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METABÓLICA
PRIMER PARCIAL
by COMIVAINAS
AUTORXS
Natalie Akierman
Nerea Carrasco
Xavi Cintas
Belén Duart
Xulia Fandiño
Ainhoa Font
Claudia Gasque
Neus García
Marta Gómez
Oscar Peralta
Pere Posas
Tomàs Portaña
Karen Lojano
Dani Salas
Clara Sempere
Ivonne Ramírez
Raquel Rodríguez
Abel Rodríguez
TEMA 1
METABOLISMO Y SEÑALIZACIÓN
CELULAR
BQ 1 - METABOLISMO Y SEÑALIZACIÓN CELULAR
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1.3. RELACIONES METABÓLICAS ENTRE VÍAS ANABÓLICAS Y CATABÓLICAS.
Si nos centramos en los organismos heterótrofos, observamos que hay dos grandes tipos de rutas
metabólicas: anabolismo (vías reductoras) y catabolismo (vías oxidativas).
En el catabolismo, a partir de nutrientes (combustibles reducidos) muy cargados de electrones (Ex. lípidos,
proteínas, glúcidos…) obtenemos productos oxidados desprovistos de energía (Ex. CO2, H2O, NH3).
Durante este proceso liberamos los electrones que poseían los nutrientes. Estos se transfieren de un dador
de electrones (el cual se oxida) a un aceptor de electrones (el cual se reduce).
Hay tres principales cofactores transportadores de electrones: NAD+, NADP+ y FAD. Estos, como
consecuencia de las rutas catabólicas se reducen y acumulan los electrones que hemos obtenido de los
nutrientes. Además este flujo nos permite obtener ATP (moneda energética) a partir de ADP + Pi.
Por lo tanto, como consecuencia del catabolismo obtenemos: poder reductor y ATP.
Con lo obtenido en el catabolismo, podemos llevar a cabo el anabolismo.
Por lo tanto, transferir grupos fosforilos y electrones es esencial en el metabolismo. Las deshidrogenasas
son las enzimas que más intervienen (pueden oxidar y reducir reversiblemente)
Las monedas energéticas son utilizadas para llevar a cabo el anabolismo, pero también para
requerimientos energéticos (realizar trabajos útiles o ser transformadas). La energía química puede generar
otros tipos de energía:
- Generación potencial de membrana: sostienen la transmisión sináptica.
- Creación de gradientes electroquímicos: favorecen el transporte.
- Contracción muscular.
- Movimiento
- Calor.
El 70% de la energía corresponde a la tasa metabólica basal (mantener la homeostasis de
la célula), el 20% a la actividad física y el 10% a mantener la temperatura corporal.
El ATP es una molécula con una energía de hidrólisis muy elevada.
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El FMN (flavín mononucleótido) está formado únicamente por el segundo nucleótido que compone el FAD
(flavina).
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1.6. PRINCIPALES COMBUSTIBLES.
Las grasas son mejores fuentes de energía que los
glúcidos porque están más reducidas. Tal y como vemos
en la imagen, del palmitato obtenemos 106 ATP y de la
glucosa 32 ATP.
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Satisfacer la demanda energética de una neurona para así poder mantener el potencial de
membrana y la actividad sináptica sería inviable mediante la degradación de ácidos grasos. Por
dos motivos: es un proceso más lento (debido a ser más complejo, con más pasos) y porque el
transporte de lípidos en sangre y que atraviese membrana hematoencefálica es difícil.
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Después de una ingesta los niveles de glucosa en sangre aumentan. La glucosa puede entrar tanto a la
célula 𝛂 o 𝛽 mediante GLUT2. Provocando en la secreción de insulina y la inhibición de la secreción de
glucagón.
La insulina actúa sobre un conjunto de tejidos que tiene receptores (adiposo, muscular). Aquí activa el
GLUT4 (un transportador de glucosa de alta afinidad) que normalmente no funciona. Por lo tanto, la
insulina permite que se sinteticen lípidos o proteínas (acción anabolizante).
En el hígado favorece glucogenogénesis o síntesis de glucógeno con el fin de generar una reserva de
carbohidratos (vía metabólica) mediante el GLUT2. Por lo tanto, el hígado sólo capta glucosa cuando las
concentraciones son muy altas.
Todas estas acciones se realizan con el fin de disminuir los niveles de glucosa y volverlos a sus parámetros
normales.
Si tras estos procesos, sufrimos un periodo largo de ayunas (toda la noche), pasaremos a estar
hipoglucémicos y por lo tanto se frenará la secreción de insulina y se activará la secreción de glucagón con
el fin de volver a los parámetros normales.
En el hígado activa la degradación de glucógeno o glucogenolisis y activa la síntesis de glucosa. Para llevar
a cabo estos procesos necesitamos una fuente de materia (movilización proteínas en el tejido muscular) y
una fuente de energía (degradación de grasas del tejido adiposo).
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TEMA 1. METABOLISMO Y SEÑALIZACIÓN CELULAR
2. Control del metabolismo energético
2.1. Anabolismo y catabolismo
2.2. La carga energética regula la velocidad de vías metabólicas
2.3. La proteína quinasa activada por AMP (AMPK)
2.4 Control del anabolismo por mTORC1
2.5. Etapas limitantes de una ruta metabólica
2.6. Regulación de la actividad de enzimas que catalizan etapas limitantes
CATABOLISMO: Tres rutas diferentes dependiendo del tipo de nutrientes. Obtienen energía degradando
biomoléculas que pueden venir de la dieta como de nuestras reservas energéticas.
1. Proteínas: Por acción de peptidasas obtenemos aminoácidos y por
acción de desaminasas y de transaminasas fundamentalmente a
nivel del músculo y del hígado pierden el grupo amino.
El hígado lo que hará es detoxificar el amonio que es tóxico y esto
es posible ya que el amonio entra al ciclo de la urea generando un
gasto energético (por ello, no es la mejor vía) y se generan:
a. Cetogénicos (se convierten en Acetil-Coa y entran en el
ciclo de Krebs y sus carbonos se pierden)
b. Glucogénicos (se convierten en cetoácidos, como el
piruvato, y pueden ser sustrato para la síntesis de
glucosa).
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Si las condiciones de la célula son la de obtener energía, el Acetil-Coa con el oxalacetato (un cetoácido) iniciarán el
ciclo de los ácidos tricarboxílicos [vía anfibólica (catabólica o anabólica)] que a través de una serie de
intermediarios se oxida completamente el Acetil-Coa generando CO2 y poder reductor (NADH+H+ y FADH2).
Todo el poder reductor generado en las diferentes vías puede ser transferido a otros cofactores hasta el receptor
final que es el oxígeno (muy electronegativo). Esta cadena de transporte de electrones junto con el bombeo de
protones provoca un gradiente de concentración electroquímico en la membrana interna mitocondrial que
promueve la síntesis acoplada de ATP al intentar equilibrar la diferencia de potencial generado, es decir, que los
protones vuelvan a la matriz mitocondrial.
Las vías metabólicas están reguladas, nunca es 0, serán más activas o menos
activas
LAS CÉLULAS MANTIENEN UN EQUILIBRIO DINÁMICO debido a que en la célula la mayoría de los metabolitos
intermediarios y cofactores como ATP, NAD y el NADP se encuentran en una concentración muy constante y
adecuadas para el correcto funcionamiento de las reacciones en las que participan.
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2.2 LA CARGA ENERGÉTICA REGULA LA VELOCIDAD DE VÍAS METABÓLICAS
Existen dos quinasas relacionadas con el ATP:
La carga energética hace referencia al estado de salud energético celular. Se expresa con la ecuación:
[𝐴𝑇𝑃]+0.5[𝐴𝐷𝑃]
𝒄𝒂𝒓𝒈𝒂 𝒆𝒏𝒆𝒓𝒈é𝒕𝒊𝒄𝒂 = [𝐴𝑇𝑃]+[𝐴𝐷𝑃]+[𝐴𝑀𝑃] (Valores entre 0 y 1)
El ATP y ADP son moduladores alostéricos de muchos enzimas del metabolismo. Muchos enzimas son capaces de
medir los niveles relativos de ATP respecto de ADP de manera que muchos del catabolismo se activan cuando hay
poco ATP y muchos del anabolismo se activan cuando hay mucho ATP.
Aunque el verdadero sensor de la carga energética de la célula es el AMP. Existe una quinasa activada por AMP
(AMPK) que participa en el control del metabolismo. Cuando se produce una caída de los niveles de ATP, al subir
los niveles de ADP, la reacción se desplaza hacia la derecha y se transforma en ATP + AMP (reacción catalizada por
adenilato quinasa), de esta manera los valores de ADP se reducirán volviendo a los de reposo. Con ello, generamos
un metabolito cuya concentración ha aumentado muchísimo de 0,1 a 0,6 (600%) . Por eso es un buen sensor.
Grandes o pequeños cambios de la carga energética celular se verán representados en la concentración de AMP.
Esta quinasa en carácter general inhibe el anabolismo, es decir, inhibe procesos en los que se gasta energía por lo
tanto su misión es recuperarla y potencia procesos del catabolismo para restaurar los niveles de ATP.
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2.4 CONTROL DEL METABOLISMO POR mTORC1
Antagonizando la quinasa anterior está la mTORC1 (frena el
catabolismo) que se activa por la llegada de nutrientes y
factores de crecimiento.
Además, fomenta la síntesis de la membrana plasmática a través de factores de transcripción como el HIF-1, PGC-
1alfa y PPAR que activan programas genéticos relacionados con la angiogénesis (que se trata de la vascularización
de un tejido nuevo, permite el crecimiento del tejido), que participa en el metabolismo mitocondrial y la
adipogénesis (síntesis de lípidos) respectivamente. Prepara a la célula para crecer.
– Catabolismo y anabolismo del mismo tipo de biomoléculas NO tienen lugar simultáneamente: distintos tipos
celulares, distintos compartimentos subcelulares, distintos cofactores, etc…
2.5 ETAPAS LIMITANTES DE UNA RUTA METABOLICA
En las rutas metabólicas al menos una de las reacciones (1) , que
suele estar al principio de la ruta, posee menor velocidad, funciona
muy alejada del equilibrio, tienen una AG’º muy negativa, marca la
dirección de la ruta respecto al resto de reacciones (2 y 3) y se erige
en el punto de control de la ruta
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alta de una 3 veces en comparación con la acción de la enzima 2 y 3 que prácticamente son las mismas, esto hace
que la reacción se desplace a la derecha.
Si se inhibe la enzima 1 y se activa la enzima que cataliza el paso contrario lograré que la reacción vaya a la izquierda.
Estas enzimas se caracterizan por tener Keq ( constantes de equilibrio) muy elevadas porque llegan al equilibrio
cuando hay mucho más producto que sustrato y por tanto el Keq es más grande que el Q (coeficiente de acción de
masas). Y todo esto va a asociado a AG negativas
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Se debe tener en cuenta que estas regulaciones no son excluyentes, es decir se pueden dar simultáneamente una
regulación por la concentración de un determinado metabolito y por cambios postraduccionales.
3 SEÑALIZACIÓN CELULAR
3.1 CARACTERÍSTICAS DE LOS SISTEMAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑAL
Las células deben ser capaces de interpretar una enorme diversidad de señales
extra e intracelulares (estrés ambiental, señales paracrinas que proceden de
células vecinas, señales de células endocrinas, de la matriz extracelular, señales
nutricionales y señales que proceden del interior de la célula relacionadas con la
homeostasis celular y la fase del ciclo celular donde se encuentre) y utilizar esta
información para regular una gran variedad de procesos celulares, que darán
lugar a la respuesta apropiada (cambios en la expresión génica, cambios en el
citoesqueleto, producción y secreción de metabolitos, crecimiento y división
celular, quiescencia o muerte celular); En todo el mecanismo de señalización
celular tiene que haber mecanismos o estrategias de retroalimentación negativa
intrínsecas que informan a una célula de cuando la respuesta ya está aceptada y por tanto para que se detenga la
trasmisión de la señal.
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La investigación en diferentes disciplinas como en la embriología del
desarrollo, endocrinología, inmunología, neurología, etc pone de
manifiesto un conjunto común de mecanismos moleculares de
señalización celular que son la base molecular que controla respuestas
celulares apropiadas a estímulos concretos. Con lo cual, la señalización
celular no es patrimonio del metabolismo.
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3.3 CARACTERÍSTICAS DE LOS SISTEMAS DE TRANSDUCCIÓN DE SEÑALES
● La especificidad: la señal extracelular encaja con el sitio de unión en su receptor: para cada receptor
existe un único ligando o señal extracelular.
