BIOQUÍMICA

II
DRA. ETHEL ALEJANDRA APANGO FIGUEROA
La enzima como unidad fundamental de vida
UNIDAD 1. CINÉTICA ENZIMÁTICA Y BIOENERGÉTICA

1. ENZIMAS
1.1. Definiciones y clasificación de las enzimas.

ENZIMAS

Son catalizadores bioquímicos,

generalmente son proteínas que aceleran
la velocidad de las reacciones químicas
sin que estas sufran algún cambio neto.

* Catalizan cientos de reacciones en los sistemas biológicos.

* Regulan muchas vías metabólicas necesarias para mantener la vida.
Aplicaciones de las enzimas

*Limpieza (detergentes)
*Textiles
*Procesamiento de almidón
*Fabricación de cerveza
*Trabajo con pieles
*Hornear En la Ciencia Biomédica

*DNA polymerase
*Restricción de enzimas
*Industria alimenticia
*Cosméticos
TAREA 1.

Investigar las enzimas con aplicaciones técnicas en:

* Industria papelera
* Industria textil
* Detergentes de lavandería
* Procesamiento de comida
* Industria cervecera
* Industria cosmética
 IMPORTANCIA BIOMÉDICA
 Las enzimas son polímeros biológicos que catalizan las reaccio­nes químicas que hacen
posible la vida tal como la conocemos.
 Casi todas las enzimas son proteínas

 Las deficiencias de la cantidad o la

actividad catalítica de enzimas clave
pueden sobrevenir por defectos genéticos,
déficit nutricionales o toxinas.
 Von-Gierke
 Dihidrofolato reductasa
 Las deficiencias de la cantidad o la actividad catalítica de enzimas clave pueden
sobrevenir por defectos genéticos, déficit nutricionales o toxinas.

 Las enzimas defectuosas pueden pro­

ducirse por mutaciones genéticas o
infección por virus o bacte­rias patógenos.
  Desequilibrios de la actividad de
enzimas al utilizar fár­macos para
inhibir enzimas específicas.

 Las enzimas son catalizadores eficaces y muy específicos

  Las enzimas que catalizan la conversión de uno o más compuestos (sustratos)
hacia uno o más compuestos diferentes (productos) aumentan los índices de la
reacción no catalizada correspon­diente por factores de al menos 106

¿Cómo se clasifican?
 Los nombres de uso frecuente para casi todas las enzimas descri­ben el tipo de
reacción catalizada.
 Seguido por el sufijo -asa.
las deshidrogenasas eliminan átomos de hidróge­no
las proteasas hidrolizan proteínas
las isomerasas catalizan reordenamientos de la configuración.
 CARACTERÍSTICAS

Poder catalítico Especificidad Regulación

Velocidad de la reacción Son específicas para un

catalizada por la sustrato dado Interacción reversible de la
enzima/velocidad de la reacción No se producen productos no enzima con metabolitos
sin catalizar deseados inhibidores y activadores
 NATURALEZA GENERAL DE LAS ENZIMAS
1. En su mayoría son proteínas de ahí que la ruptura total o parcial de su estructura 1°, 2°, 3° o
4° puede destruir su actividad.

2. La mayoría de las enzimas son polímeros de mas de 100 aa (M=10,000 A 1,000,000).

3. Términos comunes: b) Substrato

a) Sitio Activo
Bolsillos o cavidad dentro de la enzima donde se van a unir los
reactantes y se produce la rxn entre ellos
De pequeño tamaño respecto al total de la proteína
Generalmente hay pocos aa involucrados en la unión de los
reactantes y esos aa estan espacialmente cerca.
Cadenas laterales de los aa involucrados en la catálisis de rxn
La especificidad de unión de reactantes al centro activo es
determinada por los aa que conforman éstos.
Es el reactante que se une al sitio
activo.
Interaccionan con el sitio activo
utilizando las mismas fuerzas que
mantienen la estructura terciaria de la
proteína.
c) Esquema de rxn gral de una enz con un
único substrato
𝑬 +𝑺→ 𝑬𝑺 → 𝑬𝑷 → 𝑬 +𝑷
 4. Las enzimas utilizan una amplia variedad de cofactores (componentes químicos no proteicos que
facilitan el incremento de la velocidad de reacción).

