MODELOS DE

PROCESAMIENTO
BIOQUÍMICO

Ludis Morales Alvarez, Ph. D.

Parte 1
Todo lo que existe en el universo está formado
por materia y energía

una de las formas en las que se

manifiesta la materia en este
universo es LA VIDA

Aunque toda la materia está formada por

moléculas inanimadas, la materia viviente
difiere notablemente de la materia no viva
La esencia de un organismo viviente reside en el
hecho de que selecciona elementos particulares
de su entorno y los introduce a su entidad por
cierto tiempo, organizándolos en patrones
característicos. Es, por tanto, esta “actividad” de
organización selectiva la que distingue a la vida.
(Young, 1971)
 Un ser vivo es un sistema que continuamente está
intercambiando materia y energía con el medio
circundante, manteniéndose en un estado más o menos
constante de equilibrio dinámico -llamado metastable o
estacionario - por lo que, desde el punto de vista de un
termodinámico, se trata de un sistema abierto.
(Bertalanffy, 1968)

El Universo

Entorno

Materia + Energía
Energía
Sistema Sistema
cerrado abierto

Sistema
Frontera
Desde un punto de vista físico, los seres
vivos son sistemas heterogéneos en
composición química y con reacciones
químicas y físicas complejas, con fronteras
dinámicas (membranas), diatérmicos y
abiertos, esto es, en constante intercambio
de masa y energía con el exterior.
TODOS LOS ORGANISMOS ESTAN FORMADOS POR LOS
MISMOS TIPOS DE SUSTANCIAS, MAS O MENOS EN
IDENTICAS PROPORCIONES, QUE REALIZAN LOS
MISMOS TIPOS DE FUNCIONES GENERALES

 Compuestos biológicos: Predominio elementos

naturales: C,H,O,N,P,S.
 Carbono más abundante: 2 tipos de organismos vivos:
o Fotosintéticos:
CO2-----> Glucosa ------> aa, etc.
o Heterótrofos: Glucosa

Fuente de energía: TRABAJO

TRANSFORMACIONES BIOQUÍMICAS

CONJUNTO DE REACCIONES
QUÍMICAS QUE TIENEN
LUGAR DENTRO DE LOS
ORGANISMOS

VIAS METABÓLICAS
 Reacciones químicas celulares Vs moléculas en
reacciones no enzimáticas.
 Enlaces químicos: Mecanismos comunes.
 En células vivas: reacciones catalizadas ::: altas
velocidades.
 Repertorio: limitado.

MODELOS DE REACCIÓN BIOQUÍMICA:

CONSTANTE
BIOLÓGICA UNIVERSAL
M 1. ACTIVACIÓN y ADAPTACIÓN
Monosacáridos, Ácidos grasos, aminoácidos

2. OXIDACIÓN BIOLÓGICA
O
3. TRANSFERENCIA DE GRUPOS FOSFORILO

•Desde sustratos de alta energía

D •Mediante reacciones oxidativas acopladas
•Mediante reacciones acopladas no oxidativas

E •Por reordenamiento intramolecular

M 4. ISOMERIZACIÓN
Funcional, Epimerización, Racemización, etc.

5. RUPTURA Y FORMACIÓN DE ENLACES C-C

O •Aldolización
•Transaldolización
•Transcetolización
D •Tiólisis

6. FORMACIÓN Y REMOCIÓN DE DOBLES ENLACES

EN FORMA NO OXIDATIVA
E
M 7. TRANSFERENCIA DE UNIDADES DE CARBONO
•Con alto estado de oxidación

•Con bajo estado de oxidación

O
8. FIJACION Y TRANSFERENCIA DE NITRÓGENO

D •Formación de amidas

•Formación de carbamoil-fosfato

E
 1.
ACTIVACIÓN Y
ADAPTACIÓN
 MONOSACÁRIDOS
 Especificidad de sustratos:
Fosfotransferasa
 Agente activador: ATP