Sin embargo, existen excepciones:
• En la insulina, el IGF1 también es capaz de unirse al receptor de la insulina, pero con baja
afinidad; asimismo este receptor tiene su receptor específico (el receptor IGF1) y de igual
manera la insulina también puede unirse a este receptor, pero del mismo modo con muy baja
afinidad. Con lo cual, la insulina y el IGF1 encuentran su mayor eficacia de trasmisión de señal
cuando se unen a su receptor específico
• Por otro lado, el mismo ligando o mensajero extracelular reconoce a más de un receptor específico (la
misma hormona, adrenalina, opera a través de hasta cinco receptores distintos pero cada uno solo se une
a la adrenalina).
Esta relación específica ligando-receptor es lo que garantiza la especificidad a los sistemas de transducción de
señales.
● Integración: de señales que afectan a un mismo proceso cuando estas son de signo
opuesto siendo la respuesta final el sumatorio de ambas señales (por ejemplo, en
el control del tono cardíaco).
Es decir, a una misma célula llegan 2 señales que pueden llegar a estimular efectos
contrarios ya sean como efectos que regula la concentración de un determinado
metabolito de la célula o de un potencial de membrana o de un nivel de expresión
de un gen, sea cual sea la célula es capaz de integrar estas señales antagónicas y dar una respuesta que serán la
suma de las dos señales.
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3.4 TIPOS DE MENSAJEROS EXTRACELULARES O SEÑALES
RECEPTORES: Son proteínas a las que se asocian los mensajeros intercelulares de forma reversible y específica.
NOTA: Los receptores del primer grupo → factores de transcripción
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2. Receptores acoplados a proteína G (en la membrana), en los cuales la unión del ligando a su receptor activa
una proteína G intracelular, la cual activará una enzima que producirá un segundo mensajero. Este es el caso
que sigue tanto el glucagón como la adrenalina.
3. Los receptores con actividad enzimática intrínseca y dentro de ellos destacamos los receptores tirosina-
quinasa, donde la unión al ligando con el receptor da la activación del receptor por la autofosforilación y
muchas veces desencadena cascadas de quinasa que activan a un efector al final de vía que puede tener
Receptores diferentes efetos.
con actividad
enzimática
intrínseca. 4. Los receptores guanil ciclasa que cuando se unen a su ligando generan un segundo mensajero que se denomina
GMPc, este tipo e receptor transmiten las señales del óxido nítrico y de sustancias natriuréticas y se relacionan
con la contracción de la musculatura vascular lisa que recubre el endotelio y por lo tanto en última instancia
están implicados en el control de la presión sanguínea.
5. Canales iónicos: la unión con el ligando a su receptor provoca la apertura del canal y con ello la entrada o la
salida del ion.
6. Receptores asociados a enzimas que puede ser una quinasa u otro tipo de enzima ( en este caso los receptores
no son intrínsecos)
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La unión de la hormona a la región correspondiente en el receptor permite que el receptor se una a la región del
promotor de gene regular y ayuda a activar la trascripción de ese gen .
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hormona; una región transmembrana y una región intracelular que tiene la actividad enzimática intrínseca (en este
caso la actividad tirosina quinasa)
En ausencia de señal el receptor esta inactivo, porque está en forma monomérica. Cuando la célula es estimulada
con el factor de crecimiento correspondiente el receto dimeriza y esta dimerización provoca un acoplamiento de
dos monómeros y particularmente de los dos dominios tirosina-quinasa y esta proximidad favorece que el dominio
quinasa de monómeros fosforile en trans a la región intracelular del otro monómero. Por lo tanto, se produce una
fosforilación- autofosforilación en trans en residuos de tirosinas.
La aparición de tirosinas fosforiladas en el espacio intracelular genera lugares de reclutamiento, estas fosfo-
tirosinas son muy adhesivas, normalmente no se encuentran dentro de la célula y cuando lo están por acción del
factor miogénico, serán reconocidas por todo un conjunto de proteínas intracelulares que presentan unos dominios
proteicos específicos que tienes el nombre de “dominios de unión a phosfo-tirosinas”, esta unión es específica,
una proteína intracelular concreta que contenga uno de estos dominios de unión phosfo-tirosinas era capaz de
reconocer una tirosina concreta cuando esta fosforilada y no sólo a esa tirosinas sino todo el conjunto de aa que la
envuelven, de tal manera que esta molécula reconoce esta phosfo-tirosina ya que tiene afinidad por esta región
del receptor y cada molécula tiene su afinidad con otra en concreta.
Sin embargo, si la tirosina no esta fosforilada y al fosforilarla no se le han dado cargas negativas, estas proteínas no
serán capaces de hacer esta unión. Por lo tanto, cuando se estimulan receptores con actividad tirosina -quinasa
intrínsecas, se autofosforilan residuos de tirosina y estas phosfo-tirosinas pasan a ser lugares de anclaje o lugares
de reclutamiento o de reclutamiento de proteínas intracelulares específicas que en ausencia de señal estaría libres
en el citosol.
En el caso de factores de crecimiento, como el FGF (FACTOR DE CRECIMIENTO DEL FIBROBLASTO), se une a su
receptor, induce la activación del mismo, se auto-fosforila y en este caso la proteína adaptadora que reconoce las
fosfotirosinas se denomina Grb2. Esta también está unida a otra proteína que se denomina Sos que tiene una
actividad catalítica (GEF) que fomenta el intercambio de nucleótidos de guanosina, con lo cual Sos activa una
proteina que se encuentra en la membrana que se denomina RAS (proteína G pequeñas). RAS no es un segundo
mensajero es un transductor y amplificador de la señal.
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NOTA: Las proteínas G pequeñas cumplen con dos características: son activas
cuando están unidas a GTP y se inactivan solas cuando hidrolizan GTP a GDP. Esta
actividad para la inactivación de la proteína está controlada por GAP, es decir,
permite la hidrólisis de GTP a GDP en las proteínas G. Para cambiar el GDP por
GTP, activarse, necesitan un GEF.
Es decir, cuando Ras está activo cuando está unido a GTP, y podrá activar la vía
de señalización que hay por debajo de él, pero en cambio tiene su actividad GTP-
ASA intrínseca inactivada. Cuando la proteína GAP activa a la activad GTP-ASA
intrínseca de RAS la GTP se hidroliza y RAS se inactiva.
En el caso de RAS: al GAP se le conoce como NF1 y ese nombre viene de un síndrome hereditario humano, donde
lo que se hereda es la predisposición a partir tipo de cáncer, que es conocido como neuro fibromatosis tipo 1. Los
individuos que lo padecen desarrollan neuro-fibromas.
Con lo cual, si perdemos el desactivador de Ras, en estos pacientes que padecen de neurofibromatosis la
consecuencia es de padecer una proliferación fuera de control.
IMPORTANTE: en esta vía de señalización de las map-quinasas no hay ningún segundo mensajero. Los segundos
mensajeros son metabolitos pequeños que se sintetizan y se degradan a una velocidad elevada y que por lo tanto
son capaces de generar picos dentro de la célula.
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4. SEÑALIZACIÓN POR INSULINA
4.1 ACTIVACIÓN DEL RECEPTOR DE INSULINA
El receptor de la insulina es un heterotetrámero formado por dos cadenas
alfa extracelulares y dos cadenas beta transmembrana que contiene una
región extracelular que participa junto con alfa en la unión a la insulina y una
región intracelular que contiene el dominio tirosina quinasa.
La unión de la insulina al receptor hace un cambio conformacional
transmitido por la región transmembrana y activa el dominio quinasa
intracelular (con lo cual, se une a los dos dominios).
Como consecuencia de la activación cada uno de los dominios catalíticos
fosforila a el otro dominio en tres tirosinas críticas (autofosforilación trans).
• Tyr 1158.
• Tyr 1162.
• Tyr 1163.
Estas están localizadas en un segmento del dominio catalítico que se denomina loop o lazo de activación. Cuando
las tirosinas están desfosforiladas, inactivas, este loop de activación bloquea el sitio de unión al sustrato.
Como consecuencia de esta autofosforilación en trans de estas 3 tirosinas provocan una fosa de repulsión o un
estrés de cargas negativas contra un aa que se localiza cercano al lugar de unión denominado aspártico, haciendo
que el lazo se mueva, liberando el surco de unión al sustrato.
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1. Como es la Grb2 que reclutará a la Sos (GEF) y
fomentará el cambio de GDP por GTP en RAS, el
cual se activará de desencadenará una señal que
desencadenará la activación de la ruta de las
MAPKs. Con lo cual esta ruta de la insulina es capaz
de activar estas cascadas al igual que los
mitógenos.
fosfolipasa C .
3. Por otro lado, se crea una fosforilación que en este caso no es funcional.
4. La última tirosina es capaz de reclutar a una quinasa muy especial, la fosfatidilinositol 3-quinasa
(PI3K); ya que no fosforila quinasas, fosforila lípidos, concretamente el (PI (4,5)P2) y produce PI
(3,4) P2 Y PI(3,4,5)P3 que actúan como 2 mensajeros. Esta es la vía más relevante.
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*Lo que debemos tener claro es que la insulina a través de la ruta MAPKs es capaz de reprogramar las
expresión génica de la célula. ( con lo cual, la ruta de las MAPKs no es exclusiva de los factores de crecimiento)
Estos módulos de señalización celular, muchas veces las encontramos adaptadas a uno u otro receptor y a
señales diferentes y darán diferentes respuestas.
Este PIP 3 actuará como punto de anclaje que es reconocido de forma muy específica por todo un conjunto
de proteínas que tiene unos dominios específicos de reconocimiento para PIP3 y estos dominios se conocen
como “PH domains”. Las tres proteínas que vamos a destacar son PKB y PDK1 y mTORC2,que se van a colocar
en la membrana y esta colocalización es suficiente para PKB que es la proteína efectora que será fosforilada
por PDK1 y por Mtorc2, esto provocará que se active que se desenganchará de la membrana debido a un
cambio conformacional, viajará al citosol y también al núcleo y realizará sus señales.
PIP2: fosfolípido: Vemos el esqueleto tricerol, donde tiene 2 de sus carbonos esterificados en dos ácidos
grasos que se insertan a la membrana plasmática y el 3º carbono está esterificado con un enlace fosfato a un
esqueleto carbonatado que recibe el nombre de anillo inositol que esta fosforilado en los carbones 4 y 5
contando desde el carbono que de une al glicerol.
La PI 3- Kinasa como cualquier quinasa utiliza el ATP
para transferir uno de esos fosfatos a la posición 3” del
anillo inositol y libera ADP, generando el PIP3
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El desactivador de la vía es una fosfatasa PTEN que antagonista la reacción de la PI3-Kinasa, es decir revierte
la reacción de la PI3K lo que hace es hidrolizar el fosfato de la posición 3 y volver a PIP2, con lo cual lo que
verdaderamente hace es eliminar el 2 mensajero cuando la respuesta ya se ha ejecutado.
La prueba de que la insulina no sólo es una hormona, sino que puede ser un factor de crecimiento es que
PTEN es un gen que se encuentra mutado en personas que heredan un síndrome de predisposición a partir
de un tipo determinado de tumores, este síndrome es conocido como cowden que es la tendencia a formar
“harmatomas” que son tumores benignos que eventualmente pueden malignizar. Asimismo, estas personas
tienen predisposición a originar otro tipo de tumor.
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4.3 SUSTRATOS CITOSÓLICOS DE PKB: estimulación de la captación de glucosa y la
síntesis de glucógeno en musculo (modulación covalente)
CAPTACIÓN DE GLUCOSA
La insulina de una forma ordenada, mediante la
activación de PKB es capaz de fomentar la
captación de glucosa en el músculo esquelético y
su acumulación en forma de glucógeno.
PKB es una quinasa doblemente fosforilada que
fosforila y activa a una proteína AS160 reguladora
del tráfico vesicular. Esta fomenta el tráfico de unas
vesículas específicas (se encuentran en el citosol)
que están cargadas del transportador de glucosa
GLUT 4. Este transportador se transloca a la
membrana plasmática y permite la captación de
glucosa por parte de la AS160.
Seguidamente cuando se inhibe esta señal, las
vesículas vuelven a su ligar de origen y dejan de
estar en la membrana plasmática.
Además. La insulina activa la fosfatasa PP1 (encargada de desfosforilar GS cuando ya había sido inactivada
por GSK3)
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4.5 ALGUNOS GENES REGULADOS POR INSULINA
La insulina degradando FOXO1 conlleva la inhibición de la expresión génica de algunos genes dependientes
de FOXO1 que controlan etapas claves de la gluconeogénesis.
