Bioquímica Sem-04 Sesión 10-2023-1

BIOQUÍMICA
Departamento Académico de Cursos Básicos

Enzimas y Cinética enzimática
Estrategias catalíticas de las
enzimas
Semana 04
Sesión 10
Contenido
1. Introducción 13. Métodos experimentales para medir actividad
2. Definición de enzima y sus características enzimática
3. Propiedades de las enzimas 14. Estrategias catalíticas
4. Generalidades de las enzimas 15. Integrando lo aprendido: Conclusiones
5. Definiciones relacionadas con las enzimas
6. Comportamiento de una enzima
7. Mecanismo de acción enzimática
8. Pasos de la reacción enzimática
9. Modelos sobre la forma en que el S se une al centro
activo de la E
10. Nomenclatura de enzimas
11. Factores que influyen en la actividad enzimática 3
12. Parámetros enzimáticos
Resultado de aprendizaje de la sesión
Al finalizar la sesión, el estudiante puede

explicar propiedades, cofactor, grupo
prostético, mecanismo de acción, factores que
afectan las reacciones enzimáticas, métodos
experimentales siguiendo procedimientos y
ejercicios prácticos.
https://acortar.link/sHeD2U

4
Reflexión desde la experiencia
Responde las siguientes preguntas
¿Qué son las enzimas?
¿Cómo están constituido las enzimas?
¿Cuál es la función en los procesos biológicos del

organismo?
¿Cuáles son los pasos para que un enzima produzca

https://acortar.link/eZBT4z
producto?
5
Enzimas
Enzimas
Las enzimas son agentes químicos (proteínas) que

ayudan en los procesos bioquímicos a una velocidad
compatible con la vida
La mayoría de la reacciones bioquímicas son

catalizadas por enzimas
En ausencia de las enzimas las reacciones se

realizarían con lentitud y no aportarían la energía que
se requiere para cubrir las necesidades metabólicas 7
Enzimas
Las enzimas presentan implicaciones importantes como determinantes de la salud y la enfermedad.
1. Enfermedades de errores congénitos del metabolismo se

deben a anormalidades en la síntesis de enzima.
2. Procesos inflamatorios, necrosis de tejidos, o afecciones por

suministro sanguíneo, ciertas enzimas aumentan en el plasma.
https://n9.cl/17fii
La determinación de la actividad o concentración de la enzima es

una herramienta útil para el diagnóstico diferencial, vigilar el curso
8
del tratamiento y pronóstico de la enfermedad
Definición de enzima y características
o Son catalizadores biológicos eficaces y muy específicos, que funcionan aumentando la velocidad
de las reacciones bioquímicas de 106 a 1012 veces en comparación con las reacciones no
catalizadas.
o Se caracterizan por su poder catalítico y su especificidad
de la
de ntro tiene
ón e a
Regi a qu ada par
m o
enzi a adecu substrat
form el
que ione
c
reac
La catálisis se lleva a cabo en el Centro
(sitio) activo de la enzima 9
https://n9.cl/p7ktw
Como catalizadores, las enzimas tienen
ciertas propiedades
1. No se alteran ni se consumen en la reacción.

2. Eficiencia: Se requieren de pequeñas cantidades de ellas.
3. Aceleran la velocidad a la cual la reacción química alcanza el
equilibrio, pero no alteran la constante de equilibrio (la cantidad de
producto que se forma a partir del substrato)
010
Generalidades
o Las enzimas son proteínas que tienen una secuencia exclusiva de aminoácidos (estructura
primaria y secundaria) y estructura tridimensional (ESTRUCTURA TERCIARIA).
o Además, algunas ENZIMAS tienen estructura cuaternaria (formadas por dos o más cadenas de
polipéptidos).
SON ESENCIALES PARA LA ACTIVIDAD CATALÍTICA
https://n9.cl/nxxsw
011
https://n9.cl/alsqz
Definiciones relacionadas con enzimas
• Existen enzima que no requieren para su actividad más grupos químicos que sus
residuos de aminoácidos.
• Existen enzimas que son proteínas conjugadas y contienen un COFACTOR
(compuestos inorgánicos, iones metálicos, u orgánicos).
012
https://n9.cl/cb2i8
o Cofactor esta unido a un compuesto orgánico, se denomina
COENZIMA (las vitaminas). Ej: NAD+, NADP+ y pridoxal
5 fosfato.
o Iones metálicos (Fe+2, Zn+2, Cu+2, Mg+2, Mn+2), se encuentran
como componente estructural.
o Coenzimas o iones metálicos enlazados de manera covalente
a los enzimas se denominan GRUPO PROSTÉTICO.
o Enzima catalíticamente activa unido a su grupo prostético, se
denomina HOLOENZIMA.
o La parte proteica del enzima recibe el nombre de
https://biologiageologia.com/biologia2/451_estructura_de_las_enzimas.html
013
APOENZIMA O APOPROTEÍNA.
o Cofactor esta unido a un compuesto orgánico, se denomina
COENZIMA (las vitaminas). Ej: NAD+, NADP+ y pridoxal
5 fosfato.
o Iones metálicos (Fe+2, Zn+2, Cu+2, Mg+2, Mn+2), se encuentran
como componente estructural.
o Coenzimas o iones metálicos enlazados de manera covalente
a los enzimas se denominan GRUPO PROSTÉTICO.
o Enzima catalíticamente activa unido a su grupo prostético, se
denomina HOLOENZIMA.
o La parte proteica del enzima recibe el nombre de
https://biologiageologia.com/biologia2/451_estructura_de_las_enzimas.html
013
APOENZIMA O APOPROTEÍNA.
Apliquemos lo aprendido
015
El comportamiento de
una enzima
El comportamiento de una
enzima
o Las reacciones químicas se dan a cierta velocidad (Cinética).
o En las reacciones químicas se produce la ruptura o formación de enlaces entre átomos.
o Las enzimas proporcionan el ambiente óptimo para que se den las reacciones química,
de manera energéticamente favorable.
Estado activado o de transición de reactivo y/o sustrato

