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Cultivos (cuaderno)
Tema 9. Análisis cromosómico.
Técnicas de análisis cromosómico.
- Técnicas de análisis cromosómico nos permiten poner de manifiesto los cromosomas
y analizar si presentan algún tipo de anomalía.
- Dos categorías:
Anomalías estructurales, donde se produce alteración del orden o la cantidad de los
genes que portan,
Anomalías numéricas, cuando aparecen o desaparecen cromosomas de la célula.
Existen técnicas para estudiarlos por tinciones, que les dan color
por bandeo, dejando diferentes bandas de
colores
por fluorescencia, resaltando estructuras
marcadas ssssssssssssssssssssssssssssssssscon colorantes fluorescentes.
Los cultivos celulares y el análisis cromosómico es la principal técnica que se realiza en los
laboratorios de citogenética destinados al diagnóstico de anomalías cromosómicas.
Interés del estudio cromosómico.
Se realiza el estudio de cariograma o ideograma en:
- anomalías congénitas en bebés
- alteraciones del correcto desarrollo
- psicomotor de los niños
- problemas relacionados con el desarrollo sexual de los adolescentes o patologías
similares en adultos,
- Infertilidad o problemas genéticos, como hijos con malformaciones o alteraciones en
los genes.
Ideograma Ordenar representaciones gráficas de los cromosomas uno tras otro, sin
su pareja, en función de su tamaño y tras un bandeado
Cariograma los ordena mediante imágenes reales de los mismos, por parejas y según tamaño
o posición del centrómero.
Técnicas de obtención de la muestra, sembrado y cultivo celular.
- Las extensiones cromosómicas la obtenemos a partir de muestras biológicas.
- Ya tomadas, se llevan al laboratorio para realizar un cultivo celular de las mismas, lo
cual permite aumentar la densidad celular de la muestra para posibilitar el estudio
cromosómico.
- Se obtienen por venopunción, en el caso de la sangre periférica; por amniocentesis
para el líquido amniótico o por biopsia para las vellosidades coriales.
- La siembra se realiza incorporando la muestra al medio de cultivo, que es un líquido
enriquecido con sustancias para la nutrición y desarrollo y reproducción celular.
- Es fundamental incubar las muestras con las condiciones óptimas de
pH, osmolaridad, temperatura, viscosidad, tensión superficial y tiempo de
incubación.
- En el caso de la sangre periférica, es recomendable sembrarla por duplicado y de
manera independiente, para evitar contaminaciones y pérdidas de material.
- La de sangre periférica requiere una temperatura de 37 o C y un tiempo de 24 a 72
horas, al 5 % de CO2.
- Es importante recordar que el medio de cultivo debe contener sales, aminoácidos
esenciales, vitaminas, glucosa, moléculas orgánicas como coenzimas, hormonas y
factores de crecimiento, antibióticos y fungicidas.
- También cuentan con mitógenos como la Fito hemaglutinina para estimular la mitosis.
En los medios de cultivo se emplea mucho el suero bovino fetal
Técnicas de sacrificio. Inhibidores de mitosis.
- Sacrificio hace referencia a la detención de la mitosis en la
metafase.
- Para ello, emplearemos sustancias que detienen la mitosis,
entre las cuales las más populares son la colchicina y el
Colcemid.
- Ambos detienen la metafase celular, que es el momento
idóneo, ya que los cromosomas se han formado tras la
condensación y empaquetamiento del ADN.
- Este producto se añade al cultivo y se deja incubar 30
minutos a 37 o C.
- Una vez pasado el tiempo, solo se necesita centrifugar la
muestra para retirar el sobrenadante (el líquido que sobra en
la parte superior del tubo donde lo realicemos) y volver a
provocar la suspensión de las células centrifugadas, que se habrán quedado en el fondo
del recipiente, mediante golpes en el fondo de este.
- El inhibidor de la mitosis debe añadirse de 90 a 120 minutos antes de que termine el
periodo de incubación.
Técnicas de recogida, procesado y extensión de células.
1- Añadimos una solución hipotónica al medio, normalmente cloruro potásico,
mezclándolo con la muestra y dejando que actúe durante 20 minutos.
2- Al encontrarse las células, el agua pasará al interior de las células mediante el
mecanismo de ósmosis.
3- La finalidad es que las células se hinchen para que los cromosomas se separen y, así,
poder verlos mejor.
4- Este paso es delicado y requiere seguimiento estricto de los tiempos y procedimientos,
porque las células podrían quedar muy poco hinchadas y los cromosomas no se verían
como es debido o, por el contrario, podrían hincharse demasiado y romperse.
