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Unidad 2

Enzimología

Edición: BIOQUÍMICA GENERAL


Tatiana Zuvić M., MSc DBIO1037
Paula Aracena S., PhD
Función catalítica de las proteínas

MOVIMIENTO
Miosina, actina
TRANSPORTE CATÁLISIS REACCIONES A LA
Albúmina, hemoglobina Enzimas
VELOCIDAD COMPATIBLE
CON LA VIDA
ADHESIÓN COMUNICACIÓN
CELULAR Hormonas, proteínas de
Integrinas, caderinas señalización

NECESIDAD DE
PROTEÍNAS DE CATALIZADORES
MEMBRANA INMUNIDAD
Receptores, bombas Anticuerpos, complemento
ASISTENCIA
Histonas, chaperonas
Resultados de aprendizaje

Interpreta los datos cinéticos de una reacción


enzimática y el efecto de la modulación por
inhibidores.

Describe los mecanismos generales de regulación


enzimática y su efecto en los parámetros de cinética
enzimática.
Recursos Conceptuales

PFK-1 ATP sintasa

Succinato
deshidrogenasa
CATÁLISIS CINÉTICA
ENZIMAS ENZIMÁTICA ENZIMÁTICA

¿Qué son? ¿Cómo aumentan la ¿Cómo se mide


¿Para qué sirven? velocidad de las la función de
¿Cómo se clasifican? reacciones? las enzimas?
Recursos Conceptuales

LDH
GGT

GOT

REGULACIÓN ENZIMAS
ENZIMATICA EN CLÍNICA
¿Cómo y por qué ¿Cuál es su utilidad
son reguladas? en clínica?
Enzimas
Son catalizadores biológicos que actúan aumentando la velocidad de las
reacciones metabólicas.

PFK-1 ATP sintasa Ribozimas

Succinato
deshidrogenasa Ribosoma

NATURALEZA QUÍMICA REQUERIMIENTO ESTRUCTURAL

Casi todas las enzimas tienen Para ejercer su acción, la enzima


naturaleza PROTEICA. debe estar en su
La excepción son las ribozimas. CONFORMACIÓN NATIVA.
Enzimas
La acción enzimática se caracteriza por la formación de un Complejo Enzima-
Sustrato, que se designa como [ES].

Unión de
sustrato Complejo
B Enzima-Sustrato
(ES)
A
ENZIMA
A+B C+D Catálisis
CICLO
SUSTRATOS PRODUCTOS CATALÍTICO
Enzima
Moléculas sobre las que Moléculas en las que se libre
actúa la enzima transforman los sustratos

Regeneración Complejo
de la enzima Enzima-Producto
C
(EP)
D
Sitio activo de las enzimas
Es un lugar tridimensional de la proteína enzimática al cual se une el sustrato
y donde se lleva a cabo la reacción (transformación del sustrato en producto).

SITIO ACTIVO
Residuos de
UNIÓN CON EL Residuos
SUSTRATO CATALÍTICOS Microambiente
favorable a la
reacción
Sitio activo de las enzimas
Esta formado por residuos lejanos en la secuencia lineal, pero que quedan
cercanos después del plegamiento tridimensional.

RESIDUOS DEL SITIO ACTIVO

Secuencia lineal

Estructura tridimensional
Sitio activo de las enzimas
El sitio activo también se asocia con cofactores o coenzimas, si la enzima los
emplea.

COFACTOR

SITIO ACTIVO

COENZIMA
Microambiente
favorable a la
APOENZIMA reacción

HOLOENZIMA
Cofactores y coenzimas
Son moléculas no proteicas, indispensables para la catálisis, que se asocian
reversiblemente a las enzimas, como si fuesen un sustrato más.

COFACTOR INORGÁNICO COENZIMA

Especie inorgánica, Cofactor orgánico o


usualmente un catión. metaloorgánico.
Cofactores inorgánicos y fuentes dietarias
Usualmente son cationes, los cuales pueden ser suministrados a través de la
dieta en diversos alimentos.

Mg2+ Mn2+
Zn2+
Hexoquinasa Arginasa
Piruvato quinasa Fe2+, Fe3+ Superóxido dismutasa

Anhidrasa carbónica
Carboxipeptidasa
ADN polimerasa Cu+, Cu2+
Catalasa
Nitrogenasa
Alcohol deshidrogenasa
Citocromo oxidasa
Coenzimas y fuentes dietarias
Son moléculas orgánicas, la mayoría derivadas de vitaminas, las cuales
pueden ser suministradas a través de la dieta en diversos alimentos.