Estado de energía de la molécula en donde su reacción ocurre
fácilmente
018
Mecanismo de acción
enzimática
Edo de transición: edo.
intermedio de alta energía, alta
ET inestabilidad y corta duración.
https://acortar.link/Xwpby0
https://acortar.link/MRsOeU
Diagrama Energético de una Reacción
019
Energía de activación: energía necesaria para

comenzar la reacción. 19
Pasos de la reacción enzimática
https://acortar.link/V47prw
1.Enzima y sustrato se combinan y forman un complejo o Presenta aminoácidos orientados en forma

singular que forma una muesca o una bolsa
en su superficie.
SITIO SITIO o Otros aminoácidos dan lugar al marco
DE CATALÍTI estructural que mantiene la configuración
UNIÓN CO de sitio catalítico
https://n9.cl/8mbez
021
2. La E (1) permite que los sustratos se

unan a su centro activo con una
orientación óptima para que la
reacción se produzca
Estado intermedio de alta energía,

alta inestabilidad y corta duración.
022
https://n9.cl/8mbez
3.
4.
022
https://n9.cl/8mbez
Modelos sobre la forma en
que el S se une al centro
activo de la E
Modelo de llave y cerradura
(Emil Fischer, 1894)
o Cada E tiene un sitio activo y solo un S

(especificidad).
o Complementaridad geométrica entre el S

(llave) y el centro activo de la E
(cerradura).
o No explica la catálisis (explica la

especificidad de las enzimas, falla al intentar
explicar la estabilización del
estado de transición que logran adquirir las
enzimas)
025
https://n9.cl/j0cmyl
Modelo de adaptación inducida
(Daniel Koshland, 1958)
o El sustrato se enlaza con el

sitio activo induciendo a la
enzima a modificar su forma de
manera que se adapte al entorno
del sustrato.
o La adaptación en torno al
sustrato provoca tensión y es
probable que halla ruptura de
enlaces químicos para la
transformación del sustrato a
https://n9.cl/sa1op producto.
026
Sin importar el mecanismo de actividad catalítica,
la forma en que la enzima distorsiona el sustrato
reduce la energía de activación necesaria para
acelerar la transformación del sustrato en
producto.
https://n9.cl/adul2
027
NOMENCLATURA
DE LAS ENZIMAS
o Nombres comunes
o Principio de la Clasificación Internacional
NOMENCLATURA DE LAS ENZIM
Nombres comunes
o En muchos casos son formados añadiendo el sufijo –asa al nombre del substrato
Por ejemplo:
o Tirosinasa cataliza la oxidación de la tirosina
o Celulasa cataliza la hidrolisis de la celulosa
Estos nombres no describen la química de la reacción
029
Principio de la Clasificación Internacional
o Todas las enzimas son clasificadas en 6 categorias dependiendo del tipo de

reacción que ellas catalizan.
o Cada enzima tiene un Número de Clasificación que consiste de 4 dígitos:
EC: 2.3.4.2
EC: Enzyme commission
o El primer dígito se refiere a la clase de enzima, el segundo a la subclase de la
enzima, el tercero a la sub-subclase, y el cuarto es el número ordinal de la enzima
dentro de la sub-subclase.
030
031
www.chem.qmul.ac.uk/iubmb/enzyme
032
https://proteopedia.org/wiki/index.php/Alcohol_dehydrogenase
Factores que influyen en
la actividad enzimática
N°
Factores que influyen en la actividad
enzimática
o En el plasma la cantidad de enzima es muy baja.
o En el laboratorio generalmente se determina la actividad enzimática.
o La unidad de actividad enzimática se expresa en unidades internacionales (U/L).
Al estudiar la actividad enzimática, se observa la velocidad de reacción en diferentes

condiciones.
o Cambios de pH
Factores que afectan la velocidad de o Cambios de temperatura
reacción o Concentración de sustrato
o Concentración de la enzima
o Activadores 034
o Inhibidores
enzimática
Cambios de pH
o Las enzimas presentan un pH donde su actividad es óptima.
o Los cambios en la ionización de la enzima o del sustrato
explican los efectos del pH.
o Al producirse ionización de los grupos aminados en el sitio
activo o cerca de él, conlleva a desnaturalización de la enzima.
Grupos ionizables en las
E:
-COOH
-NH 2
-SH
-OH
035
https://acortar.link/9quQjk
enzimática
Cambios de temperatura
o Rango óptimo 35-40°C.