5- Transcurridos estos 20 minutos, se vuelve a centrifugar, como en el apartado anterior,
retirando el sobrenadante y resuspendiendo la muestra de nuevo.
6- El siguiente paso consiste en fijar la muestra con 5 mL de fijador de Carnoy.
7- Tras 5 minutos, se centrifuga durante 5 minutos y se retira el sobrenadante. Será preciso
realizar 2 o 3 lavados más con el fijador, hasta que obtengamos un botón celular blanco
y limpio.
8- Este material ya estará listo para ser extendido en un portaobjetos, que se realiza
dejando gotear la suspensión sobre este. De esta forma, se rompen las células y se
dispersan sus cromosomas por el portaobjetos.
9- Proporciones para la elaboración de 100 mL de solución fijadora Carnoy:
• Fijador de Carnoy 100 mL
• Etanol 75 mL
• Ácido acético 25 mL
Métodos de tinción y bandeado cromosómico.
Existen diferentes métodos de tinción:
1. Tinción simple: Un ejemplo es la tinción con orceína, una tinción roja-violácea que tiñe los
cromosomas enteros de un color rosado intenso, pero no permite la diferenciación de la
composición de este.
2.Tinción fluorescente: Mediante el empleo de fluorocromos, sustancias que en la
microscopía de fluorescencia le otorgan su característico brillo a la muestra, gracias a la
radiación que emite el colorante.
3. Bandeo:
- Es un tipo de tinción que pondrá de manifiesto diferentes bandas o regiones específicas de los
cromosomas.
- Existen diferentes tipos, como los bandeos G, R, Q, C y NOR.
- Cada uno evidencia un tipo de estructura de los cromosomas. Tenemos:
- El bandeo G se emplea mucho en la elaboración de los cariogramas e ideogramas.
- El bandeo Q es útil para identificar el cromosoma.
- El bandeo C se emplea para estudiar genes que se localizan en regiones conocidas como
heterocromáticas (se verá en el apartado siguiente).
- El bandeo R (reverse), que da un resultado de tonos opuestos al bandeo G, es muy útil para
teñir los extremos distales de los cromosomas.
Bandeo G:
Para la obtención de estas bandas, se añade tripsina sumergiendo el portaobjetos en
una solución y después, se lava.
Luego, se tiñe con Giemsa y se vuelve a lavar el portaobjetos, para finalmente dejarlo
secar.
Nos ofrecerá cromosomas con bandas claras y oscuras; estas últimas serán ricas en A-
T.
Bandeo C:
Con esta técnica vamos a conseguir teñir intensamente zonas heterocromáticas. Tienen
cromatina muy condensada y responde a la zona de los centrómeros. A los cromosomas
se les aplica una solución básica y luego se tiñen con Giemsa.
Bandeo NOR:
Se tiñe a genes del ARN ribosómico.
Test de screening (para embarazadas) Test que indican la probabilidad de padecer una
enfermedad, pero que no la diagnostican. Si uno de estos presenta riesgo de patología genética
realizar pruebas diagnósticas.
• Líquido amniótico:
- Obtención: Punción abdominal se extrae líquido amniótico.
- Cuanto antes se haga, mayor riesgo habrá de aborto, que está normalmente en torno al 1
%.
- Complicaciones: infecciones.
• Sangre fetal:
- Obtención. Se punciona la vena del cordón umbilical y se extrae sangre de ella.
- Es la que mayor riesgo de complicaciones tiene, ya que hasta en un 50 % de los casos se
produce una hemorragia transplacentaria.
- Dentro de las vellosidades coriónicas hay diferentes tipos celulares (fibroblastos, células
endoteliales y macrófagos en una abundante matriz intercelular. (nos importa mas los
fibroblastos)
- Mas importante fibroblasto ya que crecen rápidamente in vitro.
- 1er paso: Disgregar las células que nos interesan mediante el empleo de tripsina/EDTA
para eliminar una capa de células de la placenta, luego empleamo la enzima colagenasa, que
digerirá la matriz intercelular.
- 2do paso: Mantener el cultivo adherido al recipiente en cuestión y se cultivan de 5 a 7
días. Pasado este tiempo, se trata con Colcemid (sustancia que detendrá la mitosis celular.)
- 3er paso: Se produce la hinchazón de las células con una solución hipotónica de citrato de
sodio y, entonces, se procesan para su tinción y análisis.
-1er paso Una vez obtenida la sangre se añade heparina, una sustancia anticoagulante,
para que la sangre con la que trabajemos sea sangre heparinizada.
- 2do paso Esta se incorpora a los medios de cultivo, se tapa el tubo y se mezcla bien.
- 3er paso Se incuban a 37 oC de 48 a 96 horas.