Algunos elementos inorgánicos que sirven como

cofactores para enzimas
Cu2+ Citocromo oxidasa  Funcionar como ácidos de Lewis en
los enzimas.
Fe2+, 3+ Citocromo oxidasa, catalasa, peroxidasa
K+ Piruvato quinasa  Participar en procesos de oxido-
reducción.
Mg2+ Hexoquinasa, glucosa 6-fosfatasa, piruvato quinasa
Mn2+ Arginasa, ribonucléotido reductasa  Estabilizar la conformación activa del
enzima.
Mo Dinitrogenasa
Ni2+ Ureasa  Pueden formar quelatos con el sustrato
Glutatión peroxidasa (GPX) siendo este quelato el verdadero
Se
sustrato.
Anidrasa carbónica, alcohol deshidrogenasa,
Zn2+ carboxipetidasas A y B
Coenzima:
 Son moléculas orgánicas pequeñas, derivadas a menudo de vitaminas, que
funcionan en conjunción con el enzima en el proceso catalítico.

Algunas Coenzimas que sirven como portadores transitorios de átomos específicos o grupo

Coenzima Transfiere grupos químicos Precursor en mamíferos

Biotina CO2
Coenzima A Grupos Acil Ácido pantoténico entre otros
5’-desoxiadenosil-cobalamina Átomos de H y grupos alquilo Vitamina B12
Tetrahidrofolato Grupos de un carbono Folato
Tiamina pirofosfato Aldehídos Vitamina B1
Nicotinamida adenina dinucleótido Iones hidruro Ácido nicotínico
 ¿Por qué necesitan un cofactor?
A. Como péptidos las enzimas pueden

1. Catalizar reacciones ácido-base general

2. Formar enlaces covalentes

B. Las enzimas requieren de la ayuda de un cofactor:

3. Catalizar reacciones de oxidación-reducción

4. Reacciones donde se transfieren grupos

COFACTORES
1. Son modificados en el curso de la reacción pero al final de la misma deben regresar a su
estado inicial

2. Si un cofactor se encuentra permanentemente asociado a la enzima (covalente o no

covalente) se denomina grupo prostético
 Holoproteínas: enzimas formadas solamente por polipéptidos.

 Holoenzimas: enzimas formadas por la asociación de una parte polipeptídica o

apoenzima y de una parte no polipeptídica o cofactor.

 Enzima + grupo prostético = holoenzima

 Enzima sin grupo prostético = apoenzima

Molécula Inorgánica Metal

Cofactor Enlace covalente Grupo prostético
Molécula orgánica
Enlace NO covalente Coenzima
Apoenzima:
Es una proteína globular formada exclusivamente por secuencias de aminoácidos.
Determinan la especificidad de la reacción enzimática.

TIPOS

No De unión o
Estructurales Catalíticos
esenciales de fijación

No intervienen Establecen Se unen al

en el proceso Mantienen la
estructura enlaces débiles sustrato
catalítico. on el sustrato mediante un
tridimensional
Si se elimina de de la proteína. orientándolo enlace
la cadena la para aproximar covalente
No intervienen la parte del debilitando su
enzima no directamente en
pierde la mismo que ha estructura y
la actividad de ser atacada favoreciendo su
actividad enzimática. por la enzima ruptura.
enzimática
 Coenzima:
 Son cofactores enzimáticos orgánicos que se unen al apoenzima mediante enlaces débiles.
 La unión apoenzima-coenzima no es específica ya que un mismo coenzima puede unirse a
diferentes apoenzimas y esta unión suele ser temporal.

Principales Coenzimas

Adenosín-fosfatos Piridín- Flavín - Vit

Co A
nucleóticos nucleótidos hidrosolubles

NAD Co A-B5
AMP FMN
NADP Gpo. –SH en Vit C
ADP FAD
un extremo Vit B 2,3,4,6 y9
Transfieren protones y
ATP electrones pasando Transportador
fácilmente de forma de radicales
oxidada a reducida y
viceversa CH3 -COOH
 International Union of Biochemistry
 Nombre recomendado: corto y apropiado para su uso habitual.
 Nombre sistemático: identifica la reacción que cataliza
 Número de código

Nombre sistemático Grupo transferido

Donador 𝑨𝑻𝑷 + 𝒄𝒓𝒆𝒂𝒕𝒊𝒏 𝒇𝒐𝒔𝒇𝒐 𝒕𝒓𝒂𝒏𝒔𝒇𝒆𝒓𝒂𝒔𝒂

Aceptor

Número sistemático Nombre común

Grupo Subgrupo

Enzymas
Comission EC 2. 7. 3. 2 Enzima Creatín-quinasa

Sub-subgrupo
 CLASE
S

Oxidorreductasas Transferasas Hidrolasas Liasas Isomerasas Ligasas

Catalizan la Añaden o Catalizan

Catalizan Catalizan la Catalizan la
transferencia eliminan cambios
oxidaciones división de unión de dos
de porciones, los geométricos
y C-C, C-O, moléculas en
como grupos elementos o
reducciones C-N y otros reacciones
glucósido, del agua, estructurales
metilo o enlaces acopladas a la
amoniaco o dentro de hidrólisis de
fosforilo covalentes
CO2 una ATP
molécula.
 La sustancia sobre la que actúa
una enzima se denomina
sustrato
 CLASE
CLASE
CLASES
Transferasas

