Bioquímica

Karla Pastor Moya

Tema 24: Metabolismo de Aminoácidos

TEMA 24: METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS

La chikikarla quiere dedicar este tema a todos los que me tienen que aguantar todas las mañanas, mención especial a Susana, Lucía x3. A la pequeña Yaiza, por
humillarme en la cuenta de pollos. Al pequeño FiLLardi por ayudarme con R. Al pequeño Fran por dejar(nos) que le robemos la cama. A mi amiga invisible que
me ha regalado lo que quería. A Oxonioooooo por aguantar que le llame así. Al pequeño Jose, por acompañarme a la reunión y ayudarme en el gimnasio. Y
bueno, gracias a todos los que hacéis que cada día sea un poco menos mierda de lo que sería sin vosotros. Gracias por presentaros tributos a futuros
biotecnólogos, que la suerte esté siempre de vuestra parte y que comiencen los juegos del hambre.

OBJETIVOS:

-Trabajar en equipo

-Aprobar (y, si aprendemos algo de paso mejor)

- Comprender todos los procesos que sufren los aminoácidos para degradarse. Aprender las rutas que sigue el
nitrógeno hasta que es eliminado. También el catabolismo de aa. Y el ciclo del Nitrógeno

CONTENIDOS:

1. Visión general del Catabolismo de aa

a. Recambio protéico (Ubiquitinización)
2. Digestión de aa
3. Formas de excreción del N2
a. Reacciones del grupo amino
i. Transaminación
ii. Glutamato DHasa
iii. Glutamina sintasa
4. Ciclo de la Urea
a. 5. Pasos
i. Balance
ii. Enzimas
iii. Regulación
b. Relación con el ciclo de Krebs
5. Destino del esqueleto carbonado
a. Clasificación de los aminoácidos
i. Esenciales y no esenciales
ii. Según la biosíntesis
b. Regulación
i. Retroinhibición acumulativa
ii. Modificaciones covalentes
6. Biogénesis del nitrógeno orgánico
7. Ciclo del nitrógeno
a. Organismos en el ciclo
b. Fases

1. VISION GENERAL DEL CATABOLISMO DE AA

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 Los aa se degradan perdiendo el grupo amino (NH3) que se transformará en urea para ser excretado. Después
el esqueleto carbonatado puede seguir diferentes vías como la transformación a Acetil-Coa, piruvato o
intermediarios del ácido cítrico y la energía que se consiga de su oxidación. La cadena carbonada de los aa
podrá transformarse finalmente en cuerpos cetónicos (aa cetogénicos) o glucosa (aa glucogénicos).

*ketone bodies 🡪 cuerpos cetónicos

En animales, los aminoácidos se degradan oxidativamente en tres situaciones:

∙ En el recambio proteico, los AA que no son necesarios para la biosíntesis de las proteínas son
degradados
∙ Con una dieta rica en proteínas, si los AA ingeridos exceden las necesidades para la síntesis de nuevas
proteínas, el exceso se cataboliza; los AA no se almacenan.
∙ Durante la inanición o en las condiciones en las que no se disponga de glúcidos, se recurre a las
proteínas celulares como combustible
Los aminoácidos (AA) se degradan perdiendo el grupo amino y después su α-cetoácido se integra
generalmente en el C.A.T. Las cadenas de 3 o 4 C, a veces, pueden convertirse en glucosa por
gluconeogénesis.

RECAMBIO PROTEICO:

Las proteínas están sujetas a una biosíntesis y degradación continuas. Por lo que, si tenemos una concentración
constante de una proteína, la síntesis de esta se produce a una velocidad adecuada para suponer su pérdidas
producidas por su degradación. Es decir, siempre que tengamos una cantidad suficiente, la síntesis y degradación de
una proteína es proporcional (se produce tanto como se degrada).

La vida media de una proteína puede variar desde unos pocos minutos a muchos meses. Las proteínas que se
excretan al medio extracelular (enzimas, hormonas, anticuerpos) tienen un recambio metabólico rápido (se renuevan
constantemente, la vida media es más corta). Por otra parte, las proteínas cuya función es fundamentalmente
estructural, son metabólicamente mucho más estables ( su renovación es más lenta, su vida media es más larga).

Hay 4 tipos de señales que determinan la tasa de recambio:

-Ubiquitinización

-Oxidación de residuos de aa. Degradación de glutamina sintetasa oxidada (E.coli, hígado de rata) 2

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-Secuencias PEST (Prolina, glutamato, Serina, Treonina)

-Residuo aa N-terminal (Phe, Leu, Tyr, Trp, Lys, Arg)

 ∙ Ubiquitinación

1. Se produce la unión de la ubiquitina al enzima E1

2. Se transfiere la ubiquitina de la E1 a E2
3. E2 y el sustrato se acoplan a E3
4. Se transfiere la ubiquitina de E2 al grupo amino terminal del sustrato proteico
5. Se libera el sustrato con la ubiquitina, la ubiquitina funciona como marcador e indicará que el sustrato debe
ser degradado.

