UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO

SEDE GUADALUPE
ESCUELA DE AGRONOMÍA
EXPERIENCIA CURRICULAR: BIOQUÍMICA AGRÍCOLA

SEMANA 1:

• Los enlaces químicos en Bioquímica. El agua en las Rx.

• La Termodinámica y los sistemas biológicos.
• Los sistemas buffers.
Dr. E. MARINO OLIVARES DE LA CRUZ

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 ÁTOMOS Y MOLÉCULAS

• Átomo: Es eléctricamente neutro.

N° de protones (carga +) del núcleo coincide siempre con el N° de e‒ (carga ‒) de
la corteza  se compensan las cargas + con las ‒  carga neta total: nula.
• Iones: Átomos que han ganado o perdido e‒  no son eléctricamente neutros; se
ha descompensado la carga eléctrica total.
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 IONES: CATIONES Y ANIONES

• Catión: Han perdido e‒ con

relación al átomo neutro 
tienen un exceso de carga +.
• Anión: Han ganado e‒ con
relación al átomo neutro 
tienen un exceso de carga ‒.

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 UNIONES QUÍMICAS (ENLACES)
¿Qué son?
Fuerzas que unen los átomos en una molécula  Algunas propiedades de
las sustancias dependerán de la naturaleza del enlace que una sus átomos.
TIPOS:
Intramoleculares: Iónico, Covalente, Metálico.
Intermoleculares: Se producen entre moléculas
1. Enlace Iónico: Fuerzas eléctricas que unen iones + y ‒  dan lugar a
estructuras cristalinas (sólidos cuyos iones se sitúan ordenadamente).
Ej.: NaCl (sal común). El Na ha perdido un e‒,  se forma el catión Na+, y ese
e‒ lo coge el Cl, formándose el anión Cl-.

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2. Enlace Covalente: Los átomos al presentar = tendencia a coger e‒ y
ninguno a cederlos  comparten e‒  se forma el compuesto covalente.
Originan 2 tipos de sustancias covalentes:
• Moleculares: Se presentan en forma de moléculas. Ej.: H2O, CH4, etc.

• Cristalinas: Se presentan en forma de

cristales. pueden estar formadas por;
- Un solo tipo de átomo: Ej. Diamante
y el grafito, formados solo por C.
- Por varios tipos de átomos ≠: Ej.
Cuarzo o sílice (SiO2).
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3. Enlace metálico: Se produce entre los átomos de los metales  son
sólidos a T° ambiente, excepto el mercurio (Hg).
En los metales, los átomos pierden los e‒ más externos (de la última
capa)  se transforman en cationes  se forma una estructura de
cationes ↑ compacta cuyos e‒ perdidos forman una nube, que puede
desplazarse a través de los huecos disponibles entre los cationes.
Ej.: Hierro (Fe), aluminio (Al), estaño (Sn), cobre (Cu), cobalto (Co),
níquel (Ni), plata (Ag), oro (Au), etc.

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 Estructura: Formada por 2
átomos de H y uno de O
unidos por enlaces covalentes
H2 O simples (0.965 Å).

A T° AMBIENTE es LÍQUIDA
Causa: Molécula dipolo.
Los 2 e‒ de los 2 H están desplazados
hacia el átomo de O ═> en la molécula
aparece un polo negativo (donde está
el O) debido a la mayor densidad
electrónica, y 2 polos positivos (donde
están los 2 H) debido a la menor
densidad electrónica.

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  = densidad
O de carga - Es eléctricamente neutra, pero tiene un
exceso de carga (‒) sobre el átomo de O 
la molécula de H2O tiene carácter polar (es
un dipolo)  establecen enlaces (puentes)
de H entre ellas  forman grupos de 3-9
+ moléculas.
+
H Enlace
covalente
+
Enlaces
de -
hidrógeno +

FUNCIONES
1. Medio donde ocurren las Rx del metabolismo.
2. Sistemas de transporte de sustancias  aporte de nutrientes y
= 0.965 A

la eliminación de desechos.
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 TERMODINÁMICA Y LOS SISTEMAS BIOLÓGICOS
TERMODINÁMICA: Estudia;
• La interacción entre el calor y otras
formas de energía.
• El intercambio entre las distintas
formas de energía.
• El flujo de energía en los sistemas:
Los cambios de energía.
SISTEMAS BIOLÓGICOS:
Sitios complejos e intrigantes
de transferencia de energía
• Son 1 de las áreas de aplicación
más importante y significativa de
la Termodinámica.
• No están en equilibrio
termodinámico ═> no son
fáciles de analizar.
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LEYES DE LA TERMODINÁMICA:
1ra ley: Conservación de la energía.
Rigen a las Rx. metabólicas
2da ley: Aumento natural del desorden.