Ascorbato
Vitamina C
Coenzimo A

Ácido pantoténico
(Vitamina B5)

Coenzima Q10
Tetrahidrofolato
Ácido fólico (Vitamina B9)
NAD+ Niacina
NADP+ (Vitamina B3)
Grupos prostéticos
Son moléculas no proteicas, indispensables para la catálisis, que se
encuentran fuertemente asociados o unidos covalentemente a las enzimas.
Intercambio
de electrones
Grupos Fe-S Interacción con oxígeno
molecular
Grupo hem

SUCCINATO
FAD
DESHIDROGENASA
Intercambio de
(Complejo II mitocondrial)
átomos de hidrógeno
Grupos prostéticos y fuentes dietarias
Son moléculas no proteicas, indispensables para la catálisis, que se
encuentran fuertemente asociados o unidos covalentemente a las enzimas.

Biotina
Hem Vitamina H

FAD
Piridoxal
FMN Riboflavina
(Vitamina B2) fosfato
Piridoxina (Vitamina B6)
Grupos Fe-S
Ácido lipoico
Propiedades de las Son

enzimas catalizadores

No cambian
Pueden ser
la constante
reguladas
de equilibrio

PROPIEDADES

Trabajan en
condiciones de
pH y Son
temperatura específicas
determinadas

No se
consumen
durante la
reacción
Propiedades de las enzimas: Catálisis
Las enzimas aumentan la velocidad de una reacción miles o millones de veces,
sin alterar el equilibrio de la reacción.

Algunos aumentos de la velocidad de


reacción producidos por enzimas

Ciclofilina 105 VELOCIDAD DE LA EQUILIBRIO DE LA


REACCIÓN REACCIÓN
Anhidrasa carbónica 107
Triosa fosfato isomerasa 109
Carboxipeptidasa A 1011 Las enzimas no hacen posibles
Fosfoglucomutasa 1013
reacciones energéticamente imposibles,
sólo las aceleran.
Succinil-CoA transferasa 1014
Adaptado de Lehninger, Nelson & Cox (2009)
Propiedades de las enzimas: Catálisis
Toda reacción química debe superar un umbral energético para proceder. Este
umbral se denomina energía de activación.

La velocidad de una reacción


depende de la energía de activación.

MÁS MÁS
RÁPIDA
Ea LENTA
Propiedades de las enzimas: Catálisis
El único modo de alterar la energía de activación de una reacción consiste en
cambiar el mecanismo a través del cual ésta se produce.

MECANISMO DIFERENTE

DISTINTO ESTADO DE TRANSICIÓN

DIFERENTE ENERGÍA DE ACTIVACIÓN

DIFERENTE VELOCIDAD
Propiedades de las enzimas: Catálisis
Las enzimas participan en la reacción que catalizan, por lo que alteran su
mecanismo de tal forma que disminuyen la energía de activación.

Complejo
Enzima-Sustrato
Reacción no catalizada (ES)

S P
CICLO
CATALÍTICO
Enzima
Reacción catalizada libre

S+E ES EP P+E
Complejo
Enzima-Producto
(EP)
Propiedades de las enzimas: Catálisis
Las enzimas participan en la reacción que catalizan, por lo que alteran su
mecanismo de tal forma que disminuyen la energía de activación.

=1
Reacción no catalizada
=1
S P
Ea
=2

Energía
=1
SUSTRATOS Ea
ES =3
Reacción catalizada
=1 =2 =3 EP
PRODUCTOS
S+E ES EP P+E

Progreso de la reacción
Propiedades de las enzimas: Catálisis
La acción enzimática depende de dos etapas fundamentales: la unión a los
sustratos y la etapa catalítica.

=1
Reacción no catalizada Ea
=1
S P Ea
=2

Energía
=1
SUSTRATOS
ES =3
Reacción catalizada
=1 =2 =3 EP
PRODUCTOS
S+E ES EP P+E Unión a
sustratos
Catálisis

Progreso de la reacción
Unión a Catálisis
sustratos
Propiedades de las enzimas: Especificidad
Cada enzima es específica para sustratos y la reacción catalizada, debido a la
forma del sitio activo y a los residuos presentes en éste.