o Reacción mas lenta: < 35°C.
o Desnaturalización: > 45°C.
036
https://acortar.link/PfjcFx
enzimática
Fase II Reacción es de orden cero la velocidad es independiente de conc. S
Concentración de sustrato
https://acortar.link/H0R2qb https://n9.cl/kuuqx
Fase inicial la velocidad es

lineal con respecto a la
concentración del sustrato
037
https://acortar.link/wbaTur
enzimática
Concentración de sustrato Concentración de Michaelis-Menten (Km)
Velocidad máxima:
A mayor cantidad de sustrato disponibles, se enlazan
con los sitios activos de la enzima, lo que permita que
la E ejerza su actividad al máximo de la velocidad.
https://n9.cl/dabo8
038
enzimática
Fase I:
Cinética de primer orden: La
velocidad de reacción es directamente
proporcional a la concentración del
II sustrato.
Fase II:
I Cinética de orden cero: La velocidad
de reacción es independiente a la
concentración del sustrato.
La enzima esta saturada de sustrato.
https://n9.cl/k6s4b
039
enzimática
Concentración de la Enzima
La velocidad de reacción aumenta a

mayor concentración de enzima y
disminuye a menor concentración de
enzima (Concentraciones fijas de
sustratos).
El valor de Km es independiente de
la concentración de la enzima.
https://n9.cl/gbw14
042
N°
¿Cómo sería el comportamiento de la velocidad de reacción si se varía la concentración del sustrato
y se deja fija la concentración del enzima?
040
https://n9.cl/k6s4b
enzimática
Activadores enzimáticos: Molécula o ion que al unirse a la enzima produce un aumento en la
velocidad de la reacción catalizada.
Pueden ser:
1. iones: Zn+2, Mg+2, Fe+2, Mg+2, Ca+2
MECANISMO DE ACCIÓN ACTIVADORES ENZIMÁTICOS TIPOS IONES:
a. Proporcionar un sitio activo electropositivo que atrae a los grupos cargados
negativamente del sustrato.
b. Función estructural y ayudan a estabilizar la estructura terciaria y cuaternaria de la
enzima.
MECANISMO DE ACCIÓN ACTIVADORES ENZIMÁTICOS TIPOS COENZIMAS:

2. Coenzimas: Moléculas orgánicas como: NAD+ y NADP
a. Actúan como aceptores o donadores de electrones en reacciones de deshidrogenasas. 043
b. Funcionan más como un segundo sustrato
enzimática
Para la actividad óptima de la enzima

los iones metálicos deben estar
presentes para las enzimas que los
requieren.
044
https://acortar.link/yHkcPb
enzimática
Las coenzimas deben estar en

una concentración suficiente
para que se lleven a cabo las
reacciones enzimáticas
046
https://acortar.link/uQY7Mz
Parámetros enzimáticos
Km
(constante para cada enzima) = concentración de S a
la que Vo es ½ Vmáx. Es una medida de la afinidad
de la enzima por S. Cuanto menor es Km, mayor es
la afinidad de la enzima por S.
Kcat
(constante para cada enzima) = número de recambio
= número de moléculas de sustrato convertidas en
producto por molécula de enzima y unidad de
tiempo, en condiciones saturantes del sustrato.
Vmax
Velocidad máxima teórica = la velocidad cuando
todos los centros activos están ocupados con
sustrato. 047
Velocidad Es la velocidad límite a la que tiende la reacción catalizada por enzimas

a concentraciones saturantes del sustrato, es decir cuando toda la enzima
máxima (Vmáx) está como ES.
Vmax = kcat[E]total
Se alcanza cuando todos

los centros activos están
ocupados con el sustrato.
048
https://n9.cl/5ogfs
Constante catalítica (kcat)
o Contempla tanto la afinidad como la capacidad catalítica
o Sólo puede conocerse cuando se tiene a la enzima pura y por tanto se conoce su concentración.
o kcat = Vmax / [E]total o kcat = Vmax / [sitios activos]
o Si uno de los pasos es limitante de la velocidad, kcat es la constante de velocidad de este paso.
o A kcat también se le conoce como número de recambio, porque indica el número máximo de ciclos
catalíticos por sitio activo y por unidad de tiempo.
o Parámetro muy útil para comparar diferentes enzimas o la misma enzima con diferentes sustratos.
o El valor máximo teórico de la constante de especificidad es denominado límite de difusión tiene un valor de
108-109 (M-1 s-1), a las enzimas con esta propiedad se les llama enzimas catalíticamente
perfectas o cinéticamente perfectas.
049
Constante de Michaelis Menten

