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Paula Cerda M.

Lic. Biología 2022


Bioquímica

Resumen Prueba 2

1. Ácidos grasos

Moléculas altamente polares, anfipáticas y con altos puntos de fusión. Pueden ser:

- Saturadas: enlaces simples, más flexibles

Ejemplo:

- Insaturadas: enlaces dobles o triples, menos flexibles.

Ejemplo:

Independiente si es saturado o insaturado, si el ácido graso tiene C par o impar es muy importante ya que:

- Par genera + ATP


- Impar genera - ATP

1.1 Ingreso de grasas a través de la dieta

Vesícula biliar emulsiona grasas gracias a bilis.

Bilis activa enzimas lipasas que liberas ácidos grasos y glicerol.

En intestino, ácidos se asocian a alipoproteínas y atraviesan la barrera intestinal en un kilomicrón.

Kilomicrón va al torrente sanguíneo donde es reconocida por lipoproteína lipasa, allí libera su contenido con
destino a miocitos y adipocitos.

• Lipoproteínas:
Es la asociación de un lípido con una proteína, éstas cumplen la función de facilitar el transporte de
lípidos en medio acuoso como la sangre y son muy importantes en el metabolismo de lípidos.
Ejemplos:
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2. Lípidos

¿Qué son? Son macromoléculas constituidas por ácidos grasos.

¿Función? Reserva energética (si se degrada libera ATP) - triglicéridos

Componen membranas y estructuras - fosfolípidos y esteroles

Funcionales - hormonas y vitaminas.

Tipos:

• Triacilgliceroles / Triglicéridos
Molécula apolar que se compone de 3 moléculas de ácidos grasos unidos cada uno por enlace éster a
una molécula de glicerol. Se conservan en adipocitos y son degradados cuando el organismo lo
requiera. Pueden ser:
- Simples: con el mismo tipo de ácidos grasos.
- Conjugados: distintos tipos de ácidos grasos.

Movilización de triglicéridos almacenados:

1. Señalización celular de epinefrina y


glucagón aumenta (provocada
principalmente por ejercicio aeróbico).

2. Se activa el AMPcíclico que activa a las


proteinquinasas.

3. Proteinquinasas fosforilan a enzimas para


activar triacilglicerolipasas

4. Enzimas triacilglicerolipasas hidrolizan


trigilicéridos liberando ácidos grasos y
glicerol.

5. Ác. Graso pasa al torrente sanguíneo donde


se acopla a un carrier para que la lleve a la
célula muscular que la está requiriendo, y el
glicerol pasa a glucogénesis.
Paula Cerda M.
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• Colesterol
Molécula derivada del esterol que es muy rígida y apolar, es débilmente anfifílico por presencia de OH
lo que le permite interactuar con el agua.
Función: constituye membranas y es precursor de hormonas.

Derivados del Colesterol:


- Testosterona - Vitamina E (antioxidante)
- Estradiol - Vitamina K (desagregación plaquetaria)
- Progesterona

2.1 Lípidos de Membrana


Se dividen en:
FOSFOLÍPIDOS GLICOLÍPIDOS
Glicerofosfolípidos Esfingofina
Esfingolípidos

• Fosfolípidos
- Glicerofosfolípidos:
Se constituyen de un glicerol, 2 ácidos grasos unidos por enlace éster y fosfato.

Ej: fosfatidilserina y fosfatidilcolina.

- Esfingolípidos:
Se constituyen de esfingosina (18 Carbonos), ácido graso y fosfato. Podemos encontrar:
Esfingofosfolípidos esfingomielinas
Esfingoglicolípidos cerebrósidos, globósidos y gangleosidos.

Cuando X es:
Glucosa ---- es cerebrósido
Di/tri/tetra sacárido ---- es globósido
Complejos de sacáridos ---- es gangliósido
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2.2 Movimiento de fosfolípidos de membrana
Mosaico Fluído: este modelo compartamentaliza las células permitiendo y regulando el ingreso de
sustancias. Aquí encontramos:
Glicoproteínas Señalización celular y reconocimiento
Glicolípidos Señalización para abrir y cerrar canales de la membrana.

Los fosfolípidos de membrana tienen movilidad, sus tipos de movimientos son:

- Rotacional
Se mueven los carbonos del lípido
haciendo que gire en torno a su propio eje

- Difusión lateral
Se pierden interacciones hidrofóbicas
entre los carbonos de fosfolípidos
haciendo que muevan de un lugar a otro.

