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• La estructura primaria de
esta enzima consta de 245
aminoácidos.
• La estructura cuaternaria
de consta de tres cadenas
polipeptídicas: a, b y c.
• Los enlaces disulfuro unen
las cadenas a,b y c entre sí.
• Los aminoácidos del Sitio
Activo son tres: His, Asp y
Ser.
• De 245 aminoácidos totales,
solamente los grupos R de
tres de ellos conforman el
sitio activo de esta enzima.
Modelo espacial de la Quimotripsina
• La enzima tiene un
aspecto globular,
dado por el
plegamiento de las
subunidades a,b y
c.
• El S.A se muestra
en naranja.
• Esta enzima tiene
un solo S.A.
• Las enzimas
pueden tener un
S.A por subunidad.
Modelo del esqueleto polipeptídico en forma de
cinta
• Los grupos
funcionales que
componen el S.A
Lámina plegada están en rojo, y los
puentes disulfuro
en amarillo.
• Puede observarse
en detalle las
superestructuras
secundarias en alfa
hélice y lámina
plegada.
- hélice
Un acercamiento al sitio activo
• En detalle pueden
verse los grupos
funcionales dela
enzima que toman
contacto con el
sustrato de la
reacción
• En la siguiente
animación se ve un
modelo de enzima
en acción.
CLASIFICACION INTERNACIONAL DE ENZIMAS
Existen 6 categorías:
1- Oxidoreductasas:
2-Transferasas
3- Hidrolasas
4- Liasas
5- Isomerasas
6- Ligasas
Nomenclatura
La nomenclatura internacional reconoce a las enzimas mediante
4 números. Por ejemplo:
Anhidrasa carbónica es la enzima 4.2.1.1
Cinética de saturación: curva experimental.
La tangente de la
curva en este punto
es la V0
• Normalmente hay más
sustrato que enzima en los
sistemas de reacción,lo
que explica el “efecto de
saturación” observado en
la curva de M.Menten.
• Ni siquiera una alta
concentración de sustrato
influirá en la Vmax de la
reacción.
• Este tipo de curvas se
conocen como Cinética
Michaeliana.
Ecuación de Michaelis Menten
• Este es el algoritmo de
la curva experimental.
• La V0 es la velocidad
instantánea, o
aceleración a tiempo
cero según la cantidad de
enzima.
• La Km es una constante
para cada enzima con un
determinado sustrato, en
condiciones de pH y tºC
fijas.
¿Qué pasa cuando la V0 es 1/2 de la
Vmax?
• Veamos qué ocurre con la ecuación de M.Menten
en este caso.
• Si V0 es 1/2 de la Vmax, entonces:
• Km + [S] = 2 [S]
• [S]= 99 Km
• Las reacciones enzimáticas generalmente no operan a su
Vmax
La Km es una constante para cada tipo de
sustrato
• Gráficamente puede
verse que la mitad de la
Vmax se alcanza con una
determinada
concentración de
V inicial (V0)
Moles/tiempo sustrato, cuyo valor es
el de la Km.
E1
• La Km no cambia para
distintas
E2
concentraciones de
E3 enzima,lo que
evidencia una elevada
aceleración del
Km Sustrato (moles)
proceso.
Variación de la velocidad en función de la
concentración de la enzima
• La tangente de cada
una de las curvas
Producto representa la
velocidad inicial para
cada concentración
E1
de enzima.
• La condición para
E2 obtener esta gráfica,
es que la enzima esté
E3 saturada por el
sustrato.
• A mayor cantidad de
enzima para un
tiempo mismo t,la variación
de velocidad es
mayor.
Valores de Km de algunas enzimas
• El valor deKm
depende del
sustrato, como
puede verse
por ejemplo
para la enzima
hexoquinasa.
Otra forma de representar la cinética
enzimática. Ecuación de Linneweaver-Burke
¿Qué factores afectan la actividad de una
enzima?
• La gráfica muestra la
respuesta de una enzima
digestiva en respuesta al
pH.
• La Pepsina es una hidrolas
de proteínas ( proteasa), y
su acción ocurre fuera de
las células que la
producen ( es una enzima
extracelular).
Otro caso de respuesta de la actividad
enzimática frente al pH
• Esta enzima es una
esterasa ( hidroliza
enlaces éster).
• La reacción que cataliza es
la siguiente:
• Glucosa-6-P + H2O
• Glucosa + fosfato
Glucosa 6-fosfatasa
Los inhibidores competitivos de las enzimas, son
estructuralmente semejantes a los sustratos
Inhibición competitiva
Los inhibidores no competitivos de las enzimas,
no se parecen estructuralmente a los sustratos
Inhibición no competitiva
Representación gráfica de la acción de inhibidores reversibles
competitivos y no competitivos