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Regulación de la expresión génica

composición del ADN

Dogma del flujo de información en los seres vivos es de ADN a proteína.

También puede ser de RNA a DNA y poder hacer el flujo al inverso con una retro transcriptasa. Esto lo hacen los
virus, los virus entran a las células y hacen que su genoma sea procesado, multiplicado y luego las proteínas
incluso ensamblado en el interior de la célula.

Niveles de control de la expresión génica

1. Pretranscripcion  empaquetamiento del ADN, mientras esta empaquetado no tiene acceso los
promotores y toda la maquinaria que tiene que ver con la replicación y transcripción del ADN.
2. Transcripcion
3. Procesamiento del transcrito primario del ARN
4. Transporte desde el núcleo al citoplasma del mensajero
5. Traducción del mensajero
6. Degradación de lo que queda del mensajero
7. Modificaciones postraduccionales

Control pretranscripcional
Regulación transcripcional

Control de la expresión

Elementos CIS: se encuentran en el interior, serian una


secuencia reconocible como la caja TATA en el lugar.

TRANS: factores transcripcionales que unidos a la


secuencia blanco desempeñan un papel fundamental
en el control de la transcripción. (gatillan una cascada
de proteínas que inician la transcripción).

Control transcripcional de procariontes

Los genes relacionados con el metabolismo de los


procariontes están en tanden, una misma via metabólica
que necesita degradar un disacárido tiene un gen
primero de una enzima, otra enzima, otra enzima.

Tiene un promotor, operon LAC es un represor en


presencia de lactosa esta ocupa un espacio en el
represor y de esta forma tiene acceso la polimerasa al
promotor y ahí empieza a secretarse las enzimas que
necesita para degradar el polisacárido, por ejemplo.

Control transcripcional de eucariontes

La regulación en eucariontes es más compleja:

-Los factores transcripcionales actúan a distancia y otros en el lugar del sitio de inicio de la transcripción para
que la polimerasa pueda actuar.
.
-La ARN polimerasa eucariótica (ARN polimerasa II) proteínas reguladoras denominadas factores generales de la
transcripción que se ensamblan de manera coordinada y secuencial en el promotor de los genes y que son
necesarias para la acción de la ARN polimerasa II.
Enhancer: favorecen la unión de
los complejos proteicos del
promotor.
Silenciador: inhiben la
transcripción

Factores generales de la transcripcion

El ensamblaje se inicia con la unión del factor


transcripcional TFIID a la secuencia TATA en el
promotor (formada por dos proteínas diferentes:
TBP (TATA binding protein) y TAF (TBP associated
factor).

En conjunto van a favorecer que la ARN polimerasa


continue con la polimerización.
Bajo ciertas condiciones un gen se puede expresar y en otros no, esto lo podemos estudiar. Cuando se silencia
un gen o cuando se estimula.

Se puede medir la transcripción de los distintos genes con las distintas técnicas que hemos visto, nos permiten
medir el movimiento o cambio de la transcripción.

Factores transcripcionales inducibles

Son grupo de factores transcripcionales que pueden actuar como activadores, si estimulan la transcripción de los
genes, o como represores, si la inhiben.
Estructura de los factores transcripcionales

Se pueden observar 4:

A. hélice-vuelta-hélice. (interactúa directamente con


ADN)
B. hélice-asa-hélice.
C. dedos de cinc.
D. zipper de leucinas. (“cierre”, va por encima del
ADN)

Activación de los factores de transcripción

-Transcripción: se sintetiza sólo cuando se necesita y


se degrada rápidamente.
- Unión ligando-receptor: Un factor requiere de la
unión de un ligando para activarse.
- Fosforilación: consiste en la adición de un grupo
fosfato por una cinasa en aminoácidos
predeterminados, generalmente serina o treonina del
factor transcripcional.
-Formación de complejos: acoplamiento de varias
proteínas da como resultado un factor transcripcional
activo con capacidad de migrar al núcleo y unirse al
ADN. (unido a la proteina no puede entrar)
- Liberación del inhibidor. El factor transcripcional se
encuentra inactivado por un inhibidor. Cuando éste
es fosforilado sufre un cambio conformacional que
libera el factor transcripcional y permite su traslado al
núcleo y su unión al ADN.

Al tener acceso a los promotores los complejos


proteicos van a las zonas de consenso como la caja
tata ahí se une a las proteínas y empieza a reclutar las
otras para formar el complejo con la ARN polimerasa
y empieza la transcripción.
Regulación mediante potenciadores (Enhancer)

A. Seguimiento, viene el promotor se une a la caja TATA, ahí empiezan a unirse las proteínas y empieza la
polimerización.
B. Enlace, está el potenciador y se unen la cadena, se desplazan y se unen las distintas proteínas y empieza
la polimerización.
C. Reubicación, se corre para promover la unión de la polimerasa
D. Bucle, el otro que esta rio arriba, donde se puede plegar con las proteínas.

Mecanismos por los cuales puede ser regulada la expresión de un gen

*si tuviese la cola de poli A pudiese seguir expresándose infinitamente, llegandose a convertir en una enfermedad

*existen los miARN, que son pequeños ARN

*riboenzimas, arns que tienen funciones catalíticas, por ejemplo cortan una hembra de ARN.
*RNA no codificante de 20 a 24 nucleótidos
que funcionan como guías para llevar a cabo
el silenciamiento génico. (silenciar algunos
genes)

*funcionan como ARN de interferencia

*de alguna manera están moderando la


transcripción.

*gen MIR se transcribe en un Pri-miARN, la


horquilla con patitas es cortada por la proteina
DROSHA, se convierte en Pre-miARN, este
sale del núcleo hacia el citoplasma y se une
con la proteína DICER forma un complejo
(dúplex) del pequeño miARN y con la
ARGONAUTA se separan y corta el
mensajero y se degrada, así se evita que el
mensajero sea traducido.

*puede reconocer por complementariedad

Función de miARNs en diversas enfermedades humanas

*si la secuencia de estos miARN de alguna manera muta puede llevar a que una proteína se sobre exprese, por ejemplo un
oncogen si se hecha a perder ese miARN le va a dar cáncer a la persona.

*sirven para terapia genica, para tratamiento y pronostico en algunas enfermedades

Obtener el RNA:
*es el paso principal de los estudios de ARN.
*No debe estar contaminado con ADN porque va a competir con el RNA dando un resultado erróneo.
*Se debe purificar, lavar y cuantificar.
Cuantificación de la expresion genica
Nortem blot

Micro rray
RT-PCR

Enzimas que usan:

-AMV (avian mieloblastosis virus) Tóptima 42 ºC

-MMLV (Moloney murine leukemia virus) Tóptima 37 º C

- primero tenemos el mensajero, después usamos


partidores (oligo dt, random primers, secuencia
especifica) luego la polimerasa la toma y empieza a
construir la copia desde el ARN y ese es el cdna (adn
copia) cuando ya esta listo empieza el pcr con los
partidores convencionales.

-Como se puede saber si la expresion del gen es por que no esta o por que yo me equivoque en purificar el
ADN?
R. se puede verificar con el gen housekeeping (gen constitutivo), con el gen de mantención como la beta actina,
en esta caso de esta enzima.
Se hace una para el gen x y otra para el gen constitutivo. Poner al menos 2 o 3 controles para cuantificar

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