Por contra, tras la inhibición de FOXO1 hay una serie de genes que resultan inducidos ya que permite que
otros factores de transcripción realicen mejor su función. El promotor es un claro sitio de integración de
señales.
Importante: La inactivación del factor de transcripción no siempre signifique una reducción de la expresión
génica.
Se debe tener en cuenta que la región promotora de un gen concreto (en este caso es el PEP carboxiquinasa) que
codifica para una enzima y tiene secuencias de unión a múltiples factores de trascripción.
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BQ 1 – METABOLISMO Y SEÑALIZACIÓN CELULAR
5.1 Proteínas G
Subunidad alfa funciona como proteína G monomérica. La forma activa será la subunidad G
alfa cuando está unida a GTP y que hará que se disocie de las subunidades beta y gama, en
algunos casos las subunidades beta y gama podrán quedar libres también resultando en un
estado activo
G INACTIVA = TRIMÉRICA G ACTIVA = ALFA SE DISOCIA
Aún así, tenemos también diferentes tipos de subunidades alfa: G alfa s que activa la adenilil
ciclasa y se encuentra en receptores beta adrenérgicos, G alfa i que inhibe la adenilil ciclasa y se
encuentra en receptores alfa 2 adrenérgicos y la G alfa q que activa la fosfolipasa C en los
receptores alfa 1 adrenérgicos y acetilcolina (M1). Es por eso, que la adrenalina podrá provocar
hasta tres respuestas distintas en función de con qué tipo de subunidad alfa interactúe.
Cuando una actividad GAP extraiga un fosfato de la GTP que se encuentra en la subunidad alfa
y este se convierta en GDP, entonces se formará de nuevo el trímero inactivo, la subunidad alfa
se volverá a unir a las otras.
AMP cíclic (AMP normal no podría hacerlo) activa PKA. PKA es un tetrámero formado por 2
subunidades reguladoras y dos catalíticas. La unión de ambas hará que se tapea el sitio de unión
al substrato de la subunidad catalítica (inhibida).
La unión de AMP cíclico a subunidades reguladoras (4 en total) causan un cambio
conformacional y se desorganiza la unión con la subunidad catalítica y deja libre el sitio de unión
al substrato permitiendo que el substrato se una y este sea fosforilado En residuos de serina o
treonina (RESPUESTA FINAL A HORMONA).
Otro de los sistemas de movilización de reservas energéticas que produce tanto adrenalina
como glucagón (receptor de adrenalina tipo beta adrenérgico y glucagón NO son los mismos
pese a que ambos señalizan a partir de proteínas G). PKA en respuesta a una u otra hormona
será capaz de activar a una lipasa sensible a hormonas, fosforilándola, que provocará la
degradación de grasas y la liberación de ácidos grasos que viajan por el torrente sanguíneo para
cubrir la demanda energética de otros tejidos en respuesta a ejercicio o ayuno. En el caso de
ejercicio se usarán para abastecer el músculo de una fuente diferente de carbohidratos
diferente de glúcidos en largas distancias deportiva, por ejemplo. En el caso de ayuno estos
ácidos grasos se destinarán a la síntesis de glucosa
Diacilglicerol y calcio, IP3 son metabolitos los cuales su concentración en la célula es muy bajo y
que aumenta en respuesta a la adrenalina cuando esta señaliza a través de un receptor de tipo
1. Diacilglicerol y calcio activarán PKC y el calcio a su vez se une a calmodulina formando el
complejo calcio calmodulina que activa otra kinasa llamada kinasa activada por el complejo
calcio calmodulina y estas dos kinasas son kinasas efectoras de la vía de transmisión de la
adrenalina cuando señaliza por un receptor alfa 1, también son capaces de promover respuestas
metabólicas en respuesta a la adrenalina fosforilando y inactivando la glicógeno sintasa.
PKA, CAMK y PKC son glicógeno sintasa kinasas. La vía de las MAPKs no usa segundos
mensajeros.
TEMA 2
FASE COMÚN DEL METABOLISMO
OXIDATIVO
TEMA 2. FASE COMÚN DEL METABOLISMO OXIDATIVO
1. INTRODUCCIÓN DEL METABOLISMO ENERGÉTICO MITOCONDRIAL
1.1 FASE COMÚN DE LAS VÍAS CATABÓLICAS
Todas las rutas del metabolismo oxidativo (carbohidratos,
aminoácidos, ácidos grasos y ácidos nucleicos) convergen
en el TCA (ciclo de Krebs) el cual siempre se desenvuelve
en presencia de O2. Es tan principal, importante y central
este proceso que si se producen errores graves no se podrá
llevar a cabo el objetivo de la ruta, es por ello, que
enfermedades genéticas asociadas a enzimas de este
proceso no existen. Las etapas de producción de energía
también pueden llamarse de respiración celular dado que
consumimos O2 y expulsamos CO2. El metabolismo
catabólico consta de tres etapas:
1. Todas las biomoléculas se oxidarán a Acetil-Coa: molécula central del metabolismo. En este proceso se
obtienen pequeñas cantidades de ATP y poder reductor.
o Los ácidos grasos y los aminoácidos cetogénicos tras la desaminación se transforman
directamente por la beta-oxidación (AG) en Acetil-Coa.
o Los carbohidratos y aminoácidos glucogénicos se transformarán en piruvato que se convertirá
en Acetil-Coa al entrar en la mitocondria.
En este proceso se obtienen pequeñas cantidades de ATP y poder reductor (NADH y FADH2) →
mayoría de sustratos, PERO nos darán poco poder reductor, el que realmente da poder reductor es
el AcetilCoa a CO2.
2. La oxidación del Acetil-Coa en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos (Krebs) junto con la cadena de
transporte de electrones acoplada la fosforilación oxidativa de ATP, en el que se obtiene CO2 →
produciendo NADH y FADH2. En este proceso se obtiene una gran cantidad de poder reductor y ⅔ del
ATP global de la ruta.
Ambas dos fases anteriores (2 y 3 ) constituyen la fase común del metabolismo oxidativo (oxidativo por la
necesidad de O2 → producida en mitocondria), y es común porque se da para todos los nutrientes.
Este proceso no solo es útil para el catabolismo, también está destinado al anabolismo (síntesis de moléculas).
1
La mayoría de las reacciones metabólicas ocurren en el CITOSOL a excepción de
la fase común del metabolismo oxidativo → 𝛃-oxidación de ácidos grasos,
oxidación del piruvato a Acetil-Coa, el ciclo de Krebs, fosforilación oxidativa y parte
del ciclo de la urea.
MITOCONDRIA
Tener estas reacciones en la mitocondria nos ofrece una serie de ventajas, y son para que el ciclo de Krebs y la
cadena electrónica estén cerca una de la otra → aumentando eficiencia, acceso directo al sustrato y modulación
rápida = ciclo de Krebs irá +/- rápido dependiendo de la velocidad de la cadena de e-; y esta puede dar un feedback
negativo al ciclo. Asimismo, esto esta muy regulado por el poder reductor de NAD+ i NADH (ya que se encuentran
dentro de la mitocondria y no pueden pasar al citosol).
ANABOLISMO: el acetil-coA se transforma a citrato y el oxalacetato a aspartato que puede salir de la mitocondria.
(tema 4)
Piruvato es una molécula de 3 carbonos+ grupo carboxil+ grupo ceto + grupo metal → se transforma a AcetilCoa
(grupo ceto y cromatil unido a CoA). De manera que el piruvato pasa a ser Acetil CoA, mientras que el grupo carboxil
se pierde en forma CO2 (descarboxilación + oxidación).
Dentro de esta transformación hay un conjunto de moléculas que participan → no se transforma en Acetil CoA
directamente, existen 5 pasos.
Por lo que la piruvato deshidrogenasa NO es un enzima, es un complejo enzimático y catalizan estas reacciones.
2
- Este complejo está formado por: E1 E2 y E3 (hasta 50 unidades de cada uno) → nos permite hacer el
trabajo de forma rápida y en cadena= catálisis veloz + eficiencia del proceso global y facilita su regulación.
Las vitaminas NO ayudan a formar ATP pero si a sacarlo. Son unas moléculas orgánicas, que no podemos sintetizar,
que necesitamos en pequeñas cantidades para el mantenimiento de las funciones de los organismos, funciones
antioxidantes (vitaminas E y C), también pueden ser precursoras de cofactores enzimáticos importantes para el
metabolismo de biomoléculas (vitaminas B) o precursoras de hormonas o moléculas señalizadoras (vitaminas A y
D).
3
En este proceso hemos reducido y oxidado e- → en la transformación del piruvato han pasado e- y hemos
obtenido un lipoil reducido. Este NO puede ser funcional (el acetil no podría unirse dado que se encuentra
reducido)→ debemos volver a oxidarlo y formar el doble enlace, pero además, hay 2e- que se malgastan
dado que tenemos 2x -SH y debemos oxidarlo para formar -S-S → si ahora oxidamos el lipoil para poder
volver a utilizarlo podemos pasar los e- a un FAD para obtener poder reductor. Los 2 e- salen del enlace
del carboxi inicial.
El PDH es un ejemplo de complejo enzimático que muestra la perfecta combinación de enzimas para realizar de
forma rápida y eficiente una reacción →si estuvieran separados y lo realizaran tipo vía metabólica se tardaría
mucho.
IMPORTANTE: Al final del proceso que lleva a cabo la PDH se obtiene NADH+H + y Acetil-Coa. Los dos electrones
del piruvato se utilizan para la obtención de NADH+H+ (poder reductor) que se utilizará en la cadena de transporte
de electrones y fosforilación oxidativa (síntesis de ATP). Se trata de una reacción muy irreversible en condiciones
celulares.
El Acetil-Coa tiene 8e- y está formado por un enlace tioéster → la hidrólisis de sus enlaces produce mucha energía
(ΔGº’= -33,4 kJ/mol → irreversible, muy exergónica) = ΔGº’ usada para reiniciar el Ciclo de Krebs.
NUNCA podremos pasar de AcetilCoA a Piruvato → IMPLICA que de carbohidratos podemos obtener ac grasos,
pero de los ac grasos NO podemos obtener carbohidratos.
4
2.3 REGULACIÓN DE LA PDH
En general, disminuyen la actividad:
- Metabolitos de la mitocondria → concentración de ATP y NADH+ → ATP/ADP (alta carga energética) y
NADH/NAD+ (alto poder reductor). El objetivo de PDH es formar AcetilCoA y entrar en ciclo de krebs (CK),
por lo que si tenemos mucho ATP o NADH la reacción quedará más reducida.
- Combustible: AcetilCoA y ác grasos, si lo obtenemos de otras vías la reacción también queda reducida,
porque no necesitamos producirla tanto.
• Modulación covalente por fosforilación E1: existe una quinasa y una fosfatasa que fosforilarán la piruvato
deshidrogenasa, por lo que tendremos la PDH quinasa y PDH fosfatasa:
o La PDH quedará activa por desfosforilación (fosfatasa)
o La PDH se inactiva fosforilada (quinasa).
¿De qué modo se modula la actuación de la quinasa o la fosfatasa? Los mismos metabolitos, de modo
que, en la modulación de la quinasa:
o AcetilCoA, NADH y ATP modulan alostericamente, y regulan la quinasa → activan la quinasa (porque
es una enzima de desactivación).
o ADP, piruvato → inhiben la quinasa, evitando que fosforile y desactive. En el músculo, el Ca2+,
también inactiva la quinasa. El Ca2+ permite la contracción del músculo y la contracción implica gasto
ATP, por lo que es necesario obtener ATP = pasar piruvato a Acetil-Coa.
*El O2 es necesario para la formación de ATP, se hace de forma oxidativa, en los casos de patología o temporales
de hipoxia se reduce todo el metabolismo oxidativo, ¿cómo? Activando y sintetizando la PDH quinasa, existe un
factor que en presencia de hipoxia hace que la quinasa esté más activa y la PDG reduzca su actividad.
5
2.3 EL CICLO DE LOS ÁCIDOS TRICARBOXÍLICOS
Recordatorio
El ciclo de Krebs es la fase común del metabolismo
oxidativo en la que convergen las vías catabólicas de
proteínas, glúcidos y lípidos, en la clase anterior se explicó
el paso de piruvato, el cual era obtenido mediante el
metabolismo de carbohidratos y de algunas proteínas, a
acetil-CoA, siendo catalizado por un complejo enzimático,
denominado piruvato deshidrogenasa. Esta reacción es
totalmente irreversible y regulada por metabolitos, como
son ATP y poder reductor.
