ARN y transcripción

Dogma central de la biología molecular Relevancia de la transcripción en la

- La información fluye del DNA al RNA y de este a las
proteínas. La principal excepción al dogma central es
un proceso llamado transcripción inversa, en el cual
la información codificada por cierto virus que
contiene RNA se transcribe a DNA por la acción de la
enzima transcriptasa inversa.
- El RNA es de tipo funcional como rRNA, Trna, SNrna,
miRNA,
etc.
expresión génica
Materia viva: reacciona ante un estímulo, externo o internos
(capacidad metabólica, stress metabólico, etc.)
La reacción es evaluable midiendo la expresión de genes
(decodificación precisa de algunos genes) – Síntesis de
proteínas
La información contenida en el ADN se transcribe en un
polímero lineal de RNA (polimerización por templado) Parte
de los RNA (mRNA) traducen su información en proteína
(polímeros lineales de aa)

- Hay una hebra codificante y una no. Cuando una esta

codificando la otra hebra no codifica. La que va de 5
´a 3´ es la codificante.

El ADN se transcribe a RNA

…..

Tipos de RNA y sus funciones Transcripción

Tipos de RNA Función principal - El ADN provee información para la síntesis de RNA
- Enzima:
mRNA – mensajero -Traducción (síntesis de - RNA polimerasa DNA dependiente, incorpora
proteínas) ribonucleótidos (nt) dentro de una cadena de RNA
rRNA – ribosomal -Traducción (síntesis de (20nt/seg en eucariontes, 40nt/seg en procariontes)
proteínas) (catalítico) - No requiere primer o partidor
-80% del RNA es ribosomal - Carecen de síntesis ocurre en dirección 5´- 3´.
tRNA – transferencia -Molécula que se repliegue - Hay muchos mecanismos redundantes para que la
sobre sí misma, forma de x
secuencia sea redundante, sin embargo, en la
Encargados de agarra los
transcripción no hay estos mecanismos.
aminoácidos y pasárselos al
ribosoma - Apareamiento A-U durante la transcripción.
hnRNA – heterogéneo
molecular - El promotor del gen proporciona el sitio de unión a la
scRNA RNApol.
snRNA – pequeño
citoplasmático - La RNApol se mueve en dirección 3´- 5´
snoRNA – pequeño
nucleolar - La cadena de RNA crece en dirección 5´- 3´
RNAs – regulatorios Regulan la expresión final
(miRNA, siRNA, shRNA, de la proteína - El nt solo se incorporan si es complementario al
lncRNA) molde de ADN
Solo el 5% del RNA es mensajero -Aunque estén en reposo
siempre se esta trascribiendo información
 - A medida que ocurre la transcripción, la doble hebra
de ADN se vuelve a enrollar (se enrolla para un gen
en particular)
- Hay un pequeño tramo donde se forma un hibrido
de RNA-DNA
- Simultáneamente transcriben cientos de RNApol a la
vez
- La secuencia promotora es específica para que se
una ciertas proteínas. Estas proteínas reclutas la
ADNpol para empezar a polimerizar. La secuencia
promotora no se transcriba salvo un pedacito corto
del principio.
Etapas de la transcripción
- Reconociemienot del molde
- Iniciación
- Elongación
- Terminacion
Polimerasas procariontes vs eucariontes
Eucariontes: hay 3, la más importante es la RNA polimerasa II,
tiene 12 partes (una está por atrás)
Procariontes: solo hay una.
Promotor de genes procariontes
- Cuando se empieza la transcripción hay un punto de
partida. Del startpoint hacia atrás (riboarriba) es
todo negativo (hasta -35), del start point es donde se
empieza a transcribir el gen. Desde el startpoint a los
números positios se habla de ribabajo (hasta +10).
- Secuencia TATA muy importante para le
transcripción (hay 2 creo)
Inicio de transcripción en procariontes
Es más fácil desplegarla que un eucarionte
Se una a la secuencia del promotor, se produce un
plegamiento de la -10 a la 1 para que empiece la
transcripción.
Transcripción en eucariontes
Existen 3 polimerasa
1: no es una holoenzima, es mas chica. Transcribe genes
chicos
2: la más importante para la transcripción. Los más grandes
son transcritos mayormente por la pol2.
Como se mide el tamaño del DNA
- Por secuencia de nucleótidos/ numero esto solo nos
dice algo luego transcritos
- Se usa el valor S, velocidad de sedimentación, mide
la masa del RNA, mientras más masas más grandes
son.
Core de la RNA Pol II compuesta por 4 elementos
Síntesis del RNAm por la RNA Pol II
- Promotor posee secuencia de consenso 5´-3’
TATAAA-3´: caja TATA
- Sobre la caja TATA se ensamblan el complejo de pre-
iniciación, formando factores generales de
transcripción (GTF) +RNA pol II
*Caja TATA: secuencia rica en adenina y timina.
Sobre esta se generan un montón de proteínas que
son factores de transcripción actúan para todos los
RNA.
RNA Polimerasas eucariontes
Requieren GTF para unirse al DNA (pre-iniciación)
TFII, TFIIB, TFIID, TFIIF, TFIIH. Requieren
desensamble de cromatina (nucleosomas)
TFII: Transcripción factor para polimerasa II
Complejo de Pre-iniciación
Secuencialmente:
1. TBT (TATA biding protein) se una a la caja TATA (TBT es
parte de TFIIB; se insertan en el surco menos del ADN y dobla
a la molécula en 80° en el sitio de interacción.
2. TFIIB se una al TBT y al DNA a ambos lados de TBT.
3. TFIIA estabiliza el complejo TFIIB-TBT.
4. Complejo TFIIF y RNA pol II se unen al complejo TFIIB-TBT. - Ahora recién se pide exportara para que se forma la
proteína.
5. TFIIF dirige a la pol II hacia los promotores al reducir la
unión de la RNA pol II a sitios inespecíficos del DNA. mRNA en procariontes y eucariontes