Residuos de
UNIÓN CON EL Residuos
SUSTRATO CATALÍTICOS
Cada enzima es específica para Cada enzima es específica para la
sus sustratos reacción que cataliza

ESTO ES POSIBLE, EN PARTE, DEBIDO A LA


DIFERENCIA EN TAMAÑO ENTRE ENZIMA Y SUSTRATOS
Propiedades de las enzimas: Especificidad
La unión del sustrato a la enzima responde al modelo de “ajuste inducido”: la
enzima es complementaria al segundo estado de transición.

Reacción catalizada
=1 =2 =3 =2
S+E ES EP P+E =1

Energía
SUSTRATOS
ES =3

Si la enzima fuese complementaria al EP


PRODUCTOS
sustrato (modelo “llave-cerradura”), ES
la reacción no seguiría en forma
espontánea.
Progreso de la reacción
Propiedades de las enzimas: Mecanismo catalítico
Las enzimas cumplen su función catalítica a través varios mecanismos, que son
posibles debido a los residuos de unión a sustrato y los catalíticos.

Se ganan
interacciones

Reacción catalizada
=1 =2 =3 =2
S+E ES EP P+E =1

Energía
SUSTRATOS
ES =3

Al ser complementaria al segundo EP


PRODUCTOS
estado de transición (modelo de Se crean
interacciones
“ajuste inducido”), la reacción continúa
espontáneamente a productos.
Progreso de la reacción
Propiedades de las enzimas: Especificidad
El modelo de “ajuste inducido” supone un cambio conformacional de la
enzima para lograr la complementariedad al estado de transición.

SUSTRATO

Cambio conformacional

COMPLEJO
ENZIMA
ENZIMA SUSTRATO
Propiedades de las Orientan a los
sustratos de

enzimas: manera óptima


para la reacción

Mecanismos de
Reaccionan
catálisis con el sustrato
para generar
Generan un
entorno
estados de favorable para
transición la reacción
nuevos
MECANISMOS

Residuos de
UNIÓN CON Residuos
EL SUSTRATO CATALÍTICOS
Causan Generan un
distorsiones en entorno
el sustrato que desfavorable
son favorables para reacciones
para la reacción secundarias
Propiedades de las enzimas: Tº óptima
Las enzimas presentan una temperatura óptima de catálisis, determinada por
un equilibrio entre su efecto termodinámico y el de desnaturalización.

EFECTO TERMODINÁMICO

La velocidad de las reacciones DESNATURALIZACIÓN


químicas no catalizadas es siempre
proporcional a la temperatura. TEMPERATURA ÓPTIMA

Velocidad de reacción
Las reacciones catalizadas por enzimas
aumentan su velocidad a medida que
aumenta la temperatura, hasta una Tº óptima,
Reacción
específica para cada enzima. catalizada por
enzimas
A mayor temperatura, se produce la Reacción no
catalizada
desnaturalización de la enzima, por
lo que la velocidad disminuye.
Temperatura
Propiedades de las enzimas: pH óptimo
En forma análoga a la temperatura óptima, las enzimas tienen un pH óptimo
para la catálisis.

La velocidad de las reacciones pH ÓPTIMO


químicas no catalizadas pueden

Velocidad de reacción
responder o no al pH del medio.
Reacción
catalizada por
Una reacción catalizada por enzimas enzimas
siempre responderá al pH, ya que la
estructura proteica es alterada por la
acidez del medio. Reacción no
catalizada

El pH óptimo es específico de cada


enzima. pH
Propiedades de las enzimas: pH óptimo
Un cambio en el pH afecta la unión del sustrato y propia catálisis, debido al
cambio en la estructura de la proteína enzimática.

Succinato deshidrogenasa y su sustrato a distintos pH

pH 2 pH 7 pH 13

¿A cuál pH se produce la mejor interacción con el sustrato?


Clasificación de enzimas
Las enzimas se clasifican en seis clases, según la reacción que catalizan.

