Está en la página 1de 44

TEMA: PROTEOMA HUMANO.

INTEGRANTES: ARGOTTI ZUMBANA RODRIGO DANIEL CURICHO RONQUILLO CRISTINA ELIZABETH JIMNEZ MOREJN VINICIO XAVIER MORALES ALDS ANDREA CAROLINA SEMESTRE: 4TO PARALELO: C ESPECIALIDAD: MEDICINA DIRECTOR: DR. PATRICIO ZURITA

DEDICATORIA

En el difcil trajinar de la existencia asoman impetuosos los pensamientos que marcan el hito de las pginas de la historia, as es como todos nosotros a travs de este trabajo hemos descubierto el sacrificio de quienes dispusieron a ayudarnos. En especial agradecemos al Todo Poderoso quien con su divino poder, infundi su sabidura en cada uno de nosotros al darnos conocimiento y existencia sobre este tipo de tema.

AGRADECIMIENTO

AGRADECEMOS..... A todos y cada uno de nuestros maestros quienes han sabido diariamente impartir, sus valiosos conocimientos, a todos y cada uno de nosotros.

Agradecemos a todas las personas quienes forman esta prestigiosa institucin, como tambin a cada uno de nuestras compaeras y compaeros.

INTRODUCCIN

PROTEOMA HUMANO: EL NUEVO DESAFO En la jerga biolgica ltimamente son muy abundantes los denominados omas, es decir, trminos conceptuales entre los que podramos destacar genoma, transcriptoma, metaboloma y proteoma. En realidad, con ellos se trata de describir los diferentes niveles de anlisis con los que se puede abordar el funcionamiento de nuestras clulas, rganos, tejidos u organismos. De este modo, el genoma (constituido por ADN) es el conjunto de genes. Una parte de esos genes se transcriben en forma de ARN mensajero, cuyo conjunto sera el transcriptoma. Los ARN mensajeros codifican la sntesis de protenas y el conjunto de todas las protenas obtenidas directamente o tras diversas transformaciones constituye el proteoma, mientras que el trmino metaboloma se reservara al conjunto de los diferentes metabolitos existentes, con diversas naturalezas qumicas.

JUSTIFICACIN.Nosotros como estudiantes, escogimos este tema, para conocer los ltimos avances de desarrollo biolgico que hacen referencia al Proteoma Humano.

Adems la continua investigacin en lo que concierne a gentica ha provocado que se vaya ms all del mtico genoma humano.

Para lo cual, cientficos han descompuesto la cadena gentica en diminutas estructuras denominadas protenas, que estn constituyendo parte fundamental del complejo sistema del organismo vivo.

OBJETIVOS.-

1. Objetivos generales:

Conocer sobre el desarrollo investigativo del Proteoma Humano000.

2. Objetivos Especficos:

Obtener una resolucin ms alta de la estructura de las protenas humanas especficas y protenas de patgenos.

Explorar ms all de los lmites de prediccin de la estructura de protena.

CAPTULO

1.1.- Caractersticas Generales.

ANTECEDENTES HISTRICOS A lo largo del siglo XX se han logrado grandes avances en la comprensin de las bases genticas de los fenmenos biolgicos. La biologa molecular de los cidos nucleicos (ADN y ARN) tuvo un desarrollo vertiginoso, y en alrededor de 50 aos pasamos de la comprensin bsica de su naturaleza qumica (la doble hlice) a la secuencia completa de los cromosomas humanos. Sin embargo, el Proyecto Genoma Humano representa slo el fin del principio. La secuencia del genoma es un conjunto de datos muy valiosos, pero absolutamente esttico. Pensemos por ejemplo en dos clulas de un mismo individuo, una heptica y una nerviosa, ambas poseen el mismo genoma, sin embargo, es obvio que presentan grandes diferencias funcionales y estructurales. Estas diferencias no pueden ser explicadas por su genoma. Dnde buscar entonces? Una respuesta posible podra ser buscar en el resultado de la expresin de ese genoma, es decir, en las protenas que se sintetizan a partir de la informacin contenida en el ADN. Este nivel de anlisis nos puede brindar una visin dinmica, ya no de la informacin gentica contenida en el ncleo de la clula sino de qu parte de esa informacin se est manifestando en un momento dado. Podemos ver tambin la situacin de

la siguiente manera: cuando existe una modificacin en el ambiente, pensemos simplemente en un cambio de temperatura, nuestro genoma permanece inalterado, sin embargo, NUESTRO PROTEOMA (el conjunto de nuestras protenas), se modifica inmediatamente para conservar las propiedades fisiolgicas de las clulas. Es por esto que muchos investigadores prefieren definir este tipo de estudios como protemica funcional, para que refleje la naturaleza dinmica que posee describir todas las protenas sintetizadas por un organismo en un tiempo relativamente breve. En principio podramos pensar que las protenas sintetizadas por un organismo deberan poder ser deducidas a partir de su genoma. Pero no todo es tan sencillo.

IMPORTANCIA.Despus del genoma, el estudio del proteoma, fue una bomba, esta fue la reaccin ante la noticia que sorprendi al mundo cuando a los cientficos que estaban realizando el Proyecto Genoma Humano les preguntaron qu vendra despus. La protemica, el estudio mediante el cual se busca identificar la estructura y la cantidad total de protenas que concurren en la realizacin de los distintos procesos biolgicos en un organismo, es un anlisis mucho ms complejo y de mayor alcance que la genmica. Al fin y al cabo, son las protenas, y no los genes, las molculas que realizan el verdadero trabajo dentro de una clula. Por consiguiente, la deficiencia en la sntesis de protenas es lo que realmente causa las enfermedades, bien sea esa deficiencia el resultado de fallas en la estructura celular generadas por genes mutantes o sea slo una consecuencia del desgaste natural de la clula. El Proyecto Genoma Humano, que identific los genes y la secuencia total de las bases nitrogenadas que constituyen el ADN humano, fue todo un xito gracias a una gran lucha de egos. Al contrario, los cientficos que se han abocado al estudio del proteoma han sido modestos, y por tanto la noticia sobre sus investigaciones nada ruidosa. El hecho de que estn intentando trabajar con calma no quiere decir que hayan

permanecido ociosos. Recientemente se dio a conocer un estudio sobre el proteoma que ayuda a establecer una causa subyacente comn a padecimientos neurodegenerativos como el mal de Parkinson y la enfermedad de Alzheimer.

1.2.- EN POS DEL CONOCIMIENTO.UN GEN, UNA PROTENA?

