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CITOGENETICA
Encontramos dos áreas zonas sucias y zonas limpias entre las que no se pude cruzar materiales para
intentar minimizar el riesgo de contaminación.
La técnica básica que se lleva a cabo es la reacción en cadena de la polimerasa (PCR), técnica
mediante la cual se puede amplificar(copias) una muestra de ADN. En una PCR no se amplifica el
ADN entero, solo un fragmento, la polimerasa va a copiar la parte que le índique una molécula. Se
realiza en un termociclador (se pueden procesar 90 muestras) y se suele programar entre 30 y 40
ciclos.
Para empezar la PCR tiene que separarse las dos cadenas para que la polimerasa pueda comenzar
su trabajo y eso se hace variando la temperatura.
Etapas de la PCR:
CICLO 1
Desnaturalización 95ºC; anillamiento 55-65ºC; elongación 72ºC
CICLO 2 (se sintetizan 4 nuevas cadenas)
Desnaturalización 95ºC; anillamiento 55-65ºC; Elongación 72ºC
(Dos ciclos y no hay fragmento que se quiere amplificar, ya que todas las cadenas tienen restos de la
cadena principal)
CICLO 3 (8 moléculas de las cuales 2 son la copia del gen que queríamos amplificar)
Desnaturalización 95ºC; anillamiento 55-65ºC; elongación 72ºC
CICLO 4 (Partimos de 8 moléculas y dos fragmentos que nos interesan y cuando terminen
contaremos con 16 moléculas y tendremos 8 copias de interés.)No se duplican ,crecen
exponencialmente.
Las copias de gen de interés se calcula haciendo 2 elevado a “n” , siendo n el número ciclos que
se realiza menos 2 por n (TODOS DEL MISMO TAMAÑO)
2.1 El equipamiento
Específico
Permite realizar técnicas exclusivas de este tipo de laboratorio. Equipamiento necesario para
realización PCR y análisis de los productos obtenidos.
También forman parte los aparatos automáticos necesarios para los procesos específicos como son:
La secuenciación de los fragmentos que son objeto de estudio. Esta función la cumplen los aparatos
denominados secuenciadores.
Termociclador
Bloque incubador: Soporte metálico con múltiples pocillos para colocar los tubos de reacción de
PCR .El rango de temperaturas esta entre 4 a 96ºC.
Los distintos modelos que existen se diferencian en la tecnología para calentar y enfriar el bloque:
Efecto Peltier: Efecto termoeléctrico que produce transferencia de calor entre 2 metales o
semiconductores distintos unidos por dos soldaduras cuando son atravesados por una corriente
eléctrica continua. Este efecto se usa en termocicladores para aumentar o bajar temperatura del
bloque rápidamente, invirtiendo la polaridad de la corriente continua que alimenta el circuito.
El equipo de electroforesis
ELECTROFORESIS
Este proceso sirve para separar moléculas de ácidos nucleicos de distintos tamaños y permite
analizar los productos amplificados en una PCR o purificar y obtener fragmentos de tamaño
concretos de ADN.
Se lleva a cabo aplicando un campo eléctrico, en una disolución tampón en la que se sumerge una
matriz que contiene las muestras de ácidos nucleicos, migran con más o menos velocidad a través
de la matriz en función de la carga neta que poseen.
La matriz que se utiliza es un gel de agarosa o de poliacrilamida (el uso de los geles y la
concentración depende del tamaño de las moléculas que queremos separar)
Para poder visualizar los resultados hay que añadir un agente intercalante; el bromuro de etidio, un
agente cancerígeno,que se intercala entre las hebras de ADN
Procedimiento
1º Añadir una solución tampón (MANTIENE CONSTATE EL PH) TAE1%: Tris base, ác.Acético y EDTA
(ácido etilendiaminotetraacerico,agente quelante) (pH 7,5-7,8)
5º Ácidos nucleicos migraran con mayor o menor velocidad a través del gel en función de:carga neta
que posean tamaño y conformación tridimensional.
