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DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA MOLECULAR

Consiste en la generación de moléculas de ARN o RNA, para permitir a nivel


citoplasmático la síntesis de proteínas, conocido también como proceso de
decodificación. Propuesto inicialmente por Francis Crick, 1958.

Recuperado de: http://apuntesbiologiamol.blogspot.com/2014/03/dogma-central-de-la-


biologia-
molecular.html

El producto final es la creación de proteínas y recibe en nombre de síntesis de


proteínas. Éste consiste de tres procesos: replicación, transcripción y
traducción. La replicación ocurre en el núcleo, y consiste en la duplicación
semiconservativa del ADN. La transcripción ocurre en el núcleo. Utiliza el ADN
como modelo para crear una molécula de ARN. EL ARN luego sale del núcleo y
va a un ribosoma en el citoplasma, donde ocurre la traducción. La traducción lee
el código genético en el ARNm y crea una proteína.

1.- Replicación o síntesis del ADN o DNA.

El ADN posee la información necesaria para transmitir los caracteres de una especie de
generación en generación y conseguir la supervivencia de la especie. Por lo tanto, la molécula
de ADN constituye la base química de la herencia. La mayoría de las moléculas de ADN se
encuentran en los cromosomas del núcleo de las células. El número de cromosomas depende
de la especie, así, por ejemplo, las bacteriasposeen un único cromosoma, mientras que las
células humanas poseen 46 (23 de cada progenitor). La información genética en forma de ADN
se organiza estructuralmente dentro del cromosoma arrollándose alrededor de ciertas
proteínas (histonas) constituyendo asociaciones ADN-proteína denominadas nucleosomas
(Figura 1).
Las cadenas de ADN de cada especie difieren en longitud y en la secuencia de las bases
nitrogenadas, de tal manera que esta secuencia contiene la información genética
característica de cada especie. La información genética debe reproducirse exactamente cada
vez que la célula se divide. El proceso por el que las moléculasde ADN se copian a si mismas
en el núcleo de las células recibe el nombre de replicación del ADN. La replicación pretende a
partir de una cadena de ADNobtener dos iguales.

Figura 1.
Organización estructural del
ADN en el cromosoma.
1.1. Principales características de la replicación

Las características principales del proceso son: su carácter semiconservador, la realización


simultanea en ambas hebras, de forma secuencial y con carácter bidireccional y origen
monfocal (procariotas) o multifocal (eucariotas).

Semiconservador. Es decir cada hebra sirve como molde para la síntesis de una nueva cadena,
produciendo dos nuevas moléculas de ADN, cada una con una de lashebras viejas y una nueva
hebra hija. Esta hipótesis fue propuesta pro Watson and Crick poco después de la publicación
del modelo de la doble hélice, y fue probado definitivamente por los ingeniosos experimentos
diseñados por Meselson and Stahl en 1957.

Solo caben tres posibles hipóteisis para explicar el mecanismo de la repiclación: conservadora
(las dos hebras se copiaran para dar una nueva molécula, de forma que el ADN progenitor
permanece intacto y el ADN hijo tendría dos hebras nueva), dispersante (el ADN progenitor se
rompería antes de que se sintetizaran los nuevos fragmentos de ADN, estos luego se unirían
a los fragmentos originales para dar ADNhijos con fragmentos tanto nuevos como de las dos
hebras del progenitor) y semiconservadora (Las dos nuevas moléculas de ADN formadas
tienen cada una una hebra vieja y una hebra nueva).

Meselson and Stahl cultivaron células de E.coli en medio con N15 (isótopo pesadode N14)
durante muchas generaciones, hasta que todo el ADN de E. coli estuviera marcado con N15.
El ADN aislado de estas células tenía una densidad un 1% mayor que el ADN normal con N14.
Esta pequeña diferencia puede apreciarse en una centrifugación en gradiente de densidad
CsCl.