Hace aproximadamente 40 aos se postul el dogma central de la biologa, por el cual se propona el axioma un gen, una protena. Esto fue de gran importancia porque vinculaba de una manera eficiente a las molculas responsables de la mayora de las actividades biolgicas conocidas con la molcula que contena la informacin para su sntesis. Este axioma es en lneas generales vlido, pero a medida que se extendieron y profundizaron los estudios genticos y bioqumicos se observ que no todo es exactamente as. Pero primero veamos en que consiste la sntesis de protenas. La informacin bsica y fundamental para que se puedan sintetizar las protenas est contenida en el ADN. Esta molcula es un polmero de slo cuatro elementos distintos (los nucletidos A, C, G y T). As, una secuencia de ADN puede representarse como un texto escrito con estas cuatro letras, por ejemplo, AAT TTG GTA ATT AAG CCC. Esta informacin est contenida en el ncleo y debe ser llevada hasta el lugar mismo donde se van a sintetizar las protenas.

De esto se encarga otro cido nucleico denominado ARN mensajero (ARNm). El ARN mensajero tiene una estructura similar a la del ADN pero es ms pequeo y puede atravesar la membrana nuclear e ir hasta el citoplasma. All, la informacin es traducida de un lenguaje de nucletidos a uno de aminocidos (los constituyentes bsicos de las protenas). El cdigo que utiliza la clula para esta traduccin es relativamente sencillo, a cada grupo de tres nucletidos (denominado codn) se le asigna un aminocido. As, por ejemplo a la trada AAT le corresponde el aminocido asparagina, y a la TTG leucina, entonces, la secuencia de nucletidos AAT TTG GTA ATT AAG CCC resulta en los aminocidos leucina, valina, isoleucina, lisina y prolina. Pero ocurre que en muchas ocasiones el ARNm es editado antes de ser traducido, es decir, fragmentos de ARN se cortan y pegan formando un mensaje nuevo, entonces la secuencia de aminocidos sintetizada es distinta. Este proceso es denominado splicing. Pero las complicaciones para el dogma no terminan aqu. Muchas protenas

10

una vez sintetizadas son modificadas por la unin de otras molculas, tales como fosfatos, acilos, azucares, lpidos, etc., molculas que se unen de forma estable y pueden modificar radicalmente la actividad biolgica de la protena. Entonces, si consideramos las modificaciones postrancripcionales (edicin de ARN) y postraducionales (fosforilacin, ubiquitinilacin, glicosilacin,

adenilacin, unin a lpidos, clivaje proteoltico, etc.) vemos que se puede arribar a protenas de actividad biolgica muy diversa partiendo de un mismo gen. Segn se ha estimado hay en promedio alrededor de 1 a 2 protenas por gen en bacterias, 4 a 6 en levaduras y hasta 8 en el ser humano. Esto hace que la informacin contenida en el genoma no sea suficiente para inferir cules son las protenas celulares y mucho menos para interpretar qu es lo que est pasando en una clula. De hecho, se calcula que en el ser humano existen algo as como 20000 a 40000 genes, que generan no menos de 60000 a 80000 ARN mensajeros, resultando luego en 200000 a 400000 protenas.

QU ES UNA PROTENA?

11

Las protenas estn lejos de ser slo cosas que nosotros comemos. Ellos son las mquinas moleculares que llevan a cabo el metabolismo, ellos llevan los mensajes que el desarrollo directo y permite al sistema inmunolgico decirle al amigo del enemigo, ellos reparan el dao a nuestro ADN despus de que nosotros nos hemos pasado demasiado tiempo en el sol. Para abreviar las protenas estn en el centro de biologa Humana, toda la biologa. Pero que es una protena? La mayora del cdigo de los genes para las protenas. Las protenas son polmeros que se construyen del monmeros ms pequeo llamados los aminocidos (150 en un momento, pero la longitud de protenas vara de gen a gen). Estos cordones de aminocidos (con aminocidos diferentes que tienen formas y propiedades qumicas diferentes) entonces el pliegue, para hacer formas ms compactas que tienen la funcin especfica. As que la naturaleza puede usar los mismos 20 aminocidos que estn en forma de escalera para hacer una protena, la variedad es grande, de formas y funciones que usan los mismos 20 12

aminocidos, el mismo ribosoma (la mquina que ata los aminocidos juntos), al combinar de diferente orden y tipo a los aminocidos en las protenas, puede proponer nuevas funciones y formas vivientes. Este proceso se llama a menudo la mutacin. Las mutaciones producidas en las protenas pueden ser cambios de un aminocido en una protena, (como la hemoglobina en su sangre). Muchos esfuerzos de la investigacin nos permiten disear las sucesiones de las protenas racionalmente para hacer nuevas funciones y terapias. La mayora de las drogas llevan a cabo sus funciones, ligndolas a las formas especficas que plegaron las protenas en las clulas. La protena comprensiva de la estructura tridimensional es una de muchas cosas que nosotros necesitamos entender.

Las protenas humanas son los blancos de las drogas y son la llave a mejorar la salud humana. Mejorando nuestra comprensin sobre estas protenas, tendramos muchos efectos positivos innumerables. La segunda categora consiste en protenas encontradas en los genomas de los patgenos. Entendiendo la biologa de estas bacterias y virus que tienen la causa de la enfermedad, nos evitaramos sufrir algn problema de salud.

La ltima categora consiste en protenas que se encuentran en los genomas de microbios medioambientales. Estos microbios representan la mayora de biodiversidad molecular en el planeta y entendiendo estos microbios y su papel en nuestro ambiente se ayudaran a un entendiendo ms profundo de su proteomas (la estructura y funcin de las protenas en su genomas). Estos microbios son responsables, durante el carbono global y ciclos de nitrgeno, de degradar los productos de desechos humanos, y pueden realizar la biosntesis enzimtica.

Las protenas son esenciales a los seres vivientes. Casi todo en el cuerpo humano involucra o est hecho de protenas.

Las protenas son molculas grandes que estn hechas de cadenas largas de molculas ms pequeas llamadas los aminocidos. Mientras hay slo 20 tipos 13

diferentes de aminocidos que constituyen todas las protenas, a veces cientos de ellos constituyen una sola protena.

Agregando a la complejidad, las protenas no se quedan tpicamente como las cadenas largas. En cuanto la cadena de aminocidos se construya, la cadena pliega y enreda en forma ms compacta y particular que permite que las funciones especficas y necesarias se dirijan dentro del cuerpo humano.

Las protenas se pliegan porque a los aminocidos diferentes les gusta pegarse siguiendo ciertas reglas. Imagine que los aminocidos son palomitas de maz de 20 colores diferentes. Las palomitas de maz son pegajosas, pero pegajosas de tal manera que slo ciertas combinaciones de colores pueden pegarse juntos. Esto hace que el aminocido se pliegue de una manera particular creando as protenas que son tiles al cuerpo humano. Las clulas humanas tienen los mecanismos para ayudar a las protenas a plegarse propiamente e, igualmente importante, mecanismos para librarse de protenas

inadecuadamente plegadas.

