Química Biológica

Módulo 4. Aminoácidos

El estudio de las proteínas

implica conocer las
características de sus
unidades constitutivas, los
aminoácidos

MC. Cintia Amaral

Montesino

Otoño 2022
 Aminoácidos:
Unidades estructurales con las que se construyen
las proteínas

Grupo heterogéneo de moléculas que poseen

características estructurales y funcionales
comunes

Estructura primaria de la proteína:

Disposición lineal de los AA que la conforman
 Actividad biológica de los aminoácidos

-Componentes de las proteínas (función principal)

- Aminoácidos o sus derivados actúan como mensajeros

químicos o neurotransmisores

-Hormonas (tiroxina, adrenalina)

- Precursores de moléculas complejas que contienen Nitrógeno
(Bases nitrogenadas -nucleótidos, ácidos nucleicos)
(Grupo hemo- Proteínas)

-Aminoácidos estándar y no estándar actúan como intermediarios de rutas

metabólicas (arginina, citrulina, ornitina- Ciclo de la urea)
AA como precursores de Neurotransmisores, Hormonas, Mediadores
de la Inflamación y Moléculas transportadoras y efectoras
GABA (Ácido Ganma-aminobutírico)
Se produce por descarboxilación de
Glutamato, es un neurotransmisor
con función inhibitoria

Dopamina: Derivado de Tirosina,

neurotransmisor, se usa como fármaco
en el sistema periférico para aumentar
la frecuencia cardíaca y dilatar vasos
sanguíneos renales

Adrenalina: Se sintetiza en
Glándulas suprarrenales a partir de
Tirosina. Hormona y neurotransmisor

Serotonina: Se sintetiza a partir del

triptófano en las neuronas
serotoninérgicas del SNC. Efecto
sedante y placentero. Niveles bajos se
asocian con depresión
Péptidos: Tienen pesos moleculares bajos, constan hasta 50
aminoácidos.

Polipéptidos, Proteína: Molécula con un contenido mayor de 50

aminoácidos. Cada proteína consta de 1 o varias cadenas polipeptídicas

La hidrólisis de cada polipéptido genera un conjunto de Aminoácidos

-20 aminoácidos - estándar (código genético), enlaces peptídicos
covalentes - proteínas

- Aminoácidos estándar - Alfa aminoácidos

-Contienen un átomo de Carbono central (alfa), se le unen un grupo

amino, un carboxilato o carboxilo, un átomo de Hidrógeno, y un grupo R
(cadena lateral)

-Cadena lateral: pueden ser de diferente naturaleza y determina

propiedades químicas (solubilidad, tipo de interacciones, reactividad)
 Enantiómeros de los aminoácidos

Todos los aminoácidos aislados de los polipéptidos son

ópticamente activos: Pueden desviar el plano de luz polarizada
(excepto Glicina)

Carbonos Quirales (griego: manos) o Asimétricos:

Carbonos alfa unidos a 4 grupos diferentes
Todos los AA que forman las proteínas tienen configuración L
 Clasificación de aminoácidos según su capacidad
para interactuar con el agua

-La secuencia de aminoácidos determina la configuración

tridimensional de cada proteína

-Se distinguen cuatro tipos o clases de aminoácidos: (R)

-A) Apolares

-B) Polares

-C) Ácidos

-D Básicos
 Aminoácidos apolares:

-Contienen principalmente grupos R hidrocarbonados sin

cargas

-No pueden formar enlaces con el agua, son hidrófobos

-Importantes en el mantenimiento de la estructura

tridimensional de las proteínas

Se encuentran dos tipos de cadenas R de Hidrocarburos:

las aromáticas y las alifáticas, pueden tener átomos de
Azufre
 Aminoácidos polares:

-Poseen grupos funcionales capaces de formar enlaces por puentes de

hidrógeno
-Interactúan de forma sencilla con el agua (hidrófilos)
-Contienen grupo hidroxilo polar que le permite participar en la formación
de enlaces de Hidrógeno o Amida
 Aminoácidos ácidos:

- Presentan cadenas laterales con grupos carboxilato (COO-) o

carboxilo

-Su identificación depende de las cargas que presenta

- Tienen carga negativa a pH fisiológico

Acido aspártico (aspartato)

Acido glutámico (glutamato)

 Aminoácidos básicos

-Llevan carga positiva a pH fisiológico

-Forman enlaces iónicos con los aminoácidos ácidos
-Lisina – forma colágeno

-Arginina (grupo guanidino, siempre protonado a pH fisiológico, no

actúa en las Reacciones ácido-base)

-Histidina (cadena Imidazol es una base débil, parcialmente ionizada

a pH =7)
Aminoácido esencial, contiene Grupo imidazol

Precursor de la histamina, sustancia que se

libera por el sistema inmune ante una reacción
alérgica

Histamina: Amina vasoactiva que se

encuentra almacenada en los mastocitos como
una molécula química preformada, en basófilos
y plaquetas.

Se libera en respuesta a diferentes estímulos

como:
Traumatismos, Calor, Respuesta inmune que
involucre IgE, estimulación por parte del
complemento (C3a y C5a), proteínas de los
leucocitos, neuropéptidos y citocinas. (Kumar,
2013)

Histidina - pKr= 6,60 - única que se ioniza a

pH fisiológico
Vasodilatador, involucrado en urticaria e inflamación.

Estimula secreción de Pepsina y HCl en el estómago.

 Escombroidosis

Descomposición bacteriana del

pescado provoca la degradación del
aminoácido Histidina presente en
la carne, la cual conlleva a que se
produzca concentraciones elevadas
de histamina en este tipo de
alimentos (intoxicación
alimentaria)
 Los grupos amino y los ácidos carboxílicos se ionizan
fácilmente
A pH fisiológico los grupos amino están protonados y los
ácidos carboxílicos forman su base conjugada
(carboxilato)
Grupo Amino- Carácter básico (acepta protones)
Grupo carboxilo- Carácter ácido (cede protones)

Los aminoácidos puede actuar como ácido y como base,

porque son ANFOTEROS
 Son anfóteros

Las moléculas neutras que llevan un mismo número de

cargas positivas y negativas se llaman zwitteriones

La estructura anfótera (zwitter-ion) representa su

estructura neutra (carga neta = 0) que se obtiene a un pH
= pI del aminoácido
 Titulación de los aminoácidos
-Los aminoácidos presentan grupos ionizables

-La forma iónica predominante de estas moléculas en solución

depende del pH

-Titulación : Es una herramienta útil para el efecto del PH sobre la

estructura del aminoácido y determinar la reactividad de sus cadenas
laterales

-Se realiza con bases fuertes (NaOH)

Alanina
-Pierde 2 protones que pierde escalonadamente
-Los protones que se pierden primero son los del grupo con menor pka)
(pk carboxilo=2,2 y pk amino=9,4)
-pH ácido- grupo carboxilo no está cargado y el Amonio está protonado
(+1) (CATION)

-pH va aumentando- Grupo carboxilo pierde su protón (COO-) carga

neta=0 eléctricamente neutra pH= Punto isoeléctrico
-pH va aumentando – Grupo Amonio pierde su protón, se queda sin
carga NH2 y la carga neta es -1 por el Carboxilato (ANION)
El Punto isoeléctrico (alanina) se calcula:

pI= pK1 + pK2

2
pI= 2.34 + 9.67
2
pI= 6.02
 Comportamiento ácido-base de los
aminoácidos naturales
● Sus grupos COOH y NH2 se comportan como electrolitos débiles,
y tienen su pKa propios (cada aminoácido)

○ COOH COO- + H+ PKa1 = 2-4

○ NH2 + H+ NH3+ pKa2 = 8-10

(aminoácidos polares tienen un pKaR con valores diversos)

● Si pH < pKa1, predomina forma ácida del electrolito (COOH) (+,

C)
● Si pKa1 < pH < pKa2 Zwitterion (Neutròn)
● Si pH > pKa2, predomina forma básica del electrolito (NH2) (-,
A)
Punto Isoeléctrico:

Valor de pH en que el aminoácido tiene estructura isoeléctrica

y su carga neta = 0 (es el pH neutro del aminoácido)

pH=pI

La capacidad de amortiguación (efecto tamponante) en los

pH=pKa es máxima
 Cálculo de Punto Isoeléctrico

● pI = ½ pKa1 + pKa2 (si solo hay un COOH y un NH2)

● Si hay grupo “R” polar, éste influye en el pI: (se toman los valores a
ambos lados del zwiterion)
○ pI = ½ (pKa1 + pKaR) (Si COOH)

○ pI = ½ (pKa2 + pKaR) (Si NH2)

○ (según la naturaleza del grupo “R”- ácido o básico)

○ De ahí se determina la estructura ácido-base del aminoácido y

su carga neta
● Si pH < pI, cargado positivamente (ácida)
● Si pH > pI, cargado negativamente (básica)
Aminoácidos modificados en las proteínas:

-Son residuos de Aminoácidos que se han modificado

químicamente después de incorporarse a un polipéptido
(modificaciones postraduccionales), se forman tras la síntesis
de la cadena polipeptídica
Glucosilación:

Los azúcares pueden unirse de forma covalente a las proteínas

mediante la formación de enlaces O-glucosídicos o N-glucosídicos
Acilación o Prenilación grasa:
Adición de lípidos a una molécula se le conoce como Acilación
grasa

Presente en proteínas de membrana

Grupo palmitoilo (c16) se unen a proteínas de la membrana

(palmitoilación)

Grupo miristoilo (C14) a proteínas en los lípidos de las membranas de

las vesículas intracelulares (miristoilación)

Fenilación: Adición del grupo farnesilo (C15) o grupos geranilgeranilo

(c20)

Se unen a un residuo de cisteína

Fosforilación:

- Importancia biológica- Regulación covalente

-Se le une Pi a un grupo hidroxilo (OH) de las cadenas laterales de
Serina, Treonina, Tirosina
-Catalizado por enzimas quinasas o fosfatasas
-Es un proceso reversible que activa e inactiva a enzimas
Otras modificaciones: Carboxilación del Glutamato
Otras modificaciones: Hidroxilación de Prolina- Colágeno
Selenocisteína:

Es un aminoácido inusual , se encuentra en algunas enzimas y se

requiere para que puedan actuar .
No es una modificación posttraducccional
Modificación de la serina que ocurre mientras se sintetiza la proteína
(serina se une al ARN t)
 INTERACCIONES

1. Las propiedades de las cadenas laterales

determinan las interacciones no covalentes

-Interacciones hidrófobas:
-Plegamiento de la proteína existe un acercamiento de los grupos R
Hidrófobos y se excluye al agua.

-Fuerzas de Van der Walls

-Las cadenas laterales de los aa apolares pueden formar dipolos
instantáneos que pueden originar fuerzas de atracción muy
débiles pero en conjunto pueden influir en la estructura
tridimensional de la proteína
 Interacciones no covalentes

-Interacciones electrostáticas o puentes salinos

Puentes salinos que se establecen entre los grupos iónicos de
carga opuesta (carácter ácido o básico) (Lys, Arg, Hist (+) y Glut,
Asp (-). Estos AA desempeñan un papel importante en la
catálisis enzimática.
Proteínas -DNA

-Enlaces de Hidrógeno:
Cadenas laterales pueden actuar como donadores o aceptores
de Hidrógeno
2. Unión de elementos metálicos

-La unión covalente a proteínas de cationes divalentes (Mg, Ca, Zn)

y metales de transición (Fe, Cu, Ni) es frecuente en proteínas y
enzimas

-Su unión es muy importante para la función de la proteína

-Brinda estabilidad a su estructura tridimensional

-Los metales se unen formando entidades de coordinación (cadenas

laterales y el metal)

-Aumentan la posibilidad de las proteínas de transferir electrones

3. Formación de Enlaces Covalentes:
 Los puentes disulfuros se encuentran
solo en Proteínas extracelulares

No se presentan en proteínas
intracelulares (citosol-reductor)