Clase de enzima Tipo de reacción que catalizan Ejemplos


Succinato deshidrogenasa
Oxidorreductasas Óxido-reducción.
Citocromo oxidasa
Transferencia de un grupo desde una Proteína Quinasa A
Transferasas
molécula a otra. Transaminasa GOT
Ruptura de un enlace por adición de una Tripsina
Hidrolasas
molécula de agua. Aldolasa
Liasas Ruptura de enlaces no hidrolítica (sin agua). Piruvato descarboxilasa
Transferencia de un grupo dentro de la Glucomutasa
Isomerasas
misma molécula. Triosa fosfato isomerasa
Formación de enlaces entre dos moléculas, Acil-CoA sintetasa
Ligasas
dependiente de ATP. HMG-CoA sintetasa
Cinética enzimática
Corresponde al estudio cuantitativo de la función enzimática, a través de las
propiedades cinéticas de las reacciones catalizadas por las enzimas.

AFINIDAD DE LA ENZIMA CANTIDAD DE UNIDADES EFICIENCIA


POR SU SUSTRATO ENZIMÁTICAS ACTIVAS DE LA CATÁLISIS

Evaluación de la avidez de Determinación de la concentración Cuantificación de cuán eficiente es


la enzima por cada sustrato de enzimas activas la catálisis enzimática
Cinética enzimática: Velocidad de reacción
La velocidad de una reacción se puede cuantificar, ya sea midiendo la
desaparición de reactante o la aparición de producto.

[R]
A medida que transcurre el tiempo, la
Concentración

concentración de reactante disminuirá, debido a


[P] que se transforma a producto.

En forma análoga, la concentración de producto


aumentará a medida que transcurre el tiempo.

Tiempo
Cinética enzimática: Velocidad de reacción
La velocidad de una reacción se puede cuantificar, ya sea midiendo la
desaparición de reactante o la aparición de producto.

[R]
La velocidad de reacción se cuantifica midiendo
Concentración

Pendiente
negativa la pendiente de la porción lineal de estas curvas
[P]

Δ [R] Δ [P]
Pendiente V=- =
positiva Δt Δt

Tiempo
Cinética enzimática: Velocidad de reacción
La velocidad de una reacción catalizada se llama actividad enzimática y es
proporcional a la concentración de complejo ES.

Reacción catalizada

S+E ES EP P+E

EL VERDADERO REACTANTE DE UNA REACCIÓN


CATALIZADA ES EL COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO.

LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA SIEMPRE ES PROPORCIONAL


A LA CONCENTRACIÓN DEL COMPLEJO ENZIMA-SUSTRATO.
Cinética enzimática: Curva de saturación
La curva de saturación de sustrato es un gráfico que nos entrega mucha
información acerca de la actividad enzimática.

La curva de saturación de sustrato se obtiene


graficando la velocidad de reacción, medida
a diferentes concentraciones de sustrato.
Velocidad
Velocidad

máxima
(Vmáx) Presenta dos porciones relevantes:
la velocidad inicial y la velocidad máxima.
Velocidad
inicial (V0)
La diferencia entre estas velocidades se explica
por la presencia de enzima libre o
[Sustrato] completamente saturada con sustrato.
Cinética enzimática: Velocidad inicial
Corresponde a la velocidad medida a bajas concentraciones de sustrato, a las
cuales aún existe enzima libre de sustrato (condición no saturante).
Velocidad

Velocidad
inicial (V0)
En condiciones de velocidad inicial, no hay
suficiente sustrato para “ocupar” a toda la
[Sustrato]
enzima presente.
Cinética enzimática: Velocidad inicial
Corresponde a la velocidad medida a bajas concentraciones de sustrato, a las
cuales aún existe enzima libre de sustrato (condición no saturante).

SUSTRATO ENZIMA
Velocidad

[S]total = [ES] [E]total = [E]libre + [ES]


Velocidad
inicial (V0)
Todo el sustrato se La enzima se encuentra
encuentra en la forma de libre o en la forma de
[Sustrato] complejo ES. complejo ES
Cinética enzimática: Velocidad inicial
Corresponde a la velocidad medida a bajas concentraciones de sustrato, a las
cuales aún existe enzima libre de sustrato (condición no saturante).

LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA


SIEMPRE ES PROPORCIONAL A LA [ES].
Velocidad

Velocidad COMO [S] = [ES], LA VELOCIDAD MEDIDA ES


inicial (V0) PROPORCIONAL A LA [S].

[Sustrato]
Cinética enzimática: Velocidad máxima
Corresponde a la velocidad medida a altas concentraciones de sustrato, a las
cuales toda la enzima está como complejo ES (condición saturante).