CMO SE RELACIONAN LAS PROTENAS A LOS GENES HUMANOS?

La coleccin de todos los genes humanos est conocido como "el genoma" humano. Dependiendo cmo los genes estn contados, hay encima de 30,000 genes en el genoma humano. Cada gen que es una seccin de una cadena larga conocido como ADN dicta cmo construir la cadena de aminocidos para una de las 30,000 protenas. En los recientes aos, cientficos pudieron trazar la sucesin para cada gen humano. Esto significa que nosotros sabemos la sucesin de aminocidos ahora en todas las protenas humanas. As, el genoma humano se relaciona directamente al proteoma humano, la coleccin de todas las protenas humanas.

EL MISTERIO DE LA PROTENA

Mientras investigadores han aprendido un gran trato sobre el proteoma humano, las funciones de la mayora de las protenas siguen siendo un 14

misterio. Los genes no revelan exactamente cmo las protenas plegarn en su forma final que es crtica porque eso determina lo que una protena puede hacer y con qu otras protenas pueden conectarse o pueden actuar recprocamente.

Las protenas aparecen como pedazos del enigma. Por ejemplo, las protenas del msculo se conectan para formar una fibra del msculo. Estos se unen juntos de una manera especfica debido a su forma, as como otros factores que relacionan a la forma.

Todo lo que sigue en las clulas y en el cuerpo esta especficamente controlada por la forma de las protenas que permiten o no a las protenas enlazarse con otras protenas. Por ejemplo, las protenas de un virus o bacterias pueden tener formas particulares que le permiten que penetre por la membrana celular, infectando a la clula.

1.3.- HERRAMIENTAS.Encarar un proyecto como el proteoma humano supone el diseo de herramientas acordes al estudio de la secuencia y estructura de las protenas. Las protenas presentan cuatro niveles de estructura claramente definidos, que van desde su estructura primaria (la secuencia de aminocidos) hasta su asociacin con otras protenas. La tcnica bsica que se utiliza para estudiar el proteoma es la separacin de protenas en geles de 2 dimensiones, donde las protenas son separadas en una primera instancia por su carga elctrica neta y luego por su tamao. As, es posible separar de una manera automatizada hasta 10.000 protenas distintas en un gel. Otras tcnicas utilizadas son la espectrometra de masas, la resonancia magntica nuclear y la cristalografa de rayos X, que permiten identificar y caracterizar las protenas para poder luego integrar la informacin y hacer una suerte de mapa proteico de la clula.

15

1.4.- PERSPECTIVAS.-

Existe la alternativa de que la protemica tenga un rol muy relevante en la medicina molecular ya que una gran cantidad de medicamentos son protenas o ejercen sus acciones a travs de ellas. La posibilidad de identificar la presencia de una protena en particular permite comparar los patrones proteicos presentes en distintas muestras y asociar las diferencias a su origen. Por ejemplo, se pueden comparar las protenas totales presentes en lquido cefalorraqudeo de personas sanas y enfermas e identificar protenas asociadas a enfermedades neurodegenerativas. La construccin de mapas proteicos comparativos permitir avanzar sobre la comprensin de numerosas enfermedades y en el planteo de nuevas estrategias teraputicas. En suma, comienza una era postgenmica, basada en las expectativas de inmediatos e importantes logros en el campo de la protemica.

1.5.- BASES DE DATOS DE LAS PROTENAS.UniProt PIR Suizo-Prot Pfam PDB NCBI

16

CAPTULO
PROTEOMA

II

2.1.- Introduccin

El trmino proteoma se acu por Mark Wilkins en 1995 y se usa para describir el complemento entero de protenas en un organismo biolgico dado o sistema en un momento dado, es decir los productos de la protena del genoma. El trmino se ha aplicado a varios tipos diferentes de sistemas biolgicos. Un proteoma celular es la coleccin de protenas encontrada en un tipo celular particular bajo un juego particular de condiciones medioambientales como la exposicin al estmulo de la hormona. Tambin puede ser til considerar los proteomas completos de un organismo que pueden conceptuarse como el juego completo de protenas de todo el varios proteomas celular. sta es muy aproximadamente la protena equivalente del genoma. El trmino "proteoma"

17

tambin se ha usado para referirse a la coleccin de protenas en ciertos sistemas biolgicos subalternos celulares. Por ejemplo, pueden llamarse todas las protenas en un virus un proteoma viral.

El proteoma es ms grande que el genoma, sobre todo en los organismos eucariotas, en el sentido que hay ms protenas que los genes. El proteoma tiene dos niveles de complejidad que falta en el genoma por lo menos. Cuando el genoma se define por la sucesin de nucletidos, los proteomas no pueden limitarse a la suma de las sucesiones del presente de las protenas. El conocimiento del proteoma requiere el conocimiento de la estructura de las protenas en el proteoma y la interaccin funcional entre las protenas. La Protemica es el estudio del proteoma, que se basa en la separacin de protenas por dos electroforesis de gel dimensionales. En la primera dimensin, las protenas estn separadas por un enfoque isoelctrico se resuelve las protenas en base a la carga. En la segunda dimensin, las protenas estn separadas por peso molecular. El gel se tie con Coomassie Azul o Plateado para visualizar las protenas. Las manchas en el gel son protenas que han emigrado a las situaciones especficas.

Los Pptidos se juntan en masa tomando las huellas dactilares e identificando una protena pegndosela en el pptido corto y entonces se deduce la identidad de la protena emparejando las masas del pptido observadas contra una base de datos de la sucesin. La espectrometra de masa de Tandem, por otro lado, se puede obtener la informacin de la sucesin del pptido individual, aislndolos, chocndolos con un gas no reactivo, y catalogando los iones del fragmento que se produjo.

2.2.- PROTEMICA.La Protemica es el estudio de la gran potencia de las protenas, particularmente sus estructuras y funciones. Este trmino fue acuado para 18

hacer una analoga con la Genomia, y mientras se ve a menudo como el "prximo paso", la protemica es mucho ms complicada que la genomia. Lo ms importante, mientras el genoma es una entidad bastante constante, el proteoma difiere de la clula a la clula y constantemente est cambiando a travs de sus interacciones bioqumicas con el genoma y el ambiente. Un organismo tiene la expresin de la protena sumamente diferente en las partes diferentes de su cuerpo, en las fases diferentes de su ciclo de vida y en las condiciones medioambientales diferentes.

La integridad de protenas en la existencia en un organismo a lo largo de su ciclo de vida, o en una pequea escala, la integridad de las protenas se encontr en un particular tipo de estmulo y celular, est respectivamente llamado el proteoma del organismo o tipo de la clula.

Desde que las protenas juegan un papel central en la vida de un organismo, la protemica es instrumental en el descubrimiento de biomarcadores, como marcadores que indican una enfermedad particular.

