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Resumen Bioqca Hasta Ppt7
Resumen Bioqca Hasta Ppt7
REPASO CARBOHIDRATOS
·
⑧
8
C,H,O
⑧
Pueden unirse a proteínas y lípidos
Configuración y conformación
⑧
Configuración: sustituyentes Conformación: disposición
que componen una molécula espacial de los grupos
7
.
⑧
Isomería y quiralidad
&
n
espacial a partir del carbono unido a sus 4 sustituyentes 2 Esteroisómeros
Isomería
.
⑧
Biológicamente las moléculas quirales se presentan en una sola de sus formas
-
La interacción es esteroespecífica — no da lo mismo el orden atómico
7
Esteroisómeros: moléculas con misma forma, misma secuencia de átomos, mismo tipo de enlaces pero distinta orientación espacial
Monosacáridos
• Cadena de carbonos no ramificada
• Sólo enlaces simples
• Uno de los carbonos del esqueleto forma un grupo
carbonilo (aldehído o cetona)
• Los otros carbonos están unidos a -H y -OH
• En solución acuosa se ciclan
>
pueden existir en 2 formas cíclicas
⑧
C 1 De un monosacárido - C 9 16 De otro mononsacárido
Disacáridos Polisacáridos
⑧
Azúcares sencillos, fáciles de digerir ⑧
Unión de muchos monosacáridos (variación entre 2 y miles)
⑧
Abundantes en la dieta
⑧
Unión mediante enlace gulcosídico
⑧
Pesos moleculares elevados
Heteropolisacáridos Homopolisacáridos
distintos polisacáridos - mismos monosacaridos
->
LÍPIDOS
8
Características comunes a todos los lípidos: Insolubilidad en agua
&
Tipos de lípidos
↓
Ácidos grasos
⑧
Ácidos carboxílicos con cadenas hidrocarbonatadas de 4 a 36 C (mas comunes de 16 a 18C)
Cadena no tiene ramificaciones
! Puede presentar enlaces dobles
Ojo: las propiedades de los acidos grasos y los
compuestos que los contienen están determinados por su
longitud y grado de insaturación
[ I
A. Grasos saturados a temperatura
ambiente actúan como ceras
·
Trans Cis
I
&
Origen industrial, sólidos a temperatura ambiente ⑧
Origen natural, líquidos a temperatura ambiente
Ejemplo: margarina
Ejemplo: aceites
-
** * *
Nomenclatura
-
Especifica:
• Longitud de la cadena Ejemplo:
• número de enlaces dobles separados por
20 : 0
dos puntos
Insaturaciones
L
Número de carbonos
Nomenclatura delta ( ) Nomenclatura omega ( )
..
Los átomos de carbono se enumeran comenzando del ácido Depende de la posición del primer enlace doble desde el grupo metilo
..
carboxílico de la cadena
Esfingolípidos:
• Componen gran porcentaje de la membrana celular
• En lugar de glicerol: esfingosina
Presenta un doble enlace y un grupo amino
A partir de ella se derivan las ceramidas
Esteroides
Tipo de eicosanoide
•
&
Presenta anillo de 5 átomos de carbono (originalmente formaban
parte del ácido araquidónico presente en la membrana plasmática )
•
&
Regulación de síntesis de AMPc
•
⑧
Mediador de la acción de varias hormonas
•
④
regulan una amplia gama de funciones celulares y tisulares
Ejemplo:
• Afectan al flujo sanguíneo de ciertos órganos específicos
• Ciclo de sueño-vigilia
• Capacidad de respuesta de ciertos tejidos a la adrenalina y al glucagón
• Elevación de temperatura (fiebre)
• Inflamación y dolor
Vitaminas
“Vitae”
-
se deben ingerir en la dieta
Vitamina A Vitamina D
⑳
Se obtiene de los betacarotenos: ruptura de betacarotenos Colecalciferol
↓
produce 2 Vit A (retinol) Funciones:
Se forma en la piel a partir de la
• Absorción de calcio (falta:
Oxidaciones sucesivas: trasformación del 7-deshidrocolesterol
raquitismo, osteoporosis)
• alcohol — aldehído — ác carboxilico en Vit D por la acción de la luz UV
- • Movimiento muscular
• retinol — retinal — ác. Retinoico
• Sinapsis
>
⑳
Ác retinoico participa en regeneración celular del epitelio • Capacidad de combate del
⑧
A partir de retinal se sintetiza rodopina (visión) sistema inmune
Vitamina E Vitamina K
Tocoferoles ⑧
Participación en la cascada de coagulación sanguínea
⑧
Se asocia a membranas plasmáticas y depositos de lípidos y
lipoproteínas
•
8
rol antioxidante — anilllo aromático previene lesiones
-
⑧
Se encuentra en aceites vegetales, huevo y germen del trigo
UNIDAD 1
BIOMOLÉCULAS
Generalidades
> 1. Unión de átomos por enlaces covalentes
• Esenciales para la vida - 2. Base: C, H, O
