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1.

Describir las reacciones del complejo multienzimático de la piruvato deshidrogenasa,


sus coenzimas, productos y regulación
El complejo está regulado por el mecanismo de inhibición del producto y, solo en
mamíferos, de forma covalente. En la inactivación de la enzima, un residuo de serina
específico de E1 es fosforilado por piruvato deshidrogenasa quinasa (PDK). La reactivación
ocurre gracias a una fosfatasa de fosfoproteína específica (piruvato - deshidrogenasa -
fosfatasa, PDP). La regulación alostérica positiva se lleva a cabo por AMP, CoA, NAD + y
Ca 2 +; el negativo por ATP, acetilo - CoA, NADH y ácidos grasos de cadena larga. El
piruvato a su vez actúa inhibiendo PDK y, en consecuencia, estimulando indirectamente la
activación de la enzima y la consiguiente transformación del piruvato en acetil-coenzima A.
Esta misma transformación es estimulada directamente por la insulina, una hormona que
actúa como antagonista en PDK y, en consecuencia, en la activación de la enzima piruvato -
deshidrogenasa.
2. Cuáles son los grupos funcionales presentes en las coenzimas relevantes al ciclo de
Krebs, al cual se les une los grupos que acarrean, transportan o activan, por
ejemplo, el de la coenzima A.
Acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 3 H2O → CoA-SH + 3 (NADH + H+) + FADH2 +
GTP + 2 CO2 + 3 H+
Coenzima A = Piruvado carboxilasa
Citrato = Acidos grasos y colesterol
Cetoglutarato = Aminoacidos
Succinil-CoA = Porfirinas, propionato, isoleucina, metionina y valina
Fumarato = Tirosina Fenilanina
Malato = Piruvato
Oxalacetato = Aminoacidos
3. Cuáles son las coenzimas que participan en el acarreo de electrones en el ciclo de
Krebs
NADH y FADH2
4. Describa detalladamente los ocho pasos del ciclo de Krebs, con sus puntos de
regulación, enzimas, intermediarios y grupos funcionales relevantes
El proceso comienza con la oxidación del piruvato, produciendo un acetil-CoA y un CO2.
El acetil-CoA reacciona con una molécula de oxaloacetato (4 carbonos) para formar citrato
(6 carbonos), mediante una reacción de condensación.
A través de una serie de reacciones el citrato se convierte en oxaloacetato. El ciclo
consume netamente 1 acetil-CoA y produce 2 CO2. También consume 3 NAD+ y 1 FAD,
produciendo 3NADH y 3H+ y 1 FADH+.
El resultado de un ciclo es (por cada molécula de acetil-CoA): 1 ATP, 3 NADH, 1 FADH2,
2CO2
Cada molécula de glucosa produce (vía glucolisis) dos moléculas de piruvato, que a su vez
producen dos acetil-CoA, por lo que por cada molécula de glucosa en el ciclo de Krebs se
produce: 2 ATP, 6 NADH, 2 FADH2, 4CO2 .
5. ¿Qué enzima del ciclo de Krebs participa en éste y en la cadena respiratoria? Y por
qué es posible esta dualidad
La respiración aeróbica en las mitocondrias puede usar el NADH y el FADH2 generados por
la degradación de los aminoácidos y ácidos grasos para la producción de energía, además
de los producidos por la descomposición de la glucosa.
Los ácidos grasos se descomponen mediante la eliminación de dos carbonos a la vez a
través de la deshidrogenación (β-oxidación) ingresando al ciclo del Krebs como acetil-CoA,
donde se oxidan completamente a dióxido de carbono.
Al final los grupos amino se transforman en urea, y los esqueletos de carbono restantes se
oxidan completamente mediante la glucólisis y el ciclo de Krebs y se utilizan para la
producción de ATP.
De esta forma, la cadena respiratoria mitocondrial. Sirve como el componente clave para la
producción de energía.
6. Qué enzimas del ciclo de Krebs pueden usar tanto al NAD como al NADP, es decir
que tienen especificidad dual.
Piruvato deshidrogenasa
Isocitrato deshidrogenasa
Cetoglutarato deshidrogenasa
Malato deshidrogenasa
7. Qué reacciones del ciclo de Krebs generan un intermediario carbanión, cuáles un
carbocatión y cuáles ambos
8. Qué enzima del ciclo de Krebs produce una deshidratación/rehidratación de
intermediarios
Fumarasa
9. Escriba el balance total de productos, energía, descarboxilaciones y acoplamientos
con otras rutas de biosíntesis del ciclo de Krebs
10. Cuál es el rendimiento de los electrones acarreados por el NADH y FADH2 en
términos de ATP por molécula
Cálculos más exactos indican que, de hecho, la energía liberada cuando se oxida 1 mol de
NADH.H + , es suficiente para la síntesis de 2,5 moles de ATP y no 3 como se consideraba
anteriormente. Estos cálculos indican también que el equivalente de la oxidación de 1 “mol”
de FADH2 es suficiente para la síntesis de apenas 1,5 moles de ATP y no 2 moles de ATP
como se consideraba antes. No obstante, diferentes libros de texto continúan utilizando los
equivalentes de 3 y 2 ATP por cada NADH.H + y FADH2 que es oxidado en la Cadena
Respiratoria.
11. Qué es una reacción de transferencia de electrones, y donde se lleva a acabo en las
distintas células de los dominios de la vida aquellas que conducen a la producción
de ATP
La oxidación era la combinación de una sustancia con el oxígeno y la reducción del proceso
inverso, esto es, la disminución del contenido de oxígeno de una sustancia. El NADH
transfiere un par de electrones que entran en el complejo I de la cadena transportadora de
electrones. Los electrones son transferidos al mononucleótido de flavina, y luego a la
ubiquinona (coenzima Q) a través de un transportador de hierro-azufre. Este proceso libera
una cantidad de energía (16,6 kcal/mol).
12. Describa la síntesis de ATP en la fosforilación oxidativa: etapas y rutas que
participan
La síntesis de ATP a partir de ADP y Pi en las mitocondrias está catalizada por la ATP
sintasa (o complejo V).
El mecanismo catalítico de la ATP sintasa. Los protones atraviesan la membrana del lado P
hacia el lado N a favor de su gradiente electroquímico, por un conducto formado entre las
subunidades a y c, provocando un giro de 120° en la subunidad γ, que a su vez produce
cambios conformacionales en las subunidades catalíticas. Las tres subunidades catalíticas
β adquieren conformaciones diferentes durante la síntesis de ATP: abierta, semiabierta y
cerrada. Cuando la subunidad pasa del estado cerrado al abierto se libera una molécula de
ATP, y a su vez se captan las moléculas de ADP y fosfato. Con estos sustratos, la
subunidad β cambia a una conformación semiabierta, donde se lleva a cabo la reacción de
formación del ATP, y posteriormente uno de los sitios catalíticos se abre para liberar el
producto. Este ciclo se repite en forma alterna en las tres subunidades β de la ATP sintasa.
13. Cómo se regula la fosforilación oxidativa, que intermediarios y sobre qué moléculas
y etapas del proceso
14. Cuáles son las evidencias que apoyan el origen endosimbiotico de la mitocondria y
el cloroplasto
Cuando Margulis propuso por primera vez la teoría endosimbiótica, muchos científicos se
rehusaron a aceptarla. Sin embargo, existen evidencias abundantes de que por lo menos la
mitocondria y cloroplasto se originaron por endosimbiosis.
La evidencia de que las mitocondrias y los plastos surgieron a través del proceso de
endosimbiosis son las siguientes:
● El tamaño de las mitocondrias es similar al tamaño de algunas bacterias.
● Las mitocondrias y los cloroplastos contienen ADN circular - al igual que los
procariotas- mientras que el núcleo eucariota posee varios cromosomas
lineales.
● Están rodeados por una doble membrana, lo que concuerda con la idea de la
fagocitosis: la membrana interna sería la membrana plasmática originaria de
la bacteria, mientras que la membrana externa correspondería a aquella
porción que la habría englobado en una vacuola.
● Las mitocondrias y los cloroplastos se dividen por fisión binaria al igual que
los procariotas (los eucariotas lo hacen por mitosis).
● En general, la síntesis proteica en mitocondrias y cloroplastos es autónoma.
● En mitocondrias y cloroplastos encontramos ribosomas 70s, característicos
de procariotas, mientras que en el resto de la célula eucariota los ribosomas
son 80s.
15. Describa la reacción global de la fotofosforilación
La fotofosforilación es la forma por la cual los organismos fotosintéticos captan la energía de
la luz solar, produciendo ATP. Ese fenómeno incluye innumerables reacciones las cuales
ocurren en los cloroplastos.

