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Genética molecular
1. El ADN como depositario de la información
genética.
2. Concepto molecular de gen.
3. Replicación del ADN
1. Etapas de la replicación
2. Diferencias entre el proceso replicativo en
procariotas y eucariotas.
4. Expresión de la información genética:
dogma central de la biología molecular.
5. Transcripción.
6. El código genético
7. Traducción.
8. El genoma de procariotas y eucariotas
9. El proyecto genoma humano.
10. Concepto de proteoma y proteómica.
Aplicaciones en biociencias.
1. El ADN como portador de información genética
Interfase
A principios del
siglo XX se sabía…
Análisis de los
Cromosomas.
(ADN + proteínas)
“Collar de
perlas”
Interfase
¿Qué molécula posee la
información genética?
¿El ADN o las proteínas?
“Collar de
perlas”
Interfase
¿Las proteínas en su
secuencia de
aminoácidos?
“Collar de
perlas”
Interfase
¿El ADN en su
secuencia de
nucleótidos?
“Collar de
perlas”
Primeras evidencias:
Las proteínas. El ADN tiene
una estructura demasiado
sencilla. Las proteínas son más
complejas y tienen funciones
catalíticas.
¿Quién es el
1928. Experimento de
depositario de la
Griffith (buscando vacuna contra la
información neumonía provocada por
genética? Streptococcus pneumoniae)
1. ADN COMO MATERIAL GENÉTICO
Streptococcus
pneumoniae
(bacteria causante de la
neumonía, presenta dos
variantes o cepas distintas)
Tipo S
Bacterias R
Bacteria sin cápsula
vivas Bacterias S
(no virulenta) muertas por
Tipo R calor
3 De los ratones inoculados no se extraen 4 De los ratones muertos se extraen bacterias vivas
bacterias vivas, pues no crecen en el animal. de la cepa S
CONCLUSIÓN. En las bacterias muertas (cepa S) existía algo, llamado
PRINCIPIO TRANSFORMANTE que era captado por las bacterias
vivas no virulentas (cepa R) y transformaba sus caracteres
hereditarios convirtiéndose en virulentas.
1. Se inoculan ratones con cepas S, contraen la enfermedad y mueren. De ellos se extraen
bacterias S vivas.
2. Los ratones inoculados con cepas R no contraen la enfermedad. De ellos se extraen bacterias
vivas pues no crecen en el animal
3. Se inoculan ratones con cepas S, muertas por el calor. No contraen la enfermedad. De ellos no
se extraen bacterias vivas.
4. Los ratones inoculados con cepas S, muertas por el calor y, simultáneamente, cepas R vivas
contraen la enfermedad y mueren. De ellos se extraen bacterias vivas S.
EXPERIMENTO DE AVERY (1944) (CULTIVO DE BACT. R EN
UN MEDIO CON DNA PURIFICADO PROCEDENTE DE
BACTERIAS S)
CONCLUSIÓN
Descubrieron:
Descubrieron:
Si se altera el gen, no se
fabrica la enzima
correspondiente y la ruta
se bloquea.
2. CONCEPTO MOLECULAR DE GEN
1 gen 1 enzima
1 gen 1 proteína
1 gen 1 cadena
polipeptídica
2. CONCEPTO MOLECULAR DE GEN
El ciclo celular
Fase permanente en células que
no entran nunca en mitosis. Síntesis de proteínas y
Estado de quiescencia. aumento del tamaño celular.
Fase G1
Fase G0
Replicación del ADN y
síntesis de histonas.
Citocinesis
Fase S
División del
citoplasma
Interfase
Fase de
mitosis
División celular
ADN copia
Cada una de las dos cadenas hijas contiene fragmentos
de la cadena original y fragmentos de la nueva
síntesis
TEORÍA SEMICONSERVATIVA
ADN N14
ADN N14-15
ADN N15
1- Cultivaron bacterias en un medio con N-15 (Las bases nitrogenadas incorporaron el isótopo).
2- Transfirieron las bacterias a un medio con N-14. El ADN obtenido tenia la misma proporción N14, N15.
Cada bacteria había heredado la mitad de ADN de su progenitora y la otra mitad la sintetizaba de los
componentes del medio.