Las células de E. coli cultivadas con N15 se transfierieron a medio fresco con N14, y se dejaron
crecer durante el tiempo suficiente para que la población se duplicara. El ADN aislado de estas
células formaba una sola banda en la centrifugación engradiente. Esto eliminaba al hipótesis
de la replicación conservadora. Si las células de E. coli se dejaban en el medio fresco con N14
durante dos generaciones se observaban en la centrifugacion en gradiente dos bandas.
Una con la densidad
correspondiente al ADN ligero y otra con la densidad del ADN mixto obtenido en la primera
generación. Esto descartaba también la hipótesis dispersante y confirmabala replicación
semiconservativa como la única hipótesis posible.

Bidireccional. La separación de las hebras progenitoras que comienza en cada origen de


replicación progresa en ambas direcciones. Los puntos de transición entre la doble hebra y las
hebras sencillas se llaman horquillas de replicación y van alejándose entre si. Estos datos se
obtuvieron utilizando el marcaje isotópico delADN con Titrio H3. El ADN marcado, aislado y
expuesto a una emulsión fotográfica durante semanas podía fotografiarse. Si el titrio se añadia
durante un corto período de tiempo y la reacción se paraba observando los autoradiogramas
podía observarse que el ADN marcada aparecía a ambos lados de la horquilla de replicación.

El inicio de la replicación en procariotas es monofocal, comienza siempre en un punto


determinado del cromosoma circular denominado origen (ORI). La replicación progresa
formando dos horquillas de replicación. Por el contrario en eucariotas la replicación es
multifocal, pues en cada cromosoma existen múltiples orígenes de replicación (cientos o
miles) que dan lugar a un número doble de horquillas de replicación. Esto permite completar
la replicación de los cromosomas en un tiempo razonable. Esto puede visualizarse mediante
microscopia electrónica. Vemos comola replicación de un cromosoma circular se inicia un
punto en concreto y es simultanea (las dos hebras se replican a la vez).

Semidiscontinuo. Como veremos más adelante la síntesis de la nueva cadena tiene siempre
lugar en el sentido 5`-3`, siendo el grupo 3`OH el punto por el cual el ADNes elongado. Esto
es válido para todas las polimerasas tanto la ADN como las ARN polimerasas. Si las dos hebras
son antiparalelas, como pueden las dos hebras ser sintetizadas de manera continua mientras
progresa la horquilla de replicación. La solución que la célula adopta ante este problema fue
descubierta por Okazaki. Que descubrió que una de las hebras era sintetizada en pequeños
fragmentos llamados fragmentos de okazaki. Por lo tanto una de las hebras es sintetizada de
forma continua, y la otra de forma discontinua. La longitud de los fragmentos de okazaki
puede variar desde unos cientos de nucleótidos hasta unos miles, según el tipo de célula.

1.2. Pasos de la replicación del ADN en eucariotas

La replicación se lleva a cabo gracias a la ADN polimerasa III, esta enzima cataliza la unión de
los desoxinucleótidos trifosfato que son abundantes en el fluido delnúcleo celular. Estos
desoxinucleótidos trifosfato se desplazan hacia la parte desenrollada de la molécula de ADN
y se colocan por complementariedad enfrente de la base que les corresponde (A=T; C=G) de
la cadena que actúa como molde, y una vez que están en el sitio adecuado se unen entre si
por acción de la polimerasa
III. La adición de dos unidades nucleótidicas consecutivas tiene lugar mediante la unión del
grupo hidroxilo del carbono 3`de un nucleótido con el grupo fosfato del extremo 5`del
siguiente. El mecanismo por el que se produce esta unión es un ataque nucleofílico del grupo
3`-OH de un nucleótido al 5`-trifosfato del nulceótido adyacente, eliminándose el pirofosfato
y formándose un enlace fosfodiéster. Lapolimerasa lee la hebra que hace de molde en el
sentido 3` 5` y sintetiza la nueva hebra en el sentido 5` 3`. Esta enzima necesita para iniciar
la síntesis un pequeño fragmento de nucleótidos que denominamos cebador. En la síntesis
del cebador interviene un tipo de ARN polimerasa denominado primasa.

