Tema 2.

Biología Molecular
2.4 PROTEÍNAS
Idea fundamental: Las proteínas tienen una amplia variedad de funciones en los
organismos.

Definición: grupo de moléculas orgánicas más abundantes que destacan por su

multifuncionalidad en los organismos vivos. Están formados por átomos de C, H, O & N
(a veces P y S)

Concepto: Polímeros denominados polipéptidos à constituidos por la unión de moléculas

denominadas aminoácidos (monómeros)

Junto con los ácidos nucleicos, son portadores de información genética à el

ordenamiento de sus monómeros (Aa) son instrucciones heredadas de nuestros
antecesores.

Las proteínas ejecutan las órdenes dadas por los ácidos nucleicos.

Importancia biológica: Radican exclusivamente por su multifuncionalidad.

AMINOÁCIDOS

Amino à grupo amino à H2N

Ácidos à grupo ácido/carboxilo à -COOH

Definición: Unidades básicas (monómeros) que se unen entre si mediante condensación

para formar polipéptidos. Se obtienen, por tanto, por la reacción inversa: hidrólisis de
polipéptidos o proteínas.

Aminoácidos (monómeros) à condensación à polipéptidos

Aminoácidos ß hidrólisis ß polipéptidos o proteínas

(⭐Recuerda)
§ CONDENSACIÓN = anabolismo à unión de monómeros para creas polímeros à
liberación de de H2O
§ HIDRÓLISIS = catabolismo à rotura de enlaces à creación de monómeros a partir
de polímeros à requiere el H2O para realizar

Sólo hay 20 Aa que forman proteínas y se llaman aminoácidos proteicos. Diez de ellos
son esenciales à hay que incluirlos en la dieta al no poder sintetizarlos

1
 Todos los Aa tienen en común:
1) NH2 y COOH (grupo amino y grupo
carboxílico que están unidos
covalentemente a un átomo de C alfa)
2) Átomo de H
3) Cadena lateral à R à diferencia una
Aa de otro

CLASIFICACIÓN DE LOS AMINOÁCIDOS

Hay 20 aminoácidos diferentes en los polipéptidos sintetizados en los ribosomas. Estos,

se diferencian en sus cadenas laterales R.

Diferentes propiedades químicas en diferentes R (grupos funcionales)

En función de la polaridad de dichas cadenas al interaccionar en medio acuoso, los Aa

se clasifican en 3 grupos:

§ APOLARES
§ POLARES SIN CARGA
§ POLARES CON CARGA (ácidos o bases)

1) Apolares (9)1
Cadena R posee grupos hidrofóbicos que interaccionan con otros grupos hidrófobos à
mediante fuerzas de Van der Waals.

Tipos:

a. Alifáticos (6)
R es de dicha naturaleza
b. Aromáticos (3)
R contiene anillos aromáticos

2) Polares sin carga (6)

Cadena R posee grupos polares capaces de formar enlaces de H con otros grupos
polares.

1
(#número) es para indicar cuántos Aa son de este tipo

2
 3) Polares con carga (5)
Cadena R posee grupos polares cargados. Pueden establecer enlaces electrostáticos
entre grupos de distinta carga. Pueden ser ácidos cuando presentan un grupo carboxilo
en la cadena R. O pueden ser básicos cuando presentan algún tipo de grupo amino en su
cadena R

à ácidos (-COOH) à carga (+)

à básicos (H2N) à carga (-)

Algunas proteínas pueden contener aminoácidos que no pertenecen a estos 20

aminoácidos básicos. En general, se debe a una modificación que sufre uno de los 20 Aa
básicos, una vez que se ha sintetizado un polipéptido.

Ejemplo: Colágeno à proteína estructural que aporta fuerza de tensión en los tendones,
ligamentos, piel o vasos sanguíneos

El colágeno presenta algunos Aa de prolina modificados en forma de hidroxiprolina à

aporta más estabilidad a la molécula

BÚSQUEDA DE PATRONES, TENDENCIAS Y DISCREPANCIAS

La mayoría de los organismos (no todos) construyen las proteínas a partir de los mismos
20 Aa.

Posibilidad: Esta tendencia se debe al azar à ha propuesto varías hipótesis para

explicarlo

Dichos 20 Aa fueron los primeros en haber sido producidos mediante procesos químicos
en la tierra antes del origen de la vida à los organismos los han continuado usando
desde entonces

Son los 20 Aa ideales para fabricar un amplio rango de proteínas, por lo que la selección
natural siempre favorecerá a los organismos que los utilicen.