- 4to paso Se añade Metotrexato un día antes de la recolección y se incuban a 37 oC de
nuevo.
- 5to paso El mismo día de la recolección, se añade timidina y se sigue incubando. Treinta
minutos antes de la recolección se añade Colcemid y se deja incubando a 37 oC.
-6to paso Se centrifugan los cultivos y se retira el sobrenadante.
- 7mo paso. Se añade KCl para hinchar las células y se re suspende el cultivo celular. Se añade
el fijador, se mezcla bien y se centrifuga otra vez.
Posteriormente, se retira el sobrenadante, se añade fijador de nuevo y se centrifuga una vez
más.
La recolección se llevará a cabo cuando veamos al microscopio que el crecimiento del
cultivo celular es el adecuado.
Biopsia corial.
Se toma la muestra del trofablasto por: Via transcervical o via transabdominal.
Permite realizar estudios: citogenéticos, moleculares y bioquímicos.
Permite estudiar el cariotipo fetal antes de la semana 15 de gestación.
Nos ofrece resultado en el 99% (alta precisión).
Complicaciones:
- Perdida de la gestación
- Infección aguda
Amniocentesis
Punción abdominal para llegar a la cavidad uterina y extraer L. Amniótico.
Dos tipos: La precoz (se realiza entre las semanas 11 y 14)
La clásica (se realiza a partir de la semana 15 o del 2do trimestre)
Nos ofrece resultado por encima del 99% (alta precisión).
Cordocentesis
Obtener sangre fetal a partir del cordon umbilical.
Tecnicas invasiva mas difícil.
Es una técnica importante ya que cuando la sospecha de cromosomopatía aparece tarde,
ahorra tiempo frente a las demás.
Deleción (del.):
Consiste en una pérdida de material genético.
Durante la meiosis o a consecuencia de agentes externos, un fragmento del cromosoma se
pierde y con él, los genes que codificase.
Marginales si tienen lugar en los telómeros e intersticiales si lo hacen en segmentos
intermedios del cromosoma.
Las principales enfermedades:
- Sindrome de maullido de gato (pérdida de material genético del cromosoma cinco)
- Síndrome de William (pérdida en el cromosoma siete),
- Tumor de Wilms (microdeleción) y retinoblastoma.
Duplicaciones (dup.):
- Aquí se duplica el material genético. Así, parte de un cromosoma estará repetido.
- Cuando se repiten porciones contiguas se denominan en tándem. Si están separadas,
entonces se llaman desplazadas.
MOSAICO GENÉTICO
- Condición de un organismo por la cual existen diferentes cariotipos en sus células.
- Si el mosaicismo genético afecta a células germinales (espermatozoides y óvulos) es
mosaicismo de línea germinal.
- La quimera coexistencia en un individuo de células con ADN totalmente
diferentes, no solo pequeñas mutaciones.
Aplicaciones diagnósticas
Con la citogenética
Podemos identificar las alteraciones numéricas o estructurales.
Puede realizarse de manera prenatal para confirmar una enfermedad de origen
cromosómico.
A veces la citogenética nos permite establecer el diagnóstico certero, siendo la prueba
indiscutible que confirme la enfermedad en estudio.
Investigación a conocer mejor el origen de múltiples.
- Todas las células de una misma especie tienen el mismo número de cromosomas.
- a excepción de las células sexuales que pertenece a organismos diploides son haploides.
- El brazo corto de los cromosomas -- letra p
- El brazo largo de los cromosomas ---letra q
En el caso de mosaicos, se escribe primero una línea celular y, tras una barra, se escriben las
demás.
Anomalías numéricas:
• Trisomía: 47,XY,+21 (hombre con una trisomía en el cromosomas 21)
• Monosomía: 45,XY,-21
• Monosomía de cromosoma sexual: 45, X o 45, X0.
• Mosaicos: 45, X/46, XY
Formula del mosaico
Deleción:
Cariotipo + (número del cromosoma) + (región/es afectada/s)
Ejemplo
- Hombre con deleción intersticial del brazo corto del cromosoma 4 cuya ruptura se
produce entre los puntos p12 y p13: 46, XY, del (4) (p12p13)
- Mujer con deleción terminal del brazo corto del cromosoma 7 con rotura en
p14: 46, XX, del (7) (p14)
Duplicación
Cariotipo + (dup con el número del cromosoma) + (la/s región/es afectada/s.)
Ejemplo
- Mujer con duplicación en tándem directo desde q23 hasta q30 en el cromosoma 8: 46,
XX, dup (8) (q23q30). En este caso, es una duplicación directa, por lo que se comienza
por el número menor.