Oxidorreductasas Hidrolasas
Catalizan la transferencia de
porciones, como grupos
Implican la rotura hidrolítica
glucósido, metilo o fosforilo de enlaces C-O, C-N, O-P y
Catalizan rxns de oxidación- C-S
reducción
 Aminotransferasas Los enzimas proteolíticos
(transaminasas) constituyen una clase
 Quinasas especial de hidrolasas
Oxidasas denominadas peptídicas.
Oxigenasas
Peroxidasas
Catalasas  Fosfatasas
 CLASES CLASE CLASE

Isomerasas Ligasas
Liasas

Catalizan cambios Ligar=unir rxns sintéticas

Añaden o eliminan los geométricos o en las que se unen 2
elementos del agua, estructurales dentro de moléculas “enlace
amoniaco o CO2 una molécula. fosfato de alta energía”
del ATP
 Descarboxilasas: eliminan  Isomerasas: catalizan la
unidades de CO2 de α y β- inversión en átomos de  Sintetasa: formación de los
cetoácidos o aminoácidos. carbono asimétricos. aminoacil-tRNA, acil Co A,
glutamina y la adición de CO2
 Deshidratasas: eliminan  Mutasas: catalizan la piruvato son rxn catalizadas
H 2O en una rxn de transferencia intramolecular por ligasas.
deshidratación. de un gpo. tal como el
fosforilo
ISOENZIMAS

 Es un organismo, más de una enzima pueden catalizar una reacción dad.

Cuando múltiples enzimas catalizan la misma reacción, estas enzimas se
denominan isoenzimas.

 Difieren en sus propiedades catalíticas.

 Pueden estar presentes en diferentes tejidos o en distintas etapas del

desarrollo.
 CINÉTICA ENZIMÁTICA / CATÁLISIS ENZIMÁTICA

 Cinética: Es el estudio de la velocidad de cambio de reactivos a productos

 Velocidad: Se expresa en términos del cambio en la concentración de sustrato o

producto por unidad de tiempo.

 Tasa: Se refiere a cambios en la cantidad total (moles o gramos) por unidad de

tiempo.
 PARÁMETROS ENZIMATICOS

 Velocidad inicial: es el cambio en la concentración de

reactivo o de productos durante los primeros segundos
de la reacción y se determina como la pendiente de la
línea durante la fase lineal de la rxn, extrapolada en
tiempo cero.

𝑑[ 𝐴] 𝑑[𝑃 ]
𝑉𝑒𝑙𝑜𝑐𝑖𝑑𝑎𝑑= 𝑣=− =
𝑑𝑡 𝑑𝑡

 Velocidad máxima Vmax: es la velocidad obtenida en condiciones de saturación de la

enzima por sustrato en unas condiciones determinadas de pH, temperatura y fuerza iónica.
Esta se vuelve constante para una [ ] determinada por la enzima
 Factores que regulan la activada catalítica
Temperatura
óptima velocidad de
reacción es máxima.
Suele ser 40º 45° C.
El calor aumenta la
energía cinética con
lo que aumenta la
movilidad de las
moléculas facilitando
su encuentro
pH
Cada enzima presenta unos
valores de pH entre los que son
efectivos. Entre ambos existe un
pH óptimo en el que la velocidad
de la reacción es máxima.
[Sustrato]
Al aumentar la concentración del
sustrato se aumenta la velocidad de
reacción, hasta alcanzar la velocidad
máxima (Vmáx).
La Vmáx se alcanza cuando toa la
enzima está ocupada por el sustrato.
 Km= [S] a la que V0 es ½ Vmax Es una medida de la afinidad de la enzima por
el S. Cuanto menor es Km, mayor es la afinidad de la enzima.

 Kcat = número de recambio = número de moléculas de sustrato convertidas

en producto por molécula de enzima y unidad de tiempo, en condiciones
saturantes del sustrato. 1 Kat=1mol/s

 Vmax = la velocidad cuando todos los centros activos están ocupados con
sustrato.
 Energía de Activación
 La fuente de energía de activación normalmente es el calor, esto
es, las moléculas de reactivo absorben la energía térmica de su
entorno.