3- Aparecían ADN hibrido (N14-N15) y ADN solo con N14
3. La duplicación del ADN
Núcleo (eucariotas)
Nucleoide (procariotas)
¿Dónde ocurre? Matriz (mitocondrias)
Estroma (cloroplastos)
FASE S DEL
¿Cuándo ocurre? CICLO CELULAR
(en interfase)
3. La duplicación del ADN
Principales características de la
replicación
¿Qué necesitamos?
- ADN molde
- Nucleótidos: ATP, GTP, CTP, TTP
- Proteínas SSB (impiden que se enrede el ADN)
- Enzimas:
- Helicasas: rompen puentes de H entre las dos cadenas complementarias,
separándolas.
- Topoisomeras (girasas). Desenrollan ADN, evitan tensiones
- ADN ligasas (unen fragmentos ADN mediante enlaces fosfodiéster). Así sellan el
hueco entre dos fragmentos de Okazaki.
- ARN polimerasas (también llamadas primasas). Sintetizan fragmentos de ARN
(llamados ARN cebador) usando como molde ADN y actúa como iniciador de la síntesis
de ADN.
- Nucleasas. Rompen enlaces fosfodiéster entre nucleótidos, escinden ARN cebador y
reparan lesiones en el ADN.
- ADN polimerasas. Catalizan la formación de enlaces fosfodiéster entre nucleótidos.
3. La duplicación del ADN
ARN polimerasa
5`
ARN cebador 3`
ADN
(40-50 nucleótidos)
3`
5`
ADN molde
ADN polimerasa
Función polimerasa
3. La duplicación del ADN Precisa ARN cebador (primer o iniciador) y la
cadena molde de ADN
Recoore la hebra de ADN, es decir lee en sentido 3
´! 5´, y por tanto la hebra nueva crece en
sentido 5´-> 3´
ADN POLIMERASA
Función exonucleasa
Detecta errores, elimina nucleótidos cuyas bases
están mal emparentadas y fragmentos de ARN
cebador
ARN polimerasa
3`
5`
ADN molde
ADN polimerasa
En procariotas distinguimos:
ADN POLIMERASA I
(Retira fragmentos ARN cebador: exonucleasa
Sintetiza ADN en los huecos: polimerasa
Es correctora, ya que repara errores de la síntesis de
ADN)
ADN POLIMERASA II
(Interviene en procesos de reparación del ADN
Tiene actividad polimerasa en sentido 5`! 3´y
exonucleasa en 3´! 5´)
RECUERDA
La ADN polimerasa:
Precisa ARN cebador
Lee en sentido 3´! 5
Sintetiza en sentido 5´! 3´
RECUERDA
La actividad polimerasa
consiste en catalizar la unión
de nucleótidos a la cadena
de ácido nucleico que se
está sintetizando.
La actividad exonucleasa
consiste en escindir
nucleótidos de los extremos
de los ácidos nucleicos.
Fases de la replicación: elongación
Junto a las enzimas que participan en la iniciación, en esta fase actúan las ADN polimerasas.
EXONUCLEASA POLIMERIZACIÓN
POLIMERASA INICIACIÓN
dirección función dirección función
elimina
5’→ 3’
I cebador 5’→ 3’ síntesis no
3’→ 5’ reparación
Fase de iniciación
Fase de elongación
Fase de terminación
Fases de la replicación: iniciación
Consiste en el desenrollamiento y apertura de la doble hélice de ADN
La replicación empieza en un
punto del ADN donde abundan
las secuencias de bases GATC
(Ori C)
En él se separan las dos
cadenas de ADN por acción de
las enzimas.