2. DIGESTIÓN DE AA

Las proteínas son degradadas por enzimas proteolíticas dando lugar a oligopéptidos y aminoácidos. Los
aminoácidos (AA) se degradan perdiendo el grupo amino –NH2 que puede ser eliminado por el ciclo de la
urea, después su cetoácido se integra en rutas del metabolismo intermediario, para degradarse en el ciclo de
Krebs o para generar otros metabolitos: glucosa o cuerpos cetónicos.

3. FORMAS DE EXCRECIÓN DEL NITRÓGENO

A. REACCIONES DEL GRUPO AMINO

∙ La transaminación proporciona una ruta para la resdistribución de nitrógeno de los aa.

Transaminasa: se produce una transferencia del grupo amino. Los grupos amino se transfieren de un
aminoácido a un α-cetoácido con las enzimas transminasa o aminotransferasa. Generalmente participa el par
glutamato-α-cetoglutarato.

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La transaminasa existe para todos los aminoácidos excepto para treonina y lisina. Tiene piridoxal fosfato (PLP)
como grupo prostético, el cual deriva de la vitamina B6. El PLP funciona como transportador intermedio de
grupos amino en el sitio activo e las aminotransferasas.

AA1 + α-cetoglutarato 🡪 CA1(cetoácido1) + glutamato

REACCIONES DE TRANSAMINACIÓN

Son reacciones donde se traspasa el grupo amino desde un α-aminoácido a un α-cetoácido, convirtiéndose el 1º
en α-cetoácido, y el 2º en un αaminoácido. Las enzimas que catalizan estas reacciones son las transaminasas y
necesitan el piridoxal fosfato (PLP) como coenzima. El efecto de las reacciones de transaminación consiste en
recoger los grupos aminon de muchos aminoácidos diferentes en forma de L-glutamato.

Cuando predomina la degradación, la mayoría de los aminoácidos cederán su grupo amino al αcetoglutarato que
se transforma en glutamato (GLU), pasando ellos al α-cetoácido correspondiente.

-Sustratos: α -aa y α -cetoácido

-Productos: α -cetoácido y α -aa

-Enzima: aminotransferasas o transaminasas 🡪 Coenzima piridoxal fosfato (PLP)

α-AA1 + α-KA2 🡪 α-AA2 + α-KA1

Hay dos transaminasas, GOT y GPT, cuyos niveles en suero tienen un importante significado en el diagnóstico
clínico.

Estas enzimas, abundantes en corazón e hígado, son liberadas cuando los tejidos sufren una
lesión, por lo tanto sus niveles altos en suero pueden ser indicativos de infarto de
miocardio, hepatitis infecciosa, u otros daños orgánicos

∙ El Glutamato DHasa: libera al amonio gracias al H2O. Vuelve a producirse α-cetoglutarato a partir de
glutamato y libera NH4+. Es un proceso reversible.

Glutamato + H2O 🡪 α-cetoglutarato + NH4+

REACCIÓN DE DESAMINACIÓN OXIDATIVA

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En los hepatocitos, el glutamato, se transporta desde el citosol a la mitocondria, en donde experimenta la
desaminación oxidativa catalizada por el L-glutamato deshidrogenasa (La glutamato deshidrogenasa es una
enzima alostérica con seis unidades idénticas y su actividad está influida por un complicado conjunto de
moduladores alostéricos. Los mejores estudiados son el modulador positivo ADP y el modulador negativo GTP).
En los mamíferos esta enzima se encuentra en la matriz mitocondrial

El AA pierde el grupo amino y pasa a a-cetoácido. Esta reacción reversible puede convertir el GLU en
αcetoglutarato para su degradación, pero también puede sintetizar GLU. Luego es una reacción que actuará en
 sentido degradativo o en sentido biosintético según las necesidades celulares. El α-cetoglutarato formado a
partir de la desaminación del glutamato puede utilizarse en el ciclo del ácido cítrico y para la síntesis de glucosa.