 Esta energía térmica acelera el movimiento de las moléculas de reactivo, incrementa la

frecuencia y la fuerza de sus colisiones, y también agita los átomos y enlaces dentro de las
moléculas individuales, por lo que aumenta la probabilidad de que los enlaces se rompan.

La energía de activación de una

reacción química se relaciona
estrechamente con su velocidad.
Específicamente, mientras mayor
sea la energía de activación, más
lenta será la reacción química.
 Indica que la reacción se llevará a cabo  Las reacciones con un ∆G positivo (∆G > 0), por
sin energía adicional pero no dice nada otro lado, requieren de un aporte de energía, los
acerca de qué tan rápido va a suceder. productos o el estado final, tienen más energía
libre que los reactivos o estado inicial.

La velocidad de una reacción depende de la vía que sigue entre el estado inicial y el estado final
(las líneas moradas de los diagramas), mientras que la espontaneidad solo depende de los estados
inicial y final.
 La diferencia entre la energía del estado basal y la máxima energía alcanzada se
denomina energía de activación.

 Un catalizador disminuye la energía de activación y permite incrementar la velocidad con

que cursa la reacción a una temperatura constante.

 Los catalizadores no cambian sin embargo el cambio de energía que acompaña la

transformación de A en B.

 Cuando un sistema se deja reaccionar, la concentración de los componentes alcanza un

valor fijo que depende de la naturaleza de los reactantes. Esa situación se conoce como
equilibrio químico.
 Inhibición Enzimática

Reversible Irreversible

Inhibidores interactúan
con la enzima por medio
de uniones no covalentes
Inhibidores forman
enlaces con las cadenas
laterales de los aa o
grupos prostéticos de la
enzima.
Disminuye la cantidad de
enzima activa.
 Inhibición competitiva
Inhibición Enzimática  El inhibidor se una reversiblemente a la enzima en el mismo
sitio al que se une el sustrato.

 Si está unido el sustrato a la enzima, el inhibidor no se puede

Reversible unir. Son mutuamente excluyentes.

 La formación de un complejo IES no se da.

 El inhibidor no es modificado por la enzima.

Inhibidores competitivos
Inhibidores acompetitivos
 Ecuación de la velocidad en presencia de un
inhibidor competitivo
𝑉 𝑚𝑎𝑥 [ 𝑆]
𝑣=
Vm no varía, Km aumenta 𝐾 𝑚 1+ ( [𝐼]
𝐾 𝑖𝑐 ) +[ 𝑆 ]

Patrones de inhibición competitiva Lineweaver-Burke

 Inhibición acompetitiva
 El inhibidor se une reversiblemente a la enzima en un sitio
diferente del que se une el sustrato.

Inhibición Enzimática  El inhibidor no se une a la enzima libre, se une solo al complejo

ES.

 El inhibidor no tiene semejanza estructural con el sustrato.

Reversible
 El inhibidor distorsiona el sitio activo de la enzima inactivando
catalíticamente a la misma.

Inhibidores competitivos
Inhibidores acompetitivos
 Patrones de inhibición acompetitiva Lineweaver-
Burke

[𝑰]
𝜶′= 𝟏+
𝑲 ′𝒊
 Inhibición mixta

 El inhibidor se une reversiblemente a la enzima y al

complejo ES.

 El inhibidor se une a ambas con diferentes constantes

de disociación.

 El inhibidor se une a sitios que participan tanto en la

unión al sustrato como en la catálisis o el inhibidor se
une a un sitio diferente del sitio activo pero influencia la
unión del sustrato al sitio activo
Las enzimas son proteínas altamente especializadas que tienen como
función la catálisis o regulación de la velocidad de las reacciones
químicas que se llevan a cabo en los seres vivos.
Cada célula y cada tejido tienen su actividad propia, lo que conlleva a
continuos cambios en su estado bioquímico y en la base de la cual están
las enzimas, que tienen el poder de:

 Catalizar
 Facilitar
 Agilizar determinados procesos sintéticos analíticos
Los propios genes son reguladores de la producción
de las enzimas; por tanto, genes y enzimas pueden
considerados como las unidades fundamentales de la
vida.

Todas las reacciones que tienen lugar en las células (metabolismo) son
catalizadas por enzimas. Lo que permite que ocurran a un ritmo compatible
con la vida. Las enzimas son proteínas (aunque también hay algunos ARN
con función catalítica llamados ribozimas) especializadas en la catálisis de las
reacciones biológicas, que poseen las siguientes características
  Aceleran la rxn disminuyendo la Energía de activación
Características
compartidas con  No se consumen ni se modifican durante la reacción
los catalizadores  No alteran el equilibrio de la rxn, solo hacen que se alcance
químicos
mas rápidamente.