Por otro lado, también nos interesa desde un punto de vista energético el enlace tioéster
(C-SCoA), ya que su hidrolisis proporciona mucha energía y propulsa la reacción.
Mientras que los carbonos del acetil no son aprovechados. Estos carbonos se acabarán perdiendo en forma de
CO2.
El Ciclo de Krebs es una forma útil de aprovechar de forma eficiente 8 electrones y la energía libre de la
hidrolisis del enlace tioéster del acetil-CoA.
6
− 3 NADH y 1 FADH2, los cuales pasarán a la cadena de transporte de electrones, donde se oxidarán
(obteniendo NAD y FAD) aportando la energía para sintetizar ATP.
− También se obtiene un GTP
Es decir, es una vía altamente eficiente. Ya que la Gº global = 57kj/mol, es una reacción exergónica, aunque
no todas sus etapas sean energéticamente favorables.
Por otro lado, el CoA-SH es un modulador alostérico positivo de la piruvato deshidrogenasa, es decir, estimula
la producción de Acetil-Coa.
Se produce la isomerización (misma fórmula empírica, pero diferente estructura, la aconitasa cataliza el
paso de citrato a isocitrato. Con un paso intermedio, el cis-aconitato.
ISOMEROS
(MISMA FÓRMULA, PERO DISNTA ESTRUCTURA
El paso intermedio, Cis-aconitato, es tan fugaz que no aparece representado en el ciclo de Krebs
7
CICLO DE KREBS: TERCERA ETAPA
− Enzima: isocitrato deshidrogenasa
− Cofactor: Mn2+
− Sustratos: isocitrato (6C) + NAD+
− Productos: α-cetoglutarato (5C) + NADH + H+ + CO2
− Tipo de reacción: descarboxilación oxidativa
− Mecanismo de reacción:
La isocitrato deshidrogenasa cataliza la descarboxilación oxidativa del isocitrato (6C) a α-
cetoglutarato (5C), para ello reduce un NAD+ a NADH+H. Este grupo COO- sale en forma de CO2. Es
una reacción muy favorable energéticamente.
Además, requiere de manganeso que actúa como cofactor inorgánico de la isocitrato deshidrogenasa.
Este poder reductor será utilizado posteriormente la cadena de transporte electrónico.
Esta reacción es muy similar a la acción de la piruvato deshidrogenasa debido a que mantienen el mismo
mecanismo de reacción y también se trata de un complejo enzimático formado por tres enzimas:
ENZIMAS COFACTORES
E1 (descarboxilasa de α-cetoglutarato) TPP
E2 (transcucinilasa) lipoil o lipoamida y Acetil-CoA
E3 (dihidropoildeshidrogenasa) NAD+ y FAD
Los enzimas son diferentes, aunque muy
similares y se mantienen los mismos
cofactores
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CICLO DE KREBS: QUINTA ETAPA
− Enzima: succinil-CoA sintetasa
− Sustratos: succinil-CoA (4C) + GDP + Pi
− Productos: succinato (4C) + GTP + CoA-SH
− Tipo de reacción: Hidrolisis
− Mecanismo de reacción: El enzima actúa hidrolizando el enlace tioéster y aprovecha la energía
liberada para formar GTP. Se trata de una reacción en equilibrio.
La succinil-CoA sintetasa utiliza la energía libre del enlace tioéster del succinil-CoA (4C) para formar succinato
(4C) y GTP a partir de GDP y fosfato inorgánico.
El GTP se puede transformar en ATP a través de la nucleósido difosfato quinasa en una reacción
energéticamente neta, en la que el aumento de la [GTP] implica el desplazamiento del equilibrio hacia la
derecha, formándose ATP. Por tanto, es equivalente sintetizar un GTP a un ATP.
La succinato deshidrogenasa oxida el succinato (4C) a fumarato (4C), reduciendo el FAD a FADH2, que
pasará a la cadena de transporte de electrones.
− una subunidad forma parte de la región que cataliza la reacción de SUCCINATO a FUMARATO (cara de
la matriz)
− tres subunidades son transmembrana, una de ellas hace de puente entre subunidad enzimática y la
membrana mitocondrial interna, estas subunidades participan en la cadena de transporte.
9
De modo que ahora, FADH2 pasa los e- a los centros ferro-sulfanatos (uniones Fe-S dentro de la subunidad
matricial, en el dibujo representados de color amarillo) que son capaces de captar e-, por lo que pasan a estos
dominios transmembrana, hasta la cadena de transporte, así el complejo II aprovecha directamente este poder
reductor.
Esta reacción es necesaria para obtener dos electrones más, que se utilizarán en la siguiente etapa para obtener
poder reductor.
Su energía libre es muy positiva, pudiendo realizarse la ecuación en sentido contrario. En la célula esta reacción
ocurre tanto en el citosol como en la mitocondria.
10
ΔGº’<0: (en verde)
En condiciones fisiológicas son reacciones muy desplazadas
hacia la formación de producto (irreversibles), por:
↓[productos], ΔGº’ muy negativas y también porque la
reacción contraria ocurre muy lentamente.
REGULACIÓN
El ciclo de Krebs (CK) presenta una regulación muy
estricta porque ha de suplir las necesidades
metabólicas de la célula. la regulación está mediada
a través de tres enzimas, cuyas reacciones son
exergónicas y prácticamente son irreversibles:
− citrato sintasa (CS)
− isocitrato deshidrogenasa (IDH)
− α-cetoglutarato deshidrogenasa (ACDH).
Regulación alostérica
Inhibición Activación
Enzima
(alostérica negativa) (alostérica positiva)
↑[NADH]= inactiva
Citrato sintasa ↑[ADP]= activación
↑[ATP]= inactiva
Isocitrato ↑[ADP]= activación
deshidrogenasa ↑[ATP]= inactiva
Ca2+: en músculo relación directa con la
contracción (estrés energético produce
Alfa-cetoglutarato pérdida de ATP) → la señal para contraerse
deshidrogenasa - se produce por el ↑[Ca2+] → ↓[ATP] =
Activación CK + activación PDH para obtener
Acetil-Coa
11
Regulación por disponibilidad de sustratos o competición con el sustrato:
regulando que haya suficiente sustrato o impidiendo la unión del sustrato al sitio activo.
CITRATO SINTASA
− Regulación por disponibilidad de sustrato → NADH regula la concentración de oxalacetato disponible
para la formación de citrato:
Por la ley de acción de masas una elevada [NADH] implica que la reacción para obtener oxalacetato
se enlentezca, originando concentraciones de este muy bajas. Esto provoca que no tengamos sustrato
suficiente y como consecuencia se disminuirá la velocidad de formación de citrato.
Por tanto, es necesaria una baja concentración de oxalacetato y NADH para que la reacción catalizada
por la malato deshidrogenasa se produzca. Sin embargo, concentraciones muy bajas de oxalacetato,
causadas por altas concentraciones de NADH, provocan una inhibición en la formación de citrato por
insuficiencia de sustrato y por consiguiente inhibición del propio ciclo de Krebs.
− Regulación por competición con los sustratos → Concentraciones muy elevadas de citrato y succinil-CoA
inhiben citrato sintasa
Ya que elevadas concentraciones de citrato compite con el oxalacetato por la ocupación del sitio activo
de la citrato sintasa, inhibiendo el enzima.
Al igual sucede con el succinil-CoA que compite con el Acetil-CoA por la ocupación del centro activo
de la citrato sintasa, impidiendo que la reacción continúe.
Como sucede con la citrato sintasa, elevadas concentraciones de NADH, producto de la reacción,
implica que la reacción no sea tan favorable y por tanto se enlentezca. Es decir, desplaza la reacción
hacia la izquierda.
Dado que puede ocupar el sitio activo de la enzima, evitando que se una el CoA y, por tanto, inhibe la
reacción.
CONCLUSIÓN: El ciclo de Krebs tiene como objetivo utilizar los 8 electrones del Acetil-Coa y la hidrólisis del
tioéster para iniciar todo el ciclo y está regulado por la carga energética y por el poder reductor.
12
2.3.5 REACCIONES ANAPLERÓTICAS
Las reacciones anapleróticas permiten la síntesis
de intermediarios del ciclo de Krebs a fin de
mantener sus concentraciones. Mientras que las
reacciones en sentido contrario, es decir, la
síntesis de otras biomoléculas, como
aminoácidos, no son anapleróticas, sino
anabólicas. El sentido de estas reacciones
dependerá de la concentración de los
intermediarios del ciclo, desplazándose en la
dirección en la que sea más favorable la reacción,
y de las necesidades celulares. Estas reacciones
anapleróticas portarán carbonos al ciclo de
Krebs.
En esta reacción, se retira el grupo amino mediante una hidratación obteniendo un grupo ceto, en el carbono
donde estaba el grupo amino. Esta oxidación, nos permite reducir un NAD+ (o NADP+) en NADH+H+ (o
NADPH+H+)
De modo que si pasamos de α-cetoglutarato a l-glutamato, será porque la célula requiere de sintetizar
biomoléculas.
La alanina y aspartato aminotransferasa: son enzimas que convierten un aminoácido en un cetoácido, a base
de transferir el grupo amino del aminoácido al α-cetoglutarato para formar L-glutamato.
El cofactor para estas reacciones es siembre el PLP (piridoxal fosfato), el cual procede de la vitamina B6
(piridoxina)
13
Las dos aminotransferasas más importantes, sobre todo desde el punto de vista clínico, son:
− La alanina aminotransferasa (ALT): usa como aminoácido la alanina, de ella se puede obtener piruvato
y viceversa. Siguiendo el mismo mecanismo, en este caso el cetoácido será piruvato
− La aspartato aminotransferasa (AST): usa como aminoácido el aspartato, sigue el mismo mecanismo,
en este caso el cetoácido es el oxalacetato, esta reacción también puede ocurrir en ambos sentidos
Clínica: En el hígado elevadas concentraciones de ALT y ALS, en una analítica si están muy elevadas nos indican
un problema en este órgano
La piruvato carboxilasa: este enzima cataliza la transformación de piruvato (3C) a oxalacetato (4C), lo cual le
permite pasar directamente al ciclo de Krebs.
Consiste en una carboxilación, la cual solo ocurre en una sola dirección, de manera que es irreversible.
La piruvato carboxilasa requiere de la biotina (vitamina B7) como coenzima. Este coenzima interviene en
muchas reacciones de carboxilación del organismo, como en el metabolismo de purinas, aminoácidos y algunos
lípidos.
Tiene mucha importancia en el hígado, no solo cuantitativamente, ya que en este órgano la cantidad sea varias
veces superior al resto de tejidos (siendo prácticamente inexistente en estos), sino también funcionalmente.
También es muy importante saber que está regulada de manera alostérica positiva por acetil-CoA, de manera
que su activación requiere que haya un incremento importante de Acetil-CoA.
Normalmente, en el ciclo de Krebs, el piruvato es el sustrato de la PDH, obteniéndose acetil-CoA. Ahora bien,
si la concentración de acetil-CoA es muy elevada, por ejemplo, por el metabolismo de ácidos grasos, va a
provocar la inhibición de la PDH y va a activar la piruvato carboxilasa, lo cual transformará el piruvato en
oxalacetato. A partir de aquí, hay varias opciones:
− Si la carga energética es baja, es decir se necesita sintetizar ATP, el oxalacetato se incorpora al ciclo
de Krebs. Lo cual junto con el aumento de acetil-CoA, facilitándose la obtención de ATP.
− Si la carga energética es alta, es decir, la célula no necesita sintetizar más ATP, por tanto, el ciclo se ha
inhibido por el aumento del NADH. Esto sucede, por ejemplo, cuando el hígado se encuentra en ayuno,
14
por tanto, usa los ácidos grasos, cuya oxidación provoca la obtención de gran cantidad de acetil-CoA
y de NADH.
En estos casos, el oxalacetato es usado para la síntesis de glucosa mediante la gluconeogénesis, para
ello se debe transformar el oxalacetato y desplazarlo al citosol:
o Recordad que el paso malato ↔ oxalacetato (catalizado por la malato deshidrogenasa) se
encontraba en equilibrio por las bajas concentraciones de oxalacetato. El aumento de este
intermediario provocará la reacción contraria, obteniéndose malato, el cual si posee un
transportador especifico que lo llevará fuera de la mitocondria iniciándose la síntesis de
glucosa
o En otras circunstancias el oxalacetato puede ser sustrato de la fosfoenolpiruvato (PEP)
carboxiquinasa, formando fosfoenolpiruvato (PEP). Este enzima es reversible y por tanto
puede ser considerado un enzima anaplerótico.