Las moléculas más pequeñas migrarán más rápido que las grandes y por tanto aparecerán en la
parte inferior del gel, mientras que las de mayor tamaño quedan en la parte superior.
Documentador de geles
Visualizar las bandas de ácidos nucleicos en el gel después de la electroforesis y obtener una
fotografía de él.
Cabina de bioseguridad
Sistema de purificación de agua
Espectrofotómetro
Microscopio de luz transmitida y fluorescencia
Autoclave
Incubador o estufa
Baño termostático, termobloque y placa calefactora
Centrífuga y microcentrífuga
Neveras y congeladores
Otros equipamientos
Autoclave: recipiente metálico de paredes gruesas con cierre hermético que permite
trabajar con vapor de agua, a alta presión y alta temperatura que sirve para esterilizar
material
Incubador o estufa estas características dependen de las muestras que se estudien. Si se
trabajan con bacterias se necesitarán estufas de cultivo de microbiología. Si se trabaja con
cultivos celulares se requerirán incubadores con CO2 y humedad controlada.
Baño termostático, termobloques y placa calefactora temperatura regulable es básico
para realizar todo tipo de incubaciones, digestiones y tratamientos enzimáticos.
Centrífuga y microcentrífuga aparatos mediante los cuales separamos componentes
por densidades, permiten centrifugar tubos de 50 a eppendorf de 0,2 ml. (el rotor siempre
debe estar equilibrado)
Neveras y congeladores de -20 y -80ºC, imprescindibles para conservación de
reactivos y muestras:
Reactivos y enzimas: -20ºC
Muestras de ARN y almacenamiento a largo plazo muestras de ADN -80ºC CONGELADAS
PREVIAMENTE EN NITRÓGENO LÍQUIDO.
Otros equipamientos: Balanzas, agitadores magnéticos, vórtex, pHmetro
Preparación de reactivos
Extracción y purificación de ADN de una muestra biológica
Reacción de PCR
Cada fase de PCR se realizará en un área de trabajo independiente, separados físicamente, cada una
con su propio equipamiento y material de trabajo.
Importante que no se contaminen los reactivos con ADN por lo que debería tener presión positiva
imprescindible que disponga de una cabina de bioseguridad.
Sala de secuenciadores
Sala sucia
En el laboratorio de biología molecular el flujo debe ser unidireccional, desde las áreas limpias hacia
las áreas sucias.
Salas autónomas y cada sala tiene su propio equipamiento: Micropipetas, EPIs, material fungible.
Fuentes de contaminación
Tener un plan de mantenimiento, para garantizar que los aparatos estén correctamente
calibrados, con revisiones periódicas. (equipamientos e infraestructuras).
Asegurar la trazabilidad de los reactivos.
Tener en RRHH un plan de formación y adiestramiento continuados.
Tener técnicas de procedimientos estandarizados, mediante PNT (procedimientos
normalizados de trabajo): recepción de muestras, desarrollo, emisión resultados.
Gestión ambiental: buenas prácticas, reducir consumo, garantizar el reciclado.
3 EL LABORATORIO DE CITOGENETICA Y CULTIVOS CELULARES
Incubador de CO2
Proporciona las condiciones ambientales óptimas para el crecimiento celular en el medio de cultivo.
Elementos:
Control de Tª: fija y mantiene estable, para cada tipo de cultivo una temperatura optima
Recirculación del aire interior: homogeneizar la temperatura.
Control CO2: mezcla el CO2 puro en botella presurizadas con aire en proporción 4-7% inyectándolo
en interior incubador.
Control de humedad: inyecta H2O estéril. Cuando la humedad sube evitamos la evaporación del
medio de cultivo.
Microscopio invertido
Permite controlar el crecimiento del cultivo. La fuente de luz está encima de la platina y los objetos
debajo. Consta con un sist. de contraste de fases, para facilitar la visión de células en crecimiento sin
tinción. (Control diario resiembra cada semana).
