ENZIMAS

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 LAS ENZIMAS

ENZIMAS

ESTRUCTURA FUNCIÓN CLASIFICACIÓN

puede ser

Holoenzima Estrictamente Biocatalizadores Ligasas Isomerasas Liasas Hidrolasas Transferasas Oxidorreductasas

formada
proteica actúan

Cofactor Apoenzima  Energía  velocidad

naturaleza
de naturaleza
activación reacción

Inorgánica Orgánica
Cinética Concent. sustrato Temperatura pH Inhibidores
llamados
enzimática
actúan como tipos
Coenzimas

por ejemplo Reversibles Irreversibles

tipos
Vitaminas
se clasifican en
No competitivos Competitivos

Hidrosolubles Liposolubles
(B, C) (A, D, E, K)
Estructura
 Apoenzima (función proteica)

 Proteínas globulares.

 existen algunos ARN que pueden actuar como enzimas

(ribozimas)

 Cofactor (función no proteica)

 Este puede ser un Ion metálico (Fe,Mg,Zn,Ca)
 Una molécula orgánica denominada coenzima
 Apoenzimas
Las proteínas globulares doblar sus cadenas en una forma
esférica apretada o compacta dejando grupos hidrófobos
hacia adentro de la proteína y grupos hidrófilos hacia afuera,
lo que hace que sean solubles en disolventes polares.

La mayoría de las enzimas, anticuerpos, algunas hormonas y

proteínas de transporte, son ejemplos de proteínas globulares.
Algunos tipos son:

Prolaminas: zeína (maíza),gliadina (trigo), hordeína (cebada)

Gluteninas: glutenina (trigo), orizanina (arroz).

Albúminas: seroalbúmina (sangre), ovoalbúmina (huevo),

lactoalbúmina (leche)

 Hormonas: insulina, hormona del crecimiento, prolactina, tirotropina

Enzimas: hidrolasas, oxidasas, ligasas, liasas, transferasas...etc.

Cofactores Metálicos

Enzimas que requieren

elementos inorgánicos
Citocromo oxidasa Fe2+, Fe+,
Catalasa, peroxidasa
Citocromo oxidasa Cu2+
DNA polimerasa
Anhídrasa carbónica Zn2+
Alcohol deshidrogensa
Hexoquinasa Mg2+
Glucosa 6-fosfatasa
Arginasa Mn2+
Piruvato quinasa K+, Mg2+
Ureasa Ni2+
Nitrato reductasa Mo2+
 coenzimas
Los cofactores participan de dos maneras distintas:

1. A través de una fijación muy fuerte a la proteína y

salen sin ser modificados del ciclo catalítico.

2. Como un segundo substrato; salen modificados

del ciclo catalítico y por lo general requieren otra
enzima para volver al estado original.
Los cofactores son moléculas complejas,
que nuestro organismo no puede sintetizar
deben ser, ingresados con la dieta; muchos de
ellos son, por lo tanto, vitaminas.
Cofactores de naturaleza vitamínica; ejemplos

1. Hidrosolubles
Tiamina Tiamina pirofosfato B1
Riboflavina Flavinas: FAD, FMN B2
Piridoxal Piridoxal fosfato B6
Cobalamina Coenzimas cobamídicos B12
Ác.Ascórbico Ac. Ascórbico C
Nicotinamida NAD+, NADP+ PP
Ác.Lipoico Lipoamida
Ác.Fólico Coenzimas folínicos
Ác.Pantoténico Panteteínas (CoA, p.e.)

