Generalidades del DNA

CARACTERISTICAS DE LAS CELULAS

 Están rodeadas de una membrana que permite paso de nutrientes (entorno intracelular y
extracelular)
 Requieren energía para sus funciones metabólicas (ATP)
 Contienen toda la información (genética) para formar una nueva célula
 Replican su material genético a partir de un molde
 Utilizan una molécula intermediaria para transcribir la información Usan proteínas para
catalizar reacciones (bio)químicas

PROCARIONTE Y EUCARIONTE

Procarionte

→ no tienen compartimentalizacion, no hay un orden dentro del nucleo de su estructura

Lo que pasa es que no esta en compartimiento pero si esta ordenado

Caracteristicas de los procariontes

 Su material genético es una molécula de DNA circular (4-5), a diferencia de una celula
humana que tiene 46 cromosomas distintos.
 Carecen de sistemas de endomembranas
 Más pequeños y simples que eucariontes Se replican a través de división binaria
 Gran parte de los estudios geneticos se hacen en bacterias porque por ejmplo de un
cultivo podemos sacar millones de bacterias
 Ciclo de vida celular mas corto
Division binaria

Que es el proceso de division por el cual pasan las bacterias que implica un evento de replicacion
del material genetico y a una duplicacion de este organismo

La gracia de esto es que es un crecimiento exponencial porque por cada generacion voy
produciendo el doble de la generacion anterior

Son tiempos de reproduccion que son muy cortos podemos encontrar bacterias que se dividen
alrededor de los 9 minutos

Se requiere coordinacion espacial y temporal (secuencial) en la sisntesis de macromoleculas:

 DNA
 Proteinas
 Hidratos de carbono
 Lipidos

Reflejado poblacionalmente por un aumento en el numero de organismos presentes

Eucarionte

→ tenemos dos tipos de celulas animal y vegetal, ordenamiento, compactadas

Su material genético es DNA lineal y está rodeado por una membrana

Presenta organelos

Sistema más complejo que los procariontes

Se replican de diferentes maneras, la más común es a través de mitosis

Ciclo de vida mas largo

Ciclo celular

Dos fases principales:

-interfase

→ lo que hace es prepararse para el evento de division

G1: la celula duplica su tamaño y aumenta la cantidad de organelos, enzimas y otras moleculas

S (sintesis): duplicacion del DNA y proteinas asociadas. Existen ahora dos copias de la informacion
genetica de la celula, tiene que decidirse aquellas que se quieren dividir entran a la fase s
G2: crece un poquito mas, las estructuras necesarias para la division empiezan a montarse, los
cromosmas empiezan a condensarse

-mitosis o division celular (divicion de la celula en 2, dos celulas indenticas entre si) se separan los
dos juegos de cromosomas , ocurre citocinesis es decir el citoplasma se divide.

 Se separan y distribuyen las cromatidas hermanas duplicadas en dos nucleos hijos

 Mitosis se refiere especificamente a la division del nucleo celular
Se puede distinguir 4 estados o fases:

-Profase

-Metafase

-Anafase

-Telofase

M: mitosis

→ primero la celula debe condensar sus cromatidas hermanas recien duplicadas luego se produce
la separacion de estas cromatidas

1) El material genetico ya viene duplicado de la fase s y lo que tengo que hacer ahora es
separar
2) Tengo un hilo de 2 metros y lo organizo una parte de ese hilo a una celula y el otro a la
otra celula, en el caso del DNA hace un enrrollamiento del material genetico,en los que
vemos los famosos cromosomas
Etapas de la mitosis

Y finalmente ocurre citocinesis que se dividen las celulas en 2

Cariotipo: Patrón cromosómico de una especie. Conjunto de los pares de cromosomas de una
célula, de forma, tamaño y número característicos de cada especie.

