Paulina Madariaga Caravia

* Formación

↳ la traducción
sintetizados en

en
por una sustitución nucleofílica
los ribosomas mediante la salida

de
agua
.

- ×
PROTEÍNAS
5
' 3)

Amiuoacido - Amiuoacido
enlace peptídico

Paulette Conget, PhD

constituyentes

AMINOÁCIDOS
enlace peptídico: formación
proteínam Y

enlace
peptídico

carbono
µ electrofílica
O
↳ rompe el enlaza -
.

RIBOSOMAS

←
→ proteína se
↳ rompe el
esta hidrolizando

enlace
proteasa
reacción de condensación ↳ rompe
sustitución nucleofílica proteínas
enlace peptídico: hidrólisis no enzimática
↳ ph nacido
requiere un
muy
↳ poco común en

seres vivos

¡prácticamente no ocurre in vivo!

favorecida en medio ácido (HCl 6M)
 enlace peptídico: hidrólisis enzimática → Proteasas →
degradan proteínas
y péptidos
t,
selectivo
t,

proteasas rompiendo

{
enlaces

estómago

* Cada proteasa
corta en un
lugar
preestablecido
estructura
estructura primaria
↳ sólo enlace peptídico

amino-terminal carboxilo terminal

ó ó
N-terminal C-terminal

pentapéptido: serilgliciltirosilalanil-leucina
 X Hélice

estructura secundaria: α hélice µ

→ f plegada
Estructura 20 :

•
enlace peptídico
•
Puentes de Ht

cadenas laterales
protruyen

aa con
cargas opuestas estabilizan
aromáticos
aa con
igual carga desestabilizan
voluminosos
muy “flexibles” (Gly)
dextrogira
puente de hidrógeno intracatenario
estructura secundaria: hoja β plegada

puente de hidrógeno intracatenario e interhojas

aa pequeños (Gly, Ala) estabilizan

estructura terciaria: α hélice + hoja β plegada + giro β

Estructura 3?
•
Puentes disulfuro
•
Enlaces iónicos
•
Interacciones
Hidrofóbicas

todo α todo β
albumina inmunoglobulina

αyβ
fosfofructoquinasa
estructura cuaternaria: multímeros
↳ t de l proteína
sub-unidades α#

β#
regulación
multifuncionalidad
organización tridimensional: fundamentos

8libre rotación enlaces simples

8se define porque ella aumenta la entropía del agua

dado que disminuye capa de solvatación estructurada
en torno a residuos hidrofóbicos

8se adquiere conformación de menor energía

8se mantiene por formación de

puentes disulfuro
puentes de hidrógeno
enlaces iónicos
interacciones hidrofóbicas
libre rotación enlaces simples

grupo peptídico plano ! impedimento estérico

aumento de la entropía del agua (I)

los residuos hidrofóbicos se “sepultan” en el interior de la proteína,

lejos del agua
aumento de la entropía del agua (II)

se forma la mayor cantidad posible de puentes de hidrógeno dentro de proteína

conformación de menor energía

PLEGAMIENTO

Enfermedad de Alzheimer
Enfermedad de Creutzfeld Jacob
plegamiento facilitado

8chaperonas: evitan agregación proteínas no plegadas

8disulfuro isomerasa: cataliza intercambio enlaces disulfuro

8péptido prolil-cis trans isomerasa:

cataliza interconversión cis-trans de enlaces peptídicos con prolina
enlaces intra- e inter-catenarios
peptídico
¡

- Van der
Valls
/
Y
A partir
puentes
hidrógeno
→

de las 3
de

Y
1
iónico
 el
denaturación → factores que afectan plegamiento proteico

agentes denaturantes:
" calor
" pH extremos
" agentes caotrópicos (urea, GdnHCl)
" detergentes (SDS)
" solventes orgánicos (acetona, alcohol)

proceso cooperativo
desplegada ≠ denaturada
 rearmar
renaturación → romper
y
disulfuro
puentes
nomenclatura (I)

respecto del tamaño:

8péptidos: oligopéptidos (2 - 10 amino ácidos)

polipéptidos (10 - 100 amino ácidos)

8proteínas (100 - 30.000 amino ácidos)

(promedio 2.000)

respecto de la cantidad de polipéptidos:

8monoméricas: 1, unido covalentemente

8oligoméricas: 2 o más, unidos no covalentemente

nomenclatura (II)

respecto de la composición:

8sencillas

8conjugadas: grupo prostético (no amino acídico)

nomenclatura (III)

proteína nativa: proteína en su configuración funcional

proteína denaturada: proteína que ha perdido su conformación nativa

por exposición a calor, detegentes, etc.