Velocidad
Velocidad

máxima
(Vmáx)

En condiciones de velocidad máxima, toda la


enzima presente está “ocupada” por el sustrato y
[Sustrato]
existe sustrato libre.
Cinética enzimática: Velocidad máxima
Corresponde a la velocidad medida a altas concentraciones de sustrato, a las
cuales toda la enzima está como complejo ES (condición saturante).

SUSTRATO ENZIMA

Velocidad
Velocidad

máxima
(Vmáx)

[S]total = [S]libre + [ES] [E]total = [ES]

El sustrato se encuentra Toda la enzima se


libre o en la forma de encuentra en la forma de
[Sustrato] complejo ES complejo ES
Cinética enzimática: Velocidad máxima
Corresponde a la velocidad medida a altas concentraciones de sustrato, a las
cuales toda la enzima está como complejo ES (condición saturante).

LA VELOCIDAD DE UNA REACCIÓN ENZIMÁTICA


SIEMPRE ES PROPORCIONAL A LA [ES].
Velocidad
Velocidad

máxima COMO LA [ES] SE HACE CONSTANTE E


(Vmáx) INDEPENDIENTE DE LA [S], LA VELOCIDAD SE
HACE CONSTANTE Y NO AUMENTA MÁS A
MEDIDA QUE AUMENTA LA [S].

POR LO TANTO, LA Vmáx PROPORCIONA


UNA IDEA DE LA CANTIDAD
[Sustrato] DE ENZIMA ACTIVA PRESENTE.
Cinética enzimática: Velocidad máxima
Corresponde a la velocidad medida a altas concentraciones de sustrato, a las
cuales toda la enzima está como complejo ES (condición saturante).

MUESTRA A
Velocidad

¿En cuál muestra hay más enzima activa?


MUESTRA B

[Sustrato]
Cinética enzimática: Michaelis-Menten
Leonor Michaelis y Maude Menten definieron matemáticamente la curva de
saturación de sustrato.

Vmáx [S]
V= Michaelis Menten
Velocidad

KM + [S]
Constante de
Michaelis-Menten

[Sustrato]
Cinética enzimática: KM
La constante de Michaelis-Menten (KM) corresponde a la constante de
equilibrio de la disociación del complejo ES.

Equilibrio gobernado por la


constante de afinidad (Kafinidad)

Reacción catalizada ASOCIACIÓN

S+E ES EP P+E
DISOCIACIÓN

Equilibrio gobernado por la


constante de disociación (KM)
Cinética enzimática: KM
La constante de Michaelis-Menten (KM) corresponde a la constante de
equilibrio de la disociación del complejo ES.

[ES]
Kafinidad =
[S] [E]

Reacción catalizada ASOCIACIÓN

S+E ES EP P+E
DISOCIACIÓN

[S] [E] 1
KM = =
[ES] Kafinidad
Cinética enzimática: Relación entre KM y afinidad
Al ser el inverso de la afinidad, la KM nos permite deducir la afinidad de la
enzima por su sustrato.
Velocidad

Kafinidad
MENOR MAYOR
AFINIDAD
AFINIDAD
KM

[Sustrato]
Cinética enzimática: Cálculo de la KM
Matemáticamente, la KM puede calcularse como la concentración de sustrato
que produce la mitad de la Vmáx.

Vmáx
Velocidad

Vmáx /2 LA KM PUEDE SER INTERPOLADA


GRÁFICAMENTE COMO LA [S] QUE
CORRESPONDE A Vmáx/2.

KM [Sustrato]
Cinética enzimática: Cálculo de la KM
Matemáticamente, la KM puede calcularse como la concentración de sustrato
que produce la mitad de la Vmáx.

ENZIMA A
Kafinidad
MENOR MAYOR
AFINIDAD
AFINIDAD
ENZIMA B
Velocidad

KM

¿Cuál de las dos enzimas tiene mayor KM?

¿Cuál de las dos enzimas tiene mayor


afinidad por el sustrato?
[Sustrato]
Cinética enzimática: Recambio y eficiencia
catalítica
Son parámetros cinéticos adicionales a KM y Vmáx.

