierde al desnaturalizar y reducir la proteína
38
Conocer la proteína de interés
39
Protocolo de Western Blot
Paso 4: Inmunodetección
Controles recomendados en WB
Selección de anticuerpos
40
Protocolos y material de interés
SwissProt – www.uniprot.org
• Protocolos detallados de WB
www.abcam.com/protocols
Anticuerpos
• Anticuerpos secundarios validados para WB
secondarios • Conjugados a fosfatasa alcalina (AP) o peroxidasa (HRP)
AbExcel
• www.abcam.com/abexcel
42
Optiblot – reactivos para WB
43
Anticuerpos monoclonales de conejo
( ), óptimos para WB
Histona H3 RabMAb: ventajas para WB
(fosfoT3) RabMAb
• Alta afinidad – mayor factor de dilución (hasta
1:500.000 en algunos RabMAbs)
• Alta especificidad – señal específica, sin o
con muy poco ruido de fondo
• Reconocen epítopos diversos – ideal para la
detección de modificaciones post-
traduccionales (ej. fosforilación, metilación,
acetilación)
• Cada RabMAb has sido testado en WB en
muestras humanas, de ratón y rata para
determinar la reactividad
• Más de 4000 RabMAbs disponibles
44
AbExcel anticuerpos secundarios
Más información:
AbExcel: http://www.abcam.com/AbExcel
45
Bolígrafo Luminol para membrana
(ab166858)
46
Contáctanos
soportecientifico@abcam.com
47
Promoción especial para participantes
• Gama Optiblot
• RAbMAbs
• Gama AbExcel
Código : SPWEB-XBIS1
48
¿Preguntas?
49