Características  Son muy eficaces a bajas [ ]

exclusivas de las  Son altamente específicas
enzimas
 Son saturadas
 Su actividad catalítica puede ser regulada
El rasgo particular es que pueden
catalizar procesos químicos a “baja
temperatura” compatible con la propia
vida, sin el empleo de sustancias
lesivas para los tejidos.
La vida es, en síntesis, una cadena de procesos enzimáticos, desde
aquellos que tienen por sustratos los materiales mas simples, como el
agua (H2O) y el anhídrido carbónico (CO2), presentes en los vegetales para

la formación de hidratos de carbono, hasta los más complicados que

utilizan sustratos muy complejos.
Ello hace posible que en

“condiciones fisiológicas”

tengan lugar reacciones que sin

catalizador requerirían condiciones
extremas de presión, temperatura o pH
COMPOSICIPON QUÍMICA DE LAS ENZIMAS

HETEROPROTEINAS
HOLOPROTEINAS Holoenzima (enzima
funcional

Proteínas con Apoenzima Cofactor

estructura (parte proteica) (parte no proteica)
terciaria o
caternaria
Molécula Catión y
Catión metálico
orgánica coenzima

Unión débil al Unión covalente al

apoenzima apoenzima
(Gpo. prostético)
Las enzimas, a diferencia de los catalizadores inorgánicos catalizan
reacciones específicas sin embargo hay distintos grados de especificidad.

La enzima sacarasa es muy específica: rompe el enlace β-glucosídico de

la sacarosa o de compuestos muy similares.

Así, para el enzima sacarasa, la sacarosa es su sustrato natural, mientras

que la maltosa y la isomaltosa son sustratos análogos (maltasa e
isomaltasa).
Mecanismo de actuación enzimática:

1) Se forma un complejo: enzima-substrato o

substratos. productos
sustrato

2) Se une la coenzima a este complejo.

3) Los restos de los aminoácidos que configuran el centro

activo catalizan el proceso. Para ello debilitan los
Enzima
enlaces necesarios para que la reacción química se
lleve a cabo a baja temperatura y no se necesite una
elevada energía de activación.
Centro activo
4) Los productos de la reacción se separan del centro
activo y la enzima se recupera intacta para nuevas
catálisis.
Coenzima
5) Las coenzimas colaboran en el proceso; bien
aportando energía (ATP), electrones (NADH/NADPH)
o en otras funciones relacionadas con la catálisis
enzimática
Reacción con y sin enzima
Cuando se forma esta interacción baja la energía de
activación necesaria para poder llevar a cabo la reacción.

Las enzimas, a diferencia de los catalizadores

inorgánicos catalizan reacciones específicas sin embargo
hay distintos grados de especificidad.

ESPECIFICADAD
ENZIMÁTICA

ESPECIFICIDAD ESPECIFICIDAD ESPECIFICAD DE

ABSOLUTA PARA RELATIVA PARA EL ACCIÓN
EL SUSTRATO SUSTRATO
“MUY ESPECÍFICA” “POCO
ESPECÍFICA”
Esquema de la acción de Centro activo de una Enzima
una Enzima
 Mecanismo muy específico

Sacarasa
Sacarosa

enlace β-glicosídico
Glucoquinasa

Mecanismo muy específico

La enzima actúa con máxima eficacia sobre el sustrato natural y con
menor eficacia sobre los sustratos análogos.

Entre las enzimas poco específicas están:

“las proteasas digestivas como la quimiotripsina, que rompe los enlaces

amida de proteínas y péptidos de muy diverso tipo”.

Quimiotripsinógeno Quimiotripsina
(zimógeno inactivo) (enzima activa)
 Quimiotripsina

La quimotripsina bovina es una enzima con

actividad proteolítica con 245 aminoácidos, que
cataliza la ruptura hidrolítica de enlaces
peptídicos adyacentes a residuos aminoacídicos
aromáticos

Esta formada por tres cadenas polipeptídicas

conectadas mediante dos puentes disulfuro
intercatenarios.
Esta enzima se sintetiza en forma de precursor inactivo,
quimotripsinógeno, que es activado por la ruptura específica de su enlace
peptídico Ser 14, Arg 15 y Thr 147, Asn 148
 Los aminoácidos esenciales en el proceso de catálisis son la His 57 y Ser 195,
estos aminoácidos se encuentran localizados en el sitio de fijación del sustrato,
junto con el Asp 102.
 Estos tres aminoácidos se encuentran unidos por enlaces por puentes de
hidrógeno, y se conocen con el nombre de tríada catalítica.
Los principales sustratos de la quimotripsina son el:
Triptófano
Tirosina
Fenilalanina
Metionina
que son hidrolizados en el carboxilo terminal.

