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Laboratorio 1
Laboratorio 1
OBJETIVOS
Conocer los principios de la técnica de electroforesis SDS-PAGE.
Observar el perfil de proteínas de las diferentes fracciones obtenidas durante la purificación de la caseína por
cromatografía de intercambio iónico.
Si suponemos una proteína formada únicamente por Una ventaja importante de los geles de poliacrilamida es
aminoácidos sin grupos laterales ionizables la carga neta que son químicamente inertes, transparentes y estables
de la proteína dependería exclusivamente de la en un amplio rango de pH, temperatura y fuerza iónica.
protonación/desprotonación de los grupos amino y Algunas características destacables de la electroforesis
carboxilo terminal. En la realidad las proteínas están en geles de poliacrilamida son:
formadas por multitud de aminoacidos unidos mediante
enlaces peptídicos y la carga va a depender de los Los geles de poliacrilamida se forman por la
grupos ionizables que poseen los aminoacidos que la polimerización de la acrilamida por acción de un agente
componen y del pH del medio. entrecruzador (cross – linking), la bis-acrilamida en
presencia de un iniciador y un catalizador. Como iniciador MATERIALES Y REACTIVOS
se suele utilizar TEMED (N,N,N,N'-tetrametilnediamina) y Los siguientes materiales y reactivos son de uso general:
como catalizador el ión persulfato (S2O8 –) que se añade
en forma de persulfato amónico. En algunas situaciones, Soluciones buffer pH 4.0 y 7.0 para calibrar el
como por ejemplo en el isoelectroenfoque en el que la potenciómetro
presencia de persulfato puede interferir con la Potenciómetro
electroforesis se emplean riboflavina y TEMED. Espectrofotómetro
Leche entera corriente (1 litro)
Las soluciones de acrilamida se desgasifican pues el Cámara de electroforesis
oxígeno es un inhibidor de la polimerización. Además, Fuente de poder
durante la polimerización se libera calor que podría Reactivo de Bradford
provocar la formación de burbujas en el seno del gel. La Patrón de albúmina de huevo 0.02 mg/ml
velocidad de polimerización viene determinada por la Un juego de micropipetas
concentración de persulfato (catalizador) y TEMED
(iniciador).
MATERIAL
CANTIDAD TIPO
REACTIVOS
La porosidad del gel la determina las proporciones
relativas de poliacrilamida y bis-acrilamida, siendo menor Vaso de precipitado
10 Agua destilada
el poro cuanta más bisacrilamida vs acrilamida se use. de 25 ml
Vaso de precipitado
2 Acetato sódico 0.1 N
El porcentaje total de acrilamida/bisacrilamida determina de 50 ml
el rango de separación del gel. Habitualmente los geles vaso de precipitado
1 Ácido acético 0.01 N
se denominan en función del % de de 250ml
acrilamida/bisacrilamida que contienen. Así, la mayoría 10 tubos de ensayo Ácido acético 0.1 N
de las proteínas se separan bien en el rango 5 a 10%. Un 1 Probeta de 50ml Ácido acético 1.0 N
menor porcentaje (mayor tamaño de poro) es mejor para Matraz aforado de 50
1 NaOH 1N
separar proteínas de gran tamaño. ml
pipeta graduada de
1 Éter etílico
En función del estado de las proteínas (nativo o 5.0 ml
desnaturalizado) a lo largo del proceso electroforético pipeta graduada de
1 Etanol al 70%
éstas se clasifican en electroforesis nativas o 1.0 ml
desnaturalizantes. pipeta graduada de
1
10.0 ml
Una electroforesis desnaturalizante, la más común, es la Embudo de vidrio
que somete a las proteínas a migración asegurando la 1
mediano
completa desnaturalización (pérdida de la estructura 1 Termómetro
tridimensional). En esta situación la migración es Papel de filtro
proporcional a la carga y al tamaño de la molécula pero
no a su forma. El agente desnaturalizante más empleado Nota: Las soluciones que se requieren para la
es el sodiododecilsulfato o SDS, un detergente. electroforesis se adjuntan en el Anexo 1, estas
soluciones ya han sido previamente preparadas para la
Una electroforesis nativa es la que somete a las práctica en el laboratorio
proteínas a migración sin desnaturalización. En esta
situación las proteínas migran en función de su carga, de PROCEDIMIENTO
su tamaño y de su forma. Además se mantienen en Aislamiento de caseína
ciertos casos las interacciones entre subunidades y entre Calentar en un vaso de precipitado 100mL de agua
proteínas, separándose los complejos. Los sistemas destilada a 38°C, añadir 50mL de leche. Luego agregar
tampón empleados en estos caso son: tris-glicina (rango gota a gota con bureta y con agitación ácido acético 1N,
de pH 8.3 a 9.5), tris-borato (rango de pH 7.0 a 8.5) y tris- hasta que se observe un precipitado, es decir, la leche se
acetato (rango de pH 7.2 a 8.5). corte.
Añadir 1mL de la solución de caseína a cada vaso. (Para
Precipitar, centrifugar y guardar para utilizar en esto usted gastara 10ml de la solución de caseína). La
procedimiento de electroforesis (solución A). Lavar el fracción sobrante, se debe guardar como solución D.
precipitado con 20mL de etanol y centrifugar nuevamente
(solución B). Agitar suavemente y esperar aproximadamente 3
minutos, luego medir la absorbancia de cada muestra a
Pesar un vaso de precipitados pequeño y colocar el 640nm con cubetas de colorimetría de 1cm de paso
precipitado en él, volver a pesar el vaso; a continuación, óptico. Anotar los resultados a fin de representar la
adicionar 10 mL de éter etílico, centrifugar y recoger absorbancia frente al pH y determinar el pI aproximado
centrifugador (solución C). de la caseína.
Leche (ml)
Biuret (ml)
Agua (ml)
Albumina
Extracto
de precipitado de 50mL. Agregar 20mL de agua destilada
Tubo
(ml)
(ml)
y 5mL de NaOH 1N, agitar hasta completar la disolución
total de la caseína.
Finalizada la corrida extraer los vidrios del cassette 3. SDS 10% (p/v), 100ml:
cuidadosamente y separarlos de manera tal que el gel Pesar 10 g de SDS, añadir agua destilada hasta
quedara posado sobre uno de los vidrios. Sumergir el gel completar el volumen de 100ml, información de
en una solución colorante (1g de azul de Coomassie, seguridad: El SDS es un polvo fino neurotóxico, por lo
459ml de metanol, 450ml de agua destilada y 100ml de tanto se debe usar máscara, guantes y lentes de
ácido acético glacial) por 3 horas. Transcurrido el tiempo, protección para su manipulación.
sumergir el gel en una solución decolorante (100ml
metanol, 100ml de ácido acético glacial, 800ml de agua 4. Glicerol 50% (v/v), 100 ml:
destilada) para eliminar las asociaciones inespecíficas Tomar un volumen de 50ml de glicerol al 100%, añadir
del gel al colorante. Observar las bandas proteicas. 50ml de agua destilada
NOTA:
Las soluciones 1, 2 y 6 son estables por meses a 4°C.
Las soluciones 7 y 9 deben ser almacenadas a –20°C. El
resto a temperatura ambiente.