Enzima málico: es otro tipo de reacción anaplerótica, con la cual partir se carboxila piruvato para ello se debe
oxidar un NADH (o NADPH) y se obtiene malato. Esta reacción también puede ocurrir en sentido contrario.
Puede ser NADPH o NADH porque el enzima málico tiene diferentes isoenzimas, las cuales pueden estar en el
citosol o en la mitocondria, algunos usaran uno u otro, en la mitocondria los isoenzimas usan sobre todo
NADPH, pero habrá algunos que usen NADH
CONCLUSIÓN: El ciclo de Krebs se trata de una serie de reacciones que están entrecruzadas y relacionadas de
manera que hay reacciones anabólicas, de síntesis y reacciones catabólicas, de degradación y anapleróticas que
nos permitirán mantener los intermediarios y asegurar que el ciclo de Krebs tenga lugar.
El transporte de protones, la cadena respiratoria y la síntesis de ATP están totalmente acopladas, pero no
directamente, sino mediante el gradiente de protones.
15
2.4.2 REACCIONES REDOX
El transporte de electrones hasta al O2 sucede por una serie de pasos de oxidación-reducción en los que cada
componente de la cadena se reduce al aceptar electrones y se oxida al transferirlos al siguiente componente
de la cadena. Los enzimas que realizan reacciones redox en la célula son de distintos tipos (RECORDATORIO BQ
ESTRUCTURAL):
− Deshidrogenasas: ocurren tanto con la piruvato deshidrogenasa como en el ciclo de Krebs. Pueden
ser:
o transferencia del ion hidruro
En la cadena de electrones algunos electrones, aunque mayoritariamente pasen mediante iones inorgánicos,
también habrá de otros grupos. En la cadena podemos encontrar los siguientes grupos:
16
o Grupo C: son muy parecidos, pero en este caso están
unidos a proteínas mediante un puente disulfuro (unión
covalente) con dos cisteínas
o Grupo A: grupo hemo unido a isoprenoide (cadena
altamente hidrofóbica y muy larga) de forma no covalente
a la cadena polipeptídica.
17
o Co Q: insertado dentro de la membrana, captando los e- del complejo l o ll y los llevará al
complejo lll.
o CytC: localizado en el espacio intermembrana. Porta electrones del complejo lll hacia el
complejo lV.
Factores por los que los electrones siguen un orden determinado entre los complejos:
1. El hecho de tener estos complejos muy cerca entre sí, cediendo y aceptando e-, permite que los electrones
se dirijan a donde deben. Precisamente, esta es una de las funciones de los complejos, permitir el correcto
traspaso.
2. Potencial redox que presentan, es decir, la tendencia de un par redox (dador-aceptor) a ganar electrones se
cuantifica mediante el potencia redox (E). Los e- fluyen espontáneamente hasta el par con mayor tendencia a
ganar e- (MAYOR E). Los electrones pasan de un componente con una menor E a una mayor, es decir, a un
componente con mayor tendencia a captar electrones. De modo que si cuantificamos el incremento del
potencial redox:
Cuando tenemos mayor se hace ΔE provoca que el ΔG sea cada vez más negativo por eso el transporte de los
electrones se realiza de manera espontánea e irreversible. Esto se traduce a que todos los e- pasarán al
elemento que tengan más cerca y con E más positivo.
− En el eje Y izquierda: valores de potencial de electrones, los electrones irán de más negativos a más
positivos
− Eje Y derecha: valores de energía libre, la cual se ira haciendo cada vez más negativa
− Nota: en todos los pasos se cumplen los principios de cercanía y diferencia de potencial, pero en
concreto para los citocromos c1 y citocromos c sobre todo es una cuestión de proximidad y una
pequeña diferencia del potencial
Balance total
18
Estos valores tan negativos implican mucha energía (-220KJ/mol) y no hay ninguna reacción que necesite tanta,
por ello, el proceso necesita que sea en pasos (paquetes) para poder aprovechar la energía. Otro motivo por el
que son muchos pasos es que, siendo un proceso tan importante, si solo estuviese conformado por un solo
paso, cualquier error provocaría que no se pudiese aprovechar ninguna energía. Además, el calor desprendido
sería muy difícilmente disipado
La ΔG creada en este paso se usa para poder pasar 4 protones de la matriz al espacio intermembrana. El
transporte de electrones es energéticamente favorable.
En el proceso global se toman 5 H+ de la matriz y un H+ de la oxidación del NADH, de estos: 4 pasan al espacio
intermembranoso y los otros 2 son usados para obtener el QH2
19
Otras vías de transferencia de electrones
Hay otras dos deshidrogenasas que pueden transferir e- al CoQ, recogen los e- de poder reductor generado en
las vías metabólicas:
− La β-oxidación de ácidos grasos (TEMA 4) produce una serie de FADH2 en la matriz, y en este caso, un
FAD del Acil-Coa deshidrogenasa que lo pasará a otra proteína que tiene FAD, y finalmente lo pasará
al EFT CoQ oxidorreductasa (proteína con FAD) → dará los e- al CoQ → QH2.
El metabolismo de ácidos grasos también dará NADH, los cuales si entrarán al complejo I
− Parte de la glicólisis, en algunos tejidos, como el músculo (TEMA 3) → se obtienen NADH que no se
transportan dentro de la mitocondria en la lanzadera habitual, sino que se dan en una molécula que
tiene un FAD (Glicerol-3 Fosfato deshidrogenasa). Esta proteína está en la membrana interna de la
mitocondria, de modo que, el FAD pasa directamente al CoQ de la membrana mitocondrial→ QH2.
En el musculo y otros tejidos los electrones pasan con glicerol 3-fosfato que puede atravesar la
membrana externa de la mitocondria. Otros electrones del citosol atraviesan la membrana externa
mediante la lanzadera malato-asparato. TEMA 3
Coenzima Q
El CoQ (o CoQ10) no está unido a ninguna proteína.
Tiene una cadena lateral hidrofóbica que le confiere hidrofobicidad y, por tanto, el CoQ es capaz de difundirse
dentro de la membrana mitocondrial interna haciendo de lanzadera entre los complejos I o II y el complejo III.
20
2.4.6 COMPLEJO III: COMPLEJO CITOCROMO BC1/ QUINOL: CITOCROMO C REDUCTASA (O UBIQUINONA:
CITOCROMO C OXIDORREDUCTASA
El complejo III es una proteína grande formada por 9-10 cadenas polipéptidicas. Los elementos que intervienen
en las reacciones REDOX:
− 2 citocromos b
− 1 citocromo c1
− 1 agrupación de 2 ferro-sulfatado.
Cada uno de los citocromos que forman parte de este complejo solo pueden captar un electrón, sin embargo,
el Co Q puede portar 2e- hasta el citocromo C, captando un solo 1e-, por ello es necesario un mecanismo de
retención que impida perder el otro electrón restante. Este funciona de la siguiente manera:
− Primer electrón: el CoQ (ubiquinona) reducido (QH2) llega al complejo lll, de modo que transferirá uno
de los e- a un centro hierro sulfatado, y este lo pasará al citocromo c1 (aun dentro del complejo lll). Y
entonces, es cuando este lo pasará al cyt c, elemento móvil situado en el espacio intermembranal
(soluble, molécula pequeña) portándolo hacia el siguiente complejo.
− Segundo electrón: se queda retenido en el cyt b, este tiene dos grupos hemos (bL y bH). Entonces, el
e- pasará primero a un grupo hemo y luego al otro, que lo acabará dando a otro CoQ oxidado→ al
unirse este e- quedará en su forma semirreducida = semiquinona.
En este proceso, los 2H+ que deja ir el primer QH2 que llega al complejo III pasan al espacio intermembranal.
Para que la semiquinona (Q-) se reduzca totalmente, vuelve a aparecer otro CoQ reducido (QH2) de otro NADH,
y repite el mismo proceso. El primer e- lo pasa hasta el cyt c, y el segundo e- lo dará al CoQ que estaba
semirreducido, de modo que acabaríamos obteniendo un CoQ totalmente reducido (QH2), los dos protones
que necesita los toma de la matriz. Por lo que, de 2 CoQ que han pasado recuperamos uno. De modo que al
final por cada 2e- que se pasan a 2Cyt C se bombean 4H+.
Tened en cuenta que además sale un QH2, por eso en el proceso global, solo aparece uno. Este QH2 que sale
puede ser reutilizado por el complejo III.
21
2.4.7 COMPLEJO IV / CITROCROM C OXIDASA
Está formado por 13 polipéptidos y en referente a los elementos
que se oxidan y reducen, tenemos dos grupos hemo A (A y A3) y dos
centros de cobre (CuA y CuB). Los Cyt A3 y CuB están formando un
núcleo llamado complejo binuclear. De modo que:
Resumen: tenemos que de 2 CytC reducidos (1e- por cada uno), se reduce media molécula de O2 y de 4H+ de
la matriz: dos son usados para formar H20 y dos son transportados al espacio intermembrana.
− Complejo I → 4H+
− Complejo II → 0H+
− Complejo III→ 4H+
− Complejo IV → 2H+
22
La acumulación de H+ en el espacio intermembrana en contra de gradiente, provoca que el paso contrario, de
intermembrana a matriz sea un paso espontáneo (a favor de gradiente), e impulsará la síntesis de ATP. Esta
G negativa, originada por el paso de protones hacia la matriz se denomina fuerza protón-motriz1.
Los protones son la moneda de cambio que nos permite acoplar dos procesos que por sí solos serían
independientes, y son:
Si no hay transporte de e- por la cadena no se puede sintetizar ATP, porque no tendríamos protones en el
espacio intermembranal que generen la fuerza protón-motriz.
Pero también pasa al revés, si no sintetizamos ATP acabamos por perder el transporte de e- a través de la
cadena. Porqué al sintetizar el ATP (mediado por una ATPasa) se pasan H+ del espacio intermembranal a la
matriz, por lo que, el proceso de síntesis de ATP disipa el gradiente, es decir que las diferencias de concentración
de protones en la matriz y en el espacio intermembranal sea menor.
(↑C2) /C1 y ↑ = ↑ΔG → cada vez se necesitaría más energía libre para pasar los protones fuera de la matriz,
y por tanto, la oxidación de NADH (pérdida de los 2e-) es más difícil.
EN RESUMEN:
− Si hay síntesis de ATP: se facilita la disipación del gradiente y la oxidación del NADH.
− Si no hay síntesis de ATP: los protones no pasan a la matriz y por lo tanto se necesitará más energía
para que los complejos transporten protones hacia el espacio intermembranal y se dificulta la
oxidación de NADH
23
4.5 ESTRUCTURA DE LA ATP SINTASA (COMPLEJO V) Y MECANISMO DE SÍNTESIS
Es una proteína con muchas subunidades, que
podemos dividir en dos partes:
Proceso de Fo: los e- entran en C y giran → las subunidades gamma y épsilon (superiores en la imagen), que
forman parte de F1 también girarían (sin transferirse a las unidades catalíticas alfa y beta). Las alfa y beta están
en contacto con delta, que a su vez delta está unido a b2, que está anclado a la membrana y a la subunidad alfa
de la membrana, permitiendo el deslizamiento del cilindro sin hacer girar a toda la membrana.
F1 → matriz mitocondrial.
Función: responsable de síntesis ATP, se encuentra en la matriz de la mitocondria. Está formada por
diferentes subunidades, estas subunidades no rotan.
2 Fo no es lo mismo que F0 (cero), la subunidad se denomina Fo → porque está formado por liomesina, molécula
24
comporta el rápido equilibrio del ADP+Pi con el ATP en la superficie del enzima. Finalmente, la subunidad
cambia hacia la conformación de β-vacía, que tiene una afinidad muy baja por el ATP, por lo que el ATP recién
sintetizado se libera de la superficie del enzima. Cuando esta subunidad vuelve a adoptar la conformación β-
ADP, se une ADP+Pi, con lo que se inicia otra ronda. Por cada 3H+ se sintetiza 1 ATP.
Explicación extra
Con cada rotación de 120º, gamma se pone en contacto con una subunidad β diferente, y el contacto
provoca el cambio de conformación de la subunidad a la β-vacía.