Con la realizacin de un proyecto spero del genoma humano, muchos cientficos estn investigando cmo los genes y protenas actan

recprocamente para formar otras protenas. Un hallazgo sorprendente del Proyecto de Genoma Humano es: hay protenas codificadas a menores distancias en los genes del genoma humano que en las protenas del proteoma humano (~22,000 genes vs. ~400,000 protenas). Se piensa El gran aumento en la diversidad de la protena puede ser debido a alternativas de unificacin y a la modificacin post traslacin de protenas. Esta diferencia implica que esa diversidad de la protena no puede caracterizarse totalmente por el anlisis de la expresin de un gen nico, mientras, haciendo una herramienta til a la protemica para caracterizar las clulas y tejidos de inters. Catalogar todas las protenas humanas y determinar sus funciones y regalos de las interacciones es un desafo desalentador para cientficos. Una colaboracin internacional para lograr estas metas est siendo coordinada por la Organizacin del Proteoma Humano (HUPO). 19

2.3.- RAMAS DE LA PROTEMICA.1. La separacin de la protena.- Todas las tecnologas de la protemica confan en la habilidad de separar una mezcla compleja para que se procesen las protenas individuales ms fcilmente con otras tcnicas.

2. La identificacin de la protena.- Los mtodos muy conocidos incluyen secuenciacin a travs de la degradacin de Edman.

3. La cuantificacin de la protena.- Se usan los mtodos basados en gel, incluso diferencial que mancha de geles con los tintes fluorescentes (la electroforesis de gel de diferencia). Los mtodos de liberacin de gel incluyen varios mtodos de modificacin qumica, como las etiquetas de afinidad istopo-codificado (ICATs) o la combinacin de cromatografa diagonal fraccionaria (COFRADIC). Hoy en da la electroforesis de gel investiga a menudo las influencias del anlisis de la imagen de software basado en la utilizacin de herramientas para analizar los bio-marcadores cuantificando del individuo principalmente, as como mostrando la separacin entre una o ms protenas "mancha" en una imagen examinada de un producto de 2-DE. Adicionalmente, estas herramientas emparejan las manchas entre los geles de muestras similares, por ejemplo, que el proteoma diferencia entre las fases tempranas y avanzadas de una enfermedad.

4. El anlisis de sucesin de protena.- Esto es ms de una rama bioinformtica, especializada en las bases de datos escrutados para la posible protena o el pptido emparejado, pero tambin la asignacin funcional de dominios, la prediccin de funcin de la sucesin, y relaciones evolutivas de las protenas.

5. La protemica estructural.- Esto involucra el alto grado de determinacin de estructuras de la protena en el espacio tridimensional. Los mtodos comunes son cristalografa de la radiografa y espectroscopia de NMR.

20

6. La protemica de la interaccin.- Esto involucra la investigacin de interacciones de la protena en los niveles atmicos, moleculares y celulares.

7. La modificacin de la protena.- Casi todas las protenas se modifican de pura sucesin del amino-cido traducida, llamada modificacin post translacional. Se han desarrollado los mtodos especializados para estudiar la fosforilacin (fosfoprotemica) y glicosilacin (glicoprotemica).

8. La protemica celular.- Una nueva rama de la protemica. La meta es trazar la situacin de protenas e interacciones de la protena-protena en las clulas enteras durante los eventos celulares importantes. Los centros alrededor del uso de tcnicas como la Radiografa, Tomografa y la microscopia de fluorescencia ptica.

2.4.- PROTEOMA HUMANO.-

Sabiendo las formas de protenas, se ayudar a investigadores a entender cmo las protenas realizan sus funciones deseadas y tambin cmo las enfermedades impiden a las protenas hacer sus funciones necesarias para mantener las clulas saludables.

El Proteoma Humano combina el poder de millones de computadoras en una sola que ayudar a los cientficos a entender cmo se realiza el pliegue de las

21

protenas humanas. El Proteoma Humano predice la forma de protenas Humanas.

Estos cientficos esperan aprender las funciones de estas protenas, como la forma de protenas que se relaciona inherentemente, o cmo estas funcionan en nuestros cuerpos. Esta base de datos de estructuras de la protena y estas funciones permitirn a los cientficos a tomar los prximos pasos en entendiendo cmo enfermedades que involucran estas protenas, como trabajan y finalmente cmo se puede curar estas enfermedades.

Podran decirse que las protenas son las molculas ms importantes en los seres vivientes. Casi todo en nuestro cuerpo involucra o est fuera hecho de protenas. Las protenas son que cadenas realmente largas compuestas de molculas ms pequeas llamadas los aminocidos. Hay 20 aminocidos diferentes que constituyen todas las protenas. Uno puede pensar en los aminocidos como ser cuentas de 20 colores diferentes. A veces, cientos de ellos constituyen una protena. Las protenas no se quedan tpicamente sin embargo como las cadenas largas. En cuanto la cadena de aminocidos se construya, la cadena pliega y enredos a en una masa ms compacta, terminando en una forma particular. Este proceso se llama el plegado de la protena.

Las cadenas del aminocido construidas en el cuerpo deben plegar a de una manera particular de hacer las protenas tiles. La clula tiene los mecanismos para ayudar a las protenas a plegar propiamente y mecanismo para librarse de protenas inadecuadamente plegadas. Cada gen dice el orden de los aminocidos para una protena. El propio gen es una seccin de la cadena larga llamada ADN.

El genoma humano; tiene por encima de 30,000. La coleccin de todos los genes humanos est conocido como "el genoma" humano. Cada uno de estos genes dice cmo construir la cadena de aminocidos para, cada una de las 30,000 protenas. La coleccin de todas las protenas humanas est conocido como "el 22

proteoma" humano.

EL DOGMA CENTRAL

1. La sucesin del Genoma es el resultado final producido por los proyectos de secuenciacin del genoma. Para el genoma humano habra una palabra para cada cromosoma. La longitud total de los 23 cromosomas en el humano es de 3 billones. Esto representa un lugar relativamente estable para una clula.

2. Genoma ADN se copia a mensajero RNA complementario por ARNpolimerasa. El ARN es menos estable que ADN.

3. ARN se traduce en la sucesin de la protena por el Ribosoma. Cada pedazo corto y grueso es la sucesin de ARN (el codn) se traduce en uno de 20 aminocidos. As cada ARNm codifica para una sola nica protena.