Fases de la replicación: iniciación
Consiste en el desenrollamiento y apertura de la doble hélice de ADN
Ori C (abundan secuencias
ricas en GATC) Evitan las tensiones debidas a un superenrrollamiento
Girasa
Topoisomerasa
Proteínas
específicas
Proteínas SSB
Helicasa
Las proteínas
específicas se
unen al punto La helicasa rompe los
de iniciación enlaces de hidrógeno entre
las bases y abre la doble
hélice
Fases de la replicación: iniciación
3’
FRAGMENTO DE OKAZAKI 5’
( procariotas: 1000 – 2000
nucleótidos, en eucariotas de Cadena
150 a 200 nucleótidos)
5’
retardada 3’
3’
La ADN polimerasa
5’ III sintetiza un corto
La ADN poli I va eliminando el fragmento de ADN
cebador y rellenando los
nucleótidos de ADN. Finalmente la
ADN ligasa suelda todos los
fragmentos obtenidos
RECUERDA
La ADN polimerasa III:
Precisa ARN cebador
Lee en sentido 3´! 5
Sintetiza en sentido 5´! 3´
Burbuja de
replicación
El mecanismo de elongación o formación de las nuevas cadenas de ADN
3’
5’
Una de las hebras se
5’ sintetiza de modo contínuo
3’ por la ADN polimerasa III. Es
Fragmentos de la conductora o lider.
5’ Okazaki
3’ 3’
3’
5’ 3’
La ADN polimerasa III necesita
un fragmento de ARN (cebador
o primer) con el extremo 3’ libre 5’
para iniciar la síntesis.
Primasas
Cebador
3 La primasa sintetiza un nuevo cebador sobre 4 La ADN polimerasa III comienza a sintetizar un
cada hebra retardada. fragmento de ADN a partir del nuevo cebador.
Hebra retardada
Hebra retardada
5 Cuando la ADN polimerasa III llega al cebador 6 La ligasa une los fragmentos de ADN.
de ARN, lo elimina y lo reemplaza por ADN.
Nuevo cebador
Ligasas
Nuevo cebador
Síntesis de nuevas cadenas de ADN
Horquillas observadas
5’ 3’
3’ 5’
Origen de
Crecimiento Crecimiento
replicación
continuo discontinuo
5’ 3’
5’
3’
Fragmentos
de Okazaki
Fases de terminación
Tiene lugar cuando las dos horquillas de replicación del cromosoma circular de E. coli se
encuentran, y se han formado dos cromosomas completos que permanecen ligados
Burbuja de
replicación
CORRECCIÓN DE ERRORES DE LA ADN
POLIMERASA
Durante la replicación, es frecuente que se produzcan
errores y se incorporen nucleótidos incorrectos.
Gracias a la acción exonucleasa, la ADN polimerasa
elimina nucleótidos mal apareados y adiciona los
correctos.
Número de errores 1 por cada 100 000 bases
Aunque el mecanismo de
corrección de errores es
muy eficiente, a veces
queda alguno sin corregir.
Esos errores suelen ser
importantes en la evolución
Replicación en los eucariontes
Es muy parecida a la de los procariontes, salvo en algunas diferencias:
Los fragmentos de Okazaki en eucariotas son más cortos, entre 150-200 nucleótidos (en
procariotas de 1000 – 2000 nucleótidos)
La replicación se inicia simultáneamente en carios puntos del cromosoma llamados replicones.
Telómero
Cuando se elimina el último 3’
cebador, la ADN polimerasa 5’ 3’ 5’
no podrá rellenar el hueco, al 5’
5’
no poder sintetizar en
Cebador Último cebador
dirección 3’ - 5’.
5’
El mecanismo de duplicación del ADN en eucariotas
Hebra conductora Origen de la replicación Origen de la replicación
Hebra retardada
Horquilla
de replicación
Hebra retardada
Burbujas de replicación
Nucleosomas
Hebra
conductora
Nuevos nucleosomas
LA TELOMERASA
En las células que se dividen continuamente
(células madre de los gametos, células
embrionarias y células cancerosas) hay
una enzima, denominada telomerasa, que
impide el acortamiento de los telómeros.
Se forma por una porción proteica y ARN que
actúa como molde.
A partir de este molde, la enzima sintetiza
ADN para completar la hebra retardada.
ARNt
Este esquema fue considerado durante muchos años el “dogma central de la biología molecular”.,
pero los virus son una excepción a este dogma
REDEFINICIÓN DEL DOGMA CENTRAL DE LA
BIOLOGÍA MOLECULAR
Algunos virus poseen ARN replicasa, capaz de obtener copias de su ARN. Otros poseen
transcriptasa inversa que sintetiza ADN a partir de ARN mediante un proceso de retrotranscripción.
