(a) Calcule el pH de una disolución 1M de NH4Cl (véase la

figura 2.19).
(b) Calcule el pH de la disolución resultante tras la adición de
10 mL de NaOH 1 M a 40 mL de NH4Cl 1M.(c)
(c) Calcule el pH de la disolución resultante tras añadir 30 mL
de NaOH 1 M a 40 mL de NH4Cl 1M.
(d) Calcule el pH de la disolución resultante tras añadir 40 mL
de NaOH 1 M a 40 mL de NH4Cl 1M.
Aminoácidos y proteínas
Aminoácidos
Las proteínas son polímeros constituidos por monómeros denominados aminoácidos proteicos
o naturales, los cuales son 20.

Cada uno de ellos posee un grupo amino (-NH2) y un grupo carboxilo (-COOH) unidos al
mismo átomo de carbono alfa se diferencian entre sí por el tamaño de sus cadenas laterales.
.
El grupo R da a cada aminoácido sus propiedades
distintivas. Los aminoácidos difieren en sus propiedades
Carbono alfa químicas y físicas, como tamaño, solubilidad en agua, carga
eléctrica, debido a sus diferentes grupos R.
 Clasificación de los aminoácidos
Los aminoácidos se agrupan en cuatro categorías según las propiedades de sus cadenas laterales así.

ALIFÁTICOS

NO POLARES

AROMÁTICOS

POLARES SIN CARGA

Aminoacidos CON GRUPOS ÁCIDOS

POLARES CON CARGA

CON GRUPOS BÁSICOS

 Aminoácidos no polares
Poseen cadenas laterales hidrofóbicas (H, alifáticos o aromáticos) que no interactúan con el agua por lo
tanto, se localizan al interior de la molécula de proteína de la cual hacen parte. Esta ubicación les impide
quedar en contacto con el agua.
 Aminoácidos polares
Son aminoácidos con cadenas laterales no cargadas pero polares o hidrofílicas (R: alcohol, tiol o
amida). Debido a sus cadenas polares estos aminoácidos pueden formar puentes de hidrógeno con el
agua y por su naturaleza hidrofílica tienden a ubicarse en la región externa de la molécula de la
proteína que estén constituyendo.
 Aminoácidos polares

La cisteína destaca en dos aspectos adicionales. En primer

lugar, la cadena lateral puede ionizarse a un pH
moderadamente alto

En segundo lugar, la oxidación de dos cadenas laterales de

cisteína produce un enlace disulfuro: El producto covalente de
esta oxidación se denomina cistina.

La cistina no aparece entre los 20 aminoácidos porque se forma

por la oxidación de dos cadenas laterales de cisteína y no está
codificada por el ADN

Estos tipos de enlaces disulfuro estabilizan la estructura activa

de una proteína que los contiene. estructura activa de una
proteína que los contiene.
 Aminoácidos básicos: Catiónicos

Son aminoácidos con cadenas laterales que poseen

grupos básicos cargados (grupo amina), carácter que
los hace muy hidrofílicos.

son fuertemente polares, por lo que suelen

encontrarse en las superficies exteriores de las
proteínas, donde pueden ser hidratados por el medio
acuoso circundante, o en las hendiduras de unión al
sustrato de las enzimas, donde pueden interactuar
con grupos polares del sustrato que se une a la
enzima
 Aminoácidos básicos: Catiónicos
La histidina es el menos básico de los tres, y su curva de valoración
muestra que el anillo de imidazol en la cadena lateral del aminoácido
libre pierde su protón aproximadamente a pH 6

Cuando la histidina se incorpora a las proteínas, el pKa suele oscilar

entre 6,5 y 7,4

El valor pKa de una cadena lateral ionizable depende de su entorno

electrostático. Así, cuando otros grupos cargados están en proximidad,
los pKas de las cadenas laterales ionizables pueden alterarse
significativamente con respecto a los valores normales

Dado que la cadena lateral de la histidina tiene un pKa cercano al pH

fisiológico, a menudo participa en transferencias de protones
(intercambio de iones hidrógeno ) durante la catálisis enzimática.
 Aminoácidos ácidos: Aniónicos
Tienen cadenas laterales ácidas que
terminan en grupos carboxilos como el
ácido aspártico y el ácido glutámico. Estos
aminoácidos están cargados negativamente
en la célula y por lo tanto siempre se hace
referencia a ellos como aspartato o
glutamato. Son muy hidrofílicos y se
localizan en la superficie de las proteínas.
 Aminoácidos esenciales en el ser humano y animales superiores

Aminoácidos esenciales Aminoácidos no esenciales

Histidina Alanina
Leucina Arginina
Isoleucina Asparagina
Lisina Acido Aspartico
Metionina Cisteína
Fenilalanina Glutamina
Treonina Acido glutámico
Triptofano Glicina
Valina Prolina
Serina
Tirosina
Propiedades físicas y químicas

Los distintos aminoácidos se distinguen por sus diferentes

cadenas laterales.

la mayor parte de la bioquímica tiene lugar en el intervalo de

pH fisiológico cercano a 7 (neutralidad).