Glucosa + ATP Glucosa-6-P + ADP

Hexoquinasa
 =O

=O
-C- H C- H

-
H- C - OH H- C - OH
-

-
HO- C - + ATP HO- C - +
Hexoquinasa
-

-
H ADP
-

H- C -

-
H- C -
OH P -O-
-

OH

-
H- C - O
H- C - -
-

H- C -

-O
-
H
OH OH
H-HIDROLISIS
C- DE UN ENLACE DE ALTA ENERGIA:
OH PRODUCTOS ACTIVOS Vs SUSTRATOS INICIALES
H EXCEPCION
ES
ACIDOS GRASOS

 Reutilización,
Degradación
 Agente activador: HS-CoA
 Enzima sintetasa: ATP
 Modelo general:

=O
R- C - OH + HS-CoA+ ATPisa
Acido graso
=O AcilCoA sintetasa

R- C - SCoA + AMP + PPi + H2O

Acil CoA

Ej.: Araquidónico + HS-CoA + ATP

Araquidonil CoA sintetasa

AraquidonilCoA + AMP + PPi + H2O

ADAPTACIÓN DE AMINOÁCIDOS

 Separación grupo -NH2

 Esqueleto hidrocarbonado
 Transaminación
 Desaminación oxidativa
 Desaminación no oxidativa
 TRANSAMINACIÓN

Modelo General:

Sustrato dador Enzima-Piridoxal Producto aminado

Enzima-Piridoxamina
Producto deaminado Sustrato aceptor
(base Schiff)

Ej.:
Acido aspártico Enzima-Piridoxal Glutamato

Oxalacetato Enzima-Piridoxamina -
cetoglutarato
 +
NH3 O

=
-
R - CH- COO - + R’ - C - COO-

Aminoácido A  – cetoácido B
Transaminas
a
O NH3+
=

-
R - C - COO- + R’ - CH- COO-
 – cetoácido A Aminoácido B
 COO-

-
COO- C=O
-

-
+ H3N -C-H
-
+ (CH2)2

-
COO-
CH3
L-Alanina -cetoglutarato
COO-
COO-

-
+H N -C-H
3
-

C=O +

-
(CH2)2
-

CH3

-
COO-
Piruvat L-
o glutamat
o
 DESAMINACIÓN OXIDATIVA

L-Glutamato + NAD(P)+

Glutamato DH

- cetoglutarato + NAD(P)H + NH3

 DESAMINACION NO OXIDATIVA

COO- H2 O COO-
+ H3N- C- H +H N
3 C

=
CH2- - CH2
COO- O H , H

OH C= O
H C-H + NH4+
H
 2.
MODELO DE
OXIDACIÓN
BIOLÓGICA
  G Vs E:
 Go = -nFEo
 Eo = E red. - E ox.

Reductor + Oxidante ----------> Reductor + Oxidante

Oxidado reducido

Fe+2 + Cu+2 ----------> Fe+3 + Cu+1

 Para que un compuesto
pueda oxidar a otro, es
necesario que su potencial
redox sea más positivo o
menos negativo.
 NAD+ / NADH + H+  -0.320 V

FAD / FADH2  -0.219 V

Piruvato / Lactato  -0.185 V

Oxalacetato / Malato  -0.166 V

Ubiquinona / Ubiquinol  -0.100 V

O2 / H2O  +0.82 V

NADH FAD Lactato Oxalacetato Ubiquinol O2

NAD+ FADH2 Piruvato Malato Ubiquinona H2O

NAD+ (Nicotinamida adenina dinucleótido) NADP+

(Nicotinamida adenina dinucleótido fosfato)
FAD (Flavina adenina
dinucleótido) FMN (Flavina
mononucleótido) Ácido lipoico.
 ESTRATEGIA BÁSICA DE OXIDACIÓN
BIOLÓGICA
H H H
Deshidrogenasa

-
R - C - C- R’ R - C = C- R’
β α

-
H
H H FAD FADH2

Hidratasa H 2O

H H H
Deshidrogenasa
-

R - C - C- R’

-
-
R - C - C- R’
=
-

O NAD+ HOH
NAD H + H+
H
R’: Grupo funcional
 Reacciones de oxidoreducción:
Oxidoreductasas….transferencia
de electrones:
 Hidrogenación
 Deshidrogenación
 Oxidantes biológicos: coenzimas
de oxidación::: NAD+, NADP+,
FAD, FMN, Ácido lipóico.
¡Gracias!

Continuaremos con los Modelos

en la Parte 2