• No se encuentran en la materia inorgánica 7
3. Pueden contener: N, P y S
- 4. Realizan funciones de forma independiente y asociada a otras
biomoléculas
7
5. Interacción y reactividad depende de sus grupos funionales
Grupos funcionales
a
Acetilo: da energía
CoA: llave
2
PUAG
L Ezuanina
púrical
UNIDAD 1
Carbohidratos
Aminoácidos
⑧
En la mayoría de los seres vivos solamente 2 aa son codificados Estructra común
por el DNA para formar proteínas (proteinogénicos)
8
En arqueobacterias se suman selenocisteína y pirrolisina
Cualquier molécula que tenga grupo Nota: muchas proteínas contienen aa modificados y
amino y grupo carboxilo cuenta como aa partes no protéicas (grupos prostéticos )
Efecto del pH
8
Los grupos ionizados y no ionizados reciben nombres diferentes y tienen distintas propiedades ácido - base ⑳
-
“-log” se aplica para poder transformar la
concentración de protones en un esquema lineal
pK : -log K Base H
>
Señala a que valor de pH ocurre una transformación química
Ka =
2) Ácido
Ejempo: si pK = 3, la reacción ocurre a valor de pH 3
I sy
[Productos
K= Multiplicados
[ Reactivos1 -
co Pos
UNIDAD 1
ejemplo
:
pk =
3
pkderx
pH
!3 pH > 3
Carga de los aa
0 - 1 - 1
X
Carbohidratos *
Enlace glucosídico
v
[ Hay muchos tipos de enlaces glucosídicos y cada uno es diferente y único, ↳ Formación: condensación de dos monosacáridos
se necesita una enzima específica para cortar cada enlace específico — forma enlace O-glucosídico
-
L B
4. Indicar nombre de segundo monosacárido
W
Disacáridos
⑳
Azúcares sencillos, fáciles de digerir
④
Abundantes en la dieta, azúcares más
importantes de la leche (lactosa) y las frutas
(sacarosa)
⑳
Unión entre alcohol y grupo carboxilo
Enlace peptídico
Enlace amida
v
⑳
Se crea por condensación
-
unión de grupo carboxilo el primer aa, al grupo amino del segundo
>
Dos configuraciones posibles para el enlace peptídico
Cis Trans
Carbonos hacia el mismo lado del enlace peptídico Los dos átomos de carbono están sobre los lados
opuestos del enlace peptídico
⑧
Polímero lineal de aa (residuos de aa), unidos por enlace peptídico Para estimar el peso molecular de una proteína: n°de aa x 110
⑧
Secuencia única para cada proteína
De esta estructura se puede deducir la estructura 3-D y u función
La masa de la proteina se mide en daltons (1 Dalton = 1/12
⑧
puedan plegarse
⑳
Estructura secundaria
Ordenamiento de regiones cercanas, organización espacial del polipéptido en un patrón de plegamiento regular
V
8
Fuerza encargada: puente de hidrógeno de la cadena principal
-
No participan los grupos R
Más comunes: - Hélice y hoja B- Plegada
⑧
Otra forma: loop / vuelta / giro
ples deH entre aa
15 246 347,
,
<
...
el ner ad pone el H
,
el Indo el O
Estructura a -
⑧
Se repite cada 5,4 A a lo largo del eje de la hélice ⑧
Cadenas o zonas lineales que inetractúan y se estabilizan por
⑧
Grupo C=O se une por pte de H al grupo N-H distante de 4 aa ⑧
Zig-zag tienen forma mas extendida que una Hélice
Átomos H y O se atraen por carga parcial + del H y carga ②
Las hebras B Se pueden asociar a través de ptes de H y formar
parcial - del O(por los enlaces covalentes entre N-H y O=C) hoja B Plegada
⑳
Los radicales miran hacia el exterior de la hélice ⑧
Los grupos R de los aa vecinos de una hebra apuntan en
⑧
El giro más común es hacia la derecha direcciones opuestas
! ma
""""
Nota: 3 aa especiales
Estructura terciaria
Organización tridimnsional de unna cadena polipeptídica Depende de las interacciones de los grupos R
·
Interacciones de zonas distantes, toda la cadena se pliega y se organiza, Desde esta estructura, una proteína es
empaquetamiento de elementos de la esturctura secundaria funcionalmente activa
⑳
Resulta de la agregación de dos o más subunidades polipeptídicas
⑧
En la formación de estructura terciaria y cuaternaria, los aa lejanos de la cadena pueden quedar cera y formar una región funcional
(ejemplo: sitio activo )
GRUPOS DE AMINOÁCIDOS
Según el grupo R
Alifáticos no-polares Aromáticos : apolares
↑
Apolar (o mínimamente polar), sin carga 8
Capaz de absorber luz ultravioleta
->
Grupo R hidrofóbico
.