Al igual que muchas proteasas, la quimotripsina también hidroliza

enlaces éster in vitro.
 ESPECIFICIDAD DE ACCIÓN

Consiste en que la enzima solo cataliza “UNA DE LAS POSIBLES REACCIONES QUE
PUEDE SEGUIR UN SUSTRATO”

En el caso del glutamato, por ejemplo, que puede experimentar diferentes
transformaciones, se requiere una enzima diferente para cada una de esas
transformaciones:

Glutamato a:

SUSTRATO ENZIMA
GLUTAMINA (FIJACIÓN DE AMONÍACO) GLUTAMINA SINTASA
ÁCIDO GAMA AMINOBUTÍRICO (GABA)
GLUTAMATO DESCARBOXILASA
[DESCARBOXILACIÓN]
ALFA-CETO-GLUTARATO
ALFA-CETO-GLUTARATO (REDOX)
DESHIDROGENASA
 Especificidad (conclusión)
Las moléculas del sustrato se unen a un sitio particular en la superficie de la
enzima, denominado sitio activo, donde tiene lugar la catálisis.

La estructura tridimensional de este sitio activo, donde solo puede entrar un
determinado sustrato (ni siquiera sus isómeros) es lo que determina la
especificidad de las enzimas.

El acoplamiento es tal que E. Fisher (1894) enunció:

“El sustrato se adapta al centro activo o catalítico de una enzima como una llave
a una cerradura". 
 Hexoquinasa (HK)

 La hexoquinasa es una enzima relativamente inespecífica que cataliza la

fosforilación de hexosas (D-glucosa, D-manosa y D-fructosa)
 La unión de la glucosa induce un cambio de
conformación en la enzima. Los dos lóbulos de la
enzima se acercan mutuamente al unirse con la
glucosa.
 En la conformación abierta, la molécula tiene una
afinidad por la glucosa y la molécula de ATP. La unión
de una de las moléculas.

 Ejem. La glucosa, desplaza el equilibrio en la

conformación cerrada de la proteína, produciendo una
mayor afinidad por ATP.
 En Glucosa se une al centro
sitio (centro) activo formado
por 7 aa.

 Thr 172, Lys 173, Asn 208,

Asp 209, Asn 235, Glu 260 y
Glu 294
Modelo llave-cerradura

Los sustratos se unen

perfectamente al sitio activo en la
enzima: “son específicos”
 Importancia del centro activo en la catálisis enzimática

Centro Activo

e1
F
Centro F e2
tr ato c2
sus
Centro C
C
c1
e3

El centro activo es la región de la enzima en la que transcurre la catálisis

uniéndose a el sustrato, los cofactores (bioelementos) de naturaleza inorgánica, o
coenzimas (vitaminas) de naturaleza orgánica
Esta unión puede originar modificaciones estructurales tanto en la enzima como
en el sustrato
Los AMINOÁCIDOS en el CENTRO ACTIVO se clasifican como:

Aminoácidos catalíticos (c1 , c2 c3 , c4 ) directamente implicados en los cambios

covalentes del sustrato durante la reacción enzimática (en el centro C)

Centro Activo

e1
F
Centro F o
e2
str at c2
su
Centro C
C
c1
e3
 Centro Activo

e1
F
Centro F e2 at o c2
su str
Centro C
C
c1
e3

Aminoácidos de especificidad o contacto (e1 , e2 ) participan en la unión del

sustrato a la enzima pero no intervienen en los cambios covalentes (en el
centro F)
Aminoácidos de conformación: no están relacionados con el proceso
catalítico directamente pero son necesarios para el mantenimiento de la
estructura tridimensional de la enzima
 MODELOS DE INTERACCIÓN
COMPLEJO (E-S)

Modelo llave Modelo de Modelo de Modelo de

Cerradura ajuste inducido compresión distorsión
¿Cuáles son los modelos de interacción del complejo Enzima-Sustrato
(ES)?

1.- El modelo llave-cerradura:

supone que la estructura del
sustrato y la del centro activo
S
son complementarias, de la
S
misma forma que una llave
E E encaja en una cerradura.
2.- El modelo de ajuste inducido: el centro activo
adopta la conformación idónea sólo en presencia
del sustrato. La unión del sustrato al centro activo
del enzima desencadena un cambio
conformacional que da lugar a la formación del
producto
3.- El modelo de compresión: el centro activo adopta la conformación idónea
sólo en presencia del sustrato pero el sustrato también modifica su
conformación en la formación del complejo ES

S
S

E E
4.- El modelo de distorsión: supone que la estructura del sustrato y la del
centro activo son complementarias pero en el momento de formar el
complejo ES ambos se distorsionan para generar un cambio
conformacional.