Control del ciclo celular

Las etapas del ciclo celular estan totalmente reguladas entocen tenemos distintos puntos de
control mas conocidos como CHECk POINT

El mecanismo de control del ciclo celular debe asegurar que :

 Cada proceso o evento cuente con el tiempo adecuado para permitir que se complete
 Los procesos se inician siempre en el orden correcto
 Cada evento o procesos ocurre solo una vez por ciclo
 Cada evento se gatilla en forma irreversible (switch binario On/Off)
 Adaptable a la condiciones del medio
Puntos de control del ciclo celular

Control de fase G1:

→antes de entrar a ese hago el primer control donde pregunto

¿tiene la celula el tamaño adecuado?

¿el entorno favorece la duplicacion o no?

¿el material genetico tiene algun daño?

Si no hay problema entra an el ciclo

Control de la fase S

¿Se ha producido daño en el DNA?

si no hay problema continua la sintesis del DNA

Control de la fase G2

¿se ha replicado todo el DNA?

¿el entorno es favorable ?

¿tiene la celula el tamaño adecuado?

Si no hay problema se comienza la mitosis

Control de la metafase

¿estan todos los cromosomas alineados en el huso?

¿se ha producido daño en el DNA?

Si no hay problema se finaliza la mitosis

Estan los reguladores quienes van chequeando que estos puntos de control se vayan pasando de
manera exitosa, sucede que aveces estos controladores se echan a perder y como se echan a
perder djan pasar una celula o una etapa sin que esten todos los chequeos correctos.

Las mutaciones son eventos naturales que se producen continuamente aveces hay errores que no
son visible y otras veces que si , esto pasa porque falla el sistema de control, esto puede suceder
en caso que la celula este bajo estres que produjo un cambio en ese controlador y este
controlador permitio que una celula que tenia una mutacion que era dañina continuara en el
ciclo.

ADN

El ADN es un polimero formado por unidades reptidas de nucleotidos unidas a traves de un enlace
fosfodiester

Nucleotido: Base nitrogenada+azucar+ grupo fosfato

Gupo fosfato: punto de union entre dos nucleotidos

Bases nitrogenadas

-timina/uracilo con adenina

Las funciones biologicas del ADN incluyen el almacenamiento de informacion y su replicaicon para
asegurar la transmision de la informacion a las celulas hijas durante la division celular.
Azucar ADN

Desoxiribosa para el ADN → En el carbono 2 un grupo H

Pirimidinas: timinina, citocina (1 anillo)

Purinas: adenina, guanina (2 anillos)

5´3´ 3´5´´

Azucar ARN

Ribosa para el ARN → en el carbono 2 un grupo OH

Pirimidinas:uracilo,citocina

Purinas: adenina, guanina

5´ 3´

Polinucleotidos

Este polimero se forma cuando yo tengo nucleotidos libres que tienen la base nitrogenada y el
nucleotido nuevo que va ingresando el grupo fosfato es un trifosfato es decir que tiene 3 fosfatos,
se produce una reaccion de union y de lisis en el cual reacciona en este caso ambos nucleotidos, se
libera un bifosfato y uno de estos permanece unido al carbono 5 de la base que viene ingresando
y forma la union con el carbono 3 del nucleotido que se encontraba presente

Grupo fosfato esta unido al carbono 2.

Diferencia entre un nucleosido y un nucleotido

La diferencia es que un nucleosido esta compuesto por una base nitrogenada+ azucar , este al no
tener grupo fosfato no es capaz de formar una cadena y el nucleotido esta compuesto por una
base nitrogenada+ azucar+ grupo fosfato puede formar cadena

ESTRUCTURA PRIMARIA DEL ADN: SECUENCIAS DE BASE DEL DNA

• La información genética está contenida en el orden exacto de los nucleótidos.

• Las bases nitrogenadas que se hallan formando los nucleótidos de ADN son Adenina, Guanina,
Citosina y Timina.
• Los nucleótidos se unen entre sí mediante el grupo fosfato del segundo nucleótido, que sirve de
puente de unión entre el carbono 5' del primer nucleótido y el carbono 3' de siguiente
nucleótido.

• Como el primer nucleótido tiene libre el carbono 5' y el siguiente nucleótido tiene libre el
carbono 3', se dice que la secuencia de nucleótidos se ordena desde 5' a 3' (5' → 3').