Al moverse dos electrones desde cada molécula de agua al NADP+ se bombea alrededor
de dos H+ desde el estroma a la luz del tilacoide. Se generan otros dos H+ dentro de la luz
por el complejo que forma oxígeno. El flujo de protones a través del poro protónico en
Cfoimplusa la síntesis de ATP en CF1. (MSP=proteína estabilizante de manganeso; ph
=teofilina; Fd = ferredoxina -NADPoxidorreductasa.)
16. Qué moléculas donan los electrones para la fosforilación oxidativa y qué para la
fotofosforilación
17. Qué compuesto es el último aceptor de electrones en la fosforilación oxidativa y qué
para la fotofosforilación
18. Qué es la fuerza protón motriz
La fuerza protón-motriz se define como la fuerza que promueve el movimiento de protones a
través de una membrana biológica debido a su potencial electroquímico.
19. En que complejos de la fosforilación oxidativa se bombean protones
Es un proceso de la fase luminosa de la fotosíntesis en que se utiliza la energía liberada en
el transporte de electrones para bombear protones desde el estroma al interior del tilacoide
con el fin de crear un gradiente electroquímico el cual al disiparse por la salida de protones
del tilacoide al estroma a través de las ATP-sintetasas acopla esta energía Protón-motriz a
la fosforilación del ADP que forma ATP.
20. Cuáles son los nombres de los complejos de la cadena de transporte de electrones
de la fosforilación oxidativa y de la fotofosforilación
21. Cómo se acopla la absorción de luz con la fotolisis del agua
La fotólisis del agua, por ejemplo, es fundamental para la existencia de formas de vida
compleja en el planeta. Ésta la llevan a cabo las plantas empleando la luz del sol. La ruptura
de moléculas de agua (H2O) brinda como resultado oxígeno molecular (O2): el hidrógeno
es empleado para el almacenamiento de poder reductor.