- Flip-flop
Movimiento que requiere mucha energía y
tiempo, donde el fosfolípido se mueve de
arriba abajo y viceversa.

3. Enzimas y su rol metabólico


Las enzimas son moléculas orgánicas que regulan procesos metabólicos. Pueden ser de tipo:
Ribosina porción de ARN
Proteicas porción de proteína

Características principales:
- Específicas: son biocatalizadores por lo que aceleran y desaceleran los procesos metabólicos con
alta eficiencia.
- Reguladoras y reguladas: enzimas pueden ser reguladas por escalas de señalización o por
concentración de metabolitos. Pudiendo también ser inhibidas.

Cofactores y Coenzimas:

Son moléculas que “co-ayudan” a la enzima a tener una actividad eficiente y específica, ayudando a que la
enzima reconozca al sustrato, entregando electrones y más.

- COFACTORES: moléculas inorgánicas (iones metálicos) que son requeridos como catalizadores de
reacciones bioquímicas.
- COENZIMAS: moléculas orgánicas que facilitan la acción enzimática. Actúan como transportadores
de grupos.

Clasificación enzimas según reacción:


1. Oxidoreductasas Oxidan o reducen al sustrato
2. Transferasas Transfieren grupos
3. Hidrolasas Catalizan hidrólisis
4. Liasas Adicionan doble enlace tras la formación/remoción de un grupo
5. Isomerasas Transforman isómero de un compuesto en otro
6. Ligasas Forman enlaces que dependen de energía
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Algunos ejemplos de estas reacciones:

- Fermentación láctica donde por acción de oxidereductasa, en específico una lactatodeshidrogenasa +


NADH transforma un piruvato en lactato.
- Transformación de ADP a ATP gracias a la transferencia de un grupo fosfato por una transferasa.
- Transformación de GAP a DAP gracias a triosafosfatoisomerasa que mueve al fosfato de posición.

3.1 Cambio de Energía libre de Gibbs:


Esta es una medida que determina los cambios de energía libre útil para realizar un trabajo de
reacción química, es decir, determina cuándo se libera o se requiere energía para realizar un trabajo.
Delta G es + Endergónica (requiere energía)
Delta G es - Espontánea (libera energía)

Por lo tanto, en una reacción que es catalizada se alcanza el estado de transición más fácilmente ya
que disminuye la energía de activación (energía necesaria para alcanzar el estado de transición). En
cambio, en una reacción no catalizada, la energía de activación será mayor.

Diagramas de energías:

En los gráficos: el punto más alto corresponde al estado de transición, momento en el cual la molécula se
está transformando, una vez lista baja la energía ya que comienza a estabilizarse. Lo que cambia en cada
caso es la energía necesaria para alcanzar el estado de transición. Siendo el primer caso aquella que no
posee enzima y requiere más energía, luego el caso donde la enzima es complementaria al sustrato, allí se
requiere mucha energía para obtener el producto.

Finalmente, el último caso es aquel donde se tiene una enzima complementaria al estado de transición,
donde se requiere la menor cantidad de energía, siendo éste el más eficiente.

4. Regulación de las Enzimas

Las enzimas pueden ser reguladas por distintos procesos como:

- REGULACIÓN POR SUSTRATO

Aquí la concentración del sustrato regula la actividad catalítica, donde:

(+) concentración = regulación negativa

(-) concentración = regulación positiva

Ej: si poseo mucho ATP almacenado significa que debo regular negativamente la producción de éste ya que
el sistema no lo requiere.
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- REGULACIÓN POR PRODUCTO

Aquí la concentración del producto obtenido es quien regula la actividad catalítica.

- REGULACIÓN COVALENTE

Una sustancia regula a la enzima tras unirse de forma covalente generando modificaciones.

Ej: la adición del fosfato a una enzima (fosforilación) gatilla procesos asociados a hormonas. También son
ejemplos las metilaciones y ribosilaciones.