Reacción catalizada
kcat Vmáx
kcat
S+E ES P+E KM KM
NÚMERO DE RECAMBIO (kcat) EFICIENCIA CATALÍTICA

Máximo número de moléculas de un Medida de la eficiencia de una enzima para


sustrato que una molécula de enzima puede catalizar una reacción
convertir en producto por unidad de tiempo
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
La representación de Lineweaver-Burk es una linearización de la curva de
saturación de sustrato a través del gráfico de dobles recíprocos.
1/Velocidad

Lineweaver Burk
1/Vmáx

KM/Vmáx 1 KM 1 1
= +
V Vmáx [S] Vmáx
1/[Sustrato]
- 1/KM
y = pendiente x + intercepto
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

Si la afinidad por el sustrato baja

Aumenta la KM
1/Velocidad

Disminuye 1/KM

El intercepto en el eje x se desplaza a la derecha

Una disminución de afinidad por el sustrato se


1/[Sustrato] verá como un movimiento del intercepto en el
eje x hacia la derecha
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

Si la Vmáx baja
1/Velocidad

Aumenta 1/Vmáx

El intercepto en el eje y se desplaza hacia arriba

Una disminución de la Vmáx se verá como un


1/[Sustrato] movimiento del intercepto en el eje y hacia arriba
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

Si la eficiencia catalítica baja

Disminuye Vmáx/KM
1/Velocidad

Aumenta KM/Vmáx

La pendiente de la recta aumenta

Una disminución de la eficiencia catalítica se verá


1/[Sustrato] como un aumento de la pendiente
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

A
¿Tienen la misma afinidad?
B
1/Velocidad

¿Tienen la misma Vmáx?

¿Tienen la misma eficiencia catalítica?

1/[Sustrato]
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

A
¿Tienen la misma afinidad?
B
1/Velocidad

¿Tienen la misma Vmáx?

¿Tienen la misma eficiencia catalítica?

1/[Sustrato]
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

A
¿Tienen la misma afinidad?
B
1/Velocidad

¿Tienen la misma Vmáx?

¿Tienen la misma eficiencia catalítica?

1/[Sustrato]
Cinética enzimática: Lineweaver-Burk
Esta representación permite discriminar más fácilmente cambios de KM o
Vmáx de una enzima, o comparar estos parámetros para diferentes enzimas.

A
¿Tienen la misma afinidad?
B
1/Velocidad

¿Tienen la misma Vmáx?

¿Tienen la misma eficiencia catalítica?

1/[Sustrato]
Resultados de aprendizaje

Interpreta los datos cinéticos de una reacción


enzimática y el efecto de la modulación por
inhibidores.

Describe los mecanismos generales de regulación


enzimática y su efecto en los parámetros de cinética
enzimática.
Inhibición irreversible de enzimas
Consiste en la inhibición de la función enzimática por unión covalente del
inhibidor a la enzima.

PMSF
(Modifica residuos de serina)

Yodoacetamida DMPA
(Modifica residuos de cisteína) (Modifica FAD)

MODIFICACIÓN COVALENTE MODIFICACIÓN COVALENTE


DE RESIDUOS ESPECÍFICOS DE GRUPOS PROSTÉTICOS

Son muy utilizados para identificar residuos o grupos prostéticos esenciales


para la unión de sustrato o la catálisis
Inhibición reversible de enzimas
Consiste en la inhibición de la función enzimática por unión del inhibidor a la
enzima a través de interacciones no covalentes.

INHIBICIÓN COMPETITIVA
CATÁLISIS El inhibidor interfiere con la etapa de unión al sustrato

INHIBICIÓN NO COMPETITIVA
S+E ES P+E
El inhibidor interfiere con la etapa catálisis

UNIÓN INHIBICIÓN MIXTA


AL SUSTRATO El inhibidor interfiere con ambas etapas
Inhibición competitiva de enzimas
Se produce por una competencia entre el sustrato y el inhibidor (de
estructura similar al sustrato) por unirse al sitio activo.

Sustrato
ENZIMA
ACTIVA

A baja concentración de sustrato, habrá


competencia, lo que se refleja como una
disminución aparente de la afinidad
ENZIMA
INACTIVA
Inhibidor Aumenta la KM aparente
Inhibición competitiva de enzimas
Se produce por una competencia entre el sustrato y el inhibidor (de
estructura similar al sustrato) por unirse al sitio activo.