4. El plegando de protenas consiste principalmente en rotaciones alrededor de las ataduras qumicas.

2.5.- NITRACIN DEVELADA.-

Es bien sabido que estas enfermedades tienen que ver con la acumulacin de protenas anormales y disfuncionales que actan como agentes patgenos en el cerebro, pero las verdaderas causas de estas condiciones mdicas an estn siendo estudiadas. Colette Sacksteder, investigadora del Pacific Northwest National Laboratory de Richland, estado de Washington, y sus colegas utilizaron tcnicas protemicas para confirmar algo que ya

sospechaban: que la nitracin es, al menos, parte de la causa de ambos males. La nitracin es uno de los diversos procesos qumicos dainos agrupados bajo el trmino "estrs oxidativo". Este tipo de estrs ocurre cuando el equilibrio entre los radicales libres que genera el cerebro en su funcionamiento y la

23

cantidad de molculas antioxidantes presentes en el mismo se pierde a favor de los primeros, desencadenando procesos malignos que pueden provocar la muerte celular. A fin de investigar ms a fondo esta correlacin, el equipo de la doctora Sacksteder decidi estudiar el conjunto de las protenas que se sintetizan en el cerebro que son susceptibles a la nitracin, aunque para el experimento utilizaron cerebros de ratones y no de personas. Los resultados fueron complejos: hay una mayor cantidad de diferentes tipos de protenas en el cerebro de estos roedores que en cualquier otro rgano de su cuerpo, si bien no se sabe exactamente cuntos. Pese a que existen varios catlogos al respecto, la doctora Sacksteder decidi empezar de cero. Para ello primero descompusieron todas las protenas de las muestras tomadas de ratones saludables en unidades ms pequeas llamadas pptidos. Un pptido es una cadena de molculas de aminocidos, que son los componentes principales de las protenas. Al clasificar los pptidos de acuerdo con caractersticas como la carga elctrica y la atraccin al agua, y luego al separarlos segn su peso molecular en mquinas llamadas espectrmetros de masa, el equipo pudo determinar la composicin exacta de cada pptido. Regresar los pptidos a su forma original de protena fue una labor que requiri de un gran esfuerzo computacional, pero una vez que lo lograron, los investigadores calcularon haber identificado casi 8.000 protenas _el catlogo ms completo sobre las protenas sintetizadas en el cerebro de los mamferos que se haya compilado. Como resultado, el equipo pudo reconocer 29 protenas que aparecan en forma tanto nitrada como no nitrada. Al analizar las bases de datos se dieron cuenta de que ms de la mitad de estas protenas estaban presentes en una o ms enfermedades neurodegenerativas. Siguiendo este modelo, decidieron investigar con ms detalle el papel que desempea el proceso de nitracin en el mal de Parkinson. A otro grupo de ratones le inyectaron MPTP, una molcula que simula los efectos de esta enfermedad. A continuacin midieron los niveles y patrones relativos de la nitracin en las 29 protenas identificadas y encontraron aumentos significativos

24

en seis de ellas. An est por verse si esta investigacin podr ser de gran beneficio para el campo clnico. Pero lo que s es cierto es que se trata de una demostracin sorprendente del gran alcance de la protemica. Por medio de los mtodos convencionales en los que se analiza una sola protena a la vez se ha descubierto nicamente media docena de protenas cerebrales que son susceptibles a la nitracin. En cambio, un solo estudio logr multiplicar esa cifra por cinco, y puede haber descubierto un mecanismo generalizado mediante el cual se deterioran las clulas del cerebro.

25

CAPTULO

III

ACTIVADADES DE INVESTIGACIN

3.1.- Introduccin.Protemica.-

Despus de ordenar del genoma humano, est claro ahora que mucha de la complejidad del cuerpo humano reside en el nivel de protenas ms bien que las secuencias de la DNA. Esta visin es apoyada por el nmero inesperado bajo de los genes humanos (aproximadamente 35.000) y el nmero estimado de las protenas (que es actualmente cerca de 300.000 - 450.000 y constantemente levantamiento) que se generan de estos genes. Por ejemplo, se estima que en las protenas humanas medias existen como diez a quince diversas formas transitorias modificadas de protenas. Probablemente se tiene diversas funciones. Mucha sobre el tratamiento de la informacin en clulas humanas sanas y enfermas se puede estudiar solamente en el nivel de la protena, y est aumentando evidencia a los cambios de menor importancia del acoplamiento en la expresin de algunas de estas modificaciones con enfermedades especficas.

3.2.- PROTEMICA EN CIENCIAS DE LA VIDA.-

La Protemica tiene un campo de usos increblemente ancho y al lado de los usos obvios en entender los procesos de la vida, muchos usos prcticos diversos existen en los campos de:

26

Medicina Biotecnologa Ciencias de alimento Agricultura Gentica y horticultura animales Vigilancia ambiental Contaminacin

Dentro del campo de la medicina: el proteoma se ha aplicado a: La protena cambia durante procesos normales como la diferenciacin, el

desarrollo y envejecer. La expresin anormal de la protena en el desarrollo de la enfermedad (y se satisface especialmente para los estudios de enfermedades del origen multignico)

3.3.- MEDIOS Y FINALIDADES DE LA PROTEMICA.-

27

El proteoma se define como la totalidad de las protenas especficas complementarias al genoma tanto temporalmente como por el tipo de clula. Esto incluye todas las protenas que se expresan en una clula en un determinado momento, ya sean las isoformas como las protenas modificadas. Su complejidad es extraordinaria si se supone que en la especie humana hay 45.000 genes, y que cada transcrito de RNA puede sufrir uniones alternativas, y cada protena codificada puede sufrir modificaciones post-traduccionales. Es posible, por tanto, que el proteoma de cada individuo independiente, retratado en un momento particular de su vida, tenga una complejidad de dos a tres rdenes de magnitud superior a la del genoma. De hecho se estima que el proteoma completo de la especie humana podra estar constituido por 108 cadenas polipeptdicas. El conocimiento del proteoma constituye uno de los desafos ms importantes de la era post-genmica. A diferencia del genoma, el proteoma presenta una gran variabilidad estructural y funcional, que depende del individuo

considerado, de su estado de desarrollo, del tejido estudiado, e incluso de las condiciones ambientales. El anlisis de dicha variabilidad est cobrando cada vez mayor inters, debido a que est asociada tanto al funcionamiento normal del organismo, como a muchas de sus patologas. Los principales mecanismos generadores de dicha variabilidad son tres: El splicing alternativo del mRNA, Las modificaciones postraduccionales, y Los SNPs ("single nucleotide polymorphisms").

