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TEMA 1: INTRODUCCIÓN A LA BIOLOGÍA MOLECULAR

BIOLOGÍA MOLECULAR: área que está relacionada con otros campos de la biología y la química, particularmente
ingeniería genética y bioquímica.

La biología molecular concierne principalmente al entendimiento de las interacciones de los diferentes sistemas de la
célula, lo que incluye relaciones tales como las que existen entre el ADN y el ARN, la síntesis de proteínas, el metabolismo,
y el cómo todas esas interacciones son reguladas para conseguir un correcto funcionamiento de la célula.

1. PROPIEDADES DISTINTIVAS DE LOS SISTEMAS VIVOS


 Autorreproducción: Su objetivo es transmitir el ADN  Los sistemas vivos están comprometidos en
para perpetuar la especie. transformaciones energéticas.
 Complejos y altamente organizados.  Todos estos mecanismos son realizados por los seres vivos
 Todas las estructuras biológicas desempeñan una función. para garantizar la supervivencia e, instintivamente, los
genes nos llevan a sobrevivir.

1.1 EVOLUCION DE LOS ORGANISMOS VIVOS: La evolución se remonta desde un ancestral procarionte hasta la
actualidad y podemos clasificar a los seres vivos en tres principales reinos: Archaea, Bacteria y Eukarya. Todos los seres
vivos tenemos un mismo origen, conocido gracias al código genético:

Procariotas Eucariotas Unicelulares (Protistas) Eucariotas Multicelulares.

Además, partimos de una atmósfera primitiva reductora (sin O, formada por CO, CH, NH...). Las radiaciones solares
generaron las primeras moléculas orgánicas sencillas y posteriormente más complejas.

El primer modelo de la célula fue la procariota, que debió ser anaerobia (por falta de oxígeno) y heterótrofa, ya que, se
nutría del material orgánico de su entorno. Según se agotaron estos recursos, la presión evolutiva dio lugar a la vida
autótrofa y, estas nuevas células liberaron oxígeno a la atmósfera, iniciando la vida aerobia.

Así surgió la célula eucariota (teoría de la endosimbiosis): una asociación simbiótica progresiva de diferentes procariotas en
una unidad superior. Esta teoría se puede confirmar con ciertos orgánulos (mitocondrias y cloroplastos) que presentan
ribosomas y ADN propios. Estos orgánulos actualmente eucariotas, fueron bacterias ancestrales que se asociaron por
beneficios mutuos.

2. TIPOS DE ORGANIZACIÓN CELULAR


Células procariotas: es el Reino Moneras (bacterias). Son organismos unicelulares de tamaño muy pequeño con una
estructura muy sencilla, sin orgánulos complejos ni citoesqueleto. Se compone de una pared bacteriana, membrana
plasmática, citoplasma nucleoide, ribosomas y vesículas. Su ADN es circular, de doble hélice y sin histonas asociadas,
disperso por todo el citoplasma bacteriano. Se le llamará nucleoide o cromosoma bacteriano (ya que solo posee uno).

Existen dos modelos de bacterias:

 Bacterias Gram negativas: su alto contenido en lípidos  Bacterias Gram positivas: su bajo contenido lipídico,
impide la absorción del colorante de Gram. permite absorber el colorante y se tiñe la pared.

Células eucariotas: son células complejas y existen dos tipos de células eucariotas: vegetal y animal. Las células
vegetales contienen una pared celular que impide el paso del agua y por tanto evita que esta explote. Sin embargo, en las
células animales se da el proceso de osmosis. Fenómeno por el cual, entre dos disoluciones acuosas de diferente
concentración, separadas por una membrana semipermeable (la membrana plasmática de las células animales) que deja
pasar el disolvente, pero no el soluto, se da un trasiego de agua desde la disolución más diluida (hipotónica) a la más
concentrada (hipertónica), hasta que ambas alcanzan la misma concentración (isotónica).

3. ORGANIZACIÓN MOLECULAR: La célula es un conjunto organizado de precursores inorgánicos, intermediarios,


sillares estructurales, macromoléculas y orgánulos celulares. Se distinguen unos niveles de observación de los procesos
vitales, del celular al molecular.

Unidades monoméricas  macromoléculas  sistemas supramoleculares  la célula y sus orgánulos.