Los pKas de los grupos ácido carboxílico y amino de los

aminoácidos son aproximadamente 2 y 10, respectivamente.
Cerca del pH neutro, entonces, el grupo ácido carboxílico se
desprotonará (-COO-), y el grupo amino se protonará (-NH3 +),
para producir la forma zwitterion Esta es la forma en la que
habitualmente se describe las estructuras de los aminoácidos
 Propiedades físicas y químicas
El carbono central de los 20 aminoácidos comunes está
hibridado sp3, están dispuestos en una geometría tetraédrica.
Cuando un átomo de carbono tiene cuatro sustituyentes
diferentes unidos a él, se dice que es quiral, o un estereocentro,
o (preferiblemente) un carbono asimétrico
Proyecciones de Fischer
• La estereoquímica de los aminoácidos
también puede representarse mediante
una convención conocida como
proyección de Fischer
• En una proyección de Fischer, todos los
enlaces se representan como líneas
continuas, en las que se entiende que los
enlaces horizontales se proyectan hacia
delante desde la página y los enlaces
verticales se proyectan detrás de la
página.
 Propiedades físicas y químicas
Los aminoácidos son compuestos sólidos; incoloros; cristalizables; de elevado punto de fusión (habitualmente por
encima de los 200ºC); solubles en agua; con actividad óptica y con un comportamiento anfótero.
1. La actividad óptica se manifiesta por la capacidad de desviar el plano de luz polarizada que atraviesa una
disolución de aminoácidos, y es debida a la asimetría del carbono , ya que se halla unido (excepto en la glicina) a
cuatro radicales diferentes. Esta propiedad hace clasificar a los aminoácidos en Dextrogiros (+) si desvían el plano
de luz polarizada hacia la derecha, y Levógiros (-) si lo desvían hacia la izquierda. L son los únicos aminoácidos
usados en las proteínas

No proteinogénicos Proteinogénicos
(amino a la izquierda) (amino a la derecha)
 Propiedades físicas y químicas

¿Cuál de las siguientes proyecciones de Fischer (a) - (d)

representa la l-serina? Tomar como punto de referencia
2. El comportamiento anfótero se refiere a que, en disolución acuosa, los aminoácidos son capaces de
ionizarse, dependiendo del pH, como un ácido (cuando el pH es básico), como una base (cuando el pH es
ácido) o como un ácido y una base a la vez (cuando el pH es neutro). En este último caso adoptan un estado
dipolar iónico conocido como zwitterión.

Ganancia de protón
Perdida de protón (ion
(ion amonio)
carboxilato)

Zwitterion
(Carga cero +A-)

Aminoácidos
neutros
Carga +1 Carga -1
Zwitterion
(Ambos grupos protonados: +A) (Ambos grupos desprotonados: A-)
(Carga cero +A-)
CATION ANION
3. El pH en el cual un aminoácido tiende a adoptar una forma dipolar neutra (igual número de cargas
positivas que negativas/neutralidad) se denomina Punto Isoeléctrico. La solubilidad en agua de un
aminoácido es mínima en su punto isoeléctrico.

El pH controla la carga de la glicina: catiónica

por debajo de pH = 2.3; aniónica por encima
de pH = 9.6 y zwitteriónica entre pH = 2.3 y
9.6. El pH isoeléctrico es 6.0.

El punto isoeléctrico es el pH al que el

aminoácido se encuentra en equilibrio entre
las dos formas, como el zwitterión dipolar con
una carga neta de cero.
 Punto isoeléctrico (pI)
Consideración 1.- La reacción de ionización es una reacción en el equilibrio; cada paso desde la
izquierda a la derecha supone la cesión de un H+:
aa+ + ↔ aa+ - ↔ aa- -
Ka1 Ka2

Consideración 2.- pKa es el pH al cual el ácido se encuentra semidisociado:

A pH = pKa1, tenemos que [aa+ +] = [aa+ -].

que [aa+ + ] = [aa - -]. pI = pH al que tenemos
A pH = pKa2, tenemos que [aa+ -] = [aa- -].
Aminoácidos Ácidos

Aminoácidos Básicos
Si pH del medio = pK del grupo [forma disociada] = [forma no disociada]

Si pH del medio es > pK del grupo entonces predomina la forma disociada

y [forma disociada] > [forma no disociada]

Si pH del medio es < pK del grupo entonces predomina la forma no disociada

y [forma no disociada] > [forma disociada]

Si pH del medio = pI del a.a carga eléctrica neta = 0 y no se desplaza en un

campo eléctrico

Si pH del medio es < pI del a.a carga eléctrica neta positiva y se desplaza al
cátodo en un campo eléctrico

Si pH del medio es > pI del a.a carga eléctrica neta negativa y se desplaza al
ánodo en un campo eléctrico
El aminoácido acido aspártico se ioniza según el siguiente esquema:

a) Calcula el punto isoeléctrico .