3
Todos los organismos han evolucionado de una misma especie ancestral que usaba
estos mismos 20 Aa à dada la forma en la que los polipéptidos son fabricados en los
ribosomas, es difícil para cualquier organismo, cambiar su repertorio de Aa.

Una discrepancia à lo constituyen algunas especies que usan uno de los UGA para
fabricar un Aa extra denominado selenocistenina (UAG) para pirrolosona.

FORMACIÓN DE ENLACE PEPTÍDICO

Se establece entre el grupo COOH y NH2 de 2 Aa diferentes à reacción de condensación

à donde se pierde una molécula de H2O formando un enlace peptídico.

4
PÉPTIDOS, POLIPÉPTIDOS Y PROTEÍNAS
Formación de Péptidos à unión de ellos = polipéptidos à más de 100 Aa à proteína

REACCIÓN DE CONDENSACIÓN

POLIPÉPTIDO:

Un dipéptido es la unión de 2 Aa mediante la formación de un enlace peptídico. (se libera

una molécula de H2O para realizar esa reacción de condensación)

La unión sucesiva de varios Aa crea un polipéptido. En los enlaces peptídicos, los grupos
funcionales R no participan y quedan fuera de la unión entre Aa.

5
Péptido à la cadena contiene menos de 20 Aa
Polipéptido à cadena contiene más de 20 Aa
Proteína à polipéptido con más de 100 Aa
⭐ Una proteína puede consistir en un único polipéptido o en varios polipéptidos unidos
entre sí.

Ejemplo

proteína resumen Número de Estructura

polipéptidos tridimensional
Lisosoma Enzima que dirige el 1 Terciaria
peptidoglicano de la
pared celular
bacteriana
Integrina Proteína integrada 2 Terciaria
en la membrana
celular para la
señalización celular
Colágeno Proteína estructural 3 Terciaria
que aporta sostén
anticuerpos Proteínas 4 Cuaternaria
producidas por los
linfocitos B en
respuesta a
antígenos

NIVELES DE ORGANIZACIÓN ESTRUCTURAL DE LAS PROTEÍNAS

Cada proteína posee una estructura o conformación tridimensional única que le confiere
una actividad biológica específica.

La secuencia de aminoácidos determina la conformación tridimensional de una proteína.

Se pueden describir 4 niveles distintos de complejidad creciente en la confirmación

tridimensional de una proteína, Cada uno se construyen a partir del anterior.

Estructura primaria à secuencia encadenada de aminoácidos

Estructura secundaria à formada por el plegamiento de la estructura primaria
Estructura terciaria à cuando se pliega sobre sí misma la secundaria
Estructura cuaternaria à cuando varias cadenas se asocian entre sí

6
ESTRUCTURA PRIMARIA
Es la disposición lineal de los Aa unidos mediante enlaces peptídicos. Es distinta para
cada proteína y se llama secuencia de Aa: número, tipo y orden en la cadena
polipeptídica.

Como el Aa de un extremo tiene un grupo amino libre y el Aa del otro extremo un grupo
carboxilo libre, los Aa se enumeran desde su extremo amino inicial hasta el extremo
carboxilo terminal.

Los Aa se pueden unir entre sí en cualquier secuencia, lo que proporciona una variedad
enorme de posibles polipéptidos.

20n à n=número de Aa de la cadena à para un polipéptido de n aminoácidos,

existen 20n posibles secuencias.

La secuencia de Aa en la cadena polipeptídica está determinada por los genes (la

información codificada y almacenada en el ADN de los cromosomas en el núcleo via
ARNm). No todo el ADN codifica a Aa à la secuencia de bases que codifica para un
polipéptido se denomina marco abierto de lectura: ORF

EN CONCLUSIÓN:
La estructura primaria (secuencia de Aa) es la conexión entre el mensaje genético
contenido en el ADN y la configuración tridimensional que perfila la función biológica de
la proteína a través del código genético.

ESTRUCTURA SECUNDARIA
Las cadenas polipeptídicas se pliegan en estado natural a medida que se sintetizan en los
ribosomas hasta adoptas espontáneamente la configuración espacial más estable para el
medio en el que se encuentra, adquiriendo la forma tridimensional más cómoda.