Sustrato
ENZIMA
ACTIVA

A alta concentración de sustrato, éste


desplaza al inhibidor de la enzima
ENZIMA
INACTIVA
La Vmáx se mantiene
Inhibidor
Inhibición competitiva de enzimas
Se produce por una competencia entre el sustrato y el inhibidor (de
estructura similar al sustrato) por unirse al sitio activo.

-I +I
Vmáx

-I

1/Velocidad
+I
Velocidad

1
Vmáx

KM KM 1 1
[Sustrato] - - 1/[Sustrato]
KM KM
Inhibición no competitiva de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
sólo la catálisis.

ENZIMA
Sustrato
ACTIVA

Inhibidor

A baja concentración de sustrato, como no


hay competencia, la unión del inhibidor
ENZIMA provocará una disminución de catálisis
INACTIVA
Inhibidor La KM aparente se mantiene
Sustrato
Inhibición no competitiva de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
sólo la catálisis.

ENZIMA
Sustrato
ACTIVA

Inhibidor

A alta concentración de sustrato, como no


hay competencia, no hay desplazamiento
ENZIMA del inhibidor.
INACTIVA
Inhibidor La Vmáx disminuye
Sustrato
Inhibición no competitiva de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
sólo la catálisis.

+I
-I Vmáx

-I

1/Velocidad
1
Velocidad

Vmáx
+I
Vmáx 1
Vmáx

KM 1
[Sustrato] - 1/[Sustrato]
KM
Inhibición mixta de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
la afinidad por el sustrato y la catálisis.

ENZIMA
Sustrato
ACTIVA

Inhibidor

A baja concentración de sustrato, no hay


ENZIMA competencia, la unión del inhibidor
INACTIVA provoca una disminución de afinidad

Inhibidor La KM aparente aumenta


Sustrato
Inhibición mixta de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
la afinidad por el sustrato y la catálisis.

ENZIMA
Sustrato
ACTIVA

Inhibidor

A alta concentración de sustrato, el


ENZIMA inhibidor tampoco puede ser desplazado
INACTIVA

Inhibidor La Vmáx aparente disminuye


Sustrato
Inhibición mixta de enzimas
Se produce por la unión del inhibidor a un sitio diferente del activo, afectando
la afinidad por el sustrato y la catálisis.

-I +I
Vmáx

-I

1/Velocidad
1
Velocidad

Vmáx
Vmáx
+I
1
Vmáx

KM KM 1 1
[Sustrato] - - 1/[Sustrato]
KM KM
Inhibición reversible de enzimas: Resumen
Los cambios en KM y Vmáx aparentes permiten discriminar el mecanismo de
inhibición enzimática de un inhibidor

Tipo de inhibición Cambio en KM Cambio en Vmáx Cambio en eficiencia catalítica

Competitiva Aumenta Ninguno Disminuye


No competitiva Ninguno Disminuye Disminuye
Mixta Aumenta Disminuye Disminuye
Resultados de aprendizaje

Interpreta los datos cinéticos de una reacción


enzimática y el efecto de la modulación por
inhibidores.

Describe los mecanismos generales de regulación


enzimática y su efecto en los parámetros de cinética
enzimática.
Propiedades de las
enzimas: Modulación
alostérica
Regulación

TIPOS DE
REGULACIÓN

Escisión Modificación
proteolítica covalente
Regulación de enzimas: Modulación alostérica
Así como otro tipo de proteínas (por ejemplo, hemoglobina), algunas enzimas
están sujetas a regulación por moduladores alostéricos.

Sustrato

Sustrato

Activador Inhibidor
alostérico
Enzima alostérico Enzima
inactiva Enzima activa Enzima activa inactiva

ACTIVACIÓN ALOSTÉRICA INHIBICIÓN ALOSTÉRICA


Regulación de enzimas: Modulación alostérica
La cinética de enzimas alostéricas es diferente a las enzimas Michaelianas
(que siguen cinética de Michaelis-Menten).

Vmáx La curva de saturación de sustrato presenta una


forma sigmoidea característica.
Velocidad

Vmáx /2

La constante de disociación del complejo


enzima-sustrato (K0.5) se calcula del mismo
modo que la KM por interpolación gráfica.

K0.5 [Sustrato]
Regulación de enzimas: Modulación alostérica
La cinética de enzimas alostéricas es diferente a las enzimas Michaelianas
(que siguen cinética de Michaelis-Menten).