(Km)
En todos los casos es la
concentración de sustrato a la
que Vo = Vmáx / 2
o Cuanto mayor es Km menor es la afinidad
(predominan las formas E y S libres)
o Cuanto menor es Km mayor es la afinidad
(predomina la forma ES).
050
https://n9.cl/224fq
Constante de especificidad (Vmax/Km

o kcat/Km)
o Indica cuál es el mejor sustrato de una enzima (aquél
que tenga la mayor constante de especificidad).
o Indica la eficiencia catalítica de la enzima a

concentraciones de sustrato por debajo de los niveles
de saturación.
o Representa el paso de unión de la enzima y el

sustrato (cualquier factor que afecte esta constante
está afectando el paso de unión).
https://n9.cl/o64ey
051
https://n9.cl/ugji7
Vmax = Kcat x Et
Km alto = baja afinidad 053

Km bajo = alta afinidad
Km = cte de disociación del ES
Estimación de Vmáx y Km por inspección

Aunque los métodos gráficos dan una
determinación exacta de la Vmax y Km de una
reacción catalizada por una enzima, a veces estos
valores pueden estimarse rápidamente
inspeccionando los valores de Vo al incrementar
[S]. Estimar Vmax y Km de la reacción catalizada
enzimáticamente con los siguientes datos
obtenidos:
Vmáx = 140 μmol/mL min

Km = 1 x 10-5 M
054
Gráfico de Lineweaver-Burk
Como la gráfica de Michaelis-Menten tiene forma hiperbólica, el valor de Km se obtiene

más fácilmente si la ecuación de Michaelis-Menten se transforma en una línea recta.
La ecuación de Lineweaver-Burk toma la forma recíproca de la ecuación de Michaelis-

Menten para producir una ecuación de línea recta.
Graficando 1/v vs 1/S tenemos una línea

recta: Representación de Lineweaver-Burk
056
y= m x+ b
Esta ecuación tiene la forma de la ecuación de la recta y= mx 058

+b
Factores que afectan la actividad
enzimática
Inhibidores
o INHIBIDOR : Molécula o ion que al unirse a la enzima produce
una disminución en la velocidad de la reacción catalizada.
o Se enlazan con diferentes sitios de la molécula enzimática y

producen efectos como VARIACIÓN DE LA VELOCIDAD DE
REACCIÓN y del VALOR DEL Km.
IMPORTANCIA:
1. Mecanismo regulatorios de las células.
2. Estudios de vías metabólicas.
3. Estudio de la estructura, especificidad y mecanismo cinético.
4. Diagnóstico. 058
5. Terapéutica. https://n9.cl/1ft1t
Factores que afectan la actividad
enzimática
Clasificación de los Inhibidores
IRREVERSIBLES REVERSIBLES
o Se unen fuertemente a la enzima, por
lo general formando enlaces o Se unen reversiblemente al E,
covalentes. complejo E-S o ambos.
o No se restaura la actividad o Al remover el inhibidor el enzima
enzimática recupera su actividad
o La disociación complejo E-I es muy
lenta o no ocurre
Tipos:
Tipos: o Inhibición competitiva
o Inhibidores de grupo específicos o Inhibición no competitiva
o Inhibidores dirigidos al sitio activo o Inhibición acompetitiva
o Inhibidores suicidas 059
o Análogos del estado de transición
Inhibidores irreversibles
Grupo Específicos
IAA reacciona con las

cadenas laterales de
Cys https://acortar.link/bgFiZS
061
https://acortar.link/bEGQyW
Grupo Específicos
062
Inhibidores dirigidos al sitio activo

Son moléculas que son estructuralmente
similar al sustrato, que modifican
covalentemente los residuos del sitio activo.
Tosyl phenylalanyl chloromethyl ketone, es un

sustrato análogo de la quimiotripsina. Esta
molécula se une al sitio activo con el residuo Hys
reaccionando irreversiblemente e inhibe la enzima.
Bromoacetol Phosphate (análogo del

bromoacetol fosfato), presenta afinidad por la
triosa-fosfato isomerasa (TIM). Se une a los
residuos glutámicos en el sitio activo de manera
covalente.
063
https://acortar.link/lhz7L1
Inhibidores suicidas
• Compuestos relativamente no
reactivos hasta que se unen al
centro activo del enzima
• El inhibidor no vuelve a ser

activo y no puede reaccionar
con ninguna otra molécula, de
allí su especificidad
MAO degrada neurotransmisores como