Secuencia de DNA

La secuencia de DNA se escribe como un código de 4 letras y corresponde a una sola hebra, la
hebra codificante (5´ 3´)→

Estructura secundaria del DNA: doble helice

 Ambas cadenas son complementarias, pues la adenina de una se une a la timina de la

otra, y la guanina de una a la citosina de la otra, a través de Puentes de Hidrógeno.
 Adenina forma dos puentes de hidrógeno con Timina.
 Guanina forma tres puentes de hidrógeno con Citosina.
 Ambas cadenas son antiparalelas, pues el extremo 3´ de una se enfrenta al extremo 5´ de
la otra.
 Las dos hebras están enrolladas en torno a un eje imaginario, que gira en contra del
sentido de las agujas de un reloj.
 Las vueltas de estas hélices se estabilizan mediante puentes de hidrógeno.

Estructura terciaria del ADN: compactacion

El contenido de DNA de una celula diploide humana de unos 8x10^9 pb que se estima tiene una
longitud de 3 metros . este DNA debe quedar empaquetado en un nucleo con un diamentro de 10
mm

La compactacion la vemos en Los cromosomas eucariontes estos no se encuentran libremente en

el citoplasma. Cuando las células no se están dividiendo los cromosomas se encuentran al interior
del núcleo formando un complejo DNA-proteína, llamado cromatina

Cromatida densa cerca de la envoltura nuclear es sujetada a la lamina nuclerar

Cromatina difusa en el nucleoplasma

Cromatina

Material filamentoso de los cromosomas eucariontes, formado por DNA enrrollando las histonas y
otras proteínas asociadas
Es un octameto de histonas

Nucleosoma

Unidad estructural de primer orden para el empaquetamiento de la cromatina, que esta formada
por 146 pb de DNA que envuelven 1,75 veces un núcleo octamérico de proteínas histonas. Los
siguientes nucleosomas están conectados por fragmentos de DNA conector o “linker”

Con estas estructructuras yo puedo enrrollar el material genetico

1)tengo la fiba de DNA

2)Se enrolla sobre la histona

3)estas histonas enrrolladas se asocian entre si (nucleosoma)

4)despues estas forman a pasar a ser en formas de loop que se empiezan a apretar

5)se condensa la seccion del cromosoma

6)sobreenrrollamiento llamado cromosoma metafasico

El resultado neto: la molecula de DNA es empacada en un cromosoma miotico que es 10.000

veces mas corto en longitud.

Replicacion

→ proceso a traves del cual yo genero una copia de mi material genetico.

Genotipo: Patrimonio genético característico de un organismo, especie o individuo

Propiedad inherente a los genes presentes en un organismo

Fenotipo: Conjunto de características observables o medibles de un organismo, especie o
individuo

Conceptos generales: Definiciones

Gen: -estructura que posee la informacion para codificar una proteina

Entidad que codifica para un producto, donde el producto puede ser una proteína, un péptido o
RNA

Un gen constituye información almacenada

Los genes se encuentran, a su vez, en macromoléculas de información, llamadas ácidos nucleicos

Dogma central de la biología molecular

Replicaicon del RNA: virus RNA

Transcripcion reversa: retrovirus

Replicacion

Ivolucra la duplicacion del material genetico

Replicacion semiconservativa

Modelo Conservativo: En este modelo las dos cadenas de ADN parentales se vuelven a juntar
después de que ocurre la replicación. Una molécula hija contiene a ambas cadenas parentales y la
otra contiene al nuevo material sintetizado.
Modelo Semiconservativo: En este modelo las dos cadenas parentales del ADN se separan y
sirven de molde para la síntesis de una nueva cadena de ADN. El resultado son dos dobles hélices
de ADN, donde ambas están constituidas de una cadena parental y una cadena nueva.