Durante el proceso de replicación, una de las cadenas madre se lee “bien” (en sentido 3` 5`)
y, por lo tanto, la nueva cadena se sintetiza de corrido (hebra conductora), pero la otra está
dispuesta en sentido contrario al que la polimerasa puede leer (hebra retardada). La solución
a este problema es sintetizar la cadena en pequeños fragmentos en el sentido 5` 3`. Los
cebadores son luego eliminados por la acción exonucleasa de la ADN polimerasa tipo I y los
nuevos fragmentos resultantes son unidos por la acción de la ligasa, que elimina las mellas
que quedan entre fragmentos. La secuencia de pasos implicados la replicación del ADN puede
resumirse como sigue (Figura 2):

- Apertura de la doble hélice del ADN por acción de las helicasas.


- Sintesis de los cebadores para que la ADN polimerasa pueda actuar. Lasenzimas
implicadas denominan primasas.
- Se inicia la polimerización por acción de la ADN polimerasa III
- Cuando se alcanza el cebador del fragmento sintetizado anteriormente laPolimerasa I
sustituye a la Pol III y, haciendo uso simultáneo de sus actividades
exonucleasa (degradadadora de nucleótidos) y polimerasa, va sustituyendo loscebadores por el
ADN correspondiente.
- Las ligasas cierran las mellas que hay entre cada dos fragmentos.

Figura 2.
Visión general del proceso dereplicación
del ADN.

2.- Transcripción o síntesis del ARN o RNA.


La transcripción consiste en la síntesis de ARN tomando como molde ADN y significa el paso
de la información contenida en el ADN hacia el ARN. La transferencia de la información del
ADN hacia el ARN se realiza siguiendo las reglas de complementaridad de las bases
nitrogenadas y es semejante al proceso de transcripción de textos, motivo por el que ha
recibido este nombre. El ARN producto de la transcripción recibe el nombre de transcrito.
La transcripción es la primera parte del dogma central de la biología molecular: ADN →
ARN. Es la transferencia de instrucciones genéticas en el ADN al ARN mensajero (ARNm).
Durante la transcripción, se crea una hebra de ARNm que es complementaria a la hebra
de ADN.
Pasos de la transcripción
La transcripción ocurre en tres pasos: iniciación, elongación, y terminación.

1. Iniciación: es el inicio de la transcripción. Ocurre cuando al enzima ARN polimerasa


se une a una región de un gen llamada promotor. Esto le indica al ADN que se
desenrolle para que la enzima pueda "leer" las bases en una de las hebras de ADN.
La enzima está ahora lista para crear una hebra de ARNm con una base
complementaria de bases.

2. Elongación: es la adición de nucleótidos a la hebra de ARNm. La ARN polimerasa lee


la hebra desenrollada de ADN y construye la molécula de ARNm, usando pares de
bases complementarias. Hay un breve momento durante este proceso en que la
nueva molécula de ARN está unida al ADN desenrollado. Durante este proceso, una
adenina (A) en el ADN se une a un uracilo (U) en el ARN.

3. Terminación: es el término de la transcripción, y ocurre cuando la ARN polimerasa


cruza una secuencia de terminación en el gen. La hebra de ARNm está completa y
se separa del ADN.
Procesamiento del ARNm
En las células eucariotas, el nuevo ARNm no está aún listo para la traducción. Debe pasar
por procesamiento adicional antes de salir del núcleo. Esto puede incluir división, edición y
poliadenilación. Estos procesos modifican el ARNm en varias formas. Tales modificaciones
permiten que se use un solo gen para crear más de una proteína.

