Regulación de la expresión

génica parte I

SÍNTESIS CONCEPTUAL 4 DE BC 2021

 Eucariota
Característica Procariota
DNA Desnudo Cromatina

Promotor Cajas y zona operadora Solo cajas

Cistrón Policistrones Monocistrones

una sola, con 5 3 RNA polimerasas CON 11-15

RNA polimerasa SUBUNIDADES.
subunidades distintas

Estabilización El RNA recién transcrito, 7-metil-guanosina o CAP, secuencia poli A.

no tiene.
RNA pol, necesita la presencia de
Comienzo RNA pol, se autoacopla
proteínas de iniciación, que se unan antes
al promotor
que ella al ADN.
Intrones No tiene Tiene y se eliminan mediante splicing
(corte y empalme).
Lugar de acción Inmediatamente, al ser
creado En el citoplasma (transporte).
Visión global de los procesos de expresión génica en
Eucariotas
Clase de ARN Función

Síntesis de proteínas
mARN Mensajero. Codifica proteínas
tARN Transferencia. Transfiere aminoácidos al ribosoma
durante la síntesis proteica
rARN Ribosomal. Forma parte de la estructura de los ribosomas y
catalizan la síntesis de proteínas
Procesamiento de otros ARNs
snARNs ‘Small nuclear’ (pequeños* nucleares), catalizan las
reacciones del splicing del mARN.
snoARNs ‘Small nucleolar’ (pequeños* nucleolares).Procesan y
modifican químicamente al rARN

*pequeños: Menos de 200 nucleotidos

Clase de ARN Función

Con funciones reguladoras de la expresión génica

miARN MicroARNs (~20nt). Regulan negativamente la traducción y
estabilidad de los mARNs.
piARNs ARNs asociados a proteínas Piwi (~28nt). Participan del
silenciamiento de transposones.
lncARN ‘Long non-coding’ (largos no codificantes). Regulan la
expresión génica. Participan, entre otros procesos, en la
inactivación del cromosoma X y en el imprinting.
Otros
SRP-ARN ARN de la ‘Signal recognition particle’ (Partícula de
reconocimiento de la señal), participa del proceso de
localización de proteínas.
TERC ‘Telomerase RNA component’. Componente de ARN de
la telomerasa
 Terminología e importancia de la
orientación de la ARN polimerasa

ADN
La transcripción en eucariotas: ARN POLIMERASAS

ARN polimerasa Genes que transcribe

ARN polimerasa I • rARN 5.8S, 18 S y 28S

ARN polimerasa II • mARN

• snoARNs
• snARNs (excepto U6 snARN)
• miARNs
• piARNs
• lncARNs
• TERC
ARN polimerasa III • tRNA
• rARN 5S
• U6 snRNA
• SNP-ARN

Cada ARN POLIMERASA tiene varias subunidades

 Proteínas de la maquinaria de
transcripción:
I. Factores basales de transcripción:

II. Factores específicos de la transcripción:

III. Coreguladores: (coactivadores y correpresores)

Tipo especial de coregulador-coactivador:

COMPLEJO PROTEICO MEDIADOR
FACTORES DE TRANSCRIPCIÓN.
Familia de proteínas de unión a ADN (Factores de
transcripción)
Factores transcripción específicos
Niveles de regulación de la expresión génica en
Eucariotas
Contenido del presente seminario
 Desarrollo

-CONTROL PRE-TRANSCRIPCIONAL

-CONTROL DE LA TRANSCRIPCIÓN
Control pretranscripcional

ACCESIBILIDAD DEL ADN A LA MAQUINARIA

DE TRANSCRIPCIÓN
Niveles de condensación de la cromatina
Cromatina y accesibilidad a la transcripción
La maquinaria de transcripción tiene que poder
acceder al DNA para que la transcripción ocurra.