2. Liposolubles
Naftoquinonas -Carboxilación K
Cofactores de naturaleza no vitamínica: ejemplos

Hemo Hemoenzimas, citocromos

Complejos Fe-S Ferredoxinas
Quinonas Tr.electrónico mitocondrial y fotosintético
Glutatión Redox; transporte de aminoácidos
ATP Transf.de fosfato y/o de energía
UTP Transf.de grupos glicosídicos
PAPS Transf.de grupos sulfato
S-AM Transf.de grupos metilo
Carnitina Transportador de grupos acil-
Coenzimas: Actúan como transportadores eventuales de
átomos específicos o de grupos funcionales
Coenzimas Entidad transferida
Pirofosfato de tiamina . Aldehídos
Dinucleótido de flavina y adenina. Átomos de hidrógeno
Dinucleótido de nicotinamida y de adenina Ion hidruro (H-)
Coenzima A . Grupos acilo
Fosfato de Piridoxal . Grupos amino
5’-Desoxicobalamina (Coenzima B12) Átomos de H y grupos
alquilo
Biocitina . CO2
Tetrahidrofolato . Otros grupos
monocarbonados
Coenzimas

Adenosine Triphosphate (ATP)

Coenzyme A (CoA)

Nicotinamide Adenine
Dinucleotide (NAD+) Nicotinamide Adenine Dinucleotide
Phosphate (NADP+) Flavin Adenine Dinucleotide (FAD)
Aminoácido
LAO Cetoácido
R CH COO- + O2 + H2O R CO COO- + H2O2 + NH4+
NH3+

LAO: L-aminoácido oxidasa: es una flavoproteína

Las flavoproteínas tienen un grupo prostético flavínico,
que interviene en el proceso catalítico sin salir modificado
del mismo
O
H3C N
NH

H3C NH N O
 S: PM 250, 0.8 nm Ø

Cofactor
E: PM 100000, 7 nm Ø
Inorgánico:
Fe2+, Mn2+, Zn2+,etc.

Orgánico:
Orgánico:
Coenzimas
Coenzimas
NAD,
NAD,
FAD,
FAD,
CoASH.
CoASH.
GrupoProstético
Grupo Prostético
 Las enzimas

Catalizan reacciones químicas necesarias para la sobrevivencia celular.

Sin las enzimas los procesos biológicos serían tan lentos que las células no
podrían existir.

Las enzimas pueden actuar dentro de la célula, fuera de ésta, y en el tubo

de ensayo.
 Enzima - Catalizador
Tanto la enzima como el catalizador aceleran la velocidad de una
reacción química.

Una enzima puede transformar 1000 moléculas de sustrato/

segundo

Las enzimas tienen 3 propiedades que los catalizadores NO tienen

◦ Especificidad por el sustrato
◦ Se inactivan por desnaturación
◦ Pueden ser reguladas
La alta especificidad se debe a
que su estructura terciaria le
permite formar cavidades
llamadas sitios activos, lugar
donde se ubica el sustrato
durante el proceso de catálisis.
La enzima se une específicamente a las moléculas
denominadas sustratos, formando un complejo enzima-
sustrato y favoreciendo su transformación en productos.

E E E E
• Las enzimas se unen a los reactivos (sustratos)
reduciendo la energía de activación

• Cada enzima tiene una forma única con un

sitio o centro activo en el que se une al sustrato

• Después de la reacción, enzimas y productos

se separan.

• Las moléculas enzimáticas no han cambiado

después de participar en la reacción
 Desnaturalización

En general, la
desnaturalización produce una
destrucción permanente de la
molécula

Agentes desnaturalizantes: Se
distinguen agentes
físicos calor
químicos detergentes,
disolventes orgánicos, pH,
fuerza iónica.
 Estructura
globular

 Hervir con HCl

 Tripsina
 Temperatura elevada
 pH extremo

Funcionalidad Inactiva
•Actúan en disolución acuosa, a pH y T. óptimos

Enzima pH óptimo
Pepsina 1.5

Tripsina 7.7

Catalasa 7.6

Arginasa 9.7

Fumarasa 7.8

Ribonucleasa 7.8
Enzima (gr). : fermento
1800´s fermentación del azúcar por levaduras
Vitalistas