• La división elimina intrones del ARNm. Los intrones son regiones que no codifican
proteínas. El ARNm restante consiste en solo regiones que codifican proteínas, las
que se conocen como exones. Las ribonucleoproteínas son nucleoproteínas que
contienen ARN. Las ribonucleoproteínas nucleares pequeñas están involucradas en
la división pre-ARNm.

• La edición cambia algunos de los nucleótidos en el ARNm. Por ejemplo, la proteína


humana llamada APOB, que ayuda a transportar lípidos en la sangre, tiene dos
formas diferentes a causa de la edición. Una forma es más pequeña que la otra
porque la edición añade una secuencia de terminación prematura en el ARNm.

• La poliadenilación le añade una "cola" al ARNm. La cola consiste en una cadena de


A (bases de adenina). Señala el fin del ARNm, también está involucrada en la
exportación de ARNm desde el núcleo. Además, la cola protege al ARNm de las
enzimas que podrían desarmarla.

Recuperado de: https://www.ck12.org/book/ck-12-conceptos-biolog%C3%ADa/section/4.5/

• La transcripción es la parte del dogma central de la biología molecular en la que


DNA → ARN.

• La transcripción ocurre en el núcleo.

• Durante la transcripción, se crea una copia del ARNm que es complementaria a la


hebra de ADN. En las células eucariotas, el ARNm puede ser modificado antes de
salir den núcleo.
3.- Traducción o síntesis de las cadenas polipeptídicas.
La traducción implica "decodificar" un mensaje del ARN mensajero (ARNm) y utilizar su
información para construir un polipéptido o cadena de aminoácidos. En la mayoría de los
casos, un polipéptido no es más que una proteina (con la diferencia técnica de que algunas
proteínas grandes se conforman de varias cadenas de polipéptidos).

El código genético

En un ARNm, las instrucciones para construir un polipéptido vienen en grupos de tres


nucleótidos llamados codones. A continuación, tenemos algunas características clave de
los codones:

• Hay 616161 codones distintos para aminoácidos


• Tres codones de "alto" indican que el polipéptido ha terminado
• Un codón AUG, es la señal de "inicio" para comenzar la traducción (además especifica el
aminoácido metionina).
Estas relaciones entre los codones del ARNm y los aminoácidos se conoce como el código
genético.

Tabla del código genético. Cada secuencia de tres letras de nucleótidos de ARNm
corresponde a un aminoácido en específico o a un codón de terminación. UGA, UAG y UAA
son codones de terminación. AUG es el codón de metionina además de ser el codón de
inicio.
De los codones a los aminoácidos
En la traducción, los codones de un ARNm se leen en orden (del extremo 5' al extremo 3')
mediante moléculas llamadas ARNs de transferencia o ARNt.
Cada ARNt tiene un anticodón, un conjunto de tres nucleótidos que se une a un codón de
ARNm correspondiente a través del apareamiento de bases. El otro extremo del ARNt lleva
el aminoácido que especifica el codón.

Los ARNt se unen a los ARNm dentro de una estrucutra de proteína y ARN llamanda
ribosoma. A medida que los ARNt entran a los espacios en el ribosoma y se unen a los
codones, sus aminoácidos se unen a la cadena de polipéptidos creciente en una reacción
química. El resultado final es un polipéptido cuya secuencia de aminoácidos refleja la
secuencia de codones en el ARNm.

Recordar la afinidad química entre


las cuatro Bases Nitrogenadas

Recuperado de: https://www.wiki.cch.unam.mx/Tema_II._Gen%C3%A9tica_y_biodiversidad.


Traducción: comienzo, desarrollo y final

Un libro o una película tiene tres partes principales: un comienzo, un desarrollo y un final.
La traducción tiene básicamente las mismas tres partes, pero tienen nombres más
elegantes: iniciación, elongación y terminación.

