XI Curso de Prevención y Control

de las Infecciones Asociadas

a la Atención de Salud 2023
Microbiología aplicada a las IAAS

Módulo 1
 Temario

• Flujo de diagnóstico en Laboratorio de Microbiología Dictado por:

Dra. Beatrice Hervè

• Muestras relevantes en IAAS

• Urocultivo
• Hemocultivo
• Muestras respiratorias
• Secreciones de heridas
• Microorganismos relevantes en IAAS:
• AREPI
• ARAISP
• Métodos de detección
• Análisis de Brotes
 Objetivos del diagnóstico
microbiológico
1. Realizar el diagnóstico etiológico de una enfermedad infecciosa
.

2. Orientar terapia antimicrobiana a través del estudio de

susceptibilidad.

3. Entregar información epidemiológica con el fin de mantener una

vigilancia de los agentes más prevalentes y su comportamiento
frente a los antimicrobianos
4. Lo anterior, en forma OPORTUNA y CONFIABLE
 Proceso de diagnóstico de laboratorio
• Tipo de muestra adecuada al objetivo
. • Calidad de la muestra: protocolos de obtención
• Información relevante al laboratorio
pre analítico • Trazabilidad de la muestra

• Procesos controlados, estandarizados, validados: Técnicas confiables

• Personal que realiza el examen entiende su importancia
analítico • Tiempo de respuesta oportuno

• Resultados confiables
• Reporte de valores críticos: cuales, como, cuando
Post • Consolidaciòn de informaciòn: indicadores de calidad, endemias, tablas de susceptibilidad a antimicrobianos
analítico
 Muestras relevantes en IAAS
.

ITS/CVC
ITU/CUP

• Orina de Sonda Foley. • Se requiere siempre muestras

• Obtener de puerto pareadas
• Enviar en Frasco estéril • Indicar cual es central y cual es
• Indicar forma de obtención periférico
• Requiere sedimento de orina • Preparar piel
simultáneo • Obtención con técnica estéril
 Muestras relevantes en IAAS
.
NAVM

ISQ
• Expectoracion • Se requiere MUESTRA
• Secrecion bronquial REPRESENTATIVA
• AET • Obtención con técnica asèptica,
• LBA desde superficie de la incisiòn o
• CEPILLO tejido subcutàneo.
• Enviar en Frasco estéril • eliminar pus y tejido desvitalizado
con SF estéril, obtener de tejido vital
• Indicar TIPO DE MUESTRA
• Solicitar Gram y Cultivo…aunque
exista PCR
 UROCULTIVO

• .Siembra con asa de

0,001u

Observación y
Incubación recuento de colonias:
IDENTIFICACION
atb: realización de pruebas
Y ATB
18-24 hrs Bioquímicas o Maldi y atb
ID x Maldi
.
.
 Hemocultivos
Incubación en
equipo
• Ingreso
. de frascos al automatizado:
lab 5-7 ds

Observación de gram al momento

Incubación de
IDENTIFICACION
atb: alarma de equipo,realización de
Y ATB pruebas bioqcas o Maldi y RAST +
18-24 hrs atb cuando hay colonias. PCR
ID x Maldi
directo
 Hemocultivos automatizados
.

Resina sensible a CO2

 Muestras Respiratorias
.
 Muestras Respiratorias
.
Criterio de aceptabilidad de la
muestra

Criterio de umbral o nivel de carga

bacteriana
 Muestras Respiratorias
.
 Diagnóstico de patógenos
respiratorios por biología molecular
.