Es una reacción de alto interés metabólico:

1º) permite liberar el grupo amino de los AA hasta NH4+ (degradación de AA)

2º) puede fijar nitrógeno sobre una cadena carbonada (síntesis de AA)

Es una reacción muy regulada

Las mutaciones que alteran el sitio alósterico de unión de GTP o que causan alguna otra forma de
activación permanente de la glutamato deshidrogenasa, conducen a un transtorno genético
humano denominado síndrome de hiperinsulinismo-hiperamonemia, que se caracteriza por niveles
elevados de amoníaco en la sangre acompañados de hipoglucemia

Descarboxilación

Los AA se descarboxilan y forman aminas biógenas, ellas o sus derivados tienen muy importantes funciones
biológicas (hormonas, neurotransmisores, inmunomoduladores, etc): histamina, etanolamina, serotonina,
feniletilamina, etc.

Desde la TYR (tirosina), por descarboxilación y otras reacciones, se producen la familia de las catecolaminas:
dopamina, noradrenalina y adrenalina. El TRP (triptófano) se descarboxila a triptamina y ésta se convierte en
Serotonina.

∙ Glutamina sintasa: Se produce el paso de glutamato a glutamina (la glutamina almacena NH4+). La
glutamina ya sabemos que es uno de los 20a.a de las proteínas que sirve como dador de nitrógeno en
varias vías biosintéticas. Además es muy abundante en la circulación, pues sirve como forma de

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transporte inocua del amoniaco (el cual es tóxico) hacia el hígado y el riñón. El hígado y el riñón tienen la
enzima glutaminasa que libera el amoniaco gracias a la glutamina y el agua.

Glutamina sintetasa: Glutamato + NH4+ + ATP 🡪 Glutamina + ADP + Pi + H+

Glutaminsasa: Glutamina + H2O 🡪 Glutamato + NH3

B. DESTINO DEL GRUPO AMINO

Transporte de amoniaco en el torrente circulatorio al hígado

El amonio es tóxico, sobre todo para el tejido nervioso, por lo que sus niveles en sangre están regulados. En
la mayoría de animales, gran parte del amoniaco libre se convierte en un compuesto no tóxico antes de ser
exportado de los tejidos extrahepáticos a la sangre y transportado al hígado o a los riñones. El glutamato,
que es tan importante para el metabolismo intracelular de grupos amino, es sustituido por la glutamina para
esta función de transporte.

Intoxicación por AMONÍACO: Estado comatoso acompañado de edema

cerebral y aumento de la presión craneal (posible agotamiento del ATP, fase
terminal)
El amoníaco libre producido en los tejidos se combina con glutamato, dando glutamina por acción de la
glutamina sintetasa. Esta reacción requiere ATP y tiene lugar en dos pasos:
1º El glutamato y el ATP reaccionan formando ADP y un intermedio γ-glutamil fosfato. 2º El γ-glutamil
fosfato reacciona a continuación con el amoníaco, produciendo glutamina y fosfato inorgánico.

La glutamina se transporta por la sangre al intestino, al hígado y a los riñones para su tratamiento. En estos
tejidos el nitrógeno amídico se libera en forma de ión amonio entro de las mitocondrias, en donde la enzima
glutaminasa convierte la glutamina en glutamato y NH4+. El NH4+ del intestino y del riñón se transporta por
la sangre al hígado. En el hígado, el amoníaco de todas estas fuentes se elimina mediante la síntesis de urea.

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Parte del glutamato producido en la reacción de la glutaminasa puede ser aún modificado en el
hígado por la glutamato deshidrogenasa, liberando más amoníaco y produciendo esqueletos
carbonados para ser utilizados como combustible metabólico.
No obstante, la mayor parte del glutamato entra en las reacciones de transaminación necesarias para
la biosíntesis de aminoácidos y otros procesos.

Transporte de amoniaco desde los músculos al hígado

La alanina también juega un papel especial en el transporte de grupos amino al hígado en una forma
no tóxica. Mediante una ruta denominada ciclo de la glucosa-alanina. En el músculo y en algunos
otros tejidos que degradan aminoácidos como combustible, los grupos amino se recogen en forma
de glutamato por transaminación (vease apartado REACCIONES DE TRANSAMINACIÓN). El glutamato
 puede convertirse entonces en glutamina para su transporte al hígado tal como se ha escrito, o
puede transferir su grupo α amino al piruvato, un producto de la glucolisis muscular fácilmente
asequible, por acción de la alanina aminotransferasa. La alanina así formada pasa a la sangre y es
transportada al hígado. En el citosol de los hepatocistos, la alanina aminotransferasa transfiere el
grupo amino de la alanina al α-cetoglutarato, formando piruvato y glutamato.
El glutamato puede entrar en las mitocondrias, donde la reacción de glutamato deshidrogenasa
libera NH4+, o puede experimentar transaminación con oxalacetato, formando aspartato que, tal
como veremos, es otro dador de nitrógeno en la síntesis de urea.