Mecanicistas

1926, James B. Summer Ureasa

Pepsina
1930´s Tripsina
Quimotripsina
Carboxipeptidasa
Enzima Amarillo viejo (flavoproteína NADPH)
Medicina Transaminasas

Industria
Química Penicilina

Transformación Fermentaciones
de Alimentos Quesos
Vinos

Agricultura Rhyzobium
Teorías de la Acción Enzimática
Modelo de Llave y Cerradura (Emil Fischer)

Sustrato y enzima se acoplan de forma

estereospecífica,
de la misma manera que una llave se ajusta a
su cerradura.
Modelo aceptado durante mucho tiempo; hoy
se considera insuficiente al no explicar
algunos fenómenos de la inhibición
enzimática.
 Modelo de Ajuste Inducido (Koshland)

Tanto la enzima como el

substrato sufren una
alteración en su estructura
por el hecho físico de la
unión.

Está mucho más de acuerdo

con todos los datos
experimentales conocidos
hasta el momento.
La teoría del Ajuste Inducido se amplía en la actualidad
definiendo la acción enzimática como:

Estabilización del Estado de Transición

Según lo cual, el Centro Activo enzimático es en

realidad complementario no al sustrato o al producto,
sino al estado de transición entre ambos.
 O
Substrato: un éster
R C O R'

O- Estado de transición:
intermediario tetraédrico,
R C O R' inestable
-
O

O
Productos
-
R C O HO R'
Enzimas alostéricas o reguladoras
Presentan estructura cuaternaria, son proteínas con múltiples sitios
que interactúan entre si.

Presentan
Sitio Activo: Sitio de unión al ligando o sustrato
Sitio Alosterico: Sitio de unión al modulador

una cinética sigmoide, indica cooperatividad entre las subunidades.

La unión de un sustrato a uno de los sitios, afecta el enlace en los
otros sitios

Son reguladas por la unión de:

•Moduladores positivos
•Moduladores negativos
que pueden ser:
Homotrópicos: cuando los sitios son idénticos. Por ejemplo las
interacciones de la unión del O2 a la Hb.

Heterotrópicos, cuando la unión de un ligando afecta la unión de otro

sitio diferente . Por ejemplo el efecto de BPG (Bifosfoglicerato) en la
afinidad de la Hb por el O2
Nombre sistemático: Grupo transferido

ATP: hexosa fosfotransferasa

Donador Aceptor

Grupo Subgrupo
Número sistemático

Enzyme EC 2.7.1.1 Enzima

Comission
Sub-subgrupo

Nombre común: Hexokinasa

Clasificación de enzimas: Grupos
1. Oxidorreductasas
Si una molécula se reduce, tiene
que haber otra que se oxide

2. Transferasas
•grupos aldehidos 
•gupos acilos
•grupos glucosilos
•grupos fosfatos (kinasas)

3. Hidrolasas
•Transforman polímeros en monómeros.
Actuan sobre:
•enlace éster
•enlace glucosídico
•enlace peptídico
•enlace C-N
4. Liasas
•(Adición a los dobles enlaces)
•Entre C y C
•Entre C y O
•Entre C y N