Modelo Dispersivo: En este modelo la doble hélice parental es rota en segmentos de doble
cadena de ADN. Al igual que en el modelo conservativo, actúan como moldes para la síntesis de
nuevas moléculas de doble hélice. Los segmentos se recomponen en dobles hélices de ADN
completas, cada una con segmentos intercalados de padres e hijos.

Origen de la replicacion: el replicon

La iniciacion del proceso de replicacion comienza por el reconocimiento (ori) por una serie de
proteinas

 Las secuencias requeridas para un origen de replicacion varian segun las especies
 Saccharomy cerevisiae 3-4 secuencias de 10-15 pb en regiones de 100-150 pb. Posee app
400 elementos ARS en diferentes cromosomas

Esta determinado por estas secuencias que se encuentran en el cromosoma de individuos y que
son secuencias que permien el aglomeramiento o la agrupacion de las proteinas que son
escenciales para el inicio de la transcripcion y que dependiendo del tamaño del individuo va a ser
el numero de replicaciones que vamos a tener

Pj: en las bacterias como estamos hablando de genomas pequeñitos en comparacion con las
eucariontes, tenemos 1 origen solamente 1 origen de replicacion por cromosoma, eso quiere
decir que cuando se replica ese cromosoma lo hace desde un punto

En el caso de los eucariontes como los cromosomas suelen ser mucho mas grandes es poco
eficiente que yo solamente tenga el origen o el inicio en un punto y tengo distintos origenes de
replicacion + de 1.

Replicacion del DNA

La síntesis de la cadena comienza con un complejo de proteínas denominadas primosoma. La

elongación la lleva a cabo otro complejo denominado replisoma.

Enzimas que participan en el proceso de replicación del DNA :

 DNA polimerasa : va poniendo uno a uno los nucleotidos

 Primasa (síntesis de partidor RNA 2-60 nucleótidos) : para que la DNA polimerasa pueda
funcionar esta pone el primer
 Helicasa : abre la cadena
 Ligasa (enlace fosfodiéster):
 Topoisomerasas, (relajan el DNA permitiendo el avance de la horquilla de replicación)
Pasos:

HEBRA CONDUCTORA

1-el dna se desenrrolla y los puentes de hidrogeno entra las dos cadenas se rompen, este proceso
es ayudado por la enzima helicasa, luego las proteinas enlazantes a cadena sencilla (SSBs) van a
evitar que las cadenas se unan nuevamente, que dara como resultado una burbuja de replicacion,
estas burbujas se forman en varios lugares a lo largo del ADN quepuede aumentar la velocidad de
la replicacion

Como la cadena ya fue desenrrollada y separada viene la DNA polimerasa, para comenzar a
construir una nueva cadena, en este caso la hebra conductora, esta enzima construye la nueva
cadena en direccion 5´ 3´ , el problema es que no puede iniciar una nueva cadena, solo puede
prolongar una cadena preexistente por lo que la RNA primasa se encargara de poner el primer que
son los primeros nucleotidos de la nueva cadena (proporciona el extremo 3´)

La dna polimerasa puede ahora ir colocando los nucleotidos complementarios en la cadena molde

Dna polimeraza lee la cadena molde en 3´a 5´

Posterioriormente la helice se sigue desenrrollando y se abre para crecer de modo continuo ,

Luego la dna polimerasa diferente reemplaza el cebador de RNA con DNA

Y la ligasa fija los nucleotidos

Hebra rezagada

Se sintetiza en direccion opuesta a la del avance de la horquilla, RNA primasa pone el cebador ,
DNA polimeraza sintetiza la nueva cadena, se desenrrola mas la helice y vuelve a ponerse un
cebador y a utilizarse la DNA polimerasa, y a los tramos discontinuos se les va a denominar
fragmentos de okazaki, luego una DNA polimerasa diferente cambia el RNA por DNA, finalmente
una ligasa sella la union de los fragmentos de DNA

Replisoma: elongacion

Complejo enzimático de la replicación que coordina la síntesis de las dos cadenas, consta de:

 DNA polimerasa : va agregando las bases nitrogenadas

  Primosoma: formado por las enzimas :

