CATABOLISMO DE PROTEÍNAS AMINOACIDOS

David L. Nelson and Michael M. Cox

LEHNINGER
PRINCIPLES OF BIOCHEMISTRY
Sixth Edition
CHAPTER 18
Visión general del catabolismo de los
aminoácidos en los mamíferos.
Los grupos amino y el esqueleto carbonado siguen rutas
separadas pero interconectadas.
Catabolismo del grupo
amino.
Visión general del catabolismo del grupo amino (sombreado
en el hígado de vertebrados.
Formas de excreción del nitrógeno.
El exceso de NH: se excreta en forma de amoníaco (microbios, peces óseos), urea (la mayor parte de
vertebrados terrestres), o ácido úrico (aves y reptiles terrestres). Observe que los átomos de carbono de la urea
y el ácido úrico están muy oxidados; el organismo sólo desecha el carbono tras extraer la mayor parte de su
energía de oxidación disponible.
Porción del tracto digestivo
(gastrointestinal) humano.
a) Las células parietales y las células principales de las
glándulas gástricas secretan sus productos en respuesta a la
hormona gastrina. La pepsina inicia el proceso de degradación
de las proteínas en el estómago.
b) El cito plasma de las células exocrinas está totalmente
relleno de retículo endoplasmático rugoso, el sitio de síntesis
de los zimógenos de muchos enzimas digestivos. Los
zimógenos se concentran en partículas de transporte rodeadas
de membrana denominadas gránulos de zimógeno. Cuando se
estimula una célula exocrina, su membrana plasmática se
fusiona con la membrana de los gránulos de zimógeno y éstos
se liberan por exocitosis en la luz de los conductos colectores.
Los conductos colectores llegan finalmente al conducto
pancreático y de ahí al intestino delgado. (c) Los aminoácidos
se absorben a través de la capa de células epiteliales (mucosa
intestinal )de las vellosidades y entran en los capilares.
Recuerde que los productos de la hidro lisis de lípidos en el
intestino delgado entran en el sistema linfático después de la
absorción por la mucosa intestinal.
Transaminación catalizada
enzimáticamente.
En las reacciones de muchas aminotransferasas el
alfa-cetoglutarato es el aceptor del grupo amino.
Todas las aminotransferasas utilizan el piridoxal
fosfato (PLP) como cofactor. Aunque la reacción se
muestra aquí en la dirección de transferencia del
grupo amino al alfa-cetoglutarato, es fácilmente
reversible
Piridoxal fosfato, grupo prostético de las
aminotransferasas. (a) El piridoxal fosfato (PLP) y su forma
aminada, piridoxamina fosfato, son los coenzimas, fuertemente unidos,
de las aminotransferasas. Los grupos funciona les están sombreados. (b)
El piridoxal fosfato se une al enzima mediante inte racciones no
covalentes y una unión por base de Schiff (aldimina) con un residuo Lys
del sitio activo. Los pasos para la formación de la base de Schiff en tre
una amina primaria y un grupo carbonilo se detaran en la Figura 14-5.
Reacción catalizada por la
glutamato deshidrogenasa. La
glutamato deshidrogenasa hepática de los
mamíferos tiene la capacidad poco común de
utilizar tanto NAD+ como NADP+ como cofactor.
Las glutamato deshidrogenasas de las plantas y
microorganismos son generalmente especificas
para el uno o el otro. El enzima de los mamíferos
está regulado alostéricamente por GTP y ADP.
Transporte de amoniaco en
forma de glutamina
El exceso de amoníaco de los
tejidos se adiciona al glutamato en
forma de glutamina, un proceso
catalizado por la glutamina
sintetasa. Después de su
transporte a través de la sangre la
glutamina entra en el hígado
donde el enzima glutaminasa
libera NH4, en la mitocondria.
Ciclo de la glucosa alanina
La alanina actúa como
transportador de amoníaco y del
esqueleto carbonado del piruvato
desde el músculo esquelético al
hígado. El amoníaco se excreta y
el piruvato se utiliza para producir
glucosa, que vuelve al músculo.
Ciclo de la urea y reacciones que
introducen grupos amino en el mismo.
Los enzimas que catalizan estas reacciones
(nombrados en el texto) se distribuyen entre la matriz
mitocondrial y el citosol. Un grupo amino entra en el
ciclo de la urea en forma de carbamil fosfato
formado en la matriz; el otro entra como aspartato,
formado en la matriz por transaminación del
oxalacetato y el glutamato, catalizada por la
aspartato aminotransferasa. El ciclo de la urea consta
de cuatro pasos: 1) Formación de citrulina a partir de
ornitina y carbamil fosfato (entrada del primer grupo
amino); la citrulina pasa al citosol, 2) Formación de
arginino-succinato a través de un intermedio citrulil-
AMP (entrada del segundo grupo amino). 3)
Formación de arginina a partir del arginino-
succinato; esta reacción libera fumarato que entra en
el ciclo del ácido cítrico. 4) Formación de urea; esta
reacción también regenera la ornitina.
Reacciones de adquisición de nitrógeno en la síntesis de la urea los nitrógenos de la
urea se adquieren en dos reacciones que requieren ATP.
El primer nitrógeno del amoníaco entra en la reacción catalizada por la carbamil fosfato sintetasa I. Los grupos fosfatos terminales de dos moléculas de
ATP se utilozan para formar una molécula de carbamil fosfato. Dicho en otras palabras en esta reacción hay dos pasos de activación. Mecanismo de la
carbamil fosfato sintetasa I En la reacción catalizada por la argininosuccinato sintetasa, entra en el segundo nitrógeno procedente del aspartato La
activación del oxígeno ureido en el paso 1 prepara la adición de aspartato en el paso 2 . Mecanismo de la argininosuccinato sintetasa
Conexiones entre el ciclo de la urea y el ciclo del
ácido cítrico.