5. Isomerasas
•(Reacciones de isomerización)

6. Ligasas
•(Formación de enlaces, con aporte
de ATP)
Entre C y O
•Entre C y S
•Entre C y N
•Entre C y C
Enzimas:
No. Clase Tipo de reacción que Ejemplo
catalizan
Deshidrogenasas
1 Oxidorreductasas De óxido reducción (transferencia de e-) Peroxidasa Oxidasas
Oxigenasas
Reductasas
2 Transferasas Transferencia de grupos Kinasas
Transaminasas
3 Hidrolasas Hidrólisis, con transferencia de grupos Pirofosfatasa
funcionales del agua Tripsina
Aldolasa
4 Liasas Lisis de un substrato, generando un (Sintasas)
doble enlace, o Descarboxilasa pirúvica
Adición de un substrato a un doble
enlace de un 2o. substrato
(Sintasa)
5 Isomerasas Transferencia de grupos en el Mutasas
interior de las moléculas para Epimerasas
dar formas isómeras Racemasas
6 Ligasas Formación de enlaces C-C,
C-S, C-O y C-N. Mediante Sintetasas
reacciones de condensación,
acopladas a la ruptura del ATP
EC 1.1 Acting on the CH-OH group of donors
EC 1.1.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.1.1.1 alcohol dehydrogenase
EC 1.1.1.2 alcohol dehydrogenase (NADP+)
EC 1.1.1.3 homoserine dehydrogenase
EC 1.1.1.4 (R,R)-butanediol dehydrogenase
EC 1.1.1.5 acetoin dehydrogenase
EC 1.1.1.6 glycerol dehydrogenase
EC 1.1.2 With a cytochrome as acceptor
EC 1.1.2.1 now EC 1.1.99.5
EC 1.1.2.2 mannitol dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.1.3 With oxygen as acceptor
EC 1.1.3.1 deleted, included in EC 1.1.3.15
EC 1.1.3.2 now EC 1.13.12.4
EC 1.1.3.3 malate oxidase
EC 1.1.3.4 glucose oxidase

EC 1.1.4 With a disulfide as acceptor

EC 1.1.4.1 vitamin-K-epoxide reductase (warfarin-sensitive)

EC 1.1.5 With a quinone or similar compound as acceptor

EC 1.1.5.1 Deleted, see EC 1.1.99.18 cellobiose dehydrogenase (acceptor)
EC 1.1.99 With other acceptors
EC 1.1.99.1 choline dehydrogenase
EC 1.1.99.2 2-hydroxyglutarate dehydrogenase
EC 1.2 Acting on the aldehyde or oxo group of donors
EC 1.2.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor
EC 1.2.1.1 deleted, replaced by EC 1.1.1.284 and EC 4.4.1.22
EC 1.2.1.2 formate dehydrogenase

EC 1.2.2 With a cytochrome as acceptor

EC 1.2.2.1 formate dehydrogenase (cytochrome)
EC 1.2.2.2 pyruvate dehydrogenase (cytochrome)

EC 1.2.3 With oxygen as acceptor

EC 1.2.3.1 aldehyde oxidase

EC 1.3 Acting on the CH-CH group of donors

EC 1.3.1 With NAD+ or NADP+ as acceptor

EC 1.3.1.1 dihydrouracil dehydrogenase (NAD+)

EC 1.3.2 With a cytochrome as acceptor

EC 1.3.2.1 now EC 1.3.99.2
EC 1.3.2.2 now EC 1.3.99.3

EC 1.3.3 With oxygen as acceptor

EC 1.3.3.1 dihydroorotate oxidase
EC 1.3.3.2 now EC 1.14.21.6
Unidad de Actividad Enzimática
Es la cantidad que transforma 1.0 M (10-6 M) de S /min
a 25oC, en las condiciones de medida óptima.

La Actividad Específica
Es el no. de U de enzima / mg de proteína.
Es una medida de la pureza de la enzima.

Catalasade
Catalasa de Catalasa
Catalasade
de
Aspergilliusniger
Aspergillius niger Hígado
Hígadode
debisonte
bisonte
4000-8000U/mg
4000-8000 U/mgdedeprot.
prot. 2000-5000
2000-5000U/mg
U/mgdedeprot.
prot.

100mg
100 mg $$209.80
209.80USD.
USD. 11gg $$768.50
768.50USD.
USD.
 El Número de Recambio de una Enzima
Es el no. de moléculas de S transformadas / unidad de tiempo,
por una molécula de enzima
(o por un sólo sitio catalítico, cuando la E, es el limitante).

Enzima. Moles de S, transf./ min.

a 20-38 oC.

Anhidrasa carbónica 36 000 000

-Amilasa 1 000 000
-Galactosidasa 12 000
Fosfoglucomutasa 1 240