4. CICLO DE LA UREA
El grupo amino de los aminoácidos se debe eliminar debido a su alta toxicidad. En los animales
ureotélicos, entre los que se incluye el hombre, se hace formando urea. En los organismos
uretéolicos, el amoniaco depositado en las mitocondrias de los hepatocitos se convierte en urea
mediante el ciclo de la urea. Tambien hay animales Amoneotélicos, se trata de vertebrados
acuáticos, peces y larvas de anfibios, excretan el amoniaco en forma del ión amonio. También hay
animales uricotélicos, aves y reptiles, que excretan el amoniaco como ácido úrico.

Esta ruta fue descubierta en 1932 por Hans Krebs y Kurt Henseleit. La producción de la urea tiene
lugar casi exclusivamente en el hígado y representa el destino de la mayor parte del amoníaco allí
canalizado. La urea pasa al torrente sanguíneo y de ahí a los riñones, y se secreta en la orina.

(No puedo borrar esta ralla soy inútil I´m sorry)

A. LOS PASOS ENZIMÁTICOS DEL CICLO DE LA UREA

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El ciclo de la urea empieza en el interior de las mitocondrias del hígado (marcado con sombreado azul), pero, tres de
los pasos posteriores tienen lugar en el citosol (sin sombreado).

∙ PASO 1: El primer grupo amino que entra en el ciclo de la urea proviene del amoníaco de la matriz mitocondrial,
 NH4+, que es el resultado de las rutas antes descritas. Parte del amoníaco también llega al hígado vía venosa
portado a partir del intestino, en donde se produce por oxidación bacteriana de aminoácidos. Cualquiera que
sea su origen, el NH4+ generado en las mitocondrias hepáticas se utiliza inmediatamente junto con el CO2 (en
forma de HCO3-) producido por la respiración mitocondrial, generando carbamoil fosfato en la matriz. Esta
reacción dependiente de ATP es catalizada por la carbamoil fosfato sintetasa I, una enzima reguladora.
∙ PASO 2: El carbamoil fosfato, que puede ser considerado como un donador activado del grupo carbamoilo, entra
ahora en el ciclo de la urea, que consta de cuatro pasos enzimáticos. En primer lugar, el carbamil fosfato cede
su grupo carbamilo a la ornitina para formar citrulina y libera Pi. La ornitina desempeña pues un papel similar
al del oxalacetato en el ciclo del ácido cítrico, aceptando material en cada vuelta del ciclo. La reacción está
catalizada por la ornitina transcarbamilasa, y la citrulina formada pasa de la mitocondria al citosol.
∙ PASO 3: El segundo grupo amino se introduce a partir del aspartato (generado en la mitocondria por
transaminación y transportado al citosol) mediante una reacción de condensación entre el grupo amino del
aspartato y el grupo ureido (carbonilo) de la citrulina, que forma argininosuccinato. Esta reacción citosólica,
catalizada por la argininosuccinato sintetasa, requiere ATP y tiene lugar a través del intermedio citrulil-AMP.

Paso 3.a: Se introduce ATP sale PPi y aparece el intermediario citrulil-AMP. Paso 3.b Se introduce aspartato
sale AMP y se forma el arginosuccinato.

∙ PASO 4: A continuación, se corta reversiblemente el argininosuccinato por la argininosuccinasa, para formar

arginina libre y fumarato, este último entra en la mitocondria y se une a la reserva de intermedios del ciclo del
ácido cítrico. (Vease “C. conexión del ciclo de la urea el ciclo de Krebs) ÉSTE ES EL ÚNICO PASO REVERSIBLE EN
EL CICLO DE LA UREA.
∙ PASO 5: En la última reacción del ciclo de la urea, la enzima citosólica arginasa corta la arginina dando urea y
ornitina. La ornitina es transportada a la mitocondria para iniciar otra vuelta del ciclo de la urea.

(La citrulina transportada al exterior de la mitocondria no se diluye en la reserva general de metabolitos del citosol
sino que pasa directamente al centro activo de la argininosuccinato sintetasa. Esta canalización entre enzimas
continúa para el argininosuccinato, arginina y ornitina. Sólo se libera la urea a la reserva general de metabolitos del
citosol.)

Balance

2NH4+ + HCO3- + 3ATP + 2H2O 🡪 UREA + 2ADP + 4PI + AMP 2H+

Aunque el balance parezca que es de gasto de 3ATP en realidad se gastan 4 enlaces fosfato de alta energía. Ya que los
dos primeros ATP pasan a ADP. Pero el tercer ATP pasa directamente a AMP. Por lo que sería como el uso de 4ATP.