b) Calcula la carga media del ácido aspártico cuando pH = 10.2 (Sugerencia: Encuentre la carga media de cada
grupo ionizable y súmalos).
c) ¿Es razonable el valor de la carga media que calculó en la parte b, dado el pI que calculó en la parte a?
Explica tu respuesta.
El aminoácido arginina se ioniza según el siguiente esquema:

a) Calcula el punto isoeléctrico de la arginina. Puedes despreciar las contribuciones de la forma I. ¿Por qué?
b) Calcula la carga media de la arginina cuando pH = 9,20. (Sugerencia: Encuentre la carga media de cada
grupo ionizable y súmalos).
c) ¿Es razonable el valor de la carga media que calculó en la parte b, dado el pI que calculó en la parte a?
Explica tu respuesta.
 Separación de aminoácidos
Cuando una corriente eléctrica se usa para
separar una mezcla de aminoácidos
• Los aminoácidos cargados
positivamente se mueven hacia el
electrodo negativo
• Los aminoácidos cargados
negativamente se mueven hacia el
electrodo positivo
• Un aminoácido a su pI no migra
• Los aminoácidos se identifican como
bandas separadas en el papel de filtro o
en las placas de capa fina
Importancia de los grupos en la cadena R de los aminoácidos
En las cadenas laterales de los aminoácidos están presentes diferentes grupos químicos según el
aminoácido especifico que se trate. Estos grupos tienen importancia en la determinación de la estructura
tridimensional que adopten las proteínas.

Grupos Enlace o interacción

Entre un grupo básico con carga + y un grupo ácido con carga - Unión salina
Entre las cadenas hidrocarbonadas de 2 aminoácidos apolares Unión hidrofóbica
Entre el –COO- de un aminoácido acido y otro con OH en R Puente de hidrógeno
Entre el NH3+ de un aminoácido básico y otro con OH en R Puente de hidrógeno
Entre dos aminoácidos con grupos OH en R Puente de hidrógeno
Entre dos grupos SH Puente disulfuro
Entre dos anillos aromáticos presentes en R Fuerzas de Van der Waals que en estos casos se conocen con el
nombre de apilamiento o stacking
 Péptidos
Los péptidos son cadenas lineales de
aminoácidos enlazados por enlaces químicos
de tipo amídico a los que se denomina
Enlace Peptídico. Así pues, para formar
péptidos los aminoácidos se van enlazando
entre sí formando cadenas de longitud y
secuencia variable. Para denominar a estas
cadenas se utilizan prefijos convencionales
como:
 Enlace peptídico: doble enlace parcial con momento dipolar.

Aminoácidos

Dipéptido
 Péptidos
Los oligopéptidos y polipéptidos se forman por
polimerización de aminoácidos. Los aminoácidos de
los oligopéptidos y polipéptidos se mantienen unidos
mediante péptidos. Todas las proteínas son
polipéptidos muchas proteínas tienen el grupo N-terminal bloqueado por
grupos N-formilo o N-acetilo, y unas pocas tienen el grupo C-
Las cadenas que contienen sólo unos pocos residuos terminal carboxilado y modificado a amidas.
de aminoácidos se denominan colectivamente
oligopéptidos. Si la cadena es más larga (es decir, 7
∼15-20 residuos), entonces se denomina polipéptido.

Se muestra que la mayoría de los oligopéptidos y

polipéptidos conservan un grupo amino sin
reaccionar en un extremo (denominado amino-
terminal o N-terminal) y un grupo ácido carboxílico
sin reaccionar en el otro extremo (carboxilo-terminal
o C-terminal).
 Polipéptidos como polianfolitos

Además del grupo amino libre en el extremo N-

terminal y el grupo carboxilato libre en el
extremo C-terminal, los polipéptidos suelen
contener algunos aminoácidos que tienen grupos
ionizables en sus cadenas laterales.

Estos diversos grupos tienen una amplia gama

de valores de pKa, pero todos son grupos
débilmente ácidos o básicos
 Polipéptidos como polianfolitos

las cadenas laterales de los aminoácidos muestran un rango de

valores pKa en diferentes proteínas debido a las diferencias en
el entorno electrostático local.

La cadena lateral del ácido glutámico libre, o ácido glutámico

en un entorno electrostático no perturbado ambiente
electrostático, se disociará con un pKa cercano a 4,2.
 Polipéptidos como polianfolitos
Cuando el entorno de la cadena lateral se ve perturbado por la
proximidad de un grupo cargado (-), la disociación de protones se ve
desfavorecida porque la desprotonación de la cadena lateral del ácido
glutámico produce interacciones electrostáticas desfavorables con el
grupo cargado (-).
Se espera que el pKa de este ácido glutámico sea ˃ 4,2, ya que la
disociación de protones es menos probable en estas condiciones
Cuando el entorno de la cadena lateral se ve perturbado por la
proximidad de un grupo cargado (+), entonces se favorece la
disociación del protón porque la desprotonación de la cadena
lateral del ácido glutámico da lugar a interacciones
electrostáticas favorables con el grupo cargado (+).
Se espera que el pKa de este ácido glutámico sea ˂ 4,2, ya que
la disociación de protones es más probable en estas
condiciones.
El proceso de ionización de las cadenas laterales afecta a la carga
molecular de una proteína,

Valoración de Glu-Gly-Ala-Lys (Tetrapéptido). Si el proceso comienza

con el tetrapéptido en una solución muy ácida con pH = 0. A este pH,
que está por debajo del pKa de cualquiera de los grupos presentes, todos
los residuos ionizables estarán en sus formas protonados.

Es decir, ambos grupos amino estarán cargados positivamente y ambos

grupos carboxilo tendrán carga cero.

el tetrapéptido tiene una carga total de +2 a pH = 0.