- REGULACIÓN ALOSTÉRICA

Moduladores alostéricos generan un dinamismo en la enzima que le permite mayor actividad. Esto se da
gracias a la unión no covalente de moduladores (cofactores o metabolitos) a la enzima. El sitio de
modulación puede ser distinto del sitio activo de la enzima, donde:

Modulador Homotrópico
Sustrato y modulador casi idénticos estructuralmente, donde se da la “confusión” que el modulador
ocupa el espacio en el sitio activo destinado para el sustrato, dando como resultado una regulación
negativa porque la enzima no logra interactuar con el sustrato.
Aquí el sitio activo y regulatorio son el mismo.

Modulador Heterotrópico
Sustrato y modulador son distintos estructuralmente, por lo que el modulador interactúa por otro
sitio con la enzima haciendo que ésta adquiera otra posición que puede facilitar o dificultar la
asociación del sustrato al sitio activo. Puede ser una regulación positiva o negativa.

• Efecto de pH en actividad enzimática:


El sustrato y el sitio activo se asocian por interacciones de cargas por lo tanto al alterar pH podría
alterar la carga de las enzimas (de origen proteico). Así, el pH afecta la actividad catalítica donde
para obtener una buena actividad catalítica (máxima velocidad) se debe tener un pH óptimo.

• Efecto de temperatura en actividad enzimática:


La temperatura altera la estructura, donde:
Menor T = enzima inactiva pero no necesariamente denaturada.
Mayor T = enzima puede llegar a denaturarse.
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5. Cinética Enzimática

La cinética enzimática permite visualizar cuál es el rol de la enzima en un proceso metabólico,


determinando las afinidades entre sustrato-enzima y sustrato-inhibidores. Existen parámetros que
permiten identificar cómo la enzima está ejerciendo su rol catabólico:

Km Constante de Michaelis-Menten

Vmáx Velocidad de reacción

• Ecuación de Michaelis – Menten

Ecuación que describe la cinética enzimática de una enzima que cataliza la reacción de un único sustrato.

En el experimento se observó que: en tiempos cortos, la concentración de enzima libre disminuía,


pero en gran parte de la reacción se mantenía una concentración constante. Así también ocurrió para
la concentración de complejo enzima-sustrato, a esto se le denominó “supuesto estado estacionario”
o “supuesto orden cero”.
La explicación: la enzima que interactúa lo hace de manera constante, liberando producto y luego
volviendo a interactuar.

Orden 1: en algunas ocasiones se decía que el orden de la reacción era 1 ya que la reacción dependía del
sustrato y/o reactantes.

Ecuaciones:

Donde a mayor Km significa menor afinidad, y a menor Km es una mayor afinidad.

Kcat: Es el número de recambio, corresponde a l número de reacciones que realiza cada sitio activo por
unidad de tiempo. Kcat y Km son medidas de eficiencia catalítica.
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• Análisis de datos cinéticos

Si observamos la ecuación de los dobles recíprocos


podemos observar que equivale a una ecuación de la recta:

Esta equivalencia a una ecuación de la recta permite linealizar, es decir crear una línea recta tras graficar
datos y así obtener una pendiente y un intercepto. Donde:

Reacciones catalizadas por mecanismos bisustrato:

Una única enzima puede catalizar más de una reacción, donde un complejo ternario corresponde a una
enzima con dos sitios de unión aleatorios. Esto se da a través de dos mecanismos:

- Estructurada: enzima debe tener expuesto su sitio activo para que el sustrato forme el complejo y
luego los productos.
- Pin-pong: enzima no forma un complejo, sino que tiene un sitio para el sustrato 1, donde al catalizar
adquiere una formación espacial para liberar sus productos. Con esa formación es capaz de
interactuar con el sustrato 2, donde al liberar los productos de esa segunda reacción vuelve a
adquirir su forma inicial y poder interactuar nuevamente con el sustrato 1.

5.1 Inhibición de Actividad Enzimática

Inhibidor Es una sustancia que altera la actividad de una enzima (Velocidad y/o Km).

Las inhibiciones pueden ser reversibles o irreversibles.

INHIBICIONES REVERSIBLES:

• Inhibición Competitiva
Se pueden tener muchas enzimas para un mismo sustrato, donde además exista un inhibidor que se
parece al sustrato. Si bien se espera que las enzimas se asocien con el sustrato, una de las enzimas
puede generar un complejo enzima-inhibidor. Inhibidor y sustrato generan una competencia directa
por el sitio activo de la enzima.

Al suceder esto, se necesitará más sustrato para alcanzar la mitad de la velocidad, esto indica que el
inhibidor reduce la energía libre disponible para la fijación con el sustrato.