Diferencia de electronegatividad: cargas parciales
Ejemplo: el carbono es más positivo (menos EN) que el oxígeno
⑧
Cisteína es el único aa que puede formar puentes disulfuro con otra cisteína
x
Este enlace puede unir zonas muy distantes de una proteína
- Juega un papel esencial en muchas proteínas
⑧
Los aa de esta categoría no pueden liberar protones porque no
tienen cargas completas
Cargados negativo ABREVIACIÓN
⑧
Tienen la opción de quedar negativos
&
Pueden estar en forma cargas negativa o en forma sin carga
IONIZACIÓN DE a -AMINOÁCIDO
⑧
Los grupos ionizados y no ionizados reciben nombres diferentes y tienen distintas propiedades ácido-base
⑧
Las moléculas orgánicas se ven afectadas por su entorno
por lo que el pK puede variar un par de decimales
pk 3
=
8
Cuando el valor de pH sea menor a pK, habrá protones en exceso
⑳
Los “mejores ácidos” son los que liberan su protón a menor valor de pk
El valor de pka es el más útil: permite deducir el estado de ionización de los grupos ionizables de los aa, a diferentes pH del medio
& -aminoácidos presentan por lo menos dos grupos ionizables (y dos valores de pka), entonces, pueden sufrir por lo menos dos
reacciones de ionización
COO
-
200H
⑧
Según el valor de pka NH3 + I
NH2
de sus grupos
ionizables, y el pH del
medio, presentan
diferente carga neta
&
Cantidad de transformaciones varía según la cantidad de especies ionizables
Punto Isoeléctrico y Especie Zwitteriónica
I
⑧
No cumple su función • Alzheimer: alteración del péptido beta-amiloide, forma placas amiloides.
8
Tiende a unirse a otras moléculas También hay alteración en el citoesqueleto de las neuronas
proteínas pueden afectar la de forma patológica) en humanos y encefalopatía enspongiforme bovina (enfermedad de las
3. Desnaturalización de proteínas
⑳
Destrucción de la estructura tridimensional de una proteína que no
supone la separación de sus aminoácidos constituyentes
...
Si es reversible o no, depende del agente denaturante y de la proteína
Depende del grado de cambio estructurales que haya sufrido la
.
⑧
Renaturalización: la proteína denaturada vuelve a su conformación
nativa en ausencia del agente denaturante
Químicos Físicos
>
Nota: agentes reductores como el beta-mercaptoetanol pueden
romper enlaces disúlfuro
C I T
Nota: %
C I T
T
s
M
I Hacen referencia al mismo fenómeno
A la “vida media”
4. Hidrólisis de proteínas
⑧
Ruptura química o enzimática de moléculas de proteína -
Irreversible en forma natural, por sí solos los aa no se vuelven a juntar
en péptidos de tamaños diversos y/o aminoácidos -
La proteína pierde su función y estructura de forma permanente
confundir
Tipos de mecanismo de hidrólisis
Químico Enzimático
(Biológicos)
Involucran condiciones drásticas/extremas
Digestión de proteínas
• HCL 6M a 110°C por 24 hrs o más — inespecífico
-
• Bromuro de cianógeno (BrCN) (tóxico) corte específico • Proteasas que rompen enlaces de secuencias específicas
post metionina • Ocurre en el aparato digestivo o dentro de la célula (en
lisosomas, proteosomas)
• Ejemplo: pepsina, tripsina quimiotripsina
A Queratina
Colágeno
:
Constituida por unos poco aa Siempre la 1era posición es glycina (representa 1/3 del colágeno)
Menor diámetro En X es común encontrar prolina
En Y es común encontrar OH prolina o OH lys
:
huesos, dientes, cartílagos, tendones, ligamentos, piel y vasos sanguíneos C) (cofactor de la enzima prolil-hidroxilasa)
impide la hidroxilación de las prolinas. Baja
Tropcolágeno Enrollamiento de 3 hélices
la temperatura de denaturación de 39 a 24
Nota: Vitaminas (vitae) es un grupo muy En mamíferos: 17 cadenas polipéptidos que forman distintos tipos de moléculas de grados — provoca escorbuto