Los ciclos interconectados han sido denominados el
"doble ciclo (biciclo) de Krebs". El ciclo que conecta
los ciclos del ácido cítrico y de la urea se denomina
desviación del aspartato-arginino-succinato. Estas
rutas conectan de forma efectiva los destinos de los
grupos amino y los esqueletos carbonados de los
aminoácidos. Las interconexiones son incluso más
elaboradas de lo que sugieren las flechas. Por ejemplo,
algunos de los enzimas del ciclo del ácido cítrico,
tales como la fumarasa y la malato deshidrogenasa,
tienen tanto isozimas mitocondriales como citosólicos.
El fumarato producido en el citosol, ya sea por el ciclo
de la urea, la biosíntesis de purinas u otros procesos,
puede convertirse en malato citosólico, que se utiliza
en el citosol o se transporta a la mitocondria para
entrar en el ciclo del ácido citrico
Síntesis de N-acetilglutamato y su
activación por la carbamil fosfato
sintetasa I.
Aminoácidos esenciales y no esenciales para humanos y ratas albinas
Deficiencias de enzimas del ciclo de la Urea
Tratamiento de las deficiencias en las enzimas del ciclo de la
urea.
Los ácidos aromáticos benzoato y fenilbutirato,
administrados en la
dieta, se metabolizan y se combinan con glicina y glutamina,
respectivamente.
Los productos se excretan por la orina. La síntesis posterior
de glicina y glutamina para reponer el conjunto de estos
intermedios elimina el amoníaco del torrente sanguíneo.
Resumen del catabolismo de
aminoácidos
Los aminoácidos se agrupan según su producto de
degradación principal. Algunos amino ácidos se
mencionan más de una vez puesto que diferentes
partes de su esqueleto carbonado se degradan a
diferentes productos finales. La figura muestra las
rutas catabólicas principales en animales
vertebrados, si bien existen pequeñas variaciones
entre especies de vertebrados. La treonina, por
ejemplo, se degrada al menos a través de dos rutas
diferentes. pudiendo variar la importancia de cada
ruta en función del organismo y de las condiciones
metabólicas. Los aminoácidos glucogénicos y
cetogénicos también quedan delineados en la
figura por el color del sombreado. Observe que hay
cinco aminoácidos que son a la vez glucogénicos y
cetogénicos. Los aminoácidos que se degradan a
piruvato también son potencialmente cetogénicos.
Sólo dos aminoácidos, leucina y lisina, son
exclusivamente cetogénicos.
Catabolismo de Ala, Gli, Ser, Cis, Trp, Thr
El destino del grupo indol del triptófano se muestra en la figura 18-21.
Los detalles de la mayoría de las reacciones que involucran a la serina
y la glicina se muestran en la figura 18-20. La vía de degradación de
la treonina que se muestra aquí representa sólo alrededor de un tercio
del catabolismo de la treonina (para la vía alternativa, véase la figura
18-27). Varias vías de degradación de la cisteína conducen al piruvato.
El azufre de la cisteína tiene varios destinos alternativos, uno de los
cuales se muestra en la figura 22-17. Los átomos de carbono aquí y en
las siguientes figuras están codificados por colores según sea
necesario para rastrear su destino.
Enfermedades genéticas ligadas al catabolismo de aminoácidos
 Vías catabólicas para Trp,
Lis, Phe, Tyr, Leu, Ile
Estos aminoácidos donan algunos de
sus carbonos (rojo) a acetil-CoA. El
triptófano, la fenilalanina, la tirosina
y la isoleucina también aportan
carbonos (azul) a los intermedios del
ciclo del piruvato o del ácido cítrico.
La vía de la fenilalanina se describe
con más detalle en la figura 18-23. El
destino de los átomos de nitrógeno no
se rastrea en este esquema; en la
mayoría de los casos, se transfieren a
α-cetoglutarato para formar
glutamato.
Vías catabólicas para Phe, Tyr
En los seres humanos, estos aminoácidos
normalmente se convierten en acetoacetil-
CoA y fumarato. Los defectos genéticos en
muchas de estas enzimas causan
enfermedades humanas heredables
(sombreado en amarillo).
Vías catabólicas para arginina, histidina,
glutamato, glutamina y prolina. Estos
aminoácidos se convierten en α-cetoglutarato.
Los pasos enumerados en la ruta de la histidina
son catalizados por 1 histidina amoniaco liasa, 2
urocanato hidratasa, 3 imidazolonepropionasa y
4 glutamato formimino transferasa.
Vías catabólicas para metionina, isoleucina,
treonina, y valina.
Estos aminoácidos se convierten en
succinil-CoA; la isoleucina también aporta
dos de sus átomos de carbono a la acetil-
CoA. La vía de degradación de la treonina
que se muestra aquí ocurre en humanos; en
la figura se muestra una vía que se
encuentra en otros organismos.
Vías catabólicas para los tres aminoácidos
de cadena ramificada: valina, isoleucina y
leucina.
Las tres vías ocurren en tejidos
extrahepáticos y comparten las dos
primeras enzimas, como se muestra aquí.
El complejo de α-cetoácido deshidrogenasa
de cadena ramificada es análogo a los
complejos de piruvato y α-cetoglutarato
deshidrogenasa y requiere los mismos
cinco cofactores (algunos no se muestran
aquí). Esta enzima es defectuosa en
personas con enfermedad de la orina con
jarabe de arce.
Vía catabólica para asparagina y aspartato.
Ambos aminoácidos se convierten en
oxaloacetato.