Transcriptasa
inversa ADNc
ADNc
(complementario)
bicatenario
ARN
vírico
Transcriptasa
Envoltura inversa
RETROVIRUS
Transcriptasa Transcriptasa
inversa inversa
ADNc
Membrana plasmática Degradación monocatenario
de la célula huésped del ARN
Transcripción
ADN ARN PROTEÍNAS
Transcripción Traducción
inversa
Replicación Replicación
4. La expresión del mensaje genético
Transcripción Traducción
ADN ARNm Proteína
Transcripción
inversa
Duplicación
Duplicación
3´ 5´
5´ 3´
¿Qué es un triplete y un codon?
TRIPLETE
ADN
AATTCGAGCTAGCAGCCACTTACGAGTACGTAC
ARN
ACUUUCCCGACGCAAAACGUUUUUCGAACUU
CODON
Triplete: Cada una de las secuencias posibles de tres
nucleótidos en el ADN.
Codon: Secuencia de tres nucleótidos en el ARN
Síntesis de ARN: requisitos previos
La síntesis de ARN o transcripción necesita:
Bases
Ribosa
Ribonucleótido
trifosfato
RECUERDA
Fase de iniciación
Fase de elongación
Fase de terminación
Fase de maduración
El proceso de la transcripción
1 INICIACIÓN
La ARN-polimerasa reconoce los centros promotores (ricos en
A y T). Cola poli-A
NO OLVIDES
Cadena inactiva de ADN La ARN polimerasa lee en dirección
3`! 5´
5. Transcripción: maduración en procariotas
Promotor ARN-polimerasa
5’ 3’
3’ 5’ No existe maduración del
ARNm, se unen a los
ribosomas y se traducen
Iniciación
5’ 3’
3’ 5’
Los ARNr y ARNt (transcritos
ARN primarios) precisan de un
Elongación proceso de maduración
5’ 3’ para ser funciones
3’ 5’
Finalización
5’ 3’
3’ 5’
Los ARN que se forman son
policistrónicos (contienen
información para la síntesis
de varios polipéptidos)
ARN transcrito completo
Transcripción: maduración en procariotas
Promotor ARN-polimerasa
5’ 3’
3’ 5’
Iniciación
5’ 3’
3’ 5’
ARN
Elongación
5’ 3’
3’ 5’
Finalización
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
Iniciación
3’ 5’
ARN
ARN-polimerasa
5’ 3’
3’ 5’
CONTINUAR
m7-Gppp
Transcripción en eucariotas
5’ 3’
Finalización
3’ 5’
PoliA-polimerasa 2. Después de la
separación del
ARN, una enzima
m7-Gppp la poliA-
polimerasa
Capucha 5' añade una
OH
secuencia de
unos 200
nucleótidos de
adenina (cola de
poli A)
ARN heterogéneo
nuclear
Cola de poli-A
m7-Gppp OH
Capucha 5'
Transcripción en eucariotas. Proceso de maduración
5’ 3’
Maduración
Exón 1 Intrón Exón 2
Proteína
RNPpn
Espliceosoma.
5’ 3’
3. Eliminación de Mecanismo de
i n t r o n e s splicing
(segmentos de
ARN que no se
traducen)
Intrón
¿Cómo se pasaba de un
lenguaje de cuatro
letras a otro lenguaje
formado por 20
elementos distintos?
