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miRNA
2. DESCUBRIMIENTO
En 1928, Wingard
Recuperación de plantas
con virus de la mancha
anular del tabaco (TRSV)
La reincorporación del
virus no produjo
modificación en las hojas
2. DESCUBRIMIENTO
Silenciamiento Formación de
postranscripcional heterocromatina
Silenciamiento
transcripcional
Proliferación
celular
Virus
Defensa
Hongos
de
Insectos
actividad
Bacterias
4. MECANISMO MOLECULAR DEL
RNAi
Proteinas comunes
Argonauta DICER
Endonucleasa Enzima endoribonucleasa clase
Contiene 4 dominios: III
terminal-N, PAZ. Medio y Pose diversos dominios, pero
Piwi-terminal-C los mas importantes son los
dominios PAZ, helicasa
y ARNasa
4.1 MECANISMO MOLECULAR:
siRNA
siRNA miRNA
Antes de entrar al DICER Ingresa dsRNA con un Ingresa con una estructura de
contenido de 30-100 horquilla un pre-miRNA que
nucleotidos contiene de 70-100
nucleotidos
Estructura 21-23 nucleotidos de RNA 19-25 nucleotidos con RNA en
duplex duplex
Complementaridad Completamente Parcialmente complementario
complementario al mRNA al mRNA, normalmente
apuntando a la zona 3' del
mRNA
Objetivo del mRNA Uno Multiples
Mecanismo de regulación de Corte endonucleolitico del .Represión translacional
genes mRNA .Degradción del mRNA
.Corte endonucleolitico del
mRNA(solo cuando hay alta
compatibilidad)
5. SÍNTESIS DE dsRNA in vitro: siRNA
5. SÍNTESIS DE dsRNA in vitro: siRNA
Numata et al (2014)
5. SÍNTESIS DE dsRNA in vitro: siRNA
T
7
T
7
Gen
5. SÍNTESIS DE dsRNA in vitro: siRNA
RNA polimerasa T7 ssRNA
Producto de la PCR
RNA polimerasa T7
ssRNA
RNA polimerasa T7
95 °C
5 minutos
5´ 3´
Kit T7 RiboMax 3´ 5´
dsRNA
5.1 ESTRATEGIAS: siRNA
Cadena relativamente
Selección de la cadena inestable
Lam et al (2015)
5.1 ESTRATEGIAS: siRNA
<9 C
CC C GG G C C C C C C CC C G C
CC C C C GG GG GG G G G
<9 G
≈ 30 –50 %
Eficiencia
Lam et al (2015)
5.1 ESTRATEGIAS: siRNA
Lam et al (2015)
5.1 ESTRATEGIAS: siRNA
DICE
R
Evitar:
siRNA
GUCCUUCAA
UGUGU
21-23 nt
UGU
30 nt UGGC
Lam et al (2015)
6. RNAi PARA EL CONTROL DE PLAGAS EN PLANTAS
DC
ARNi derivados del ARN
Detección del ARN viral L
bicatenario viral
Realiza el silenciamiento
siARN
DEFENS ARNdc
DICE miARN
RISC
R
A
RESISTENCIA
ARN BICATENARIO MEDIADO POR ARNi
HAUSTORI
O
INSECTOS:
C. Vías de aplicación
A. Selección del blanco C1. Métodos usados en
laboratorio: Aplicación
tópica e inyectada
aplicación oral mediante
dietas artificiales y
método de la gota.
B. Producción de moléculas
desencadenantes
C2. Estrategias de
liberación en campo
C2A. Aplicación de
moléculas desencadenantes
formuladas.
C2C. Uso de plantas C2B. Aplicación a través
hospederas transgénicas de vectores (bacterias y
virus)