dopamina y Serotonina. En enfermedades
como Depresión o Parkinson los niveles de
estos neurotransmisores disminuyen mucho.
Estas enfermedades se tratan con N,N- 064
dimethylpropargylamine. Inhibidor de MAO(-)deprenyl
http://www.herrerobooks.com/pdf/REVE/9788429176025.pdf
Análogos del estado de transición
Se asemejan geométricamente y electrónicamente al estado de transición de la reacción
Enzimas que catalizan la inversión de un centro

estereoespecífico en una molécula biológica.
065
http://www.herrerobooks.com/pdf/REVE/9788429176025.pdf
Susbtrato
Estado de transición
+ Productos
Análogo de
estado de transición 066
https://acortar.link/JaPuzL
Inhibidores reversibles
o ISOSTÉRICO
El inhibidor se une al mismo sitio que el sustrato
(sitio activo).
o ALOSTÉRICO
El inhibidor se une a un sitio diferente al que se
une el sustrato (sitio alostérico).
068
https://n9.cl/ugji7
Inhibición competitiva (IC)
1. Compite con el sustrato por el sitio activo de

la enzima.
2. Impide la fijación del sustrato al enzima,
mientras el Inhibidor (I) ocupa el sitio activo.
3. Muchos IC son similares al sustrato,
formando el complejo EI.
069
Inhibición competitiva (IC)
o Este tipo de inhibición se puede contrarrestar a

concentraciones suficientemente elevadas de
sustrato.
o La Km observada en presencia de un inhibidor, se

denomina Km aparente.
070
o El incremento de la concentración de I
y= m x + b resulta en varias líneas rectas con
intersección común en el eje 1/Vo pero con
pendientes diferentes.
o Como la intersección sobre el eje 1/Vo es
igual a 1/Vmáx podemos ver que Vmáx no
cambia.
o Hay variaciones en el Km aparente.
071
Inhibición competitiva
072
http://www.pharmacy180.com/article/inhibition-of-enzyme-activity-1849/
Inhibición no competitiva
Es un tipo especial de inhibidor que se une con igual
afinidad al enzima libre y al complejo enzima-sustrato
Ki Kii
073
Kii=[ES][I]/[ESI]
Representación gráfica de Inhibición no Km será constante

competitivo Vmáx disminuye
074
Inhibición no competitivo
075
http://www.pharmacy180.com/article/inhibition-of-enzyme-activity-
1849/
Inhibición acompetitivo
o El I se une al complejo ES (EIS)

solamente, no a la enzima libre.
o Esta inhibición es rara, decrecen los
valores de Vmax y Km.
o La reacción puede retrasarse pero no
impedirse Se presenta cuando hay más
de un sustrato en la reacción
076
Inhibición acompetitiva
o El I se une al complejo ES (EIS) solamente, no a la enzima
libre.
o Esta inhibición es rara, decrecen los valores de Vmax y Km.
o La reacción puede retrasarse pero no impedirse Se presenta cuando
hay más de un sustrato en la reacción
077
078
https://acortar.link/9WpDJB
Indique el tipo de inhibición reversible de acuerdo

con las representaciones gráficas de doble recíproco
080
https://acortar.link/rp7Q3Y
Métodos experimentales para
medir actividad enzimática
Métodos experimentales para medir actividad
enzimática
Diseño experimental
o Llenar varios tubos con [S] diferentes

o Adición de la misma cantidad de E c/u
o Medición de [P] antes que disminuya [S]
o v=D[P]/Dt=velocidad inicial de la reacción
o Graficar v en función de [S] inicial
o Mantener la temperatura y el pH constante
082
enzimática
Métodos continuos en el espectrofotómetro:
El progreso de la reacción es monitoreada

por disminución de Abs a 340 nm que
acompaña a la oxidación de NADPH.
083
https://acortar.link/ThCIFr
enzimática
Sustratos sintéticos se pueden usar para medir actividad
Color amarillo 410 nm

084
https://acortar.link/QoFAgk
enzimática
Actúa donde
hayan Arg o Lys
085
https://acortar.link/ODSiXh
Integremos lo aprendido
1. Definir una enzima y sus propiedades
¿Qué aprendiste
hoy? - No son alteradas durante la reacción.
2. Definir términos relacionados con enzima: Cofactor. Coenzima. Grupo
prostético. Apoenzima. Holoenzima.
- Son muy selectivas y muchas enzimas requieren coenzimas no
proteicos o cofactores para cumplir su función catalítica.
3. Explicar el mecanismo de la acción enzimática.
4. Describir los factores que afectan las reacciones enzimáticas.
-pH, temperatura, sustratos, enzimas, activadores e inhibidores.
5. Describir los métodos experimentales para medir actividad enzimática.
-Permitan medir la desaparición del sustrato o aparición de

producto, también podemos usar sustratos sintéticos para determinar 087
esta actividad.
Actividad asincrónica
Video
o 1. Enzimas
https://youtu.be/UVeoXYJlBtI
o 2. Cofactor y coenzimas
https://youtu.be/LK5HzcAOmyA
o 3. Enzyme catalytic strategies
o https://youtu.be/Qviwe17Br3I
Lectura
o Modo de acción de las enzimas.
https://acortar.link/3495bu
o https://biolanhealth.com/
mecanismos-de-accion-de-las- 089
enzimas/
Referencias Bibliográficas
DE CONSULTA