1) Conservación de la energía (1ra ley):

“La energía no se crea ni se destruye, se transforma”
Entalpía (H): Contenido de calor del sistema.
∆H: Variación de entalpía ∆H > 0 Reacción endotérmica (absorbe calor)
Es propiedad de la 1ª ley. ∆H < 0 Reacción exotérmica (libera calor)

los sistemas
vivos absorben
calor del entorno
(endotérmico: ∆H
> 0).

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2) Aumento natural del desorden (2da ley):
Entropía (S): Aleatoriedad o desorden del sistema.

∆S: Variación de entropía.

Propiedad de la 2ª ley. Determina la
espontaneidad de un proceso fisiológico.

∆S > 0 Aumenta S en el sistema

∆S < 0 Disminuye S en el sistema

La muerte implica un aumento de S y

es un proceso irreversible.
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ENERGÍA DE GIBBS (G):
(Antes denominada "energía libre de Gibbs",
"energía libre" o "entalpía libre")
• Cantidad de energía capaz de realizar
trabajo en una reacción a T° y P ctes.
• Energía disponible/útil para
producir trabajo = (Energía
interna de un sistema) –
(Cantidad de energía no útil:
T°S).
G = U – TS + PV
• Función termodinámica más
útil en bioquímica. Indica:
- Espontaneidad/Dirección de
la Rx. química.
G: Única
- Cantidad de trabajo energía que
pueden utilizar
desarrollado. las células vivas
(a P y T° ctes.).
- Composición en el equilibrio.
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Cambio o variación de energía libre (∆G): (Variación de energía libre real)
• Es variable, depende de la naturaleza de los reactantes (expresada por
∆G°) y de sus concentraciones ([R] y [P]), y de la T°.
• Es el concepto unificador de la 1ª y 2ª ley. ∆G = ∆H – T ∆S
• Predice si una reacción es factible o no.
∆G = 0 Proceso en equilibrio
∆G > 0 Reacción endergónica, consume energía ═> no espontánea
∆G < 0 Reacción exergónica, genera energía ═> espontánea

Una reacción termodinámicamente desfavorable puede ser dirigida por una

termodinámicamente favorable acoplada a ella.
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 BIOENERGÉTICA
¿Qué es la Bioenergética?
• Intercambio de energía de los
seres vivos con su
medio/ambiente.
• Cambios de energía en las Rx.
químicas y procesos
físicoquímicos de los seres vivos.
• Cuantificación/descripción de la
transferencia y utilización de la
energía en los sistemas
biológicos.

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 La Bioenergética se sustenta SERES VIVOS:
en los principios de la SISTEMAS ABIERTOS
Termodinámica

Células e individuos son

sistemas abiertos ═>
intercambian materia y energía
con su entorno (medio).
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 ¿ PARA QUÉ SIRVEN LOS SISTEMAS BUFFERS?

pH: Logaritmo decimal del inverso de la [H+],

Regulación expresada en equivalentes gramo/litro (N)
del pH pH = log 1/ [H+] o pH = - log [H+]
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 ¿QUÉ SON LOS SISTEMAS BUFFERS?
• Solución que mantiene el pH cuando se agregan
pequeñas cantidades de ácido o base ═> son soluciones
amortiguadoras, reguladoras o tampón.
• Solución de un ácido débil y su sal, o una base débil y su
sal.
BUFFER ÁCIDO BUFFER BÁSICO
Formado por un ácido Formado por una base
débil y su sal. débil y su sal.
Ej.: Ej.:
✓ CH3COOH/CH3COONa
✓ NH3/NH4Cl
✓ H2CO3/HCO3Na

• Existen dentro de la célula (intracelular) y fuera de ella

(extracelular) en los líquidos circundantes.
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 FUNCIÓN E IMPORTANCIA DE LOS BUFFERS
◼ Mantienen un pH casi constante en los seres vivos ═>
se llevan a cabo las Rx enzimáticas y metabólicas.
◼ Previene cambios rápidos en el pH de una solución al
agregar más ácido o base.