 Primasa y Helicasa (desenrolla el DNA)

 Proteína de unión a cadena sencilla, ssb (estabiliza el DNA de cadena sencilla)

 Topoisomerasas tipo I (rotura una cadena) y II (rotura de dos cadenas) que en conjunto
con la DNA ligasa permiten la relajación del superenrollamiento

Primosoma: apertura y formacion del primer

1)Es la primera estructura que incluye primero abrir el material genetico por la enzima que se
llama la helicasa (descomprimiendo), liberando el trenzado y tension que hay entre las helices

2)llega la DNA polimerasa, pero hay un problema porque no puede llegar y empezar este necesita
el primer o iniciador(secuencia pequeña de 20-30 nucleotidos que se genera al inicio de la
transcripcion)

3)primasa pone el primer y DNA polimerasa puede empezar a sintetizar la nueva hebra
adicionando uno a uno los nucleoticos a un extremo 3´-OH que entrega el primer

DNA polimerasa procarionte

En bacterias se conocen tres enzimas DNA polimerasa, todas tienen la actividad exonucleasa 3’-5’
DNA polimerasa I: un polipéptido de 103 kDa, única con actividad exonucleasa(puede eliminar
nucleotidos) 5’-3’

Funcion: ir revisando hacia atras e ir cortando hacia adelante , rellenando espacios

DNA polimerasa II: Involucrada principalmente en la reparación del DNA

DNA polimerasa III: Complejo enzimático. Replicasa (encargada de la replicacion)

Polimerasa II y la polimerasa III son las que principalmente estan en la replicacion y la polimerasa
I tiene la gracias que puede eliminar fragmentos en extremo 5´ 3´

Hebra continua: capacidad de solamente ir agregando nucleotidos al extremo 3´ son hebras

complementarias que van en direcciones opuestas
Fragmento de okasaki, estos frgamentos primero se debe eliminar el primer de RNA y rellenar y de
esto se encarga la DNA polimerasa I , despues viene la DNA ligasa que reconoce los espacios y los
repara y une las dos hebras formando una hebra continua.

DNA polimerasa eucarionte

Transcripcion y procesamiento del transcrito

La transcripción es el proceso en el que la secuencia de DNA de un gen se copia (transcribe) para

hacer una molécula de ARN.

El DNA provee la información para la síntesis de RNA

Enzima: RNA polimerasa DNA dependiente,

 incorpora nucleótidos dentro de una cadena de RNA cuya secuencia es complementaria a

una de las cadenas del ADN: la hebra molde.

Timina se cambia por uracilo

Nomenclatura de las cadenas

Hebra no molde= hebra codogenica= secuencia del Mrna

Hebra molde= hebra no codogenica (antisense)

Etapas de la transcripcion

Reconocimiento del DNA( gen a transcribir)

 iniciacion
 elongacion
 terminacion
¿por que el reconocimiento es tan importante?

Porque yo tengo el gen y en replicacion el reconocimiento es para saber donde parte la replicacion

Esquematizacion del gen

Region regulatoria + region estructural

Promotor: lugar donde se unen las enzimas encargadas de la transcripcion. (region regulatoria)

Regios estructural: secuencia que luego dara origen a una proteina.

La transcripcion comienza cuando la ARN polimerasa se une a una secuencia llamada promotor
cerca del inicio de un gen (directamente o a traves de las proteinas auxiliares.

Los promotores tienen secuencia de consenso similares pero no identicas

Dentro de esta region promotora hay dos secciones que es la region -10 y la region -35
Iniciacion +1 en verde donde se inicia la transcripcion y se encontro que 10 nucleotidos antes se
encontro un secuencia que es muy similar entre todas ellas y 35 nucleotidos antes tambien a esto
se le denomina el consenso

-35: 77GACA

-10:TATAAT

Transcripcion en procariontes : escherichia coli

Estructura basica de un promotor bacteriano:

Sitio de inicio de transcripcion: +1
Secuencia consenso: -35 y Secuencia TATAAT: -10

RNA polimerasa
Las RNA polimerasas son enzimas que transcriben el ADN en ARN. Mediante un molde de ADN, la
ARN polimerasa construye una nueva molécula de ARN a través del apareamiento de bases. Por
ejemplo, si hay una G en el molde de ADN, la ARN polimerasa agregará una C a la nueva cadena
creciente de ARN.

