Introducción a la Bioquímica

¿Qué significa estar vivo?

- Complejidad química (organización
molecular)
Los seres vivos están compuestos de
materia orgánica (gran cantidad de C,
que forman las macromoléculas)
 Aminoácidos -> Proteínas METABOLISMO
 Ácido nucleico -> DNA Son todas las R(X)
 Lípidos -> Membranas químicas que ocurren
 Azúcares -> DNA, membrana o dentro de nuestras
energía. células. Existe:
 Catabolismo: Se
- Capacidad de tiene una molécula
autorreplicarse/reproducirse grande que se corta
(Descendencia) en pedazos
- Extraer, transformar y uso de energía generando pequeñas
del medio (Metabolismo) moléculas y energía
Entonces, el organismo vivo es capaz de en forma de ATP.
extraer del medio moléculas complejas Por tanto, el
(luz, nutrientes en plantas), catabolismo va de moléculas grandes
transformarlos en ATP (energía). Al a pequeñas.
transformar y generar ATP se libera Las r(x) que permiten generar moléculas
energía que va de vuelta al medio pequeñas y energía son llamadas
generando productos de desechos o no EXERGONICAS (favorables)
(CO2, que es liberado por respiración,
excesos de N se liberan por orina, el H20  Anabolismo: Se tienen moléculas
para regular se suda y el HP02 que regula pequeñas que se unirán por enlaces
el ph en sangre.). Por tanto, al tener que tienen gasto de energía (ATP).
energía se sintetizará, crear o polimerizar Estas r(x) son ENDERGONICAS (no
(unir) para formar macromoléculas favorables, por lo que necesitan
(DNA, RNA y proteínas) energía/calor)
DNA
- Hebras complementarias
- Replicación semiconservativa
- Estructura doble asegura replicación y
reparación fiel a la original
- Compuesta por bases nitrogenadas
complementarias. Que dan nuestra
información genética.
A partir de los genes que están en nuestro
DNA formamos proteínas

Las bases nitrogenadas forman los

tripletes que generan los 20
Aminoácidos. Las macromoléculas son
lo mismo para todos los seres vivos, solo
cambia la expresión de genes, si tenemos
El agua y sus
o no el X gen. propiedades
El agua tiene estructura dipolar (+ y -) y
es capaz de formar enlaces de hidrogeno.
Tiene enlaces covalentes.

El DNA en nosotros se compacta, genera

Tiene dipolos ya que el H es muy electro+ y
los cromosomas que dentro tienen genes
el O es muy electro- por tanto, quedan
y estos genes tienen la finalidad de
PARCIALMENTE cargados (2 positivos de
formar proteínas por sus variadas
H, y 2 negativos de H)
funciones.
El H puede hacer 1 enlace y el O 2
Recordar, se fabrica el RNAm, el
enlaces.
mensaje es leído por el ribosoma en
tripletes indicando que aminoácido se
debe unir para formar la proteína.
 Transcripción: Fabricar el RNAm.
 Traducción: Sintetizar/formar una
proteína.
 Gen: Estructura dentro del DNA que
permite formar una proteína.
 ESTRUCTURA DEL AGUA  A mayor T° menor cantidad de puentes
Dipolar ya que posee una región de hidrogeno entre las moléculas
electronegativa (una región cargada -, es Si el H20 se encuentra en estado sólido
decir el O y además, tiene (hielo) puede formar 4 puentes de
una región electropositiva hidrogeno.
con los H)
Al tener las cargas
parciales + del H, puede
interaccionar con otra
molécula de agua mediante el
O cargado - de la otra
molécula formando la SI el H20 está en estado liquido puede
INTERACCIÓN DE formar de 1 a 3 puentes de hidrogeno,
PUENTE DE HIDROGENO. mientras que en estado gaseoso ninguno.
Los puentes de Hidrogeno no solo ocurren
entre moléculas de agua, si no que en otras
moléculas siempre y cuando se respeten
los puntos anteriores.

PUENTE DE HIDROGENO
- Interacción más débil que un enlace AGUA COMO SOLVENTE
covalente. UNIVERSAL
- Unión de dos átomos electronegativos
El agua disuelve solo moléculas con carga, es
(Ej: O, N) mediante un átomo de H.
decir, “POLARES”
- Para que ocurra debe haber átomos con
diferencias de carga (polo + y un polo -)
- Las moléculas deben estar cerca, si se
alejan no se puede.
- Debe haber una molécula de H.
 Cuando hay una diferencia
de cargas teóricamente se asocia
como que hay una
electronegatividad.
Normalmente el H siempre está unido al O
y al N, que forman la parcialidad de
cargas.
Hidrolisis: Se rompe una molécula de agua
(H20 -> H+ / OH)
  Mientras mas carga, más polar y más
soluble en el agua.
 Mientras menos carga, menos soluble en
el agua.
MOLECULAS POLARES (si interaccionan
con el H20)
- OH, COOH y NH3
MOLECULAS APOLARES (no En ACIDOS GRASOS: Son anfipáticos,
interaccionan con el H20) contienen una cabeza carboxilo polar
- CH, CH2, CH3 y (anillo aromático) (hidrofílica) y una cadena hidrocarbonada
apolar CH (hidrofóbica), por tanto, el H20
interactúa solo con la cabeza. Hidrofílica.