La organización molecular de las células
 Precursor del entorno (CO2, H2O, N2, NH3)  Intermediario (Piruvato, citrato, malato)
 Unidades / Sillares estructurales (Nucleótido, aminoácido, enzimáticos, sistemas contráctiles y microtúbulos)
monosacárido y ácido graso)  Orgánulos (mitocondria, núcleo, cloroplasto, aparato de
 Macromoléculas (ac. Nucleicos, proteínas, polisacáridos y Golgi, retículo endoplasmático, etc.)
lípidos).  Célula
 Sistemas supramoleculares (ribosomas, complejos

4. ELEMENTOS QUIMICOS DE LAS MOLECULAS ORGANICAS


4.1 LOS BIOELEMENTOS: La materia viva está formada por bioelementos. La unión de los bioelementos forma
moléculas como el H2O (todos los organismos vivos necesitamos agua (todas las reacciones celulares necesitan agua)

 Elementos primarios: constituyen el 96% del peso de un  Oligoelementos: aparecen en cantidades demasiado
organismo: CHON, carbono, hidrógeno, oxígeno y pequeñas <0,01%, la mayoría son metales porque
nitrógeno. transfieren elementos (comparten e, O, …). Como
oligoelementos más universales podemos citar, Fe, Cu,
 Elementos secundarios: aparecen en el organismo Zn, Mn, I, Ni, Co, Se.
aproximadamente en un 3%, forman las sales minerales.
Na, K, Mg, Ca, Cl, S y P

ESTRUCTURA TRIDIMENSIONAL DE LAS MACROMOLECULAS

A. INTERACCIONES ENTRE ELEMENTOS


 Enlaces iónicos o puente salino: se establece entre elementos cuya electronegatividad es muy diferente: metales y no
metales. El metal pierde electrones y se convierte en un catión (Na+), mientras que el no metal gana electrones y se
convierte en un anión (Cl-). Además, los electrones se transfieren, no se comparten.

 Covalente: Enlace más estable y energético, comparte electrones.


- Polar: Se enlazan átomos de distinta electronegatividad (hidrofílicos)
- Apolar: Se enlazan átomos de misma electronegatividad (hidrofóbicos)

 Enlace metálico: se produce entre átomos metálicos, compartiendo sus


electrones.

 Diferencia de polaridad en los enlaces covalentes e iónicos según la


electronegatividad: es la tendencia de los átomos de atraerse hacia sí, el
par de electrones compartidos.

B. INTERACCIONES ENTRE MOLÉCULAS NO COVALENTES:


 Interacciones hidrofóbicas: enlaces que unen moléculas  Carga-carga: unión entre moléculas que generan cargas
que no interaccionan con el agua (suelen ser anillos)

 Puentes de H: resultan de la atracción electroestática entre  Dipolo-dipolo: unión entre moléculas de cargas parciales
el polo + y el polo - de dos moléculas dipolares integradas (polar, H2O)
por átomos de H. Son enlaces débiles establecidos entre
moléculas próximas.  Dipolo-dipolo inducido: unión entre moléculas que
generan carga y otras de cargas parciales
 Interacciones de Van Der Waals: fuerzas de atracción que
se establecen entre moléculas eléctricamente neutras que
se encuentran muy próximas

Según la fortaleza del enlace: Enlace de hidrógeno > Dipolo-dipolo > Dipolo instantáneo-dipolo inducido.

4.2 LAS BIOMOLÉCULAS: Moléculas que forman parte de la materia prima. Están formadas por bioelementos y se
clasifican en biomoléculas orgánicas e inorgánicas.

 Orgánicas: glúcidos, lípidos, proteínas y ácidos nucleicos.  Inorgánicas: agua y sales minerales.

5. LA MOLÉCULA DE AGUA: El agua es la molécula más abundante de la


materia viva (65-95% del peso corporal). Está constituida por un átomo de oxígeno unido, mediante un enlace covalente
polar, a dos átomos de hidrogeno. La molécula de agua aparece en forma de tetraedro, siendo los hidrógenos dos de sus
vértices. Los pares de electrones del oxígeno que no participan en el enlace se localizan en los otros dos vértices.

Aunque su carga total es neutra, se comporta como un dipolo debido a la mayor electronegatividad del oxígeno. Este
carácter polar permite la creación de puentes de hidrógeno, formando una estructura de tipo reticular.

5.1 LAS PROPIEDADES FÍSICAS DEL AGUA:


El agua puede actuar como:
 Lubricante: facilitando movimientos (mucus, líquido amniótico, líquido cefalorraquídeo).
sinovial).
 Regulador de la temperatura debido a su elevado calor
 Agente protector frente a daños mecánicos (líquido especifico puede absorber gran cantidad de energía sin que
aumente su temperatura.

El agua se caracteriza por:


- Disolvente universal: el agua establece puentes de H con - Elevado calor específico: es capaz de absorber gran
otras sustancias polares (grupos OH, C-H, carboxilos…) y cantidad de calor aumentando muy poco su temperatura.
las disuelve. También disuelve compuestos iónicos, como Actúa como amortiguador térmico evitando los cambios
las sales minerales. Esta característica permite que ocurran bruscos de temperatura en los organismos.
reacciones químicas en su seno y que transporte sustancias
disueltas. - Elevado punto de fusión, de ebullición y calor de
vaporización: para pasar a un estado gaseoso se deben
- Elevada fuerza de cohesión: la estructura reticular que romper los puentes de hidrógeno, por lo tanto, necesita
resulta de la unión mediante puentes de hidrogeno hace mucha energía. Esta propiedad permite a los seres vivos
que el agua sea prácticamente incomprensible. Puede disminuir su temperatura mediante el sudor.
servir como esqueleto hidrostático o permitir la turgencia
en plantas. - Densidad anormal: todos los materiales disminuyen su
volumen al enfriarse. En el caso del agua, este
- Tensión superficial elevada: la gran fuerza de adhesión comportamiento se mantiene alcanzar los 4ºC. A partir de
existente entre las moléculas de agua es responsable de su esta temperatura, el agua deja de contraerse y se dilata.
tensión superficial, actúa como una membrana elástica Consecuentemente, el hielo es menos denso que el agua
tensa. La tensión superficial favorece los cambios y líquida y, por lo tanto, flota. Esta propiedad permite
deformaciones del citoplasma celular. Esta adhesión mantener la vida acuática en las zonas frías.
también provoca efectos de capilaridad (el agua puede
ascender por tubos delgados).

5.2 DISOCIACION DE LA MOLECULA DE AGUA EN SUS DOS ESPECIES IONICAS: HIDRONIO E


HIDROXILO
En el dibujo de la derecha, se puede observar la molécula disociada. Se crea
un dipolo con la carga positiva del hidrogeno y negativa con el oxígeno.
Mediante enlaces covalentes de puentes de hidrógeno, en la naturaleza
podemos ver unidas las diferentes moléculas creando H2O.

La solubilidad depende de la capacidad del solvente para interaccionar con


las moléculas de soluto:

 Moléculas polares: Si esta interacción es más fuerte que la que tienen las moléculas de soluto entre sí, se produce la
disolución.

 Compuestos iónicos: Las sales se disuelven en agua. La interacción de los iones con el agua es más fuerte que la
interacción de unos iones con otros. La atracción entre iones de carga opuesta se debilita por la elevada densidad del agua.

 Las moléculas apolares son insolubles en agua. La presencia de moléculas hidrofóbicas provoca la ordenación de las
moléculas de agua en contacto con ellas (estas ordenaciones se conocen como clatratos).

La interacción entre moléculas apolares es más fuerte (efecto hidrofóbico + Fuerzas de Van der Waals) entre ellas que,
con el agua, no se produce la disolución.

En el agua las moléculas apolares tienden a agruparse, ya que así aumenta la entropía
del sistema (la cantidad de moléculas de agua ordenadas es menor que cuando están
dispersas): es a lo que llamamos efecto hidrofóbico. Una vez agrupadas, las moléculas apolares establecen interacciones
hidrofóbicas entre ellas, se trata de interacciones débiles de tipo van der Waals.

Estando dispersas las moléculas anfipáticas, el número de moléculas de agua ordenadas es grande. Cuando se agrupan las
moléculas anfipáticas disminuye el número de moléculas de agua ordenadas. La formación de micelas y bicapas es un
proceso espontáneo. (1. 39 moléculas de H2O ordenadas; 2. 15 moléculas de H2O ordenadas).

6. EL PH Y TAMPONES: el agua es un electrolito débil, de cada 107 moléculas de agua, solo una se encuentra ionizada.
El pH es una medida de la concentración de protones.

El agua se disocia en: H2O  H3O+ + OH-. Esto explica que la concentración de iones hidronio (H3O+) y de los iones
hidroxilo (OH-) sea muy baja. Dado los bajos niveles de H3O+ y de OH-, si al agua se le añade un ácido o una base, aunque
sea en poca cantidad, estos niveles varían bruscamente. (Se utiliza el símbolo H+, en lugar de H3O+).

El producto [H+] · [OH-]= 10-14, se denomina producto iónico del agua, y constituye la base para establecer la escala de
pH, que mide la acidez o alcalinidad de una disolución acuosa, es decir, su concentración de iones [H+] o [OH-]
respectivamente. Definimos pH como:

pH= -log [H+]; [H+] = nº de moles de H+ por litro de disolución.

 A más protones, más ácido (pH 1); a más OH, más básico  El pH del agua a 25ºC = 7
(pH 14)

Necesitamos tener un pH estable para la funcionalidad enzimática. El pH se mantiene estable con los sistemas
amortiguadores (tampones).

La mayoría de las reacciones metabólicas ocurren a pH neutro (7). Para mantener estas condiciones existen las soluciones
amortiguadoras o tampón. Las soluciones tampón son sistemas acuosos que pretenden regular el pH añadiendo
cantidades importantes de una base o un ácido. Para que la sustancia pueda tamponar, el pH tiene que aproximarse al
pKa. Las más importantes son:

 Tampón Fosfato: tampón biológico intracelular. El  Tampón Bicarbonato: regula el pH de la sangre (tampón
principal regulador del interior de la célula que hace que el sanguíneo), más o menos entre 6,3. Aumentos del pH en
pH sea 7,2. la sangre puede provocar el coma. El pH de la sangre se
regula respirando.

Dependiendo de la enzima se tienen rangos óptimos de pH.

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