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Enzimas

-Carbamil-fosfato sintetasa I

-Ornitina transcarbamilasa

-Arginosuccinato sintetasa

-Argiosuccinato liasa

-Arginasa
 Regulación

El flujo de nitrógeno a través del ciclo de la urea varía con la dieta de un organismo. Cuando la dieta es
mayoritariamente proteína, la utilización de los esqueletos carbonados de los aminoácidos como combustible da
lugar a la producción de mucha urea a partir del exceso de grupos amino. Durante la inanición prolongada, en la que
la degradación de proteína muscular empieza a suministrar gran parte de la energía metabólica del organismo,
también aumenta sustancialmente la producción de urea.

Estos cambios en la demanda de actividad del ciclo de la urea se consiguen a largo plazo mediante la regulación de
las velocidades de síntesis de las enzimas del ciclo de la urea y de la carbamil fosfato sintetasa I en el hígado. Las
enzimas se sintetizan a velocidades más elevadas durante la inanición o en los animales con dietas muy ricas en
proteínas, que en animales bien alimentados con dietas que contienen principalmente glúcidos y grasas. Los
animales con dietas carentes de proteínas producen niveles más bajos de los enzimas del ciclo de la urea.

En una escala de tiempo más corta, la regulación alostérica de almenos una enzima, la primera enzima de la ruta la
carbamil fosfato sintetasa I que está activada alostéricamente por el N-acetilglutamato que a su vez se sintetiza a
partir del acetil-CoA y glutamato por la N-acetilglutamato sintetasa. En mamíferos la actividad de la N
acetilglutamato sintetasa tiene una función puramente reguladora

B. CONEXIÓN DEL CICLO DE LA UREA Y EL CICLO DE KREBS

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Dado que el fumarato producido en la reacción de la argininosuccinasa es también un intermediario del ciclo del
ácido cítrico, los ciclos están, en principio, interconectados en un proceso conocido como el “doble ciclo de Krebs”.
Sin embargo, cada ciclo puede funcionar de manera independiente y la comunicación entre ellos depende del
transporte de intermedios clave entre la mitocondria y el citosol.

Varias enzimas del ciclo de krebs, incluyendo la fumarasa (fumarato hidratasa y la malato deshidrogenasa) también
están presentes como isozimas en el citosol. El fumarato generado en la síntesis citosólica de arginina puede, por
tanto, convertirse en malato y a continuación en oxalacetato en el citosol, y estos intermedios pueden seguir siendo
metabolizados en el citosol o ser transportados a las mitocondrias para su utilización en el ciclo de krebs.

El aspartato formado en las mitocondrias por transaminación entre oxalacetato y glutamato puede ser transportado
al citosol, en donde actúa como donador de nitrógeno en la reacción del ciclo de la urea catalizada por la
argininosuccinato sintetasa. Estas reacciones, que constituyen la desviación del aspartatoargininosuccinato,
proporcionan vínculos metabólicos entre las rutas separadas por las que se procesan los grupos amino y los
esqueletos carbonados de los aminoácidos. (Vease Paso 4 de “A los pasos enzimáticos del ciclo de la urea”)

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4. DESTINO DE LA CADENA CARBONATADA DE LOS AMINOÁCIDOS

Las rutas del catabolismo de los aminoácidos, consideradas en conjunto, normalmente solo
representan el 10- 15% de la producción energética del cuerpo humano. Las 20 rutas catabólicas
convergen para formar solo seis productos principales, que entran todos ellos en el ciclo de Krebs. De
ahí los esqueletos carbonados se pueden desviar hacia la gluconeogénesis o la cetogénesis o se
pueden oxidar completamente a CO2 y H2O.

-Los esqueletos carbonados de siete de los aminoácidos se degradan, total o parcialmente, dando en
último término acetil-CoA.

-Cinco aminoácidos se convierten en α-cetoglutarato.

-Cuatro en succinil-CoA.

-Dos en fumarato y dos en oxalacetato.

∙ Destino del esqueleto carbonatado

Los aminoácidos se clasifican según el destino final de su esqueleto carbonado en glucogénicos y

cetogénicos.

Cetogénicos: los que su esqueleto carbonado se degrada a acetilCoA o acetoacetato y pueden

convertirse en ácidos grasos o cuerpos cetónicos: Ile, Trp, Phe, Leu, Lys y Tyr.

Glucogénicos: el resto de aminoácidos, sus esqueletos son degradados a piruvato, fumarato,

α-cetoglutarato, succinil-CoA u oxalacetato y finalmente glucosa.

En periodos de ayuno, los esqueletos carbonados se utilizan como fuente de energía, rindiendo CO2

y H2O 11

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Los aminoácidos en azul, son Cetógenicos. Pueden formar ácidos grasos o cuerpos

cetónicos. Los aminoácidos en rosa, son Glucogénicos. Pueden formar glucosa.