PCR (termociclador
convencional) Mezcla de: Visualización en gel de
Acido nucleico de la agarosa con bromuro
muestra, primers de etidio, debe migrar Visualización: Detección de nivel de
específicos, polimerasa, en campo pulsado. fluorescencia ciclo a ciclo. Fluorescencia es
nucleótidos Tiempo : hrs emitida en función de presencia de 2ble
hebra. Sobre un CT determinado es positivo
Microarrays

Visualización se basa en
hibridación del producto con
sondas específicas adheridas
a un soporte sólido y revelado
con peroxidasa o fluoroforo
 PCR:
•Bordetella
•Mycobacterium TBC y Complex
•Chlamydiophila pneumoniae
•Legionella pneumophila
•Mycoplasma pneumoniae
•Pneumocystis jiroveci

Microarray:
• 17 virus respiratorios
• Filmarray Pneumonia/PneumoniaPlus
 panel respiratorio de Neumonia:
.
Dg de Microorganismos: PCR en
tiempo real. Dg de genes de
resistencia: Nested PCR,
aumenta mucho la S
 Limitaciones Panel Neumonia
.• Sensibley Específico para cada gen que detecta
• No se puede establecer correlación entre gen y especie, excepto en
S.aureus ( Mec)
• No se puede excluir R a atb por ausencia del gen, puede haber otros
mecanismos de R
• Hay otras bacterias que pueden producir NAV o NIH, no incluidos en
el panel
• Recuento de copias/ml no es necesariamente equivalente a ufc/ml.
 AREPI
.
• SARS-CoV-2
• C.difficile
• Enteropatógenos: rotavirus, norovirus,etc
• Virus Respiratorios: VRS, PI, Flu A/B, Mv, Rhinovirus, etc
 Diagnóstico Microbiológico
Muestra paciente

DIRECTO INDIRECTO
Antígeno Anticuerpo

Cultivo:ID y S Molecular Inmunológico

Inmunológico

ELISA, Western Blott

ELISA
Test rápido PCR
Inmunofluorescencia
inmunocromatografia
 Inmunocromatografia-Inmunofluoresc
encia
.
 Título del tema o texto destacado
.
 Enteropatógenos:

Estudio de virus:
TP/PCR
.
Rotavirus
TP/PCR Adenovirus
entéricos
PCR Norovirus
 Enfermedad Fungica Invasora: ELISA
( Galactomanano)
.

En sangre/en LBA.
Como dg premptivo
Como seguimiento
 ARAISP: norma 2018
.
 ARAISP: cuáles son
.
 ARAISP: rol del laboratorio
.

Identificación Reporte de
confiable y Valor Crítico
oportuna
 Brotes: sospecha y análisis de
clonalidad
• Sospechar con microorganismos que no se aislan habitualmente
.
• Sospechar con acumulos de cepas por sobre la endemia
• Alerta con mecanismos de R no habituales (siempre confirmarlos)

• Antibiogramas similares
• EFCP
 ¿cuando se dice que 2 cepas pertenecen al
mismo clon?
.

Se busca relación genética entre cepas: estudio de perfiles

•digestión enzimática de DNA mediante enzimas de
restricción
• electroforesis en gel ,campo pulsado
• Se comparan los patrones de bandas obtenidos
•Si tienen > 80 % de homología, o difieren en 3 o menos
bandas son “altamente relacionadas”
Criterios de Brote clonal
Alta: >90% de las cepas de un brote son relacionadas
Genéticamente.Alta probabilidad que transmisión sea
Nosocomial. Frena brote con refuerzo de medidas de
control de IIH
Moderada: 35- 75% de las cepas están relacionadas
genéticamente. Sugerente de transmisión nosocomial,
manejo con educación y medidas de barrera
Baja: 20 –35 % de las cepas relacionadas genéticamente.
Poca probabilidad de diseminación horizontal. Hay que
buscar otras causas de aumento de casos (ej. manejo de
ventiladores)
Pseudobrotes: <20% cepas relacionadas genéticamente.
No requiere intervención y se asume como variabilidad
normal de la presencia del microorganismo. AHORRO
.
 Gracias por ver el curso de:

XI Curso de Prevención y Control

de las Infecciones Asociadas
a la Atención de Salud 2023
Presentado por:
Comitè de IAAS, Sociedad Chilena de Infectologìa

Si ha visto todos los módulos al 100%, su certificado estará disponible.