Aunque la aproximacin experimental al estudio de la variabilidad del proteoma facilita una informacin de gran calidad, de momento se ha ceido al estudio de sistemas especficos. Frente a esta situacin, la bioinformtica puede proporcionar una aproximacin original a este problema, al permitir realizar un anlisis sistemtico del amplio volumen de datos disponible. As la bioinformtica permitir racionalizar y sintetizar los resultados de los estudios experimentales, la informacin sobre el genoma humano y de otros genomas, la enorme coleccin de datos sobre SNPs, la informacin estructural sobre 28

protenas, los datos sobre patrones de splicing alternativo, y las bases de datos de patologas asociadas a mutaciones. Considerando esta gran complejidad, est claro que el cientfico, hoy en da, necesita tener a disposicin un amplio abanico de instrumentacin para separar e identificar cada protena del proteoma de cualquier organismo. Entre los ms antiguos y populares, tambin en nuestros das, est la clsica electroforesis bidimensional que consta de un isoelectroenfoque como primera dimensin, que discrimina en base a la carga superficial, y un SDS-PAGE (electroforesis en geles de poliacrilamida saturados de docecilsulfato sdico) como segunda dimensin, que separa en base a la masa. A esta metodologa se le han sumado, en los ltimos aos, mtodos cromatogrficos

bidimensionales, que en general combinan cromatografa de intercambio inico y de interaccin hidrofbica (con diversas variantes, dado que se pueden utilizar mltiples procesos cromatogrficos, como quelacin de metales, exclusin molecular, chromatofocusing, resinas de fosfato clcico, etc., sin considerar las resinas basadas en la bioafinidad). Estas ltimas metodologas pueden incluso hibridarse, p.ej. el eludo de una columna de RP-HPLC acoplada con la electroforesis capilar. Por ltimo, no podemos olvidar los chips de protenas que pueden constituir interesantes superficies de captura de marcadores en lquidos biolgicos para un rpido diagnstico en bioqumica clnica. Estos chips de protenas no llegan a alcanzar los sistemas variados y complejos de los chips de ADN, donde es posible mostrar simultneamente miles y miles de genes diferentes, cosa que es impensable para los chips de protenas de hoy en da. Sin embargo, el anlisis protemico actual, no avanzara mucho si slo dependiera de los instrumentos anteriormente mencionados. De hecho, ya en 1975 OFarrel perfeccion bastante los geles 2-D, pero se avanz muy poco debido a la falta de medios tanto para el anlisis cuantitativo como cualitativo. La identificacin de la protena o protenas contenidas en un punto electrofortico o en un pico cromatogrfico necesita de ulteriores tcnicas que son independientes de la separacin. La protemica moderna es en realidad un conjunto de al menos tres disciplinas diferentes, que contribuyen por igual a la solucin de problemas complejos, siendo estas: 29

Las metodologas de separacin, tanto las enumeradas anteriormente como las futuras, dado que el sector est en rpida expansin.

La espectrometra de masas, tcnica indispensable para el reconocimiento de las cadenas polipeptdicas diluidas de los geles 2-D, cromatografa bidimensional, chips de protenas, etc.

La bioinformtica, instrumento en continua evolucin, con creacin de buscadores, bancos de datos y mtodos de screening cada vez ms avanzados en la identificacin de protenas de cualquier origen. La bioinformtica, en su ms vasta acepcin, es un instrumento fundamental para conectar las bases de datos de protenas y genes.

Estas tres disciplinas contribuyen por igual al anlisis protemico y por tanto, tienen que estar a disposicin en los laboratorios ligados al proteoma. Dos mecanismos presentan una particular problemtica y antecedentes sobresalientes, brevemente:

SPLICING ALTERNATIVO El splicing alternativo es un mecanismo mediante el cual la expresin de un gen puede dar lugar a diferentes protenas, a travs de mecanismos de substitucin o insercin/delecin de determinados fragmentos de la secuencia de la protena. Estudios recientes muestran que es una importante fuente de variabilidad en el proteoma de los eucariotas, ya que afectara a ms de un 40 % de las protenas del organismo. Su contribucin vara de un tejido a otro, destacando su importancia en el sistema nervioso. El efecto del splicing alternativo sobre la variabilidad de las protenas puede llegar a ser enorme, como por ejemplo en el caso de la protena DSCAM en D.melanogaster, para la cual se ha postulado la existencia de ms de 38000 isoformas posibles, un nmero superior al total de genes predicho para Drosophila. Aunque estas cifras son extremas, nos dan una idea de la capacidad del

30

splicing alternativo para generar variabilidad. Sin embargo, y a pesar de su importancia, todava no se sabe prcticamente nada de la manera en la que el splicing alternativo modula la funcin de las protenas. Como era de esperar, tambin se ha observado una clara relacin entre patrones de splicing anmalos y patologas. Por ejemplo, se ha observado que el splicing alternativo puede estar asociado a diversas patologas del sistema nervioso, a procesos cancergenos, etc. Tambin en este caso, la falta de conocimiento bsico sobre los aspectos funcionales del splicing alternativo ha impedido, en la gran mayora de los casos, esclarecer el mecanismo molecular de la enfermedad. En el campo de la bioinformtica, los estudios sobre splicing alternativo a nivel de protena son contados. Entre ellos cabra destacar los estudios del grupo de P.Bork, centrados esencialmente en cuantificar la contribucin del splicing alternativo a la variabilidad total del proteoma, siendo suya la primera estimacin de un 30 % de protenas afectadas por el splicing alternativo. Ms en la direccin del presente proyecto, los precedentes que existen son mnimos; cabra mencionar el trabajo de Modreck et al., 2001, en el que se estudia la distribucin del splicing alternativo entre las diferentes familias funcionales de protenas. En lo que respecta a nuestro grupo, cabra destacar la aplicacin de tcnicas bioinformticas a la caracterizacin estructural de dos isoformas de hSos. Por todo ello, la caracterizacin bioinformtica de la variabilidad asociada al splicing alternativo es un rea de investigacin prcticamente virgen todava, en la que los estudios bioinformticos pueden realizar contribuciones novedosas, y de utilidad para el posterior anlisis experimental del proteoma, tanto en el contexto de las aplicaciones biomdicas, como en el de la ciencia bsica.

3.4.- TOMAR EN CUENTA.El Proteoma Humano el proyecto Plegadura les proporcionar datos que predicen la forma de un nmero muy grande de protenas humanas a 31

cientficos. Estas predicciones les darn las pistas que ellos necesitan identificar las funciones biolgicas de protenas individuales dentro del cuerpo humano a cientficos. Con una comprensin de cmo cada protena afecta la salud humana, cientficos pueden desarrollar las nuevas curas para las enfermedades humanas como el cncer, HIV/AIDS, SARS, y malaria.