A. CLASIFICACIÓN AMINOÁCIDOS

Esenciales y no esenciales

Los aminoácidos se clasifican en esenciales y no esenciales y esta clasificación es variable según los diferentes
organismos.

Los aminoácidos esenciales. Son aquellos aminoácidos imprescindibles para el desarrollo y que el organismo no
tiene capacidad para sintetizarlos. Esto implica que la única fuente de estos aminoácidos es la ingesta directa a través
de la dieta.

*(Esenciales en animales jóvenes en crecimiento)

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Pnemotecnia para los esenciales 🡪 Lysina y Fer hicieron un Lio tremendo y Valina le metío un Triptófano en
argentina. (a mí me funciona, pero hay más)

Según su biosíntesis

Clasificación por familias en función de su precursor biosintético (está en negrita)

-Aproximadamente, la mitad de los 20 aminoácidos se biosintetizan a partir de intermediarios del ciclo de Krebs y del
piruvato.

Aminoácidos derivados del alfa-cetoglutarato

Los 4 aminoácidos provenientes del alfa-cetoglutarato son el glutamato, la glutamina, prolina y arginina. Como
primer paso para la síntesis de los aminoácidos derivados del α-cetoglutarato, se necesita sintetizar glutamato (a
partir de este, se sintetizarán posteriormente la glutamina, prolina y arginina) como se muestra en la siguiente
reacción, catalizada por la glutamato-deshidrogenasa:

NH3 + α-cetoglutarato + NAD(P)H + H+ --> L-glutamato+NAD(P)++ H2O

La glutamina se forma a partir del glutamato por medio de dos reacciones catalizadas por la glutamina

sintetasa.

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B. REGULACIÓN DEL METABOLISMO DE AMINOÁCIDOS
La actividad de la glutamina sintetasa está regulada en prácticamente todos los organismos, lo que no es
sorprendente si consideramos su papel metabólico central como punto de entrada del nitrógeno reducido (NH4+).

En las bacterias entéricas tales como la E.Coli, la regulación es sumamente compleja. La enzima está formada por 12
subunidades idénticas de inhibidores y está regulado alostéricamente y por modificación covalente al mismo tiempo

∙ Retroinhibición acumulativa. La alanina, la glicina y al menos seis productos finales del metabolismo de la
glutamina son inhibidores alostéricos de la enzima. Cada inhibidor por sí solo causa solo una inhibición parcial.
Los efectos de los distintos inhibidores son más aditivos, de manera que actuando conjuntamente llegan a
inactivar totalmente la enzima glutamina sintetasa. Este mecanismo de control proporciona un ajuste continuo
de los niveles de glutamina en respuesta a los requerimientos metabólicos.

∙ Modificaciones covalentes. Esta modificación covalente incrementa la sensibilidad del enzima a los inhibidores
alostéricos, y la actividad disminuye cuantas más subunidades son adenililadas. Tanto la adenililación como la
desadenililación son promovidas por la adeniltransferasa, que forma parte de la compleja cascada enzimática
que responde a los niveles de glutamina, α-cetoglutarato, ATP, Pi La actividad de la adeniltransferasa está
modulada por la unión a una proteína reguladora denominada PII, y la actividad de la PII es a su vez regulada
por modificación covalente (uridililación) de nuevo en un residuo de Tyr. El complejo adeniltransferasa con PII
uridilada (PIIUMP) estimula la desanililación, mientras que el mismo complejo con PII desuridililada estimula la
adenililación de la glutamina sintetasa. Tanto la uridililación como la desurililación de PII se lleva a cabo por una
única enzima, la uridililtransferasa. La uridililación es inhibida por unión de glutamina y Pi a la uridililtransferasa
y es estimulada por unión de αcetoglutarato y ATP a PII.

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 5. BIOGÉNESIS DEL NITRÓGENO ORGÁNICO

Las moléculas orgánicas nitrogenadas son difíciles de sintetizar, por lo que los organismos dependen de su ingestión
en gran medida o al menos de la ingestión de sus predecesores en la cadena trófica.

Carbamoil-P sintetasa, Glutamato deshidrogenasa y Glutamina sintetasa, son tres las moléculas de N orgánico que
saben sintetizar los organismos superiores a partir del NH4+ libre, que ya es sabido es tóxico: A partir de estas tres
moléculas los organismos pueden generar otros muchos compuestos nitrogenados.

6. CICLO DEL NITRÓGENO Y LAS PLANTAS.

A. ORGANISMOS EN EL CICLO DEL NITRÓGENO

*Las oxidaciones generan energía biológica.