Las tres subunidades β interaccionan de tal modo que cuando una adopta la conformación β -vacía, la
vecina de lado ha de adoptar la conformación β-ADP y la del otro la β-ATP. Por lo tanto, una rotación
completa de la subunidad y provoca que cada subunidad β se cicle a través de sus tres conformaciones
posibles, y en cada rotación completa se sintetizan y se liberan de la superficie del enzima tres moléculas
de ATP, lo cual consumirá 9 H+.
3
Respuesta ROSER: la membrana mitocondrial externa es muy permeable a moléculas pequeñas ya que
tiene unos canales inespecíficos (VDAC, pero no os dije el nombre en clase), por lo que se considera que
desde el citoplasma moléculas como ATP, ADP, fosfato inorgánico, piruvato, malato .... pasan libremente
al espacio intermembranal. La membrana mitocondrial interna es "mucho menos permeable" y cada
soluto debe tener su transportador selectivo.
4
El FADH2 proviene del complejo II, por eso no rinde los 4H+ que pasan por el complejo I cuando se oxida
NADH.
25
RELACIÓN P/O: relación de ATP formado por O2 consumido → ecuación anterior. Es una medida de la eficiencia
de la fosforilación oxidativa respecto a la respiración.
En condiciones fisiológicas, una mayor cantidad de O2, no implica un mayor transporte de normales e- y en
consecuencia más ATP. Sino que (en normoxia) el O2 no es limitante y su consumo se ve regulado por las
necesidades celulares de energía, es decir, por el [ADP] mitocondrial. No se da este caso porque siempre
tenemos suficiente O2, el elemento limitando sería realmente la cantidad de ADP mitocondrial disponible para
formar ATP, lo cual es regulado por las necesidades energéticas de la célula.
Estrés energético
1. Si tenemos mucho consumo de ATP (↓), normalmente ↑[ADP] en la célula, ↓ la carga energética.
2. La disminución de la carga energética celular produce una activación del ciclo de Krebs (↑[NADH]) y
activación de PDH, además de la activación de la glucólisis y oxidación de ácidos grasos →
favorecemos el catabolismo.
3. Producimos más NADH → ↑ [NADH] implica tener más sustrato para el transporte de e-, pero a la
vez, la ↓ ATP en la célula, hace que el ADP dentro de la mitocondria no sea limitante por lo que
podemos incrementar la síntesis de ATP.
4. El aumento de síntesis de ATP hace que el gradiente entre P y N5 disminuya, porque sintetizamos ATP
(retornando H+ a matriz), favoreciendo a la misma vez el transporte de e-.
Exceso de ATP
1. Si ↑ la carga energética, esto limita el ADP dentro de la mitocondria.
2. Si el ADPn está limitado, la síntesis de ATP se reduce.
3. Se incrementa el gradiente de H+, siendo C2>C1 → dificulta el transporte de e- por la cadena, es decir
se da una reducción transporte.
Hipoxia
1. Tenemos una disminución del O2 que en este caso SÍ es limitante.
2. Al no tener o tenerlo disminuido el aceptor final de la cadena de e- → se limita el transporte de e- en
la cadena.
3. Al limitarse el transporte induce a que no haya H+ en el espacio intermembrana, produciendo una
disminución de H+ para la síntesis de ATP.
4. Al mismo tiempo que se reduce el O2:
− Se activa HIF-1 (FT que se activa en hipoxia) → provoca la expresión de una subunidad del
complejo IV menos eficiente (hipoxia de forma crónica) pero que aumentará el transporte
de e-.
− La activación de HIF-1 → aumenta la expresión de la PDH quinasa que regula negativamente
la PDH → menos Acetil Coa = menos poder reductor = menos transporte de e-.
− Se activa IF1 que inhibe la actividad ATPasa de la ATPsintasa. (Esta vía es más rápida ya que
no implica expresión génica)
5
P →Matriz; N→ espacio intermembrana
26
5. Por lo que al final se provoca que se reduzca la síntesis y que tampoco se realice.
27
4.8 FORMACIÓN DE ESPECIES REACTIVAS DE O2
En el complejo lV, cuando se reduce el O2, se reduce
completamente a H20, es un sistema perfecto. Pero
existe un 1% de O2 de la célula puede estar en
contacto (por ejemplo) con el CoQ, y este podría
transferirle un e-, impidiendo su conversión a H20 y
favorecerá su conversión a ión superóxido. Esta
situación suele darse cuando oxígeno toma electrones
de los complejos de la cadena de transferencia de e-
(especialmente en el complejo III).
El ion superóxido es muy reactivo, porque intenta aparear sus e-, de modo que puede:
− Unirse a un electrón y dos H+ para formar H2O2 (peróxido de oxígeno) → es una molécula sin e-
desapareados, pero sigue siendo muy reactiva, con mucha tendencia a reaccionar.
− Unirse a un H2O2 (reacción de Haber-Weiss), formando O2, agua y radical Hidroxil (-OH)
El H2O2 puede unirse a un e- (reacción de Fenton) y se nos puede formar otro radical de oxígeno que es el
radical de hidroxil (-OH) junto con un grupo hidroxilo (OH-).
28
− Fallo renal aguda − Enfermedades cerebrovasculares
− Síndrome de Down − isquemia; daño a reperfusión
− fibroplasia retrolental
El glutatión reducido es un tripéptido formado por un residuo de glutamato, cisteína y glicina. La cadena lateral
de la cisteína contiene un grupo tiol potencialmente oxidable. La enzima glutatión peroxidasa oxidará dos
grupos tiol formando un puente disulfuro (S-S) entre ellos, y reducirá (ganar e-) en el proceso una molécula de
peróxido de hidrógeno a dos aguas. Asimismo, el glutatión puede reactivar enzimas que por estar oxidadas se
encuentran de forma inactiva.
22
dañado la célula (p. ej. la membrana mitocondrial), la salida del citocromo c mitocondrial al citosol activa una
proteasa (caspasa 9), desencadenando el inicio de apoptosis.
También se pueden eliminar las especies reactivas de oxígeno mediante la presencia de vitaminas, cofactores
enzimáticos los cuales son antioxidantes por que evitan que estos radicales libres oxiden otras moléculas y
perjudiquen a otros tejidos.
Son las vitaminas E y C (la vitamina E es liposoluble y la C es hidrosoluble), ambas trabajan de forma coordinada
y lo hacen gracias a un anillo aromático que poseen en el cual tienen un doble enlace conjugado y eso les
permite dar el átomo de hidrógeno a radical de oxígeno y lo reducen.
Por ejemplo, se intercalan entre los ácidos grasos de la membrana agentes oxidantes y los oxida, para
contrastar este efecto tenemos a la vitamina E insertada en la membrana y es su anillo el cual puede captar el
radical libre de oxígeno para reducir a los ácidos grasos y, por lo tanto, ella se oxida.
Tenemos la vitamina E oxidada y lo que hay que hacer es regenerarla con ayuda a la vitamina C captando el
electrón de más que posee la E. Finalmente, oxida la C y se libera en la orina.
Un haz enfocado de radiación produce un flujo de radicales hidroxilos de agua y radicales orgánicos en el lugar
del tumor, oxidante y destruyendo al ADN de la célula tumoral y adyacentes
Cuando hay una infección bacteriana las células que combaten esta infección suelen ser neutrófilos o
macrófagos.
Cuando entra una bacteria reconoce que es externa y la ataca mediante anticuerpos y en la membrana de
macrófago hay receptores de estos anticuerpos.
Lo que hace es fagocitar a la bacteria y este fagosoma se fusiona con un lisosoma y forma el fagolisosoma.
también se puede fusionar con orgánulos que poseen proteínas en su interior para destruir a la bacteria.
Se produce ahora un estallido respiratorio, es decir, se consume una elevada concentración de oxígeno por
parte de la NADPH oxidasa que se encuentra anclada en la membrana y lo que hace es sintetizar el radical
superóxido.
Después puede actuará la Superóxido dismutasas que convierte el radical superóxido en H2O2. También
mediante la MPO se produce la transformación de H2O2 con H+ Y CL- en ácido hipocloroso HCLO.
29
El H2O2 y el HClO son bactericidas que degradan lípidos, proteínas y DNAs bacteriano
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SAT 1
INTRODUCCIÓN AL METABOLISMO
SAT 1 INTRODUCCIÓ METABOLISME 1 1 Març 2021
1. Laconcentració d’ATP, ADPi AMP ales cèl·lules musculars esquelètiques en repòs és de 5 mM, 1 mM i 0.1 mM respectivament.
A) Calcula les concentracions finals i el percentatge de canvi d’aquests metabòlits després d’un esforç de contracció que implica la
utilització d’un 25 % de l’ATP de la cèl·lula.
ADP 1 2,25 1 0%
Esto se debe a que el ATP al hidrolizarse para aconseguir energia se transforma en ADP, y luego a través de la via de la via de
la adenilato quinasa el ADP formará un ATP y un AMP, por eso la mitad de ADP conseguido se transforma en ATP y la otra
mitad en AMP.
B) L’AMP és un modulador al·lostèric positiu de l’AMPK. En aquesta taula es mesura l’augment en l’activitat catalítica de l’enzim
AMPK quan fosforila i activa a la proteïna AS160.
Quina conseqüència té aquesta despesa d’ATP per al transportador GLUT4, i quina resposta metabòlica s’activa a la cèl·lula
muscular per respondre a aquesta demanda energètica?
Cuando el ATP se desfosforila y se produce AMP, entonces el AMPK se activa y fosforila (activandola) la proteïna AS160, esta
proteïna es la encargada de regular el trafico vesicular de las vesiculas que contienen la GLUT4 y por lo tanto estas proteïnes
asarán de estar en la vesícula a encontrarse en la MP para poder captar glucosa e introducirla a la cél·lula. Esta glucosa podrá
ser utilizada para recuperar la energia perdida.
C) El transportador GLUT4 també pot ser regulat per una hormona. Digues quina i descriu la senyalització
La hormona que puede regular el GLUT4 es la insulina. La insulina se libera cuando hay mucha glucosa en sangre y se colocan
en los receptores de insulina. La insulina activa 3 vias, la que se encarga de la activación del GLUT4 es la de la fosfatidinisitol
3-quinasa, que se encarga de fosforilar lípidos.
Esa encima fosforila la PIP2 y la transforma en PIP3 (segundos mensajeros, ya que hay muy poca concentración cuando la
célula no esta estimulada y augmenta drasticamente), habrá 3 proteinas que serám atraidas por el PIP3, la PDK1, la mTORC2 y
la PKB, las 2 primeras fosforilan a la ultima que serà el efector final de esta vía. PKB también fosforila AS160 y por lo tanto
también hará que GLUT4 pasé de la vesícula a la membrana plasmàtica.
D) Creus que el destí de la glucosa serà el mateix quan la seva captació ha estat estimulada per insulina o per despesa
energètica?
No, cuando ha sido estimulado por la insulina se va a almacenar en forma de glicogeno (activando la hexoquinasa y la
glicogeno sintasa), mientras que si se ha estimulado por una perdida de energia se usarà esta glucosa para reponer el ATP
perdido (ruta catabòlica de la glucosa).
E) Proposa un mecanisme pel qual la metformina, fàrmac prescrit pel tractament de la diabetis tipus 2 des de fa vàries
dècades, pot exercir els seus efectes hipoglucemiants a nivell muscular.
La metformina es una encima que provoca el augmento de la concentración de AMP, gracias a la inhibición (no completa) del
complejo 1 de las mitocondrias (encargada de hacer la cadena de transporte electrénico), lo que provoca un augmento de
AMP y una disminución de ATP. Por lo tanto tiene una función parecida a la insulina, ya que al augmentar el AMP se activa
AMPK, el cual activará AS160 y los receptores de glucosa GLUT4 saldran a la membrana plasmática para introduir la glucosa
dentro de las células. Pero como se augmenta la concentración de AMP, se inhibe la adenilil ciclasa lo que no deja produir
PKA y se ve inhibida la capacidad de la célula para sintetizar glucogeno.
2. Regulació del metabolisme. Respon a les següents preguntes.
A. Fes un esquema per explicar com la glucogen sintasa (principal enzim de la síntesis de glucogen) del fetge pot ser
inhibida per adrenalina actuant a través de dos tipus de receptors adrenèrgics diferents.
B. Compara la regulació de la glucogen sintasa amb la de la de la glucogen fosforilasa, enzim clau de la ruta de
degradació del glucogen.
D. Com pot ser que una mateixa hormona o transmissor desencadeni respostes fisiològiques diferents en diferents
teixits?
Puede ser que una misma hormona active diferentes receptores (como en el caso de la adrenalina) y cada receptor active
una vía diferente. Otro ejemplo es en las proteínas G triméricas, la subunidad α es distinta (s, i, q) i cada tipo de subunidad
hace acciones distintes.
