BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL Y METABÓLICA

PROBLEMAS DE AMINOÁCIDOS Y PÉPTIDOS

1. Escribir los diferentes estados de ionización de la histidina dependientes del

pH (Pka: 1,82; 9,17 y 6,0). Dibujar la curva de titulación e indicar en ella (del
I al XI) la forma del aminoácido: .

VI / VIII

III / VII / X / XI

V/ VI

II / IX / XI

IV / VI
I / XI

I) Predominantemente protonada.
II) Con carga neta media +1.
III) La mitad de los grupos amino están ionizados
IV) El pH es igual al pKa del grupo carboxilo.
V) El pH es igual al pKa del grupo amino
VI) Máxima capacidad tamponante.
VII) Carga neta media igual a cero.
VIII) El 50% carga neta media cero y el 50% tiene carga neta media -1.
IX) Molécula totalmente ionizada.
X) Punto isoeléctrico.
XI)Peores regiones de tamponamiento.
.
2. Dado el siguiente tripéptido: Asp-Lys-Ala (ácido aspártico (Asp), lisina (Lys)
y alanina (Ala).)

a) Escribir las diferentes formas de ionización

b) Indicar la estructura que predomina apH4.

A pH 4, el grupo carboxilo de Asp estará principalmente protonado (COOH) y el
grupo amino terminal de Lys estará principalmente protonado (NH3+).
c) Calcular el pI
6.4
.
d) Indicar la carga del péptido a pH1,4,8y12.
pH 1 = Carga +2
pH 4 = Carga 0
pH 8 = Carga 0
pH 12 = Carga -1
e) ¿Serían iguales los péptidos Asp-Lys-Ala y Ala-Lys-Asp?. ¿Por qué?.
No, Los péptidos Asp-Lys-Ala y Ala-Lys-Asp son diferentes debido a la
secuencia de aminoácidos. En Asp-Lys-Ala, el ácido aspártico (Asp) está en el
extremo N-terminal, seguido de lisina (Lys) y luego alanina (Ala). En Ala-Lys-
Asp, la alanina (Ala) está en el extremo N-terminal, seguida de lisina (Lys) y
luego el ácido aspártico (Asp).
f) Explique razonadamente algún tratamiento por el cual se obtenga, en un
único paso, un dipéptido y un aminoácidos libre.
Para obtener un dipéptido y un aminoácido libre en un solo paso, puedes
utilizar una enzima proteolítica, como la tripsina. La tripsina es una enzima que
rompe los enlaces peptídicos específicos en las proteínas y péptidos después
de la lisina (Lys) o la arginina (Arg).
DATOS: Considerar los siguientes valores de pKa: 2,2; 3,8; 9 y 10.

3. A partir de los datos que se dan a continuación, determinar la secuencia de

aminoácidos del opioide leucina-encefalina. Explicar porqué.

a) La hidrólisis completa con HCl 6 M a 110oC seguida de análisis de

aminoácidos indica la presencia de Gly, Leu, Phe y Tyr en una proporción
molar 2:1:1:1
Después de la hidró lisis completa con HCl 6 M a 110°C, se encontraron los
aminoá cidos Gly (glicina), Leu (leucina), Phe (fenilalanina) y Tyr (tirosina) en una
proporció n molar 2:1:1:1. Esto sugiere que el péptido contiene estos aminoá cidos
en una secuencia específica.

b) El tratamiento del péptido con1-fluoro-2,4 dinitrobenceno seguido

dehidrólisis completa y cromatografía indicó la presencia del 2,4-dinitrofenil
derivado de la Tyr. No se encontró Tyr libre.

El tratamiento del péptido con 1-fluoro-2,4-dinitrobenceno permitió derivar la

tirosina (Tyr) presente en el péptido. Sin embargo, no se encontró tirosina libre en
la muestra. Esto indica que la tirosina en el péptido está unida y no es una tirosina
libre.
c) La digestión completa del péptido con quimotripsina seguida de
cromatografía dió lugar a un tetrapéptido más leucina.
La digestión completa del péptido con quimotripsina dio como resultado un
tetrapéptido y leucina. Esto significa que la quimotripsina cortó el péptido
después de un residuo de leucina (Leu). El tetrapéptido resultante debe
contener los aminoácidos restantes.

4. Indicar los péptidos que se obtendrían al tratar el siguiente polipéptido Val-

ile-cys-ala-lys-glu-gly-ile-phe-ile, con:

a) tripsina
 En el caso de la tripsina esta haría el corte a partir de Lys ya
que la tripsina reacciona con Lys o Arg. Al dar el corte del
polipetido este se separaría en Val-Ile-Cys-Ala-Lys y el otro
péptido será Glu-Gly-Ile-Phe-Ile

b) quimiotripsina
En la quimiotripsina veríamos algo similar a la tripsina, en este
caso solo se haría un corte el cual sería en Phe. Sabemos que la
quimiotripsina solo reacciona con Phe, Trp, Tyr o Leu. Los
péptidos resultantes serian Val-Ile-Cys-Ala-Lys-Glu-Gly-Ile y PheIle.

c) bromuro de cianógeno
En la quimiotripsina veríamos algo similar a la tripsina, en este
caso solo se haría un corte el cual sería en Phe. Sabemos que la
quimiotripsina solo reacciona con Phe, Trp, Tyr o Leu. Los
péptidos resultantes serian Val-Ile-Cys-Ala-Lys-Glu-Gly-Ile y PheIle.