∙ Introducción
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Este es quizá uno de los ciclos más complicados, ya que el nitrógeno se encuentra en varias formas, y se llevan a
cabo en él, una serie de procesos químicos en los que el nitrógeno es tomado del aire y es modificado para
finalmente ser devuelto a la atmósfera. El nitrógeno (N2) es el elemento que se encuentra en forma libre (estado
gaseoso) y en mayor abundancia en la atmósfera (78 %.). Es tan estable, que apenas se combina con otros
elementos y, por tanto, es difícil que los organismos lo asimilen, ya que primero necesitan desdoblarlo y emplearlo
en la síntesis de aminoácidos, proteínas, ácidos nucleicos (ADN y ARN) y otras moléculas fundamentales para su
metabolismo.

En este sentido, se necesita de una gran cantidad de energía para desdoblarlo y combinarlo con otros elementos
como el carbono y el oxígeno. Esta ruptura puede hacerse por dos mecanismos: descargas eléctricas y fijación
fotoquímica, que proveen suficiente energía como para formar nitratos (NO3-). Este último procedimiento es
reproducido en las plantas productoras de fertilizantes.

Sin embargo, existe una tercera forma de fijación del nitrógeno que es llevada a cabo por bacterias que usan
enzimas en lugar de la luz solar o descargas eléctricas. Estas bacterias pueden ser las que viven libres en el suelo o
aquellas que en simbiosis, forman nódulos con las raíces de ciertas plantas (Leguminosas) para fijar el nitrógeno.

Todas las bacterias pertenecientes a estos géneros fijan nitrógeno, tanto como nitratos (NO3-) o como amonio (NH3).

Así mismo, los animales herbívoros sintetizan sus proteínas a partir de los vegetales, mientras que los carnívoros la
obtienen a partir de los herbívoros. Por último, cabe mencionar que todos los seres vivos almacenan grandes
cantidades de nitrógeno orgánico en forma de proteínas, y que vuelve nuevamente al suelo con los excrementos o al
descomponerse los cadáveres. Por lo que en el metabolismo de los compuestos nitrogenados, los animales acaban
formando iones amonio, que resultan muy tóxicos y que deben ser eliminados. Esta eliminación se hace en forma de
amoniaco (algunos peces y organismos acuáticos), en forma de urea (el hombre y otros mamíferos) o en forma de
ácido úrico (aves y otros animales de zonas secas), para que posteriormente, las bacterias nitrificantes se encarguen
de transformarlo.

A pesar de que la mayor parte del nitrógeno se encuentra en la atmósfera, la reserva realmente activa de este
elemento se encuentra en el suelo, ya que aquí van a parar los desechos orgánicos de los organismos vivos y los
restos de éstos. Y es así, como las bacterias fijadoras de nitrógeno concluyen el proceso de descomposición de estos
materiales, convirtiendo el nitrógeno orgánico en inorgánico (nitratos). Los nitratos son la única forma en la cual las
plantas pueden absorber este elemento para poder sintetizar sus propias proteínas, por medio de la fotosíntesis.

Sin embargo, existen ciertas bacterias llamadas desnitrificantes (entre ellas Pseudomonas desnitrificans), que
devuelven parte del nitrógeno inorgánico del suelo a la atmósfera en forma gaseosa, produciendo así una “pérdida”
de este elemento para los ecosistemas y la biosfera.

B. FASES DEL CICLO

1. FIJACIÓN: La fijación biológica del nitrógeno consiste en la incorporación del nitrógeno atmosférico, a las
plantas, gracias a algunos microorganismos, principalmente bacterias y cianobacterias que se encuentran
presentes en el suelo y en ambientes acuáticos. Esta fijación se da por medio de la conversión de nitrógeno 16
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gaseoso (N2) en amoniaco (NH3) o nitratos (NO3-). Estos organismos usan la enzima nitrogenasa para su
descomposición. Sin embargo, como la nitrogenasa sólo funciona en ausencia de oxígeno, las bacterias
deben de alguna forma aislar la enzima de su contacto. Algunas estrategias utilizadas por las bacterias para
aislarse del oxígeno son: vivir debajo de las capas de moco que cubren a las raíces de ciertas plantas, o bien,
vivir dentro de engrosamientos especiales de las raíces. La relación entre Rhizobium y sus plantas huéspedes
 es mutualista: las bacterias reciben carbohidratos elaborados por la planta, y la planta recibe nitrógeno en
una forma asimilable. En el medio acuático la fijación de nitrógeno es realizada por cianobacterias.