 A diferencia de la DNA polimerasa no requiere un partidor

 No posee actividad correctora
 Un solo tipo que presenta múltiples subunidades

AGREGADO: El virus de vih tiene una DNA polimerasa De RNA dependiente o retropolimerasa
porque va a ser al reves, toma el RNA y a partir de este RNA genera moleculas de DNA
Estructura

Se compone de 5 subunidades: 2 subunidades a idénticas, b, b’, ω, más el cofactor 

El cofactor  tiene la propiedad de disociarse del resto de subunidades durante el proceso dejando
el núcleo central de la enzima al descubierto.

APOENZIMA = Inactiva, CORE de la RNA polimerasa compuesta de las subunidades a, b, b’, ω

HOLOENZIMA = Activa, APOENZIMA más factor  (sigma)

Procariontes: RNA polimerasa de escherichia coli.

Holoenzima: Apoenzima+factor sigma 

Reconcimiento del promotor e iniciacion de transcripcion

→ ¿por que ocupo el factor ?

Si yo quiero hacer una transcripcion general ocupo un factor  que se llama 70

si quiero expresar un gen que tenga que ver con degradacion de azucares 70, el sigma viene se
une a region -35 el resto de la holoenzima se puede unir entre -35 y -10, reconoce al factor sigma
y se activa comenzando la transcripcion

si yo quiero un gen que este relaionado con el estres s,el factor sigma s se va a unir a todos
aquellos genes que el producto de ese gen este relacionado con estres y despues la RNA
polimerasa estara buscando el factor sigma

factor sigma encargado de activar o desactivar genes.

si yo quiero un gen que me active una via especifica de la absorcion nitrogeno de la bacteria 54

para choque termico : 32 y E

etapas de la transcripcion

1)iniciacion: la RNA polimera se une a la region promotora entre las secuencias consenso: -35 pb
y -10 pb

El promotor reconoce a la holoenzima del RNA polimerasa, el CORE asociado con sigma con el
RNA polimeras con la subunidad que une a un promotor espefico (ROJO) en el ADN

Esta enzima activada que esta unida a region promotora empienza la transcripcion en el sitio de
incio de la transcripcion

En el sitio de inicion el DNA se abre formando una burbuja

Esta enzima hace todo, esta es la que descomprime, abre las 2 hebras exponiendo la hebra que yo
quiero copiar y sin la necesidad de un primer empieza la copia y la generacion del RNA y despues
ella es la misma la que vuleve a recomprimir

2- elongacion

5´→3´

Enrrollamiento rio arriba 5´ y desenrrollamiento 3´del DNA , lo que va haciendo es que va

agregando los nucleotidos cambiando las T por las U

Liberacion factor sigma

Elongacion de la cadena RNA

El factor sigma solamente esta involucrado en el proceso de iniciacion para la activacion, y una vez
que esta activado empieza la polimerizacion y existe la disosiacion del factor sigma y esta enzima
sigue funcionando hasta que se encuentra con la secuencia de terminacion.

3.terminacion

→ la secuencia de terminacion es una estructura que le va a indicar a la RNA polimerasa que este
es el punto donde debe terminar la transcripcion.

Para poder terminar la transcripcion tenemos 2 opciones

1) Depende del factor rho: en donde rho es una proteina y este es el encargado de avisarle a
la RNA polimerasa que la transcripcion se acabo.