S
S

E E
 Efecto del pH sobre la actividad enzimatica

 Las enzimas poseen grupos

químicos ionizables (carboxilos -
COOH; amino -NH2; tiol -SH;

imidazol, etc.) en las cadenas

laterales de sus aminoácidos. Según
el pH del medio, estos grupos
pueden tener carga eléctrica
positiva, negativa o neutra.
 Como la conformación de las
proteínas depende, en parte, de sus
cargas eléctricas, habrá un pH en el
cual la conformación será la más
adecuada para la actividad catalítica.
Este es el llamado pH óptimo.
EJEMPLO:
La pepsina gástrica tiene un pH óptimo de 2
La ureasa lo tiene a pH 7
La arginasa lo tiene a pH 10

Ligeros cambios del pH pueden provocar el cambio conformacional

nativo de la proteína, los seres vivos han desarrollado sistemas más o
menos complejos para mantener estable el pH intracelular:

“Los amortiguadores fisiológicos.”

ENZIMA pH ÓPTIMO

PEPSINA 1.5

TRIPSINA 7.7

CATALASA 7.6

ARGINASA 9.7

FUMARASA 7.8

RIBONUCLESA 7.8
Organelos especializados de forma
redonda o polimorfa que contienen
diferentes tipos de enzimas
hidrolasas ácidas (40 tipos).

Lipasas, Fosfolipasas (lípidos)

Proteasas (proteínas)
Sulfatasas (ésteres de sulfato)
Fosfatasas (fosfatos de moléculas orgánicas) = Fosfatasa ácida
Nucleasas
Todas estas enzimas necesitan de un
ambiente ácido para su funcionamiento
óptimo, las membranas de los lisosomas
disponen de bombas de protones que
transportan de manera activa H+ hacia el
lisosoma, manteniendo así un pH de 5.
Los lisosomas mantienen las enzimas que necesitan para poder funcionar de un
pH de 5 fuera del contacto del citosol, cuyo pH es de 7.2.

De esta forma se asegura su actividad, pero al mismo tiempo se protege al propio
citosol en caso de que se produjera algún escape de enzimas hacia fuera.

Cuando se produce una alteración de la membrana del lisosoma, por ejemplo si

se rompe, se liberan las hidrolasas y se digieren los componentes celulares,
pudiendo provocar incluso la muerte de la célula.
 Ejemplo de Enfermedades Lisosomales

1.- Enfermedad de Gaucher: enfermedad metabólica rara,

deficiencia de la enzima β-glucosidasa ácida, que origina
un depósito de un glucocerebrósido, la glucosilceramida,
en el sistema reticuloendotelial.

2.- Enfermedad de Niemann-Pick: enfermedad genética que

impide el metabolismo de la esfingomielina celular por falta o
deterioro de la enzima responsable, la esfingomielinasa
ácida
 3

3.- Síndrome de Hunter: causada por un error

en la enzima iduronato-2-sulfatasa. Produce
también alteraciones en el desarrollo físico y
mental del niño.

4.- Enfermedad de Hurler, Sialidosis, Deficit de Mancha Rojo

Cereza enfermedad metabólica hereditaria muy rara, alcanza
una incidencia de 1 en 100,000 a nivel mundial; defecto de la
enzima α-1-iduronidasa.
 Cristales

Fagocitados por células

Acumulación lisosomas secundarios

Cristales rompen las vacuolas

5.- Gota: acumulación de
ácido úrico proveniente Liberación de enzimas lisosómicas en el citosol

del catabolismo de las

Digestión de componentes celulares
purinas provoca la
deposición de cristales de Liberación de sustancias de la célula
urato en las
articulaciones. Autolisis Celular
 Efecto de la Temperatura sobre la actividad enzimática
En general, los aumentos de temperatura aceleran las reacciones químicas: por
cada 10ºC de incremento, la velocidad de reacción se duplica.

Las reacciones catalizadas por enzimas siguen esta ley general. Sin embargo, al ser
proteínas, a partir de cierta temperatura, se empiezan a desnaturalizar por el calor.