- Hombre con duplicación en tándem inverso desde q23 hasta q30 en el cromosoma 8:
46, XY, dup (8) (q30q23). Como es un tándem inverso, se invierte el orden de los
números.
- Hombre con duplicación desplazada directa del segmento q21 hasta q31 insertada en el
punto p12 del cromosoma 6: 46, XY, dup (6) (p12q21q31). Al ser desplazada, se
escribe primero el punto del cromosoma donde se ubica la duplicación seguido de los
tramos afectados.
Inversión
Cariotipo + inv (número del cromosoma) + (región/es afectada/s)
Ejemplo
- Mujer con inversión en cromosoma 2 cuyos puntos de ruptura y reunión son q20 y q25:
46, XX, inv (2) (q20q25)
Translocación
Recíproca:
cariotipo + t (los cromosomas que intercambian información) + (los segmentos intercambiados)
Ejemplo
- Mujer con una translocación recíproca entre los cromosomas 5 y 14 cuyos puntos de
translocación son 5p22 y 14q23: 46, XX, t(5; 14) (p22; q23). Se escriben las partes
intercambiadas en el mismo orden que se pusieron los cromosomas que intervienen.
- Hombre con una translocación recíproca entre los cromosomas X y 18 cuyos puntos de
intercambio son Xq25 y 18q12: 46, Y, t(X; 18) (q25; q12). No escribimos el
cromosoma X en el cariotipo porque lo vamos a escribir a continuación.
Translocación robertsoniana:
Inserción
Se indica el punto de inserción y le siguen los extremos del fragmento que se inserta, poniendo
en primer lugar el extremo que se ubique más cerca del centrómero en su nueva ubicación.
Ejemplo
- Hombre con inserción en la banda q22 del segmento p14 p12, siendo una inserción
hetero braquial inversa: 46, XY, inv ins (5) (q22 p14 p12)
Tema 12. Citogenética y cáncer. (estudiar punto 3 y 7 más, y las definiciones)
Punto 3 Bases genéticas y moleculares del cáncer
En la célula existe un equilibrio entre estímulos y el cáncer aparece cuando se altera este
equilibrio y la célula se divide sin control.
Estos mecanismos pueden verse alterados por:
- factores intrínsecos (hormonales, inmunológicos o genéticos)
- factores extrínsecos (factores físicos, químicos o biológicos del medio que lesionan la
célula).
4 grupos de genes responsables de la aparición de las células tumorales:
• Protooncogenes u oncogenesregulación de la proliferación celular (ejm Ret, C-erb-B1).
Propician la aparición de tumores.
•Genes supresores de tumores,controlan y regulan la proliferación y muerte celular. (ejem
P53). Protegen de la aparición de tumores.
• Genes de reparación del ADN Evitan la acumulación de mutaciones en el ADN y repara
daños en el ADN.(ejem MSH2 y MSH3). Evitan la aparición de tumores.
• La homogeneización química
- Se realiza mediante proteasas y detergentes que destruyen el tejido.
- Es más apropiada para piezas pequeñas o congeladas.
- El protocolo consiste en añadir los reactivos citados e incubar la muestra de 24 a 48 horas. -
Pasado este tiempo, se continúa con el proceso de lisis celular.
3. Purificación
La purificación es el proceso de separar los ácidos nucleicos del resto de sustancias, ya que se
encuentran en una solución con restos de la lisis celular y los propios reactivos.
Tipos:
• Purificación mediante solventes orgánicos:
- Utilizamos compuestos basados en el carbono: fenol, cloroformo y alcohol isoamílico
- Los componentes del lisado celular tienen distintas solubilidades frente a estos
compuestos por lo que podremos separarlo.
- Fases: Eliminación de compuestos solubles en solventes orgánicos. Se centrifuga
---------y queda el ADN en fase acuosa.
Precipitación del ADN. Al añadir acetato sódico e isopropanol.
Lavado del ADN (con etanol)
Re-suspensión del ADN. Añadiendo agua destilada.
• Purificación mediante precipitación con sales.
• Cromatografía de intercambio iónico
• Cromatografía de adsorción
• Unión por esferas magnéticas
• Ultrafiltración
4. Técnicas automatizadas
La automatización ha llegado a la extracción y purificación de ácidos nucleicos, aportando:
calidad, rendimiento, velocidad y seguridad a este proceso. Requiere calibración y
mantenimiento.
Algunos tipos: Cromatografía de adsorción y el uso de partículas magnéticas.
8. Conservación
ADN CORTO PLAZO. 4ªC
LARGO PLAZO. -80ºC
Resumen
1. Pretratamiento de la muestra
- Recuperamos la célula
!! - Inactivar las nucleasas