SAT 2
BIOENERGÉTICA Y REGULACIÓN
ENZIMÁTICA APLICADA AL CICLO
DE KREBS
SAT2:
BIOENERGÉTICA Y REGULACIÓN ENZIMÁTICA APLICADA AL CICLO KREBS
1. Citrato está formado por la condensación de acetil-CoA con oxalacetato, una reacción catalizada por
citrato de sintasa:
OXALACETATO + ACETIL-COA + H2O CITRATO + COA
Calcular G en condiciones fisiológicas y decirnos cuál es la dirección del flujo metabólico a través de la
reacción de la citrato sintasa en células hepáticas en condiciones estándar y fisiológicas.
NOTA: EL CITRATO
PUEDE SALIR DE LA
MITOCONDRIA CON
LA FINALIDAD DE
SINTETIZAR ACIDOS
GRASOS
La dirección del flujo metabólico tanto en condiciones estándar como en condiciones fisiológicas es la marcada
por el enunciado, es decir se sintetiza citrato a través de oxalacetato. La reacción en condiciones fisiológicas,
es menos exergónica que la normal, sin embargo sigue siéndolo y como consecuencia esta se desplazará hacia
los productos y ocurrirá de manera espontánea.
Malato= 0,20 mM; NAD+ = 1 mM, NADH=0,006 mM y oxalacetato= 0,0001mM (ignora H ++ para este
ejercicio).
1
d) ¿Esta reacción está en equilibrio en condiciones fisiológicas?
No se encuentra en equilibrio en condiciones fisiológicas debido a que el incremento de energía libre es menor
que cero por lo tanto se desplazará hacia los productos aunque en menor medida que la reacción en
condiciones estándar. Sin embargo, se trata de una reacción la cual se halla muy cerca del mismo y un ligero
cambio en las concentraciones de los reactivos o productos generará un cambio en el sentido de la reacción.
3. Utilizando los cálculos de los años anteriores, responda a las siguientes preguntas:
En condiciones estándar posee Gº positiva (29,7 KJ/mol) por lo tanto no podría tener lugar de manera
espontánea porque se necesitaría energía, es decir, la reacción es muy endergónica. En cambio, nuestro
organismo se encuentra bajo las condiciones fisiológicas las cuales permiten que se convierta en exergónica
con la finalidad de que el ciclo de Krebs pueda llegar a darse.
2
b) Explica qué reacción acoplada hace posible que la reacción de la malato deshidrogenasa tenga lugar
en la dirección malato al oxalacetato en las mitocondrias.
La reacción endergónica de la malato deshidrogenasa está impulsada por la reacción altamente exergónica
de la citrato sintasa que utiliza el oxalacetato producido. Hay que tener en cuenta que las concentraciones de
oxalacetato en condiciones fisiológicas son muy limitadas
En primer lugar, decir que si hay un elevado poder reductor no es necesario el ciclo de Krebs ya que es uno de
sus objetivos y este se inactivaría. En segundo lugar, se puede regular por que el NADH es el producto de la
reacción de la malato deshidrogena por lo que la inhibirá y lo que producirá es la síntesis de la malato, en vez
de oxalacetato, en definitiva genera una reducción de la concentración de oxalacetato. Producirá que la
reacción de la citrato sintasa se ve desfavorecida debido a que sufre una reducción de los reactivos.
d) ¿Cuál de las dos enzimas, malato deshidrogenasa o citrato de sintasa es una enzima que regula el
ciclo de Krebs?
Citrato sintasa esto se debe porque son muy exergónica por lo que se darán de manera espontánea e
irreversible y es necesario regularlas. Esta enzima es inhibida por alosterismo, competición y disponibilidad
de sustrato por las moléculas que podemos observar en la imagen superior.
NOTA: Las reacciones limitantes del ciclo de Krebs con la 1, la 3 y la 4 y estas están catalizadas por las enzimas
citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y la alfa cetoglutarato deshidrogenasa. Las tres reacciones son muy
exergónicas.
e) ¿Qué etapa (primera, última...) cataliza el citrato de sintasa dentro del ciclo Krebs? En
general, ¿las enzimas regulan las enzimas iniciales en las vías metabólicas?
Cataliza la primera etapa, las enzimas reguladoras se suelen encontrar al inicio de las rutas metabólicas esto
se debe a que son muy exergónicas, es decir, están muy lejos del equilibrio con la finalidad de no se gaste
energía de manera innecesaria. Además decir que marcan la dirección y la velocidad de la vía metabólica.
3
o Sustratos: Oxalacetato (4C) + Acetil-Coa (2C) + H2O
o Productos: Citrato (6C) + CoA-SH
o Tipo de reacción: hidrolisis
o Mecanismo de reacción: En esta reacción se libera el CoA-SH, la hidrólisis del Acetil-Coa es lo que
impulsa la reacción (por la rotura del enlace tioéster), siendo una reacción muy favorable
energéticamente.
f) ¿Cuáles son las otras enzimas reguladoras en el ciclo Krebs y cuáles son sus aumentos de energía
libre estándar? Si en condiciones fisiológicasestas son aún más negativas, ¿es lógico que regulen esta
vía metabólica?
Los enzimas reguladoras son isocitrato deshidrogenasa (-29,9 KJ/mol) y alfa cetoglutarato deshidrogenasa (-
33,5 KJ/mol). Tiene sentido porque son unas etapas que son muy exergónicas y son la que se darán de manera
espontánea por lo tanto son las que interesa regular.
4. Hay diferentes maneras de regular las vías metabólicas variando la actividad de las enzimas que catalizan
las etapas limitantes de estas.
o Esto implica la unión o no a una subunidad reguladora que puede ser activadora o inhibidora, puede
suponer la translocación del enzima desde un compartimento al compartimento donde debe realizar
su función o la degradación del enzima o aumentar su capacidad catalítica, por ejemplo.
4
b) En el ciclo Krebs, ¿qué tipo de regulación tienen las enzimas reguladoras?
1. El ATP y el NADH son reguladores ALOSTERICOS negativos ya que si tenemos mucha cantidad
significa que no hace falta conseguir más energía ni poder reductor por lo tanto el ciclo de Krebs
no debe activarse, en cambio el ADP es un regulador alostérico positivo.
2. Se ve activado cuando las concentraciones de calcio son elevadas ya que, eso es sinónimo de
contracción muscular y por lo tanto, gasto energético y provoca una disminución de ATP.
Implicando la activación del mismo.
3. Regulación por competición con los sustratos de estas reacciones; citrato y Succinil-CoA son
reguladores negativos. El citrato compite con el oxalacetato y el Succinil-CoA con acetil-CoA para
unirse.
4. Regulación por disponibilidad de sustratos como por ejemplo la baja concentración de
oxalacetato.
En este caso de regulación tenemos dos enzimas que se encargan de funciones opuestas; tenemos en primer
lugar, la piruvato deshidrogenasa fosfatasa que se activa en presencia de calcio del musculo y además de
insulina y en segundo lugar, tenemos a la PDH QUINASA que se inactiva con la presencia de ADP, PIRUVATO y
CALCIO MUSCULAR (actúa como segundo mensajero a nivel de la isocitrasa y la alfa cetoglutarato
deshidrogenasa).
d) ¿Cuál es, por lo tanto, el tipo de regulación mayoritaria de la fase común del metabolismo
oxidativo? ¿Podría explicar si tiene sentido?
La regulación mayoritaria en la fase comuna del ciclo de Krebs es la regulación alostérica debido a que se
produce de manera más rápida y más eficiente tiene sentido ya que es una ruta muy importante de la cual
depende la gran mayoría de reacciones tanto anabólicas como catabólicas. Si tratamos con una regulación
lenta como puede ser la regulación covalente puede que no se resuelva el problema de forma adecuada.
5
5. Llevas tres días sin comida debido a la gastroenteritis. Por suerte para usted, durante el ayuno triglicéridos
de tejido adiposo se movilizan que aumentan la concentración de ácidos grasos en la sangre. También se
movilizan proteínas. Teniendo en cuenta que el hepatocito puede obtener NADH y acetil-CoA de ácidos grasos
y piruvato de proteínas, razonó:
La enzima carboxilasa en condiciones fisiológicas suele estar inactivada es decir tiene una actividad nula. Se
activa cuando la concentración de Acetil-CoA es alta.
Nos damos cuenta que esta se regula de manera alostérica por el Acetil-CoA y que el Acetil-CoA regula tanto la
enzima piruvato carboxilasa como la piruvato deshidrogenasa tiene sentido esta doble regulación para evitar
excesos de Acetil-CoA que esto ocurre cuando hay mucha degradación de ácidos grasos:
o Si la carga energética es baja hay poco ATP lo que genera es la síntesis de oxalacetato por lo que se
activa la carboxilasa y con ello se activará el ciclo de Krebs.
o Si la carga energética es alta lo que producirá es la inhibición de ambas enzimas y hará que el
oxalacetato pase a glucosa haciendo la gluconeogénesis en el hígado. Esto es importante en el hígado
en ayunas el cual obtiene mucho acetil-CoA y NADH de la oxidación de ácidos grasos y piruvato de la
degradación de aminoácidos o del lactato.
o La acumulación de acetil-CoA estimula la síntesis de oxalacetato a partir de piruvato.
Tenemos mucho NADH por lo tanto la dirección de la reacción será de oxalacetato a malato.
e) ¿Se activará el ciclo Krebs? ¿Cuál será el destino del oxalacetato formado por carboxilasa piruvato?
Si, pero su velocidad disminuirá por la enorme cantidad de poder reductor y ATP que viene dada por la
oxidación de ácidos grasos y el destino del oxalacetato es la síntesis de glucosa a través de la transformación
del mismo a través de fosfoenolpiruvato mediante la PEP carboxilasa.
El acetil-CoA no puede convertirse en piruvato debido a que es irreversible dicha reacción, es decir, a partir de
ácidos grasos no se puede sintetizar glucosa. Otra cosa es que el acetil-CoA estimule la síntesis de glucosa. Lo
que ocurrirá con el Acetil-CoA es que se convertirá en cuerpos cetoicos.
Respecto a la creación de oxalacetato a partir del Acetil-CoA sino que los dos carbonos de este se desprenden
en forma de CO2 durante las 5 primeras etapas y de la sexta a la octava etapa se produce la regeneración de
oxalacetato.
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SAT 3
FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
SAT 3 – FOSFORILACIÓN OXIDATIVA
1. El síndrome de Leigh es UNA ENFERMEDAD NEURODEGENERATIVA hereditaria poco frecuente.
Por lo general aparece entre los 3 y los 12 meses de edad, aunque algunas personas no lo manifiestan hasta la
adolescencia o al comienzo de la edad adulta. La salud de las personas afectadas se deteriora rápidamente y no
hay tratamiento.
Busque información en libros de bioquímica o sitios web confiables y diga qué genes pueden ocurrir mutaciones
en pacientes con síndrome de Leigh y qué alteraciones en la fase común del metabolismo oxidativo tienen lugar.
El síndrome de Leigh es una enfermedad neurodegenerativa progresiva provocada porque los genes del
COMPLEJO PDH Y LOS COMPLEJOS 1 Y 4 DE LA CADENA RESPIRATORIA Y DE LA ATP SINTETASA se ven afectados
(disminuye o inhibe su efectividad).
El hecho de que afecten a estos complejos genera un fallo en el funcionamiento de la cadena de electrones por
lo tanto, impide que la síntesis de ATP en la mitocondria y por eso, la célula no genera suficiente energía.
o Su HERENCIA puede ser autosómica recesiva o ligada al sexo. Es una herencia ligada al sexo al
cromosoma X ya que, las mitocondrias tan solo se heredan de la madre.
A pesar de que la mitocondria cuenta con su propio ADN no es independiente de la participación del ADN
nuclear ya que, ambos participan en la codificación de las subunidades que conforman cada uno de la complejo
enzimáticos, a excepción del complejo 2 que esta exclusivamente codificado por el ADN nuclear.
Por lo tanto, dependiendo del complejo afectado y de su codificación el tipo de herencia puede ser:
Los CASOS MÁS REPORTADOS de este síndrome han sido identificados por mutaciones en el ADN mitocondrial
cuyo gen codifica para la subunidades ATP sintasa.
Los PRINCIPALES TEJIDOS que se ven afectados son los músculos y las neuronas (el 20% del O2 es usado a nivel
cerebral para mantener el potencial membrana).