Si aumentamos el pH de la solución (por ejemplo, valorando
con NaOH), los diversos grupos ionizables perderán protones a
valores de pH cercanos a sus valores de pKa

Las propiedades ácido-base de las cadenas laterales son de gran

importancia en bioquímica.

Un pequeño cambio en el pH puede alterar la disposición de

cargas que aparecen en la superficie, o en el sitio activo, de una
proteína y, por lo tanto, afectará significativamente a su
estabilidad y/o a sus propiedades funcionales.
 El enlace peptídico
1. El enlace peptídico es un enlace covalente y se establece entre el grupo carboxilo (-COOH) de un aminoácido y
el grupo amino (-NH2) del aminoácido contiguo inmediato, con el consiguiente desprendimiento de una
molécula de agua.
2. Por otra parte, el carácter parcial de doble enlace del enlace peptídico (-C-N-) determina la disposición espacial
de éste en un mismo plano, con distancias y ángulos fijos. Como consecuencia, el enlace peptídico presenta
cierta rigidez e inmoviliza en el plano a los átomos que lo forman.
 Estructura del enlace peptídico
El enlace peptídico tiene algunas propiedades muy importantes para la estructura de las proteínas

• Más rígido y corto que un enlace C-N simple

• Los átomos que participan (O, C, N, H) son coplanares
• El grupo de átomos alrededor del enlace peptídico puede darse en dos configuraciones posibles:
trans y cis
• Carácter parcial de doble enlace:
Se le puede considerar un híbrido de resonancia
No se permite giro alrededor del enlace -C-N-
Átomos coplanares
Por ejemplo, casi invariablemente los enlaces amida
carbonilo (C=O) y amida N-H son casi paralelos; de
hecho, los seis átomos unidos a los átomos que participan
en el enlace peptídico suelen ser coplanares. Hay poca
torsión posible alrededor del enlace peptídico porque el
enlace C- N tiene una fracción sustancial de carácter de
doble enlace.
El enlace peptídico puede considerarse un híbrido de resonancia
de dos formas: Los datos de cristalografía de rayos X de proteínas muestran
que el grupo de átomos alrededor del enlace peptídico existe en
dos configuraciones posibles, trans y cis, que están relacionadas
por rotación alrededor del enlace CCO-N

Carácter parcial de doble enlace

CONFORMACIONES POSIBLES

Normalmente se favorece la forma trans

porque los grupos R de los α carbonos
adyacentes pueden interferir estéricamente en
la configuración cis.

La principal excepción es el enlace en la

secuencia X-Pro, donde X es cualquier otro
aminoácido. En este enlace a veces se
permite la configuración cis, aunque se sigue
favoreciendo la configuración trans en una
proporción de aproximadamente 4:1.
Un enlace peptídico podría formarse por la La reacción no catalizada es extremadamente lenta a pH y
eliminación de una molécula de agua entre dos temperatura fisiológicos. los polipéptidos son metaestables,
aminoácidos. hidrolizándose rápidamente sólo en condiciones extremas o
cuando hay catalizadores presentes.
De hecho, este proceso es termodinámicamente
desfavorable en un medio acuoso como el que se
encuentra en las células.

El cambio de energía libre para la formación del

enlace peptídico a temperatura ambiente en una
solución acuosa es de aproximadamente +10 kJ/
mol,

por lo que la reacción termodinámicamente

favorable en estas condiciones es la hidrólisis del
enlace peptídico
Hidrólisis ácida
• La hidrólisis ácida se puede realizar en fase líquida o de vapor.
Aunque se puede usar una variedad de ácidos diferentes para
esta reacción, el más común es el HCl 6 M.
• Debido a que el HCl se evapora, también se puede utilizar para
recuperar el hidrolizado en cantidades más pequeñas de
solución tampón, una característica que es muy útil para
pequeñas cantidades de muestra.
• La reacción de hidrólisis ácida con HCl 6 M da como resultado
la adición de agua a cada enlace peptídico covalente,
produciendo los aminoácidos individuales deseados
Sin embargo, no todos los aminoácidos se recuperan
por completo bajo la hidrólisis con HCl. Algunos
aminoácidos se hidrolizan a sus formas ácidas, como
la asparagina y la glutamina, que forman ácido
aspártico y ácido glutámico, respectivamente.
Además, no se pueden determinar de forma fiable
otros aminoácidos.
Es un tratamiento duro que también destruye las
cadenas laterales de Asn, Gln y Trp (y en menor
medida Ser, Thr y Tyr).
 Hidrólisis alcalina

Se usa la hidrólisis alcalina o básica para determinar triptófano. Debido a que

el triptófano es estable en condiciones básicas, esta técnica proporciona una
cuantificación exacta de triptófano y se utiliza en gran medida para una
variedad de muestras, desde alimentos y piensos hasta péptidos y proteínas.

En condiciones alcalinas, la arginina,

La hidrólisis alcalina suele utilizar
la cisteína, la serina y la treonina se
NaOH o KOH como reactivo. Sin
destruyen y no se pueden cuantificar.
embargo, la hidrólisis alcalina no puede
Otros aminoácidos también se ven
sustituir a la hidrólisis ácida para la
afectados, por lo que la hidrólisis
cuantificación de todos los
alcalina se usa generalmente solo para
aminoácidos.
el triptófano.
 Los enlaces peptídicos pueden hidrolizarse para producir aminoácidos
individuales.