Equipo de criogenia
Conservar a largo plazo y de forma variable muestras de células y cultivos celulares, formad por
depósitos de nitrógeno líquido.(-195,8ºC).
Sistema de purificación del agua esta agua tiene que ser ultrapura estéril y libre de pirógenos.
Otros equipamientos: centrífugas con rotores apropiados, placas calefactoras (hibridación in situ),
pHmetro, balanza, agitador magnético, pipeteadores automáticos.
Sala de cultivos: (Zona limpia) se van a realizar todos los procedimientos directos con el
cultivo celular. Se encuentran las cabinas de flujo laminar, los incubadores y el microscopio
invertido
Sala de laboratorio convencional: (Zona sucia) aquí no realizan procedimientos directos con
el cultivo, se encuentran todos los equipos menos el equipo de criogenia.
Sala de frío: con congeladores y equipo de criogenia. Para conservar cultivos celulares
procesados.
4.Seguaridad de laboratorio
La seguridad de los laboratorios de biología molecular, citogenética y cultivos celulares, previenen la
exposición del personal a agentes nocivos e impedir la liberación de estos al exterior.
4.1 Bioseguridad
Engloba todas la técnicas, normas, prácticas y hábitos de trabajo que intentan evitar la exposición
accidental del personal a agentes biológicos potencialmente peligrosos, e impedir la liberación de
estos al exterior.
Cualquier muestra puede ser potencialmente peligrosa por lo que se deben de utilizar EPI.
En los laboratorios de cultivos celulares y de citogenética como mínimo hay 2 niveles, pero hay 4
niveles, de menor a mayor peligrosidad.
Una sustancia teratógena es aquella que puede influir en el desarrollo del feto.
Estas medidas quedan basadas en la Ficha de Datos de Seguridad (FDS)que es específica para cada
producto: composición, manipulación, peligros, vías de exposición, efectos tóxicos, eliminación y
primeros auxilios.
Inflamables alcoholes
Tóxicos y muy tóxicos acrilamida, azida sódica, bromuro de etidio
Carcinógenos: acrilamida(grado2), DAB, formaldehído
Mutágenos acrilamida, bromuro de etidio
Teratógenos y/o perjudiciales para la fertilizad: acrilamida, formida, tetrametil, urea
Gestión de residuos tóxicos y peligros deben de inducir medidas para la recogida selectiva,
clasificación y el almacenamiento temporal de residuos hasta su recogida por una empresa gestora
Residuos biosanitario especiales se incluyen grupos punzantes y cortantes q han estado en contacto
con productos biológicos, cultivos biológicos, cultivos microbiológicos y material contaminado
Residuos químicos envases que han contenido productos químicos reactivos caducados o
innecesarsios
Residuos radiactivos.
Se recogen:
Y deben cumplir:
En caso de derrame, que es el accidente más común en el laboratorio, se deben llevar a cabo 3
acciones de forma inmediata:
Neutralización: depende de las características químicas del producto derramado
Absorción: el material absorbente depende del producto derramado
o Celulosa, absorbe derrames en pequeñas cantidades
o Serrín, para líquidos no inflamables, tóxicos ni corrosivos
o Carbón activo, para líquidos inflamables, tóxicos y corrosivos
o Absorbentes/neutralizador comercial
Eliminación: se debe introducir el residuo en un envase adecuado y eliminar en el
contenedor específico
o Derrames de productos en polvo, se debe evitar la formación de aerosoles y polvo
en suspensión.
o Derrames de productos volátiles tóxicos recogidos con celulosa, se debe meter
cuanto antes en un envase hermético.
Mientras se lleven a cabo estas actividades se debe restringir el acceso al laboratorio, mientras que
el personal responsable de la recogida debe estar equipado con los EPI y tener especial cuidado con
los derrames de líquidos inflamables y volátiles.