proteína globular: cadena amino acídica hidrosoluble plegada en forma esférica

proteína fibrilar: cadena amino acídica insolubles dispuestas en hebras u hojas

proteína monomérica: proteína formada por una única cadena amino ácidica

proteína multimérica: proteínas formada por 2 o más cadenas amino acídicas

proteínas globulares

hemo R hidrofílicos

α hélices

R hidrofóbicos

Anemia Falciforme
proteínas fibrilares

Osteogenesis Imperfecta
Síndrome de Marfan
Epidermolisis Bulosa Simple
función

" tampón ej: albumina

" mantención presión oncótica ej: albumina

" estructurales ej: actina, citoqueratina, colágeno

" enzimas ej: DNA pol, transaminasas, GAPDH, HMGCoAreductasa

" señales ej: insulina, FSH, GH, interferon gamma

" receptores ej: EGF-R, IL-3R, acetilcolinaR

" transportadores ej: hemoglobina, GLUT, CFTR

" anticuerpos ej: IgG, IgA

estructura # función

8secuencia amino acídica conservada # función similar

en dominios
entre especies

8distinta secuencia amino acídica # distinta función

8alteraciones en secuencia amino acídica ⇔ disfunción (patología)

 Enfermedades :
Mal
plegamiento proteico → Neuro
degeneración
-
.

Alzheimer mal corte proteolítica

-

Vaca loca →
zoonosis

Hemalopoyelico
↳ Anemia
falciforme
para estudiar las proteínas.........
proteína

http://www.slideshare.net/fpsanidad/proteinograma
proteínas
proteoma
proteoma diferencial
secuenciación (I)
secuenciación (II)
secuenciación química

Sanger

Edman

background
50 residuos
secuenciación por espectrometría de masa

30 residuos
secuenciación deducida
a ejercitar.........
Problema 1
+
Respecto de la siguiente estructura: NH3

COO-
1.1 ¿Qué tipo de prótido es?
R. Es un tetrapéptido.

1.2 ¿Qué residuos lo constituyen?

R. Ala, Glu, Gly, Lys.

1.3 ¿Cuál es su nombre? +

NH3
R. Alanilglutamilglicil-lisina.
COO-
1.4 ¿Cuál es su PM aproximado?
R. 440 g/mol

1.5 ¿Cuál es su carga neta a pH fisiológico?

R. 0
Problema 2
Respecto del siguiente prótido:

1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14
Lys-Thr-Glu-Phe-Arg-Tyr-Gly-Phe-Pro-Ala- Ala-Met-Cys-Ile-
15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28
Trp-Glu-Ala-Gln-Pro-Asp-Gly-Met-Glu-Cys-Ala-Phe-His-Arg

2.1 ¿Qué amino ácido presenta en sus extremos N- y C-terminal?

R. lisina y arginina, respectivamente.

2.2 ¿Dónde se podrán formar enlaces disulfuro intracatenarios?

R. Entre los residuos cisteina 13 y 24.

2.3 Una vez plegado, ¿dónde se localizarán los siguientes residuos:

Lys 1, Thr 2, Ala 10, Ile14, Gln 18, Asp 20? Fundamente
R. Lys1, Gln 18 y Asp 20: en exterior porque son polares y cargados.
Ala 10 e Ile14: en interior porque son alifáticos.
Thr2: en interior o exterior porque su índice hidropático es ≈ 0.
Problema 3
En el siguiente gráfico se muestra como la poli-lisina cambia su conformación
en función del pH del medio en que se encuentra. 6
5

rotación específica
4

0
0 2 4 6 8 10 12 14
pH

Hint: la rotación específica de α hélices y hojas β es mayor que la de glóbulos fundidos#

3.1 ¿Qué estructura secundaria tendrá poli-lisina a pH ácido? Fundamente

R. ninguna. A pH ácido los grupos R (amino) de lisina están protonados.
Por lo tanto, cargados positivamente. La repulsión entre estas cargas
desestabilizarán las estructuras secundarias, denaturando al poli-péptido.
3.2 ¿Qué estructura secundaria tendrá poli-lisina a pH neutro? Fundamente
R. idem anterior.
3.3 ¿Qué estructura secundaria tendrá poli-lisina a pH básico? Fundamente
R. α hélices. Los grupos R de lisina se “sepultaran” al interior.
Problema 4
En la siguiente figura se muestran los proteinogramas de muestras de plasma
de 4 pacientes (identificados por sus iniciales):

RUG IGP CLP JAA

4.1 ¿Qué paciente presenta un proteinograma normal? Fundamente

R. RUG porque la proteína más abundante es albumina.

4.2 ¿Cuál de los proteinogramas sugiere un cuadro de inflamación crónica? Fundamente

R. él de JAA porque las gamma globulinas están aumentadas.

4.3 ¿Qué rasgo del proteinograma de CLP sugiere un síndrome nefrótico? Fundamente
R. la disminución de los niveles de albumina y de gamma globulinas,
que se deben estar filtrando.
de lo discutido en esta clase,
qué me servirá para cuidar la salud de una persona?
por qué?
 PROTEÍNAS

Paulette Conget, PhD