Hidrólisis Enzimática
Este proceso tiene lugar en el estómago, cuando enzimas como pepsina o
tripsina (proteasas) catalizan la hidrólisis de proteínas para producir
aminoácidos.

Esta hidrólisis interrumpe la estructura primaria al romper los enlaces

amida covalentes que unen los aminoácidos. En la digestión de proteínas,
los aminoácidos se absorben a través de las paredes intestinales y se
transportan a las células, donde pueden usarse para sintetizar nuevas
proteínas
Las enzimas proteolíticas o proteasas proporcionan un corte más específico en condiciones más
suaves.

Muchas de estas enzimas escinden sólo enlaces peptídicos específicos

Péptidos con actividad biológica

• HORMONAS: Insulina y glucagón (metabolismo de la glucosa)

• ANTIBIÓTICOS: Gramicidina S
• VENENOS: α-amanitina
• NEUROPÉPTIDOS: Encefalinas
• ANTIOXIDANTE: Glutation (g-glutamil-cisteinil-glicina)
• Conjugación con xenobióticos
• Paso de aa a través de la membrana plasmática
Proteínas
1. La palabra Proteína viene del griego : protos que significa primero.
2. Son el instrumento molecular a través del cual se expresa la información genética.
3. Todas las proteínas desde las más sencillas hasta las más complejas están constituidas por el
mismo tipo de subunidades: 20 aminoácidos.
4. Las proteínas están constituidas por cadenas de amino ácidos, unidos por un tipo específico de
enlace covalente.
5. La actividad biológica de una proteína depende en gran medida de la disposición espacial de su
cadena polipeptídica
6. Son imprescindibles para la síntesis de proteínas corporales y otros compuestos funcionales
como:
1. Hormonas
2. Anticuerpos
3. Neurotransmisores
4. Enzimas
 Funciones
Función ESTRUCTURAL

•Algunas proteínas constituyen estructuras celulares:

1. Ciertas glucoproteínas forman parte de las membranas celulares y actúan como receptores o
facilitan el transporte de sustancias.
2. Las histonas, forman parte de los cromosomas que regulan la expresión de los genes.

• Otras proteínas confieren elasticidad y resistencia a órganos y tejidos:

1. El colágeno del tejido conjuntivo fibroso.

2. La elastina del tejido conjuntivo elástico.
3. La queratina de la epidermis.

Las arañas y los gusanos de seda segregan fibroína para fabricar las telas de araña y los capullos de
seda, respectivamente.
Función ENZIMATICA

Las proteínas con función enzimática son las más numerosas y especializadas. Actúan como
biocatalizadores de las reacciones químicas del metabolismo celular.

Función REGULADORA

Algunas proteínas regulan la expresión de ciertos genes y otras regulan la división celular (como la
ciclina).

Función HORMONAL

Algunas hormonas son de naturaleza proteica, como la insulina y el glucagón (que regulan los
niveles de glucosa en sangre) o las hormonas segregadas por la hipófisis como la del crecimiento o la
adrenocorticotrópica (que regula la síntesis de corticosteroides) o la calcitonina (que regula el
metabolismo del calcio).
Función HOMEOSTATICA

Algunas mantienen el equilibrio osmótico y actúan junto con otros sistemas amortiguadores para mantener constante el
pH del medio interno.

Función DEFENSIVA

 Las inmunoglobulinas actúan como anticuerpos frente a posibles antígenos.

La trombina y el fibrinógeno contribuyen a la formación de coágulos sanguíneos para evitar hemorragias.
Las mucinas tienen efecto germicida y protegen a las mucosas.
Algunas toxinas bacterianas, como la del botulismo, o venenos de serpientes, son proteínas fabricadas con funciones
defensivas.

Función CONTRACTIL

La actina y la miosina constituyen las miofibrillas responsables de la contracción muscular.

La dineina está relacionada con el movimiento de cilios y flagelos.
Función de TRANSPORTE

 La hemoglobina transporta oxígeno en la sangre de los vertebrados.

 La hemocianina transporta oxígeno en la sangre de los invertebrados.

 La mioglobina transporta oxígeno en los músculos.

 Las lipoproteínas transportan lípidos por la sangre.

 Los citocromos transportan electrones.

Función DE RESERVA

 La ovoalbúmina de la clara de huevo, la gliadina del grano de trigo y la hordeina de la cebada, constituyen
la reserva de aminoácidos para el desarrollo del embrión.

La lactoalbúmina de la leche.

 Clasificación según composición química
1.Proteínas simples u Holo proteínas: Las cuales están formadas
exclusivamente o predominantemente por aminoácidos.