Esta investigacin abrir los secretos de la vida. El genoma humano era solamente el informe especial del principio. El aviso de la terminacin del primer bosquejo del proyecto humano del genoma fue tratado como una revolucin cientfica, tan significativa como el primer paso del hombre en la Luna. Fue un logro masivo, pero comparado a poner a un hombre en la luna, no desarroll ninguna nueva tecnologa; as el descubrimiento anterior de la hlice del doble de la ADN fue la clave, pero el genoma humano todava no ha proporcionado a ninguna nueva penetracin fundamental. Y, a diferencia de la penicilina, el genoma todava no ha salvado una sola vida. Todo lo que proporciona es una cadena larga de diagramas binario, por lo dems poco informativo. El genoma humano es el umbral a un proyecto ms ambicioso: el proteoma. Nuestra secuencia de la ADN es el cdigo gentico, pero la dinmica de la vida son las protenas Las protenas son el nivel siguiente por encima de los genes. Son los bloques del edificio de las mquinas celulares que extraen energa del alimento, contraen los msculos, permiten que ver, or o sentir, que late el corazn, estimula el mecanismo impulsor del sexo o del pensamiento. Son los nanites de la naturaleza, dirigiendo en la escala de los tomos y las molculas. Hasta ahora, El desarrollo de casi todas las drogas se han fundado en el crudo sistema del ensayo y error: los millares de productos qumicos se prueban para descubrir cul es su fuerza interactiva con las mquinas moleculares para corregir sus defectos. Para superar esto, es necesario entender cada protena: el proteoma humano. Aunque el esqueleto del proteoma est all en el genoma, cada gen codifica para una protena su plegamiento y doblamiento es an un misterio.

32

Grfico 1 Formacin de protenas.

Grfico 2 Plegamiento de protenas.

Si las letras que representan las secuencias de los aminocidos de protenas se alinean se puede ver que algunos modelos los aminocidos se repiten, incluso en todas las secuencias en las mismas posiciones (estas posiciones se llaman "conservadas"). En otros modelos las posiciones de los aminocidos, en las secuencias, son diferentes en la alineacin de la protena (se llaman posiciones no-conservados). La prediccin de la estructura de la protena Tirosina-fosfatasa sobre la base de la alineacin se ha logrado reconstruir la cadena de aminocidos. Los mtodos automatizados que toman un acercamiento similar han sido desarrollados por Burkhard Rost y la Chris Sander, en Alemania. Fuente: Fields, Stanley; Proteomics in Genomeland, Science 2001.

Para la mayora de la maquinaria molecular, se desconocen los genes, las piezas de la protena, o cmo se combinan. sta es la tarea de la protemica, cuando un gen se expresa para hacer una protena, su informacin gentica unidimensional se traduce al esqueleto tridimensional de la protena que se enrosca y dobla para componer una forma tridimensional de una variable nica; pero las torceduras y las vueltas que hacen los martillos, los interruptores, las tuercas y los pernos moleculares no pueden ser fcilmente anticipados desde la informacin disponible sobre el genoma, ste es el desafo de la protemica. Los cientficos han comenzado ya en el proyecto del proteoma con la constitucin de la Organizacin del Proteoma Humano (HUPO).

33

Para exponer una idea de qu maravillas se ocultan en el interior de las propias clulas, considere el F1 ATPasa. ste es un motor minsculo de protena que es un componente de una mquina celular llamada la mitocondria. Cuando las clulas extraen energa del alimento, pelan los electrones y los transmiten debajo de la membrana mitocondrial. Esto genera una corriente elctrica minscula que se utiliza para impulsar desde una estacin de bombeo (otro motor de la protena) los protones de las bombas fuera de la mitocondria. Como el agua de una estacin de bombeo, los protones pueden fluir nuevamente dentro de la mitocondria, solamente con el F1 ATPasa. El flujo del protn que resulta hace girar el rotor del F1 ATPasa. El F1 ATPasa tiene siete porciones hechas a partir de tres diversas protenas, cada una codificadas por diversos dgitos binarios del genoma. El rotor que gira acciona un martillo molecular que junta las molculas para hacer un producto qumico llamado ATP, que las clulas utilizan para producir energa. Millares de bombas, de turbinas, de motores, de dnamos, de martillos y de interruptores minsculos dentro de cada clula mantienen vivo el cuerpo. Cuando ese engranaje proteico funciona mal se padece de enfermedades cardiacas, de enfermedades del pulmn, de desrdenes digestivos, de enfermedades del rin, de demencia o de cncer. El seuelo de los nuevos gneros tion de las drogas especficas para todo tipo de cncer est tentando a muchas compaas farmacuticas en competencia. Celera, la corporacin que orden el genoma en concurrencia con el consorcio pblico ha anunciado su propio programa del proteoma. Despus vendr segn los cientficos- el metaboloma que describir cmo las bombas, los motores, los motores y las turbinas dentro del proteoma convierten la masa de alimentos en vida para la clula. En el horizonte est una fusin de la biologa, de la fsica y de la ingeniera: la nanotecnologa. Los cientficos en la universidad de Cornell (Estados Unidos) han empezado ya la construccin de un propulsor minsculo de encendido de F1 ATPasa para hacer un motor a nano escala. Tales dispositivos un da sern utilizados para conducir las mquinas miniatura, capaces de nadar a travs del cuerpo para dispensar drogas o para realizar microingeniera en las clulas. Eventualmente, poniendo juntos los genes, el proteoma y el metaboloma en los recipientes de la

34

ingeniera de la nano escala, los cientficos pueden poder construir el ltimo dispositivo de la nanotecnologa: la vida artificial.

35

ANEXOS:

Artculo Tomado de la Revista EL UNVERSAL.COM, del 25 de julio de 2006: LA PROTEMICA CAMBIA LA MIRADA Enfermedades neurogenerativas son vistas a travs de la lente de las protenas THE ECONOMIST Despus del genoma, el estudio del proteoma! Esa fue la reaccin ante la noticia que sorprendi al mundo cuando a los cientficos que estaban realizando el Proyecto Genoma Humano les preguntaron qu vendra despus. La protemica, el estudio mediante el cual se busca identificar la estructura y la cantidad total de protenas que concurren en la realizacin de los distintos procesos biolgicos en un organismo, es un anlisis mucho ms complejo y de mayor alcance que la genmica. Al fin y al cabo, son las protenas, y no los genes, las molculas que realizan el verdadero trabajo dentro de una clula. Por consiguiente, la de ficiencia en la sntesis de protenas es lo que realmente causa las enfermedades, bien sea esa deficiencia el resultado de fallas en la estructura celular generadas por genes mutantes o sea slo una consecuencia del desgaste natural de la clula. El Proyecto Genoma Humano, que identific los genes y la secuencia total de las bases nitrogenadas que constituyen el ADN humano, fue todo un xito gracias a una gran lucha de egos. Al contrario, los cientficos que se han abocado al estudio del proteoma han sido modestos, y por tanto la noticia sobre sus investigaciones nada ruidosa. El hecho de que estn intentando trabajar con calma no quiere decir que hayan permanecido ociosos. Recientemente se dio a conocer un estudio sobre el

36

proteoma que ayuda a establecer una causa subyacente comn a padecimientos neurodegenerativos como el mal de Parkinson y la enfermedad de Alzheimer. Nitracin develada