La sucesión de placas planas de la estructura primaria queda estabilizada cuando adopta

3 conformaciones secundarias espaciales posibles:

I) Alfa Hélice
II) Lámina Beta
III) Hélice de Colágeno

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 Alfa Hélice
Construcción à Una región contínua de la
cadena polipeptídica es la
principal y forma parte del interior.
à Semejante a un cilindro
(espiral).
à Las cadenas laterales R se
colocan hacia el exterior
Estructura Queda estabilizada por enlaces
química de hidrógeno INTRACATENARIOS
entre los grupos -NH y -CO de la
cadena principal.
El sentido de plegamiento de una
hélice puede ser en sentido de
giro agujas del reloj o el contrario.
Lámina Beta
à Regiones distintas del polipéptido pueden unir
de forma paralela o antiparalela.
à La estructura no es plana, sino que presenta un
ligero plegamiento según si los enlaces peptídicos
de las distintas cadenas avanzan en el mismo o
distinto sentido.
Quedan estabilizadas mediante enlaces de
hidrógeno INTERCATENARIOS entre los grupos -
NH y -CO de los enlaces peptídicos enfrentados
que mantienen las cadenas unidas.
Las cadenas laterales R se colocan por encima o
por debajo de los planos en zig-zag de la lámina
plegada.
8
 Las a hélice naturales son en
sentido de giro agujas del reloj.

SE encuentran en muchas
proteínas como la miosina

ESTRUCTURA TERCIARIA

La conformación espacial definitiva que adoptan las diferentes regiones de la cadena

polipeptídica (cada uno con su correspondiente estructura secundaria) como
consecuencia de las interacciones entre las cadenas R.

La estructura terciaria confiere a una proteína à su actividad biológica

El resultado es diferente según se trate de

à proteínas globulares, en las cuales la estructura secundaria se pliega sobre sí misma
hasta formar una proteína compacta y soluble en agua
à proteínas fibrosas que son alargadas, muy resistentes e insolubles en agua

I) Proteínas Globulares

Niveles de estructuración: 1º, 2º y 3º à cada nivel contiene a los anteriores y

es contenido por los superiores (disposición jerárquicamente)

Las proteínas globulares son funcionales à e.g. amilasa e insulina

Lo habitual es que tengan ambas conformaciones: a hélice y lámina B

Son proteínas solubles en agua à el plegamiento se hace de modo que

1) los Aa con cadenas R apolares se dispongan hacia el interior de la
estrucutra, protegidos del agua.
2) Los Aa con cadenas R polares se localicen en la superficie, formando
enlaces con el agua.

Los enlaces o fuerzas que estabilizan su estructura terciaria

a) Puentes disulfuro (enlace covalente S-S)

Se establecen entre 2 regiones de la cadena peptídica en las que se
encuentran 2 grupos tiol (-SH) correspondiente al Aa cisteína.

b) Enlaces electrostáticos entre grupos -COO- y -NH3+ de Aa ácidos y

básicos

c) Enlaces de H entre las cadenas laterales R de los Aa polares sin carga

9
 d) Enlaces hidrofóbicos y fuerzas de Van der Walls entre las cadenas R de los
Aa apolares.

e) Tendencia de la molécula completa a curvarse en los puntos de

inestabilidad para adoptar una estructura tal que los grupos polares se
coloquen hacia el agua (hacia fuera) mientras que los R apolares puedan
mantener en el interior de la macromolécula, en un ambiente sin agua. Si el
ambiente es apolar, la disposición es al revés.

¿Cómo se plegará el polipéptido al colocarse en agua?

1. Grupos polares en el exterior
2. Grupos apolares en el interior
3. Cargas positivas y negativas próximas
4. Puentes disulfuros

II) Proteínas Fibrosas

Tienen función estructural.

Las cadenas laterales R apenas influyen à estructura terciaria muy simple à

suelen haber pocos grupos polares

La estructura fundamental de las proteínas fibrosas es la estructura secundaria

(a hélice, lámina B o hélice de colágeno)

Ejemplo: queratina à una proteína fibrosa cuya estructura terciaria es un nuevo

enrollamiento hasta formar una superhélice (hélice que contiene a otra)

GLOBULARES VS FIBROSAS

CARACTERÍSTICA GLOBULAR FIBROSA

Morfología Esférica Filamentosa

Solubilidad Solubles Insolubles

Variaciones de pH,
temperatura, Alta sensibilidad Baja sensibilidad
concentración, salina, etc

Catálisis, transporte,
Función Estructural
hormonal

Insulina, Inmunoglobina, Actina, queratina,

Ejemplo
hemoglobina, amilasa colágeno, fibrina

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ESTRUCTURA CUATERNARIA

Sólo se manifiesta en proteínas fibrosas o globulares formadas por la asociación de más

de una cadena polipeptídica nombradas subunidades proteicas.