2.Proteínas conjugadas o Hetero proteínas : Poseen un componente de

proporción significativa no aminoacídico que recibe el nombre de grupo
prostético. Según la naturaleza de este grupo consideramos:
Hemoproteina

1.Hemoproteínas o Cromoproteínas: Proteínas que tienen en su Glicoproteina

estructura un grupo hemo Ejemplo: Hemoglobina, Mioglobina y ciertas
enzimas como los citocromos.
2.Glicoproteínas: Se caracterizan por poseer en su estructura azúcares.
Se pueden citar como ejemplo: las inmunoglobulinas, algunas proteínas
de membrana, el colágeno y otras proteínas de tejidos conectivos
(glucosaminoglicanos).
3.Lipoproteínas: Proteínas conjugadas con lípidos que se encuentran en
las membranas celulares.
4.Nucleoproteínas: Se presentan unidas a un ácido nucleico, como en los
cromosomas, ribosomas y en los virus.
5.Fosfoproteínas: Contienen en su molécula uno o más moléculas de
fosfato.
 Niveles estructurales
La estructura tridimensional de una proteína es un factor
determinante en su actividad biológica. Tiene un carácter
jerarquizado, es decir, implica unos niveles de
complejidad creciente que dan lugar a 4 tipos de
estructuras: primaria, secundaria, terciaria y cuaternaria.

Cada uno de estos niveles se construye a partir del

anterior.
Estructura primaria

La ESTRUCTURA PRIMARIA esta

representada por la sucesión lineal de
aminoácidos que forman la cadena
peptídica y por lo tanto indica qué
aminoácidos componen la cadena y el
orden en que se encuentran. El
ordenamiento de los aminoácidos en cada
cadena peptídica, no es arbitrario sino
que obedece a un plan predeterminado en
el ADN.
Esta estructura define la especificidad de
cada proteína.
 Estructura secundaria
Nuestra comprensión de la estructura secundaria de las
proteínas tiene su origen en el notable trabajo de Linus
Pauling.

Los seis átomos del grupo amida del péptido deben permanecer
coplanares con los α carbonos asociados en la configuración
trans; Por consiguiente, la rotación sólo es posible alrededor de
los dos enlaces adyacentes al carbono α en cada residuo de
aminoácido,

Es necesario algún tipo de enlace no covalente para estabilizar

un plegamiento regular. La posibilidad más obvia es el enlace
de hidrógeno entre los protones amida y los oxígenos carbonilo:
Estructura secundaria
La ESTRUCTURA SECUNDARIA está representada por la disposición espacial que adopta
la cadena peptídica (estructura primaria) a medida que se sintetiza en los ribosomas. Es debida
a los giros y plegamientos que sufre como consecuencia de la capacidad de rotación del
carbono y de la formación de enlaces débiles (puentes de hidrógeno). Las formas que pueden
adoptar son:

Hélice alfa: la cadena polipeptídica se

enrolla en espiral sobre sí misma debido a
los giros producidos en torno al carbono
alfa de cada aminoácido.
• La cadena se va enrollando en espiral.
• Los enlaces de hidrogeno intracatenarios mantienen la
estructura.
• La formación de estos enlaces determina la longitud del
paso de rosca.
• La rotación es hacia la derecha. Cada aminoácido gira
100º con respecto al anterior. Hay 3,6 residuos por
vuelta.
• Los grupos –C=O se orientan en la misma dirección y
los –NH en dirección contraria. Los radicales quedan
hacia el exterior de la α-hélice
• La estructura helicoidal es mantenida por la formación
de puentes de hidrógeno entre aminoácidos cercanos en
las vueltas del espiral
la hélice a se repite después de exactamente 18 residuos, lo que
equivale a 5 vueltas. Tiene, por tanto, 3,6 residuos por vuelta.
La longitud de la hélice a de 18 residuos es de 27 Å; por tanto,
el ascenso de la hélice a es de 1,5 Å/residuo. Como el paso de
una hélice viene dado por p = nh, tenemos para la hélice a:

Cuando se examine el modelo de la hélice a se observará que un

oxígeno carbonilo dado, en el residuo i, está unido por
hidrógeno al protón amida que está a cuatro residuos de
distancia, en la dirección del extremo C (es decir, en el residuo i
+ 4).
Láminas beta o láminas plegadas: formada por dos
o más cadenas polipeptídicas paralelas o
antíparalelas y se adosan estrechamente por medio
de puentes de hidrógeno y diversos arreglos entre los
radicales libres de los aminoácidos.
 Estructura terciaria
La ESTRUCTURA TERCIARIA esta representada
por los súper plegamientos y enrollamientos de la
estructura secundaria, constituyendo formas
tridimensionales geométricas muy complicadas que se
mantienen por enlaces fuertes (puentes disulfuro entre
dos cisteínas) y otros débiles (puentes de hidrógeno;
fuerzas de Van der Waals; interacciones iónicas e
interacciones hidrofóbicas).

Desde el punto de vista funcional, esta estructura es la

más importante pues, al alcanzarla es cuando la
mayoría de las proteínas adquieren su actividad
biológica o función (PROTEINA NATIVA).
Un DOMINIO es un subconjunto del plegamiento de un
polipéptido (estructura terciaria) que parece plegarse con cierta
independencia del resto de la estructura y está interconectado al
resto del plegamiento a través de un enlace peptídico, casi
siempre, aunque a veces, son dos o tres.
Existen dos formas básicas:

• Globular: alto grado de plegamiento y forma compacta. Son formas típicas en enzimas. Generalmente son
solubles en agua.
• Fibrilar: grado de empaquetamiento menor y forma alargada. Tienen funciones estructurales y generalmente
son insolubles en agua.

Globular ( albúmina, insulina, etc.)