La temperatura a la cual la actividad

catalítica es máxima se llama temperatura
óptima.
Por encima de esta temperatura, el aumento de velocidad de la reacción debido a
la temperatura es contrarrestado por la pérdida de actividad catalítica debida a la
desnaturalización térmica, y la actividad enzimática decrece rápidamente hasta anularse.
 Efecto de los cofactores sobre la actividad enzimática
Algunas veces las enzima requiere para su función la presencia de
sustancias no proteicas que colaboran en la catálisis: cofactores o
coenzimas

Los cofactores pueden ser iones inorgánicos:

Fe++, Mg++, Mn++, Zn++ etc
Casi un tercio de las enzimas conocidas requieren cofactores

Cuando el cofactor es una molécula orgánica se llama coenzima. Muchos

de estos coenzimas se sintetizan a partir de vitaminas.
Cuando los cofactores y las coenzimas se
encuentran unidos covalentemente al enzima
se llaman grupos prostéticos

La forma catalíticamente activa de la enzima,

es decir, la enzima unida a su grupo
prostético, se llama holoenzima (enzima
completa)

La parte proteica de una holoenzima

(inactiva) se llama apoenzima, de forma que:
Apoenzima + Grupo Prostético = Holoenzima
 Vitaminas (moléculas orgánicas) = COENZIMAS
VITA = VIDA AMIN = SUSTANCIA QUE CONTIENE NITRÓGENO
1912: Casimir Funk.
“Moléculas orgánicas complejas, indispensables para el funcionamiento adecuado de los
seres vivos”

Otra definición
“Compuestos orgánicos esenciales que actúan como catalizadores o coenzimas en
reacciones químicas para mantener las funciones metabólicas normales, el crecimiento y la
reparación de los tejidos”

 Son necesarias en cantidades mínimas (R.D.R.) = Respuesta Relativa a una Dosis

NO cumplen funciones estructurales ni energéticas.
NO son sintetizadas por los animales y, por tanto, deben proporcionarse en la dieta.
 ¿En base a que parámetro se clasifican las vitaminas?
R= SOLUBILIDAD
HIDROSOLUBLES LIPOSOLUBLES

ABSORCIÓN: con agua en el tracto ABSORCIÓN: Se unen a las grasas

gastrointestinal. ALMACÉN: Hígado y tejidos grasos
Pueden alcanzar niveles tóxicos
EXCRECIÓN: vía renal (bioacumulables)
Menor probabilidad de acumulación

Pertenecen las vitaminas:

Son el ácido ascórbico o VITAMINA C, las A = RETINOIDES
D = CALCIFEROLES
vitaminas del COMPLEJO B (excepto la E = TOCOFEROLES
vitamina B12 que requiere un factor K = QUINONAS

intrínseco) BIOTINA Y ÁCIDO PANTOTÉNICO

 VITAMINAS HIDROSOLUBLES

COMPLEJO B:
♠ B1 = Tiamina.

♠ B2 = Riboflavina.

♠ B3 = Niacina.

♠ B5 = Ácido Pantoténico.

♠ B6 = Piridoxal.

♠ B8 = Biotina.

♠ B9 = Ácido fólico.

♠ B12 = Metilcobalamina
 VITAMINA B1 (TIAMINA)
Antineurítica, antiberiberi.

Estructura Química: Pirimidina + Anillo de tiazóico

R.D.R: Niños: 0.5 mg/día, Adultos: 1 - 1,5 mg. Según ingesta carbohidratos.

Fuentes: Tejidos animales (Carne cerdo y vísceras, cereales y leguminosas).

 Coenzima: TPP (Pirofosfato de tiamina).

Reacciones: Decarboxilación y transcetolación.

 Deficiencia: Beriberi (Neuropatía periférica, anorexia, fatiga), Encefalopatía

Wernicke – Korsakow (Alcoholismo).
 COENZIMA PPT: forma activa

Las enzimas que requieren de PPT:

Decarboxilación oxidativa y no oxidativa de a cetoácidos en el metabolismo intermediario.
Complejo piruvato deshidrogenasa.
Complejo a cetoglutarato deshidrogenasa.
 Complejo piruvato deshidrogenasa
Glicólisis aerobia

Gliceraldehído-3-P Glucosa Almidones

 VITAMINA B2 (RIBOFLAVINA)
Estructura Química: Ribitol + isoaloxacina.
(Flavina = amarillo).

R.D.R: 0,5 mg en niños y 2 mg en adultos. Según ingesta proteínas

Fuentes: Leche, granos, leguminosas, huevo y carne magra.

 Coenzima: FMN (Mononucléotido de flavina) y FAD (Dinucleótido de flavina)

 Reacciones: Oxidorreducción.

 Deficiencia: Arriboflavinosis (Anemia, queilosis, lengua color magenta, dermatitis

seborreica y fotofobia).
 Ribitol

Isoaloxacina.

Fosfato
ADP

FAD FMN
COENZIMAS
Enzima = Succinato deshidrogenasa
Succinato + FAD  Fumarato + FADH2

Reacción del Ciclo de Krebs