Las fuerzas que estabilizan dicha estructura son de la misma índole que las que
estabilizan la estructura terciara (interacciones hidrofóbicas, puentes H, fuerzas Van der
Waals, fuerzas electrostáticos y puentes S-S). En este caso, se establece entre à
cadenas R de los Aa pertenecientes a distintas cadenas o subunidades.

Tienen estructura cuaternaria la hemoglofobina y los anticuerpos.

RESUMEN DE NIVELES ESTRUCTURALES DE PROTEÍNAS

Primaria à secuencia de aminoácidos, enlaces peptídicos

Secundaria à repetición de secuencias, enlaces entre H à a hélix o lámina B
Terciaria à plegamiento de una proteína, interacciones de grupos R, cuerpo hidrofóbico
Cuaternaria à complejo de proteína, hecho por 2 o más subunidades

PROPIEDADES DE PROTEÍNAS: DESNATURALIZACIÓN

Desnaturalización proteica à permanente à no recuperan la forma original

Proteínas solubles se vuelven insolubles y precipitan debido a la exposición hacia el
exterior de los Aa con grupos R hidrofóbicos que se encontraban hacia el interior de la
proteína.

La proteína en estado activo (cuando está en su estructura terciaria) tiene una actividad
biológica funcional. Cuando se le aplica alta calor o valores de pH extremos, se
desnaturaliza y pierde su función.

1) El calor
Provoca un aumento de vibración en las moléculas à se rompen los enlaces o
interacciones intermoleculares

(La mayoría de proteínas se desnaturalizan a temperaturas inferiores también)

2) Valores de pH extremos
Sean ácidos o básicos, también provocan la desnaturalización de las proteínas à
cambios en los grupos R con carga eléctrica à altera las interacciones
electrostáticas entre ellos

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 Al igual con el calor, la proteína pierde su conformación tridimensional, y por tanto
su actividad biológica dependiendo de su pH óptimo.

FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS

Los organismos vivos sintetizan muchas proteínas diferentes con un amplio rango de
funciones.

1. Hormonal
2. Estructural
3. Catálisis enzimática
4. Homeostática: tamponante y osmótica
5. Nutrición y reserva
6. Transporte y almacenamiento
7. Movimiento y contracción
8. Defensa
9. Reconocimiento celular
10. Adhesión celular
11. Regulación expresión genética
12. Generación de impulsos nerviosos

1) Hormonal
Algunas hormonas son muy importantes de la naturaleza proteica (insulina,
glucagón, somatotropina, etc.)

2) Estructural
Las proteínas se consideran los elementos plásticos a partir de los cuales se
construyen la mayoría de las estructuras celulares. (colágeno aporta fuerza tensora
en tendones, histonas empaquetan ADN, queratina que aporta fuerza, elastina,
etc.)

3) Catálisis enzimática
Todos los enzimas son proteínas à biocatalizadores de las reacciones químicas
que dormán el metabolismo celular (amilasa o catalasa)

4) Homeostática: tamponante y osmótica

Las proteínas pueden aceptar o desprender H+ à tampones intracelulares.
También intervienen en el mantenimiento del equilibrio osmótico. (albúmina)

5) Nutrición y reserva
Algunas proteínas como la ovoalbúmina de la clara de huevo o la caseína de la
leche constituyen una reserva de aminoácidos dispuestos para ser utilizados
durante el desarrollo como elementos nutritivos y como unidades estructurales.

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6) Transporte y almacenamiento
Muchas moléculas e iones son transportados por el organismo mediante proteína.
(hemoglobina à O2 en sangre, seroalbúmina à transporta y almacena ácidos
grasos, fármacos y tóxicos en la sangre, etc)

7) Movimiento y contracción
El movimiento y la locomoción en los organismos uni y pluricelulares depende de
proteínas contráctiles (actina y miosina)

8) Defensa
Algunas proteínas desempeñan funciones de protección. Los anticuerpos son
proteínas que controlan a los posibles antígenos que pueden penetrar en el
organismo. La trombina y el fibrinógeno intervienen en la formación de coágulos
durante hemorragia.

9) Reconocimiento celular
Glucoproteínas situadas en la cara externa de las membranas celulares à antenas
que determinan otras células, hormonas, bacterias y virus

10) Adhesión celular

Muchas proteínas de membrana están implicadas en la unión de las células en los
tejidos

11) Regulación expresión genética

Algunas proteínas intervienen en los procesos de activación e inactivación de la
expresión génica à participan en la diferenciación celular

12) Generación de impulsos nerviosos

Las respuestas de las células nerviosas a los estímulos específicos vienen
mediadas por receptores proteicos, como la rodopsina del ojo a la luz, o los
receptores de los neurotransmisores.

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14