Fibrosa (colágeno, elastina, queratina)

Estructura cuaternaria
La ESTRUCTURA CUATERNARIA está representada por el acoplamiento de varias cadenas poli
peptídicas, iguales o diferentes, con estructuras terciarias (protómeros) que quedan auto ensambladas
por enlaces débiles, no covalentes. Esta estructura no la poseen, tampoco, todas las proteínas. Algunas
que sí la presentan son: la hemoglobina y los enzimas alostéricos.
 Energía libre de Gibbs (G)

Cantidad de energía capaz de realizar trabajo durante una reacción a T y presión

constantes
 Proporciona información sobre:
 La dirección de la reacción química
 Composición en el equilibrio
 La cantidad de trabajo desarrollado

 Variación de energía libre (ΔG) Reactivos Productos

 Predice si una reacción es factible o no GR GP

ΔG = GP - GR

ΔG = 0 Proceso en equilibrio
ΔG > 0 Reacción endergónica, consume energía
ΔG < 0 Reacción exergónica, genera energía (espontánea)
 Se rige por las leyes de la termodinámica

 Principio de conservación de la energía

 Aumento natural del desorden

ΔG = ΔH - T ΔS

Energía libre de Gibbs (G): Cantidad de energía capaz de realizar trabajo durante una
reacción a T y presión constantes

Entalpía (H): contenido calórico del sistema La energía de enlace total, equivale en esencia a la
energia potencial total del sistema
ΔH > 0 Reacción endotérmica (absorbe calor)
ΔH < 0 Reacción exotérmica (libera calor)
Entropía (S): aleatoriedad o desorden del sistema

ΔS > 0 Aumenta entropía en el sistema

ΔS < 0 Disminuye entropía en el sistema
Una reacción es endergónica (en griego
“energía
que entra”, con el prefijo “endo—“ que
significa “adentro”) si requiere una entrada
neta de energía, es decir, si los productos
contienen más energía que los reactivos. De
acuerdo con la segunda ley de la
termodinámica, las reacciones endergónicas
requieren un aporte neto de energía de alguna
fuente externa
A→B
ΔG = +20.9 kJ/mol (+5 kcal/mol)
Ya que ΔG tiene un valor positivo,
entonces el producto de esta reacción
tiene mas energia libre que el reactivo.
Esta es una reacción endergónica, que no
es espontanea y que no ocurre sin una
fuente de energia.

Como las reacciones endergónicas requieren un

aporte neto de energía, obtienen esa energía de
reacciones exergónicas que liberan energía. En
una reacción acoplada, una reacción exergónica
proporciona la energía necesaria para que se
efectúe una reacción endergónica
 Reacciones exergónicas y Endergónicas
Una reacción es exergónica (en griego
“energía que sale”, con el prefijo “exo—” que
significa “afuera”) si libera energía; es decir,
si los reactivos contienen más energía que los C→D
productos. Las reacciones exergónicas emiten
algo de su energía en forma de calor. ΔG = −33.5 kJ/mol (−8 kcal/mol)

El valor negativo de ΔG indica que la energia

libre del reactivo es mayor que la energia
libre del producto. Esta reacción exergónica
procede espontáneamente.
 Exergónica Endergónica
(produce energía) (requiere energía para su terminación)
El equilibrio favorece a los productos El equilibrio favorece a los reaccionantes
Keq >>> 1 Keq <<< 1
ΔGº’ = ( - ) ΔGº’ = (+)
Estabilidad reaccionantes < estabilidad productos Estabilidad reaccionantes > estabilidad productos
Ejemplo: Fotosíntesis

Ejemplo: Combustión (energía de activación)

 La termodinámica del plegamiento
Dado que las proteínas se pliegan espontáneamente en soluciones
tampón que imitan el entorno intracelular (pH ∼ 7, 150 mM
NaCl), el plegamiento de una proteína globular es claramente un
proceso termodinámicamente favorable en condiciones
fisiológicas.
En otras palabras, el cambio global de energía libre para el
plegamiento debe ser negativo. Pero este cambio negativo de
energía libre se consigue mediante un equilibrio de varios factores
termodinámicos..
Entropía conformacional
El proceso de plegamiento, que implica pasar de
una multitud de conformaciones de "espiral
aleatoria" a una única estructura plegada, implica
una disminución de la aleatoriedad y, por tanto,
una disminución de la entropía (ΔS ˂ 0). Este
cambio se denomina entropía conformacional del
plegamiento: Conformación aleatoria (mayor
entropía) proteína plegada (menor entropía)
 La termodinámica del plegamiento

La ecuación de la energía libre muestra que una ΔS negativa ΔG=ΔH - TΔS

contribuye positivamente a la ΔG

En otras palabras, el cambio de entropía conformacional

va en contra del plegamiento. La principal fuente de un ΔH negativo son
las interacciones energéticamente favorables
entre grupos dentro de la molécula plegada.