Imposibilidad a la
unión del ADN a
factores de
transcripción
 Cromatina en estado laxo

Expresión de la proteína
de interés en la célula

Expresión del ARNm de la

proteína de interés.
 Cromatina en estado
condensado

Expresión de la proteína
de interés en la célula

Expresión del ARNm de la

proteína de interés.
 Cromatina en estado muy
condensado

Expresión de la proteína
de interés en la célula

Expresión del ARNm de la

proteína de interés.
 Diferencias entre los conceptos:
Epigénesis /Epigenética/Regulación epigenética

Hay tres conceptos que son diferentes (los dos primeros

aplicados a biología del desarrollo):
 Epigénesis (versus preformismo)
 Epigenética según Waddington (Paisaje epigenético)
Aplicado a nivel molecular: (ALCANCE de este
seminario)
 Regulación epigenética: enfoque a nivel
molecular centrado en el remodelado de la
cromatina y otros procesos de expresión
génica sin modificación de la secuencia
nucleotídica con carácter estabilizante y
heredable a las células hijas
 Regulación epigenética de la expresión
génica (ej: remodelación de la cromatina)
 Cambios heredables en la expresión génica que ocurren
sin cambio en la secuencia de ADN

 Complejos multiproteicos-sistemas cooperativos que

permite la activación o inactivación de genes de forma
selectiva y con diferentes grados de estabilización.

 Ejemplos de mecanismo de acción epigenéticos:

 → Metilación de las Citosinas (a nivel ADN)
 → Acetilación, Fosforilación y Metilación (a nivel
histonas)
 Modificaciones en histonas

 Las cadenas laterales de

las histonas sufren
modificaciones.
Modificaciones
postraduccionales:
→Acetilación
→Fosforilación
→Metilación (más estable)
→Otras, ubiquitinación...
Las histonas tienen extremos NH2
 EPIGENOMA: código de terminales que forman
combinación de las colas que sobresalen de los
modificaciones de histonas nucleosomas .
Modificaciones en dichos extremos
remodelan la cromatina y activan o
desactivan la expresión de genes
 Acetilación / Desacetilación
•Correlaciona con la cromatina transcripcionalmente activa en una
amplia variedad de tipos celulares.

•Los activadores y represores transcripcionales están asociados con

acetiltransferasa y deacetilasas de histonas respectivamente.
SON CAMBIOS REVERSIBLES

• Involucrados en la Regulación de la expresión génica eucariota.

 La acetilación neutraliza la carga positiva de los residuos de lisina.
 Los residuos acetilados de lisina actúan como sitio de unión de
muchos factores activadores de la transcripción.
Cuando las histonas estan acetiladas en las colas NH2 terminales quedan sueltas
y se facilita la transcripcion .
Cuando estan desacetiladas las histonas pueden unirse a nucleosomas
adyacentes y se inhibe la transcripcion
 Metilación / Desmetilación
Se creía era un cambio Permanente.
HOY EN DIA NO.
Se conocen desmetilasas de histonas ( Ej LSD1).
. Metilacion de la LIS 9 de la H3 es imprescindible para la
formación de Heterocromatina
Modificaciones de histonas caracterizadas funcionalmente
Complejos Remodeladores de cromatina
 Complejos Remodeladores de cromatina
* Remodelación de la estructura cromatínica
Los factores remodeladores de la cromatina facilitan la unión de los factores
de transcripción al ADN alterando la organización de los nucleosomas.
Factores remodeladores de la
cromatina: alteran los contactos
del DNA con las histonas, inducen
cambios conformacionales de los
nucleosomas, provocan el
deslizamiento de los octámeros
histonas a lo largo del DNA y
recolocación de los nucleosomas.
 Metilación del ADN y
control de la expresión génica: estados hipo/hipermetilados

En células diferenciadas, hay

regiones silenciadas del genoma
están asociadas a la hipermetilación
de las secuencias

En vertebrados, la metilación
ocurre en citosinas dentro de una
secuencia 5´-CG-3’
Metilación del ADN y control de la transcripción:
Estados hipometilados/hipermetilados
 Cuándo una célula diferenciada se divide, las células
hijas heredan su patrón de metilación

En el proceso participan las ‘metiltransferasas de mantenimiento’

Relación entre grado de metilación del
ADN y la inducción a la acetilación de
histonas
Heterocromativa constitutiva vs. Heterocromatina facultativa
Los mecanismos de heterocromatización de la heterocromatina
facultativa y la heterocromatina constitutiva son distintos
Las regiones de heterocromatina La heterocromatina facultativa está
constitutiva están asociadas a regiones asociada a regiones que sí contiene
génicas de secuencias repetidas en genes que se encuentran silenciados
TANDEM dependiendo del tipo celular respondiendo
5’-
a señales del contexto celular y del
AGGACCACCAGGAAGG-3’ ambiente.