diverso de moléculas que es necesario colágeno
consumir porque son necesarias para la
vida. Compuestas principalmente por
lípidos y pueden derivar n nucleótidos Fibrina
Fibroína
• Fibrilar
•
⑧
Compuesta principalmente por hojas beta plegadas antiparalelas
•
⑧
Rica en Gly y Alanina —> permite su empaquetamiento, flexibilidad y
-
apariencia lustrosa
Albúmina
•
E
Proteína más abundante en sangre
•
8
Función: regula la presión oncótica, transporte de moléculas en sangre
entre el compartimiento intravascular y el extracelular
•
-
Proteína de estructura terciaria
⑭
Se sintetiza a nivel hepático
8
Concentración normal en sangre: 3,5 - 6,0 g/dL
⑧
Representa un 54,3% de las proteínnas plasmáticas
⑧
Concentración oncótica: cantidad de moléculas divididas en sangre
REGULACIÓN DEL TRANSPORTE DE OXÍGENO
Se necesita:
Mioglobina: reserva de O2 en el músculo • Sistema que se asegure que la hemoglobina se sature completamente de O2
• Proceso que se asegure que la hemoglobina libere todo el O2 en el camino
HEMOMPROTEÍNAS
Mioglobina y hemoglobina
-
Modelos de relación entre estructura, regulación y función biológica entre proteínas
Mioglobina Hemoglobina
• capta el O2 que ingresa desde la sangre y lo retiene en el músculo • Transporta O2 en la sangre, en el interior de los GR
• Proteína monomérica (estructura terciaria) • Estructura cuaternaria: Tetrámero ( ) — heterotetrámero
• Posee grupo prostético, grupo hemo, fija el O2 (fija 1 sólo O2) • Un grupo hemo por cada subunidad (4 grupos hemo — fija 4
• Típica globular: 75% alfa-hélice O2)
• Al interior tiene grupos R hidrofóbicos y al exterior hidrofílicos • Presente en eritrocitos, une el oxígeno en los pulmones y los
• Relativamente soluble en agua transporta ara usarse en procesos metabólicos aeróbicos
• Presente en el músculo
Conviene que tenga esta variación de afinidad para cumplir correctamente sus
dos funciones: captación y liberación de O2
lacooperatividad de la hemogrobina
?
con
respecto a la mioglobina
las ·
a
de
la
hemoglobina
presión del 02
mioglobina trabaja
tiene sensibilidad
en un
rango
a los
de 95 %,
cambio
a 100 %
en
·
la
hemogloblina trabaja en rango 10 % -80 % por 10
que es
capaz de adaptarse
COOPERATIVIDAD
↳
Definición: influencia que tienen más subunidades sobre otras en una proteína oligoméricas, en lo que se refiere a su afinidad por su ligando
L I
Los cambios en la conformación de la superficie de la
• Desoihemoglobina: Tensa -
Baja afinidad por el O2 subunidad (donde se une el O2) conduce a un nuevo
• Oxihemoglobina: Relajada -
Alta afinidad por el O2 sistema de interacciones entre las subunidades adyacentes
7
En el espacio se une 2,3-bifosfoglicerato: efector
alostérico negativo, es producto del metabolismo
=mezcla de
afinidades en
tiempo real
la proteina mas a la
izq es 19
mas afin
> La molécula debe tener más de una subunidad para sufrir cooperatividad
&
Hemoglobina exhibe cooperatividad positiva en la unión de O2 moléculas de sus subunidades
Reacción en cadena
7
La última subunidad tiene la mayor afinidad de todos — cada
-
↑ ↑
⑳
A baja presión de O2: conformación tensa — une con baja avidez
-
⑧
La unión de O2 produce un cambio de conformación a relajada y
->
modifica las subunidades vecinas
7
Hemoglobina aumenta su avidez por O2
FENÓMENO DE ALOSTERISMO
Puede estar en proteínas con estructura terciaria o cuaternaria
Definición: propiedad de algunas proteínas de cambiar la conformación y actividad (de una conformación nativa a otra) cuando
interactúa específicamente con algunos ligando
· concentración de O2
Para la hemoglobina: típica sigmiodal saturación de oxígeno
para la unión cooperativa exhibida por fetal hemoglobina
(HbF) y adultos hemoglobina (HbA)
Resumen