Para DIAGNOSTICARLO se realizan biopsias musculares y TAC craneales.
1
2. La oligomicina es un antibiótico que puede ser muy tóxico para los seres humanos porque inhibe el Fo de la
ATP sintasa, mientras que 2,4-dinitrophenol es una molécula desacoplante que se había utilizado en las dietas
para bajar de peso, pero ahora está prohibido causar la muerte.
La OLIGOMICINA, inhibe la Fo por lo que NO PERMITE LA SÍNTESIS DE ATP porque inhibe la rotación de la ATP
sintasa y no puede ofrecer suficiente energía a la subunidad F1 que se encarga de la síntesis de ATP. En
consecuencia, EL PASO DE PROTONES por Fo se INHIBE y no se puede crear fuerza protón-motriz para que la F1
sintetice ATP.
Tampoco se consume ni se gasta O2 por lo tanto, su consumo disminuye respecto al funcionamiento normal.
El 2,4-dinitrophenol, es un agente desacoplante que tiene la capacidad de aislar el flujo de los electrones y el
bombeo de protones de la síntesis de ATP. Al disipar el gradiente de H+ provoca que la energía de la
transferencia de electrones no se utilice para la síntesis de ATP, sino que se pierde en forma de calor.
En resumen, al final lo que ocurre es que los protones se trasladen de la matriz al espacio intermembranoso por
unas proteínas desacoplantes (UCP) y desprendan calor.
2
CONSECUENCIAS: Produce menos ATP y fomenta la oxidación de reservar, la reducción de nutrientes
(combustibles oxidados) y se acumulan en forma de triglicéridos para suplir la falta de energía, dando lugar a
una pérdida de peso. Puede provocar una hipertermia, es decir, una subida de la temperatura corporal por la
disipación del gradiente de protones en forma de calor y causa la muerte.
b) Hay muchas patologías humanas en las que hay una mutación genética de una enzima metabólica,
pero hay CASOS RAROS en los que hay una falta de una enzima del ciclo Krebs o de un componente de
la fosforilación oxidativa, como el síndrome de Leigh.
Primeramente, decir porque son enfermedades raras, es porque al haber depleción muscular, no generan
glucosa y sin esta es imposible sobrevivir. Aquellos embriones que se les presenta esta enfermedad sufren una
muerte prenatal.
c) Por el contrario, hay muchos venenos que afectan la actividad y/o función de estas enzimas
y complejos proteicos. ¿Por qué crees que se debe?
Afecta a estas rutas que son comunes en todo el metabolismo y por lo tanto si las afectan no podemos obtener
energía. Si hubieran afectado a una ruta no común habría rutas alternativas para sintetizar energía, pero si
afectan a las dos no podemos obtener energía por ninguna ruta.
a) ¿Cuál es la diferencia entre las especies reactivas de oxígeno (ERO) y el radical libre?
Las especies de oxígeno reactivo (EOR o ROS por reactive oxygen species) INCLUYEN IONES DE OXÍGENO,
RADICALES LIBRES Y PERÓXIDOS tanto inorgánicos como orgánicos. Son GENERALMENTE MOLÉCULAS MUY
PEQUEÑAS ALTAMENTE REACTIVAS debido a la presencia de una capa de ELECTRONES DE VALENCIA NO
APAREADA. Estas especies se forman de manera natural como subproducto del metabolismo normal del oxígeno
y tienen un IMPORTANTE PAPEL EN LA SEÑALIZACIÓN CELULAR.
Un radical (antes radical libre) de oxígeno es una ESPECIE QUÍMICA (orgánica o inorgánica), caracterizada por
poseer uno o más ELECTRONES DESAPAREADOS, que proviene de una reducción del oxígeno incompleta. Se
FORMA EN EL INTERMEDIO DE REACCIONES QUÍMICAS, a partir de la ruptura homolítica de una molécula y, EN
GENERAL, ES EXTREMADAMENTE INESTABLE Y, POR TANTO, CON GRAN PODER REACTIVO Y DE VIDA MEDIA MUY
CORTA (milisegundos).
3
REDUCCION COMPLETA: Es cuando el oxígeno con cuatro protones da lugar a dos moléculas de agua.
REDUCCION INCOMPLETA: En primer lugar, el oxígeno capta un electrón y se forma el Superóxido el cual es un
radical. Después, vuelve a ganar un electrón y dos protones y es un agente muy oxidante pero, no es un radical
sin embargo, es una molécula que a través de dos reacciones nos puede dar radicales hidroxilo. Estas dos
reacciones son la de Fenton y la de Haber-Weiss.
b) Con la edad hay más mutaciones en el ADN mitocondrial y una reducción más insatisfecha del
oxígeno. ¿Cómo se relacionan estos dos fenómenos?
En primer lugar, estas reacciones incompletas se dan en la COENZIMA Q. Con la edad se acumulan radicales
libres, su ACUMULACIÓN y hace que las mitocondrias se vuelvan senescentes y por lo tanto, DISMINUYA LA
SÍNTESIS DE ATP.
Estos radicales libres afectan a los lípidos de membrana, al ADN mitocondrial (dañando a los complejos de
la cadena de transporte) y a nivel cerebral, puede producir enfermedades neurodegenerativas porque este
sistema es muy vulnerable al estrés oxidativo.
c) Echa un vistazo a las últimas imágenes del artículo 2 que tienes en el Campus
Virtual. ¿Cómo se retira el ERE de la celda? ¿Qué es un antioxidante?
Se eliminan con enzimas específicos para cada ERO. Una especie antioxidante es capaz de neutralizar
radicales libres y evitar reacciones de oxidación.
o ELIMINACIÓN DEL RADICAL SUPERÓXIDO mediante dos protones gracias a las Superóxido
dismutasas. Hemos pasado de tener un radical a una ERO.
o ELIMINACIÓN DEL PERÓXIDO DE HIDROGENO mediante la catalasa que da lugar a agua y
oxígeno, es catalizada por la peroxidasa la cual se une con una molécula de peróxido con otra
especie.
o LA GLUTATIÓN PEROXIDASA elimina el glutatión reducido. Es muy importante en los
eritrocitos.
4
NOTA: El glutatión es un tripéptido que tiene un grupo sulhidrilo libre que funcionan como donador de
electrones en una variedad de reacciones. Esos tres aa son la cisteína, el glutamato y la glicina.
La glutatión peroxidasa lo que hace es reducir la molécula de H2O2 mediante la formación de un enlace
disulfuro que a su vez produce la oxidación de los dos grupos tiol de las dos moléculas de glutatión.
Para reciclar el glutatión y que se pueda volver a dar la reacción, necesitaremos mucho poder reductor del
NADPH y lo hace la glutatión reductasa.
Por ejemplo, se intercalan entre los ácidos grasos de la membrana agentes oxidantes y los
oxida, para contrastar este efecto tenemos a la vitamina E insertada en la membrana y es su
5
anillo el cual puede captar el radical libre de oxígeno para reducir a los ácidos grasos y por lo
tanto, ella se oxida.
Tenemos la vitamina E oxidada y lo que hay que hacer es regenerarla con ayuda a la vitamina
C captando el electrón de más que posee la E. Finalmente, oxida la C y se libera en la orina.
d) Los macrófagos son células que fagocite bacterias. ¿Podría ERO ser beneficioso para los
macrófagos? Puede comprobar las últimas imágenes del tema 2 para responder.
Cuando hay una infección bacteriana las células que combaten esta infección suelen ser NEUTRÓFILOS O
MACRÓFAGOS.
Cuando entra una BACTERIA reconoce que es externa y LA ATACA MEDIANTE ANTICUERPOS y en la
membrana de macrófago hay receptores de estos anticuerpos.
Lo que hace es FAGOCITAR a la bacteria y este FAGOSOMA SE FUSIONA CON UN LISOSOMA y forma el
fagolisosoma. También se puede FUSIONAR CON ORGÁNULOS que poseen proteínas en su interior para
destruir a la bacteria.
Se produce ahora un ESTALLIDO RESPIRATORIO es decir, se consume una elevada concentración de
oxígeno por parte de la NADPH oxidasa que se encuentra anclada en la membrana y lo que hace es
SINTETIZAR EL RADICAL SUPERÓXIDO.
Después puede actuará la Superóxido dismutasas que CONVIERTE EL RADICAL SUPERÓXIDO EN H2O2.
También mediante LA MPO se produce la TRANSFORMACIÓN DE H2O2 CON H+ Y CL- EN ÁCIDO
HIPOCLOROSO HCLO.
El H2O2 y el HClO son bactericidas que degradan lípidos, proteínas y DNAs bacteriano
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PLAB 1
CONTROL DEL METABOLISMO DE
HIDRATOS DE CARBONO: AYUNO Y
DIABETES
PLAB 1 CONTROL DEL METABOLISMO
DE HIDRATOS DE CARBONO: AYUNO Y DIABETES
CONTENIDO
I Fundamentos de espectrometría
Ley de Lambert-Beer
II Determinación de la actividad Piruvato quinasa hepática
Cálculos y gráficas
Cuestiones
III Determinación de la concentración de glucosa en sangre
Cálculos y gráficas
Cuestiones
I. FUNDAMENTOS DE ESPECTROMETRÍA
Ley de Lambert-Beer
CÁLCULOS Y GRÁFICAS
1) Representar en unos mismos ejes los valores de absorbancia a 340 nm en función del tiempo, tanto de la
muestra A como de la muestra B (Valores de Tabla 1 en Gráfico 1). Aprovecha al máximo la dimensión del
papel cuando establezcáis las unidades de los ejes.
1
2) Determinar la caída de la absorbancia en un intervalo de tiemplo amplio (1 minuto es un intervalo práctico)
en el que el gráfico de las dos muestras tenga un comportamiento lineal.
* Situación de ayuno:
- Menor absorbancia de NADH
- Menos concentración de piruvato
- Glucólisis inhibida *
- Secreción de glucagón
*La inhibición nunca es completa. Las vías nunca pueden estar paradas completamente porque se necesitan
respuestas celular rápidas para hacer frente a las necesidades. Por tanto, tiene que haber un mínimo de
actividad en las vías para poder activarse fácilmente y responder rápidamente.
Nota: debería haber más diferencia de absorción entre las dos muestras. En la muestra A, la piruvato quinasa
tiene más actividad pero por errores en la técnica (pipeteo, etc) la absorbancia no me salió muy elevada. Aun
así, aunque no hay mucha diferencia, se puede observar que en la muestra A (más actividad de la piruvato
quinasa) la absorbancia es superior que en la muestra N (menos actividad de la piruvato quinasa)
2
CUESTIONES
La regulación de la piruvato quinasa es un claro ejemplo de que la insulina y el glucagón activan e inactivan
procesos antagónicos.
La INSULINA activa a PKB, la cual activa a una fosfatasa (PP1), que a su vez DESFOSFORILA a la piruvato quinasa
y la ACTIVA.
CÁLCULOS Y GRÁFICAS
1) Hacer el gráfico de las absorbancias de la recta patrón respecto a las concentraciones de glucosa que
contienen, e interpolar a través del gráfico los valores de glucosa de los sérums I y II de sus valores de
absorbancia.
3
2) Expresad los resultados en unidades internacionales, para convertir mg/dL a mM, tened en cuenta el peso
molecular de la glucosa (180 g/mol).
CUESTIONES
1) ¿Cuál muestra corresponde al sérum control y cuál al sérum diabético tipo I? Razona brevemente el
porqué.
El sérum CONTROL corresponde al sérum I porque los niveles de glucosa obtenidos (87,7 mg/dl) están dentro
de la normalidad (euglucemia).
El sérum DIABÉTICO corresponde al sérum II porque los niveles de glucosa obtenidos (243,46 mg/dl)
corresponden a una hiperglucemia.
En este caso, el enunciado nos indica que es diabético tipo I. Si no lo indicara, para confirmar si es tipo I habría
que detectar si hay insulina en sangre. Los diabéticos tipo I no secretan insulina, por tanto, no se detectaría
insulina.
Si se detectara insulina en sangre, se sospecharía de una diabetes tipo II. En este caso, la secreción de insulina
es correcta, el problema está en el receptor. Así pues, la respuesta a la insulina no es correcta y los niveles de
glucemia se elevan.
2) ¿Cuál seria la concentración de glucosa aproximada en un sérum de un individuo que ha estado en ayuno
24h?
La concentración de glucosa se mantendría estable porque para hacer frente a este ayuno el hígado está
produciendo glucosa (gluconeogénesis) y el páncreas está secretando glucagón, es decir, también está
favoreciendo la gluconeogénesis.