Unidades de
repetición

Los procesos y marcas epigenéticas también difieren, si bien comparten

elementos.
Por ejemplo la trimetilación de lisina 9 en histona 3 (H3K9me3) es una marca
típica de heterocromatina constitutiva, mientras que la trimetilación de
lisina 27 en histona 3 (H3K27me3) es usualmente encontrada en regiones de
heterocromatina facultativa
 En resumen:

HAT: histona acetil-transferasa

HDAC: histona desacetilasa
HMT: histona metiltransferasa
SWI/SNF: complejo remodelador de la cromatina (levaduras)
Control de la transcripción

MODULACIÓN DE LA ACTIVIDAD DE LA ARN

POLIMERASA
INICIACIÓN: ensamblado de la
maquinaria modelo escalonado
Relación entre tipos de secuencias y tipos de factores en los casos de genes
de expresión constitutiva y genes de expresión diferencial

Recordar concepto
de factor de
transcripción
especifico

Identificar que
secuencias y factores
están involucrados en el
caso de genes de
expresión diferencial
MECANISMO DE PROT. REGULADORAS.
 Potenciadores-Enhancers

¿Qué principales conclusiones

obtiene comparando los
resultados que muestran las
figuras A-E?
Aisladores y restricción de acción de Enhancers
CONTROL COMBINATORIO.
 Regulación de la
velocidad de
transcripción (iniciación)
RELACIÓN de activador CON COMPLEJOS
DE REMODELACIÓN DE LA CROMATINA
Expresión de factores de transcripción específicos (inducibles)y su
transporte al núcleo también contribuye a la regulación

Dos ejemplos de factores de transcripción

específicos :

 Receptor de Hormonas esteroideas

 Proteínas HOX
Ejemplo factores de transcripción específicos: proteína
receptora de Hormonas esteroideas
Ejemplo de factores de transcripción específicos:
Proteínas Hox
 ELONGACIÓN Y TERMINACIÓN.

 TFIIH fosforila el CTD de la ARNpol II y, junto a su

actividad helicasa, da comienzo a la elongación
(polimerización de ribonucléotidos).
 Liberación del complejo de iniciación.
 Terminación: ARNpol continúa transcribiendo
segmentos de ARN abortivos que son degradados +
liberación del preARNm y de la ARNpol.
 CTD (DOMINIO CARBOXILO TERMINAL DE LA ARN POLIMERASA
II) Y SU RELACION CON PROCESOS DE INICIACION Y ELONGACION

CTD: Está involucrado en diferentes procesos de reclutamiento y regulación de

maquinarias: maquinarias remodeladoras de cromatina; maquinarias de
maduración transcripto primario a ARNm (cortes y empalme; capping y adicion
de poli A)
REGULACIÓN DE LA ELONGACIÓN.

Asociación de RNA pol

a factores reguladores
Negativos: NELF y
DSIF.

Asociación de P-TEFb
a RNA pol II.
P-TEFb fosforila a
NELF y DSIF
y RNA polII
 Aplicación: Tóxicos y ATB

 La Rifampicina inhibe el inicio de transcripción

en procariotas uniéndose a la ARN polimerasa
en la subunidad β, no tiene efecto sobre ARN
polimerasa eucariotas nuclear, pero la ARN
polimerasa mitocondrial es sensible.

 α-Amanitina (tóxico del Hongo Amanita

Phalloides: “el hongo de la muerte”) inhibe a las
ARN polimerasa eucariotas impidiendo la etapa
de elongación
 Conclusiones

• Estado de Cromatinización del ADN: control pretranscripcional que

reduce la accesibilidad a la maquinaria de transcripción

• El control durante la transcripción modula a la ARN polimerasa

• La etapa más compleja de la transcripción es la iniciación (concentra

la mayor parte de la regulación)

• Hay distintos tipos de secuencias y factores intervinientes según la

expresión sea constitutiva o regulada.
 Próximo seminario:

 En eucariotas, las proteínas reguladoras de genes pueden influír sobre

un promotor aún cuando estén unidas a secuencias de ADN distantes a
miles de nucleótidos.

 La RNA polimerasa II requiere del ensamblaje de los factores

generales de transcripción, que a su vez están sujetos a señales
regulatorias

 El empaquetamiento del ADN en la cromatina constituye un factor

regulador importante