Para buscar la explicación de una ΔG negativa global,

debemos buscar características del plegamiento de la
proteína que produzcan una gran ΔH negativa o algún
otro aumento de la entropía al plegarse.
 La termodinámica del plegamiento

Interacciones carga-carga

• Las interacciones carga-carga pueden ocurrir entre grupos de

cadena lateral cargados positiva y negativamente. Por ejemplo, La repulsión mutua entre pares de los grupos
un grupo ε-amino de la cadena lateral de la lisina puede estar cargados de forma similar que están presentes en
cerca del grupo γ-carboxilo de algún residuo de ácido las proteínas en soluciones muy ácidas o básicas
glutámico en la proteína plegada. contribuye a la inestabilidad de la estructura
• A pH neutro, un grupo estará cargado positivamente y el otro
plegada en estas condiciones.
negativamente, por lo que existe una fuerza electrostática entre
ellos.(Puentes salinos)
• Estos enlaces iónicos se rompen si la proteína se lleva a
valores de pH lo suficientemente altos o bajos como para que
cualquiera de las cadenas laterales pierda su carga. Esta
pérdida de puentes salinos es una explicación parcial de la
desnaturalización de proteínas
 La termodinámica del plegamiento

las interacciones dipolo-dipolo inducidas débiles entre grupos

no polares también pueden contribuir significativamente a la
estabilidad de la proteína, ya que en la proteína plegada los grupos
no polares están densamente empaquetados y, por tanto, establecen
un gran número de contactos de van der Waals.
El cambio en la entalpía de plegamiento, ΔHU→F , está dominado por
las diferencias en las interacciones de enlace no covalente entre los
estados desplegado y plegado:
Normalmente, los únicos enlaces covalentes
nuevos que se forman al plegarse son los
enlaces disulfuro
Cada interacción no covalente individual puede
contribuir sólo en una pequeña cantidad (como
mucho unos pocos kilojulios por mol) a la
entalpía negativa global de la interacción.

Pero la suma de las contribuciones de muchas

interacciones puede producir una estabilización
significativa de la estructura plegada

donde el estado desplegado se caracteriza por interacciones no covalentes

entre la cadena proteica extendida y las moléculas de agua, y el estado
plegado incluye muchas menos interacciones con el disolvente y muchas más
interacciones intramoleculares en su lugar
 La termodinámica del plegamiento
Efecto hidrófobo
el cambio global en la entropía es la suma del cambio en la
entropía para el sistema (en este caso la cadena polipeptídica) y
el cambio en la entropía de los alrededores (en este caso las
moléculas de agua del solvente):
ΔSuniverse = ΔSsystem + ΔSsurroundings
ΔSU→F = ΔSprotein + ΔSsolvent
ΔSprotein es el cambio de entropía
conformacional para el plegamiento, que es
negativo; sin embargo, este cambio de entropía
desfavorable se contrarresta con el aumento de
entropía favorable para el disolvente (ΔSsolvent).
En resumen, el enterramiento de la superficie
hidrofóbica en el núcleo inaccesible al
disolvente de la proteína actúa para estabilizar
el estado plegado haciendo que el valor de
ΔSU→F sea más positivo. Esta fuente de
estabilización de la proteína se denomina
efecto hidrófobo.
 La termodinámica del plegamiento

En resumen, la estabilidad de la estructura plegada de una proteína globular depende de la

interacción de tres factores:

. El cambio de entropía
La contribución favorable
El cambio de entropía favorable del disolvente
de entalpía derivada de las
conformacional derivado de la
interacciones
desfavorable, que favorece internalización de grupos
intramoleculares no
el estado desplegado hidrófobos dentro de la
covalentes
molécula
 Propiedades
SOLUBILIDAD

Las proteicas son solubles en agua cuando adoptan una conformación globular. La solubilidad es debida a
los radicales (-R) libres de los aminoácidos que, al ionizarse, establecen enlaces débiles (puentes de
hidrógeno) con las moléculas de agua. Así, cuando una proteína se solubiliza queda recubierta de una capa
de moléculas de agua (capa de solvatación) que impide que se pueda unir a otras proteínas lo cual
provocaría su precipitación (insolubilización). Esta propiedad es la que hace posible la hidratación de los
tejidos de los seres vivos.

CAPACIDAD AMORTIGUADORA

Las proteínas tienen un comportamiento anfótero y esto las hace capaces de neutralizar las variaciones de
pH del medio, ya que pueden comportarse como un ácido o una base y por tanto liberar o retirar protones
(H+) del medio donde se encuentran.
DESNATURALIZACION Y RENATURALIZACION

La desnaturalización de una proteína se refiere a la ruptura de los enlaces que mantenían sus estructuras
cuaternaria, terciaria y secundaria, conservándose solamente la primaria. Los agentes que pueden
desnaturalizar a una proteína pueden ser: calor excesivo; sustancias que modifican el pH; alteraciones en la
concentración; alta salinidad; agitación molecular; etc... El efecto más visible de éste fenómeno es que las
proteínas se hacen menos solubles o insolubles y que pierden su actividad biológica.
ESPECIFICIDAD

Es una de las propiedades más características y se refiere a que

cada una de las especies de seres vivos es capaz de fabricar sus
propias proteínas (diferentes de las de otras especies) y, aún,
dentro de una misma especie hay diferencias proteicas entre los
distintos individuos.

La enorme diversidad proteica interespecífica e intraespecífica

es la consecuencia de las múltiples combinaciones entre los
aminoácidos, lo cual está determinado por el ADN de cada
individuo.

La especificidad de las proteínas explica algunos fenómenos

biológicos como: la compatibilidad o no de trasplantes de
órganos; injertos biológicos; sueros sanguíneos; etc... o los
procesos alérgicos e incluso algunas infecciones.