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 SISTEMAS BUFFER DE IMPORTANCIA
✓ BUFFER DE CARBONATOS (H2CO3 / HCO3-):
El más importante en la sangre.
✓ BUFFER DE FOSFATOS (H2PO4- / HPO4-2):
Es el más importante buffer intracelular.
✓ BUFFER DE PROTEINAS (-NH3+/-COO-):
Tanto en sangre como dentro de la célula.
✓ BUFFER AMONIACO-CATIÓN AMONIO (NH3 / NH4+)
✓ BUFFER ÁCIDO CÍTRICO-ANIÓN CITRATO
✓ BUFFER DEL ÁCIDO FOSFÓRICO.
Elección del buffer: Según el valor de pKa (debe ser lo más próximo
al valor de pH requerido).
Si ↑ el pH, las algas proliferan consumiendo nutrientes en desmedro de
las plantas.
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1) BUFFER DE CARBONATOS (H2CO3 / HCO3-):
El más importante en sangre (es el 75 % de la capacidad buffer total de
la sangre), pKa = 6.1. También está presente en el líquido intersticial.

Si el medio se va Si el medio se va
tornando básico tornando ácido
-
OH H+

H2CO3 / HCO3-

H2CO3 ⇋ H+ + HCO3– HCO3- + H+ → H2CO3

H+ + OH- → H2O
CO2 + H2O → H2CO3
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 2) BUFFER FOSFATOS H2PO4-/HPO4-2

OH
- H+

H2PO4- / HPO4-2

H2PO4 - ⇋ HPO4 –2 + H+ HPO4-2 + H+ → H2PO4-

→ H2O
+
-
OH + H +

21 21
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 3) BUFFER PROTEÍNAS: NH3+/COO-

OH
- H+

-NH3+ / -COO-

-NH3+ ⇋ -NH2 + H+ -COO- + H+ → -COOH

H+ + OH- ⇋ H2O

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 Acidosis:
Es una condición caracterizada por un
exceso de acido en los líquidos del
organismo.
En la acidosis :
✓ Hay una ↑ [H+].
✓ El ser vivo tiene tendencia a morir.

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 ECUACIÓN DE HENDERSON - HASSELBACH
• Utilizada frecuentemente para calcular el pH en soluciones buffers.
• Para su deducción se realiza una serie de suposiciones ═> no es
aplicable en todos los casos.
• Si las concentraciones del ácido y su base conjugada (o de la base y su
ácido conjugado) son bajas ═> suele proporcionar resultados incorrectos.

pH = pKa + log [ión] pKa = - log Ka

[ácido]
pKa: Fuerza que tienen las moléculas de
disociarse en solución acuosa. Es ≈ al pH.
pOH = pKb + log [ión] Ka: Constante de disociación ácida.
A ˂ pKa > fuerza del ácido.
[base] A > pKa > fuerza de la base .

pH = 14 - ( pKb + log [ión] ) pKb = - log Kb

[base]
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 CÁLCULO DEL pH: (Ecuación de Henderson – Hasselbach)
1) En solución acuosa cierta cantidad de ácido láctico (un ácido
débil) está a una concentración 10 mM; su sal conjugada
(el lactato) a 2 mM. El pKa del ácido láctico = 3,86. Calcular el pH
del ácido láctico. (La solución no presenta ningún tipo de sistema tampón)

CH3-CHOH-COOH → CH3-CHOH-COO- + H+

pH = 3,86 + log (2 mM / 10mM) = 3,86 - 0,7 = 3,16

Se añade una solución buffer de KHCO3 y una ↑ cantidad de H2O

a la solución de ácido láctico de 10 mM, suficiente para romper el
equilibrio de concentraciones del ácido y su sal conjugada ═> la
[ácido láctico] disminuye a 0,1 mM y la [lactato de potasio]
aumenta a 200 mM. Calcular el pH de la nueva solución:

CH3-CHOH-COOH + KHCO3 → CH3-CHOH-COOK + CO2 + H2O

pH = 3,86 + log (200 mM/ 0,1 mM) = 3,86 + 3,3 = 7,16

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 MUCHAS GRACIAS

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