Para determinar si se trata de una inhibición competitiva:


Vmáx = constante
Km aparente > Km (con Km aparente = Km por alfa)
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• Inhibición no competitiva
En este caso el sustrato no se parece al inhibidor por lo que no compiten por el sitio activo. Aquí, la
unión del inhibidor es en un sitio distinto, cuando se une, la enzima se distorsiona haciendo que el
sustrato no pueda acercarse al sitio catalítico, disminuyendo así la Vmáx (no cambia Km).

Para determinar si se trata de una inhibición no competitiva:


Vmáx aparente = Vmáx / alfa
Km aparente = Km

Aplicación de la inhibición: Antiinflamatorios no esteroidales (AINEs)

Ejemplos: ácido acetilsalicílico, diclofenaco, naproxeno, ibuprofeno, paracetamol.

En nuestro sistema, los fosfolípidos de


membrana son convertidos en ácido
araquidónicos gracias a fosfolipasas 2.

Estos ácidos frente a ciclooxigenasas


pueden convertirse a:

- Prostaglandinas protectoras
gracias a COX1
- Prostaglandinas inflamatorias
gracias a COX2

Las AINEs inhiben enzimas COX por lo


tanto inhiben la producción de
prostaglandinas.

6. Metabolismo Glicosídico
Metabolismo suma de reacciones químicas catalizadas por enzimas que regulan.

Catabolismo:

Reacciones metabólicas donde moléculas macro se degradan a desechos metabólicos, liberando energía. La
liberación de energía tiene relación con los electrones (se oxidan y se liberan), cuando éstos se liberan, las
coenzimas los toman y convierten en moléculas de energía.

Aparte del fenómeno de oxidación, puede haber fosforilación del ADP generando ATP, por lo tanto, el
catabolismo degradativo: es una reacción oxidativa, genera equivalentes de reducción (coenzimas) y ATP.

Anabolismo:

Reacciones metabólicas que tienen de precursores a monosacáridos para formar macromoléculas. Esto lo
hace generando enlaces por lo que requiere energía, esta energía puede ser obtenida de la que se liberó en
catabolismo. Por lo tanto, el anabolismo: es una reacción reductora y genera enlaces gracias a ATP.
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• Naturaleza Anfibólica

El anabolismo y catabolismo funcionan de forma simultánea, la diferencia está en las velocidades con las
que funcionan. En el caso de tener un equilibrio, es decir, igual velocidad para ambos procesos corresponde
a un indicador de muerte celular.

La naturaleza anfibólica es una conexión entre ambos metabolismos, donde las moléculas que se están
degradando se derivan a un proceso anabólico. Esto se observa en muchos ciclos, ejemplo el Ciclo de Krebs.

Ciclo de Krebs: Ocurre en la mitocondria en condiciones aeróbicas donde el piruvato ingresa a la matriz y se
transforma en Acetil-CoA, el cual ingresa al ciclo para formar:

- NADH y FADH
(llevan los electrones de las moléculas que se están degradando a la cadena transportadora de
electrones que genera gradiente electroquímica que provoca la síntesis de ATP)
- CO2
- 1 ATP por mol de Acetil-CoA

• Ruta de las Pentosas Fosfato


Esta vía oxidativa de glucosa forma precursores de nucleótidos a partir de glucosa-6-fosfato que al
incorporarse en úrea se convierte a azúcares de 5C (pentosas) utilizada para la síntesis de ácidos
nucleicos, además de liberar NADPH que es muy importante en la síntesis de ácidos grasos y
fenómenos de estrés oxidativo.

6.1 Glicolisis
Corresponde a una ruta oxidativa de la glucosa (6C) donde se degradan en 2 moléculas de piruvato
(3C cada uno).

Destinos de la glucosa:

Características de la glicolisis:
- Ocurre en citoplasma
- Es un proceso oxidativo, por ende, catabólico y degradativo.
- Se forman 2 moléculas de ATP neto.
- Proceso irreversible en condiciones estándares desde el punto de vista energético, tiene dos fases:
Preparatoria / de Inversión (gasta ATP) y Producción (genera ATP).
- No depende de oxígeno.
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• Fase Preparatoria / de Inversión

• Fase de Producción de ATP


Paula Cerda M.
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Balance de Glicolisis:

¡Suerte en la prueba! :)

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