Cuadros Trillos, G. (2019). Mapas conceptuales en bioquímica (1.a ed.). El Manual Moderno
http://elibro.net.cientifica.remotexs.co/en/lc/ucsur/titulos/128368

Melo, V. y Cuamatzi, O. (2019). Bioquímica de los procesos metabólicos. Reverté, S.A. https://elibro.net/es/ereader/ucsur/127790

Müller-Esterl, W. (2020). Bioquímica: fundamentos para medicina y ciencias de la vida. Reverté, S.A.

Piña Garza, E., Martínez Montes, F., Riveros Rosas, H., Laguna, J. y Pardo Vázquez, J.P. (2018). Bioquímica de Laguna y Piña (7.a
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Pulido Villamil, X. C. (2019). Prácticas de bioquímica y estudios de casos en ciencias de la salud. Universidad de Tolima.

Simes, L. E. (2020). Introducción a la bioquímica: interpretación de análisis clínicos. Universitas. 090
OBLIGATORIAS
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Navarro, M., Salazar, J., Salazar, Y. Zarkovic, G. (2022). Manual de prácticas de laboratorio. Bioquímica. Universidad Científica del
Sur.

091
BIOQUÍMICA
Semana 02
Sesión 10
Departamento Académico de Cursos Básicos

Estrategias catalíticas de las
enzimas
CONTENIDOS
Mecanismo de acción de las enzimas
Catálisis covalente
Catálisis ácido-base
Catálisis por aproximación
Catálisis por ion metálico
Resultado de aprendizaje de la sesión
Al finalizar la sesión, el estudiante puede

explicar las estrategias catalíticas de los
enzimas siguiendo procedimientos y ejercicios
prácticos.
https://acortar.link/3iVOU7
04
Reflexión desde la experiencia
Responde las siguientes preguntas
¿Qué es una estrategia catalítica?
¿Cuáles son los tipos de estrategias

catalíticas que utilizan los enzimas?
https://acortar.link/hyjzaz
05
Estrategias catalíticas de las enzimas
(Mecanismos de acción de las enzimas)
06
https://n9.cl/lvxv7
Mecanismos de acción de
las enzimas
Proceso en donde el enzima facilita la formación del estado de transición,

mediante la utilización de la energía de unión de Enzima y Sustrato por
adaptación inducida.
La energía de unión tiene como función:

1. Establecer la especificidad del sustrato
2. Aumentar la eficacia catalítica
08
Tipos de estrategias catalíticas
Mecanismos de acción de las enzimas para conllevar la catálisis de

las reacciones, pueden ser:
1. Catálisis covalente
2. Catálisis ácido-base
3. Catálisis por aproximación
4. Catálisis por ion metálico
09
El centro activo del enzima presentan algunos residuos de aminoácidos con

cadena lateral con grupos nucleofílicos o electrofílicos, los cuales pueden
formar enlaces covalentes unidos con el sustrato para formar un intermediarios
1. Grupos nucleofílicos: reactivos que suplen un par de electrones. Están usualmente cargados
negativamente o positivamente.
2. Grupos electrofílicos: Reactivos que tienen un orbital vacío, los cuales pueden aceptar un
par de electrones. Están cargado positivamente y negativamente.
011
o Es secretada por los acinos del
sina
ip páncreas, como enzima inactiva
iotr (zimógeno).
im
Qu o Convertida a quimiotripsina por la
tripsina, y posterior auto-digestión de la
quimiotripsina (intestino delgado)
https://n9.cl/w9hum
Esta formada por tres cadenas

polipeptídicas enlazadas por
puentes disílfuros
012
https://n9.cl/es7rx
Quimiotripsina Rompe los enlaces peptídicos del extremo carboxilo de aminoácidos con
grupo R aromáticos y apolares alifáticos
013
Rompe a las proteínas en el Quimiotripsina
extremo carboxilo de
aminoácidos aromáticos o
hidrofóbicos
014
in a
ri ps Grupo
i ot
i m nucleofílico Ser
Qu 195
https://n9.cl/n67ty
015
Triada catalítica
Quimiotripsina
La conformación de estos
residuos es estabilizada por
puentes de hidrógeno
https://n9.cl/vcpz9
016
Bolsillo hidrófobico es donde se acomodan las cadenas laterales de Phe y Trp
Lugar de ruptura
ComplejoE-S
Estado de transición Complejo acil-E
1er. Intermediario Acil- +H2O H2O transfiere el Generar la
E H+ a la His y el OH enzima libre
(Hidrólisis para
liberar el ácido al sustrato
carboxílico y
liberar la E) 017
https://n9.cl/3f4s5
https://n9.cl/vcpz9
Quimiotripsina Tripsina Elastasa
Presentan la mismo estrategia catalítica, pero actúan sobre 018