• rho es una proteína de aproximadamente 46KDa y es activa como un hexámero

Lo que hace rho es localizar un sitio de union que se encuentra en el RNA mensajero que nosotros
estabamos codificando, esta secuencia que yo estaba codificando tiene una secuencia tipo que
es reconocida por este factor rho

Rho no sabe donde esta secuencia, y lo que va haciendo es identificando, controlando o

chequeando el RNA

Una vez que rho reconoce su secuencia, viaja usando el transcrito como guia hasta unirse a la
RNA polimerasa e interactuar con ella

Cuando interactua con la RNA polimerasa genera esta RNA polimerasa se libere o se disocie del
DNA y termine la transcripcion.

• Las secuencias requeridas para la terminación de rho son de una longitud de 50-90 bases y están
rio arriba del terminador

• El RNA sustrato de rho es rico en residuos C y pobre en residuos G

• rho viaja axialmente a través de la molécula de RNA hasta alcanzar la RNA polimerasa cuando
esta hace una pausa frente a un loop

• Rho desestabiliza la interacción DNARNA y libera el transcrito

 2) Independiente de rho: secuencia de terminacion

Dos características estructurales:

- Horquilla en la estructura secundaria

- 6 residuos de U al final de la estructura

La forma en la cual trabaja en por la generacion de una estructura que impide que la RNA
polimerasa siga avanzando se llama estructura una especie de coyac u horquilla que se forma
gracias a la interaccion entre secuencias

→ a medida que se va produciendo el transcrito y se va liberando el transcrito estas secuencias

empiezan a interactuar entre si

El problema esque esta estructura se forma aun estando el ARN polimerasa dentro de es como si
formara un nudo y al formarse este nudo la RNA polimeraza no puede seguir avanzando y esta se
libera terminando el proceso de transcripcion
Promotores eucariontes

Tenemos 2 genes eucariontes

a)gen mamifero: no solamente tenemos region promotora o regiones de reconocimiento tambien

vamos a encontrar regiones que llamamos de aumento de la transcripcion que hara que la
trancripicion se repita mas veces o con mas fuerza, ademas vamos a encontrar que dentro del gen
hay secuencia que se utilizan y secuencia que no se utilizan que son: exones y los intrones , y para
agregar mas dificultad como el transcrito esta dentro del nucleo tiene que salir del nucleo y que
afuera no le pase nada, tengo que sellarlo en un extremo tengo que hacer una modificacion
agregar la caperuza en 5´y la cola de poli A en el extremo 3´y todo eso va a ser transcrito

b)gen de levadura s.cerevisiae:

RNA polimerasa en eucarionte

-en eucarionte tenemos mas estructuras :

 DNA nuclear
 DNA mitocondrial
  Cloroplasto
Entonces vamos a tener :

 RNA polimerasa mitocondriales

 RNA polimerasa de nucleo
 RNA polimerasa de mitocondria
 RNA polimerasa de cloroplasto

RNA POLIMERASA PROCARIONTE

Solamente tiene una RNA polimerasa para todos los tipos de RNA que existen

Tipos de RNA

 RNA mensajero → Mrna → RNA polimerasa II

 RNA de transferencia→ tRNA → RNA polimerasa III : lo que hacen es movilizar a los
aminoacidos dentro del proceso de sintesis.
 RNA ribosomal → Rrna→ RNA polimerasa I: encargados de la sintesis de proteinas que
estan formados por RNA

Entonces como tengo distintos tipos de RNA voy a tener distinto tipo de RNA polimerasa

eucarionte

 RNApol II posee 7 o mas subunidades

 Nucleo estructural y mecanismo de funcionamiento conservado
 A diferencia de los procariontes, requiere de proteinas adicionales o factores de
transcrpcion
 La region -10 Y -35 pasa a llamarse caja TATA al punto de union,(promotor) donde se
unen todos los cofactores con el reclitamiento de los factores de trancripcion va a ser que
se forme y active la RNA polimerasa II e inicie el proceso de transcripcion.
Complejo de pre iniciacion

1. TATA(sitio de reconocimiento e inicio transcripcion) + Prot de unión a caja TATA (TBP) (estas
reconocen la caja TATA)

2. TBP es parte de TFIID; se inserta en el surco menor del ADN y dobla a la molécula en 80° en el
sitio de interacción.

3. Se une TFIIA, TFIIB

4. RNApol II – TFIIF

5. TFIIE

6. TFIIH: posee actividad helicasa y quinasa (fosforila el extremo carboxilo termial de la RNA pol),
esta fosforilacion gatilla el desprendimiento de la RNA polimerasa de todo el complejo que se
encontraba asociado a la caja TATA