22. Cuáles son los productos de la fotofosforilación


Los electrones recorren una cadena transportadora, sucediendo un conjunto de reacciones
de oxidación-reducción que conducen a la liberación de energía, parte de la cual es utilizada
para fosforizar ADP, formando ATP.

23. Cuáles son los centros fotoquímicos de los organismos fotosintéticos


24. Describa de forma global la fotofosforilación
La fotofosforilación es un proceso de síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato llevado a
cabo por las ATP-sintasas de la membrana del tilacoide, en los cloroplastos de las células
vegetales.
25. Qué significa que el transporte de electrones este acoplado a la producción de ATP
26. Qué es la teoría quimiosmótica
En concreto, la transducción de energía más importante que ocurre en biología es la
conversión de energía redox (energía de oxidorreducción) o energía luminosa en energía
química (enlaces anhidro fosfato-fosfato). Es decir, la energía redox o luminosa se emplea
para convertir dos fosfatos en un pirofosfato (liberando una molécula de agua, de ahí que
sea anhídrido), o para añadir sucesivos grupos fosfato a nucleótidos (AMP, ADP, ATP, etc.).
27. Cuál es la estructura de los diferentes centros de hierro-azufre de los
transportadores de electrones de la cadena respiratoria y fototransducción
28. Cual es el rendimiento en producción de ATP de una molécula de NADH y de una de
FADH en la fosforilación oxidativa
29. Cómo es el ciclo de la coenzima Q
El ciclo Q (llamado así por el coenzima Q10 o CoQ10) describe una serie de reacciones
sobre cómo la oxidación y reducción secuencial del transportador lipofílico de electrones
CoQ10, entre las formas de ubiquinol y ubiquinona, pueden resultar en la red de bombeo de
protones a través de una doble capa de lípidos (en el caso de la mitocondria, su membrana
interna).
30. Qué es un respirosoma y que es un cristae, o cristato; y para qué sirven
Cristae son pliegues de la membrana mitocondrial interna. La cadena de transporte de
electrones y la quimiosmosis tienen lugar en esta membrana como parte de la respiración
celular para crear ATP y se pueden ver en el diagrama:

31. Cuál es la estructura de la ATP sintasa


32. Cómo funciona la ATP sintasa
Normalmente al romper moléculas complejas se libera energía en forma de protones que la
ATP sintasa aprovecha para generar ATP, que será almacenado para su uso posterior.
También existen compuestos reducidos que sirven de intermediario entre la reacción que
genera energía y la ATP sintasa, como el NADH (Nicotinamida adenina dicnucleótido). Las
ATPasas son aquellas enzimas que requieren la degradación de ATP para funcionar.
33. Cuantos protones se necesitan para que se libere una molécula de ATP de un sitio
catalítico de la ATP sintasa
La ATP sintasa es un complejo grande, de unos 371 KDa. Está formada por varias
subunidades divididas entre la unidad bombeadora de protones, H+, llamada F0 que se
encuentra en la membrana y la unidad catalítica F1 en el citoplasma o en el lumen del
orgánulo.
34. Hacia donde se libera el ATP en la mitocondria, en el cloroplasto y en las bacterias
por la ATP sintasa
En las mitocondrias encontramos la subunidad catalítica en la matriz interna. De esta forma
al entrar protones al interior de la membrana interna de la mitocondria se genera energía.
En los tilacoides de los cloroplastos, sin embargo, la unidad catalítica está orientada hacia el
lumen. El espacio entre la membrana externa y la interna. De esta forma el ATP que se
genera no está en el interior de la membrana interna. Además se pueden encontrarse ATP
sintasas en la cara citosólica del aparato de Golgi y en algunas vacuolas, especializadas en
la generación de energía, en su cara interna. En procariotas, que no tienen mitocondrias o
cloroplastos, ni aparato de Golgi, la subunidad F1 se encuentra libre en el citoplasma y la
unidad asociada a membrana recluta a la unidad catalítica para formar el ATP. Se forman
cuando los protones entran en el citoplasma desde el exterior celular. Como se puede ver la
localización y el funcionamiento básico de la ATP sintasa es común a un gran abanico de
seres vivos.
35. Cuáles son las partes que componen a la mitocondria, cloroplasto y glioxisoma y
para qué sirven metabólicamente
Esquema donde se indican algunos contactos directos entre membranas de diferentes
compartimentos.
Los contactos entre membranas de diferentes compartimentos celulares se proponen como
una forma de comunicación entre orgánulos diferentes, y nuevos trabajos le dan una gran
relevancia previamente no sospechada.
36. Qué enzima del ciclo de Krebs es también parte de un complejo de la cadena
respiratoria

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