aminoácidos diferentes
Quimiotripsina Tripsina Elastasa
216 Val 190
189
019
Una molécula diferente al agua actúa como dador o aceptor de un

protón.
021
022
Una molécula diferente al agua actúa como dador o aceptor de un

protón.
https://n9.cl/n67ty
Actúa como catalizador básico

Quimiotripsina para aumentar el poder
023
nucleofílico de la Ser195
115
Anhidrasa carbónica
o Tres centros de
coordinación ocupados
por anillos de imidazol de
tres His (94, 96 y 119).
o Un centro de
coordinación adicional
formado por H2O o por
OH dependiendo del pH.
Las facilitan la unión de H+

de una molécula de agua
unida al Zn+2 para formar 024
OH
025
1. Zn+2 facilita la liberación de un protón de una molécula de H2O,
generando un ion OH
https://n9.cl/sx9d2
026
2. El CO2 se une al centro activo del enzima y se posiciona para

reaccionar con el OH-
027
3. El OH- ataca al CO2 convirtiéndolo en ion HCO3-
4. El centro catalítico se regenera con la liberación del

HCO3- y la unión de otra molécula de agua
https://n9.cl/sx9d2 028
Catálisis por aproximación
Las enzimas orientan y aproximan los grupos reactivos.
La combinación de los factores de proximidad y orientación favorece que los sustratos

se unan al centro activo, lo cual explica los incrementos de velocidad observados en
algunas reacciones catalizadas enzimáticamente. los enzimas todavía pueden utilizar
la energía de fijación de un modo adicional para producir catálisis.
1.Proximidad: Aumenta la velocidad de la reacción como las interacciones enzima-

Daniel Koshland 1920 – sustrato alinean grupos químicos reactivos y los mantienen juntos.
2007
Reduce la entropía de los reactivos y por lo tanto hace que las reacciones tales como
las ligaduras o reacciones de adición sean más favorables.
2.Orientación:El efecto de orientación tiene en cuenta la orientación/disposición

espacial de las sustancias reaccionantes. 030
La anhidrasa carbónica se une al dióxido de carbono y al agua en centros

adyacentes para facilitar su reacción.
031
https://n9.cl/sx9d2
¿Cuál es el mecanismo de
catálisis de la tripsina y
anhidrasa carbónica?
https://acortar.link/4YumWk
033
Catálisis por iones metálicos
Existen enzimas que requiere la presencia de iones metálicos para su actividad

catalítica.
Clases de enzimas que requieren iones metálicos.
1. Metaloenzimas: Contiene iones metálicos fuertemente unidos, metales de transición

(Fe+2 , Fe+3 , Cu+2 , Zn+2 , Mn+2 , Co+3 ).
2. Enzimas activados por metal: Fijan débilmente metales presentes en una solución
(Na+ , K+ , Mg+2 o Ca+2 ).
035
El ion facilita la formación de nucleófilo como el ion OH
Metaloenzimas:
036
Enzimas activados por metal (estrategia utilizada

por miosina y enzimas que utilizan ATP).
ADN y ARN polimerasa
Iones (Mg+2; Mn+2) orientan y estabilizan electrostáticamente el grupo trifosfato

cargados negativamente en los desoxinucleótidos y ribonucleótidos.
El ion metálico forma un puente entre el enzima y el sustrato, incrementando la

energía de unión, lo que mantiene al sustrato en una conformación adecuada.
037
Los iones metálicos participan en el proceso catalítico de tres modos principales:
1. Fijándose a sustratos, de modo que los orientan adecuadamente para la reacción.

2. Facilitando reacciones de oxido-reducción, mediante cambios reversibles en el
estado de oxidación del ion metálico.
3. Estabilizando o apantallando electrostáticamente las cargas negativas.
038
Participamos en la siguientes pregunta
¿Cuáles son las estrategias catalíticas que pueden presentar los

enzimas?
1. Catálisis covalente
2. Catálisis ácido-base
3. Catálisis por aproximación
4. Catálisis por ion metálico
https://acortar.link/ttywjs
040
Video
o 1. Enzimas
https://youtu.be/UVeoXYJlBtI
o 2. Cofactor y coenzimas
https://youtu.be/LK5HzcAOmyA
o 3. Enzyme catalytic strategies
o https://youtu.be/Qviwe17Br3I
Lectura
o Modo de acción de las enzimas.
https://acortar.link/3495bu
o https://biolanhealth.com/
mecanismos-de-accion-de-las- 042
enzimas/
DE CONSULTA

Cuadros Trillos, G. (2019). Mapas conceptuales en bioquímica (1.a ed.). El Manual Moderno

Melo, V. y Cuamatzi, O. (2019). Bioquímica de los procesos metabólicos. Reverté, S.A. https://elibro.net/es/ereader/ucsur/127790

Müller-Esterl, W. (2020). Bioquímica: fundamentos para medicina y ciencias de la vida. Reverté, S.A.