6. Se une TFIIE - Se una metilguanosina en 3 pasos

(estabiliza el 1. Fosfato saca el fosfta0
complejo) y TFIIH 2. Guanil mete un grupo guanino donde está el
(actividad helicasa) fosfato
para completar el 3. metilasa metila la guanina
complejo cerrado ¿? Buscar info de esto

7. TFIIH desenrolla el mRNA Pol II es el centro del procesamiento del RNA

DNA cerca del sitio de
- Se van uniendo los factores
inicio creándose el
- Pol II centro de procesamiento entero
complejo abierto.
Fosforila de cola CTD de Modificación de los extremos 5’ de los mRNA
la RNA pol II (dos
partes actúan como -
helicasa y las otras 7
“Splicing” del mRNA – se cortan los intrones
subunidades actúan
como Quinasa, es - Intrón:
decir, son capaces de - Exón:
fosforilar/ agregar grupo fosfato) - Ambos dependen de la necesidad de la célula, es
muy difícil viendo la secuencia determinar si es un
8. Cambio de conformación de la RNA pol II y ocurre el
exón o intrón, ya que dependen de las proteínas y
desalojo del promotor.
sus necesidades.
Activación de la elongación
Spliceosoma – Es el encargado de catalizar el splicing
- La región carboxilo terminal de la RNA pol II (CTD), (proteínas y small nuclear (sn) RNAs) Splicing: corte y
posee repeticiones de un heptapeptido (7 aa), empalme.
susceptibles a ser fosforiladas.
Splicing alternativo – distintos exones pueden comportarse
- El aumento de las -P, desacoplas a la polimerasa del
como exones o intrones
promotor e inicia la síntesis de RNA.

Expresión de genes en procariontes y eucariontes

- Ocurren 3 PSOSO
- Puesta de cap al 5’ (en el núcleo). 3 proteínas
- El splicing (intrones cortados) (en el nucelo9
- Poliadenilacion del extemo 3’, para ´protegerlo y la
ayuda en la secuencia que tiene que ir (en el núcleo)