Es bien sabido que estas en fermedades tienen que ver con la acumulacin de protenas anormales y disfuncionales que actan como agentes patgenos en el cerebro, pero las verdaderas causas de estas condiciones mdicas an estn siendo estudiadas. Colette Sacksteder, investigadora del Pacific Northwest National Laboratory de Richland, estado de Washington, y sus colegas utilizaron tcnicas protemicas para confirmar algo que ya

sospechaban: que la nitracin es, al menos, parte de la causa de ambos males. La nitracin es uno de los diversos procesos qumicos dainos agrupados bajo el trmino "estrs oxidativo". Este tipo de estrs ocurre cuando el equilibrio entre los radicales libres que genera el cerebro en su funcionamiento y la cantidad de molculas antioxidantes presentes en el mismo se pierde a favor de los primeros, desencadenando procesos malignos que pueden provocar la muerte celular. A fin de investigar ms a fondo esta correlacin, el equipo de la doctora Sacksteder decidi estudiar el conjunto de las protenas que se sintetizan en el cerebro que son susceptibles a la nitracin, aunque para el experimento utilizaron cerebros de ratones y no de personas. Los resultados fueron complejos: hay una mayor cantidad de diferentes tipos de protenas en el cerebro de estos roedores que en cualquier otro rgano de su cuerpo, si bien no se sabe exactamente cuntos. Pese a que existen varios catlogos al respecto, la doctora Sacksteder decidi empezar de cero.

37

Para ello primero descompusieron todas las protenas de las muestras tomadas de ratones saludables en unidades ms pequeas llamadas pptidos. Un pptido es una cadena de molculas de aminocidos, que son los componentes principales de las protenas. Al clasificar los pptidos de acuerdo con caractersticas como la carga elctrica y la atraccin al agua, y luego al separarlos segn su peso molecular en mquinas llamadas espectrmetros de masa, el equipo pudo determinar la composicin exacta de cada pptido. Regresar los pptidos a su forma original de protena fue una labor que requiri de un gran esfuerzo computacional, pero una vez que lo lograron, los investigadores calcularon haber identificado casi 8.000 protenas _el catlogo ms completo sobre las protenas sintetizadas en el cerebro de los mamferos que se haya compilado. Como resultado, el equipo pudo reconocer 29 protenas que aparecan en forma tanto nitrada como no nitrada. Al analizar las bases de datos se dieron cuenta de que ms de la mitad de estas protenas estaban presentes en una o ms enfermedades neurodegenerativas. Siguiendo este modelo, decidieron investigar con ms detalle el papel que desempea el proceso de nitracin en el mal de Parkinson. A otro grupo de ratones le inyectaron MPTP, una molcula que simula los efectos de esta enfermedad. A continuacin midieron los niveles y patrones relativos de la nitracin en las 29 protenas identificadas y encontraron aumentos significativos en seis de ellas. An est por verse si esta investigacin podr ser de gran beneficio para el campo clnico. Pero lo que s es cierto es que se trata de una demostracin sorprendente del gran alcance de la protemica. Por medio de los mtodos

38

convencionales en los que se analiza una sola protena a la vez se ha descubierto nicamente media docena de protenas cerebrales que son susceptibles a la nitracin. En cambio, un solo estudio logr multiplicar esa cifra por cinco, y puede haber descubierto un mecanismo generalizado mediante el cual se deterioran las clulas del cerebro.

39

BIBLIOGRAFA.WEB SITES:

http://en.wikipedia.org/wiki/Central_dogma http://www.prodiversitas.bioetica.org/nota13.htm http://www.divulgon.com.ar/julio03/bajolalupa-jul03.html http://www.fundacion-repetto.org/invierno01_h.htm http://www.juntadeandalucia.es/averroes/iespablopicasso/2005/09_05.pdf http://tiempolibre.eluniversal.com/2006/07/25/ten_art_25448A.shtml http://www.biotech.bioetica.org/clase2-20.htm http://es.wikipedia.org/wiki/Proteoma http://www.biotech.bioetica.org/docta30.htm http://www.elpais.es/especiales/2000/genoma/graficos/proteoma.html http://www.biotech.bioetica.org/ap46.htm http://web.mit.edu/esgbio/www/dogma/dogmadir.html http://www.emc.maricopa.edu Para ver los 20 aminocidos ver: http://web.mit.edu/esgbio/www/lm/proteins/aa/aminoacids.html http://web.mit.edu/esgbio/www/lm/lmdir.html [http://www.genome.org /] [http://www.sciencedirect.com /] http://bakerlab.org [http://arjournals.annualreviews.org] [http://robetta.bakerlab.org /] [http://www3.interscience.wiley.com]

[http://www.ncbi.nlm.nih.gov] [Ms: http://www.systemsbiology.org] [Ms: http://depts.washington.edu /] http://translate.google.com/translate?hl=es&sl=en&u=http://www.chemistry.o rg/portal/a/c/s/1/feature_pro.html%3Fid%3D38ee54840c2111d6e8d86ed9fe 800100&sa=X&oi=translate&resnum=5&ct=result&prev=/search%3Fq%3DP ROTEOME%2BNEWS%26hl%3Des%26lr%3D%26sa%3DG

42

NDICE
Pginas CARTULA................................................................................ DEDICATORIA.......................................................................... AGRADECIMIENTO.................................................................. INTRODUCCIN....................................................................... JUSTIFICACIN........................................................................ OBJETIVOS............................................................................... 1 2 3 4 5 6

CAPTULO I
CARACTERSTICAS GENERALES.ANTECEDENTES HISTRICOS............................................. IMPORTANCIA........................................................................ EN POS DEL CONOCIMIENTO.............................................. UN GEN UNA PROTENA? ................................................. QU ES UNA PROTENA? .................................................. COMO SE RELACIONAN LAS PROTENAS.......................... EL MISTERIO DE LA PROTENA.... HERRAMIENTAS PERSPECTIVAS. BASE DE DATOS DE LAS PROTENAS 7 8 9 9 11 14 14 15 16 16

CAPTULO II
PROTEOMA.INTRODUCCIN PROTEMICA. RAMAS DE LA PROTEMICA............................................... PROTEOMA HUMANO........................................................... DOGMA CENTRAL................................................................. NITRACIN DEVELADA.. 17

18
20 21 23 23

CAPTULO III
ACTIVIDADES DE INVESTIGACIN.INTRODUCCIN. 26 43

PROTEMICA EN CIENCIAS DE LA VIDA............................. MEDIOS Y FINALIDADES DE LA PROTEMICA................... TOMAR EN CUENTA...............................................................

26 27 31

ANEXOS:... BIBLIOGRAFA:....

36 41

44

También podría gustarte