Problemas 🡪 Soluciones: Energéticamente costoso 16 ATP/ 1 molécula Buscar microambientes

anaeróbicos

El proceso es lento (1.25seg/ 1 molécula) Nódulos simbióticos en leguminosas (Rhizobium). Los

nódulos contienen
Ieghemoglobina que mantiene el medio
anaerobio 3+
N
2 2N

Enzimas

Dos componentes

-Dinitrogenasa reductasa (ferro-sulfo proteína): Dímero con 2 subnidades idénticas Fe4-S4. Puede ser oxidado y
reducido por 1 electrón. Tiene dos centros de unión a ATP

-Dinitrogenasa (ferro-sulfo-molibdo porteína): Tetrámero, 4 subnidades a2beta2. 4 centros Fe4-S4

Balance:

La fijación requiere consumo de ATP

N2 + 16ATP + 8e- + 10H+ 🡪 2NH4+ + H2 + 16ADP + 16Pi

Proceso

Se rompe el triple enlace de la molécula de Nitrógeno (N2) para producir nitrógeno atómico y NH3.

Los electrones se transfieren del piruvato a la dinitrogenasa pasando por la ferredoxina y la dinitrogenasa reductasa
para fijar una molécula de N2-

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2. NITRIFICACIÓN O MINERALIZACIÓN: Solamente existen dos formas de nitrógeno que son asimilables por las
plantas, el nitrato (NO3-) y el amonio (NH4+), aunque la mayoría de las especies prefieren absorver nitrato que
amonio. El amonio es convertido a nitrato gracias a los microorganismos por medio de la nitrificación. Esta fase es
realizada en dos pasos por diferentes bacterias: primero, las bacterias del suelo Nitrosomonas y Nitrococcus
convierten el amonio en nitrito (NO2-), luego otra bacteria del suelo, Nitrobacter, oxida el nitrito en nitrato. La
nitrificación les entrega energía a las bacterias.

3. ASIMILACIÓN: La asimilación ocurre cuando las plantas absorben a través de sus raíces, nitrato (NO3-) o amoniaco
(NH3), elementos formados por la fijación de nitrógeno o por la nitrificación. Luego, estas moléculas son
incorporadas tanto a las proteínas, como a los ácidos nucleicos de las plantas. Cuando los animales consumen los
tejidos de las plantas, también asimilan nitrógeno y lo convierten en compuestos animales.

4. AMONIFICACIÓN: Los compuestos proteicos y otros similares, que son los constitutivos en mayor medida de la
materia nitrogenada aportada al suelo, son de poco valor para las plantas cuando se añaden de manera directa. Así,
cuando los organismos producen desechos que contienen nitrógeno como la orina (urea), los desechos de las aves
(ácido úrico), así como de los organismos muertos, éstos son descompuestos por bacterias presentes en el suelo y
en el agua, liberando el nitrógeno al medio, bajo la forma de amonio (NH3). En este nuevo proceso de integración de
nitrógeno al ciclo, las bacterias fijadoras llevan a cabo la digestión enzimática, por lo que el amonio se degrada a
compuestos aminados, como proteosas, peptonas y al final, en aminoácidos. Es por esta razón que el proceso se
llama aminificación o aminización.

5. INMOVILIZACIÓN: Es el proceso contrario a la mineralización, por medio del cual las formas inorgánicas (NH4+ y
NO3-) son convertidas a nitrógeno orgánico y, por tanto, no asimilables.

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6. DESNITRIFICACIÓN: La reducción de los nitratos (NO3-) a nitrógeno gaseoso (N2), y amonio (NH4+) a amoniaco
(NH3), se llama desnitrificación, y es llevado a cabo por las bacterias desnitrificadoras que revierten la acción de las
fijadoras de nitrógeno, regresando el nitrógeno a la atmósfera en forma gaseosa. Este proceso ocasiona una perdida
de nitrógeno para el ecosistema. El fenómeno de la desnitrificación se debe, a que en condiciones de mucha
humedad en el suelo, la falta de oxígeno obliga a ciertos microorganismos a emplear nitrato en vez de oxígeno en su
respiración.

C. UTILIZACIÓN DEL NITRATO-NITRITO

La capacidad de reducir el nitrato a nitrito es común en planta, algas, hongos y bacterias. Interviene la enzima
compleja nitrato reductasa (800 kDa), múltiples subunidades, FAD, Mo (unido a un cofactor que contiene pteridina:
molibdopterina) y citocromo 557 (F4S4)

NO3- + NAD(P)H + H  NO2- + NAD(P) + H2O (Plantas NADH; hongos y bacterias NADPH)

La reducción de nitrito a amoniaco se lleva a cabos con la nitrito reductasa. Contiene un centro Fe2S2 y una
molécula de sirohemo (ferroporfirina reducida)

CHIQUISSSSSSSS, SE HA ACABADO

BUENAS GRACIAS Y MUCHAS NOCHES.

FELIZ NAVIDAD, DE VUESTRA SUBDELEGADA

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