3 bases
43 = 64 aa
SUFICIENTE, pero sobran
palabras, lo que significa
que varios tripletes son
sinónimos, porque
codifican (significan) el
mismo aminoácido
EL CÓDIGO GENÉTICO
AUG
El código genético
establece una relación
de correspondencia
entre las bases
nitrogenadas del ARN
y los aminoácidos que
codifica
Características del código genético
UNIVERSAL DEGENERADO
Posibilidad de solapamiento
Met Gli Tre His Ala Fen Ala
necesita
ENZIMAS Y ARN DE
RIBOSOMAS AMINOÁCIDOS ARN MENSAJERO ENERGÍA TRANSFERENCIA
ARNt
Aminoacil-ARNt
Subunidad mayor
Anticodón
3’
5’
ARNm
Subunidad menor
(Unión a la (Unión al
peptidil- ribosoma)
transferasa en el
ribosoma
H C NH2 Aminoácido
(serina)
CH2
ARNt
Anticodón
U C G
La traducción. Biosíntesis de proteínas
Paso previo:
ESTA FASE PREVIA Activación de los aminoácidos
TIENE LUGAR EN EL
CITOPLASMA Y NO EN
LOS RIBOSOMAS ARNt
Aminoacil-ARNt
Aminoacil-ARNt-sintetasa
Fase de iniciación
Fase de elongación
Fase de terminación
La traducción. Biosíntesis de proteínas
Iniciación de la síntesis
3’
U
5’
A C Metionina
5’ A
U 3’
G
ARNt iniciador
E
A
GDP
GTP
3’ 3’
5’ 5’
Subunidad menor
La traducción. Biosíntesis de proteínas
Aminoácido
El aminoácido se Se libera el ARNt que ha
Enlace traslada al otro ARNt cedido el aminoácido
peptídico
ARNt Anticodón
P A P P
A
E A
E
E
GDP GDP
GTP GTP 3’
3’ 3’ 3’
5’
5’ 5’ 5’
Finalización de la síntesis
Polipéptido
libre
Último ARNt
P
A
E
3’
3’
5’
5’
Factor de
El codón de finalización puede liberación
ser UAA, UAG o UGA
Proteína en
formación
ADN de intrones
Gen
Gen
regulador
Intrones
Operador Exones: secuencias
codificantes
Promotor
5. Regulación de la expresión Histonas
Colas
génica en eucariotas
Todas las células, tanto los organismos unicelulares, como las
Regulación en
que forman parte de los organismos pluricelulares, están obli-
gadas a responder continuamente a los diversos cambios pro-
ducidos en el ambiente en el que viven (presencia o ausencia Fibra cromatínica Control de la
organismos eucariontes
cromatina
de alimentos o sustancias tóxicas, cambio de temperatura,
acción hormonal, etc.). Las respuestas a dichos estímulos con-
sisten esencialmente en modificaciones de la actividad meta-
ADN
bólica, aunque también pueden modificar su comportamiento
mediante movimientos, inducción de la mitosis, formación de
esporas de resistencia, etc. Pero, ¿cómo se puede cambiar la Control transcripcional
actividad metabólica y para qué sirve?
Exón 3’
Bien, pues se puede llevar a cabo de dos formas: se puede 5’
Pre-ARNm
modificar la actividad de ciertas enzimas (ver página 97), o se
Niveles de regulación de la expresión
puede regular la concentración enzimática, o sea, el número
de moléculas de cada tipo de enzima que participan en una
Intrón
la traducción Para
(4)evitar
y eldel pro- cesamiento
despilfarro de energía, las células no disponen de
todas las proteínas que están codificadas en sus genes, sino
postraduccional (5).
que en cada momento sintetizan solamente aquellas que nece-
sitan y en las concentraciones adecuadas. Utilizan en cada ins-
tante solamente aquella fracción de la información genética
que resulta realmente necesaria para dar respuesta a la varia- Control
ción de los factores ambientales. Para ello activan unos genes traduccional
y reprimen otros: de esta manera sintetizan rápidamente las Ribosoma
proteínas que necesitan e interrumpen su síntesis cuando ya
hay exceso de ellas.
La regulación de la expresión génica en procariotas se lleva a ARNm Cadena peptídica
cabo mediante un sistema semejante a un conmutador que
puede estar encendido o apagado. Mientras que, en las célu- Control
las eucariotas, la compleja maquinaria que regula la expresión postraduccional
génica se asemeja más bien a una computadora que procesa
la combinación adecuada de múltiples señales y decide si un
gen se activa o no.
Las células de los organismos pluricelulares deben responder Proteína
funcional
rápidamente a una gran variedad de mensajes químicos inter-
plegada
nos que reciben en forma de hormonas, neurotransmisores y
Regulación en organismos eucariontes