 Cuando se libera la RNA polimerasa(Cuando esta fosforilada) esta empieza la elongacion

del RNA

TF: Factor de transcricpión

Estos factores de transcripcion se van uniendo a medida que van siendo necesitados y
principalmente la funcion que cumplen es:

 Reconocimiento de la caja TATA

 Llegada RNApolimerasa, son los responsables de llevar a la RNA polimerasa al lugar donde
se inserta en la caja TATA que es el lugar de inicio y posteriormente una vez que
reconocen cual es el sitio de inicio de la transcripcion, liberar la RNA polimerasa para que
es esta siga con la sintesis

TFIID, da paso a que se inserten IIF,IIE,IIH y RNA polIA

Activacion de la elongacion
La region carboxilo terminal de la RNApol II (CTD), posee repeticiones de un heptapeptido( 7
aa),susceptibles a ser fosforiladas.

El aumento en las P,desacopla a la polimerasa del promotor e inicia la sintesis del RNA.

Procesamiento del pre-mRNA

1)CAP en 5’(caperuza): La aCTD recluta a las enzimas de capping que une al extremi 5’ una
guanosina metilada (es una marca)

 Previene la digestion del mRNA (estabilidad)

 Favorece transporte del Mrna al citoplasma
 Participa en el inicio de la traduccion
2)cola Poli A: la polimerasa A agrega 200 nucleotidos aprox(donde solo hay adenina), sin requerir
de un molde. Protege de la degradacion (no requiere un molde)

Splicing: remocion de intrones

Debe cortarse la cadena de RNA en los extremos 3’ y 5’ de cada intron, y los exones situados a
cada lado del intron deben unirse

-exusten secuencias que identifican la union intron-exon, llamados sitios de splicing

intrones: no codificantes, material genetico donde no hay

informacion

splicing

-secuencias especificas en la union intron-exon dan cuenta

del splicing

-complejos formados por RNA y proteinas realizan el

splicing

-los exones son unidos para formar RNA maduro

-Los intrones son eliminados mediante una estructura de lazo

(empalme y corte o union y corte)

Intrones se encuentra sequiador por secuencias especificas, estas son reconocidas por un sistemas
de proteinas y forman lo que se conoce como splicisoma permitiendo la remosion de los intrones
y solo queden presentes los exones
Secuencia de intron sale por un ataqu nucleofilico al extremo terminal por la adenina 3’, lo que
genera el corte de la secuencia, oh libre genera una ataque al extremo 5’lo cual genera la
liberacion de la secuencia amarilla

Enzima que particpan en el corte

El pre mRNA forma un complejo con diversas ribonucleoproteinas nucleares pequeñas (snRNP)

Este complejo se denomina espliceosoma

U1 reconoce justo a U2 dan lugar a una estructura de bucle. Luego se unen los factores U4, U6 y
U5 con lo que se produce la ruptura y transferencia

Este complejo lo protege de la degradacion

El espliceosma se desensambla liberando el producto ligado y el intron en forma de bucle (Lazo),

con este lazo hacen el corte en 5´ proporcionando el OH libre , el cual es utilizado para romper el
extremo 3’ y porsteriormente entre U3 Y U5 unen el extremos 5’ y 3’ del exon y generan el
empalde de estos 2 exones y posteriormente el intron es liberado

Finalmente El intron se degrada en pequeños oligonucleotidos utilizados en la sintesis de un nuevo

RNA

Resumen RNA maduro

1)Tenemos el DNA con intrones y exones

2)el trascrito genera un pre RNA el cual tiene en el extremo 5´ la caperuza y en el extremo 3’ la
cola de poli A

3)splicing, lo que hace es liberar o eliminar los intrones y dejar los exones