Protegen la estructura proteica de los

cambios de PH, de concentración
-Dos moléculas de cisteína se salina en el medio extracelular
oxidan
Estabilizan la estructura de la
- Forman Cistina que contiene proteína, permiten entrecruzamiento
un enlace disulfuro llamado
puente disulfuro, enlace
covalente
 Formación del enlace peptídico (características)

Se forma por reacción entre el COOH de un

aa y el NH2 de otro
Es un enlace amida, reacción de sustitución
de acilo nucleofílica
Enlace covalente C-N
Permite formas resonantes que lo hacen
muy estable
Rígido y plano (no permite rotación, solo en
los carbones alfa)
Carácter parcial de doble enlace, (enlaces
híbridos de resonancia)
Implica la pérdida de H20
Puede formar puentes de hidrógeno
Formación del enlace peptídico
Trans- Mayor estabilidad 
Estructura resonante del enlace
peptídico
(carácter parcial de doble enlace: híbrido
resonante entre ambas formas)

Estructuras resonantes aquellas que sean una mezcla de

las diferentes estructuras existentes para una molécula

Mientras más formas resonantes acepte

una estructura química, es más estable
 Polipéptidos
-Tienen estructuras tridimensionales bien definidas,

-Consecuencia de la secuencia de unión de sus aminoácidos

-Los polipéptidos (mayoría) se pliegan espontáneamente en una forma

biológicamente activa

Nombrar un polipéptido
Prefijo- Depende de la cantidad de AA que tenga
Convenciòn : AA con el grupo amino libre N se escribe en el extremo
Izquierdo y el que tiene el grupo carboxilo libre C extremo derecho

H2N- Tyr-Ala-Cys-Gly-COOH

Es un tetrapéptido-
Tirosilalanilcisteinilglicina
(se lee de izquierda a derecha)
 Péptidos

- Estructuras menos complejas que las proteínas

- Poseen actividades biológicas significativas
-Participan en la transducción de señales
 Glutation:

Tripéptido. (Ganma –glutamil-L-cisteinilglicina)

-Se encuentra en casi todos los organismos

-Principal péptido presente en la célula
-Participa en la síntesis de Proteínas y de DNA, metabolismo de fármacos
y toxinas ambientales, Transporte de aminoácidos
-Es un potente agente reductor
-Antioxidante intracelular importante al reaccionar con los peróxidos
 Vasopresina Hormona anti diurética (ADH)

-Nueve residuos de AA
-Se sintetiza en el Hipotálamo
-Los osmorreceptores del hipotálamo inducen su secreción ante la
hipotensión o alta concentración de sodio (hipernatriemia)
-Estimula la reabsorción de agua en la membrana de los túbulos
renales (acuaporinas), el flujo del agua aumenta la presión arterial
-Ligera actividad parecida a la oxitocina

Oxitocina

-Molécula señal que estimula la secreción de leche en las

glándulas mamarias durante la lactancia
-Se produce en el útero, estimula la contracción de este
músculo (parto)
- Actividad antidiurética ligera
Hormona liberadora de
Tirotropina (TRH)
 Son medicamentos que alivian el dolor.
Reducen la intensidad de las señales de
Opioides dolor que llegan al cerebro y afectan las
áreas del cerebro que controlan las
emociones, pueden causar somnolencia,
confusión mental ,náuseas, estreñimiento y
deprimir la respiración

Endorfinas: Péptidos opioides

endógenos, neurotransmisores. Encefalinas: Pentapèptido analgésico
Producidos por hipotálamo-hipófisis contienen leucina y metionina, se
durante la excitación, dolor, produce por hipófisis, cerebro, se
consumo libera al TGI
de picante o de chocolate,  
enamoramiento, sensación de
bienestar y efecto analgésico

Dinorfina: Péptido endógeno cerebral

que produce disforia, sedación intensa,
analgesia
Aspartame:

Alto poder edulcorante (200 veces más que el azúcar)

Sin poder calórico
Éster metílico
Contiene fenilalanina
Presente en dulces, bebidas dietéticas y otros alimentos