Piña Garza, E., Martínez Montes, F., Riveros Rosas, H., Laguna, J. y Pardo Vázquez, J.P. (2018). Bioquímica de Laguna y Piña (7.a
ed.). El Manual Moderno.

Pulido Villamil, X. C. (2019). Prácticas de bioquímica y estudios de casos en ciencias de la salud. Universidad de Tolima.

Simes, L. E. (2020). Introducción a la bioquímica: interpretación de análisis clínicos. Universitas. 043
OBLIGATORIAS
Bittencourt, J. (2018). The Power of Carbohydrates, Proteins, and Lipids (4.a ed.). CreateSpace, An Amazon.com Company.
https://www.researchgate.net/publication/322473648

Macías Alvia, A., Hurtado Astudillo, J. R., Cedeño Holguín, D. M., Cedeño Holguín, F. A., Scott ÁLava, M., Vallejo Valdivieso, P. A.,
Macías Alvia, M. J., Santana Sornoza, J. W., Espinoza Macías, M. J., Ubillús Saltos, S. P., Arteaga Espinoza, S. X., Torres
Macías, O. E., Pigüave Reyes, J. M., Pigüave Reyes, Chavarría Cedeño, D. I., & Intriago Sánchez, K. J. (2018). Introducción al
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Navarro, M., Salazar, J., Salazar, Y. Zarkovic, G. (2022). Manual de prácticas de laboratorio. Bioquímica. Universidad Científica del
Sur.

044

Bioquímica Sem-04 Sesión 10-2023-1

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BIOQUÍMICA

Departamento Académico de Cursos Básicos

Al finalizar la sesión, el estudiante puede

Responde las siguientes preguntas

¿Qué son las enzimas?

¿Cómo están constituido las enzimas?

¿Cuál es la función en los procesos biológicos del

¿Cuáles son los pasos para que un enzima produzca

Las enzimas son agentes químicos (proteínas) que

La mayoría de la reacciones bioquímicas son

En ausencia de las enzimas las reacciones se

1. Enfermedades de errores congénitos del metabolismo se

2. Procesos inflamatorios, necrosis de tejidos, o afecciones por

La determinación de la actividad o concentración de la enzima es

o Se caracterizan por su poder catalítico y su especificidad

1. No se alteran ni se consumen en la reacción.

SON ESENCIALES PARA LA ACTIVIDAD CATALÍTICA

Estado activado o de transición de reactivo y/o sustrato

Energía de activación: energía necesaria para

1.Enzima y sustrato se combinan y forman un complejo o Presenta aminoácidos orientados en forma

2. La E (1) permite que los sustratos se

Estado intermedio de alta energía,

o Cada E tiene un sitio activo y solo un S

o Complementaridad geométrica entre el S

o No explica la catálisis (explica la

o El sustrato se enlaza con el

Estos nombres no describen la química de la reacción

Principio de la Clasificación Internacional

o Todas las enzimas son clasificadas en 6 categorias dependiendo del tipo de

Al estudiar la actividad enzimática, se observa la velocidad de reacción en diferentes

o Rango óptimo 35-40°C.

Fase inicial la velocidad es

La velocidad de reacción aumenta a

MECANISMO DE ACCIÓN ACTIVADORES ENZIMÁTICOS TIPOS COENZIMAS:

Para la actividad óptima de la enzima

Las coenzimas deben estar en

Velocidad Es la velocidad límite a la que tiende la reacción catalizada por enzimas

Se alcanza cuando todos

o Contempla tanto la afinidad como la capacidad catalítica

o kcat = Vmax / [E]total o kcat = Vmax / [sitios activos]

Constante de Michaelis Menten

Constante de especificidad (Vmax/Km

o Indica la eficiencia catalítica de la enzima a

o Representa el paso de unión de la enzima y el

Km alto = baja afinidad 053

Estimación de Vmáx y Km por inspección

Vmáx = 140 μmol/mL min

Como la gráfica de Michaelis-Menten tiene forma hiperbólica, el valor de Km se obtiene

La ecuación de Lineweaver-Burk toma la forma recíproca de la ecuación de Michaelis-

Graficando 1/v vs 1/S tenemos una línea

Esta ecuación tiene la forma de la ecuación de la recta y= mx 058

o Se enlazan con diferentes sitios de la molécula enzimática y

IAA reacciona con las

Inhibidores dirigidos al sitio activo

Tosyl phenylalanyl chloromethyl ketone, es un

Bromoacetol Phosphate (análogo del

• El inhibidor no vuelve a ser

MAO degrada neurotransmisores como

Análogos del estado de transición

Se asemejan geométricamente y electrónicamente al estado de transición de la reacción

Enzimas que catalizan la inversión de un centro

Inhibición competitiva (IC)

1. Compite con el sustrato por el sitio activo de