• Iniciación ("comienzo"): en esta etapa el ribosoma se reune con el ARNm y el primer ARNt
para que pueda comenzar la traducción.
• Elongación ("desarrollo"): en esta etapa los ARNt traen los aminoácidos al ribosoma y estos
se unen para formar una cadena.
• Terminación ("final"): en esta última etapa el polipéptido terminado es liberado para que
vaya y realice su función en la célula.

Iniciación: Para que pueda comenzar la traducción, necesitamos unos cuantos ingredientes
clave; estos son:

• Un ribosoma (que viene en dos subunidades, grande y pequeña)


• Un ARNm con las instrucciones para la proteína que vamos a construir
• Un ARNt "de inicio" que lleva el primer
aminoácido de la proteína, que casi
siempre es metionina (Met)
Durante la iniciación, estas piezas deben
reunirse justo de la forma correcta.
Juntas, forman el complejo de iniciación,
el ensamblaje molecular para comenzar
a fabricar una nueva proteína. Dentro de
tus células (y las células de otros
eucariontes), la iniciación de la
traducción sucede así: primero, el ARNt
que lleva metioina se une a la subunidad
ribosomal pequeña. Juntos, se unen al
extremo 5' del ARNm al reconocer el
casquete de GTP 5' (que se agregó
durante el procesamiento en el núcleo).
Luego, "caminan" sobre el ARNm en la
dirección 3', y se detienen cuando llegan
al codon de inicio (a menudo, pero no
siempre, el primer AUG).

En bacterias, la situación es un poco


distinta. Aquí, la subunidad ribosomal
pequeña no comienza en el extremo 5'
del ARNm y viaja hacia el extremo 3'. En
lugar de ello, se une directamente a
ciertas secuencias en el ARNm.
Elongación

Etapa del desarrollo de la traducción,


cuyo nombre es: la elongación que se da
cuando la cadena de polipétidos aumenta
su longitud.
Pero, ¿cómo crece realmente la cadena?
Examinemos la primera ronda de
elongación, una vez que se ha formado el
complejo de iniciación, pero antes de que
se hubieran unido aminoácidos para
formar una cadena.
Nuestro primer ARNt, que lleva
metionina, comienza en el espacio del
centro del ribosoma, el llamado sitio P.
Junto a él, está expuesto un nuevo codón,
en otro hueco llamado sitio A. El sitio A
será el "lugar de aterrizaje" para el
siguiente ARNt, cuyo condón es la pareja
perfecta (es complementario) del codón
expuesto.

Una vez que el ARNt correspondiente se ha colocado en el sitio A,


es hora de la acción: es decir, la formación del enlace petídico que
conecta un aminoácido con otro. Este paso transfiere la metionina
del primer ARNt al aminoácido en el segundo ARNt en el sitio A.
Terminación
rápidamente) en otra ronda de

Los polipéptidos, como todas las cosas traducción.

buenas, deben llegar a su fin. La


traducción finaliza en un proceso
Imágenes recuperadas de:
conocido como terminación. La
https://es.khanacademy.org/science/biology
terminación sucede cuando un codón de
/gene-expression-central-
alto en el ARNm (UAA, UAG, o AGA) entra
dogma/translation-polypeptides/a/the-
en el sitio A.
stages-of-translation
Proteínas llamadas factores de liberación
reconocen los codones de terminación y
caben perfectamente en elsitio P (aunque
no sean ARNt). Los factores de liberación
interfieren con la enzima que
normalmente forma los enlaces
peptídicos: hacen que agregue una
molécula de agua al último aminoácido de
la cadena. Esta reacción separa la cadena
del ARNt, y la proteína que se acaba de
formar se libera.

Luego, afortunadamente el "equipo" de la


traducción es reutilizable. Después de
que se separan las subunidades Recuperado de:
https://es.slideshare.net/clauditaaranguiz/d
ribosomales grande y pequeña una de la ogma-central-24740556
otra y del ARNm, cada elemento puede
participar (y generalmente lo hace
Autoras: Paulette Blanc España.

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