 NO hay interacción entre el H20 y

PUENTES DE HIDROGENO ENTRE
MACROMOLECULAS
En DNA: Las hebras complementarias se
juntan mediante puentes de hidrógenos entre
A-T ( 2 puentes de hidrogeno, estabilizan) y
C-G (3 puentes de hidrogeno)
Los enlaces que se forman dentro de una
misma hebra son covalentes y conocidos
como ENLACE FOSFODIESTER (sólo una
enzima especifica es capaz de romperlo)
la cadena hidrocarbonada de los
ácidos grasos.
Entre medio de las colas, cadenas
hidrocarbonadas se genera una interacción
hidrofóbica (entre moléculas apolares) formando
la “MICELA”
 INTERACCIONES BIOLOGICAS
El agua se ordena alrededor de un sustrato que
interacciona con una enzima, pero para que
ocurra la r(X) química las moléculas del agua se
separan un poco para que el sustrato se una a la
enzima. La unión entre enzima y sustrato es
 Disociar: Separar
mediante puente de hidrogeno, ya que se debe
estabilizar la unión entre la enzima y la molécula El agua al disociarse forma una molécula de
que va a modificar. +H y un -OH..
Escala de pH
Resumen Interacciones: pH = -log (H+), respecto a la cantidad de H que
haya se puede decir si la solución es Ácida o
- Iónicas:
Básica.
Contienen
carga completa, - Acida: Alta concentración de H+
no parcial (protones)
- Atracción: - Básica: Baja concentración de H+
Polos opuestos  El valor de pH es inversamente proporcional
- Repulsión: a la cantidad de H+ que tiene la solución
Cargas iguales

ESTRUCTURA TERCIARIA PROTEINAS

- Dependiendo de los aminoácidos que tenga la
proteína se irán formando las estructuras
terciarias.
- Las interacciones hidrofóbicas, iónicas y
puentes de hidrógeno permiten estabilizar la
estructura terciaria. Además, hay un enlace
covalente, el puente disulfuro que al igual,
permite la estabilización.
 1-3 El H+ estará pegado (HA), como acido.
En el 4, habrá la misma cantidad de asociado
que disociado (HA) = (A- H+) y sobre el 4 se
tendrá mayor cantidad de la molécula
disociada (A- H-).
El jugo gástrico es importante ya que se
necesita secretar en acompañamiento del Esto quiere decir que a pHs menores que el
ClH, que está dentro del estomago y permite valor de pKa la molécula se encontrara como
romper los enlaces entre las proteínas para acido (tiene el H+ pegado), por tanto, se dirá
liberar los aminoácidos. PROTONADA y si el numero de pH es
mayor que su pKa, la mayor cantidad estará
 Soluciones Acidas: Tiende a ceder H+ y al
como base conjugada, es decir, entregó su
disociarse, se separa en un H+ y una base
H+, se dirá DESPROTONADA.
conjugada.. Cada acido tiene una
constante asociada.

- Ácidos fuertes, que se disocian

completamente (al colocar el acido en
agua, todas las moléculas se separan al
100)
- Ácidos débiles, que se disocian
parcialmente (algunas moléculas unidas y
otras separadas). Cuesta que entreguen el Ej:
H+. ¿Cuántos H se liberarán del ácido débil
CH3COOH?. Solo puede ceder 1, ya que los
H pegados a los C jamás se liberan.
El valor de pKa es 4,76.

- Para saber cuándo entrega el H+, se debe

identificar el pKa. Esto entrega un valor
que permite identificar si suelta o no los
H+.
 - Cuando el pH es menor que el pKa, la
molecula estará protonada como acido
Ej 2:
- Cuando el pH es mayor que el pKa, la
molécula está desprotonada.
¿Cuál será el pKa de H2SO4? 2 (por 2 H)
¿Cuál será el pKa de H3PO4? 3 (por 3 H)
Los H+ (protones) no se liberan al mismo
tiempo, cada uno es distinto por tanto tiene su
propio pKa. SOLO depende de la estructura
de cada molécula.

- El agua es acida. (aprox pH 6)

Ejemplo de Ácidos débiles
 Monoproticos (1pKa, sólo libera 1 H+)
 Diproticos (2 pKa, primero libera 1 con
valor pKa 3,77. Al soltar el siguiente es
pKa 10,2)
Ejemplo:
BUFFERS
Soluciones que están compuestas de un acido y
una base conjugada. Su función es amortiguar
bruscos de pH en ciertos rangos.
Cada base que va a estar compuesto de un acido
+ una base conjugada va a soportar un rango
especial que dependerá de su estructura
¿Cómo se sabe el rango útil de un Buffer? Se
deben hacer curvas de titulación para determinar
el pKa (que indica cuando suelta el H+)
RECORDAR: PH ES LA CONCENTRACION
DE H QUE HAY EN LA SOLUCION
 agarra un H+ (por eso en la imagen NH3+) por
tanto:
En el puntito verde encontramos (CH3COOH) =
(CH3COO-), es decir, la mitad como acido y - NH2 ->
mitad de base conjugada. Para determinar el
rango útil, al valor del pKa (4,76) se suma 1
unidad y se resta otra unidad. Por tanto, el rango
irá entre 5,76 y 3,76.
Por ej, si el pKa es 5,1 el rango será 6,1 y 4,1
exactos.

Curva de titulación de un aminoácido

Lo amarillo es igual entre todos los 20

aminoácidos, lo que cambia y hace distinto es el
radical.
El N puede hacer 3 enlaces.. Al ser tan negativo
a veces dependiendo del pH de la solución