Vmáx Los moduladores alostéricos modifican la K0.5


de las enzimas por sus sustratos.
Velocidad

Un activador alostérico provocará una disminución


de la K0.5, lo que se observa como un movimiento
de la sigmoidea hacia la izquierda.

K0.5 K0.5 [Sustrato]


Regulación de enzimas: Modulación alostérica
La cinética de enzimas alostéricas es diferente a las enzimas Michaelianas
(que siguen cinética de Michaelis-Menten).

Vmáx Los moduladores alostéricos modifican la K0.5


de las enzimas por sus sustratos.
Velocidad

Un inhibidor alostérico provocará un aumento de la


K0.5, lo que se observa como un movimiento de la
sigmoidea hacia la derecha.
K0.5
K0.5 [Sustrato]
Regulación de enzimas: Modificación covalente
Algunas enzimas están sujetas a regulación por modificaciones covalentes
reversibles de residuos específicos.

Grupos
Nombre de la Grupo que
modificables más
modificación modifica
frecuentes
O-fosforilación Ser, Thr, Tyr (-OH) Fosforilo Existen más de 100
N-glicosilación Asn (amida) Glicósido diferentes
modificaciones
O-glicosilación Ser, Thr (-OH) Glicósido
covalentes reversibles.
N-terminal, Lys
N-acetilación Acetilo
(amina)
N-metilación Arg, Lys (amina) Metilo
Regulación de enzimas: Modificación covalente
La reversibilidad de estas modificaciones es posibilitada por enzimas que
catalizan la modificación y otras que catalizan la remoción de la misma.

Enzima que cataliza


la modificación

QUE LA MODIFICACIÓN
Enzima sin Enzima COVALENTE ACTIVE O
modificar modificada INACTIVE A LA ENZIMA ES
ESPECÍFICO DE LA ENZIMA.

Enzima que cataliza la


remoción de la modificación
Regulación de enzimas: Fosforilación reversible
La regulación por O-fosforilación reversible, catalizada por proteína quinasas
o proteína fosfatasas, es de las más relevantes en el metabolismo celular.

Catalizada por
proteína quinasas

FOSFORILACIÓN

DESFOSFORILACIÓN

Catalizada por
proteína fosfatasas
Regulación de enzimas: Escisión proteolítica
Algunas enzimas son sintetizadas como zimógenos inactivos, activables por la
ruptura hidrolítica de una porción específica de su cadena polipeptídica.

Catalizada por Enzima


proteasas activa
Zimógeno
inactivo ESCISIÓN PROTEOLÍTICA

ESTA REGULACIÓN ES CARÁCTERÍSTICA DE ENZIMAS DIGESTIVAS,


DE APOPTOSIS Y FACTORES DEL COMPLEMENTO
Enzimas de utilidad clínica
Existen una serie de actividades enzimáticas que se miden en el suero
(actividad sérica) y que permiten conocer daños tisulares específicos.

Creatina fosfoquinasa
Baja actividad
plasmática

Alta actividad
plasmática

ISOENZIMAS MARCADORES DE DAÑO


Enzimas codificadas por genes La actividad de estas enzimas sólo se
diferentes, pero que catalizan la misma detecta en el suero si han sido liberadas
reacción, y son tejido específicas a la sangre por destrucción de tejidos
Enzimas de utilidad clínica: Transaminasas y
transpeptidasas.
Las más frecuentemente medidas son: GOT, GPT y GGT.

Leucocitos

Eritrocitos
Vesícula biliar
Páncreas

GOT GPT GGT


Transaminasa glutámica Transaminasa aspártica Gamma glutamil
También conocida como AST También conocida como ALT transpeptidasa
Enzimas de utilidad clínica: LDH
La lactato deshidrogenasa (LDH) se presenta como varias isoenzimas que son
tejido específicas.

Páncreas

Sistema
inmune
Placenta

LDH2 LDH4
Eritrocitos

LDH1 LDH3 LDH5


Enzimas de utilidad clínica: CPK
La creatina fosfoquinasa (CPK) también se presenta como varias isoenzimas
que son tejido específicas.

CPK1 CPK2 CPK3


Resultados de aprendizaje

Interpreta los datos cinéticos de una reacción


enzimática y el efecto de la modulación por
inhibidores.

Describe los mecanismos generales de regulación


enzimática y su efecto en los parámetros de cinética
enzimática.

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